1VR2A

Human vascular endothelial growth factor receptor 2 (kdr) kinase domain
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
299
structure length
275
Chain Sequence
LPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords PROTEIN (VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR RECEPTOR KINASE)
publication title Crystal structure of the kinase domain of human vascular endothelial growth factor receptor 2: a key enzyme in angiogenesis.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 275
sequence length 299
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 1998-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1vr2A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1vr2A01
3FWQA 4HGEA 3D7TB 4FTCA 4B7TA 3Q2JA 4PP7A 3LCOA 2J9MA 2VNWA 3Q4CA 1ZMUA 3NDMA 1FVTA 3AMYA 3W2OA 4NT4A 1BL6A 3ANQA 3UO6A 5CALA 2JIIA 5CI6A 3ZMMA 4ACDA 1WAKA 4J71A 5CEMA 3L9MA 5CEPA 1QPCA 3LW0A 1SMHA 4BL1A 4DLIA 4LGGA 2GTMA 3RAHA 4BIDA 5JFXA 2ZJWA 4YZ9A 3IW5A 4L7SA 2C6MA 4C8BA 5M53A 1TQPA 5IUHA 2VGPA 5KHXA 1UNLA 4GSBA 1YQJA 4YLJA 2JIUA 5A46A 4RWLA 3R04A 1OKWA 4LFIA 3O7LB 3CQEA 4MAOA 3HRCA 4KKHA 4YJQA 3E3BX 4FYOA 3SVVA 3IW8A 4BVUA 2XBJA 2R0IA 4L01A 3VS1A 1QPDA 3HMIA 5EI6A 2HCKA 4ZIMA 3PLSA 3AXWA 1YOLA 4FX3A 5FXRA 5KUPA 5JH6A 1FMKA 3UP2A 3Q9YA 2VWXA 4FEVA 5LMKC 4X2JA 3PSDA 4HYHA 4TWPA 2IW6A 4YC3A 2ZDTA 4FYNA 3ZCLA 4M66A 3A8WA 2X7FA 4OTFA 3K3IA 4MWIA 1PF8A 1O6LA 3S95A 3FDNA 4F9BA 2GFSA 3Q5ZA 5HX8A 3W10A 1JQHA 4FTRA 1H08A 5FTQA 3POZA 5LMBA 3EQBA 2XK9A 4LMUA 4D28A 3CY3A 2X2KA 3Q2MA 4BKJA 3G15A 5KMLA 4ZTNA 3UQFA 4RIYA 1XJDA 3BHUA 3QQHA 5AV3A 3VQHA 4WBBB 3AC5A 4FSTA 4UMUA 5TE0A 3O7LD 2XK3A 3ZSGA 1PXKA 5EDPA 3O8PA 2UZUE 3CPBA 1RQQA 4YJSA 5D41A 4DBNA 4DG2E 2OKRA 2R3GA 4YZBA 3O0GA 3LCTA 4IIRA 4U9AA 1CTPE 1GIIA 4ZTRA 4JAIA 4FNYA 4C4GA 4EH6A 3FUPA 3DFAA 3OWKA 3HECA 4UY9A 3W2CA 3I4BA 3VC4A 5BUIA 4Y95A 2P0CA 3CPCA 2ITZA 3B2TA 2B7AA 4PPBA 4EHZA 4XYFA 2ZB1A 3PWYA 1MP8A 4TYIA 3VRZA 4RWKA 1WVYA 4RGJA 5IQIA 5KMNA 2R9SA 2Y4IB 4W4WA 5FM3A 