The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGKYVKILYDFTARNANELSVLKDEVLEVLEDGRQWWKLRSRSGQAGYVPCNILGEASGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
Epidermal growth factor receptor pathway substrate 8-like pr
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from human epidermal growth factor receptor pathway substrate 8-like protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RTU A; 4LUE A; 4CC3 A; 1FYN A; 1QKW A; 3SHW A; 1GCP A; 5FWB A; 1M8M A; 2YUP A; 1HD3 A; 1X2K A; 1PWT A; 3C0C A; 4F14 A; 2DIL A; 1NM7 A; 2CH4 A; 1KIK A; 2LCS A; 4AFZ C; 2CDT A; 2VVK A; 1CKB A; 1S1N A; 1GL5 A; 2JXB A; 4JJD A; 2PNI A; 2SEM A; 5IXB A; 1I0C A; 2KR3 A; 2J7I A; 2JMA A; 1PKT A; 4HVV A; 1VYV A; 1OPL A; 4J9F A; 2KNB B; 1PRL C; 1UDL A; 4CC7 A; 1KFZ A; 1T0H A; 2KT8 A; 3I5S A; 2K7A A; 3PVL A; 1YWP A; 3VS7 A; 2ED1 A; 2HCK A; 1UUE A; 2EYY A; 2J05 A; 2P4R A; 2L3Q A; 2EKH A; 4Z8A A; 3NHN A; 2LX7 A; 1V1C A; 1WXT A; 4LNP A; 1SEM A; 2E5K A; 4J9E A; 1IO6 A; 4AFS C; 2CRE A; 2MCN A; 2EYZ A; 4GLM A; 4JPB W; 5EC7 A; 1G2B A; 2DBK A; 2C0I A; 1WFW A; 2ROT A; 2ROL A; 4A63 B; 1A0N B; 1G83 A; 2KRN A; 1ZUK A; 2ABL A; 2DE0 X; 2HBW A; 1E6G A; 1GCQ A; 4RTY A; 5IHK A; 2LMJ A; 3QWY A; 2LQW A; 1AWO A; 1E7O A; 5I11 A; 4J9D A; 3VS2 A; 2MIO A; 1UG1 A; 1CKA A; 3IQL A; 1N5Z A; 2FEI A; 2RMO A; 2DNU A; 5IHN A; 4KRT A; 2NWM A; 3PE0 A; 4AFU C; 2D8J A; 2LJ0 A; 2KRS A; 3UA7 A; 1OEB A; 2JTE A; 4JJB A; 2DJQ A; 1UGV A; 2EYW A; 1OOT A; 2KT1 A; 2MOX A; 1K9A A; 2OJ2 A; 4FSS A; 3REB B; 1Z9Q A; 2DRM A; 4RTV A; 3NGP A; 4IIO A; 1VYU A; 1UE9 A; 1Y0M A; 2AK5 A; 1PKS A; 1ARK A; 1WXB A; 2RQT A; 2C0O A; 1AZE A; 4RTT A; 1JEG A; 2M0Y A; 3CQT A; 2CH4 W; 4RTZ A; 1AD5 A; 2BZ8 A; 1W6X A; 2O9S A; 1M3C A; 5I22 A; 1RUW A; 2FO0 A; 2EQI A; 2DF6 A; 2BZY A; 2DL7 A; 2I0N A; 4OMP A; 1AWX A; 2FPE A; 3O5Z A; 2LJ3 A; 1ABO A; 2AZV A; 2F2W A; 1T3L A; 2FG0 A; 1CSK A; 2KYM A; 5FWC A; 3VRZ A; 1ZSG A; 2KBT A; 3UA6 A; 4D8K A; 1X6G A; 2GNC A; 2V1R A; 4HCK A; 4OMQ A; 2DLP A; 1YCS B; 1PNJ A; 2DBM A; 2RN8 A; 4F17 A; 2CUD A; 2KE9 A; 1UHC A; 2V1Q A; 3FJ5 A; 3M0U A; 1GFC A; 1QKX A; 1HJD A; 1VA7 A; 3TSZ A; 1AOJ A; 2YUQ A; 1AWW A; 1I07 A; 3VRY A; 2K3B A; 1EFN A; 4IIM A; 2KEA A; 2A28 