1WNOA

Crystal structure of a native chitinase from aspergillus fumigatus yj-407
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLREVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase
publication title Crystal structure of a native chitinase from Aspergillus fumigatus YJ-407
rcsb
total genus 148
structure length 394
sequence length 394
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1wnoA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1wnoA01
4J28A 1BHGA 3ZJ8A 2OSXA 1XYZA 1LL7A 2O9PA 3QOKA 1I75A 4DWSC 2GUYA 5FL0A 1ODUA 2JALA 4F66A 1E4LA 4CU8A 1NOWA 3MS8A 1MW3A 3RJYA 2Y8VA 1KR1A 2HVMA 2C0HA 3N12A 1CWYA 4CD8A 2ZUSA 3ARRA 1JZ3A 5BCAA 4FMVA 1LLOA 1XHGA 1BTCA 3VMPA 1VFOA 3RM9A 2DT0A 3WIJA 4AD2A 1MW0A 5IHRA 3WKZA 4MAZA 1FP8A 3WEOA 2E9LA 3RCNA 3UG4A 2GDVA 4OZOA 5GNXA 1BF2A 3WH6A 3ALGA 3THCA 3GXFA 1P6WA 1N82A 3AS0A 2VC9A 3AZSA 1E43A 1ZBVA 1GOOA 1V0MA 2VZSA 5FKYA 2O92A 2XGBA 5I23A 4AWEA 3WQ4A 4ZXOA 1CLXA 4W88A 1JYWA 3UCQA 3BLPX 5D9OA 4MNLA 4PSPA 4PMQA 1NOUA 4TUFA 4YHGA 2WZEA 3OZPA 3ZT7A 4D6FA 4X9YA 1V6UA 2WVUA 2CXGA 2ZX7A 5A2CA 1H1NA 3BCFA 1HP5A 3N15A 4D1IA 3BXWA 4L4OA 3SIMA 1CLVA 4AZ5A 1ISYA 3RILA 2GFTA 2E0PA 1J0ZA 2G3IA 3TTSA 2X09A 1PZ3A 2GK1A 3AHTA 3VIGA 2UY4A 1R7AA 4W93A 2XVNA 1ZJAA 3IANA 3WUGA 3EMQA 1C92A 1B31A 1JD9A 4Y7EA 2F2HA 5I79A 2WKLA 4PUEA 4W5UA 5C70A 1MQQA 3CPUA 1MFVA 1M53A 2WZHA 1JXKA 2YLLA 1GJWA 2J8FA 4MB5A 1UD4A 2YBTA 2WSKA 1A3HA 2YL6A 1NH6A 1JFXA 3F5KA 3BLKA 1UD2A 1H41A 3WFLA 5BXTA 4WKHA 2W91A 3BAWA 2VCCA 4IPNB 5IXEA 2NT0A 1MW1A 1C3FA 3CUJA 1UD3A 4PMXA 1CEOA 1GUVA 2NW0A 5CPSA 4S3JA 4PBGA 2NSXA 2Z1SA 3CZKA 4WKFA 1BLIA 2GSJA 4W85A 1UWUA 5A3HA 5DT5A 4BF7A 4CKQA 1UD8A 4W87A 3QHOA 1E4MM 2DPEA 1QBAA 2VQUA 2EPOA 4MADA 1UWIA 3APGA 1W9VA 1QPKA 1DWIM 2X0YA 5I24A 5I6SA 1B3XA 2XHYA 2WMIB 2C8NA 2CIPA 4EANA 5BXSA 2J79A 2JF6A 2E8ZA 5A6KA 1JFHA 1C91A 1PEZA 5LA0A 4PN2A 2CKRA 5D8WA 3EBVA 4B9ZA 2WC3A 5A8PA 2VRKA 3AIUA 1R86A 3N18A 1VEOA 4IISA 