1WSJA

Crystal structure of e.coli rnase hi active site mutant (k87a/h124a)
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGAAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Ribonuclease HI
source organism Escherichia coli
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2004-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1wsjA00
4I7FA 2IDOA 3DRSA 4MQ3A 1HQUA 4LSNA 4O44A 4M3UA 2OPRA 3AVLA 1N5YA 5CYQA 4OLAA 3PX4A 2FBVA 1VSJA 3NGIA 3LAKA 3IS9A 4BDZA 4DQRA 4OKKA 4O55A 3KD1E 4CHQA 4FZZA 3CM6A 4LD0A 3KLHA 4F3OA 4JRPA 2XRIA 2XY7A 3P1GA 1VRTA 3QESA 1U49A 1T03A 1KFDA 4BE2A 4ZHRA 1RT1A 4HUGA 1UA0A 3NBPA 5J2MA 2KFNA 2WOMA 1LW0A 4DTMA 4KTWA 1C1BA 2G8FA 3PX6A 3DLBA 4W5QA 1EETA 4CHPA 5FDLA 1NK6A 3V9ZA 1U47A 4B9SA 2D0CA 4KHYA 4FJXA 4B3OA 3P83D 4CEQA 1VRUA 4IFVA 3C94A 1LW2A 4M3RA 2EX3A 4J2DA 1QE1A 2E6MA 4HCBA 3ZCMA 1B9FA 3LP2A 3RMAA 3OY9A 4YNQA 5KGWA 4CGFA 3NF8A 4BE1A 2RF2A 4CCHA 4OPJA 3OYNA 1ZBLA 1RTHA 1TK0A 3NGYA 1RT4A 2IAJA 2WONA 1NK0A 1QQCA 1KTQA 1EX4A 4QAGA 3WNFA 4DTOA 1IKWA 3DRPA 4FLXA 4CEBA 1SUQA 3RR7A 2HVIA 2O4IA 1YT3A 1S9EA 5KGXA 5HRRA 1KVAA 4DQQA 1SKRA 4FJ9A 2BGGA 2Z1JA 3DLKA 3OYMA 1ASWA 1HPZA 3WNHA 2KW4A 2ZQBA 4CF2A 1FXXA 4KTZA 4DU1A 4KRFA 1BQNA 3L3UA 3NF6A 4YFUA 3G0ZA 2OZMA 4KI4A 2YHBA 3OJUA 1ZBUA 3LDSA 4M3TA 3OVNA 3HP9A 1L3UA 4ELTA 1EXQA 4H4MA 4CE9A 3EZ5A 1RDBA 2ZE2A 4F2RA 1YVUA 4C8OA 1MU2A 2W42A 4HHTA 4FLUA 2P5OA 1KVCA 4W5RA 3NDKA 4CJEA 5CYMA 4NCBA 4KREA 1CZ9A 4E7LA 3CFOA 5KRSA 3AO4A 4E0DA 3HPOA 1NK8A 4CJLA 4FZYA 4J2EA 3VQEA 3KKRA 1T05A 3B6OA 4DSIA 4J2AA 4W5NA 4I2QA 4RW4A 2X6SA 2Q3SA 1NOYA 4CHYA 2Z1IA 5KRTA 4OPKA 4PUOA 4CERA 4CF8A 2PZSA 3JYTA 3MEDA 4CJ3A 2OA8A 5JS2A 4CJ5A 1WLJA 