1W3JA

Family 1 b-glucosidase from thermotoga maritima in complex with tetrahydrooxazine
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
443
structure length
443
Chain Sequence
KKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEKEEDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPDAPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE
publication title Structural, Thermodynamic, and Kinetic Analyses of Tetrahydrooxazine-Derived Inhibitors Bound to {Beta}-Glucosidases
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 182
structure length 443
sequence length 443
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2004-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w3jA00
1X6NA 3AQUA 4WJXA 1ISZA 1JGIA 4OKDA 2D24A 3KZSA 4S3KA 5CJ5A 1UQZA 4TXEA 4WKHA 1UR1A 5DFAA 2VCAA 3L2MA 4MAZA 2CHNA 5HDRA 4EK7A 3IJ7A 1V0KA 3SUTA 4J27A 2DDXA 1KCKA 3CUFA 2V5DA 2YL5A 3W29A 4WF7A 1ZBVA 4QCFA 2QMKA 4CCCA 2D23A 5A3HA 4XZWA 3BLKA 4U3CA 1MFVA 2W91A 4GIAA 1MQPA 4LXFA 2GJPA 1HKIA 2J75A 5CZKA 4B9YA 3BAKA 3MSGA 3CUIA 5A8MA 1CIUA 4D6EA 2RGMA 2VZUA 2XSAA 1ZBCA 3WMBA 4BQ4A 4PN2A 1KXQA 4L4OA 4CD8A 4CN6A 1NOWA 3MKKA 2ZXQA 4JHOA 1HIZA 1E71M 4GO9A 4H8HA 3BAYA 2EQDA 4CGTA 4LYRA 1W3KA 3VX0A 2WCSA 9CGTA 1KCLA 3M6DA 4PTMA 2J7CA 1J18A 1VBUA 2WZHA 4P7RA 3WBEA 3ALGA 4QCEA 1SFSA 4W7VA 4B3KA 3TOPA 1IT0A 2XIBA 2PWDA 4AXNA 2YDRA 3U5UA 4F79A 5E0CA 4Q7NA 1C7SA 2CHOA 1JXJA 1RP9A 1BHGA 1BYBA 3RO8A 5BYWA 3VILA 3OLGA 2CPUA 3LPFA 4PMVA 1AQ0A 4ACZB 2YBUA 1FFRA 1M04A 2DT0A 4X0NA 1K9DA 1LL4A 2PWEA 4UOJA 3N18A 3VPLA 3O9NA 1XSKA 1XH2A 2VTFA 2FH6A 4HMDA 1BVNP 4R27A 1JAKA 3WNKA 4A3HA 4W88A 1F4HA 2XVGA 3GZAA 3GBDA 1CGUA 4EE9A 2JF6A 2O9OA 3PN8A 1E3ZA 4GZEA 1E1EA 3OBAA 2WKLA 1GPFA 3SUVA 2GFTA 4P8UA 2J62A 1UD8A 2WVTA 3EDKA 1HXJA 3TP4A 1QNOA 4Y7EA 1GJWA 4JKKA 1GONA 1TVPA 1WB0A 