1WSEA

Co-crystal structure of e.coli rnase hi active site mutant (e48a*) with mn2+
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMALMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Ribonuclease HI
publication title Identification of Single Mn(2+) Binding Sites Required for Activation of the Mutant Proteins of E.coli RNase HI at Glu48 and/or Asp134 by X-ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 44
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2004-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wseA00
4M3TA 3AA2A 3DRRA 4DU4A 3HT3A 4F3TA 4E7IA 4FJ5A 5KI6A 1NK9A 3V1OA 1VK0A 4IDKA 4N76A 2FBVA 4JS4A 3THVA 4OLAA 4FLZA 3QETA 3QINA 3KLIA 3SPZA 2HB5A 4CGGA 3OYEA 4MQ3A 1KLMA 1VSFA 2VWJA 1RBRA 3NF6A 1VSJA 3PUFA 1U45A 4CGDA 2NUBA 2DTUA 1JLCA 4E1NA 3QEPA 4DFPA 2PZSA 3WNEA 4FJJA 3F9KA 1DLOA 2B5JA 2G8VA 4Z4IA 4W5RA 3VQ6A 3K5OA 1WSGA 1HYVA 1RT2A 4FW1A 4CJLA 4M3RA 2Q3SA 4HVJA 1T05A 1RDAA 4DTXA 3NH2A 3V9XA 1BCOA 2A1RA 2KZZA 1I39A 1TAQA 2IOCA 1RTDA 3NDKA 1NJXA 5SWMA 3OVNA 3O4QA 4FVMA 1WLJA 3QLHA 1NK7A 3ULDA 3AVAA 3VQAA 4CK3A 4RW4A 1IG9A 4KHWA 4CFDA 1RT7A 3RMBA 3O3GA 4OGCA 4CIGA 5HRSA 1O1WA 3I8DA 4HUFA 3HP9A 2XHBA 2RKIA 1TL3A 2D0CA 4OKEA 3OJUA 1QS4A 4DSEA 1C6VA 1B92A 3ALYA 1VSHA 2WONA 3VQ5A 3RR8A 2BGGA 2DFEA 1IH7A 4ELTA 4DSJA 3NCIA 1SKSA 2I5JA 3PV8A 4DG1A 3OYDA 3ZT2A 3TWHA 4M3ZA 3HJFA 2EHGA 3SUOA 3V1QA 3EZ5A 2HVIA 3AA3A 3LP2A 1ZBUA 2B6AA 4I2QA 4OVLA 4EP5A 4CF8A 3AVCA 3M8PA 3ZCMA 3IAYA 4KKOA 3QNOA 4M3UA 5KGWA 1BGXT 3SZ2A 4BWJA 3K2PA 4DTJA 2XY7A 3RRGA 2ITGA 3VQQA 4DFKA 2JGUA 4OGEA 4ZHRA 1HYZA 2G8IA 2P5GA 3HVRA 3HVTA 1EXQA 4CF1A 3TAPA 1G15A 1K6YA 3DLKA 4B3OA 3HYFA 5HRNA 4E1MA 2VG7A 1RBVA 3DLRA 3NAEA 4OKKA 1EX4A 5C24A 4FM0A 