4EZ9A 2ATQA 4K8XA 3LZIA 3BGRA 1RNHA 2B4JA 3OJSA 3OYCA 4B9MA 5D3GA 4CF9A 1TAQA 4GMJB 2Y1JA 4DFKA 2HHQA 3HVRA 4H8KA 2XY5A 4F2SA 2P51A 4OJRA 3RMBA 4CEFA 4AHUA 1S1TA 4O4GA 1BHLA 2HHTA 3DMJA 1NJXA 2Z1GA 3AA4A 3AVAA 3OYGA 3KJVA 4CJUA 2HHSA 4RW7A 3D45A 1HRHA 4DTRA 3ZSQA 1JXEA 4PA1A 4DWIA 5HROA 4Y1CA 3NAEA 1SV5A 1YTUA 2YV0X 1UWBA 3A2FA 4FJLA 4W5TA 4M42A 4Z4EA 4CK1A 4FZXC 3AA5X 3QIPA 4ELVA 3OYBA 3AVNA 4HCCA 3ZT4A 2HVHA 4BACA 1VSDA 1QSLA 4EP5A 3V81A 3O3HA 5HP1A 3DI6A 3KLEA 3NFAA 1RBSA 4NYNA 3CFPA 1GOCA 3SI6A 4LH4A 3DOLA 4NCGA 1S1XA 5KI6A 2YNFA 4DS5A 2HNZA 4AHSA 3O4QA 4FK4A 2HB5A 2YNHA 4ZTJA 1WSJA 4M41A 2DTUA 1XI1A 2Z1HA 4CEZA 4DLGA 3O3FA 3QINA 1I3AA 4DG1A 3PY8A 3CM5A 4DQIA 3O4NA 5C42A 1C1AA 4FM0A 2ITGA 3QO9A 4F8RA 1J54A 1L3TA 2KTQA 1LWEA 3HO1A 3L2RA 2OYQA 1XC9A 4KI6A 1LWCA 3TI0A 4RW6A 3M8RA 1HYSA 1ASUA 2IOCA 3QERA 3LWMA 3V9XA 1NJYA 4QCLA 3LANA 3M8PA 2X74A 3ISNC 3CG7A 4OKJA 4E89A 1REVA 4RW9A 1VSKA 3L2WA 2VG6A 1C1CA 4I2PA 3LP1A 5T7BA 4FW2A 4HVJA 3VQ8A 5FRNA 1W0HA 1SL1A 1S1WA 1KVBA 1L5UA 2QKBA 5I42A 4CEEA 1TGOA 1TAUA 2VG7A 4DU4A 3L8BA 3VQ9A 2YKNA 4HUFA 1C0UA 3QEVA 4I9LA 4FLWA 2XO7A 4FLYA 1BCMA 4GVMA 3PV8A 1KLNA 4IDKA 3K5OA 4E7IA 3TARA 4FM2A 1JL2A 3OYHA 4DFJA 4Z0UA 4IKFA 3IG1A 3ZT2A 3OYFA 4OLBA 2HHWA 2B6AA 1U04A 4CECA 4DFMA 3RWUA 4KV8A 3SYZA 1JLGA 1U48A 1KRPA 4AHTA 3THVA 1JLFA 1X9SA 2KZMA 1DTTA 1QHTA 3ZSRA 3ULDA 3TAMA 4DFPA 4C8MA 4JLHA 4UQGA 2VWKA 1G15A 2DY4A 2EHGA 3V4IA 4OGCA 3HJFA 4QOZB 3HT3A 3EY1A 1HQEA 3AVIA 3CYMA 3NH0A 1XHXA 4KFBA 3V9UA 4OGEA 4CIGA 4CEAA 4Z4GA 3SNNA 5E41A 1D9FA 2HHVA 4CJ4A 4FJMA 1CZBA 3F9KA 1FK9A 3C95A 4IG0A 4MFBA 4K8ZA 3DOKA 3LALA 4Y1DA 3ZT1A 1RT6A 3D0PA 4DTPA 1GOAA 5C24A 3QEXA 1HJRA 3AVHA 