2DEPA 1J0IA 3G6LA 4PUDA 3CUGA 3AJ7A 2WHJA 2WANA 2G3IA 1EQCA 3RDKA 4AZHA 1Q6CA 2AMGA 2V3DA 2OSYA 2YL8A 1B3VA 5A6SA 4DWSB 2JEPA 4KH2A 2NW0A 1N82A 2J8GA 3MV11 4DM2A 3NSMA 2WHLA 1EQPA 1NQ6A 5I6SA 4BCEA 1EO5A 1DEDA 2BXYA 2TAAA 4AY1A 1QI3A 2WVSA 1HJUA 2QMJA 2W5FA 4XB3A 5I3DA 1XYFA 5D9NA 4ZXLA 1W1YA 3K8KA 5I2UA 1MQRA 1CXKA 3CO4A 4YHGA 3NUKA 1W9VA 3WH5A 4NZCA 2DIEA 3EDEA 1LG1A 2VO5A 3WD4A 5JBFA 1JNDA 1OD8A 4DWSA 2YL6A 1KGWA 4AZ7A 2EPLX 2C7FA 3ZSTA 4AEEA 4FLSA 1GQKA 1EOMA 2PWGA 4M80A 5D9MA 2D20A 3W27A 1DWFM 1HT6A 1ECEA 2W63A 4Z2KA 1OIFA 4WK9A 5A94A 3SCVA 4D6CA 1IZKA 1MW3A 2ZUSA 4B3LA 4C7DA 3VIOA 2BXZA 1QHPA 3SCPA 2YLAA 1UD6A 3NCOA 1VRXA 3OA5A 1VAHA 3VVGA 1AMYA 2DGAA 4CCDA 3NDZA 2CKRA 1PZ2A 3AIBA 3WEMA 4AZ5A 1E6ZA 1E6PA 1E73M 2VRQA 5LA0A 1KXHA 2W66A 4TVCA 1ISYA 5LA1A 2OLHA 1WZAA 3WF2A 1MFUA 1MVYA 2WMJA 1B2YA 3HN3A 3VIFA 4J3TA 3K8LA 4UFMA 2JE8A 3VIHA 1R87A 3O2LA 3WUFA 1ITCA 2ZIDA 1TE1A 1E6NA 1LL7A 2VRKA 4BQ2A 3A4WA 3CHCA 1K6AA 3WMSA 4LYPA 4JFTA 5IFPA 3GDBA 5IHSA 1PEZA 4DM1A 2EPNA 1QHZA 3ARYA 1XH0A 1PX3A 1QVBA 2PBGA 1E1FA 3POHA 1V0NA 4ATLA 3AMCA 5AC4A 3CZJA 1BYAA 1H2JA 4Z2IA 2WHKA 3N9KA 4H8UA 4D1IA 1J10A 3MANA 4UQDA 5I23A 3ZT6A 3ZT7A 1DTUA 1UWTA 2CERA 1Q6EA 3KL3A 1HKJA 1CLXA 2BHZA 4CU8A 3TTOA 2BY1A 2A3AA 1LQ0A 1QI2A 3L4TA 4TX8A 3BSGA 2BVDA 2D3LA 3WQ4A 1JD9A 5CLTA 2V3GA 4FLRA 4WSKA 1WDPA 1OGSA 3AIUA 1UWUA 2D2OA 3BLPX 4KRUA 2YA2A 3EMCA 3AXHA 2EPMX 3VD3A 1Q6DA 2UWFA 3MS8A 4W5UA 5A8OA 4M1RA 4TTUA 3ARQA 3MUY1 1IZJA 4AYSA 1QNQA 3SURA 1HKKA 2JIEA 5C70A 5I77A 1XCXA 5A6KA 2J7BA 1J01A 3AYRA 5DT5A 5A6LA 1FFQA 1KGXA 3AS3A 3N1AA 5D9OA 4GI9A 2XVNA 3EDFA 4KGJA 1SR0A 3BSHA 1WNOA 4JZ5A 5KEZA 3NSNA 3SCWA 2VOTA 1NWTA 3FY1A 1GHSA 3WQ6A 2ZX5A 1JNEA 1EHNA 3PZTA 1H3GA 5BWFA 2VZVA 1F4AA 2WWDA 1E40A 3FHQA 1H41A 4J3VA 1W3LA 1R86A 1GZJA 4MADA 2MANA 3WBAA 4OBRA 2Q8XA 2G3NA 