1W3KA

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in complex with cellobio derived-tetrahydrooxazine
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
publication title Structural, Thermodynamic, and Kinetic Analyses of Tetrahydrooxazine-Derived Inhibitors Bound to {Beta}-Glucosidases
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 119
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2004-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w3kA00
2G3JA 4PTWA 1J0JA 1OD8A 3BAKA 4UFJA 5IDIA 1VJZA 2WWCA 3GZAA 3O2LA 3PZTA 1E1EA 2NT0A 4JFVA 1KFWA 1Q6DA 2XGIA 5FIPA 7A3HA 1ISVA 1KQYA 1V6UA 1TG7A 3RCNA 3FXYA 2PI6A 3GXFA 4UFLA 4J3WA 2J8GA 3VMNA 1ZJAA 2WMIB 3VILA 4HOWA 1UD6A 3RM4A 4Z2IA 4W8AA 3W4RA 1W3HA 3GXMA 3L4WA 3WD4A 4PMZA 4UOJA 4MNMA 2VQUA 3UG5A 1K6AA 2XSAA 2DPEA 1WDQA 1JFHA 1LJYA 3OG2A 3BH4A 1UR8A 2CYGA 1JI2A 2BXZA 3VGBA 2PB1A 3CHDA 1FFQA 5BWFA 1GJUA 3EDJA 2WHLA 4M82A 1HF6A 2GFTA 2WK2A 1NARA 1UWUA 1KXHA 5HOSA 1C7SA 1BSIA 3THCA 4JKKA 2PWGA 2EO7A 4A3HA 3CMGA 1BPLB 4UFKA 1GQLA 2WMKA 4F66A 3T09A 1V3IA 2NT1A 1QNRA 2QPSA 1UKOA 3MV11 2XIBA 2WCAA 2VX7A 3VIPA 4UQCA 4PUDA 4NRRA 1QI3A 1W32A 3W6MA 1B3ZA 1DWGM 1VBRA 4AZHA 1HNYA 1HXJA 3SUUA 4CVWA 2XFYA 4J28A 1EQPA 3WEZA 4D6GA 3CHEA 3QOMA 1WDPA 1EHAA 1E5NA 4MAZA 4QFUA 4AC1X 4CU7A 1CGYA 5E6YA 1E6SM 1W9UA 3ZR5A 4BCEA 4DWSA 1FFRA 4P8VA 2O9TA 3N15A 2ZIDA 1GQJA 2XVNA 1JYXA 2GJXB 1E6XM 3M46A 1TUXA 1LL4A 2BHZA 3OZOA 1R7OA 2UY3A 4JFTA 4WKHA 2QF8A 4AD5A 2DSZA 1Q6GA 1W9DM 1HJXA 1UWIA 2OWCA 4WSKA 4MJ4A 1LG2A 3EBVA 1QI5A 1TE1A 4E2OA 1GVYA 4AIOA 2WHKA 3W38A 1IV8A 2D0GA 4HTYA 2Y2WA 3SCRA 3WQ6A 1GHSA 4D1JA 1L0PA 1XHGA 1UR4A 3AHZA 2JIWA 3KWXA 2PC8A 4D6DA 5CQ1A 3EMCA 1MW2A 2WYSA 4HMCA 1RPKA 1K9EA 4AZGA 3VGGA 2VCBA 4XB3A 1MW0A 5A1AA 2WC3A 1XSKA 4Y7EA 1KR0A 