The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
ERRRHSGQDVHVVLKLWKTGFSLDNGDLRSYQDPSNAQFLESIRRGEVPAELRRLAHGGQVNLDMEDHRDEDFVKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Lipid binding protein
|
| molecule keywords |
NSFL1 cofactor p47
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| publication title |
Structure, dynamics and interactions of p47, a major adaptor of the AAA ATPase, p97.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
10
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-02-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SS6 A; 1VAZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3AA3 A; 3THX B; 2G8H A; 2OPP A; 1S6Q A; 2ZGY A; 1RT2 A; 3VMF B; 4BRP A; 3M8S A; 1HYZ A; 4DSJ A; 1RDD A; 3OHR A; 4KTQ A; 5JS1 A; 3QIC A; 4DSI A; 2W40 A; 5ADX A; 3K9J A; 1OKJ A; 3CXC M; 2KZM A; 1HRH A; 2I7P A; 4CEF A; 2G8W A; 4FK4 A; 3LDN A; 4YOU A; 3J81 O; 3U6F A; 2VCP A; 4N41 A; 2F4V K; 4YY3 K; 4Y1D A; 3NF6 A; 3HP6 A; 3TI0 A; 2XHB A; 3THW A; 4FVU A; 3EZW A; 1MWK A; 2HMP A; 3A5L C; 4BR2 A; 4CJQ A; 4GV3 A; 1NKC A; 3WQT A; 3DMJ A; 4CHN A; 3NH1 A; 3FZM A; 2HVH A; 3IG1 A; 2G8I A; 4J8F A; 2CGJ A; 3P38 A; 2O8F B; 2YI1 A; 2WUS A; 3QBW A; 4RG8 A; 3LP2 A; 3DXM B; 3QEW A; 2JLE A; 2V7Z A; 5J2P A; 1GLF O; 5JIC A; 4Q0B A; 5LL6 Z; 4Z4H A; 1UWB A; 3T69 A; 1HQU A; 3DWL A; 1MWM A; 4DR6 K; 1BI4 B; 2D0B A; 2Q1N A; 5CHI A; 4X65 K; 4HWI A; 4YOT A; 2G8U A; 1NK4 A; 3LDL A; 1NJZ A; 3LL3 A; 3J80 O; 1XHZ A; 4C8M A; 3RR7 A; 1RBU A; 3E01 A; 4M63 C; 2D5R A; 4CJK A; 3AVN A; 2GUP A; 4IKF A; 3AVK A; 1ZBI A; 4CK3 A; 2A41 A; 2OCE A; 3OYI A; 4J2A A; 1EXQ A; 3MAQ A; 3HM9 A; 4FWR A; 4RW9 A; 5HL7 L; 4UY8 O; 3I8B A; 4HCB A; 1S1X A; 1UA1 A; 3CME N; 4DR4 K; 2YJE A; 4EP5 A; 3GE1 A; 1L3T A; 2NRH A; 1VSI A; 1HMV A; 3VGM A; 3ZSO A; 3OYM A; 3O08 A; 