1WAWA

Specificity and affinity of natural product cyclopentapeptide inhibitor argadin against human chitinase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords CHITOTRIOSIDASE 1
publication title Specificity and Affinity of Natural Product Cyclopentapeptide Inhibitors Against Aspergillus Fumigatus, Human and Bacterial Chitinases
pubmed doi rcsb
total genus 130
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
A PF01607 CBM_14 Chitin binding Peritrophin-A domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1wawA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1wawA01
3AXHA 4HP5A 3N17A 1B3VA 1JZ8A 1V3JA 1HF6A 5BRPA 5ABHA 4J27A 3PZ9A 4AZCB 1ECEA 2D24A 2J8GA 1QI4A 2BHYA 1XYFA 4UNIA 3SCTA 4NZCA 2YDSA 1J0YA 1GORA 1HP4A 4GI6A 1AQ0A 3CMJA 1BGAA 1JF6A 3I3DA 3VGGA 3MV01 1U2YA 1YHTA 2BHZA 4C7FA 1Q6EA 4D6JA 1QNPA 1B90A 3DC0A 4WIWA 1UH3A 1AQHA 1L8NA 1CDGA 1KGWA 1RP9A 2XPKA 2IXUA 3VO0A 4L4OA 2WWDA 2W63A 3VMPA 2VCBA 2VZVA 5HPOA 3TTOA 3CMGA 4TTUA 1NOUA 1W9BM 3MS8A 1E73M 4H7VA 1QPKA 2D0FA 2WWCA 3MUAA 5CLWA 3CZEA 4FLSA 3A4XA 3CHEA 2DT2A 5D9OA 2XHYA 1CECA 2UWFA 1C90A 1H49A 2Z1SA 4TVUA 1HN1A 3AHXA 4XV0A 2WMIB 1UD4A 1X6LA 3T09A 1V3IA 1GNXA 4JCLA 1UD3A 2ZUWA 4R5EA 1ITXA 3EDEA 1E72M 4AZ6A 5IFPA 3ARSA 3UG3A 3WELA 1TUXA 4WKAA 4OOZA 1R7AA 1PBGA 3U57A 3EDJA 3BGAA 1UR4A 3WMSA 2DGAA 4IPNB 4ZE4A 2OYMA 5F7UA 4V27A 4AD1A 3GH7A 4HMCA 1J11A 2DSUA 3WEMA 4CD4A 2WMHA 1UD2A 1NOFA 4W7VA 1US3A 5I2UA 3EDFA 4M80A 3CHCA 2FGZA 1GPFA 1AMYA 4U5IA 3AS0A 3GXDA 2WVUA 1UD8A 1FOBA 4P8XA 3PBGA 3OLIA 3T0BA 1F4AA 3RMEA 1IZJA 4LGXA 1BG4A 1GVYA 1KWKA 1B1YA 2PC8A 1EDTA 1LWJA 2BFGA 2EQDA 4OJYA 3WD1A 4Z2HA 1ISZA 3AMGA 3NSMA 4PSPA 5D8ZA 4XUYA 5CXPA 4AZIA 3WQWA 5BROA 2ZUVA 4W89A 1ZBVA 2CHNA 2AOSA 3AIEA 2DPEA 2GUYA 4S3JA 2D22A 3GTNA 1QNOA 1UH2A 3L4ZA 4KWUA 5KEZA 3FAWA 3WNMA 2J4GA 1C3FA 1VFUA 4TVDA 1WZAA 2VZOA 1VB9A 1QNRA 3AROA 3VNZA 5AC4A 