1WLJA

Human isg20
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
EVVAMDCEMVGLGPHRESGLARCSLVNVHGAVLYDKFIRPEGEITDYRTRVSGVTPQHMVGATPFAVARLEILQLLKGKLVVGHDLKHDFQALKEDMSGYTIYDTSTDRLLWREAKLVSLRVLSERLLHKSIQNSLLGHSSVEDARATMELYQISQRIRARRGLPRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords interferon stimulated gene 20kDa
publication title Crystal structure of human ISG20, an interferon-induced antiviral ribonuclease
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 168
sequence length 173
ec nomenclature ec 3.1.13.1: Exoribonuclease II.
pdb deposition date 2004-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00929 RNase_T Exonuclease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wljA00
4OPKA 2G8IA 4IDKA 3C6UA 4DWIA 1EKEA 1LW0A 3TAQA 1L3TA 3NCIA 2E4LA 3K5MA 2HNZA 3OY9A 4Z4EA 4O0JA 4DTMA 4O55A 1SKRA 3LPUA 3NF7A 4CJWA 4KB0A 3PO4A 4ELTA 3O3FA 5SWMA 4B8AB 2HW3A 2YKNA 2ZD1A 2Z1HA 2G8HA 1JLQA 5CY4A 1Z26A 1CLQA 1IKXA 3AVMA 1NK4A 1N6QA 3B6PA 3OYGA 4C8KA 4CJRA 1I39A 3M8PA 4Y1CA 3SI6A 4FJLA 4CGIA 3C94A 3NAEA 3VQBA 1ZBLA 4NCGA 4FLVA 4DSLA 1QQCA 1HMVA 1RTHA 3G0ZA 3EYZA 4DQSA 1XHZA 1U4BA 4MQ3A 1T05A 1RBRA 3QINA 3HM9A 1SKWA 4B9LA 4E7LA 4CFAA 1VSEA 5CZ1A 4CGDA 1WSGA 4LD0A 4BWJA 4CHNA 5FRNA 1WSEA 4E89A 3NGYA 5D3GA 1ASUA 4KV8A 4LSLA 2R7YA 4FK0A 3HJFA 3CM5A 4QOZB 2HVHA 4N5SA 2IDOA 3EZ5A 4PUOA 4DTPA 4O0IA 1IO2A 3NF6A 3MEDA 3ZT4A 4I9QA 3S3MA 2Q3SA 3SV3A 1BIUA 4CJSA 3LDSA 3HPHA 3OS0A 1C1BA 2XRIA 3KK3A 1U47A 4F2RA 1S1UA 2VG6A 4J2EA 3ZSXA 4DU1A 4EZ6A 1TKTA 3SJJA 1TGOA 3MECA 4DFJA 3DLGA 5CYQA 3QIPA 1RDDA 1U49A 2XY6A 2B4JA 4E3SA 1RBSA 2IC3A 1TL3A 3VQCA 3VQAA 2OPPA 4CEOA 4CIEA 4CJQA 1BCMA 1UOCA 4RW7A 1RTIA 1J5OA 3MXJA 4N47A 2FBTA 4HUGA 1RBUA 3K5NA 4KI6A 3SNNA 2OPSA 1VSDA 3T1AA 1SL2A 3VA3A 1S1XA 3CFRA 3IRXA 2Z1GA 1LWEA 4OVLA 4I9LA 3HXMA 3SUNA 4DTRA 1S9GA 3T19A 4HTUA 1WSFA 4M3YA 4OLAA 3OS1A 3ZSRA 5T7BA 3K5LA 4QAGA 2HNDA 3RMCA 1VSIA 3QETA 2B5JA 1TKXA 1N5YA 4F2SA 4KRFA 4BDPA 1QS4A 3DRSA 