The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
127
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structure length |
127
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Chain Sequence |
GSSGSSGPIDLITVGSLIELQDSQNPFQYWIVSVIENVGGRLRLRYVGLEDTESYDQWLFYLDYRLRPVGWCQENKYRMDPPSEIYPLKMASEWKCTLEKSLIDAAKFPLPMEVFKDHADLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| molecule keywords |
KIAA1617 protein
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| publication title |
Solution structure of the 2nd mbt domain from human KIAA1617 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
127
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| sequence length |
127
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02820 | MBT | mbt repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LTO A; 3LGF A; 2YRV A; 2PQW A; 2BUD A; 4Q5W A; 4A4E A; 2L89 A; 3P8H A; 3L2U A; 2XK0 A; 3M9Q A; 2D9T A; 2X4W A; 4IUP A; 4E7L A; 4QVZ A; 2LRQ A; 4C5E A; 5D6W A; 2GFU A; 3ME9 A; 4CRI A; 2O4X A; 2QQR A; 3L42 A; 3LH0 A; 3NTK A; 2DIG A; 5IN1 A; 5D6X A; 4A4G A; 1G5V A; 2RI3 A; 3OYM A; 3L2V A; 5IAY A; 4BE0 A; 2RJC A; 2E6N A; 2BIV A; 1N27 A; 2R58 A; 3OYG A; 4BDY A; 3OMG A; 5FRN A; 2EKO A; 2DIQ A; 2JTF A; 2B8A A; 4C5I A; 5C0M A; 3L2W A; 3MO8 A; 4BE2 A; 4E7J A; 1WGS A; 4QQ6 A; 4RG2 A; 4A4H A; 3Q1J A; 2M0O A; 2RJF A; 2RHX A; 3ASK A; 5KH6 A; 4Z02 A; 3LX7 A; 4N4I A; 3GOX A; 2LCC A; 2E5Q A; 4BAC A; 3NTH A; 2GFA A; 2LVM A; 3OMC A; 3OS1 A; 4BE1 A; 4PL6 A; 1H3Z A; 4E7H A; 3PMI A; 1WJS A; 3OYH A; 1MHN A; 2HQE A; 2K3Y A; 4EDU A; 3OS2 A; 3FC3 A; 3PMT A; 3OQ5 A; 2R5A A; 5KCO A; 4II1 A; 4E7I A; 4HCZ A; 1OYX A; 4C5G A; 3MEW A; 4UC4 A; 3S6W A; 3ZEH A; 3SD4 A; 2G3R A; 3OS0 A; 2RO0 A; 3DB4 A; 2EQU A; 3OB9 A; 5KCH A; 3DB3 A; 2RJD A; 1SSF A; 3P8D A; 2RHI A; 3MET A; 3OYK A; 2X4X A; 2HQX A; 2FHD A; 3E9G A; 4QQD A; 1KHC A; 3UT1 A; 3QBY A; 3H8Z A; 3UWN A; 4B9X A; 5KE2 A; 2QQS A; 3MEA A; 3OY9 A; 2DAQ A; 4PLI A; 4IKF A; 3MEV A; 3LYI A; 2EFI A; 3OYL A; 3OYI A; 