A; 3THK A; 4Y92 A; 1X69 A; 3ZL7 C; 2AKK A; 1H92 A; 3EGU A; 2CT3 A; 3PVQ A; 3M0R A; 2RF0 A; 2EGC A; 3H0I A; 3VS4 A; 4JZ3 A; 1WA7 A; 3I35 A; 1QWF A; 1WYX A; 1JO8 A; 1MV3 A; 2AKL A; 3ULR B; 1SRL A; 4DEX A; 1B3Q A; 2K79 A; 1YNZ A; 2EVR A; 2JM9 A; 1M3B A; 2O88 A; 2K2M A; 1Y57 A; 3M0P A; 1K0X A; 1NYG A; 2J6K A; 1K4U S; 2KXC A; 2FRY A; 4GBQ A; 2FRW A; 3H0F A; 3UF4 A; 2O31 A; 4EIK A; 3EG1 A; 1GFD A; 2EPD A; 1KSW A; 4Z89 A; 4LN2 A; 1BK2 A; 2L0A A; 2VWF A; 4RTW A; 1WI7 A; 1NG2 A; 2DA9 A; 2BZX A; 1PRM C; 3NPF A; 3TSW A; 2HEQ A; 2B86 A; 4F16 A; 1T3S A; 2DX1 A; 2PTK A; 2YT6 A; 1WX6 A; 2AZS A; 3JV3 A; 4HXJ A; 1W1F A; 2OAW A; 1TUD A; 1K0S A; 1BU1 A; 1SHF A; 4LUD A; 2HSP A; 2KGT A; 1UJY A; 2FPD A; 4RUG A; 2NUZ A; 2RQW A; 1NYF A; 2ENM A; 1LCK A; 1ABQ A; 2O9V A; 3EHQ A; 3I9Q A; 1X6B A; 1GRI A; 1MUZ A; 2JS2 A; 1Z9Z A; 4OMM A; 2J6F A; 1TG0 A; 2GTJ A; 5L23 A; 1U3O A; 4ORZ A; 2EGE A; 5FW9 A; 1TUC A; 2DM1 A; 3SEM A; 2KRM A; 1AVZ C; 1JXO A; 2DRK A; 2DVJ A; 4K11 A; 4AG1 C; 1VYT A; 1WLP B; 2LZ6 B; 2KRO A; 1H3H A; 2JMC A; 3R6N A; 2RQU A; 1BBZ A; 2ED0 A; 2L3P A; 4RTX A; 4QT7 A; 2FPF A; 4HVW A; 3TVT A; 3M0Q A; 2DYB A; 2D1X A; 1RLP C; 4WCI A; 5GJW B; 1AZG B; 3REA B; 1SHG A; 1X27 A; 1X2Q A; 2CT4 A; 2GQI A; 2DMO A; 3VS0 A; 2DL8 A; 1UFF A; 2JS0 A; 5IH2 A; 2ESW A; 4J9G A; 5ECA A; 1JU5 C; 2EBP A; 2YDL A; 1YWO A; 5HCK A; 2CSQ A; 2JM8 A; 2IIM A; 5IHI A; 4AG2 C; 2KYB A; 1QLY A; 1RI9 A; 2LJ1 A; 4OMN A; 1UTI A; 1UHF A; 3H41 A; 2C0T A; 1AEY A; 2RNA A; 4J9B A; 2YUN A; 2KXD A; 1QCF A; 2VKN A; 4ZNX A; 1M3A A; 2YSQ A; 1NEG A; 4X1V A; 1GCQ C; 1M27 C; 1WIE A; 2D8H A; 1U06 A; 2JW4 A; 2CSI A; 2LQN A; 3EG2 A; 5GJV B; 1J3T A; 3RBB B; 1SSH A; 1JXM A; 1K76 A; 2L2P A; 1BB9 A; 4LE9 A; 2X3X D; 1QWE A; 1SPK A; 5IXF A; 1WDX A; 3QWX X; 4J9I A; 4OMO A; 1W70 A; 1WXU A; 2PZ1 A; 4OML A; 2RQR A; 1X43 A; 2K6D A; 2W10 A; 3UAT A; 3U23 A; 4CC4 B; 2DL5 A; 4ESR A; 4R0K A; 2LP5 A; 2RPN A; 2XMF A; 1UEC A; 1KJW A; 2EGA A; 4JJC A; 2DL3 A; 3EG3 A; 1I1J A; 4E6R A; 2X3W D; 3M0T A; 1ZUU A; 2GGR A; 1PHT A; 3H0H A; 3VS5 A; 2J06 A; 2YUO A; 2A36 A; 2K9G A; 2DL4 A; 3EG0 A; 4J9C A; 1JQQ A; 2H8H A; 3GBQ A; 1AWJ A; 1YN8 A; 1YP5 A; 2GTO A; 1T0J A; 1H8K A; 2GBQ A; 1UJ0 A; 3RNJ A; 1SRM