1W1TA

Crystal structure of s. marcescens chitinase b in complex with the cyclic dipeptide inhibitor cyclo-(his-l-pro) at 1.9 a resolution
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
496
structure length
496
Chain Sequence
TRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE B
publication title Structure-Based Exploration of Cyclic Dipeptide Chitinase Inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 166
structure length 496
sequence length 496
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1w1tA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1w1tA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w1tA01
5BWFA 2B31A 1JZ3A 3ARUA 5AY7A 4CD5A 3ARWA 5EBAA 3CHDA 3VIFA 3WF4A 3T2QA 2YLLA 2XM2A 3ZT6A 3AROA 1TCMA 3MS8A 3ZOAA 1G5AA 3VM5A 3PZUA 4H7VA 3TA9A 2OSWA 1G01A 5D4YA 1EH9A 3MMUA 3RO8A 4AZGA 3WD2A 4UFLA 4PMUA 1E4IA 1WZAA 3BLKA 2W91A 1KBBA 5CPTA 2GDVA 2FHBA 1BYDA 1NARA 3CTTA 3W81A 2XGBA 1E9LA 1QBAA 3RMEA 1HNYA 2XFFA 8A3HA 2QF8A 4Y7EA 3J7HA 2D3NA 2XSBA 1U33A 4W84A 1E70M 3RJYA 2WMJA 2D1ZA 3DYMA 4UFMA 1IZJA 1PX3A 1WO2A 2YL8A 2ZX6A 3GNPA 5FCZA 4N42A 3WL0A 3OZOA 5E0FA 3OGVA 1UWRA 1XSIA 2EBNA 4UZSA 2J7CA 3ZM8A 5AC4A 1I75A 1JZ2A 1PAMA 4AD2A 1H2JA 2ZUMA 1S46A 5JUVA 3UETA 3WH5A 3MKKA 1EA9C 1B3WA 3AI0A 4FK9A 5A69A 4D6EA 1XRVA 5A8PA 4W7UA 3U5UA 2WVTA 1CXEA 4W87A 4ZEPA 3RM4A 1CIUA 1EQPA 4D6IA 1D3CA 1MXDA 2J7DA 2JIEA 5BXRA 1FH7A 3CZJA 4MB4A 1BYAA 1IV8A 1UKOA 1HF6A 1XD1A 4U33A 3MSDA 2EQDA 3AMKA 1D2KA 3WQVA 5CPQA 1W1PA 1UH4A 5LYRA 1E15A 3VD3A 3B9DA 4QAWA 4A3YA 2RGMA 3RILA 3EBVA 4C7DA 2WKLA 1CZ1A 4WKAA 4D6CA 3UCQA 2VRQA 3WD4A 2VZUA 4H2CA 1E43A 1IZKA 2DGAA 3WEOA 3CUJA 1UH2A 1UG6A 1UYQA 1HKKA 1CNVA 2E3ZA 1VBRA 1B2YA 1HN1A 1QW8A 2JF7A 4JFTA 3EMCA 4ACZB 3SCOA 4DM1A 1J0JA 1ODUA 1XV8A 3MUIA 3GZAA 5GPRA 5JIPA 3EDEA 4UNIA 4EKJA 1C91A 3CMGA 4P7OA 5BXSA 4S3JA 1XD0A 5A6LA 4PMOA 3MO4A 1MFUA 4F8XA 3A4AA 3GNOA 1MYRA 1TA3A 2UY2A 4PSRA 1BGAA 1EOMA 4FLSA 3WNKA 1WB0A 2PC8A 3B9AA 1JIBA 4BZYA 3IJ8A 3WF3A 