3BDL A; 3FDR A; 2BKD N; 2JZ2 A; 4N4G A; 4QW2 A; 4IUU A; 3QJ6 A; 2P0K A; 1RI0 A; 5M9O A; 3S3O A; 3OYB A; 3OYN A; 2EQJ A; 4A4F A; 2X35 A; 3PFS A; 4ZTF A; 2RI2 A; 2RHZ A; 3LGL A; 2IG0 A; 3E9F A; 3O8V A; 3S3M A; 2CKK A; 2L8D A; 1OZ3 A; 3OYC A; 2R5M A; 2XDP A; 4QQG A; 1OI1 A; 2LDM A; 3C4S A; 4FU6 A; 5CIU A; 1XNI A; 4IUR A; 5J26 A; 2GF7 A; 5D6Y A; 3NTI A; 4C5H A; 3CEY A; 1OZ2 A; 3L2R A; 4BDZ A; 3EAE A; 4NS5 A; 1WJR A; 4X34 A; 1WJQ A; 4ZTJ A; 2RI5 A; 4B9W A; 3DLM A; 2MWP A; 3KUF A; 2NLU A; 2WAC A; 5J39 A; 2O4X B; 4IUT A; 5FRO A; 2RHU A; 2L3R A; 3MP1 A; 2RHY A; 5C6S A; 4PLL A; 4FL6 A; 4OVA A; 3S3N A; 2VYT A; 3QKJ A; 4BD3 A; 3H6Z A; 3OA6 A; 3MP8 A; 2M1H A; 4IUQ A; 4E7K A; 3OYE A; 3FEO A; 3FLG A; 3OYA A; 5KE3 A; 2MWO A; 2X4Y A; 3LLR A; 2M16 A; 3QII A; 2EQM A; 3OYD A; 3L2Q A; 2R57 A; 2F5K A; 2K3X A; 4L59 A; 3OYJ A; 3OYF A; 4LD6 A; 2EQK A; 4IUV A; 5FRM A; 3MP6 A; 4N4H A; 4GY5 A; 3F70 A; 3MEU A; 3PNW C; 2RJE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OP0 A; 3C95 A; 2QEX Q; 3VUZ A; 3CCM T; 1AWX A; 1O9S A; 4KH0 B; 2NUP A; 5GAO l; 3GIB A; 2D1X A; 3CQT A; 4M75 C; 2QA4 Q; 3L42 A; 1ZUY A; 2YXY A; 4CC4 B; 5DY9 A; 4BI4 A; 1BCO A; 2XI9 A; 2YUO A; 1JJ2 S; 4PJO E; 1N27 A; 1WXU A; 1OEB A; 3RES A; 2DIQ A; 2LX7 A; 4JJC A; 2IPO B; 3PT9 A; 1EZZ B; 4RTT A; 2QI2 A; 4RTY A; 1Q81 R; 1YJ9 T; 2E5Q A; 4M7A G; 4JS5 A; 1KD1 R; 2D0Q B; 3QWX X; 1AT1 B; 5HY6 A; 5LJ3 f; 1NE8 A; 2DEQ A; 5FU7 B; 5CQY A; 3S6W A; 3SD4 A; 1K0S A; 2A0F B; 4PKC C; 1K76 A; 1KHC A; 4JRQ A; 4C8Q G; 5GAN g; 2QA4 T; 4HCK A; 4KT0 E; 3JCM d; 3BDL A; 1V76 A; 4P5N A; 2PUK B; 5CKF A; 1EIF A; 3LGL A; 2RD1 A; 2RN8 A; 1IHW A; 5GAM f; 1H64 1; 1UB4 A; 5CKE A; 2CDT A; 2GQI A; 2HL5 C; 4FU6 A; 4MZT A; 2DL7 A; 1NG2 A; 2VC8 A; 3R6O A; 3L2R A; 1M90 U; 1VQ7 A; 2XDB A; 3QO3 A; 2LQ8 A; 4C92 C; 5GAN 7; 3E19 A; 1VQ6 Q; 1KQ1 A; 1PRM C; 5C6S A; 2I0N A; 2LJ0 A; 2QDL A; 4PJO B; 1NJI R; 2SEM A; 4BD3 A; 3UF4 A; 1WX6 A; 3OYA A; 4OMO A; 1W2B A; 2DXC A; 4AFU C; 2DE0 X; 3MHX A; 1XOV A; 2C0O A; 4OMM A; 4J7F A; 2MMP A; 1TSF