The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
GSSGSSGMALEQTLKKDWYSILGADPSANMSDLKQKYQKLILLYHPDKQSADVPAGTMEECMQKFIEIDQAWKILGNEETKKKYDLQRSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| molecule keywords |
1700030A21Rik protein
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| publication title |
Soluiotn structure of J-domain of mouse DnaJ like protein
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
14
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| structure length |
94
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| sequence length |
94
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WJZ A; 2QWP B; 3APO A; 2CUG A; 4J7Z A; 1GH6 A; 1N4C A; 2Y4T A; 3BVO A; 2CTQ A; 3UO3 A; 2Y4U A; 2GUZ B; 2DN9 A; 2DMX A; 3UO2 A; 2QWR B; 2EJ7 A; 2GUZ A; 2N05 A; 1BQ0 A; 4J80 A; 2L6L A; 4IT5 A; 2CTR A; 2M6Y A; 2CTP A; 1IUR A; 2KQX A; 2N04 A; 4RWU A; 1FPO A; 1HDJ A; 2OCH A; 2QWQ B; 2PF4 E; 3UCS C; 1NZ6 A; 3APQ A; 1FAF A; 3AG7 A; 1BQZ A; 2LO1 A; 2YUA A; 2QWO B; 2YS8 A; 2QWN B; 2QSA A; 1XBL A; 2LGW A; 2CTW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4DV0 B; 4LNU B; 3IAY A; 2A3Q A; 2YEV B; 1H2N A; 3WB0 A; 1F4M A; 2Z0A A; 4DV7 B; 1VQ6 V; 3T4Z A; 2ZQM A; 1XMQ B; 2GV9 A; 2PI5 A; 4I5S A; 1MA1 A; 4WFB V; 1IUR A; 3L71 H; 2QDO A; 3CB2 A; 5GON A; 1S5J A; 4KFM A; 4HBN A; 5J2U B; 3K58 A; 2YS8 A; 5HFM A; 1FFX B; 1OCZ B; 5FPO A; 5LMN B; 4I0X A; 2GTA A; 5C93 A; 2Q0A A; 4X9Q A; 5BR8 O; 4LF8 O; 4JI1 B; 4DV1 B; 2Y4U A; 4ZBM A; 1M1K W; 3SYA A; 4EFE A; 3W7S A; 4E4E A; 5LMN O; 2A7W A; 2E5L B; 3JCZ A; 3JD4 A; 1M57 C; 1GAX A; 3D3Q A; 1I7F A; 3KZI Z; 4R7C A; 5IWA B; 4JI1 O; 4MTO A; 3AG7 A; 1V55 C; 4B7K A; 3CX5 F; 4MVO A; 5LL6 Y; 1XI1 A; 2HEP A; 5IYZ B; 1SER A; 4YJ3 A; 5EIB D; 4JI8 B; 3K9S A; 3T1H O; 5LGN A; 2EZO A; 2OCC B; 3GVM A; 3D36 A; 5B1N A; 2YC0 A; 3A0H Z; 3JAR A; 2Q7H A; 3LSS A; 4BR6 A; 4JYC A; 5H9C A; 2ZE6 A; 4OPH A; 1YCI A; 1BS3 A; 1WB7 A; 3QF7 A; 2UXC O; 2QJ1 A; 3SYC A; 3OW2 U; 4CC5 A; 4W4K