1GONA 3MUZ1 1ESWA 1V0NA 5ECUA 1QPKA 2W67A 3K1DA 4L4PA 1TA3B 4OUEA 2PWHA 3CUGA 5C8BB 1C90A 2EO7A 2VOTA 4A3HA 1UR0A 4BQ4A 5JBFA 2XWDA 3CUFA 2E9MA 1O7AA 2ESCA 5E09A 3PZ9A 1W91A 1DTUA 5A3HA 4PYSA 4ZXOA 4XZWA 5GQBA 2VQTA 3ARPA 3NSMA 3PZOA 3BAXA 1M03A 3WEMA 4OOZA 2D2OA 4OIFA 1KWKA 3F5KA 1H0GA 2OYLA 5A6AA 4AWEA 2WHJA 3PBGA 3WBAA 4R27A 3BC9A 3AHXA 1OD0A 3PZMA 2HVMA 2XWEA 5GNYA 1GJWA 2VZSA 1LLOA 2ZWZA 2XIBA 3F5LA 2DEPA 2PWDA 4CN1A 1GOOA 4JKMA 3A4WA 2FH6A 3FW6A 1M7XA 3HJEA 4IUGA 3WDRA 4ATLA 5I23A 3U5YA 3BAIA 3NUKA 4EK7A 1VENA 3QOKA 3TTOA 2DIJA 3FHAA 5ABEA 2JFEX 2J62A 1HJUA 2EEXA 1VEOA 5A95A 3POHA 2O9OA 4HOZA 4KRTA 1UOKA 4QFUA 1G1YA 2GUYA 2DT1A 1HT6A 3GDBA 3VNZA 3CGTA 4BF7A 4NSBA 4PRWA 2YIHA 4NF7A 3N04A 1RPKA 3PZTA 2GJRA 3CHEA 3AIUA 1CLVA 5E70A 3U7VA 1CGXA 3T08A 1UWTA 1WDRA 1OGBA 1FH9A 5IDIA 1G9HA 3MSGA 1VEPA 5D9NA 4FF5A 1MQQA 3JUGA 2ZUNA 5M5DA 2WMGA 1NM9A 4JL2A 3W28A 4MDOA 3BMWA 3KL0A 3PZQA 1BLIA 2X8RA 1QNQA 2XVLA 3K8LA 4DWSC 2G3MA 2D0HA 2OWCA 1EDTA 4AD1A 5A8NA 4H8UA 4GI8A 3DHPA 1OT2A 2TAAA 1KGWA 3UEQA 2CITA 2DPEA 1V0KA 1GNXA 5M03A 1ISYA 1MWOA 3N11A 2GK1B 3VINA 2Y4SA 2CNCA 1W9XA 5I24A 1DWJM 2QPSA 2WVUA 3SUTA 1ZB5A 1E3ZA 4MB3A 2NT0A 2J7BA 2XGIA 4PMDA 4AIUA 1KR1A 1XCWA 4UFIA 3WQWA 4H8HA 4J3WA 3WQ6A 4F66A 1JD7A 5A6BA 4UQCA 1DHKA 4KRUA 1P6WA 5HNNA 3I3DA 3BCDA 4D72A 5I77A 2MANA 5IFPA 3QHNA 1JAKA 4PEEA 5CZKA 4W8AA 4MNLA 3ZQ9A 2QLYA 1GVIA 4XV0A 5CJ5A 1HKJA 3WMSA 2FHFA 3GH4A 2YA0A 4YN5A 1GHSA 4JKLA 3CZKA 2ZX8A 1QVBA 3WQ8A 4UQDA 4B15A 1KQZA 4W8BA 1CBGA 3AOFA 4C7GA 1GVYA 2WPGA 3W29A 2V3EA 2NW0A 4DWSA 1UD8A 5I6SA 1GHRA 1ODZA 4LYQA 4IPNB 2QHAA 2UY3A 1OIMA 3G6LA 5AYBA 4GI6A 4W85A 1SYTA 2Q8XA 2V5DA 4D1IA 3ZR5A 3WDPP 3PN8A 4UFKA 1JYXA 2VUYA 1G0CA 3I3BA 2BVYA 2XG9A 1E71M 1UWSA 1JNEA 1WDPA 2CKRA 4AISA 5HPOA 2XHYA 1UD3A 3WD0A 2J7FA 1D7FA 1QNPA 4ZXLA 1E0VA 5FL1A 4JCLA 1JDAA 2WSPA 4M24A 3BMVA 5DFAA 3NSNA 4B3KA 1VAHA 1VRXA 3BAKA 1E6RA 2V3GA 4LX4A 3AMGA 4E4PA 1ISZA 2ZXQA 3I3EA 3AHVA 2VX6A 1CGVA 4NI3A 5FOOA 2WAGA 2C8NA 1XHGA 2WW5A 