1CXQA 3EY1A 4AHCA 5HRRA 4PWDA 2VG7A 1J54A 2FBXA 4Z4FA 1RILA 3OS2A 2FBVA 3SQ1A 3V81A 1VSLA 1VRTA 3ULDA 1TVRA 1SL1A 4DSIA 4F3OA 1RT7A 3OYAA 1EX4A 2BE2A 4ICLA 4M42A 3F73A 3KLEA 1KFDA 4W5TA 3NBPA 4JLHA 4Z4IA 3F9KA 4B9MA 3V9WA 4DG1A 3KLHA 3NHGA 1NJXA 1HPZA 1S9EA 2WOMA 2X78A 3DLEA 5KGXA 1KVAA 3KTQA 4HUFA 3KLFA 4ZHRA 2BDPA 3OYHA 1CXUA 5HBMA 3VQ8A 3BDPA 4AHTA 2HB5A 1JL2A 2BANA 3LWLA 4EP5A 1T8EA 1C0UA 1JXEA 4B9TA 2KQ2A 4B3OA 1KSPA 4FJ5A 2VWKA 1RNHA 4DU3A 1SV5A 1S5JA 4E1MA 3U3YA 3NH0A 4LSNA 1HQEA 3IG1A 3SPYA 4MFBA 2HHVA 3AA5X 4AHVA 1NJYA 4M3UA 4JS5A 4OKJA 1TK0A 4OKEA 3TAMA 4OGCA 3TABA 4ID1A 3SPZA 4PQUA 3AVIA 3B6OA 1U04A 3LPTA 3P5JA 5KRTA 1FKPA 2XHBA 1L3SA 3RTVA 3RRGA 3SQ0A 1DLOA 2GBZA 2OPRA 2F8SA 2HVIA 2O4GA 3HYFA 4FM2A 1XC9A 2PZSA 1ASVA 2Z1IA 3LP2A 1G15A 5HRNA 1NKCA 3C6TA 2Y1IA 2JGUA 1JLEA 1WN7A 4Q5VA 4RG8A 3QERA 2X6SA 4F8RA 3ZSOA 3ZCMA 3V1OA 3E01A 3DOKA 4FW2A 4LH5A 3AVKA 4W5QA 2YKMA 1B9DA 3NH2A 3L2UA 1X9SA 4HHTA 4Z4CA 4Z4HA 2IOCA 1WSIA 3WNHA 1KFSA 3IS9A 3CYMA 3L3UA 1Y97A 2EX3A 2HNYA 1HQUA 4FJIA 3QEWA 1QSLA 2X74A 4R5PA 2A1SA 3DRPA 3WNFA 2OPQA 3ZSQA 3KJVA 4FJ8A 3D0PA 1UA1A 2G8WA 1EXQA 1IG9A 1W0HA 4O4GA 5E41A 2P1JA 4BDZA 3MEEA 1TL1A 3D45A 4CJ5A 3PX4A 4RW9A 4CK3A 3IAYA 4CEBA 1T7PA 4BDYA 4CJVA 2X6NA 2P5GA 1DTQA 2HHQA 4DQIA 1JL1A 4CGJA 4DFPA 2G8FA 4ELVA 1C0TA 1KTQA 1NKBA 4KTQA 1LV5A 3AVHA 2A1RA 4O5BA 1S1WA 1JLAA 4E7HA 4K8ZA 3AVCA 3VA0A 3QNNA 3CG7A 1JLCA 4KFBA 1QE1A 4JRPA 3TAGA 2KZZA 1CZ9A 4FLWA 3QLHA 4CHQA 3QIOA 3VQDA 3K58A 3FFIA 4IG0A 4CFCA 4BE1A 1TK5A 2F96A 2YHBA 3LP1A 3OYCA 2JLEA 1C1CA 1ITGA 2DFHA 4F4KA 2P51A 3QEIA 4Z0UA 3DLHA 4C8MA 1RDBA 2D0AA 3OYIA 2D0CA 4ZTJA 4CJ4A 3TR8A 3CFOA 4BE0A 3ZSWA 4OKKA 4I2QA 3L2QA 1RCHA 4C8OA 3VQ6A 3V4IA 1D9FA 4CF0A 4FJ7A 2HHTA 4CEFA 3K2PA 2YNFA 3OYDA 1NK0A 3PO5A 3ZSYA 3KIOA 3WNGA 4FZZA 4PY5A 4CFDA 3PY8A 4CF2A 1BIZA 4FJKA 2HHUA 1D9DA 4M3ZA 4FYDA 4IFVA 4IKFA 2OA8A 3DRRA 4E19A 4IFYA 1KCFA 4OJRA 3U6FA 4DMNA 3V9UA 4LH4A 4O44A 1RBTA 4DTJA 3THVA 3HVTA 1TAQA 1XHXA 