5IFPA 1CIUA 5BROA 1M04A 2JE8A 4BS0A 1B2YA 1C7SA 5KEZA 2WAGA 3WELA 4WF7A 1R8LA 3VNYA 1OM0A 4U31A 4B3KA 3GDBA 3WQVA 4LGXA 1E1FA 1F4HA 2OSWA 2J78A 1FH8A 2YDRA 2D0HA 4IUGA 2E4TA 1TR1A 4AXNA 1ISVA 3N1AA 4PTWA 1C8XA 4UFHA 3E1F1 3TTQA 1E15A 1W1YA 1QVBA 3SCNA 2HISA 4D6DA 1FH9A 2Z1KA 5CPTA 1CXEA 2YL5A 1OD8A 1DEDA 4ACZB 3TONA 3S6TA 4URIA 3TA9A 4NZCA 1DP0A 3N11A 3W53A 2CYGA 1LQ0A 3NUKA 4M56A 2OLHA 3ZSTA 4D6CA 2DSWA 4W7VA 3I3BA 4P8XA 5I5RA 5LA2A 3BSGA 4JKLA 1E71M 4QLJA 5A6LA 1WO2A 1WDQA 2XVKA 2NT1A 2E8YA 4Z2JA 4GI8A 2WSPA 4W8BA 3ZQ9A 1BYBA 1FFQA 4H04A 1NARA 3AMLA 2DIEA 1J0KA 4AEFA 3EYPA 1XH1A 1UA7A 4GZIA 5AYIA 1IT0A 3ZM8A 2Y2WA 2X05A 4YPJA 2PWGA 4PMOA 4CD7A 1BYDA 4Z2LA 5DT7A 1VAHA 4X0VA 1E6SM 4UQEA 1JZ6A 2YA0A 3AYRA 3O6AA 4ATLA 1JAKA 5CG0A 2BFGA 1H09A 4BQ2A 4EK7A 1KBBA 3K8KA 4S3KA 3ARUA 1GHSA 5FIPA 2PBGA 4ZE4A 1HJWA 1EO7A 1UR2A 2W66A 1EDQA 5FOOA 1XSIA 2PWEA 3T09A 3CHFA 3OB8A 3W27A 3EDDA 2YDQA 2WBKA 3OA5A 3DHPA 4JHOA 1HL8A 4QDMA 4TX8A 5IHSA 2X0HA 1X6NA 4Z2KA 1ISZA 4V27A 3THDA 2GJPA 1KQYA 2BXZA 1EO5A 5A6SA 5AC4A 1V0NA 4H8UA 4JFUA 4GZJA 7CGTA 3VGGA 4UTFA 1Q6EA 1Q6GA 3A4XA 2WKGA 2CBJA 2W67A 1W9DM 1BQCA 1E9LA 1CGUA 1W3LA 4U2YA 2CEQA 1E72M 1V6VA 1UZ4A 3N17A 2FDMA 2ZUTA 4HZ6A 1PX4A 2D3LA 4JL2A 5A1AA 4KMQA 2IXUA 5TD4A 1NWRA 4ZFMA 4JAWA 3BAYA 2CPUA 4XUYA 1ZB5A 5A94A 2PBOA 1PX3A 3AICA 5DMYA 1VFFA 3CUFA 1UWSA 3VM7A 4CU6A 1KXTA 3RM4A 2D0FA 1UH3A 3PZMA 1VFUA 1E56A 3BAJA 2VZOA 3ZJKA 4QLLA 2WMJA 1OD0A 3KE0A 1QNOA 1J11A 3L4WA 3W37A 5M03A 3WL1A 1UR4A 1H3GA 1DWHM 4HMCA 1R85A 1FA2A 4BQ3A 4GO8A 3WNLA 2XSBA 2WVTA 3T2QA 3BAKA 1XD1A 1C93A 1V02A 8CGTA 3AHXA 2CETA 3WUEA 3UEQA 4YHEA 1OT1A 2QMJA 3GM8A 4P7RA 1V3HA 3FY1A 2WW5A 2Y5EA 1EDGA 1O6IA 1E6RA 4Z2GA 4PSRA 2WMHA 1W2PA 4CVWA 4CGTA 4NRSA 5FCZA 1E6NA 3IK2A 2VO5A 2D2OA 4F8XA 1XC6A 1CDGA 3VMNA 1EIBA 1VEMA 1UKSA 2BY2A 2G3MA 1IZJA 2GK1B 3PTKA 5ABFA 2OYKA 2O9RA 2EBNA 3NSXA 4TVCA 5BRPA 4WLCA 1R87A 2J7CA 2YJQA 4JCMA 3AFBA 4XV0A 4UQDA 5EB8A 2RGLA 2VZVA 