1IKYA 2DY4A 1SUQA 3K57A 4DSFA 3ZSWA 3JSMA 4DU1A 3KLGA 3SQ1A 4B9TA 4Z4EA 3AVMA 4OLBA 3MECA 4CEFA 3M8SA 1S1XA 1JLEA 4I7FA 2ETJA 2JLEA 3G10A 4HCCA 4E19A 1ASWA 2F96A 3C6UA 3MEDA 1ZYQA 4CIEA 4NYNA 1S9EA 3VQEA 3OYIA 1RTHA 4CESA 3RMCA 1NJZA 4FJGA 4FLUA 2YNIA 3V9ZA 4KB1A 3VQ8A 1QHTA 4M41A 5I42A 2HW3A 1QSYA 3OYFA 1RBTA 2KTQA 2P51A 2X6NA 3U3YA 3MXMA 4ZTJA 2AJQA 3ASMA 3BDPA 3MAQA 3ZSYA 2ZD1A 1TV6A 2WOMA 3AO2A 4GMJB 2YNHA 1ZBFA 4CF9A 3OY9A 3FFIA 3OS2A 1HQUA 1RCHA 4UQGA 4FJHA 3DLGA 4RW9A 4HUEA 2IDOA 5HROA 3E01A 3NGYA 4CFCA 3VA0A 4LSLA 3O3HA 3AVHA 1RILA 1NJYA 4CEAA 1RDDA 4I9LA 4QCLA 4W5OA 3CM5A 5HRPA 1CLQA 1BCMA 3P5JA 4H4MA 4CGFA 1SKWA 1A5VA 3QEVA 2PYLA 3CG7A 4DTSA 2HNDA 1TVRA 4ID1A 5FROA 2YNGA 3IG1A 4CEBA 4CK2A 4O4GA 3RRHA 4PWDA 1F21A 3SQ4A 1JL2A 1C1BA 5SZTA 3PX4A 2KQ2A 2PY5A 3DLEA 3HP6A 4DF4A 4B9UA 4EZ6A 4KV8A 1T7PA 1CZ9A 5FRNA 1S6QA 2E6LA 1ASVA 3K5NA 3QEWA 3RR7A 4CCHA 2FBXA 4BDZA 1JL1A 3QERA 1EETA 1BISA 2VWKA 2YKNA 3OYAA 3OYLA 1VSMA 3VQ7A 4KPYA 4KHUA 4CJUA 3KD5E 1VRUA 1UA1A 2RPIA 2BDPA 5D3GA 3AVLA 1N6QA 4FJ7A 3IS9A 1RT6A 1Z26A 4Z4HA 2W42A 4DS4A 4DQSA 4KHYA 1HPZA 1VRTA 1C0UA 4R5PA 1XHZA 4C8OA 3V6DA 3ZSVA 1NJWA 3TAFA 3VQ4A 3CQ8A 3CFOA 3L3VA 3KLHA 3SUPA 4CHOA 4J2EA 1SL2A 1L3VA 4CJRA 2QK9A 3LP1A 1L3UA 4QAGA 2OZSA 4M3XA 5JS1A 2YNFA 1RNHA 3KKSA 4CEEA 3SNNA 5I3UA 1ZBHA 3K59A 1VSEA 1KRPA 1RT1A 1U04A 4FXDA 3OYKA 4XIUA 2P1JA 4LH5A 3ZT0A 4CEQA 4DFMA 4CJFA 3MXIA 2KZMA 1KCFA 4J2BA 4B9NA 1J9AA 2DFFA 5KRSA 1TGOA 1VSKA 3ITHA 3LAMA 4KFBA 4CGHA 2HNYA 1WAJA 2ZE2A 1XWLA 3AVFA 4KTZA 4CJEA 1X9MA 2IGIA 4O5BA 5CY4A 3TAMA 3K5LA 3V9UA 3PO5A 4F2RA 3OYHA 4QOZB 2OA8A 1IKVA 4CFBA 1NKBA 4F4KA 1DTTA 4RW8A 3RMDA 3DRPA 4DTRA 3SUQA 1D9FA 1HNVA 4RG8A 4MFBA 2YHBA 4C8NA 3F73A 4JS5A 4DF8A 4F8RA 1QQCA 4E0DA 2KFZA 1TKTA 5KTQA 3QIOA 3T19A 3EYZA 3U3GA 1HJRA 4DFJA 4M3YA 3C95A 4B8AB 1S1VA 4GW6A 4CEDA 1T8EA 5HLFA 1LWEA 3TI0A 4DWIA 3OYJA 4O55A 3TARA 3VQDA 3SPYA 4B9MA 1KLNA 3VQBA 4LY7A 4NCBA 4JRQA 2QKKA 2HHQA 1JLQA 3NFAA 3NBPA 3OYMA 4JRPA 1I3AA 4ID5A 4CF0A 3ZT3A 4BACA 3AO1A 5J2QA 1HYSA 3PO4A 2Y1JA 3P83D 5T7BA 1S1TA 4W5QA 1L3TA 1IKXA 1ITGA 3NF8A 1SV5A 4IG0A 4FLWA 4PA1A 3S3MA 3NF9A 4YFUA 4CJ3A 4CJVA 1WSIA 2QXFA 2OYQA 3AA4A 3AVGA 1RBUA 2Z1IA 2D5RA 3M8QA 4CJKA 4FK4A 1UOCA 3KLFA 3HM9A 4E7JA 1X1PA 3O3FA 3V9WA 4K8ZA 2RF2A 1S5JA 5KRTA 1HNIA 1TL1A 3V4IA 1WAFA 3C6TA 3RTVA 3SV3A 3ISNC 3QO9A 4AH9A 1Y97A 1KFSA 3V1RA 1BQMA 5E41A 2XY8A 2G8UA 1R0AA 1LAWA 1KVBA 1TKXA 1U48A 4AHTA 2XY6A 1REVA 3HSTB 1Q9XA 2E4LA 2OPQA 4OPJA 1NOYA 4ELUA 1RT5A 4FJ8A 4FJLA 5CYMA 2IS3A 2OPRA 4FK0A 1TK0A 3HPHA 1T03A 1W9HA 2XRIA 4B8CA 4DTOA 1S1UA 4KAZA 1C1CA 1RT3A 3I0SA 3L2VA 4DTUA 3OS0A 5DK5A 4DTPA 2D0AA 1EP4A 1NK0A 1GOAA 3DI6A 3KK2A 4H4OA 4FJKA 1ZBIA 3V9SA 1C1AA 4ZTFA 4C8MA 4CK1A 4EP4A 2X78A 4LD0A 3LP3A 4KI4A 1C0MA 2A1SA 3ZSOA 3HK2A 1CXQA 1FKPA 1LWCA 3L2UA 1J54A 3NH0A 1C0TA 1RDCA 3AO5A 4AHCA 2QKBA 3QESA 2R7YA 3ZT4A 4IBNA 4PY5A 1BI4A 3ZT1A 2E6MA 2XY5A 4FLVA 3S3NA 3NGIA 1JLFA 4DSKA 3I0RA 3VQ9A 1Q9YA 3K58A 3IRXA 5HBMA 3LDSA 2BE2A 4CHQA 4I9QA 3HL8A 4FK2A 3O4NA 4CERA 1TAUA 1SKRA 4FCYA 3K5MA 2GUIA 3AVKA 3QIPA 1ZBLA 4AHRA 2Z1HA 4E7HA 1XI1A 1NK5A 4NCAA 4GVMA 1L5UA 2HHXA 3RMAA 4E89A 5C25A 4FJXA 4Q5VA 3TABA 3CYMA 2HMIA 1X9WA 2EX3A 1BIZA 1FK9A 3KK1A 3DLHA 3AVBA 3AV9A 3SQ2A 3QNNA 2O4GA 5J2NA 4Z4FA 1U49A 3B6PA 1TKDA 4CHYA 2KW4A 4PUOA 2YKMA 2F8SA 3HPGA 4HHTA 2DFHA 1A5XA 3TR8A 1KFDA 4OJRA 4DU3A 5KGXA 3SJJA 4Z4GA 1YTUA 4HUGA 3G0ZA 2D0BA 1HQEA 1TK8A 2FBTA 4W5TA 3LALA 4Q0BA 3HO1A 