1W1PA

Crystal structure of s. marcescens chitinase b in complex with the cyclic dipeptide inhibitor cyclo-(gly-l-pro) at 2.1 a resolution
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE B
publication title Structure-Based Exploration of Cyclic Dipeptide Chitinase Inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 162
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1w1pA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1w1pA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w1pA01
3RILA 4IM4A 3DECA 1WDQA 4W87A 2PB1A 3CUFA 3VNZA 2VX5A 1HJUA 7TAAA 1SYTA 4ATWA 1WAWA 1VEPA 2PBOA 2ZX7A 2CNCA 1K9FA 3NJ3A 2EEXA 1GCYA 4L4PA 2VURA 4D6GA 3AHVA 3TONA 2A3CA 4U33A 4AZ6A 3G6MA 4HP5A 3U5UA 5C71A 1WP6A 3VVGA 1E1FA 3N1AA 5E9AA 7CGTA 2O9OA 3WY1A 3VD3A 1HVQA 1C3FA 3DHPA 4WSJA 4Y7EA 2Y5EA 1Q6GA 5A3HA 2JEQA 4GI6A 2WNWA 3A4WA 3THCA 1CGVA 3OLDA 4EANA 2NSXA 2J7FA 3D5HA 3F4VA 1UHVA 1MXGA 2ZUWA 3W28A 5HPOA 3W37A 4D6HA 1LJYA 4KGJA 4M80A 4UOZA 1W9UA 4YN5A 2VX4A 1B3ZA 3BC9A 1FFQA 3VILA 2E9MA 3BAJA 1M04A 4AIEA 3N17A 1C91A 4J3UA 1TE1A 3E1F1 4PN2A 4HA1A 2GSJA 3WDQA 4TTUA 2YL5A 3MV01 1HNYA 2VNCA 1OM0A 4R5EA 3F5LA 3VDHA 1CGYA 4GPNA 4LGXA 2ZE0A 3CZGA 3N12A 5DT5A 1QW9A 5A94A 2W91A 3UERA 3WUFA 1WNOA 2RGMA 5DO8A 1XCXA 1BG9A 2WHJA 1LLOA 2E0PA 1NWRA 4U3AA 4ACZA 3UCQA 2PWGA 1LL4A 4PMXA 1DWJM 2UWFA 1RPKA 3DYMA 3IJ8A 4IPNB 4HOZA 2VCAA 2BV9A 1CGWA 3S6TA 3WFZA 3PZNA 3AJ7A 1CLXA 3TP4A 4AEFA 5C70A 3NDZA 2D3LA 3VD4A 3WNOA 5M17A 1KGUA 1DWFM 1QNPA 5A95A 7A3HA 4MNLA 3WDHA 5LA2A 4V28A 4E8DA 2ZX6A 4DUXA 5JIPA 4AISA 4AIOA 1HL9A 3A3HA 2G8ZA 3FNDA 2F2HA 2D49A 1J10A 1KXHA 3K4DA 5BRQA 1FA2A 4EE9A 3I3BA 3VD7A 3GBDA 2XWEA 3ZSTA 1BLIA 2G4FA 2IXVA 1CYGA 1R85A 2EXOA 4B9ZA 3SIMA 4QFUA 1BVZA 1WZAA 3RO8A 6TAAA 2BHYA 4W5ZA 2AOSA 2TAAA 1XC6A 2ZIDA 1UWSA 3N18A 1JGIA 1EA9C 4HU0A 4JFTA 1UD3A 1OINA 3ZJ7A 3WDPP 4UQBA 4ZFMA 1BSIA 1M7XA 3AIBA 1PIGA 3L4UA 4JFUA 1UD6A 4PMVA 1ZL1A 4JL2A 2ZUVA 2VC9A 2VJXA 2OSXA 2EPMX 