3AA3A 4KB1A 4DQPA 2QKBA 5J2NA 4CJPA 3K5OA 3OYKA 1L5UA 2ATQA 4L8RB 4FJNA 1NK8A 5HLFA 3AO4A 4M3RA 5J1EA 3TAFA 4FZXC 4B9UA 5DK5A 3SUQA 3SUOA 2LSNA 3LP0A 2ETJA 1TKDA 1A5VA 2E6MA 1BISA 1BQMA 4DLGA 3RR8A 5KGWA 1WSHA 4GMJB 1RTDA 2P5OA 4BACA 4DQRA 5C42A 4B8CA 1RDCA 2O4IA 4NCAA 1RTJA 2HHSA 4CF8A 4AHUA 3NGZA 1YTAA 3JSMA 2G8UA 3KD1E 3HPOA 4AHRA 4AH9A 4HUEA 1VRUA 4EP4A 4FLXA 3MXMA 1S6PA 3JYTA 1KLMA 1X9MA 4M45A 4FJJA 3WNEA 2DY4A 1NJWA 1Q8IA 3LANA 1RDAA 4DS4A 2RKIA 2AJQA 3M8QA 3OVNA 3V1QA 3VQ9A 4YFUA 2XY5A 3TI0A 4ELUA 1BHLA 1VSJA 4CF9A 4FLTA 2OZMA 4M41A 2F8TA 3OYEA 1KRPA 4NCBA 3M8SA 1A5WA 4G1QA 4HCCA 4DS5A 4CIGA 4I7FA 3TAPA 2KTQA 3ZT0A 4DTNA 5EU7A 4FJGA 2EHGA 1BI4B 2KFZA 1LAVA 4ID5A 3RMAA 3AO2A 4E0DA 5FRMA 4KPYA 1LWCA 1UA0A 1VK0A 4NYFA 3L3VA 3HK2A 3VQ4A 1C1AA 1WNSA 3LP3A 4IBNA 3LZIA 1L3VA 3AVJA 4E7JA 4N76A 2D5RA 5CYMA 3TAEA 1RBVA 4KAZA 4Z4GA 3PX6A 2QKKA 1S1TA 3HVRA 3NFAA 3T3FA 5I3UA 3SCXA 2DFEA 1NK5A 1HJRA 4DSFA 1MU2A 2RF2A 3AVAA 2KW4A 2XY7A 2W42A 4EZ9A 4OPJA 4FJ9A 3KKRA 4IG3A 3OYBA 3UIQA 5CZ2A 4DTSA 3S3OA 1W9HA 1FK9A 2FC0A 3LAMA 4CHYA 1BCOA 3KK1A 4B9NA 4H8KA 2HMIA 4CE9A 4CFBA 4N56A 1LAWA 3SQ2A 2DFFA 4JRQA 4C8LA 4KHUA 1ZBUA 5HROA 1RT2A 1RT4A 4H4MA 4ZTFA 3RWUA 3CM6A 3MEGA 4M3WA 4KHYA 4J2BA 4W5RA 3AVBA 3L8BA 4KREA 4WE1A 3OYMA 5J2PA 3I8DA 3AO5A 3HPGA 2DTUA 1DTTA 4FW1A 2B6AA 4CEDA 4C8NA 2Z1JA 3O3HA 3OYFA 4FVMA 2G8KA 4CEZA 3HT3A 1BL3A 1CZBA 2YV0X 4E1NA 1QTMA 3ZSZA 4CJKA 1TKZA 3H08A 5HRSA 3AA2A 3I0RA 5KI6A 3VQ5A 4CGHA 1QSSA 4FJXA 2YNHA 2Y1JA 1VSKA 3QO9A 3AO1A 3RMDA 1A5XA 1LW2A 2GUIA 1FKOA 3AVFA 2PYJA 2QXFA 1QHTA 4CJEA 2OZSA 4CJLA 1D5AA 4FJMA 5DMRA 4FXDA 3O4QA 3NE6A 2OYQA 3RRHA 1NK9A 1YVUA 1NK6A 2PYLA 1D8YA 1HYZA 5JS1A 1VSFA 3V1RA 1RT5A 1ZYQA 3DMJA 4AHSA 2YNIA 3AO3A 2IS3A 2ITGA 1K6YA 4RW8A 3AA4A 4RW6A 4CGFA 1LWFA 4I2PA 1FXXA 4CF1A 3K59A 1RT3A 3L2WA 1ASWA 2NUBA 1NOYA 1WAJA 1IH7A 4M3XA 4KTZA 3ZT3A 3NF9A 4FCYA 1EETA 5JS2A 1HNIA 3VQ7A 4CK1A 3G10A 3V6DA 2BGGA 1HRHA 4FM1A 1S6QA 1EP4A 3HP6A 1GOCA 1HNVA 