2ZUVA 3W24A 3GTNA 4W86A 1NH6A 3L4WA 2BHUA 3DYOA 1B90A 4BQ3A 5A8OA 3SCVA 2J77A 2OSXA 4FLQA 2PWFA 4PCTA 2WHLA 3VGHA 2Y2WA 1E40A 4UQBA 3VIIA 3FXYA 4RE3A 9CGTA 2A3HA 3DECA 3WF1A 3SCWA 4BQ2A 1ISVA 3MUY1 2D0GA 1X6LA 1GZJA 1V3JA 1E5JA 2VRJA 8CGTA 1M04A 4AZBA 1E6PA 5BCAA 4PTVA 1H3GA 1W3HA 3UR7A 1WE5A 1OIFA 4MPKA 1B3YA 1KBKA 3EDJA 1ZBVA 2V5CA 5HXMA 1QHZA 3WDJA 3AYSA 1XSJA 4GZJA 4MNJA 2XM1A 5FL0A 2VCAA 4TX8A 1GJUA 2ZUUA 2ZOXA 2D49A 3ZJ8A 4M8UA 3TTSA 1KB3A 1CENA 2OWXA 4ZE4A 1O6IA 4AXNA 1KCKA 1J0HA 2FHCA 2VJXA 4OKDA 1HIZA 1FH8A 2E8YA 1FOBA 4HP5A 4A4AA 4F79A 3K8MA 2CIPA 3VX1A 3NDYA 5A94A 4EANA 3MUAA 1EGZA 1NWTA 5DF0A 1E73M 3CUIA 4TTUA 3T0AA 1TFVA 1QOXA 4W8LA 2Y24A 4AD4A 4PSPA 1HJWA 3VIGA 2YKKA 4AY1A 3VMOA 2RTSA 1WP6A 1MW0A 3QOMA 3VGGA 3ARYA 1Q6DA 3VPLA 3VGBA 2IUZA 5HDRA 3BCFA 4U3CA 2PWGA 1V3LA 1H41A 1B3XA 2JE8A 3OB8A 3T0DA 3L4ZA 3WQ5A 2BS9A 3VGEA 5EMYA 4F9JA 4AC1X 2EPNA 3AIQA 2WMIB 3PZNA 3EDFA 1XYZA 1FP8A 2VX5A 2WC7A 1VFFA 3VTRA 1HVXA 1NWSA 1BG4A 3PZIA 1AQ0A 2E0PA 3VD5A 3WH9A 1JYNA 2DSUA 2GJXA 4V27A 3W6MA 4J27A 4GO8A 4B3LA 1W3LA 5EFFA 3UG3A 2BXYA 2XTKA 1QI4A 1RP9A 2BV9A 2GJXB 2WLYA 2YDQA 3PTQA 4JIEA 3WD3A 1QNOA 4JFWA 5I2UA 1CXKA 1F4AA 5A6MA 4WSJA 2EPKX 3VIOA 3W6LA 4Z2LA 5A2AA 1J18A 1ZL1A 4GO9A 1JZ8A 1MFVA 4X0VA 1ECEA 1E56A 1EQCA 3TOPA 1E1FA 2VNCA 1B1YA 1V0LA 3AZSA 5IXEA 4AZCA 2UY5A 1W2PA 3VDAA 4H8VA 3THCA 1CEOA 1JNDA 2CYGA 3L4UA 4QCFA 1HJQA 1W9DM 3UG5A 3UG4A 2WHMA 4AD5A 4AZCB 4U5IA 1QW9A 5BRQA 2ZX9A 5LA2A 2ZXAA 4LYRA 2DT2A 2F8QA 1CYGA 5C70A 3VNYA 3NYDA 2WZHA 3OBAA 1K6AA 2VTFA 3CH9A 4HMDA 4D6DA 4Z2KA 3RCNA 3HN3A 1WZLA 1KFWA 4DUXA 2VX4A 2WM0A 4QLKA 3VDHA 1PIGA 3L4TA 1TMQA 3ZJKA 3IAPA 5BRPA 3RM9A 5D9PA 2FH8A 3D5HA 4E8DA 3GNRA 2ZIDA 4UFHA 2WXDM 4ATWA 4PUDA 3ARTA 2BHYA 3U7BA 3AS1A 3K4AA 5HOSA 2D23A 2JF6A 3CIVA 2Z1KA 2F61A 1R85A 2XFRA 1MQPA 1QBBA 1JGIA 1E6NA 3BAYA 3IK2A 5TD4A 5ABFA 4GQQA 2VMFA 5M3WA 1ZU8A 4LQ1A 4GPNA 4CCEA 4JCMA 3UERA 1V3KA 4DM2A 1C93A 1EDQA 2VCCA 2PF0A 1PJ9A 3AMLA 4HMCA 3VGDA 4CVUA 1CXFA 4TTGA 2JIWA 