A; 2A37 A; 2G6F X; 2CUB A; 3M0S A; 1HSQ A; 1OPK A; 2EYX A; 2F2X A; 2L3S A; 2ECZ A; 4J9H A; 4AFQ C; 1ZLM A; 1OV3 A; 3VS3 A; 1XOV A; 1B07 A; 1GBR A; 2BTT A; 1U5S A; 4CC2 A; 1FMK A; 4D8D A; 3I5R A; 2OI3 A; 2M51 A; 1M30 A; 3KFV A; 2SRC A; 2QDL A; 3VS6 A; 3A98 A; 4Z88 A; 1ZX6 A; 3LH5 A; 2HDA A; 1NLO C; 4HVU A; 1RLQ C; 3EHR A; 2LNH B; 2O2O A; 3VS1 A; 4M4Z A; 4JZ4 A; 1E6H A; 1NLP C; 1ZBJ A; 1GBQ A; 2F2V A; 1K1Z A; 1MV0 B; 2D0N A; 2RQV A; 3NMZ C; 2JT4 A; 1ZUY A; 2A08 A; 2EW3 A; 2J6O A; 2W0Z A; 4DEY A; 1NEB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1QP3 A; 1VQM A; 4LUE A; 2LVM A; 2R58 A; 4M7A G; 4A53 A; 4CC3 A; 5CAI A; 3GIB A; 1GCP A; 4XU0 A; 2JVV A; 1X2K A; 1ZHI A; 2QEX Q; 2BUD A; 2CP0 A; 3BE3 A; 3CC4 Q; 2CH4 A; 1KIK A; 3FLG A; 4OP0 A; 1HXD A; 4M77 B; 1CKB A; 2KSS A; 5KYX B; 3HTR A; 2P84 A; 2BKD N; 4MML A; 2KR3 A; 4HVV A; 3HRU A; 4J9F A; 4HA8 A; 2XK0 A; 4BE1 A; 1K9M U; 1KFZ A; 1T0H A; 2K7A A; 2A0F B; 1YWP A; 1MMN A; 2HCK A; 3NFC A; 2L3Q A; 2X4Y A; 3I56 Q; 1WXT A; 4RKU E; 5J3B A; 1SEM A; 2QA4 T; 2CRE A; 2MCN A; 3X24 B; 1PM3 A; 1M90 C; 3CD6 T; 4BB7 A; 1QVG S; 2QK0 A; 1YIT Q; 5KYY A; 2MWO A; 3A1P A; 1E6G A; 1GCQ A; 2E1H A; 5IHK A; 1Q86 U; 2KK4 A; 1M1G A; 2MIO A; 1UG1 A; 1CKA A; 2YWW A; 1W2B S; 3QZ9 B; 2DNU A; 1TS9 A; 2NWM A; 4AFU C; 2D8J A; 5LJ5 f; 1WHK A; 4DBQ A; 2RK2 A; 5GAO m; 1K9M R; 4JJB A; 1UB4 A; 2DJQ A; 3BDU A; 1G3S A; 2EYW A; 1G3Y A; 1I8F A; 5GAN 7; 2KT1 A; 1VQ5 Q; 4HCC A; 3L1A A; 1K9A A; 4OB1 B; 2WAC A; 1FMW A; 3REB B; 4NS5 A; 4UC4 A; 3EGX B; 1G8X A; 5J26 A; 4GLK A; 2DRM A; 2B8A A; 4M7D B; 1LPL A; 4RTV A; 1R0C B; 1X6O A; 1W4S A; 4M75 E; 4IIO A; 3C94 A; 1UE9 A; 2HAX A; 1MND A; 2RQT A; 1NPR A; 2I2L A; 3CCS Q; 1VQ4 Q; 4M75 F; 4A4F A; 2P0Q A; 2BZ8 A; 4C0F A; 3EFO A; 3RKY A; 3CCM T; 1OZ3 A; 2FO0 A; 3CPW S; 1D0X A; 2EQI A; 2DF6 A; 2BZY A; 4PJJ A; 1W2B A; 2NLU A; 3OYC A; 4E7K A; 2FPE A; 1Y7X A; 4HT8 A; 4Z02 A; 2Y4X A; 4TVR A; 2KVQ G; 5DY9 A; 3CCU T; 1RAD B; 1T3L A; 3PMI A; 5CVI A; 4M75 G; 2KYM A; 5FWC A; 3CCR A; 1OQK A; 1RAH B; 1AHJ B; 2XIC A; 1X6G A; 2GNC A; 3MPU B; 4HCK A; 2CKK A; 1PNJ A; 2DBM A; 2R5A A; 2FYK A; 2CUD A; 3CC7 A; 5A0D A; 1UHC A; 3OS2 A; 2CP2 A; 1HJD A; 2NUT A; 2RI3 A; 3TEE A; 4C5G