3VINA 3MMUA 1E6PA 5AC5A 3WH6A 4LYRA 2ZX9A 1MW2A 1ISYA 2VO5A 3CTTA 2EPMX 5JBFA 1BGGA 2VUYA 2WMGA 3AFBA 3SIMA 4ML4A 2G4FA 3CZKA 5CGTA 5ABFA 2D3NA 3ZJ6A 1W3HA 7TAAA 1CEOA 3QR3A 2WNWA 2EO7A 4MNMA 4EAMA 4LPCA 4UQEA 1KR1A 1XGZA 4PEEA 1OSEA 3FHQA 2E8YA 2NT0A 4CN6A 2VTFA 4JCMA 3AIBA 3K8KA 1V6UA 1E55A 1R85A 2D2OA 3TTQA 4CU7A 1CXHA 1E1FA 3D3AA 2YBUA 4GKLA 1P6WA 1B3ZA 3PTMA 1E4LA 3LPFA 4UOQA 4EKJA 1EOKA 2WMFA 1ZL1A 3POCA 3VIFA 3ARUA 2PBOA 3THCA 4B16A 1E0XA 4QLJA 3S2CA 4HZ7A 4Q7NA 3WH5A 5IXEA 3OGRA 1C8XA 1PJ9A 4W88A 3BXWA 4P7LA 4CVWA 4CD5A 3WD2A 5M3WA 1ZS2A 4PMUA 2ZUUA 4LXFA 4GZIA 3WDRA 2EXOA 5A6JA 1E4NA 4QCEA 4DWSB 1H1NA 1UR2A 2BHUA 1ZB5A 3VIHA 1V3HA 2UY5A 4RE3A 1NM9A 2WCGA 1JFXA 3GM8A 4XB3A 4UFLA 3EYPA 1JNDA 5A94A 2PWGA 1H3GA 2MANA 2WVVA 4P8WA 1MXDA 2CETA 2QPSA 4AZCA 3N1AA 1N82A 5DT7A 3W6LA 1HJVA 4U2YA 1UR8A 2DIJA 2YL8A 2J7GA 1EH9A 5ABGA 1NOWA 4F66A 3NDYA 3QHMA 1MXGA 4WKFA 3WQ6A 1CPUA 3B9EA 1JGIA 2CESA 4Z2LA 2VQTA 4CN1A 2WB5A 2WSPA 3ARRA 2GK1A 2Y24A 3AISA 3OLGA 5AY7A 3F4VA 4D6CA 1UWSA 1W1YA 1XYZA 3F5JA 2VCAA 3W29A 3VDAA 3SCWA 4PCTA 3CIVA 3CZGA 3VIJA 1AVAA 2BXZA 1FFQA 3POHA 4M56A 3AZRA 4HPGA 3ZO9A 4PMNA 3VIMA 1NWRA 2OSYA 3OLEA 4HU8A 1G0CA 4EK7A 1GOWA 1GQJA 2QV4A 1B3XA 1YQ2A 3TP4A 2WKGA 4DM2A 2BNJA 4JAWA 4BQ4A 2DQXA 1FHDA 3W81A 5I78A 3OGVA 1VEPA 3QGVA 3RIKA 3WFLA 3WUBA 2CIPA 1GOKA 4NI3A 2PB1A 1LLOA 2XSAA 1C8QA 4J28A 2OSWA 4UZUA 3WBEA 4BQ2A 3BC9A 3KE0A 3WF0A 4UOZA 4ZEPA 1LL7A 5A6BA 1GOIA 4HU0A 4MADA 3AMKA 4FLRA 2J79A 1UKQA 1JXJA 4MDPA 4H8VA 1VJZA 1WB0A 4BF7A 1UKSA 2NT1A 4LYQA 2CBJA 3M46A 4AC1X 4LX4A 3RJXA 1TVPA 2J7FA 3VPLA 2DSVA 4XZBA 3MUY1 4GO9A 2YA0A 1W32A 3WNOA 2Y5EA 1V3LA 2O9OA 1A3HA 4TTGA 4S3KA 4HA1A 1R7OA 3WF3A 5HXMA 2YJQA 2VZTA 2C8NA 3L2LA 1ZBKA 4PMRA 1IV8A 1KR0A 1FH7A 2W66A 2XUCA 3WBAA 1W9VA 3SCPA 5A6KA 5JUVA 4H2CA 3GNPA 4E2OA 2DIEA 3W24A 2XVPA 2ZXQA 2CBIA 1H0IA 4XZWA 4BZYA 4J3WA 1QVBA 1NARA 1M01A 