A; 3IC9 A; 2JRI A; 4UCV A; 4JI7 O; 3RN4 A; 2GUZ A; 2YID A; 1XUQ A; 2B5U A; 3CWB H; 4LC1 A; 1QLE B; 3KCY A; 3E8F A; 3LDE A; 2FTK A; 2LW1 A; 1PL4 A; 3DGE A; 1K3E A; 2YSU B; 5EIB C; 5DN6 G; 4DV2 B; 1Z5V A; 4UB6 Z; 3RYF B; 2AHY A; 4RUF A; 3ZIA G; 3SPC A; 2PYL A; 1TUB B; 4DW0 A; 3K06 A; 3W7W A; 3ABT A; 1MZE A; 3SPG A; 2ITD C; 3RYC A; 2Q68 A; 1KQS U; 3OGC C; 3W7T A; 2RCV A; 1P7G A; 4CH4 A; 1K73 W; 3AG3 C; 4JI6 B; 4DR3 B; 3CPW U; 3CYO A; 1VQ4 V; 1G6U A; 3I5D A; 4KP4 A; 1VP7 A; 1R6K A; 2Y0I A; 2A06 H; 3K08 A; 2QWR B; 4YJ2 A; 3D3I A; 1Q86 W; 5GON B; 1MMM A; 1K5Q A; 3RFR A; 1XHX A; 3LNN A; 4Z1M G; 5B3S C; 4I0X B; 2HHH O; 2V7Q G; 4MS2 A; 1Q81 W; 3G6E V; 1WP7 A; 3KCX A; 3I56 V; 1GM8 A; 3L75 H; 2Q9L A; 2DYS B; 4N21 A; 3K5N A; 2X6A A; 1OCR B; 2LQT A; 1HNW B; 1Z2G A; 2GDS A; 3JAM N; 4QGP A; 3VOU A; 4RO2 A; 2HVJ C; 4MTF A; 1N36 B; 4D6T H; 1XBL A; 1AI7 A; 4YJ3 B; 3K03 A; 1HNW O; 3E2E A; 4FLV A; 2Q67 A; 2IBZ H; 2CGN A; 1VF6 C; 4F6E A; 1N36 O; 2QR4 A; 1V54 B; 3JAR B; 3CCR V; 1M93 A; 2MK3 A; 3BRC A; 3RYH A; 5LP6 C; 3BY6 A; 4BAY A; 2KKW A; 4LF7 B; 4C7U A; 2E76 B; 1VQ5 V; 1SET A; 2WLM A; 5J2T A; 4NYK A; 4PDL A; 1F4N A; 3SPJ A; 2EIL B; 5CB4 A; 2K9P A; 4DV5 B; 1YIJ V; 4UUJ C; 2QKS A; 2GUZ B; 3ASO B; 1SZT A; 4RQE A; 3WFV A; 4P9P A; 1PL0 A; 4XDL A; 1KMI Z; 3ABK C; 5JQG A; 3CHX A; 1R3J C; 4DUZ B; 4UVB A; 3ETQ A; 3K3W A; 4JI4 B; 3QG5 A; 4TV8 A; 3H01 A; 2CAZ C; 2VRZ A; 4DW1 A; 3CC4 V; 1ZUQ A; 1SQG A; 4PD4 F; 1JQ0 A; 2B9Z A; 1ORQ C; 2LJ2 A; 5GTI Z; 4UCS A; 4JI4 O; 3RYC B; 4KXR A; 4LP8 A; 4QPK A; 4X1K A; 3K9A A; 3CJH A; 3M7M X; 4RQF A; 1T5E A; 4J10 A; 1VEW A; 1EZJ A; 3G71 V; 3AK3 A; 2D3O W; 5A2Q N; 2EJR A; 3N2G A; 3JYC A; 2NR5 A; 2WA4 A; 4YJ2 B; 4J41 A; 4WFH A; 1EN4 A; 2QE7 G; 1J5E B; 3N2K A; 4GT1 A; 1K33 A; 2JVD A; 4U3F H; 4TUY A; 1FAF A; 1YJ9 V; 4FVM A; 4L8J A; 1P4R A; 3ABM C; 1UPG A; 3O65 A; 1FJG O; 3P3P A; 1HNZ B; 4B3S B; 2P6J A; 3H1K H; 1M56 B; 1SES A; 2Q8V A; 2DOS A; 2HVK C; 2CTR A; 1ZL8 A; 2KQX A; 4I55 A; 1XNR O; 3OMN B; 1HNZ O; 4B3S O; 2JGU A; 4WFE A; 2DE0 X; 2H8P C; 4JAV A; 4XDK A; 2HJF C; 3JD3 A; 4HNA A; 1GM7 A; 4BW5 A; 4LFC O; 3CP1 A; 1NQT A; 1SRY A; 2XOK G; 2VQE B; 5H6Q A; 2CGO A; 2ATK C; 4RUE A; 4JI5 O; 3FB6 C; 3RYH B; 1H8H G; 4J7K A; 4FPP A; 1PD3 A; 4MTG A; 1M57 B; 5J2T B; 4PA4 A; 3ZMT A; 2VQE O; 3ZMU A; 2QWP B; 1QVG U; 5CB4 B; 2UXN A; 1V55 B; 4PDV A; 1TGO A; 2IJI A; 2Y4T A; 1PNL A; 3VQW A; 4FK5 C; 2H3O A; 3J81 N; 2L35 A; 5JQG B; 4AQY O; 4DUY O; 3UT5 A; 4MT8 A; 1VF6 A; 1ZTE A; 1SQQ H; 1U96 A; 4TV8 B; 1S77 D; 3E8G A; 4K35 A; 2F4V B; 4DR1 O; 5LP6 A; 2W6J G; 3W7X A; 2DQ3 A; 4QPJ A; 2UXD O; 1THZ A; 1RPR A; 4OGQ B; 1L1F A; 2JS3 A; 4FM1 A; 2YIC A; 4X1K B; 1YIT V; 1NH2 D; 2F4V O; 2DJV A; 3CJH B; 2YDE A; 2VWK A; 1Q8I A; 3ZRV A; 2ZD9 A; 2Z3Y A; 4YY3 B; 1BQZ A; 2YIB D; 4X89 A; 3N2G B; 2PGG A; 4J7Z A; 5KMG A; 4UCT A; 1B6Q A; 1Q6U A; 1YI2 V; 3S3X A; 1FXK C; 3ML0 A; 5DEC A; 3N2K B; 1PP9 H; 2AZ0 A; 1AR4 A; 4TUY B; 3ASN C; 4JTC B; 2BE3 A; 3CD6 V; 4K3A A; 5LHG A; 2CTW A; 5EZY A; 4PV1 B; 5L3D A; 1XMO B; 4G2K A; 3AG3 B; 4Q6G A; 4LF9 B; 1ZL8 B; 4I55 B; 1SQF A; 4GKK B; 1JJO A; 3K0G A; 1AB3 A; 1SKV A; 5B1B B; 4BIU A; 3G80 A; 4HNA B; 1S76 D; 1SQP H; 3OM3 B; 5B3S B; 4IHJ A; 4B3M B; 2ARH A; 3K04 A; 1OZ0 A; 4PI2 A; 5JJN B; 1M9N A; 2WLJ A; 2KSD A; 3FD9 A; 2BOB C; 4JAA A; 4CH6 A; 1COW G; 2ILM A; 3FFQ A; 1RP3 B; 5FNV A; 3A0R A; 1EFR G; 4QE9 A; 4H37 A; 4LF5 B; 1FS0 G; 1LUW A; 5GW7 A; 3EFF K; 1FYJ A; 1R6T A; 4PI0 A; 3H1J H; 3UT5 B; 4P30 A; 4AIL C; 1WNS A; 3TJT A; 1SZX A; 3MHH C; 4TV9 A; 2IM9 A; 3T1Y B; 5CA1 A; 5KHK A; 3F5W C; 3OT7 A; 5EK0 A; 1N33 O; 2CUG A; 1YJN V; 1WN7 A; 5LP6 B; 1YZB A; 1AJN A; 1WB8 A; 3N27 A; 1KUQ A; 3R66 A; 3ZS8 C; 4MVR A; 1US6 A; 4JI0 B; 5K1X A; 1MAB G; 4KHP B; 2EJ7 A; 3OFN G; 4YXW G; 5IJ0 A; 2RN9 A; 1ZSP A; 5HFL A; 4DR7 B; 3WB2 A; 4JI0 O; 2QWO B; 3OTO B; 1ENV A; 4MSW C; 3ABK B; 5KMG B; 1CEZ A; 3K0D A; 1EZV H; 3E8H A; 1H2L A; 3MHS C; 4B3R B; 5KA5 A; 2JGD A; 5JH7 A; 3CRA A; 4FM0 A; 4ASU G; 3WB1 A; 1W2B U; 4CH5 A; 3DTU B; 4WBN