5J1EA 4DTMA 5J2PA 1KSPA 2ZQBA 4TSXA 1XHXA 1L3SA 4EZ9A 1J53A 1GOCA 3DOKA 2P5OA 4DQPA 3SUNA 3ZSXA 2HHVA 4KTQA 3AA5X 3VA3A 1KVCA 1WSEA 3CFPA 2Y1IA 3H08A 4FZZA 2HHTA 3LAKA 3DM2A 4IG3A 3AVJA 4KHQA 4W5NA 1QTMA 1WN7A 4FZXC 4CJWA 1SL1A 1YTAA 4CGJA 4KI6A 1X9SA 1ASUA 2YV0X 4FYDA 4FJNA 2B4JA 1VSDA 4L8RB 3LWLA 1B9DA 4FLXA 1LWFA 5JS2A 2Z1GA 1RTJA 2XO7A 3VQPA 5CYQA 1FXXA 1XC9A 3UIQA 4JLHA 2G8WA 4O0IA 3LPTA 2HHSA 2OZMA 3KLEA 1RDBA 4G1QA 5HP1A 1D5AA 1NK4A 3NHGA 3T3FA 4PQUA 2HHUA 3RWUA 3OYGA 3OS1A 1WNSA 1BQNA 4RW7A 4CIFA 3KJVA 3DRSA 2Z1JA 5EU7A 3OYBA 3WNFA 4KRFA 2ATQA 1CXUA 3L2WA 1U4BA 3KD1E 1WSJA 3WNHA 3TAGA 4N41A 3SCXA 4KHNA 3A2FA 1VSLA 4FLTA 4B08A 4HTUA 3ZSRA 3S3OA 1BHLA 1MU2A 3JYTA 1BI4B 1YT3A 2BANA 4BDYA 3SV4A 3KK3A 1S9GA 5CZ1A 1KTQA 1CZBA 5K14A 1JLGA 3L2RA 1NK6A 1FKOA 1D9DA 3V81A 2HHWA 3MEEA 4CHZA 3SI6A 2HNZA 4NYFA 1QE1A 4OKJA 1S1WA 4J2AA 3L3UA 4FJ9A 3KTQA 4K8XA 3VN5A 1B9FA 4ICLA 4M3WA 4C8KA 4Z0UA 4CJQA 1S6PA 4CE9A 4H8KA 2KFNA 3HXMA 3SQ0A 3C94A 3MXJA 3OYNA 3QEXA 2IAJA 5C42A 3AO3A 4DQRA 4E3SA 4AHSA 2G8HA 3LZIA 1A5WA 3KKRA 2OPSA 3L8BA 1D8YA 5DMRA 1UWBA 3LZJA 4C8LA 3MEGA 3VQCA 4I2PA 4YNQA 4DQQA 3OYCA 1HMVA 1RBSA 3D0PA 4E7LA 1GOBA 4F3OA 4IKFA 4N5SA 1NKEA 3LANA 1NK8A 4CJPA 4J2DA 4E7KA 4AHVA 2G8KA 4DMNA 1JLBA 3D45A 3ZSQA 1Q8IA 1QSLA 4DS5A 1BIUA 1RTIA 4AHUA 4KO0A 4FLYA 1UA0A 4KHSA 4HCBA 4DSLA 1TK5A 4M45A 1Z25A 1UAXA 3LPUA 4CF2A 2PYJA 1DTQA 3ZSZA 2IC3A 3OJSA 2YHAA 5FDLA 1NKCA 1QSSA 2FBYA 4B9SA 3NH1A 3AVNA 4BDPA 4CEZA 2VG6A 4DTNA 4FJMA 2RN2A 3P1GA 4Y1DA 4O44A 3SYZA 3L2QA 4FM1A 4RW6A 2LSNA 4Y1CA 1IO2A 3BGRA 3S9HA 3NGZA 1LW2A 3NE6A 4KREA 1LW0A 2GV9A 1NOZA 4FW2A 3T1AA 4F2SA 4BWMA 1JXBA 4N47A 1IKWA 5CZ2A 4B9LA 3LWMA 4CJSA 3AO4A 2O4IA 1EKEA 3B6OA 4CHNA 1J5OA 5HRRA 