3NF9A 4EP4A 3T1AA 4BE0A 3AVFA 1NOZA 1TKTA 2XY8A 2XHBA 3SV3A 1R0AA 1BL3A 3AO5A 1W9HA 3KD5E 1WN7A 3MEGA 1WSHA 3VQDA 4O0IA 3TWHA 3HPHA 4DSFA 4DTJA 2XY6A 3K58A 3UIQA 1ZBHA 1TVRA 3SUPA 5CZ2A 3MXMA 1QSYA 3H08A 3S9HA 3SJJA 1RILA 1X1PA 3TAPA 2A1RA 1WSGA 2F8SA 4FYDA 4Q5VA 4FJ8A 1UA1A 1VSEA 1JL1A 2G8WA 1VSIA 2YNGA 1B92A 2GV9A 3I0SA 2AJQA 3AO2A 1RDDA 1S6PA 3HM9A 4CJVA 4Z4CA 5J1EA 3NH1A 1ZBFA 3BDPA 5FRMA 2YKMA 1D9DA 1T7PA 1LV5A 4M3XA 3RTVA 3KIOA 3QIOA 4CHOA 3SV4A 2PYLA 5HBMA 4CK3A 1XHZA 1HNIA 4RG8A 3VQBA 2GBZA 2BANA 4PWDA 3NF7A 3KK3A 2KQ2A 4E7HA 2HHXA 4CJSA 3ZSZA 4F4KA 3LZJA 3RR8A 3AVBA 1DLOA 1UOCA 1GOBA 2DFHA 4NCAA 3V9SA 3TAQA 3HP6A 2VWJA 1RCHA 4ICLA 2D5RA 4DSKA 4FLTA 4B9VA 1VSFA 4O5BA 1BIZA 3OS0A 3VQPA 3T3FA 2RKIA 1WAJA 3QLHA 3HYFA 3DLRA 3ALYA 4CGGA 5C25A 2D0BA 4FJNA 3SUOA 1Z25A 4PY5A 1KCFA 4DU3A 4M3WA 1SL0A 5KTQA 3V1RA 4C8KA 3AVGA 3ITHA 4M45A 1NKBA 1B9DA 1S9GA 2B5JA 1SKSA 2G8HA 3LP3A 3RMDA 2E6LA 2I5JA 1SL2A 5CY4A 3HL8A 3TR8A 4HTUA 2JGUA 1U4BA 2R7YA 1NKEA 1WNSA 2BE2A 1Z26A 5HLFA 1D5AA 4CJKA 4CJTA 3T19A 4E1NA 4TSXA 1J5OA 1KSPA 4B8CA 1VK0A 4DQSA 2F8TA 1JLQA 2RPIA 1JKHA 4E19A 3VQ6A 1T8EA 3SZ2A 1NK4A 1HYVA 3DRRA 3SQ4A 3OYDA 3HK2A 4IG3A 4DMNA 1VSHA 3JSMA 2F96A 4N41A 4N56A 1EKEA 4CHNA 4ZTFA 4DSJA 3I8DA 3L2UA 3P5JA 3HPGA 2PYJA 1TV6A 4FJHA 3NHGA 1C0MA 2HW3A 3OS1A 4M3ZA 3B6PA 3VA0A 3S3OA 3HSTB 4KHQA 3M8SA 4B08A 1O1WA 4CFAA 1RBTA 3M8QA 3U3YA 4DSEA 2NUBA 3ZSOA 4FXDA 1XWLA 4FCYA 1RDAA 1L3VA 4DLEA 1BGXT 5HRNA 3K59A 3ZSXA 1J9AA 1IH7A 3V6DA 4N47A 2G8KA 2ETJA 1J53A 3MEEA 3ZT0A 1F21A 1JLEA 4BDYA 2OPPA 4HUEA 4DTSA 4FM1A 4BDPA 3IAYA 1JLCA 2OPSA 4C8NA 3RRGA 3C6UA 3SPYA 4CGIA 1NJZA 4CFDA 4FLZA 3SUNA 1QS4A 1TK8A 4ELUA 2KZZA 3KK1A 