A; 4R8C A; 1IBL O; 4CBC A; 3ZHT A; 4GKJ O; 5EZY B; 1JPX A; 5BY1 A; 3A0B Z; 3H1L H; 4CS2 A; 3B09 A; 3CSX A; 1SF9 A; 3FYE B; 3TCU A; 2OTJ V; 5BR8 B; 4MVQ A; 2CH7 A; 3ETE A; 4LF8 B; 1AJP A; 1FXK A; 1E79 G; 3HPL C; 4IHJ B; 1XHZ A; 3QO5 A; 3CCL V; 2ZNJ A; 1D5N A; 3B8N A; 1M90 W; 3ABM B; 1VQN V; 5EBM C; 1MSW D; 3LSU A; 3QNE A; 3UCS C; 4UFZ A; 3T1H B; 2WWW A; 2XAQ A; 5FNV B; 3CS5 A; 2QSA A; 3O9O A; 4IT5 A; 2YIB A; 3M99 B; 2Q6A A; 1KU9 A; 1PNM A; 1CP9 A; 4TOI A; 3UO2 A; 4F6R A; 3E86 A; 1X59 A; 3DXR A; 5ITZ A; 3U11 A; 4JV5 O; 4GYC B; 2UXC B; 1GN4 A; 1K8A W; 2OIG A; 4TV9 B; 2ZIO A; 4DRX A; 5IDJ A; 2JEX A; 1L0L H; 4H0L B; 1VQ8 V; 5FPR A; 5CA1 B; 5JVD A; 5IE9 A; 2Q0O C; 4JI7 B; 1GK9 A; 2Y48 A; 4XDJ A; 2LFS A; 1SC5 B; 3UKM A; 3LNM B; 5L3C A; 1Q6H A; 1F51 A; 2ZM6 O; 5IJ0 B; 1D5A A; 2GHY A; 4K0K O; 3TET A; 3ABL C; 1DF4 A; 2P7T C; 3CCU V; 1FPO A; 5LGU A; 4HZ3 A; 1QVF U; 2QKA A; 3CRR A; 1D2D A; 4U7N A; 3P3N A; 2XND G; 4Z1V A; 4KL1 A; 2HG5 C; 2BOC C; 1M5I A; 2FML A; 5LHH A; 3WU2 Z; 2B1G A; 1ZLZ A; 1KYO F; 2JGD B; 5JH7 B; 2ADQ B; 1ZX3 A; 4WBN B; 3L9D A; 1DTO A; 3CCV V; 1Q3E A; 1MZF A; 1IBM O; 1DK1 A; 2IJJ A; 4GUN A; 1NKD A; 2JIZ G; 4BWA A; 2R9A A; 2JK5 C; 3A2F A; 1N4C A; 4UV8 A; 5B1O A; 3C90 A; 2W0X A; 2HHH B; 1JMK C; 2WLH A; 5IYB O; 4G27 B; 4ZI7 A; 4FM2 A; 5LMU O; 2CH7 B; 5F2V O; 1FXK B; 2E3C A; 4X1Y A; 2NN4 A; 4FZ1 A; 1L8D A; 3ZED A; 3ASN B; 3JD0 A; 1ARO P; 2X6C A; 1MG1 A; 3ICX A; 2YI8 A; 1S3J A; 2JDI G; 2ZE8 A; 1H38 A; 1NTM H; 1J95 A; 4FLW A; 3RT3 C; 4NXM O; 1Q6I A; 3FKS G; 4H44 B; 1IX9 A; 3K79 A; 3FYI B; 3I55 V; 2N74 A; 3MD0 A; 1GKF A; 5IYC O; 4DV3 B; 4IYH A; 3RW0 A; 4F6R B; 1AVM A; 1E1Q G; 3DXR B; 4BIZ A; 2F93 B; 5ITZ B; 4YHH B; 4DRX B; 1GN3 A; 4DV3 O; 4JTA B; 5JVD B; 1W59 A; 3VBB A; 2Y69 C; 3QVN A; 1JFF A; 1N34 O; 2IJH A; 1YTF D; 1DLB A; 4YHH O; 4GX2 A; 3AK1 A; 1HWY A; 4EFB A; 3OTF A; 4LF6 O; 1XEQ A; 2F1M A; 3AG1 B; 2LW7 A; 3OE7 G; 1Q82 W; 3VQV A; 4JI2 O; 4R50 A; 4YIO A; 4X8A A; 4RAI A; 3K5L A; 4KUM A; 1VQ9 V; 2X0L A; 