4CJ4A 3CM6A 4CGIA 3TAEA 3PX0A 4FJIA 2OPPA 1U47A 4B9VA 2F8TA 5FRMA 1HRHA 3DLBA 2X6SA 4FM2A 1JKHA 4NCGA 3HPOA 4AILC 3TAQA 1SL0A 3PY8A 3AVIA 4OPKA 4O0JA 4CFAA 4CECA 3KIOA 2G8FA 3LP0A 1LV5A 3EY1A 3PX6A 4CEOA 1N5YA 4M42A 1JLAA 4LSNA 3TANA 1YVUA 1VSIA 4BE2A 1WSFA 1KVAA 1LAVA 3U6FA 4IFVA 4DSIA 2HVHA 3DMJA 1TKZA 1WSHA 4WE1A 2FC0A 3DYAA 3WNGA 3QEIA 4DLGA 1JXEA 2X74A 1W0HA 2VG5A 4CJ5A 4LH4A 3NF7A 4N56A 4BE1A 4DLEA 4BE0A 4ELVA 4CJTA 4IFYA 1BL3A 4KTWA 1RT4A 4CHPA 4Z4CA 3CFRA 5J2MA 4DQIA 4KB0A 2GBZA 3DOLA 4FZYA 3M8RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DRRA 1TYQA 5KI6A 4N76A 5AQNA 2P9KA 3THVA 5M1FA 3O08A 3QMLA 2UUCK 4CGGA 4MQ3A 2VWJA 2QWRA 3P31A 3PUFA 3BZCA 4CGDA 3ID8A 2OCEA 1VQ9N 3QEPA 4MO4A 4B1UB 3F9KA 2B5JA 2G8VA 1N8RO 4Z4IA 3K5OA 1WOQA 1ESVA 3TSPA 5FPEA 2Q3SA 4BRKA 4HVJA 1RDAA 1T05A 3CCJN 1TAQA 4FOEA 1RTDA 2E2PA 3NDKA 3J7AP 3OVNA 2OANA 1WLJA 4WFBL 3MK6A 3QLHA 3ULDA 4KHWA 3RMBA 5HRSA 4A57A 1DT9A 3I8DA 3HP9A 1IBKK 2XHBA 2WBNA 1C6VA 1VSHA 3O6WA 2DFEA 3HJFA 1GLFO 5FPDA 2HVIA 3LP2A 4CF8A 3E9PA 3ZCMA 4M3UA 3K2PA 1U6ZA 4JK8A 3L6QA 2P5GA 3HVRA 4JI1K 3HVTA 2WFBA 4E1MA 2AA4A 4OKKA 5C24A 2DY4A 1IKYA 4DSFA 4B9TA 3CPEA 3FLCO 4BR0A 3M8SA 3QFPA 4A2AA 1JLEA 4I7FA 4DUZK 4M63C 2F96A 1ZYQA 3VQEA 4BRFA 5AZJA 1YITN 4YDUC 5FPNA 1RDUA 3OYFA 2CGLA 3MXMA 3ASMA 4JEPA 3ZSYA 2ZD1A 1I94K 5KPZA 2Q36A 3VEXA 1ZBFA 1S22A 1HQUA 3NGYA 3AVHA 1RILA 4NLCA 4CW7B 3F5TA 4W5OA 5BREA 5HRPA 1BCMA 3WXLA 1A5VA 3QEVA 3CG7A 1VQ6N 2HNDA 2HF3A 3IG1A 4JKCA 5JLFA 1E3MA 4FL9A 3UKUA 4DF4A 4KV8A 3THXA 3ENBA 5JVGL 4BRGA 5AQFA 2NRVA 1T44A 4ILGB 3VQ7A 2RPIA 4FJ7A 3IS9A 2W42A 4CBUA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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