3TV7A 3FSKA 2XJ0A 3MIYA 4FKWA 1Q3DA 2WEVA 4I22A 4FSYA 3SKCA 4ALUA 2YCRA 1SNXA 4S30A 3JVSA 4EC9A 1M2QA 4JBOA 2XKEA 3AC1A 4ZK5A 1YHSA 4AS0A 4U81A 2X7GA 3TDVA 3H30A 2B0QA 2B9IA 4FODA 4I6HA 3DNEA 1PHKA 2CDZA 3TIZA 2WMVA 3CQUA 3FQHA 4MXOA 1G8SA 5EDQA 3QFVA 2VX0A 4BCGA 1Q97A 2C6LA 2WTWA 3DY7A 4R3CA 4DBXA 3O96A 4I0RA 4Y5QA 4BTFA 4YJNA 3GGFA 3ZC5A 3DAJA 3HV7A 3OUKA 5ANJA 3C7QA 1YXXA 2JITA 3O2MA 2BR1A 4HYUA 4S34A 5E90A 5FTOA 3UP7A 4KBCA 2HAKA 4EONA 2C6EA 1QCFA 5KMOA 2WMBA 4YC8A 4CT2A 2F7XE 2XNOA 2W4KA 4K8AA 5GNKA 4PPAA 3KEXA 4MX9A 2FB8A 2VTQA 3DS6A 4YSMA 3DDPA 4USEA 3KN6A 5FRIA 2YCQA 4FL1A 3PA5A 5L6WL 2XNBA 1BX6A 2Z8CA 3QA0A 2ITTA 5DBXA 5C8KA 3UNJA 3ZRKA 5FP6A 3AT2A 3ERKA 4OT6A 3RM6A 2WMAA 2XK8A 4DFZE 3T3VA 4XP2A 4EK4A 5AV1A 4EH8A 3EN4A 1RW8A 1MQ4A 3OWLA 3P9JA 4YLLA 4DEIA 3LJ2A 3UMWA 4PMSA 5TKDA 4HJOA 4EK5A 4GVAA 4P4CA 5IKWA 4YTCA 1M7NA 4QP6A 2X6DA 5EYMA 4DFYA 5LWNA 4PL5A 4TY1A 1MUOA 3GC8A 3QRIA 4BGGA 5CANA 2X6EA 4DYMA 3FQEA 4F4PA 5HCYA 4F6UA 4YBJA 4TW9A 3UVPA 2W05A 4YPDA 3SXFA 4MEDA 4OTIA 2VTIA 3VS0A 4XV3A 3TWJA 3CJGA 2OH0E 2QHMA 1WVXA 5AV2A 4YBKA 2ITPA 3GU5A 4C4HA 3C0IA 2ETKA 3WZKA 3AMBA 2EXCX 4QOXA 3B8RA 4IX6A 4D58A 2IZUA 2C0OA 5E8VA 5HE3A 4YPSA 3UNKA 4AZFA 1APME 3CBLA 4FZFB 3ANRA 4M3QA 4I1ZA 3F3ZA 4DCEA 1U54B 3TDWA 5FP5A 4BIEA 4CFVA 2BDWA 1TQIA 2QOIA 3OW4A 4GFMA 3TZ7A 4I4FA 2WIPA 5IMEA 4J1RA 4FL2A 4U43A 2OFVA 3OF0A 2RIOA 3DKOA 3PA3A 3SAYA 3QHWA 4EEVA 4NFNA 3Q53A 5AP6A 4ZXTA 1XH5A 3QTXA 5M51A 2GQRA 4XV2A 3KU2A 2VTOA 3ZXZA 2O2UA 4GT3A 4BKZA 4AA4A 1YXUA 5CS6A 2OJGA 1HOWA 2UVZA 3NRMA 1IEPA 2PHKA 5IQBA 3D5VA 3HV5A 5D1JA 5AMNA 3QTWA 3IGGA 3W33A 4FIJA 4BDDA 2ZB0A 4LL0A 2G1TA 2W9ZB 3AGLA 4C36A 2VU3A 2F7EE 4NTTA 4I93A 2ZYBA 3NR9A 4K11A 3QZIA 4L53A 4BDJA 3P23A 3WARA 4PMPA 4QMXA 5B7VA 4PDYA 2J51A 1SVGA 5CQUA 1QL6A 4A07A 5CF5A 1OVEA 1ZLTA 2YDKA 4M7IA 2PVFA 3F3TA 1W98A 4DAWA 2BIYA 5BYZA 1KOAA 3D14A 3F66A 3KC3A 4UWBA 3DCVA 4LUDA 4RWJA 5CNNA 2E9UA 3RHXA 3BEAA 2QO2A 5HESA 1YDRE 4FL3A 2XEYA 4QYGA 1GZNA 1P4FA 5K4IA 4NKAA 2B9JA 2A4LA 