2F61A 3WQVA 4PCTA 4W84A 5EB8A 4AZCA 4WKAA 1ZBWA 1XH0A 1J12A 3WUBA 1OD0A 2W62A 2W91A 2YOCA 1EOMA 2UY2A 1UWSA 2GSJA 4W8BA 1E1FA 4W7VA 2ZWYA 6TAAA 1UD4A 1UR9A 5AYBA 2J78A 3G6MA 1ISXA 1DP0A 1L8NA 1UR0A 2E4TA 4MDPA 2J4GA 1Q4NX 2XM2A 5JBFA 4DM2A 3AMLA 1ZL1A 4MTVA 4WK9A 2O92A 3WH6A 1PJ9A 1OGSA 3VDHA 3IK2A 1FA2A 4BQ2A 4Z2GA 4ACZB 1MQPA 5CPSA 3GH7A 1VFFA 3IANA 1GW1A 3U7BA 1JZ2A 2WZIA 2E9LA 2E0PA 3AXXA 4P8WA 1KXTA 4LXFA 2WVTA 4H8UA 4IISA 3SURA 3MUIA 2XWEA 4UOQA 2VOTA 4J3VA 2D3LA 2CITA 1OCQA 3CHFA 3CZGA 3M07A 3RO8A 1HJQA 3N11A 5D8ZA 3WDJA 3N04A 1R86A 1CXLA 3CLWA 2BY1A 2VRKA 1PIGA 1S46A 3ZR6A 1WPCA 2GJPA 5A94A 1V6WA 1BGAA 2RGMA 4V2XA 3KE0A 4AIUA 4KMQA 4RE2A 3FHAA 1QI4A 3VU2A 3BAIA 2W63A 4AD0A 1W1TA 3OLDA 2J25A 1WAWA 3ZJ6A 3FAXA 2DEPA 4UFIA 3G6LA 3EDKA 2BXYA 4XUYA 1IT0A 3I3DA 5I0DA 1D3CA 1LF1A 5FCZA 2C0HA 2XSBA 1OT2A 3NYDA 4QLKA 3WMCA 1LWHA 3VD3A 1BYAA 3TTYA 1JYNA 1W9XA 3T0AA 5HPOA 2YL8A 2DIEA 4AZBA 3U57A 4B16A 3TTQA 1TA3A 1B3WA 3VUPA 2PBOA 4PMXA 1KR1A 4EANA 2F2HA 3WF1A 2C8NA 1B9ZA 5D4YA 5DO8A 3WNMA 2DDXA 3DHPA 1MWOA 4H8HA 4HOXA 2D22A 8CGTA 5A8OA 5HNNA 2VUYA 2ZUTA 1EOKA 2D24A 4CU6A 2XM1A 3SCWA 3U5YA 2X0HA 4X0NA 2XFFA 1W9BM 5A6MA 2FHBA 4H04A 2PBGA 4ZE5A 1FP8A 2BVTA 4X9YA 3L4ZA 2MANA 2FHFA 4XX6A 1HIZA 2IXVA 1M53A 4ZFMA 4JCMA 1JGIA 1VFMA 4W5ZA 2QPUA 2G8ZA 2CESA 3FNDA 3RILA 5E9AA 1JI1A 3WBEA 2EPLX 3WH5A 3N12A 1W1PA 4UQBA 4GZJA 3UR8A 5FL0A 2YDSA 2VRQA 3MO4A 3VGDA 1FP9A 3W25A 4H2CA 5HBFA 1HVQA 4J3TA 4OIFA 1B3YA 2CPUA 3BC9A 4UR9A 4PBGA 2WWDA 1B1YA 2E40A 3THDA 2RGLA 1UKTA 1W1VA 1SR0A 1JZ3A 3AXIA 2XIIA 1E0VA 1NOFA 3ECQA 5I78A 1X6NA 2V5DA 3AI0A 5I77A 2VO5A 3WFLA 2OSYA 3A4XA 2WPGA 4AISA 5JIPA 5M17A 3WF4A 4GZEA 2J77A 2VZUA 4CUCA 3VIJA 5A2BA 3K8LA 2D23A 1C90A 3BAYA 1XCXA 2ZUNA 3T0DA 2JEQA 4GI6A 1DWAM 1Q6CA 4D6JA 2WM0A 