4J2B A; 2NRR A; 4CIE A; 3FZH A; 3O4Q A; 5F1X A; 3VES A; 1SKW A; 5E84 A; 4BC3 A; 4BWJ A; 1XI1 A; 3M8P A; 5AQZ A; 2VGM A; 3ULD A; 3AVI A; 1ILY A; 4LF5 K; 2YV0 X; 3K59 A; 1RDU A; 3C6H A; 2UUA K; 5FRN A; 4DG1 A; 3BGR A; 3QIN A; 3E66 A; 3NF8 A; 4OKK A; 1RDC A; 2NRZ A; 3IAY A; 1REV A; 3UKU A; 3KLF A; 4FJJ A; 3KK3 A; 4AHU A; 4GKJ K; 4WQ4 A; 4B9U A; 2F8T A; 3HXM A; 2HB5 A; 3ZT0 A; 3HOS A; 3CFR A; 3PX4 A; 1D9D A; 1KVC A; 2NRX A; 4O4G A; 5C25 A; 4PY5 A; 4KRE A; 3TAG A; 4FSV A; 1NLV A; 1GLD G; 4HHT A; 3VER A; 4CHP A; 2GEL A; 1LV5 A; 2FBT A; 1RT4 A; 1RTH A; 1VQL N; 3LP1 A; 1E3M A; 4BRA A; 1U48 A; 2D4W A; 3F73 A; 1WNS A; 2E6M A; 1A5V A; 4DR5 K; 3LDS A; 4KHQ A; 2ITG A; 3VA0 A; 4IOC L; 4BRH A; 4GVM A; 3V6D A; 3L2R A; 4RWT A; 1N8R O; 3BDP A; 4FPB A; 4FZZ A; 4H0X B; 3OS2 A; 3SPY A; 4FWQ A; 1ZBL A; 5EXW A; 2QWQ A; 4E7L A; 4KTZ A; 2NZT A; 1BUP A; 3OYG A; 4FZY A; 5M1Q A; 3DLE A; 4H0T B; 1U4B A; 1MA9 B; 3UKR B; 3QEV A; 2X78 A; 2UUC K; 2A5X A; 2AA4 A; 4AH9 A; 1EQY A; 3R3L A; 5J1E A; 3NCI A; 3H45 C; 1S72 N; 3RR8 A; 4EP4 A; 2BE2 A; 4TSX A; 3G71 N; 1Q9Y A; 5DMR A; 3NHG A; 1C6V A; 2OPR A; 4ICL A; 4DKW A; 3KZB A; 4DV3 K; 2QWO A; 3RMD A; 4FWK A; 4KRF A; 2HHU A; 2OAN A; 3ALY A; 1LWF A; 1BA0 A; 3KLE A; 5GAG P; 3F2K A; 4B9Q A; 3MX5 A; 4NLC A; 4KHW A; 3V1Q A; 1HYV A; 3WNE A; 3HPH A; 4PKI A; 1WSE A; 5A2Q O; 2GBZ A; 4DR1 K; 3VEY A; 2QEX N; 3TAE A; 3BF1 A; 4EZ9 A; 3THW B; 3I8D A; 4BGB A; 4CHO A; 4FJM A; 1IG9 A; 3NVK A; 2UXD K; 1UOC A; 2GUI A; 1KD1 O; 1JKH A; 1JXB A; 4DR7 K; 1NJY A; 1KQS M; 4GVE A; 3VPZ A; 4FJ8 A; 1Q9X A; 4B9V A; 1SL0 A; 4BRI A; 3TPQ A; 3O9Q A; 1T44 A; 4LF6 K; 3AVM A; 2YHW A; 3CER A; 2FSJ A; 4FJL A; 4C8K A; 1KAZ A; 3HBT A; 2VWJ A; 1KFD A; 1ZC6 A; 3DLB A; 4MFB A; 3PSF A; 1QZ6 A; 4IO9 L; 1XHX A; 4E7J A; 2DFH A; 1S1V A; 1XNQ K; 3ID6 A; 3A8Y A; 3DM2 A; 2Q31 