3CFRA 1BISA 3OYLA 2IS3A 3K57A 3ZSWA 2RN2A 1IO2A 3K5LA 1TK5A 1S6QA 1UAXA 4KB1A 3K5MA 3HVTA 3VQQA 5J2PA 1Q8IA 1TKDA 1BI4B 1RTDA 5EU7A 4FJGA 3MXJA 4AHRA 4O0JA 4W5OA 2Y1IA 2P1JA 3AVKA 1ASVA 1RT2A 3AA2A 1EP4A 2FC0A 3WNEA 2VG5A 4IBNA 2LSNA 2YNIA 3V9WA 3SQ2A 1NKCA 4I9QA 4DF4A 4Q0BA 3IRXA 5I3UA 1IKXA 5JS1A 5SZTA 2HHUA 4DTUA 1S1VA 1U45A 3DLGA 3OYIA 4CIEA 1BI4A 3AV9A 5J2NA 4CHZA 3OS2A 1X9MA 4L8RB 4PQUA 3KKSA 3OYKA 3CQ8A 4B9LA 4EZ6A 1IKVA 3VN5A 4N5SA 3MXIA 5SWMA 3G10A 3VQCA 2GUIA 1BCOA 4FVMA 3AVCA 4E1MA 3QNOA 4FJIA 3QEIA 3S3MA 1LAWA 4DTXA 1JLAA 1TKZA 3LPUA 4CFCA 1WAFA 3U6FA 1BQMA 4OVLA 3NCIA 2X78A 3OYEA 1DTQA 4B9NA 4G1QA 1WSEA 2OPQA 2IC3A 3ZT3A 2DFEA 1A5WA 1L3SA 3VQAA 1ZYQA 1NK7A 4KTQA 2KFZA 4RW8A 4B9UA 1CXQA 1LWFA 4FJ5A 5K14A 4Z4HA 2G8VA 2PY5A 1TL3A 1K6YA 2QKKA 4KAZA 2ZD1A 1RBVA 3AVMA 3VQ4A 3L2QA 1BIUA 1A5XA 1RTIA 4WE1A 4J2BA 3K2PA 4JRQA 4F3TA 3LP0A 3KK2A 1D8YA 4KHUA 1VSLA 1WSIA 1VSMA 3VA3A 3S3NA 4R5PA 4KHWA 4KB0A 1LAVA 4B8AB 1HNVA 1I39A 3HXMA 4BWMA 4ID5A 1N6QA 4B9TA 3MAQA 4E7KA 3TAGA 3KTQA 3TABA 3OYAA 4DQPA 1C0TA 1RDCA 3NH2A 4M3YA 4FJJA 4OKEA 1FKPA 3AVJA 1RT3A 1KFSA 1FKOA 3U3GA 3ZSVA 2OZSA 3QEWA 3EYZA 3KLIA 3V1QA 4KHNA 1A5VA 1ITGA 4CJWA 2FBXA 1JLBA 4CJPA 4CK2A 4CJFA 2HNYA 3SCXA 2A1SA 4CESA 3OYJA 1SKWA 1TL1A 2YHAA 3DLEA 4FJKA 3V1OA 4CF1A 4FLVA 4KO0A 4Z4FA 1WSFA 5HRSA 4KKOA 1NK9A 4AILC 4C8LA 3PUFA 3MECA 4Z4IA 4AHVA 1RBUA 3VQ7A 1QSSA 4JS5A 4XIUA 3PO5A 3F73A 4ID1A 4LY7A 4CIFA 1HMVA 3LAMA 1ZBIA 4E7JA 4CFBA 3RMCA 4CEOA 2G8UA 3SQ0A 3L3VA 4N76A 2JLEA 4IFYA 3AO3A 4E3SA 1RTJA 4LSLA 2QXFA 4GW6A 5J2QA 3KLGA 4CF0A 1NK5A 3AA3A 2P5GA 1YTAA 4H4OA 2X6NA 3C6TA 1Q9YA 4DSLA 2G8IA 4BWJA 3AO1A 4JS4A 1CXUA 4CGHA 1NJWA 4KHSA 1RT5A 