A; 1JXM A; 2KT8 A; 2LZ6 B; 4F7U G; 3M4Y A; 4RTU A; 4C5E A; 5KYX A; 4EIK A; 2ED1 A; 3J81 E; 2ZCF B; 4Y91 A; 2A7Y A; 4A4G A; 3FRN A; 1JEG A; 1SHG A; 3UAT A; 1OU8 A; 4E7J A; 2CSQ A; 3H0F A; 4FSX A; 1VQ6 T; 1B07 A; 2HMA A; 4XTV A; 1QP2 A; 1X69 A; 1Q7Y C; 2J6O A; 4J6X A; 3REA B; 3GLX A; 1GXI E; 1B7T A; 2GNC A; 2RPN A; 1M1K R; 1VOM A; 4EDU A; 2FZK B; 1X6B A; 1M27 C; 3OQ5 A; 3V8L A; 4E7I A; 1WLP B; 4C0Z A; 3GF5 A; 1M3B A; 4J9E A; 5LJ3 h; 1RL2 A; 4J9C A; 1MMN A; 3RR6 A; 4NOY A; 2QQS A; 1C6V X; 4M7A D; 4XQ3 A; 3FDR A; 1P92 A; 3JB9 H; 1PCX A; 2X35 A; 3PFS A; 2DYB A; 4XU2 A; 4L6V 5; 4M78 A; 4E7Z A; 3L2Z A; 2K2V A; 2F1L A; 1K9A A; 3S3M A; 1WQW A; 3X24 B; 1W70 A; 1R77 A; 2DIL A; 4C8Q D; 5GAM h; 1RAA B; 2KRS A; 2KRN A; 5DM7 R; 3T9N A; 4TVR A; 1N9S A; 3SEM A; 5CKB A; 3EGX A; 2DEU A; 4KGZ B; 1JRI A; 4PLL A; 4RCB A; 2FG0 A; 2QQA A; 3QUI A; 4GLM A; 3VS1 A; 2X4Y A; 2RK1 A; 3J7A F; 1GL5 A; 5A0D A; 3EG1 A; 3M0P A; 3D7S B; 2RJE A; 1SKU B; 2YUN A; 1VYU A; 3N5B B; 2KYB A; 3A8H B; 4M7A E; 2ROT A; 1OU9 A; 3VRZ A; 4E7L A; 4LDX A; 4J9I A; 5HK0 A; 2DBM A; 3ME9 A; 1JU5 C; 2KI7 A; 3UPU A; 3OYY A; 3LWI A; 2JUF A; 4PFO A; 1VQO T; 2JN0 A; 2RB6 A; 3SFM A; 3HSB A; 4BE2 A; 3M59 A; 3UA7 A; 4RG2 A; 4C8Q E; 1PKS A; 1LCK A; 3SWN A; 1ZSZ C; 1I0C A; 3NTH A; 3VYG A; 2MPX C; 1A0N B; 2NUZ A; 2QYZ A; 5FW9 A; 3BW1 A; 4FM4 B; 3FC3 A; 1E7O A; 5KCO A; 2CSI A; 4RTX A; 1KSW A; 5HKC A; 1K4U S; 4EMK B; 2LCL A; 2O88 A; 4AFQ C; 1BI2 A; 4M78 F; 1MGQ A; 1NM7 A; 2O9S A; 4D6W A; 3VU3 C; 5KE2 A; 1F1B B; 3PVQ A; 5FU7 C; 3JB9 I; 1YJN A; 4M75 E; 2DL5 A; 1ZSG A; 1JO8 A; 1AZG B; 1WHK A; 1MMG A; 1V29 B; 1T0J A; 1WXB A; 1GCQ A; 3M57 A; 2EYW A; 3O8V A; 4HXJ A; 2X51 A; 2QTX A; 3OBW A; 2NUT B; 2QTV A; 1Z9Q A; 4LUE A; 1OZ2 A; 1Q7Y U; 1TG0 A; 3DLM A; 4F7U E; 1AVZ C; 2DD5 A; 2RHU A; 1PWT A; 1X01 A; 3JCM X; 4OVA A; 3CCU Q; 5A0L A; 1LVK A; 1GRI A; 4J9F A; 2ZPG B; 2P0Q A; 4C8Q B; 4JJD A; 2MWO A; 4JZ4 A; 3JCM g; 5GAN 5; 2DM1 A; 1PM3 A; 4PJO C; 2CT4 A; 2P4T A; 4A4E A; 3OYL A; 1XQH A; 3RIR A; 3CCS A; 4JJB A; 