3MA3A 2BZIB 4DH3A 5FBOA 5M55A 1KV2A 3G90X 2QO9A 3AGMA 3NUYA 4FT9A 5JQ8A 1OL7A 4IZYA 2X4ZA 3F3WA 3SHEA 1TQMA 3K2LA 1W83A 1KE7A 3QX2A 3UTOA 5BVDA 3V51A 3R0TA 5CU0A 3D94A 4JG6A 2QVSE 4V04A 5AP7A 2CMWA 3VJNA 3ENHA 5BX0A 2OIDA 3VBQA 3FI3A 5KKRC 5EI8A 2JC6A 3DTWA 2HXLA 4FIHA 4X6RA 2UVXA 3ZFXA 4DITA 1OL2A 4IMYA 1MQBA 2XYUA 4Q5EA 5DR6A 3EKKA 5HO6A 5EKNA 4EOMA 3F69A 3HUBA 4BDIA 2O63A 5AUWA 3HDNA 3LFSA 4R7HA 2GCDA 4O1PA 3K5VA 5JZNA 4FG8A 2ETRA 4G3EA 4UMTA 5CEIA 4Y72A 3ODZX 4FSWA 4PDOA 4O91A 2DUVA 3NYOA 5AM7A 1JKKA 5HBJA 2CKOA 2WOTA 4F6SA 2VZ6A 1Q8TA 1PMEA 3KXMA 3EYGA 3A4PA 4PP9A 5T3QA 3TV6A 4BRXA 1U46A 4XMOA 2IZTA 3R28A 1NVQA 5BMMA 2FSMX 2G2HA 2GSFA 4JQEA 5ACBC 3QD2B 2J0JA 3EN9A 3IONA 4K77A 4BDCA 5IU2A 1IAHA 2X1NA 4FSZA 2ZDUA 4DEDA 3OCBA 3A62A 4KS7A 3G9NA 4DH8A 2PVLA 2OJJA 4IAKA 3PJ2A 3MJ1A 4FK3A 5IQGA 2I0HA 1GAGA 3EB0A 2VTTA 4FTMA 4GUBA 4XP3A 4B99A 4O7LA 4CQGA 3QBNA 4G5JA 2X7OA 4NIFB 4X3FC 5C03A 5KKRB 5EW9A 3A7FA 3QX4A 4NJ3A 4WSYA 3TV4A 4B6LA 3QWJA 3VS6A 4EWQA 3FMEA 1UU8A 5IEVA 4X0MA 3BWJA 2X4FA 3DK3A 3N51A 1UU9A 4FV0A 1JKSA 5CZHA 4LGDA 4XRJA 4A9SA 5JGDA 3D5UA 4ACGA 4L42A 3GU7A 4BCJA 5HG9A 3M1SA 3PE1A 1E1VA 2RFDA 4W9WA 4AZEA 3UO4A 3FSFA 2SRCA 5K5XA 3NWWA 1PW2A 4FNXA 2OZAB 2PE0A 2C3IB 4QP4A 5M07A 4D2RA 1VR2A 4MD9E 3HNGA 2VWVA 3KRJA 2Z7SA 3GU8A 4M69B 3DQWA 3P7AA 4XV9A 3EQDA 4BCOA 3G6HA 4ANQA 4M14A 5HOAA 4WA9A 4AZSA 4D2TA 4LOPA 5D7AA 4BDFA 4EBVA 4YURA 4BCHA 5IA5A 5I9UA 3MY5A 3FI8A 4TWOA 3MBLA 3TNHA 1ZY5A 4LRKA 4BCPA 1B6CB 2F4JA 1OMWA 3JPVA 5JRSA 1UU7A 1JSTA 4A4LA 4E8AA 2CGVA 4MXCA 2W9FB 4RC3A 3VW6A 3C4EA 4CTCA 5L6PA 4F08A 2PZRA 1I44A 4AQCA 3F2AA 3EFJA 3FKOA 4YZCA 4QT1A 1YDTE 5DMZA 1OM1A 1XHAA 5HD7A 3W2RA 4MNEB 4EH5A 3EN5A 1OIYA 3OCTA 4WRGA 5GZ8A 3Q04A 5E4HA 3KULB 3NNVA 3ROCA 5L2QA 1K2PA 5M4IA 1KE9A 3I1AA 4QYHA 3TKUA 1OITA 3U6IA 2W5HA 4UZDA 3R21A 3OC1A 3U51A 4Z7HA 5AJQA 4FV9A 4CQEA 3A2CA 5K3YA 3WF5A 3R8VA 2R64A 3C4FA 3PY0A 3KMUA 4IEBA 4C0TA 2X39A 3ALNA 3VUKA 2W1FA 3EWHA 1NVRA 4ASDA 3BBTB 4UMQA 3LM5A 3OHTA 3ZM9A 4XG7A 4GFOA 4CFWA 