1W1TA 2WLZA 4F9DA 3VDHA 2CEQA 4JKMA 3ZMRA 1GUVA 2VVSA 3ECQA 4D6HA 1QHOA 4XUYA 7A3HA 1HF6A 2DH3A 1ESWA 1GVYA 3EDDA 2YOCA 4E8DA 2Z1KA 3PZUA 4H2CA 1J12A 1G94A 3MMDA 5LYRA 3QHNA 3A3HA 3VM7A 4AD0A 1GOIA 4P7QA 3VGEA 5HXMA 5JIWA 2DSVA 3GXFA 2WXDM 2XTKA 1ISXA 4MAVA 4BA0A 4BS0A 3UR7A 5I24A 5IHRA 4M82A 4P8WA 4J7RA 4RL3A 4GQRA 4W85A 1U33A 3JUGA 3F5KA 3IJ9A 1XHGA 4Z2HA 1IV8A 2Z1SA 4MNLA 1S46A 2XSBA 2Y2WA 3W38A 1EO7A 1UKQA 4UQCA 3RM4A 1EDTA 1W1VA 4HOWA 1PIFA 3AXIA 3W37A 2CNCA 3B9DA 4IPLA 3VMNA 4J3SA 5C8BB 3SIMA 2XWDA 2CETA 1GQJA 1NP0A 3WNOA 1SYTA 2V5CA 5BXSA 2ZX7A 4AD5A 2WSPA 5GPRA 2VQTA 3AICA 2IUZA 2W62A 3PZMA 2VC9A 5HNNA 4Q22A 3VIPA 2GDVA 2QPUA 1JYVA 1KXVA 4RE3A 4YHEA 1TMQA 3GTNA 3AS2A 1H11A 4CD7A 2Y24A 5ECUA 1VFOA 2WHMA 4P8XA 2WAGA 5CLWA 2WWCA 3KE0A 1JDAA 4K68A 3K4DA 1EXPA 3VIMA 3GYCA 3QHOA 1Y7VA 3BMWA 4J3XA 1LG2A 1J0KA 1L0PA 1G5AA 1J0HA 1UD2A 4V27A 5CGMA 4D71A 3CHEA 3MUIA 1ZS2A 4QLLA 3UG4A 1FH8A 8CGTA 3TA9A 1KXTA 2VX7A 2G4FA 4E4PA 2WCGA 3SUSA 4URIA 5JBEA 4MPKA 1U30A 2WZEA 1QNSA 4GZIA 3BAIA 1TVNA 2GJXB 2OSWA 4R5EA 4H41A 1JZ8A 1SMDA 3RCNA 1CDGA 5HPCA 3WEZA 1OWQA 5A95A 3M7SA 4CD4A 3AZTA 5E9AA 1TG7A 3DHUA 4WIWA 4PMXA 4ZXOA 3RM8A 3VIGA 4N42A 3RPMA 2OYKA 4AISA 1NP2A 3II1A 1LJYA 2PC8A 4Z2JA 1E4LA 5D4YA 1WZKA 3BAJA 5BXTA 2Y8VA 5D9PA 4KRTA 1WO2A 1A47A 3DHPA 1VBRA 4CVUA 3ARWA 3L4XA 4AIUA 3GM8A 1UH4A 1VJZA 1TFVA 2D0FA 2BV9A 5I79A 4D72A 2VI0A 4DUVA 1CBGA 4B15A 4AIEA 2QHAA 2X2YA 5BRPA 2WC4A 1GOOA 2E9LA 2FGZA 4EANA 3ARTA 5JBDA 1J11A 1Q6GA 2BY3A 3BH4A 2ZXAA 2CIPA 4AD2A 1PJ9A 2Y5EA 4HOXA 3BCDA 1VEPA 5ABGA 1K9EA 1V6VA 1W9UA 3AHZA 3SCSA 1WAWA 4MDOA 3WFZA 3FW6A 3BAWA 2XM1A 1B0IA 4LX4A 2ZUWA 3A47A 1CEOA 6A3HA 3U7VA 3WIJA 4GZJA 1JDDA 2VCBA 3ARXA 3MUZ1 3VDCA 4M24A 4U5IA 1AQMA 1CXEA 4UFKA 8A3HA 5I78A 1G0CA 4CU7A 1BGAA 4PTWA 5BXRA 3VGDA 1HL9A 2VQUA 2J7HA 4S3JA 4D6JA 1KFWA 