4P8VA 3WH5A 1UUQA 4PYSA 4PTXA 2XJ7A 3T2PA 3VVGA 1XV8A 4CN1A 4E8DA 4F9DA 2WM0A 1CNVA 2DIJA 2XM1A 2CCRA 1BYCA 3VD5A 2CNCA 2GJXA 3FAXA 1VIWA 4M29A 1GQLA 2V3FA 1XSJA 3VILA 1OGGA 1W9UA 5I0DA 1PJ9A 4AZGA 3F5LA 1JIBA 1HKJA 4RE3A 1E6XM 1W3KA 3RPMA 1GOKA 1HP4A 2ZUWA 1JGIA 4ML4A 3TOPA 3WEMA 5JIWA 5E6YA 2CBVA 2W63A 3A6OA 2WHMA 3EDEA 4E8CA 1FFRA 1VBUA 5GNYA 1MQPA 1CPUA 4AIOA 1TG7A 2WANA 4MB3A 2FH6A 1UR1A 4Q7NA 2XUCA 4U3CA 2WC7A 4OBSA 1JNDA 2UY3A 5M5DA 3I3DA 5LYRA 4OOUA 1JI2A 4PCTA 1H49A 3ZMRA 3T0BA 3VIHA 4IM4A 3WH9A 2VZTA 1GOIA 4KRTA 4GQQA 4UZSA 2W5FA 2XFYA 3OIHA 2XWDA 2YA2A 3KL3A 5M3WA 2VX7A 4TTUA 3B9AA 3RMEA 1W32A 4FLSA 1QOXA 2VT0A 4JFTA 1ESWA 3HU7A 1AQMA 1JAEA 4HU0A 2V5DA 1VB9A 3PZNA 1WP6A 3W82A 5C8BB 1JD7A 1W1VA 3AXXA 4HP5A 4MNJA 1W3HA 3OBAA 4R5EA 4Z2IA 4XZWA 1E0XA 2FHCA 1PAMA 1V3MA 4E4PA 2EPMX 1E3ZA 4UFIA 1D3CA 5ECUA 1X1NA 1G01A 1OSEA 1RPKA 2B31A 3WMBA 3ZSSA 3WQWA 3MUZ1 3ZJ6A 2J47A 1RP8A 4F79A 2D22A 5DFAA 4HZ7A 3BC9A 3AI0A 5A8QA 1AQ0A 4UNIA 4CCDA 1YQ2A 3RIKA 2OYMA 2J75A 4UFLA 4DWSD 4D6HA 1TUXA 4H2CA 2VX4A 3ARWA 3PZGA 2FHFA 3L2LA 5E70A 3TTOA 3SUUA 2VURA 5CXPA 2J7DA 1MW2A 1CYGA 2J74A 1TFVA 1V6XA 2DT1A 3L4ZA 3AS1A 3WD2A 3VGFA 1B30A 3VO0A 4PRWA 4FLOA 5A6BD 4AZHA 1ZBKA 3T0AA 1EOKA 1ZL1A 3UESA 4MNKA 1JDDA 2V5CA 3HN3A 4CVUA 4P8UA 4DUVA 1QNPA 2VL4A 4U2ZA 5A6AA 3ARZA 4HA4A 2Y8KA 1KCKA 1KXVA 4B9YA 2OWWA 1UYQA 3EDJA 4IPLA 3B8SA 5CLWA 1Q4NX 4FF5A 3CO4A 1WDRA 1V0KA 4H8HA 1PBGA 3OGVA 2G41A 1KB3A 1U30A 3QGVA 3UR8A 3ZR6A 2G8ZA 2W92A 3CZJA 3AIBA 2G3JA 2XVLA 1GHRA 4GI6A 3WD0A 2VOTA 2DSUA 4KH2A 1DTUA 4GKLA 4FK9A 4M81A 2WWCA 5KZ6A 3PBGA 5DO8A 2W61A 3IAPA 4Z2HA 3M46A 4GZEA 3AROA 1FP9A 2W62A 1JNEA 3WMCA 1A47A 1JZ8A 2J62A 3VIPA 2XTKA 2WYSA 3VIJA 3WUBA 5CGTA 1W1PA 3CZLA 3W6MA 4BZYA 4UFKA 1QI3A 2X1IA 3OG2A 2WC4A 1CGYA 4M1RA 4GPNA 4D71A 4CN4A 3LPGA 4AZIA 1XYFA 4W5ZA 3FN9A 3ARVA 2BV9A 1J9YA 1W9BM 4K68A 5GQBA 2BXYA 1C8QA 1V03A 3G6MA 1SFSA 1OGSA 3VDBA 1WE5A 1G1YA 2XM2A 5EFDA 1KGXA 4WSKA 