1WUAA

The structure of aplyronine a-actin complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
367
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structure basis for antitumor effect of aplyronine a
pubmed doi rcsb
total genus 113
structure length 357
sequence length 367
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1wuaA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1wuaA03
4LC9B 1U6ZA 4BR7A 3UKRA 1NGBA 3FFKB 3UB5A 4FOEA 5FPDA 4BRAA 2E88A 3VF4A 3G25A 3ZX0A 3CJ1A 4F9OA 3O1WA 1CZAN 1XC3A 4FWQA 2Q97A 2D4WA 3L6QA 1MDUB 1YXQA 3BP8A 2E2QA 5BR9A 1U2VA 3O5BA 4PKIA 4HWIA 4CZFA 2QWOA 3HTVA 5F2RA 1XUPO 3VEZA 3LM9A 2GTDA 4BRIA 3W0LA 1G99A 1U2VB 1QQNA 3VEWA 4H0OA 4M7YA 4YDUA 4BR5A 2Q31A 2V7YA 3CHWA 3U4LA 2QWNA 1V4SA 4CBUA 1MWMA 1HKGA 3DAWA 2A6AA 4CD3A 4HTLA 1HKBA 1RFQA 4FWLA 5BRFA 1ATNA 4EAHD 1H1VA 1Z6RA 4CD1A 3QICA 4FPAA 1RGIA 5AQJA 1YAGA 5FPEA 3ZX3A 3MN5A 4A61A 1X3NA 4CZGA 3BF3A 1ZBSA 4H5WA 4M63C 3W3DA 3MMVA 3WXLA 1GLAG 1C0GA 1BUPA 3FZFA 3M3ZA 2EWSA 3SMPA 3H3OB 4FO0A 2GWJA 2QWRA 5AQPA 4BC5A 4DB3A 4DHYA 4QS8A 5EOYA 4BRLA 3EL2A 2E1YA 1BG3A 2E20A 3GL1A 4H03B 4KBOA 5AQXA 1RDWX 3R9PA 1C0FA 4C23A 3I33A 2CGLA 4BC4A 4A62A 4CJ7A 1Z05A 4E1JA 2KHOA 4BRDA 4JD2A 2HF4A 2HMPA 1BWFO 1Y64A 3ID8A 4WQ4C 4K43A 2ZGZA 3HBTA 1ZC6A 1BA0A 4Y0WA 3ZX2A 4BC2A 5FPNA 2ITMA 3EZWA 2P9SA 4JAXA 2NLXA 2P9KB 2D1KA 2VCPA 4QS9A 4CZJA 3L0QA 3VF6A 4M7XA 4JD2B 5AFUA 4J8FA 4NB4A 4FSVA 5AR0A 1GLFO 5AQWA 5KPTA 3QFPA 4EFHA 1MA9B 4CZKA 3O4WA 5AQHA 1GLCG 1TUUA 2P9SB 4A2BA 5B8HA 3WEEA 1TYQB 4FWKA 4BGAA 4H0PA 2V52B 4K41A 1V4TA 3IMXA 5LJWA 3VEYA 2FF6A 5ADXH 3D2FB 4DQ8A 2HOEA 3A5OC 4L3QA 4FOIA 3GDQA 1E4GT 5AQOA 3TPQA 3HM8A 3O1BA 4RCHA 3A5NC 3FZHA 1NGIA 4CZLA 1T6DA 3ENOA 4B1ZA 3MK6A 1GLBG 3AAQA 3CQYA 3P4IA 3CJCA 3VPZA 3TU5A 2Q1NA 1NGEA 2YJEA 3ULEB 1KXPA 2YJFA 2GEMA 3GOIA 4BRFA 2WUSA 4EHUA 1ESVA 4JHDA 3C7NB 3EN9A 2OANA 4BRPA 3LDPA 2PBDA 1T44A 2IIRA 3OHRA 4MLEA 2IVNA 3UE5A 2P9NA 2VYPA 3FZKA 4QS7A 4H0VB 3M1FA 4CBWA 