2IJK A; 1WA8 A; 3T2M A; 4ABM A; 2WLI A; 3ZRS A; 2MW2 B; 5JCO C; 3QTC A; 2D2C B; 2P06 A; 3KKY A; 3IC7 A; 4DR6 O; 2XAG A; 5KHI A; 5B5E Z; 3LUT B; 1YHQ V; 3HKE A; 1N32 O; 4X65 O; 1OCO C; 3OD4 A; 2G38 A; 1LR1 A; 1O9G A; 2CTP A; 2ITC C; 4NVP A; 2HLD G; 1BHA A; 4X88 A; 3CC7 V; 5TIS Z; 3G6B A; 1CXZ B; 3APO A; 1KKD A; 4JGS A; 4FZ0 A; 2WLL A; 1JR9 A; 1PNK A; 1NVP D; 4X20 A; 1I08 A; 4ZI7 B; 2EX3 A; 3THO A; 1BQ0 A; 1XOU A; 1G8M A; 3X2Q C; 1FJG B; 4X1Y B; 1Q5O A; 3TK1 A; 3J7A U; 3OEE G; 3B4S A; 3OAA G; 1SQX H; 4X64 O; 4OX9 B; 1K5S A; 2WAM A; 1XNR B; 3ZHQ A; 1F7Y A; 4I9W A; 1HR0 O; 4EB6 A; 2ZIN A; 5KAI Z; 2OT5 A; 4FIP C; 2B1I A; 2CE4 A; 1AP6 A; 1VF7 A; 3AG4 C; 4OPA A; 4OX9 O; 1EBO A; 3E22 A; 2WPD G; 2UXX A; 1NU1 H; 4YIP A; 4LFC B; 1GRJ A; 3ZX6 A; 4NTX A; 1GM9 A; 1AJQ A; 1QHT A; 2DYR C; 4DO2 A; 1P7B A; 4JI5 B; 4ZIB A; 3IFX A; 3U10 A; 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1Y66 A; 4I4T A; 3L72 H; 5KHJ A; 3E22 B; 3JCU Z; 1ZWI C; 2AW9 A; 2QWQ B; 4DR4 O; 1SS3 A; 2HR3 A; 3OMA B; 3CXC U; 3ZHR A; 1OCC C; 1S5H C; 1VQO V; 5IJ9 A; 4I50 A; 3VQX A; 1QNM A; 2UUC O; 5KAF Z; 2XAF A; 4X1I B; 1I5X A; 3DC6 A; 4FLY A; 3WG7 C; 3RYI A; 2P67 A; 4MVU A; 2ZNI A; 5CA0 A; 5LXT B; 3OR6 C; 1NTK H; 4H13 B; 2IU0 A; 3BCC H; 4O4L B; 2Q69 A; 1O9H A; 5LBQ A; 2VS0 A; 1TAE A; 2ZR2 A; 1N33 B; 1G4Y B; 1N0N A; 4IIJ B; 1FD9 A; 4I7Z B; 2LFR A; 3JSL A; 3Q4H B; 2RMK B; 4DK1 A; 2HFE C; 1WPX A; 2EIK C; 3AG2 C; 1S0V A; 2Y69 B; 1FXV A; 2HKO A; 2JS5 A; 4IYI A; 4PA6 A; 2Q73 A; 2XUM A; 2DWD C; 4GCZ A; 1GTO A; 1KKC A; 2ADP A; 4LH6 A; 1SA0 A; 4LH7 A; 4DYL A; 2M6Y A; 3CCQ V; 3UQ8 A; 1AI5 A; 1QCE A; 2QWN B; 4PA9 A; 4I9Q A; 3JAW B; 1VMG A; 1KP2 A; 4PA7 A; 4JYY A; 3HKB B; 3SJQ C; 2XT9 A; 1KD1 W; 4P2Z A; 4K8Z A; 1IBL B; 1NS1 A; 4GKJ B; 1P49 A; 5KUM A; 5LHI A; 2UU9 B; 3B40 A; 1OCO B; 2WSS G; 2EIJ C; 4JZG A; 2O57 A; 4PA3 A; 2RQ6 A; 4O2B A; 1LUV A; 1MNG A; 5BXZ A; 2UU9 O; 1EN6 A; 1W0K G; 3BHP A; 1SQB H; 2JJ1 G; 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