4E8DA 5A6BA 1H4PA 1GJWA 2FHCA 5E6ZA 2WCSA 3IJ8A 5ABEA 5CG0A 2OSXA 1VRXA 4M24A 3K4AA 4KH2A 3VMOA 3VGFA 4GI9A 1WKYA 1D2KA 4D6IA 3QHMA 3ZT6A 2BVDA 5A3HA 1EGZA 3VDBA 3HMCA 3MSGA 1O7AA 1E4NA 1UUQA 4WJXA 4FK9A 3UCQA 5E0CA 2XPKA 4JCLA 3OGRA 2J7CA 2XG9A 1J0KA 1XH2A 4HA4A 4UZSA 2CKRA 3RM9A 4H41A 3RJYA 4AD1A 4RE3A 1NWSA 1E0XA 2J7GA 2UY4A 3ALGA 5M3WA 1KCKA 2ZE0A 3K8MA 1DWHM 3WDIA 2XUCA 3WNOA 3PZUA 1RP9A 3CZ8A 1JFXA 1FHDA 3FY1A 3AROA 4J3XA 5C8BB 1UZ4A 2OSWA 2J47A 3OGSA 2V5CA 4M1RA 2GJRA 1QVBA 4S3KA 1KQZA 5BRQA 1E40A 3AMKA 5GPRA 2E9MA 1C8XA 3DHUA 4GZIA 4AIEA 4HZ7A 4Z2JA 3CMJA 4BZYA 5C71A 1JZ5A 5A6AA 3DYMA 3WNNA 4UZUA 1YQ2A 3WIJA 3CO4A 5BYWA 1B2YA 2E9BA 5D9NA 3K46A 2WMJA 4F9DA 2OWWA 3A6OA 3KZSA 1CXEA 1HN1A 2VX4A 3RJXA 3QHNA 2DT1A 5EBAA 1JAEA 2WVVA 2YLAA 4DWSD 4GO8A 1E4IA 5FD0A 2TAAA 4Z2HA 2QMKA 3OIHA 5M5DA 1U30A 5A2CA 3M6DA 4P7OA 1H1NA 4RL3A 1GNXA 5BRPA 3WEOA 2VZTA 4XZBA 5AYIA 1NWRA 4QAWA 2CERA 1A3HA 2ZXBA 5CGTA 5CSYA 1GOKA 4LGXA 5CPQA 1J9YA 2YL9A 4FLQA 4AYSA 5A6SA 3VINA 4HOZA 3PN8A 1VAHA 1TFVA 1GPFA 3WQWA 5KZ6A 2VCAA 1J01A 3NUKA 1LWJA 3VNZA 4U2YA 1VEPA 2J7HA 1JL8A 1CGUA 3VKKA 4CVUA 1NWUA 3BAXA 1EHNA 3AIQA 3MS8A 1EDGA 2WMIA 4MNLA 1JYWA 2QV4A 1GONA 3W6LA 3ARPA 3EMQA 1CENA 1OBAA 2VVSA 2IXUA 4HZ8A 1HL8A 3VIGA 2G3NA 5LA2A 4NZCA 1JF6A 2VZOA 2ZWZA 3SUTA 3PTQA 3L2MA 5CZKA 2WVSA 3SUWA 5IFPA 3W26A 1VB9A 1EIBA 2DSUA 3GTNA 3VD5A 2JF6A 1B31A 8A3HA 1GOMA 2G3IA 3VX0A 3MMUA 4CCCA 1AVAA 4JZ5A 1I75A 2EBNA 1XSIA 1GHRA 2OYMA 2V3FA 3N17A 3RPMA 2HVMA 1UWTA 1QW8A 1N82A 1M04A 3EYPA 4JFWA 1UZ1A 5GNYA 2JE8A 2W67A 4OZOA 4P7RA 2J7FA 1MFVA 5EMYA 5BXPA 2BVYA 1H0GA 3ZOAA 1E3XA 4QCFA 1EA9C 1CXHA 3ARVA 1OB0A 3CTTA 1G9HA 2DSWA 5EFDA 1VEMA 3AHYA 1E55A 1KXQA 3CBWA 4TTUA 1H0IA 4XV0A 4DUXA 4FF5A 1BGGA 2WSKA 4PMDA 3RDKA 3MMDA 4UTFA 2WLZA 