5CPQA 4AIEA 4A4AA 1WNOA 3IAQA 4H8VA 4HTYA 2Q8XA 3VIKA 1G0CA 5A8MA 3BGAA 1ZBWA 1I1XA 4GO9A 3NCOA 2ESCA 3EMZA 1VJSA 4DWSA 3NSNA 1XCWA 5A6JA 2IUZA 3EMCA 3L2MA 5CGMA 3PHAA 4HU8A 1B3ZA 3AHYA 4EAMA 5I78A 3GZAA 3RJXA 3QOMA 1RH9A 5CQ1A 2VI0A 4WJXA 2OWXA 4B15A 1K9TA 3A4AA 3T08A 2UWFA 3W25A 2WWDA 1H2JA 3TTYA 1W91A 3SUVA 1JG9A 3WBEA 3TP4A 3DYMA 1FOBA 1EH9A 2FH8A 4AC1X 2J7HA 2VX5A 1JDCA 3B9DA 1HJUA 1KXHA 4PMNA 4J3SA 2F8QA 5A95A 3U7BA 1JF5A 1TZ7A 1QI2A 2RGMA 5ABHA 2WLZA 1E4IA 1GOWA 1CZ1A 3HMCA 4UQ9A 3K4AA 4UQBA 2XGIA 3PZQA 1V3LA 2ZXDA 3GH7A 3VDHA 2DH2A 1E6QM 1BYAA 3AJ7A 5ABFB 1VRXA 3O9NA 2WB5A 3U57A 1OBAA 5FD0A 2A3CA 4B16A 4D6EA 2VRQA 1BVZA 3GH4A 2OWCA 3AMKA 4U5IA 4U3AA 1E5NA 3VD9A 1GVIA 3BMVA 2WVSA 3CUGA 3JUGA 1B90A 1E73M 3D3AA 1EOMA 1H0GA 3UG5A 1JF6A 1HT6A 1L8NA 2GJXB 2E9MA 1US3A 2ZUVA 4GXPA 3W6LA 3OLGA 4ZENA 2ZE0A 3W26A 2J7BA 2A3HA 1JZ4A 4AD0A 2VNCA 5HNNA 3NJ3A 4DM2A 1J0JA 2DT3A 1UG6A 4LYRA 1GQJA 1WZMA 5E9AA 3HJEA 3VKKA 1V08A 1H5VA 1XD0A 3NYDA 3LPOA 5D9NA 2CBIA 1PIGA 1E6ZA 1QNSA 1TA3A 5A8OA 3VTRA 1JYNA 1OGBA 2D23A 1UR0A 2DSVA 4J3VA 3SUSA 3SUWA 2W4XA 2DDXA 2JEQA 4AD5A 1WZKA 3WNNA 3GXIA 2ZXBA 1HN1A 3EDFA 2BVDA 2WCGA 1BFNA 1KXQA 4UFMA 4EKJA 3BH4A 4KGLA 2PC8A 4JCLA 1OINA 2GDUA 1Z32X 2IXVA 3CMJA 5A6MA 3W24A 3FHQA 3MSGA 1GZJA 1AQHA 2XIBA 4AZ6A 1GNXA 1S46A 2WHLA 3VGHA 1HKKA 3B9EA 1KGWA 3POHA 4AZ7A 2QHAA 2BNJA 4D1JA 1R7OA 3AS2A 3N13A 2D24A 3WF1A 4XB3A 1OB0A 2CBUA 1LG1A 2UY2A 4C7GA 1NP2A 4AIUA 3ARTA 1AMYA 1QI5A 2V3GA 2FHBA 1V0LA 4AD1A 3NDZA 4FLQA 2WMIA 5ABEA 3DYPA 1LL6A 1GORA 4AD4A 2F61A 2XWEA 3WDIA 2WMKA 1KCLA 3MKKA 3L4VA 4CCCA 4ATWA 1VFMA 4XZBA 4PTMA 3CMGA 4GINA 1WZAA 2EO7A 1M03A 5A2AA 1QHZA 1NWSA 3W0KA 4HZ8A 2ZX8A 4W84A 2ZXQA 4U5KA 3D5HA 2WMGA 2VCBA 4Q22A 1UR8A 3ARYA 1V3JA 3A3HA 5AY7A 4AW7A 8A3HA 2J25A 4M82A 5I3DA 4AZBA 3WF2A 3BCDA 4HOXA 5E09A 3VM5A 2G3NA 5BXPA 3A47A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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