3CQ8A 3HSTB 1BGXT 4JS4A 2GV9A 3DLKA 4KO0A 4CHZA 3NH1A 4AILC 3HP9A 2ZE2A 3MAQA 4W5OA 4DFMA 3MXIA 5HP1A 4B9SA 1HYSA 2KZMA 1O1WA 1SL0A 4TSXA 5SZTA 4CGGA 4CHOA 4NYNA 4DU4A 2G8VA 1YTUA 3DI6A 3RMBA 4YNQA 1GOBA 4DSJA 2D0BA 4RW4A 4M3TA 1NK7A 1WAFA 2YNGA 3KLIA 3L2VA 3OJSA 3DOLA 3PV8A 3ZT1A 3QNOA 2ZQBA 3DLRA 1XI1A 4F3TA 4CJ3A 4BWMA 3LALA 5KTQA 3OYJA 3V9XA 3OJUA 5FROA 3VN5A 3U3GA 3PUFA 1QSYA 1NOZA 1I3AA 3SV4A 1NKEA 4J2DA 4H4OA 4OLBA 4DLEA 3V9SA 5C25A 4CESA 4BE2A 4B08A 1XWLA 3AVLA 3HL8A 3VQPA 4CEEA 4CHPA 3VQEA 4J2AA 4Q0BA 2HHWA 1IKYA 1SKSA 1BI4A 3CFPA 1Q9XA 4FK4A 3LZJA 4FLYA 4KHWA 4HVJA 3QEVA 3OYNA 1VSMA 4DSEA 2PY5A 4GVMA 1U48A 1RT6A 1JLFA 3O3GA 4DTUA 4FJHA 3KD5E 2IGIA 3SZ2A 4KHSA 1TAUA 3AVNA 1ZBIA 3TARA 1IKWA 3NGIA 5I42A 1JLGA 4CEAA 3QESA 4GW6A 3QEXA 4CERA 1ZBHA 1X1PA 1HYVA 4OGEA 3KK2A 3LAKA 4FM0A 3SYZA 1IKVA 1X9WA 3ASMA 1REVA 3BGRA 3P1GA 4E7IA 3HO1A 2FBYA 4CCHA 3SQ4A 1NJZA 1T03A 4KI4A 2RPIA 4CJUA 4PA1A 3ISNC 1UWBA 3A2FA 4KTWA 4XIUA 4FLUA 1R0AA 3KLGA 4CK2A 4UQGA 1KVCA 4CEQA 2I5JA 4DF4A 5FDLA 3NDKA 3S9HA 4N41A 3AVGA 1KLNA 4DSKA 2KFNA 3ZT2A 2VG5A 4W5NA 2HHXA 4DFKA 1C0MA 3O4NA 3P83D 1Z25A 3ZSVA 3QEPA 1J53A 3NF8A 2IAJA 2VWJA 1UAXA 3PX0A 1KVBA 1SUQA 1B92A 3DYAA 1GOAA 3OYLA 3L2RA 4DF8A 5KRSA 3S3NA 1U45A 1L3UA 1Q9YA 1JXBA 2YHAA 1F21A 4Y1DA 1JLBA 4CECA 3RR7A 4K8XA 4CJTA 4QCLA 4HCBA 1J9AA 4KKOA 5J2QA 2RN2A 3KKSA 3VQQA 3V9ZA 5J2MA 2XY8A 3K57A 4E7KA 5HRPA 1JKHA 4LY7A 1C6VA 4CIFA 4DTXA 3TANA 1TK8A 4B9VA 2E6LA 4KHQA 3C95A 4FK2A 3M8RA 4DQQA 4FZYA 3LWMA 3DLBA 3SUPA 1WSJA 1YT3A 2WONA 4FLZA 3ALYA 1B9FA 3ITHA 1BQNA 1S1VA 4KHNA 1WLJA 4DTOA 1TV6A 1VSHA 2XO7A 3TWHA 2QK9A 5C24A 3DM2A 3AV9A 1ZBFA 3I0SA 4CJFA 1RT1A 5K14A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OPKA 4IDKA 1IBKK 4O8UA 3GE1A 3CCLN 4GKJK 3K5MA 3OY9A 4O0JA 4FOEA 4WFNL 3UKRB 5C10A 3DAWA 1NGEA 4AQYK 5SWMA 2YKNA 2CGJA 3R8EA 3DXMA 1IKXA 1NK4A 4C8KA 3M8PA 4YOWA 5A2QO 1ZBLA 4FLVA 1NGCA 4JYAK 1T05A 3CJ9A 1RBRA 2IVPA 1SKWA 4BG9A 3EKUA 4LD0A 4BWJA 