3GYCA 1OINA 2GJXA 2WC7A 1UD2A 1LLOA 1GUVA 4RE4A 1HKKA 4ZE4A 1V3JA 3S6TA 3UG4A 1PZ3A 5C70A 3W37A 1WZAA 4M29A 3PZNA 3WFZA 1W9VA 1UD8A 4UFHA 4LYPA 1TVPA 3TTOA 2OWXA 4Q7NA 4PN2A 1OT1A 2Z1SA 1XD0A 2CETA 4AD2A 1CPUA 2A3CA 1BFNA 3ZT7A 4JKMA 1SMAA 4CD6A 3W81A 5BROA 3N13A 1IZJA 3WD1A 1JD7A 4NSBA 1JYVA 1JF5A 4W8LA 3CUFA 5A6KA 2XHYA 1H11A 4MADA 2YDRA 2W4XA 4A3YA 2ZUMA 5ABFB 1J0YA 2GK1B 1ISZA 1E56A 3PZOA 1XYZA 2VTFA 3GXIA 3M7SA 4IM4A 4CD4A 1KGWA 3K8KA 1HP4A 1BTCA 1OIFA 2DH3A 4H7VA 1BAGA 5A8MA 4AZ7A 2F8QA 5ABGA 1OWQA 1MQRA 1W2VA 2PF0A 3AS2A 4YPJA 1B0IA 1C91A 2V3EA 4MAVA 1AQHA 5BXSA 1D7FA 1CWYA 1HJSA 3WDHA 5LYRA 1XRVA 4TVCA 3BSGA 1XC6A 3WQ5A 3NJ3A 4DUVA 1J0HA 1DWIM 1NOWA 5FL1A 2O9RA 3VDAA 4CD8A 3PTKA 3VD9A 4TOQA 3WNPA 3VNYA 5CPTA 3LPPA 1FH7A 4WSJA 3WELA 2XTKA 3WQ8A 5D9OA 1BYDA 4ACZA 1KWGA 2GDVA 1BYCA 3CH9A 1UD5A 2NW0A 4TTGA 4IPNB 1HL9A 2VQTA 3WNLA 3RM8A 2CEQA 1GOIA 3D3AA 3KEHA 2VI0A 3KL0A 3AHTA 4DWSC 5BXRA 2VR4A 2GDUA 1NOUA 1CYGA 3CUIA 5GNZA 1WDRA 4TXEA 3RIKA 5IHRA 1E15A 3VOCA 4ACYA 1SYTA 3ZIZA 4B3LA 7CGTA 5I6SA 3E1F1 1OIMA 1JNDA 5TD4A 2E3ZA 3BLPX 4FLRA 2BY3A 3B9DA 1W3LA 3AMGA 4GPNA 4PSRA 3SCOA 1VIWA 1OM0A 2WB5A 3BCDA 1E6ZA 3FAWA 1W2PA 3S2CA 1WE5A 5FOOA 3B8SA 1H3GA 1ZBVA 1HJUA 4WLCA 4GO9A 3EDDA 1QW9A 1R7AA 1UQYA 4F8XA 3ARWA 5D9PA 2DQXA 2D0HA 2Q8XA 2ZICA 3VM5A 1CGXA 3W27A 3AXHA 3PTMA 4PMOA 3ARUA 3ZJ8A 3ZQ9A 3ZSTA 3NSMA 4FMVA 3OGVA 4AEEA 1GQIA 1QHZA 2WKGA 2W66A 2Y4SA 2QHAA 3IJ7A 1ITCA 3SUSA 2FH6A 4CCEA 3JUGA 3WQ4A 4QP0A 5DT7A 3OA5A 1V08A 1Z32X 2ZX6A 3HN3A 1G5AA 3QOKA 3AIUA 1W91A 5I24A 3SEPA 2VZSA 2WLYA 3DC0A 1LL6A 4HU8A 4CD5A 4LYQA 4MB5A 2FDMA 4KGJA 4OOUA 1CLVA 3AYRA 4D1IA 3MANA 2V3GA 4S3JA 5A8NA 3SCSA 1US2A 2VX5A 4W86A 3UERA 3SCPA 3VIIA 1NM9A 4NI3A 1R87A 3BCFA 4LQ1A 2IUZA 4MNJA 1V3LA 3UR7A 2JF7A 4EKJA 3WD3A 