3W0KA 3W53A 4XX6A 1XH0A 3UERA 1JD7A 2G3IA 1UA7A 3GBEA 2ZE0A 4Q22A 1O6IA 4NSBA 1QNSA 3CUGA 3WEZA 4FLOA 1QW8A 3UCQA 3WQ5A 4ZXOA 5DEZA 3MSDA 2ZX6A 5E6ZA 3W28A 2DDXA 2XVLA 1MVYA 4AIUA 2PWFA 2A3AA 1XCXA 1Q6GA 3KL3A 1UYQA 1JXKA 4YHGA 4HMEA 3OGSA 4J3SA 1DTUA 5A6LA 3BLKA 3OG2A 1R86A 2VNCA 4QAWA 3UEQA 5I23A 5EMYA 3AS1A 4P7OA 2W4XA 3VIKA 3SCOA 4QFUA 5BYWA 4P8VA 2XSBA 4X0VA 4AD2A 3NYDA 3W26A 4D6IA 2W91A 5A3HA 4KGJA 1GQLA 1CGVA 3N15A 3BAWA 2YL5A 3FHAA 3KEHA 3T2PA 4GXPA 2V5CA 4BQ5A 2YKKA 3THDA 5BXPA 3RDKA 1PZ3A 1FA2A 1ISVA 3N13A 1DWAM 1BAGA 4Y7EA 4Z2JA 2ZXBA 2X05A 2OYLA 3AIRA 1JAKA 4RE2A 3QHOA 3AHVA 1U30A 4DWSA 3M07A 2FHCA 1K9FA 2VJXA 5CLTA 2XIIA 1LQ0A 3WD3A 4KRTA 1WPCA 2PWEA 1OCQA 3PZTA 4W84A 2BVTA 5FOOA 2J25A 4CD8A 4OOUA 1J0ZA 4JHZA 2OYKA 3D5HA 1Q4NX 4IISA 4Z2IA 1UKPA 1E6SM 3VIOA 4H8UA 4MB3A 1X1NA 3WF1A 1VFMA 3RO8A 3F5KA 4ATWA 3CHDA 3AZTA 1J0HA 5CPTA 1KCKA 2XWDA 1NWUA 1FH8A 4AD5A 3ZJ7A 1ZBWA 3S6TA 3A4WA 3HN3A 1QOXA 1WDRA 2G3MA 1UWUA 2O9TA 4D6HA 1HJQA 1PEZA 4TUFA 5M03A 3AZSA 2XVKA 1NH6A 1ODUA 2D1ZA 3CUFA 2WCSA 2EJ1A 1KBKA 4UQAA 2XWEA 4ATDA 1A47A 4JKLA 1WP6A 3II1A 2WKLA 2HVMA 2VX7A 5CZKA 1JAEA 1E6NA 3KL0A 1GCYA 2X0HA 1M53A 1KBBA 1OT1A 3ZIZA 4DWSC 4QP0A 3VOCA 1BYAA 4EANA 1BPLB 3TOPA 1ODZA 4DM1A 1MFUA 1SR0A 4MAVA 4N0RA 1J0KA 4R27A 2V3EA 4PMDA 3AJ7A 4TX8A 4PMQA 4ZFMA 1HJWA 5AYBA 3WIJA 4D6EA 1UHVA 3AHZA 2D0HA 3VGDA 4B3LA 2GFTA 5A8QA 3IAQA 4MB5A 3DYOA 2YL9A 3KL5A 2DH2A 2DH3A 4GZJA 2GJXB 3VVGA 1V0NA 4D71A 4W86A 1CXKA 4PN2A 4HA3A 4CCCA 4CU8A 1NWTA 2RGMA 1DWIM 1O7AA 2IUZA 4AIEA 1V03A 2ZXAA 2CKRA 1HJSA 3IANA 2CXGA 1EO5A 1EA9C 3K8LA 1EHAA 1EXPA 3ARVA 4QLKA 3WF4A 1J0JA 1EDGA 1MYRA 4TVCA 5IHRA 1BLIA 1GOMA 3TTYA 3VTRA 4UOJA 4HTYA 2XM1A 5CPQA 3SURA 5A95A 4A3HA 1UOKA 1WDPA 1XD0A 2J7BA 1G94A 3OZOA 2JE8A 1K9EA 5BXRA 1LF1A 3LPGA 1Q6FA 1C7TA 2WLZA 1GOOA 1MWOA 5C70A 2WYSA 2X0YA 3CZ8A 1B0IA 1BF2A 4JFTA 3WDIA 2WHJA 4NF7A 3RM4A 1W9DM 