4E89A 2R7YA 4LSLA 3LM2A 3CM5A 4N5SA 3CETA 3FZHA 2IDOA 4DTPA 2GEMA 1NGAA 1YIJN 3CJBA 3NF6A 3D2FB 3D7EO 5AQIA 2XRIA 2YHWA 1U47A 3C7NA 4FWNA 3CERA 1VQNN 3MECA 5CYQA 1RDDA 3M6GA 4CEOA 2IC3A 1TL3A 1J5OA 3MCAB 2FBTA 4HUGA 1RBUA 1SL2A 1VSDA 4PKHA 1S1XA 4I9LA 3SUNA 2VGMA 4DTRA 1S9GA 4M3YA 3OS1A 3RMCA 1E4GT 1N5YA 4KRFA 4BDPA 3DRSA 3O4WA 2VG7A 3CHWA 4JK7A 4Z4FA 4EHUA 1RILA 1VSLA 2ZM6K 4DSIA 1TVRA 1EX4A 4MDBA 3F73A 3HRGA 5TKYA 4JLHA 4CZLA 3F9KA 3CCVN 3N4QA 2WOMA 3DLEA 3O9QA 2YI1A 4JKGA 3VF6A 4GY2B 3NH0A 2HHVA 4JHDB 4AHVA 4JKHA 3VEYA 4OKJA 4OKEA 3O9SA 4WFBL 4H0PA 3TABA 5LY3A 3AVIA 4PQUA 3LPTA 2XHBA 4DR4K 3RRGA 1XQSC 2O4GA 4WQ5A 1XC9A 3AAQA 3W0LA 3LP2A 1G15A 4BRAA 5F1XA 4RTFD 3QERA 3ZSOA 3V1OA 3E01A 4FW2A 4B3SK 4A62A 3AVKA 4W5QA 4H5VA 3NH2A 1VQ5N 3D2EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OPK A;  4IDK A;  1IBK K;  4O8U A;  3GE1 A;  3CCL N;  4GKJ K;  3K5M A;  3OY9 A;  4O0J A;  4FOE A;  4WFN L;  3UKR B;  5C10 A;  3DAW A;  1NGE A;  4AQY K;  5SWM A;  2YKN A;  2CGJ A;  3R8E A;  3DXM A;  1IKX A;  1NK4 A;  4C8K A;  3M8P A;  4YOW A;  5A2Q O;  1ZBL A;  4FLV A;  1NGC A;  4JYA K;  1T05 A;  3CJ9 A;  1RBR A;  2IVP A;  1SKW A;  4BG9 A;  3EKU A;  4LD0 A;  4BWJ A;  4E89 A;  2R7Y A;  4LSL A;  3LM2 A;  3CM5 A;  4N5S A;  3CET A;  3FZH A;  2IDO A;  4DTP A;  2GEM A;  1NGA A;  1YIJ N;  3CJB A;  3NF6 A;  3D2F B;  3D7E O;  5AQI A;  2XRI A;  2YHW A;  1U47 A;  3C7N A;  4FWN A;  3CER A;  1VQN N;  3MEC A;  5CYQ A;  1RDD A;  3M6G A;  4CEO A;  2IC3 A;  1TL3 A;  1J5O A;  3MCA B;  2FBT A;  4HUG A;  1RBU A;  1SL2 A;  1VSD A;  4PKH A;  1S1X A;  4I9L A;  3SUN A;  2VGM A;  4DTR A;  1S9G A;  4M3Y A;  3OS1 A;  3RMC A;  1E4G T;  1N5Y A;  4KRF A;  4BDP A;  3DRS A;  3O4W A;  2VG7 A;  3CHW A;  4JK7 A;  4Z4F A;  4EHU A;  1RIL A;  1VSL A;  2ZM6 K;  4DSI A;  1TVR A;  1EX4 A;  4MDB A;  3F73 A;  3HRG A;  5TKY A;  4JLH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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