4JFUA 1VENA 3VD7A 1C92A 2G41A 3QR3A 2XVKA 3GXDA 3OLEA 3WF2A 1V0KA 2VNCA 4UQAA 3FW6A 4FLSA 5JUVA 3T08A 2X09A 1Q6EA 4GINA 1QNSA 1UKSA 1NP2A 4MDOA 2D0FA 1BVNP 4N0RA 2XJ7A 4UOZA 1V0NA 1E4MM 1I1XA 1W3JA 1M7XA 4HMEA 3WY1A 1QI2A 4J3UA 5HXMA 1H41A 2WMFA 1ODZA 2YA0A 2O9PA 1VBUA 4HP5A 3WKZA 4P8UA 1JXJA 1G01A 3CUHA 5M03A 4GIAA 3OLGA 1V6YA 1E73M 4J27A 1WZLA 1UA3A 1YHTA 2ZX7A 2BY0A 2J62A 4URIA 3AIEA 3GDBA 1OGBA 1QHOA 3CHCA 2CBVA 3NDYA 4TX8A 1ISYA 1BYBA 2XVPA 1DWJM 4WF7A 3L2LA 3GH4A 5A2AA 3WDPP 4TX6A 1TR1A 1PBGA 4B9YA 3CZLA 1LL7A 4C7FA 1EXPA 1UHVA 2ZXQA 2DGAA 4E8CA 3SCQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2G3J A;  4PTW A;  1J0J A;  1OD8 A;  3BAK A;  4UFJ A;  5IDI A;  1VJZ A;  2WWC A;  3GZA A;  3O2L A;  3PZT A;  1E1E A;  2NT0 A;  4JFV A;  1KFW A;  1Q6D A;  2XGI A;  5FIP A;  7A3H A;  1ISV A;  1KQY A;  1V6U A;  1TG7 A;  3RCN A;  3FXY A;  2PI6 A;  3GXF A;  4UFL A;  4J3W A;  2J8G A;  3VMN A;  1ZJA A;  2WMI B;  3VIL A;  4HOW A;  1UD6 A;  3RM4 A;  4Z2I A;  4W8A A;  3W4R A;  1W3H A;  3GXM A;  3L4W A;  3WD4 A;  4PMZ A;  4UOJ A;  4MNM A;  2VQU A;  3UG5 A;  1K6A A;  2XSA A;  2DPE A;  1WDQ A;  1JFH A;  1LJY A;  3OG2 A;  3BH4 A;  1UR8 A;  2CYG A;  1JI2 A;  2BXZ A;  3VGB A;  2PB1 A;  3CHD A;  1FFQ A;  5BWF A;  1GJU A;  3EDJ A;  2WHL A;  4M82 A;  1HF6 A;  2GFT A;  2WK2 A;  1NAR A;  1UWU A;  1KXH A;  5HOS A;  1C7S A;  1BSI A;  3THC A;  4JKK A;  2PWG A;  2EO7 A;  4A3H A;  3CMG A;  1BPL B;  4UFK A;  1GQL A;  2WMK A;  4F66 A;  3T09 A;  1V3I A;  2NT1 A;  1QNR A;  2QPS A;  1UKO A;  3MV1 1;  2XIB A;  2WCA A;  2VX7 A;  3VIP A;  4UQC A;  4PUD A;  4NRR A;  1QI3 A;  1W32 A;  3W6M A;  1B3Z A;  1DWG M;  1VBR A;  4AZH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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