2CYGA 8A3HA 3AICA 2Z1KA 4DUVA 3PZQA 4UCFA 4P7RA 1PX8A 3W37A 5BCAA 4OUEA 1FP8A 4GQRA 4J3XA 5A6BD 1VEOA 3A6OA 2CPUA 4K68A 1WNOA 1HJUA 4PRWA 3N18A 3QOKA 5D9MA 1V0MA 1DWJM 3MKKA 1W3KA 1LG1A 4C7GA 6TAAA 2CEQA 2ZIDA 1JD9A 4J3TA 4PTMA 3PTQA 1TVNA 2DSZA 2PWHA 4NRSA 4KGLA 3GXMA 3ZR6A 1XHGA 3DYPA 5JIWA 4PUDA 4P8UA 5HNNA 1E0WA 1UWQA 2A3CA 4PTXA 4C7DA 1UH4A 4UR9A 2WZIA 1E0VA 1KXHA 3SUSA 1RPKA 1QI0A 2WSKA 3WNLA 2CBUA 1ZJBA 1MFVA 1TMQA 4QCFA 5C8BB 3HMCA 1E70M 2YA2A 4AYSA 4H41A 4UFKA 5CJ5A 4MPKA 3ZM8A 3AYRA 1JZ7A 3ARYA 1JDDA 2ZOXA 4AZBA 3ALFA 3VDHA 2EPNA 3L4UA 1Q6DA 5GNYA 4ZE5A 1C92A 1H2JA 2XIBA 3ARWA 1HKJA 4E4PA 4ACZB 3WY1A 1KGUA 5A2AA 3NUKA 3T08A 1CZ1A 1JFHA 2W62A 3AS2A 4M24A 1JZ2A 3PHAA 2CCRA 2VX4A 3SUVA 1MQQA 2XGBA 1Z32X 1JYVA 4U2ZA 2FH8A 3DHUA 5ABEA 3QOMA 1BVNP 4GI8A 1UZ1A 3G6LA 3SUUA 3WF2A 3DYMA 3LMYA 3WDJA 1AQMA 1BYCA 1M04A 1JF5A 3VKKA 1W9UA 1J0IA 1PIGA 2PBGA 1B2YA 1JI2A 4QDMA 2G41A 1VAHA 1XSIA 3ARXA 2Y4SA 1CWYA 1BHGA 1W2PA 1TG7A 1H09A 3AIQA 3WDPP 3VNYA 1VRXA 4PYSA 2A3HA 3GZAA 3AOFA 4UZSA 2J8FA 3SCRA 1GHRA 3OZPA 2O92A 3PZNA 2J7CA 5I79A 4AZ5A 1WZKA 4FK9A 4MNLA 3WL1A 4W5UA 3MSGA 4AW7A 4KMQA 1BTCA 1OGSA 1WDSA 2JEQA 3EMCA 1XH2A 1TE1A 2E3ZA 2AAAA 4L4PA 2D20A 2UY3A 2YLLA 1EQPA 5CQ1A 1E9LA 3AYSA 3BMWA 2WXDM 3BAYA 5ECUA 2E0PA 3ZT5A 3FY1A 1BSIA 1UKOA 4PSRA 1NP2A 2WZHA 3IK2A 3K4DA 3VM5A 3PZUA 4W7WA 2J77A 2FHBA 2QPUA 4IM4A 1KGXA 3A4AA 1QBAA 3GNOA 5IDIA 3W6MA 2ZICA 2Y2WA 2C7FA 5BXSA 2V3DA 2WLYA 5GNZA 1HVXA 4AEFA 3VMOA 2ESCA 3CLWA 3GYCA 3MU7A 1HVQA 4U31A 4X0NA 2WMIA 1C93A 3IJ9A 3NJ3A 3W25A 1D7FA 5A6AA 3VDCA 3BCDA 3BSGA 3AHTA 2GJXA 5M17A 1JZ3A 3N9KA 4X9YA 3BH4A 3B8SA 1EHNA 2ZXDA 3EDKA 1QI2A 4IUGA 2YIHA 1NP0A 3BAKA 4MAZA 2E9BA 4AZGA 3IAPA 3CBWA 1NQ6A 1J9YA 2CBVA 3ZSTA 1LWHA 4W87A 3SCVA 3VD9A 1ZBCA 2CITA 4M82A 1XD1A 2YA1A 2WW5A 1UA3A 3N12A 1PZ2A 2XVGA 4CVUA 4JFUA 1FHLA 1OD0A 1LG2A 1S46A 1JZ6A 5I77A 4CUCA 3WEOA 1VFFA 1WE5A 