3SCVA 5LA1A 1KBBA 1UZ1A 4MB4A 3MUIA 3VGFA 2C7FA 3ARVA 1ZJAA 3U5YA 5D9OA 4GI8A 4EKJA 2YL6A 1N82A 2X0YA 1QI5A 2E8ZA 1FH8A 5LA0A 2CKSA 4W84A 1WZKA 4HU8A 2WCSA 4NRSA 2WHMA 4F9DA 5A6AA 3WUEA 4AD4A 2RGLA 1VF8A 4D71A 3VO0A 4CCCA 1JNDA 3ZJ6A 5DFAA 1VJSA 3VIIA 1R86A 3EMZA 3RM9A 1J0ZA 3FAXA 3LPFA 4HA4A 2JEPA 3UG3A 5E6ZA 4P8XA 2D24A 2VZOA 3IANA 4DWSB 3LMYA 3POHA 2D2OA 3TTSA 2G3NA 4GZEA 4AZ7A 1NARA 1HF6A 3NYDA 4DWSC 2DH2A 5E0FA 1JXKA 4K68A 2XM1A 2EPOA 1J01A 2ZICA 1RP8A 1V02E 3WQ8A 2CETA 3VKKA 3GXDA 2WB5A 1GQJA 2DQXA 2J77A 5ABFB 1M03A 1B31A 1QHPA 3A6OA 4NZCA 4WJXA 4CKQA 3ARUA 2ZUSA 4MAVA 4W8BA 2YA0A 3T0AA 4AZ5A 2WXDM 3LPOA 1ODUA 2E9LA 1PAMA 3FHAA 1QHZA 4JKKA 1E3XA 1JIBA 1R8LA 4YHGA 1VFFA 1EHNA 1UZ4A 1XGZA 1C8YA 3L4XA 2IUZA 1E71M 1TZ7A 1CNVA 4MNMA 2Y8KA 2WSKA 1E4MM 1CZ1A 1FH7A 5IDIA 3SCOA 4CU6A 3CO4A 1X6LA 3ARQA 3AMLA 2CKRA 1OIFA 4Z2HA 1S46A 1UKOA 1B30A 2CBIA 3AIQA 4MB3A 3T2OA 4AY1A 1E5JA 5A1AA 1AQ0A 1VRXA 1SMDA 3QHOA 2WVUA 1TA3B 5KEZA 3BCFA 3O9NA 5I78A 1C92A 3GNOA 2J47A 1JD9A 1ZS2A 2W61A 3WNMA 5ABHA 2CIPA 1JF5A 5IHRA 4JFSA 3B9EA 4RE2A 5CJ5A 2UY5A 3SUWA 1W2VA 1C7SA 2BVTA 3PZGA 6CGTA 1D3CA 1GOKA 4Z2LA 2X05A 4QLLA 4M8UA 3HN3A 1VBUA 4AD5A 5CLWA 3WD4A 2Y8VA 3GTNA 3W26A 4NI3A 2BFGA 5FD0A 1BHGA 4FK9A 3AI0A 1W3HA 2C8NA 1YHTA 1W91A 2BY1A 1HJWA 1E4IA 1B3XA 2ESCA 3K46A 1UR9A 1CWYA 5GNZA 4AZHA 2D22A 1OB0A 3WEMA 4GZJA 1HT6A 1KQYA 2O9PA 2VZSA 3L4ZA 2DH3A 1C7TA 3IAQA 1E4NA 4JL1A 4KMQA 1WDPA 2WMIB 4B3LA 2PI6A 5HDRA 4BCEA 2BNJA 3RIKA 2J4GA 1MQQA 1BQCA 1GZJA 1WO2A 1JYNA 1BF2A 2C0HA 4ATLA 4PUDA 5JBDA 1BG4A 3RJYA 4P7OA 2DT0A 2HISA 3VX1A 1Q4NX 5A8NA 1HKMA 1GPFA 3SUUA 3AMCA 1PEZA 3WMSA 3W6LA 5I77A 2ZUTA 2QV4A 2UY2A 3EMCA 1E0VA 3CTTA 4JKMA 1UD2A 2DDXA 1EDTA 2XVNA 1KWGA 4HZ8A 1V0LA 3T2PA 1X6NA 3PZUA 1KXQA 1DEDA 2W67A 3FW6A 4S3KA 4CCEA 5EBAA 3T0DA 3N9KA 2QPSA 1GJUA 4UNIA 3GBEA 2W63A 3M07A 5D8WA 5BCAA 1CXIA 3I3EA 3ARZA 1JXJA 3MMWA 1QOXA 2JIEA 4PCTA 5FL0A 2VZVA 2WMFA 4E4PA 2WMJA 3IK2A 3DYPA 1V6XA 1G5AA 