3I55 Q; 2WSF E; 5KYN A; 1UDL A; 2A28 A; 1KC8 C; 5LJ3 d; 1D3B B; 3M54 A; 4FYX B; 1VQ4 A; 1TWB A; 4DEX A; 2DTI A; 5GAO q; 2DKG A; 5D7U A; 2JJ9 A; 3CME A; 3A8O B; 3MO8 A; 4DOV A; 1WYX A; 4M75 B; 2RJF A; 1U1T A; 1UTI A; 7AT1 B; 5KH6 A; 4M4Z A; 3CCU T; 4Z02 A; 5L23 A; 2KE9 A; 3EGD B; 3MJX A; 4BE1 A; 1YHQ A; 1WJS A; 3JB9 F; 1T0H A; 3I9Q A; 5GAM d; 5I11 A; 3OS2 A; 2BTT A; 1VQ9 A; 4EMG A; 3LW5 E; 3EG2 A; 4C5G A; 2YRC A; 3I55 T; 1QP3 A; 2PU9 B; 4R55 A; 1VQN A; 4F7U B; 1OX8 A; 3MET A; 2X4X A; 2LQW A; 1VUB A; 4OML A; 2CP3 A; 1FYN A; 3PVL A; 2CUD A; 2XKO C; 4B6M A; 2DTH A; 4CI0 C; 1WPY A; 2DBK A; 4N0A A; 1VIE A; 4ZTF A; 1ZHI A; 2HBW A; 1LPL A; 1H3H A; 1PHT A; 3TQ7 P; 3EG0 A; 2OI3 A; 3OYC A; 4PFP A; 4D8D A; 2DER A; 2MCN A; 1RAB B; 4FSS A; 1MMD A; 4ATO A; 3EAE A; 3J80 E; 2VVK A; 2PNI A; 1BI1 A; 1YJW A; 3C12 A; 3WVE B; 3RER A; 3OA6 A; 2F69 A; 1GFD A; 3BDU A; 3C0C A; 5ECA A; 1I1J A; 5KYU A; 4HCB A; 4C92 B; 4BUG A; 3M0R A; 3V7S A; 2R57 A; 5LJ3 e; 2G6F X; 4GY5 A; 5LJ3 j; 4GLK A; 1RAE B; 2XK0 A; 4MDW A; 1N5Z A; 2FYK A; 4KUI A; 3PE0 A; 3H0H A; 1NYG A; 1YN8 A; 4FIB A; 2LJ1 A; 3UA6 A; 3L2V A; 2RK2 A; 5IAY A; 3VS5 A; 1VQP Q; 1JBM A; 4KUD K; 4M77 A; 4Z8A A; 1SHF A; 2FPD A; 1ARK A; 4QVC A; 4J9H A; 5GAM e; 3CXC S; 2ZGW A; 2DVJ A; 5GAM j; 3G6E Q; 4BB7 A; 3IQL A; 2GFA A; 3QSU A; 2RM4 A; 1H3Z A; 2CP6 A; 2MOX A; 1UGV A; 5IHI A; 1KG1 A; 2K3Y A; 1QQJ A; 3CBP A; 4CC3 A; 5L8R E; 4MZP A; 1IO6 A; 2G3R A; 3PGG A; 2EQU A; 2RJD A; 1YP5 A; 4A53 A; 1ZUK A; 1KC8 U; 3NHN A; 1X2K A; 1KIK A; 1I5L A; 2J6K A; 2RMO A; 4RUG A; 4EMK C; 2ESW A; 1VQP T; 3VS7 A; 2EAY A; 5IH2 A; 1KQS S; 3QZ9 B; 1Q82 C; 5GJV B; 1YIT A; 2X3X D; 2AKK A; 1UFF A; 2COW A; 4M78 G; 1B34 B; 2CP0 A; 3REB B; 1YBY A; 3G6E T; 3JV3 A; 2K2M A; 3NTI A; 3KXT A; 1YI2 A; 3CCJ A; 2PVD B; 3TRE A; 3VS2 A; 3OW2 A; 1ACM B; 4FW1 A; 5I21 A; 2FZC B; 3M55 A; 2WAC A; 2YUQ A; 1K8A R; 4AMC A; 4M7A C; 1JXO A; 4MMK A; 2MI6 A; 3G1J A; 1YJN T; 1QVG A; 2D8J A; 3CCS Q; 3LWH A; 2KRM A; 5GMK m; 1K73 R; 3MP6 A; 3RMQ A; 1TUG B; 2YRV A; 