1PX3A 5LA2A 2OLHA 2CHOA 1W91A 4GPNA 5LYRA 3ARZA 2XFRA 4F9JA 2WC7A 1RD6A 4KRUA 9CGTA 1KXVA 3RCNA 4W8BA 4JFSA 2OSXA 4GQQA 4BA0A 1CGTA 3JUGA 1Q6CA 2QLYA 1J12A 1OT2A 5HDRA 5IHSA 3WH8A 1VENA 4KH2A 1EDQA 1H4PA 1MW3A 4W5ZA 3OB8A 3RPMA 1HKIA 5BXTA 2JIWA 1E1EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3RIT A;  3UWW A;  5CG0 A;  1QTW A;  3QBU A;  2G3F A;  1M03 A;  2DZS A;  1XIJ A;  4LAK A;  2XIO A;  3ABR A;  1Q8A A;  1Q7M A;  6TIM A;  3QW4 B;  5EMM A;  4RW5 A;  4WHB A;  3NIY A;  2VI0 A;  1HKK A;  1JCX A;  5HME A;  1GVF A;  1QI3 A;  2VD9 A;  1B3Y A;  3KVK A;  1Q6U A;  2PP1 A;  4J3V A;  2VGB A;  1W3I A;  1GQK A;  3L4V A;  3AU6 A;  1HJX A;  1XYA A;  1QPO A;  4GIY A;  4DZH A;  3MW7 A;  4Z2K A;  3G3D A;  1MUW A;  2J9Z A;  3SGZ A;  2YW3 A;  4HOZ A;  4HNO A;  2B7P A;  1XIB A;  2HQA A;  3BMB A;  2FZM A;  3H2F A;  4AG0 A;  3DFY A;  4QG6 A;  6PTD A;  3OBA A;  3DIP A;  4CD6 A;  2W61 A;  3WQE A;  3SY8 A;  1QO2 A;  2KI3 A;  2Q01 A;  3UCC A;  1C29 A;  4Y9O A;  2IPF A;  3DFT A;  2I5G A;  3NXF A;  2GSJ A;  1DWH M;  1L0P A;  4PMO A;  3D46 A;  4Z2G A;  2DUZ A;  4A22 A;  1TV8 A;  2Z6J A;  4JII X;  2DSW A;  1US0 A;  4IID A;  3SFK A;  3OBK A;  5C2G A;  1RPX A;  2D69 A;  3KRZ A;  2E28 A;  1L6G A;  5FF2 A;  1H41 A;  4O1E A;  1EF3 A;  2ZWY A;  1L2Q A;  1R8L A;  3S83 A;  2O9P A;  4O19 A;  3K8M A;  3S5O A;  2Y61 A; 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 5FD0 A;  2Z7K A;  4P7N A;  1XLB A;  5JVL A;  2X7W A;  4JEJ A;  3K46 A;  4J3Z A;  4NZJ A;  4PMX A;  2QCF A;  1UR1 A;  4IIE A;  4RL3 A;  2D3L A;  1R2R A;  5A2B A;  2VRQ A;  3S5Z A;  3LRK A;  3QQ0 A;  1FKD A;  1H7X A;  5LA0 A;  1TO3 A;  1K7X A;  3HG5 A;  3DKJ A;  4LRS A;  3W74 A;  4UQB A;  4Z0J A;  4AD4 A;  4Y6G A;  4IOT A;  2XG9 A;  4LB3 A;  4YN5 A;  2X7V A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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