3FFIA 3TANA 3TAFA 1RBRA 2D0AA 1TKXA 4KPYA 4NYFA 4AH9A 3DM2A 3I0RA 3SPZA 3QNNA 3O3GA 3DLHA 3NGZA 1X9WA 2IGIA 1QTMA 3SQ1A 5HRPA 4CJQA 3RRHA 3TAEA 4FK0A 3PO4A 1S5JA 3ASMA 3LPTA 2FBTA 1JXBA 3VQ5A 3QETA 2FBYA 2HNDA 1Q9XA 4FK2A 5FROA 3QEPA 1IKYA 4CJRA 3WNGA 2O4GA 1C6VA 2DFFA 3K5NA 1S1UA 2E4LA 4FW1A 5DMRA 3LWLA 4LH5A 3DYAA 4DS4A 3ZSYA 4DF8A 2HMIA 1IG9A 1HYZA 4CEDA 1RT7A 4DTNA 5CZ1A 3PX0A 2QK9A 1KLMA 3NE6A 3E01A 2BDPA 4CGDA 1CLQA 4AHCA 4CGJA 3L2VA 4FJ7A 1Y97A 3KLFA 3SUQA 5DK5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IDHA 5LL6Z 1HQUA 5FPEA 4M3UA 3AVLA 1N5YA 3O1WA 5CYQA 3FR0A 3O1BA 2I7PA 3Q7CA 3NGIA 3BZCA 4O55A 2HSTA 4JRPA 2VWBA 1U49A 2HBLA 5CE3A 4DV7K 1UA0A 3NBPA 2KFNA 4KTWA 3PX6A 2D0CA 3P83D 2AA4A 2E2NA 2EX3A 3LP2A 3OY9A 4CGFA 5AQIA 4WQ4C 1XNRK 3BF3A 4FOEA 3LDQA 3NVKA 4OPJA 1BA1A 4DV6K 1NK0A 4A5AA 1KTQA 1EX4A 4DTOA 2Q1NA 2P9NA 3DRPA 1EWQA 2HVIA 1XMOK 3EEQA 4KRFA 4BQLA 1BQNA 3NF6A 2YHBA 4M3TA 1L3UA 1EXQA 3VESA 1NNEA 4F2RA 1QZ6A 5E26A 4HHTA 2P5OA 4W5RA 5CYMA 4X66K 4BY9C 5KRSA 3HPOA 1NK8A 4FZYA 4W5NA 3KKRA 4JKEA 3A5LC 4RW4A 1NOYA 5F0XA 4CHYA 4CERA 2QWRA 2Q0RA 4EHUA 4BGBA 1LOTB 3MN7A 3MEDA 2PAVA 4CJ3A 1NM1A 1WLJA 4EHTA 4EZ9A 4K8XA 5AQKA 3G71N 4WFAL 3LZIA 3OYCA 4CF9A 1TAQA 4GMJB 4Z94A 2XY5A 3AGKA 4MO5A 4DR6K 1S1TA 4O4GA 1P90A 3AA4A 4GVEA 3KJVA 2HHSA 3QBWA 3D45A 1RGIA 1JXEA 4PA1A 1FW6A 5GADP 3G25A 4Y1CA 3NAEA 1SV5A 1UWBA 3A2FA 4Z4EA 2BUPA 1HNXK 3MCPA 2V7YA 4HCCA 3CI5A 2HVHA 2P9SA 1VSDA 1QSLA 4FWMA 3O3HA 3DI6A 3KLEA 3NFAA 4NYNA 3CFPA 3DOLA 1VAZA 5AQXA 2UUCK 2HB5A 2YNHA 4ZTJA 4WFNL 2NNWA 3O3FA 1I3AA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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