4AZ6A 1LF1A 3VNYA 1E5NA 1Q4NX 4KWUA 1JF5A 4AEFA 2QF8A 4UQ9A 3PZQA 2O9PA 4ML4A 2ZX8A 1DWJM 2D0GA 3RJYA 3B8SA 1HNYA 1PPIA 3T0AA 3DYMA 1EA9C 1H4PA 1W9PA 1GCYA 1OINA 1WDSA 1CGWA 2GK1B 1OD0A 1LLOA 1M7XA 3F5JA 1UA7A 4BF7A 1E72M 2CBVA 3GH5A 3DC0A 1GQIA 3CUHA 5CXPA 4MDPA 2AOSA 1HJQA 1E15A 4ACZA 4WLCA 4MTVA 1JAEA 3WDIA 4C7FA 2JFEX 2V3FA 4FF5A 4YPJA 2EXOA 2HVMA 3WNMA 3CGTA 5E6ZA 3WELA 3AHXA 3RILA 3CMJA 1BTCA 1UR2A 3L4ZA 3VX1A 3GXIA 4HA4A 1WP6A 2GDUA 1XC6A 4H8VA 3SCNA 1C7TA 3VTRA 3WNNA 4D1JA 5E70A 3RMEA 3ZJKA 1EOKA 3OZPA 4W86A 4HA1A 3VINA 5A2BA 5FIPA 4M81A 1E4IA 3T0DA 2BHUA 5FKYA 4PSRA 5CPSA 1CPUA 4AZGA 4HPGA 2O9TA 4B16A 3WF1A 5ABFB 2JEQA 1LWJA 2DT3A 4PEEA 2ZUNA 3FN9A 4MB4A 7TAAA 1PBGA 4IISA 4GI8A 2QLYA 3CH9A 1G01A 3PBGA 4PMQA 3UEQA 1UKPA 4U2YA 2EPKX 1G9HA 1FH7A 3PZNA 4PMZA 1M03A 3WUGA 3AHTA 4U2ZA 2ZX9A 3DYOA 3GXMA 3WH6A 1QW8A 2XFFA 1HKMA 3UESA 4QP0A 2ZXBA 4NI3A 4ZENA 2XM2A 1FA2A 1GOKA 1XYZA 1GVIA 2W61A 3WD1A 1E43A 3MUAA 4P7LA 2VJXA 4AC1X 3L4WA 2VX6A 3VKKA 1WZLA 1B3YA 1QOXA 4X0VA 2CBUA 2ZX6A 3LPGA 2DSKA 2NSXA 4D6GA 2YBTA 4CUCA 1B3ZA 1MQQA 1QI0A 1GQLA 5HBFA 3CZGA 1UR4A 1WDRA 4GI6A 1JZ5A 3AIVA 3BAXA 4W84A 4AMCA 1BQCA 2EBNA 1GORA 5CSYA 3VDAA 5CSUA 1KQZA 1VENA 5D8WA 3D5HA 2WM0A 3CMGA 3T2QA 1QI4A 1NWUA 5A69A 2WCAA 3W82A 3ZQ9A 1TCMA 3NYDA 1JFXA 1NOFA 1ZU8A 2F61A 4HOZA 1FOBA 1I1XA 1X6LA 4ZEPA 1UWIA 1MW2A 2CITA 2XWEA 4GPNA 3ZJ8A 1QNPA 4JFSA 4V2XA 2AAAA 1JD7A 3QOMA 3SEPA 1TZ7A 2VNCA 1XRVA 3N04A 2E4TA 4PMDA 3TTQA 4CN1A 4OIFA 1HJVA 2NT0A 1UD4A 2WZIA 2ZUUA 1EGZA 2WVVB 4FLQA 1QNRA 1V6YA 4W7WA 4PMOA 2OSXA 3AIWA 4MNJA 4QLKA 3AMGA 3E1F1 4Z2GA 3L4YA 3L2LA 2HISA 3VD4A 3CHDA 5F7UA 3L4VA 5TD4A 3WMCA 4CKQA 3VGGA 2J7EA 1DHKA 4W8AA 3W24A 1Q6FA 1NWRA 3F5LA 1W3JA 5CG0A 4TVUA 5M17A 3VGFA 1ODUA 1B90A 1XD0A 1A3HA 4DWSC 1UR0A 4QDMA 3ZT5A 5DT7A 1CGTA 4AW7A 2BY0A 3CHFA 2UY5A 3CBWA 