3VDAA 4GO8A 5CSYA 1K9EA 2ZXDA 4PUEA 1CXLA 1U30A 3OZOA 3WKZA 4BS0A 2VR5A 2XIIA 3PZOA 1ED7A 4HMCA 2BY3A 5HXMA 2VQUA 3QHMA 1VFMA 1TFVA 1CXEA 2BHUA 3MANA 6A3HA 4AD1A 4PMRA 5EFDA 1FOBA 3SUTA 3AIEA 4QP0A 4QAWA 2D23A 2EJ1A 1HKKA 4AW7A 2PWEA 1E3ZA 5KZ6A 1E6QM 3TOPA 3OGRA 3U57A 3GH7A 4Q22A 2OSYA 1MXDA 2CBVA 3ZT5A 2ZWYA 5IHSA 2WKLA 1HIZA 4YHEA 3S2CA 4UZUA 2WMGA 5AC5A 3GNRA 3K8LA 1AIWA 3ARSA 5CGTA 3W27A 4X0NA 4WIWA 3AYRA 2WLZA 5AYBA 1HN1A 4M81A 4QLKA 4LXFA 2XJ7A 1EDQA 3BH4A 4W7WA 3GXIA 3PTQA 1ESWA 3WQWA 1W1VA 1OGGA 2CESA 3IJ9A 1MFUA 2XVLA 4ZEPA 1WPCA 2PC8A 3SUVA 1NWSA 1B90A 4JFVA 3WD3A 1UR0A 3KL5A 2CCRA 2AMGA 3W25A 1JYWA 1JZ3A 3AFBA 1GUVA 2GDUA 3OGVA 1CXFA 1GOMA 1UA3A 1E70M 4GI9A 1JD7A 1B0IA 2W66A 3DC0A 3AMKA 1ISXA 2VRJA 3OA5A 4Z2JA 4CN6A 3ALFA 3BMWA 4P8VA 1KQZA 1GHRA 2A3BA 1HKJA 4AZCB 3W81A 5A8QA 3WH6A 2E9BA 1JL8A 4PSRA 5DT7A 1O7AA 1QPKA 3AIWA 4JKLA 5A2AA 1CENA 1A47A 4KRUA 1K9DA 1LF1A 1UR8A 1XSJA 3VIJA 1XHGA 4NF7A 1LL6A 2X1IA 4PCSA 3ARWA 3KL0A 3BAXA 4D6EA 1VIWA 4BQ2A 1KR0A 5I5RA 3MSGA 1R7OA 3SUSA 1UQYA 2WZHA 1MW1A 1UR4A 4U5IA 2VOTA 3OGSA 1J9YA 3AZRA 2YL8A 1V6YA 3AQUA 1HJVA 1CGUA 2WHLA 5ABFA 5JIWA 3VM5A 2D20A 4OZOA 4ML4A 5BRPA 4DM1A 1E73M 1H1NA 1KFWA 4AIUA 2X0HA 2QLYA 3CBWA 1EIBA 3EYPA 4U2YA 3WQ6A 1DHKA 4FLQA 1CGXA 3WUGA 4UFIA 1TR1A 4TUFA 3APGA 4KH2A 1MW0A 2JF7A 3NUKA 5GNXA 1OGBA 1WCGA 2EPKX 1V08A 1BYDA 5I0DA 3RM8A 2WCGA 1K6AA 2GJPA 1GHSA 1HL8A 1KCKA 4AWEA 2CITA 2BVYA 4LPCA 3VM7A 2A3EA 5A8OA 5JBEA 3EDKA 5CSUA 2YDQA 3WN6A 5HPCA 1M53A 4W8AA 5HOSA 3MUZ1 3NDYA 2YDRA 1TA3A 2CYGA 3ZM8A 1E72M 2XIBA 2GK1B 3IJ7A 2GJXB 3KZSA 4QCEA 1OWQA 2V3FA 1UA7A 2A3AA 4JZ5A 5A2CA 5A6BA 1SFSA 2WW5A 4HOXA 3ZR5A 1ZBWA 2G3IA 4ZENA 1R7AA 1TCMA 2DT2A 2WMHA 3AXIA 1XSIA 2NW0A 2XGIA 3M46A 4P7LA 1JYVA 4FLOA 4M1RA 2VZTA 3WSUA 4UQEA 4Z2GA 2ZUMA 1W9DM 2ZUUA 3EDJA 4PMNA 2CBUA 3N04A 3VU2A 1E9LA 1VFUA 2WVVB 3EDEA 3PZVA 1EH9A 2WVSA 1MYRA 1W32A 2W92A 3T08A 2WBKA 1QNOA 4CU8A 4CU7A 5A8PA 3EBVA 1QW8A 4PYSA 2DPEA 1JZ2A 