1QZ5A 5AQMA 1HPMA 5BPMA 2IVOA 4JHDB 3KHYA 3FR0A 3D2EA 2BUPA 3VGLA 5AQTA 3DWLA 3QMLA 2P9NB 4IJAA 4ISEA 2E2NA 5F1XA 4CZIA 3HZ6A 2CH5A 4WYBA 4XH1A 1NBWA 3D2EB 4IZ9A 3VF2A 4FWMA 5E26A 3H1VX 5AZIB 4WQ4A 4XH4A 2QWQA 5BRHA 4ISFA 3AAPA 2YHWA 3R6MA 3LDQA 5LY3A 5AQSA 5LJVA 3CJBA 2GUPA 2VWBA 3CQXA 2FXUA 4BVOA 5KPZA 4JNEA 3I8BA 4K25A 2QW9A 2QWMA 5BN9A 2H3GX 1GLEG 4B1YB 1DEJA 2QXLA 4A2AA 3DXKB 1IJJA 5FPMA 4BR2A 4Z94A 1MWKA 3GE1A 4O5FA 5AQGA 5JICA 4PKGA 1YVNA 3ZEUB 2GELA 3S41A 2E1ZA 3VEXA 3VERA 3LL3A 3QBXA 2AP1A 4BR9A 2P9PB 3KVGA 1HUXA 1X3MA 4AM6A 5AQVA 3EO3A 2W41A 4NO7A 4FWPA 2CH6A 3UKUA 4BQZA 3B8AX 3D7EO 1ATSA 3FE1A 4FL9A 3IUCA 1DKGD 5I9EB 2P9LA 3SJHA 2P9KA 3ATUA 1JCGA 2ASOA 5AQZA 3U9DA 4O8KA 1BU6O 4BRQA 5AQYA 4RTFD 1BOTO 2CGKA 3UKUB 4CZHA 3A5MC 1QQMA 3VEOA 1NLVA 1NM1A 4MLHA 2P9LB 2F9WA 2NZTA 4GNIA 1TYQA 4BROA 1ATRA 3QB0A 2ZF5O 5AQIA 4CZEA 4JN4A 3VENA 4PKHA 3GG4A 4B1XB 3F9MA 2D0OA 2YHYA 3D2FA 4CBXA 2ZWHA 3RSEB 3IFRA 4BR4A 3H45C 4BRGA 3O8MA 2E2PA 3H6EA 2FSJA 2FSNA 2NRHA 3J8AA 2ASMA 5ELZA 4H0YB 4XH5A 3O08A 3DXMB 3VOVA 3VEVA 5F0XA 5AQLA 3ULEA 2FF3B 5AZJB 3MCPA 1JCEA 2P9UB 2GWKA 3C7NA 1ZXOA 1QZ6A 4BRHA 1QQOA 2PAVA 1GLLO 4DCHA 1NGDA 4EIAA 3WT0A 4PL7A 3SLCA 5EVZA 1IG8A 2A3ZA 1R59O 4H5TA 3HSCA 1TUYA 2QWPA 4H5NA 3H3NO 2A41A 4WQ5C 4MO5A 3C0BA 1S3XA 1NGGA 5KPRA 1K8KB 3GBTA 1DGKN 3WQUA 1HJOA 4IWVA 4I6MB 5AZIA 1NGCA 5EY4A 1GLDG 5AQNA 4CZMA 3U9ZA 1D4XA 1OKJA 3MN6A 3FZMA 3CJAA 1QHAA 4BRNA 3O6WA 1X9JA 3SK3A 3ENHA 4H5VA 1SQKA 4IO8A 3UKRB 4B1UB 3BEXA 4BVPA 4BREA 4K42A 3WUHA 1EQYA 2YI1A 2I7PA 5JLFA 3DXKA 4BRCA 3KZBA 3M6GA 5BRDA 5BPNA 5AQUA 3MDQA 4AM7A 2Q2RA 4FWSA 3ZEUA 3LM2A 1WUAA 4BRMA 2FLOA 3BF1A 3FLCO 3QFUA 5JLHA 3ATVA 2P9PA 4GY2B 5EXWA 5KQDA 3SMSA 4FWRA 5TKYA 2P9IA 5BN8A 3WQTA 3CERA 4XEIA 3BUZB 4B1VA 2A42A 1NGHA 1YUWA 4MO4A 1BDGA 2Q0UA 2AA4A 1NGFA 1Q18A 3VETA 1HLUA 2P9IB 5AFUH 4FWNA 4PL8A 3QBWA 3AY9A 5AQKA 4BGBA 5AQRA 3CI5A 2E2OA 3FZLA 2CGJA 3A5LC 2YHXA 3MN7A 1NWKA 3CJ9A 4B1WB 1LOTB 2D0PA 2A5XA 2BTFA 