4PN2A 6TAAA 5ABFB 1FFQA 4Z2IA 1SR0A 1X6NA 4YPJA 1PBGA 3OLIA 2J7HA 1E6SM 1FHLA 3GXFA 1BVNP 1JZ7A 3VMNA 5A6SA 4W5UA 3TONA 4CCCA 4J3SA 2WC3A 3MMDA 1KXHA 2FGLA 5CLWA 1JZ5A 3KL5A 4M56A 5CG0A 1C8QA 3L2LA 1H5VA 3QGVA 1UKPA 2DDXA 4FLRA 3WL1A 2CBIA 2A3BA 5FKYA 5LA0A 3MANA 2VCBA 3VIMA 4CU7A 4PTMA 1LF1A 2D0FA 4CD4A 3GYCA 1R86A 3WENA 3NCOA 3VDBA 4BQ5A 1MW1A 1UA3A 2AOSA 4NZCA 2UY4A 3SCQA 3VIPA 1E6ZA 4KGLA 1J9YA 4CVWA 3THDA 4MAVA 2W63A 1LWHA 1BTCA 1J0YA 1PX8A 2PB1A 1UWUA 3U57A 4GIAA 1V3IA 3B9EA 2C0HA 1F4HA 1TG7A 2W66A 4RE4A 5I5RA 3AIVA 1ZJBA 3LMYA 1LL6A 4JKKA 1BYCA 1FP9A 3GXMA 2WZEA 3AQUA 1J12A 2CHNA 4AZIA 3IJ9A 4M82A 3ZSSA 1E72M 1EIBA 1UKSA 3AMCA 4UZUA 1QI5A 2EJ1A 1UR1A 3N18A 1MXGA 5JBDA 2ZX5A 3CHFA 1B0IA 3EDDA 4NRSA 3KEHA 3ZIZA 4TXEA 2ZX7A 2BHZA 3AHZA 1JL8A 3ARQA 2YOCA 3WMCA 2IXUA 1C8XA 1BF2A 1UKTA 2CBVA 4M80A 1LG2A 1BAGA 3N15A 4WK9A 1DWFM 1QHPA 1VF8A 1CWYA 1C8YA 1NWUA 5CLTA 4U5KA 5DMYA 4HU8A 4DUWA 3DC0A 2CERA 1UR4A 1W32A 1B30A 3T0BA 2V38A 4J3VA 4HTYA 1E1EA 2WNWA 3WELA 1R7OA 3WFZA 5A2BA 4W7WA 4MTVA 1ISWA 1AIWA 3S6TA 1UD4A 3BAJA 3WH7A 2O9TA 3OG2A 3CZLA 4QCEA 1TZ7A 1NP2A 1H4PA 3AICA 3A6OA 4RL3A 1UD2A 1WZKA 1V6YA 2VRKA 4AMCA 1RH9A 3NIYA 1E5NA 3ZT7A 4F9DA 4OZOA 2VVNA 1GQLA 3BSGA 4AZHA 1GCYA 3EMZA 2AMGA 4KH2A 2QV4A 3O9NA 4H41A 2J8FA 5DO8A 4AEEA 3VU2A 1VFMA 1FHDA 4MB5A 4XX6A 4P8UA 1TVPA 4OOUA 4ATDA 2J47A 1EHNA 2WBKA 2YLAA 4QP0A 4N0RA 4QLLA 2XFYA 1HKIA 2O9RA 1MQRA 1H49A 1C3FA 3EMQA 4B9YA 4ACYA 1UQYA 1VJZA 5E6ZA 1M53A 2GFTA 4GINA 5FIPA 4CD8A 4ZE5A 2WWCA 1WZMA 2AAAA 1LJYA 5A8MA 3RJXA 4UTFA 3SCUA 3AIBA 3T09A 1FFRA 4FMVA 1EXPA 1JG9A 2WVVA 1J0IA 4LYPA 7TAAA 4P7QA 3VUPA 4DWSB 1PEZA 2E8ZA 1UD6A 4J3TA 3EDKA 3GXIA 4EAMA 1K9FA 2ZXBA 2WVSA 1V6XA 4JZ5A 3FNDA 1B9ZA 3AS3A 5JBEA 3PZGA 1EO7A 1NOFA 1H1NA 2XVKA 4LXFA 1Q4NX 2WSKA 4PBGA 4V2XA 1EO5A 2CCRA 2F2HA 3GM8A 1W9VA 3SCSA 3WDIA 4AD0A 2DT3A 3CZEA 4AZ6A 5JH8A 1A3HA 5D8ZA 1H11A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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