1QI0A 5C8BB 3B9AA 5AC4A 1C93A 1OSEA 1EO5A 3WDJA 1JI2A 2BHZA 3ZJKA 4WKAA 1ISYA 3W53A 2OYLA 3RDKA 3VINA 1B1YA 3LPGA 5E70A 3UG5A 3TTQA 2WMIA 1KBKA 3WMBA 1A3HA 1EQPA 3AZSA 3WD1A 4W86A 1LQ0A 5CQ1A 3MV11 3AIVA 3VDBA 4EK7A 5ABEA 3VD9A 1C90A 1TVNA 2OWCA 1GOWA 1NP2A 1UQZA 3VMOA 3ZOAA 3GH4A 2RTSA 1G01A 4TTGA 3D3AA 1QI3A 1G1YA 4UFLA 1Q6EA 3CUHA 3TA9A 2W4XA 3FN9A 3PHAA 4WSKA 1OCQA 2VCCA 2F8QA 2ZX5A 3AHYA 1FP9A 4W8LA 1IZJA 1V3JA 5M3WA 3OG2A 2ZWZA 3VGGA 1UG6A 4N0RA 5EFFA 2G41A 4PMYA 3SCSA 3WQ4A 1JDAA 3T09A 4URIA 3BCDA 4M29A 3BAWA 1AVAA 4PMUA 4ZE5A 2PBGA 1UD5A 5EMYA 2YBUA 3QHNA 3AXXA 1JZ4A 1DWGM 1H3GA 1J0IA 4UFJA 4F9JA 4TVCA 3U7BA 4GXPA 2J8FA 3VIPA 3FAWA 2XPKA 2QF8A 1DP0A 3O2LA 5CXPA 2DSWA 1MWOA 4DM2A 4PMQA 1UOKA 2D1ZA 4CD4A 3GM8A 4PTXA 1HJXA 4W89A 4PEEA 3LPPA 2J75A 1G9HA 2WCAA 1UH2A 3JUGA 3AHXA 4IISA 5AY7A 4LYPA 3CUJA 4BQ3A 2Y24A 1L8NA 2O9TA 3SCUA 4CN4A 2BXYA 3WDRA 4AD2A 1ISWA 2OSWA 2ZX9A 3WQ5A 1OT2A 1E40A 3WF3A 2YKKA 3SCQA 4XZBA 4JHZA 4LX4A 5A6KA 1EO7A 1I1XA 1ITCA 3T2QA 1BYBA 4AEEA 1E6XM 4TVUA 1QI4A 2BVDA 1FP8A 3L4VA 3QOMA 4MNJA 1KR1A 1UUQA 2QMKA 3CHCA 5CG0A 1B2YA 1BYAA 1US3A 1ODZA 4HTYA 3NIYA 3VDCA 5IFTA 1XRVA 1J11A 3OLGA 2G3MA 2V5CA 4LQ1A 2QHAA 4GO9A 1RP9A 3K8MA 1C8QA 5CPSA 3NSNA 1EDGA 4X0VA 3VPLA 4P8UA 4MJ4A 3WNNA 3VMNA 4MNKA 1UKPA 4EAMA 5BXPA 2BXZA 3BAKA 2DSZA 1EGZA 1CXHA 2VTFA 3VIHA 1TUXA 2VQTA 3WD2A 4HZ7A 4ATDA 1UWQA 3GH5A 4M56A 5BWFA 3WF2A 3GNPA 2FGZA 1J0JA 3UEQA 4UFKA 1OBAA 3B9DA 3SCRA 3AISA 4F8XA 4TXEA 1H0IA 3AROA 2NT0A 4J3TA 1HJSA 1DWHM 4NRRA 3CIVA 2ZXBA 4XV0A 4AZCA 3WH9A 2A3HA 2E8YA 1V0KA 2E3ZA 3BSHA 1TG7A 2CHOA 3AHTA 1DWAM 1QNSA 2WVTA 4WLCA 4F79A 4AD0A 2XVPA 2YA1A 4FMVA 4BZYA 1XH1A 2XGBA 4PMDA 4UQAA 2FH6A 2VRQA 3J7HA 2CBJA 1VBRA 1WZLA 5EB8A 1HVXA 2XSAA 1CLVA 2VRKA 4RL3A 3WF0A 2D3NA 1GONA 4MTVA 3UG4A 2V5DA 3W0KA 1V02A 5IXEA 3RM4A 3W24A 3VIFA 4DUWA 4U31A 2EPLX 4XX6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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