A; 3WNF A; 4FWN A; 2HOE A; 4JD2 B; 3TSQ A; 2WON A; 3L2Q A; 5EVZ A; 4RW8 A; 1RDB A; 4DB3 A; 1TUY A; 1DKG D; 1VSE A; 1C1B A; 2WOM A; 3OVN A; 1X9M A; 1KFS A; 1NGB A; 4H03 B; 3CCS N; 3NBP A; 5ELZ A; 1BA1 A; 2KLA A; 1NGJ A; 2XRI A; 2O8D A; 3TAP A; 1HUX A; 2G8F A; 4LH5 A; 4M45 A; 3IKM A; 1RBV A; 3HPO A; 2W6L A; 1DLO A; 3SJH A; 4KKO A; 1IBL K; 2HHS A; 4F8R A; 2P9P A; 2O8C A; 2HF4 A; 2OPQ A; 4CGD A; 4FL9 A; 5AQQ A; 3ZSR A; 3ZT4 A; 4M3W A; 3VQA A; 2BH1 A; 4B1V A; 5GAE P; 3ZLJ A; 1JL1 A; 1ATR A; 1NGC A; 4JKC A; 1XWL A; 3HK2 A; 4HUG A; 3IUC A; 3O4N A; 4BAC A; 3AVA A; 1VQ8 N; 5KGX A; 4BRL A; 1N6Q A; 4DSF A; 3I0R A; 3TU5 A; 5HRP A; 3P83 D; 1J5E K; 2HNZ A; 5CR4 A; 1J54 A; 4IWV A; 1NNE A; 1E4G T; 3OYH A; 2PFU A; 4CEQ A; 4XIU A; 3UE5 A; 1WSI A; 2HBK A; 1NGG A; 4Z4F A; 2P9K A; 4DUY K; 5BN8 A; 1LW2 A; 1RBR A; 2VGN A; 3HOT A; 4OJR A; 3WXM B; 1NK9 A; 3AO2 A; 1YVU A; 3HYF A; 3CJC A; 4R79 A; 3DLR A; 1RCH A; 2HHV A; 3CC4 N; 1WBB A; 1R0A A; 5AQX A; 1GLB G; 1J6Z A; 1FW6 A; 4EHT A; 1K9M O; 4O44 A; 4CK2 A; 2Z1I A; 3P1G A; 5C42 A; 3O5B A; 5TKW A; 2Q2R A; 4FWL A; 5I3U A; 1NK6 A; 1RIL A; 3E9P A; 2QA4 N; 3KVG A; 4ISF A; 3A5O C; 4B3T K; 3ZSV A; 1S5J A; 2NRW A; 3VA3 A; 4DTX A; 4E7K A; 1TKZ A; 1IO2 A; 3TAB A; 1NKB A; 5C10 A; 5CE3 A; 3CFO A; 4CFA A; 1FK9 A; 3SUQ A; 5C15 A; 5HOO A; 5FPN A; 3O3F A; 3CI5 A; 3OYJ A; 1T7P A; 4IDH A; 1NMD A; 3J7A P; 4CF9 A; 1BL3 A; 1VSK A; 3KK1 A; 1BG3 A; 2VYP A; 1G99 A; 2RPI A; 3KTQ A; 2YNF A; 4DTN A; 4DTP A; 3A0I X; 4O8U A; 1IKY A; 3O6W A; 4CBU A; 2KW4 A; 1NK0 A; 3DLG A; 3M3Z A; 2YKN A; 4KHS A; 4M7Y A; 4OPJ A; 1QHA A; 3VEZ A; 1NJI O; 1MDU B; 4FLT A; 4AHV A; 4GKK K; 2FF3 B; 2X6S A; 4BC4 A; 4DCH A; 5FPE A; 4LC9 B; 4BRG A; 4B9L A; 5I9E B; 1SS6 A; 4J2D A; 4KB0 A; 1YJW N; 2P9L A; 1GOA A; 4BDY A; 3A5M C; 5BR9 A; 5F2R A; 1Q7Y O; 2P5G A; 3VOV