2VV5 A; 4C8Q C; 5CR2 A; 2OTL A; 3OS5 A; 4IUP A; 4M77 F; 1QVF S; 1HD3 A; 3A5Z B; 1V1C A; 4JRP A; 1AWO A; 1JB0 E; 4OGC A; 2XHC A; 1W2B P; 2MAM A; 3ZL7 C; 1SRL A; 3M0Q A; 2B8A A; 3Q1J A; 3QWY A; 5CKH A; 1RAC B; 1AHJ B; 1E6H A; 3PTA A; 1RLP C; 1VQ9 Q; 2LCC A; 5KYY A; 4LDV A; 3OMC A; 2YSQ A; 3CCS T; 2P0P A; 2E12 A; 1VQN Q; 2LC4 A; 3M53 A; 3CPF A; 3RBB B; 1I81 A; 3KBG A; 3PMT A; 2LQN A; 1VQ4 T; 4DBH A; 1TS9 A; 1ZSZ B; 3CPW A; 2CH4 A; 5LJ5 h; 1M2V A; 5LJ3 g; 2DL4 A; 2QK0 A; 4R0K A; 3RUX A; 3JB9 G; 1HSQ A; 2H3J A; 1I5O B; 1Q81 C; 4JJN K; 2A36 A; 3AHU A; 2BZX A; 1AOJ A; 1CKA A; 5IHK A; 4XTU A; 1G8X A; 3OYN A; 1KD1 C; 2PTK A; 1AWJ A; 5GAN 3; 3THK A; 5AYF A; 1HXD A; 2CKK A; 4LXC A; 1CSK A; 3NFC A; 2DL8 A; 1VQ9 T; 3BFM A; 5LL6 S; 1BI0 A; 4IUR A; 2GF7 A; 4BDZ A; 4NS5 A; 1YIJ A; 1VQN T; 1Y71 A; 4LNP A; 2C06 A; 4ZTJ A; 1XJW B; 1SG5 A; 1EX4 A; 3V8K A; 2RHY A; 5KYW B; 3A8M B; 1WXT A; 2LNH B; 1JJ2 A; 1FWZ A; 4M78 D; 4JLI A; 2ENM A; 1SPK A; 2OAU A; 3OYD A; 4PJL A; 1Y7X A; 3CCV A; 4DBF A; 3I56 A; 4HT9 A; 1ZA2 B; 4RCC A; 3VYH B; 1WZO A; 3BY7 A; 1WHL A; 3RKW A; 3I35 A; 3SDZ A; 1FXX A; 4BY6 C; 4EMH A; 2X4W A; 4QVZ A; 1Q82 U; 1MV3 A; 1NYF A; 3LH0 A; 3JRZ A; 1NJI C; 1M4Z A; 1BB9 A; 4M7D D; 1NLP C; 2W0Z A; 5D6X A; 4PJO A; 5GMK i; 1N8R R; 8ATC B; 3TVT A; 3G4S A; 2EGC A; 4AG1 C; 3CCQ A; 1BK2 A; 3VKI A; 1CKB A; 2DVE A; 3ULR B; 1Y0M A; 2KYM A; 1X6G A; 1VQ8 A; 1WQ7 A; 2LX9 A; 3EH1 A; 2HZY A; 4LDY A; 4II1 A; 4DEY A; 1UE9 A; 1GBR A; 2OTJ Q; 2CZ1 B; 4DOW A; 4F16 A; 3R6N A; 2L3S A; 2HQX A; 4QQD A; 2FPF A; 1WHJ A; 1MND A; 2JS2 A; 3MEA A; 3OYI A; 4A4K A; 2HD0 A; 3PIO A; 2M9U A; 4LE9 A; 4M7D E; 1YI2 Q; 1VA7 A; 1M1K C; 2IG0 A; 2DXB A; 1AWW A; 4ANJ A; 5IHN A; 4XTZ A; 2J7I A; 2L8D A; 3G71 A; 4X9D A; 1QLY A; 3JB9 D; 4Z89 A; 2JM8 A; 1WFW A; 2F2W A; 4B9W A; 5J39 A; 2ATC B; 2VXF A; 1IRX A; 1G2B A; 1ZQ1 A; 5IXF A; 2YHT A; 4V2S A; 2J6F A; 3JCM P; 2M1H A; 4WCI A; 3X25 B; 2OTJ T; 3CBO A; 3QDF A; 1U5S A; 1NBE B; 1QWE A; 2AT1 B; 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