4D6FA 2E40A 2CESA 2IXUA 5BRQA 3VOCA 3VDBA 2F2HA 3VD9A 1HX0A 2G3MA 3M07A 2XFRA 2Y4SA 4EKJA 1ISVA 1OBAA 3FAWA 3UETA 3ZO9A 1BYDA 4GINA 1E55A 4C7GA 3CZLA 3QOKA 5A6BA 1EDQA 3THCA 5DO8A 1HJWA 4NRSA 5AC5A 1MYRA 4BQ3A 4U3AA 2QV4A 3F4VA 1UHVA 3FAXA 1TA3B 4CD5A 4LGXA 4P7NA 3SCOA 4PBGA 1DWGM 3SCTA 2WK2A 4F8XA 3FXYA 4CN4A 4TTGA 2YJQA 2EO7A 4GKLA 4KMQA 5A6JA 1RD6A 2XGBA 3W53A 2VURA 2WB5A 4UFIA 4UFJA 5FL1A 3VO0A 3D3AA 3WNLA 1E6QM 3M46A 3K4AA 3RIKA 5BROA 1UQYA 2B31A 3VMOA 1JZ6A 3CUJA 4MB1A 2O92A 3ZM8A 2DH2A 3UERA 1ISWA 1JXKA 3PTMA 1CGYA 4HTYA 2X09A 1JI1A 2D22A 4TOQA 3LPPA 1C92A 3ZR6A 3OGSA 1JZ7A 3PZ9A 1V02A 3AOFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1X6N A;  3AQU A;  4WJX A;  1ISZ A;  1JGI A;  4OKD A;  2D24 A;  3KZS A;  4S3K A;  5CJ5 A;  1UQZ A;  4TXE A;  4WKH A;  1UR1 A;  5DFA A;  2VCA A;  3L2M A;  4MAZ A;  2CHN A;  5HDR A;  4EK7 A;  3IJ7 A;  1V0K A;  3SUT A;  4J27 A;  2DDX A;  1KCK A;  3CUF A;  2V5D A;  2YL5 A;  3W29 A;  4WF7 A;  1ZBV A;  4QCF A;  2QMK A;  4CCC A;  2D23 A;  5A3H A;  4XZW A;  3BLK A;  4U3C A;  1MFV A;  2W91 A;  4GIA A;  1MQP A;  4LXF A;  2GJP A;  1HKI A;  2J75 A;  5CZK A;  4B9Y A;  3BAK A;  3MSG A;  3CUI A;  5A8M A;  1CIU A;  4D6E A;  2RGM A;  2VZU A;  2XSA A;  1ZBC A;  3WMB A;  4BQ4 A;  4PN2 A;  1KXQ A;  4L4O A;  4CD8 A;  4CN6 A;  1NOW A;  3MKK A;  2ZXQ A;  4JHO A;  1HIZ A;  1E71 M;  4GO9 A;  4H8H A;  3BAY A;  2EQD A;  4CGT A;  4LYR A;  1W3K A;  3VX0 A;  2WCS A;  9CGT A;  1KCL A;  3M6D A;  4PTM A;  2J7C A;  1J18 A;  1VBU A;  2WZH A;  4P7R A;  3WBE A;  3ALG A;  4QCE A;  1SFS A;  4W7V A;  4B3K A;  3TOP A;  1IT0 A;  2XIB A;  2PWD A;  4AXN A;  2YDR A;  3U5U A;  4F79 A;  5E0C A;  4Q7N A;  1C7S A;  2CHO A;  1JXJ A;  1RP9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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