A; 3CCQ N; 4DV0 K; 1N5Y A; 3HP9 A; 3SAF A; 3H3O B; 2DPN A; 4H5R A; 2E2O A; 3CQ8 A; 2EWS A; 3PO4 A; 4M3R A; 5AJ3 K; 4IBN A; 3OYE A; 3GBT A; 4JN4 A; 4FOE A; 4CBW A; 4A62 A; 4FXD A; 1NU0 A; 2JWL A; 3ZYY X; 4FWS A; 5EOY A; 4K43 A; 3LWM A; 3V1O A; 2RF2 A; 1KVB A; 5AQJ A; 1X9J A; 3NF9 A; 4H5T A; 4B8C A; 4LD0 A; 5ADX H; 1YAG A; 3CCM N; 4FJK A; 3KWG A; 4B9S A; 2E1Y A; 1S1W A; 5KI6 A; 4IOA L; 3LAK A; 1RGI A; 3KHY A; 2OZS A; 3BZK A; 1C0G A; 4BE0 A; 5GAD P; 1HPZ A; 5AQG A; 5FDL A; 5JS2 A; 3FR0 A; 2QKB A; 4BR9 A; 4QAG A; 1BQM A; 4YOR A; 5LJW A; 3HRG A; 1DTT A; 2IIR A; 2P9U A; 4B8A B; 1HR0 K; 2O8D B; 4WCE L; 3R9P A; 3CQX A; 1W2B M; 3ZSQ A; 3EE8 A; 4CJW A; 5LY3 A; 4ELU A; 4CJ4 A; 4E19 A; 3NAE A; 4WQ4 C; 2P9P B; 3ZT1 A; 3QNO A; 2O8C B; 1ATS A; 1VQ5 N; 1F21 A; 3VQB A; 1UAX A; 1DT9 A; 3THV A; 3AGR A; 3K0S A; 1X3M A; 2ZF5 O; 2IS3 A; 1RNH A; 4NYF A; 3VQ4 A; 4E7I A; 3B6P A; 3NDK A; 4BRO A; 3SZ2 A; 5AQK A; 3O1B A; 1TAU A; 2IVO A; 3C7N A; 1K8A O; 4O0I A; 2YJF A; 3S3O A; 2UU9 K; 2YNH A; 4AM7 A; 3HO1 A; 4BR4 A; 2D0P A; 3VGK A; 4BDZ A; 1SZ2 A; 3QEP A; 2ASM A; 4ID1 A; 4DTO A; 2F9W A; 3KIO A; 1ZBU A; 4H4M A; 1HNX K; 4DQR A; 2W42 A; 4FWP A; 3WXJ A; 2P9K B; 3HSC A; 1MU2 A; 4DV5 K; 3QO9 A; 1IBM K; 4F2S A; 1VSJ A; 1TKX A; 1EP4 A; 4LH4 A; 3LAL A; 3O8M A; 4O8K A; 5TKY A; 4CIF A; 2FC0 A; 4HUF A; 4IG3 A; 4WFA L; 2QK9 A; 4CJ3 A; 2HHQ A; 3SBG A; 1NK8 A; 3BEX A; 1HNI A; 3MCP A; 4CFD A; 3KD5 E; 4FJX A; 1N36 K; 3PUF A; 5AQH A; 3SQ4 A; 4MLE A; 4OLB A; 5BRD A; 1Y97 A; 5AQP A; 3VN5 A; 5AZJ A; 4FJN A; 4CZG A; 1BQN A; 3VQ8 A; 4X66 K; 2P9S A; 4CCH A; 3AAQ A; 3NGZ A; 1KLN A; 1WSF A; 3AO1 A; 4BQZ A; 3HT3 A; 3PV8 A; 3HVT A; 2FXU A; 3C6U A; 3LM9 A; 4CZF A; 3OYC A; 4CJV A; 4C8N A; 4NXM K; 1C1A A; 3ISN C; 4BWM A; 1KVA A; 4O55 A; 1HKC A; 4DF8 A; 3AV9 A; 5CZ1 A; 5GIN A; 4WE1 A; 2WFB A; 