4F0IA 3ORMA 3TUDA 5E8YA 3G9LX 4XG3A 3SW4A 4HVGA 2GPHA 3V01A 5IA3A 4WKQA 3TZMA 2CPKE 4HZRA 1JKLA 2G2IA 2GNJA 3KRRA 4D55A 4GT5A 1H0WA 4DT9A 4QP1A 3OOGA 4F0GA 5H3QA 4QQJA 3FLNC 2IVTA 5FEEA 5IISA 3WZUA 2O5KA 3WF8A 3BI6A 4CGAA 5I4NA 4ASXA 4HCTA 3ZDIA 4NM3A 4DH1A 2XRWA 2FSTX 2W4OA 5LARA 4A4OA 4UWCA 3MB6A 3OZ6A 4FIFA 2EWAA 3GENA 4JDJA 3VUTA 4BWKA 1W0XC 1PYEA 3O8TA 2BROA 4PL4A 2WMRA 3R30A 3W8LA 3WILA 4BYIA 2GFCA 4WD5A 3QQUA 3UNZA 3VNTA 2KULA 2GHLA 4JDIA 4ALWA 4DEBA 4BCNA 5I9YA 1KE8A 5ANGA 4AU8A 1WCCA 3NNXA 2F9GA 4QMWA 4L46A 3OEFX 3QTSA 3NYXA 4FMQA 4G6OA 3VBVA 4PY1A 3KRWA 4R5SA 5GHVA 5GJDA 4CKRA 2P2IA 2AC5A 4ZJJA 5FM2A 3HEGA 4F65A 4IX4A 1JKTA 4IAIA 3ZM4A 3L8PA 5HLPA 4A4XA 4MVFA 3U8WA 2QONA 3PLAE 5BVOA 4CLJA 3CXWA 4ANBA 2C6OA 4C2VA 4FKPA 2OICA 2HZ4A 1Q8UA 1SZMA 5E1SA 4JLCA 3CP9A 4IAAA 3PYYA 4FEQA 4JG7A 5DRBA 3ZH8A 3ZU7A 2V0DA 3NNWA 2PVYA 1YVJA 2CCHA 3NIEA 3TCPA 3LQ8A 3TUCA 5DFPA 2R3PA 3GB2A 3Q6UA 3QZHA 3ZLSA 1OUKA 3EQCA 4O7RA 3F5UA 3O51A 4IAFA 4E6AA 4CG9A 5IQHA 4FKOA 2XIKA 1PXNA 2YAKA 3HMNA 1NA7A 4HVIA 4YHJA 4EL9A 3V5JA 3FKLA 2WELA 3QTZA 5AV4A 3DOGA 3OY3A 4GKHA 1LEZA 3COIA 5HTIA 2HZ0A 2V62A 4IWQA 3PPZA 4RG0A 4EJNA 3OWJA 3QRJA 5AUVA 1XBAA 3FZSA 4ZZMA 3V8WA 3CY2A 2C5XA 3DPKA 1Q4LA 3EQFA 2ERZE 2JFLA 3QQLA 5E1EA 4EC8A 4TL0A 2R3KA 4E4XA 4QMYA 4CT1A 1URCA 3AC8A 1H27A 4QMSA 4HYIA 2OIQA 2W06A 3FYJX 4OTHA 5D12A 3FC2A 4YJRA 5EH0A 1WVWA 3O23A 3BEGA 1OL5A 5DHJA 2OJ9A 3SOCA 3V5LA 3AQVA 5AR2A 4I5CA 4HGTA 4J97A 3HVCA 4PNKA 4R7IA 1U59A 4RBLA 5HTCA 1B38A 4ANMA 2CKPA 3MFSA 5KZIA 3VS5A 4C38A 4DFUA 1OGUA 5F9EA 5G1XA 3VBTA 3EQHA 3GCSA 2CN5A 4HGLA 2C69A 5J9LA 3ZS5A 1R3CA 5BUJA 4FICA 5HE2A 2YM5A 3V6RA 3JUHA 3LXKA 4AW2A 4Z3VA 1ZOGA 4N0SA 4D1XA 2OW3A 4U42A 4IJPA 4CVAA 3QXPA 5IA0A 2UW8A 3FMKA 1H4LA 5M57A 3P78A 1ZY4A 3GQIA 4ANSA 5J5SA 3NUPA 4D4VA 3MTLA 4G3GA 3UOLA 1OBDA 3BRBA 5C4KA 3UO5A 3D9VA 4EZ3A 1Q41A 3U4UA 2QKRA 4RC2A 2HY81 4RIYB 3ORIA 3ZSIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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