3ZETA 2ASPA 3WXKA 1HX1A 3RSEA 5KQ8A 1NGAA 2DPNA 3WXJA 4WQ5A 5EX5A 3CIPA 5BPLA 2A40A 2W40A 3DJCA 3EKUA 5ADXA 5AQFA 4B9QA 1XQSC 3ZETB 3DXMA 3H1QA 3LDLA 4IXCA 3JXUA 4YDUC 5AZJA 2V51B 1JCFA 1HKCA 3A0IX 2FSKA 3LDOA 3AARA 5AQQA 4H0XB 2P9UA 2YCHA 3L4IA 4FWOA 2IVPA 1E4FT 4BC3A 4H5RA 2QWLA 1SZ2A 4BG9A 5CE3A 2HF3A 1WOQA 1J6ZA 4BR0A 1LCUA 3CJ7A 1BA1A 3H46O 3MN9A 3LDNA 2Q36A 2ZGYA 3CETA 4FPBA 3A8YA 3QDKA 3HI0A 3VGMA 1NMDA 2UYTA 3JS6A 3O80A 4BG8A 1K8KA 1NGJA 3VESA 2V7ZA 3WEEB 4BQLA 2Q0RA 3EKSA 1SAZA 5E84A 4I6MA 2QM1A 4EHTA 1BO5O 3WXIA 4RWTA 4IJNA 4BRKA 2I7NA 3R8EA 3U8XA 5JMVA 1P8ZA 3FGUA 2J4RA 2E8AA 1S22A 4H0TB 3IDHA 1KAZA 5BREA 1KAXA 1GLJO 3VGKA 1T6CA 1KAYA 4ISGA 2F9TA 4CI6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IV0A 4LC9B 4BR7A 2E5LK 1YI2N 1NJIO 5FDLA 5HRNA 2BANA 5FPDA 1NK5A 4FJKA 2E88A 3QIPA 2O8FA 3O1WA 1XC3A 5GIOA 4Q0BA 2FBTA 2Q97A 3L6QA 3VQBA 4DQPA 5LL6Z 1YXQA 4KKOA 3VA3A 4RG8A 1U2VA 3TAEA 4CECA 3O5BA 2XRIA 1NG9A 4CIFA 5LMNK 4PKIA 3V9UA 4KPYA 2KFZA 3QNOA 4DLGA 3OYBA 4DV5K 3VEZA 2D0CA 4W5OA 4BRIA 3OS2A 3LZIA 3CCMN 4O44A 3VA0A 3C6AA 4H0OA 3NF7A 2O8EB 1ILYA 3KLHA 2V7YA 1RBTA 1TK5A 1EO1A 1XNRK 4DR3K 4DS5A 4M3ZA 1HKGA 4WFBL 2A6AA 1YTUA 4BDYA 4FWLA 5BRFA 1CZBA 4B9TA 1Z6RA 4CD1A 4BE0A 3QICA 1S1WA 1RDCA 3S3OA 4DFKA 2Z1GA 5I3UA 4CGDA 1RTIA 5J1EA 1L5UA 3OYDA 4A61A 2OZMA 4IFEA 3WXLA 4FLYA 1BUPA 3ULDA 4DR6K 1D8YA 2EWSA 3TARA 3G4SN 4ELTA 5AQPA 4BRLA 5EOYA 3EL2A 2X6NA 3TSQA 2QK9A 1WBDA 4C23A 4JKGA 4C8MA 2CGLA 4DTJA 3THYA 2B4JA 4CHPA 4X64K 1W97L 2KHOA 4A5BA 4BRDA 3G6EN 1VRTA 2OTLN 3QO9A 1RT1A 1BWFO 4WQ4C 4K43A 4FK2A 1ZC6A 5HBMA 3NGZA 5FPNA 2ITMA 4DTOA 2ATQA 3EZWA 4JD2B 1HNZK 1GLFO 4OJRA 2OZSA 3O4WA 4B3RK 3QETA 5J2PA 4OKEA 4C1NK 5I42A 4K41A 4B08A 3SQ2A 3PX4A 1FKOA 1NK7A 3CFPA 1W9HA 1IG9A 3E9OA 4AHRA 3CQ8A 5ADXH 3D2FB 4J2AA 1KCFA 3VQCA 4RCHA 1WSEA 3DOLA 3LPUA 4JKCA 1X9WA 3G0ZA 4OVLA 4TSXA 3MK6A 4AHUA 1GLBG 3M8SA 1FXXA 1LAWA 3CQYA 4N5SA 1L3VA 3PIOL 3CJCA 4DUZK 1NMNA 4CJPA 1WSGA 4FLWA 