3M8Q A; 1B92 A; 1HKG A; 3VF2 A; 2DFE A; 1TKD A; 4FJ7 A; 4FJ9 A; 4LY7 A; 2CH6 A; 3NFA A; 1YHQ N; 3R1X A; 5EY4 A; 1QTM A; 3MXI A; 3VET A; 2GV9 A; 5HRO A; 3KK7 A; 4F3O A; 4I7F A; 1VQK N; 1VAZ A; 3I33 A; 3AVL A; 1HPM A; 4CI6 A; 4AIL C; 4MDA A; 4DTU A; 2IVN A; 4CEA A; 3LZI A; 4B9M A; 1ZXO A; 3NGY A; 4MDB A; 3MDQ A; 2B4J A; 3E9O A; 2E88 A; 2P9L B; 3SJJ A; 1JLB A; 2DFF A; 3K5M A; 3I56 N; 1NBW A; 2NRT A; 4FWO A; 3VQ6 A; 1W97 L; 4CEB A; 3D6R A; 1X3N A; 2A1S A; 3FE1 A; 4EFH A; 2R7Y A; 4DV1 K; 4KHY A; 4B3S K; 3VGL A; 1T8E A; 1BWF O; 3ATU A; 3OYA A; 3B6O A; 1V4S A; 3TTD A; 4JNE A; 5FPM A; 1WSH A; 5AQV A; 3V9Z A; 3LZJ A; 2ZWH A; 5C2D A; 3CCE N; 4CJR A; 5LMN K; 3O80 A; 4JKH A; 1WLJ A; 1X1P A; 4E7H A; 2WC9 A; 3TSU A; 2YHX A; 1T03 A; 1S1U A; 4C8L A; 4C1N I; 1O13 A; 2HHX A; 3ZT2 A; 3TAF A; 3N4Q A; 3HVR A; 4JKB A; 4Y1C A; 3WT0 A; 4WQ5 A; 3OBY A; 3QEI A; 2PAV A; 1X9W A; 2PZS A; 3M6G A; 4CF2 A; 1KSP A; 3SQ0 A; 4K42 A; 4PL7 A; 2AP1 A; 1LWC A; 5DM6 L; 4LSL A; 1WUA A; 3MX2 A; 4XEI A; 5C0Y A; 1ASW A; 3VF6 A; 1NKE A; 3DXK B; 1OH6 A; 2ZE2 A; 4JKA A; 3TSP A; 5HBM A; 1NGE A; 2QKK A; 1XC9 A; 3MK6 A; 4BRC A; 2D0A A; 3G25 A; 1JLC A; 4QCL A; 3SBT A; 1GLJ O; 1BCO A; 4HTL A; 3WXK A; 5B8H A; 3O3G A; 3VTI A; 4AHT A; 1N33 K; 2FLO A; 3SPZ A; 2P9U B; 4OPK A; 1UA0 A; 4FK2 A; 4FJI A; 1CZB A; 4LFC K; 4KHP K; 2ASP A; 3QFP A; 5KRS A; 1GLC G; 1IJJ A; 4FLW A; 1QSY A; 1QQO A; 1Q86 O; 1T05 A; 3U9Z A; 4H8K A; 3W3D A; 4CGI A; 1VSH A; 3MMV A; 3PX0 A; 1CLQ A; 3O4W A; 3LM2 A; 3DLL L; 3NE6 A; 3G10 A; 5FLX O; 3OYF A; 2DY4 A; 3LAM A; 3VQ7 A; 3AO4 A; 5AQO A; 4CF1 A; 1SV5 A; 1HNW K; 4BRQ A; 2FSN A; 3HZ6 A; 4DR2 K; 2YKM A; 4B1W B; 3ZSY A; 3S3N A; 4PHT X; 2E1Z A; 5C24 A; 3C7N B; 2AJQ A; 3SUN A; 5HLF A; 4B9T A; 1Y64 A; 3MN5 A; 3VEX A; 3MCA B; 3CF5 L; 5F0X A; 3D45 A; 5BN9 A; 4FLY A; 3U3G A; 3SI6 A; 1QVF M; 1S3X A; 3QBX A; 4JKE A; 4EIA A; 3BP8 A; 3D7E O; 3L4Q A; 3AAR A; 2HNY A; 3VQP A; 1TK8 A; 3QLH A; 3R8E A; 3HTV A; 4DSL A; 3M8R A; 3LWL A; 2WBN A; 1T6D A; 4A61 A; 1U45 A; 2RKI A; 1YVN A; 3WQU A; 3O1W A; 3WXL A; 1IG8 A; 1BIZ A; 4JHD A; 1NG9 A; 2ZJP L; 4CJT A; 2YCH A; 2CGK A; 4M3U A; 4M3Y A; 3CPE A; 3SYZ A; 1U2V A; 2B5J A; 2O4I A; 3K5N A; 3JAM O; 3L4I A; 1S1T A; 4E1M A; 4YOY A; 5JLF A; 1VQP N; 5AZJ B; 3S9H A; 2KFN A; 3O9S A; 3H3N O; 4E89 A; 3SQ1 A; 2P9S B; 1EWQ A; 4E0D A; 4K8X A; 4X62 K; 4AF1 A; 4CEE A; 3ENO A; 3FFK B; 4M3Z A; 2E2N A; 1X9S A; 1JLE A; 3PX6 A; 1EO1 A; 1L3S A; 3AA4 A; 3B8A X; 4CZI A; 4CJP A; 1VRU A; 3K57 A; 4F2R A; 2HHT A; 2OTL N; 3U8X A; 3AVG A; 2QI2 A; 4QS7 A; 5AQF A; 1LOT B; 2IDO A; 4BRF A; 4BVO A; 1I3A A; 4KB1 A; 4ISE A; 1LCU A; 3V9X A; 1YF5 L; 3O9R A; 4DV2 K; 1U04 A; 4W5Q A; 4CFB A; 1YIJ N; 2HBJ A; 2NUB A; 4J2E A; 1VRT A; 4CER A; 2FSK A; 3PY8 A; 1K8K A; 2NLX A; 5AFU H; 1XQS C; 5DK5 A; 2Q97 A; 4U67 L; 2JWK A; 1WSG A; 1QQC A; 4KI4 A; 2V51 B; 3GDQ A; 3BF3 A; 2IVP A; 3AAP A; 2GTD A; 4YNQ A; 2B6A A; 4I9L A; 3MEE A; 3J7Z O; 1A5W A; 1OH8 A; 1NGD A; 4CJF A; 5AQR A; 3ENH A; 2YNG A; 3MWT A; 5E41 A; 3JSM A; 1HNZ K; 2H3G X; 2QWM A; 3AVB A; 3VEW A; 1U6Z A; 3AVF A; 1EX4 A; 3CCL N; 1IV0 A; 3U4L A; 2ZQB A; 2VG6 A; 4YFU A; 5AZI A; 3IS9 A; 3UIQ A; 3OS0 A; 4RW6 A; 2E5L K; 5BPN A; 3T7Z A; 2E4L A; 3CC7 N; 1CZA N; 1QZ5 A; 2PYJ A; 4W5R A; 2QM1 A; 3EEQ A; 3THY A; 4DLE A; 4A2A A; 4CGF A; 4NYN A; 2Z1G A; 5I42 A; 3D2F A; 3ITH A; 4BRM A; 1YT3 A; 3MXM A; 1IKX A; 1IH7 A; 2BTF A; 1HJO A; 2V7Y A; 1YJ9 N; 3MN9 A; 3UKU B; 2Q3S A; 4FLZ A; 4CVN E; 3LAN A; 1JL2 A; 4OLA A; 2OZM A; 1JJ2 M; 4CZH A; 4PUO A; 2D1K A; 4U7B A; 3OTO K; 4OX9 K; 4NO7 A; 4JI0 K; 4BQL A; 4CEC A; 3TAQ A; 4JI8 K; 3MN7 A; 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