4B8CA 3AVBA 1NJZA 4PUOA 4JI8K 4M3TA 1C0MA 3C7NB 4KV8A 4E0DA 3OYIA 2PBDA 1T44A 4LFCK 3OHRA 4JK9A 1BQNA 5SZTA 5J2QA 5C10A 1FK9A 3BZCA 4QS7A 1YJ9N 1QZ5A 3AO3A 4ZTJA 5BPMA 3FR0A 3D2EA 3RMDA 4FJMA 4GV3A 3U3YA 1S9EA 3ZSRA 3CM6A 2UU9K 4M41A 1RBUA 3WNEA 4DMNA 2RE2A 1VQ5N 3L2UA 3LAMA 4KRFA 4ISFA 3MWTA 1X9SA 2HHVA 3IRXA 1TV6A 3SQ1A 5LJVA 3EZ5A 3CFOA 2GUPA 3EYZA 3N4QA 1KRPA 4IDKA 4K25A 2QWMA 1GLEG 2QXLA 1C0TA 1U4BA 3DXKB 4HHTA 1BI4A 3AVNA 4B3SK 4CGJA 1HYSA 1O1WA 4BR2A 4Z94A 1U47A 3TABA 1VQNN 5AQGA 4PKGA 3ZEUB 3HP9A 4M3RA 4YHHK 3LL3A 3QBXA 1K6YA 2QI2A 3D6RA 3HOTA 3ZSOA 3MX2A 1HNVA 1VQPN 4H4MA 1TK8A 3NH2A 4FK0A 2W41A 3CC4N 3IG1A 1ATSA 4YOTA 3OJUA 2P9LA 4BE1A 3DI6A 2NRVA 3VEOA 1C1BA 2F9WA 4GNIA 3DLEA 4JI5K 4OPKA 2QTDA 1TYQA 3HVRA 5AQIA 4PKHA 2HBKA 1W0HA 1RNHA 2VWJA 2YHYA 5GADP 4AHSA 4CBXA 3RSEB 5MLCQ 3J80O 3H45C 4BRGA 1WSIA 2NRHA 4CFDA 1WB9A 1RT5A 2ASMA 5ELZA 2OYQA 4H0YB 4CJRA 2O8BB 4XH5A 4FJ9A 3DXMB 3VOVA 5CZ2A 1WSJA 4LD0A 2ZJRL 3ULEA 4CHYA 2QEXN 4KHUA 4CEZA 3PO5A 2W6LA 4DU4A 3AVJA 1GOBA 3S5TA 5H1SQ 3SUQA 1QZ6A 2GUIA 4OGEA 2Z1HA 1XMQK 3F5TA 2WONA 3CPWM 4DTSA 1W7AA 2ZQBA 1JL2A 4DTNA 2KQ2A 4PL7A 3SQ4A 2YV0X 4OKJA 4H5TA 4CIGA 4DU3A 4H5NA 3H3NO 3QIOA 1NJWA 4KTQA 1S3XA 1NGGA 5KPRA 3BGRA 1EKEA 1S1XA 3KK2A 1HJOA 3S3MA 1BCMA 5AQNA 3PIPL 3NF9A 3U9ZA 3FZMA 3V1QA 1JKHA 4HCBA 3KTQA 3K58A 5C15A 3SK3A 4CJUA 1ZBLA 3KD5E 2HHQA 4JK7A 1SQKA 4B1UB 2OCEA 4BVPA 4K42A 2WFBA 3WUHA 1FJGK 3KKSA 3PO4A 4N56A 4BRCA 5JS2A 5BRDA 3K0SA 3HVTA 2O8FB 1I3AA 1K8AO 4FWSA 4DR1K 3HO1A 4QAGA 5KGWA 3C94A 5FLXO 4BRMA 1K73O 3BF1A 5JLHA 1KTQA 4LFBK 1IBLK 3V9XA 5EXWA 5KQDA 3KKRA 4E7HA 4DR5K 1Q9XA 2F96A 4ZHRA 3MXIA 4DSIA 4XEIA 3AO4A 4JI0K 3K5MA 3EEQA 4FJHA 2Y1JA 3SYZA 4XJXA 3JYTA 3VETA 1HLUA 4JI2K 2P9IB 1EETA 5AFUH 3MECA 4OLAA 1TL3A 3L8BA 5AQRA 4IOCL 1SL2A 3MXMA 3M8QA 1Q82O 4HUFA 2YHXA 3MN7A 3V1RA 4CJ5A 3CJ9A 1N6QA 4H4OA 2D0PA 2A5XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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