A; 3JCM P; 3TSZ A; 1D1A A; 3C12 A; 2K3B A; 3LGF A; 4IIM A; 3GPL A; 3DLM A; 2DAQ A; 5KYN A; 3ZL7 C; 3CPW A; 2AKK A; 1MMA A; 1AT1 B; 3UWN A; 2RHY A; 2VAS A; 2Z0W A; 3EGU A; 2HBP A; 3QDR B; 3MEV A; 3H0I A; 5LJ5 e; 3JCM J; 1WYX A; 1JO8 A; 1MV3 A; 3QZ5 B; 1Q81 R; 2EJ9 A; 4C92 D; 2JM9 A; 2O88 A; 1C6V X; 3M0P A; 3ZBD A; 3HKS A; 4WF2 A; 3L2U A; 3DB4 A; 4OVA A; 2M9U A; 2MF2 A; 2KXC A; 1ZQ1 A; 1MNE A; 2OTJ T; 4BDY A; 2FRW A; 4PJN A; 1IGQ A; 3AHU A; 3E19 A; 3OMG A; 5GAO n; 1H64 1; 2EPD A; 1KQ1 A; 4E7L A; 5IT9 E; 4M7A C; 5CKE A; 3M58 A; 4KUI A; 2E70 A; 2L0A A; 1VQ8 A; 1NG2 A; 2F5T X; 2DA9 A; 2BE9 B; 2M1H A; 2QDY B; 3OY9 A; 2QQR A; 4N4I A; 1T3S A; 3OSS C; 3JCM X; 3CCQ A; 4JDS A; 2DX1 A; 4XU3 A; 2PTK A; 3V8L A; 4LXC A; 4N4G A; 3JRZ A; 1JJ2 S; 2OAW A; 1TUD A; 1YFN A; 1BU1 A; 4LUD A; 4N0A C; 3JCM c; 2HSP A; 3VKI A; 1UJY A; 4J5Y A; 1Y96 A; 2NUZ A; 2DKG A; 1VQ7 T; 1NYF A; 2E10 A; 1LCK A; 3RIR A; 1X6B A; 1GRI A; 2F1L A; 3PTA A; 3P8D A; 4HCZ A; 4OMM A; 2J6F A; 4BE2 A; 4ORZ A; 3OSV A; 2HL5 C; 1YJ9 T; 2RHI A; 2MMP A; 5KE3 A; 5GMK i; 4AG1 C; 4C8Q D; 1YHQ T; 5LJ3 j; 5GAN d; 4PJO B; 1Q82 U; 2FPF A; 4A4H A; 4HVW A; 4DA4 A; 3CCM Q; 4QVD A; 1QW1 A; 4BI8 B; 2AHJ B; 2DEU A; 1KD1 R; 3TRE A; 3F70 A; 2DL8 A; 1UFF A; 2KQW A; 3HRT A; 3CCU Q; 3M9Q A; 2ESW A; 3LW5 E; 5ECA A; 4M77 D; 2K5L A; 2CSQ A; 5CKF A; 2DXU A; 3CCV A; 1QVG P; 3HHT B; 5IHI A; 1K8A U; 1D0Z A; 1RI9 A; 2LJ1 A; 1B34 A; 4ZTJ A; 1UTI A; 2PU9 B; 3CME A; 3GF5 A; 2E3H A; 2EQU A; 2COW A; 2LDM A; 2YSQ A; 4X9C A; 2RK1 A; 2LQN A; 4C8Q F; 5GJV B; 1QVF A; 5IAY A; 1J3T A; 3LH0 A; 1Q82 R; 1K76 A; 4LE9 A; 5FU6 B; 1R77 A; 2RD1 A; 4FM4 B; 5IXF A; 1G3W A; 4OMO A; 1I4K 1; 4J7I A; 1YI2 A; 1M4Z A; 1WXU A; 1PD0 A; 2W10 A; 1D1C A; 2K6D A; 3UAT A; 4C8Q G; 2RJF A; 2DFU A; 2DL5 A; 5GMK l; 2OTJ Q; 1UEC A; 1QMC A; 2DO3 A; 4JJC A; 3VJP A; 4EMK B; 4JS4 A; 3A5Z B; 4PFO A; 3INZ A; 2GGR A; 4M75 C; 3H0H A; 1WJQ A; 1DJ7 B; 1NZ9 A; 2A36 A; 2ZAE A; 4Y91 A; 4XTW A; 2H8H A; 3HPW A; 2EQM A; 3NTH A; 4FYV B; 4ATO A; 1KK7 A; 1UJ0 A; 3J80 E; 2M02 A; 1SRM A; 2YRC A; 4ME7 A; 3VUZ A; 1VQP A; 3M0S A; 2PQW A; 3H8Z A; 4E47 A; 3MHX A; 1K73 U; 1VUB A; 4M78 D; 4M7D D; 3SD4 A; 4XTZ A; 4J9H A; 2JUF A; 1ZLM A; 4FIB A; 1PSF A; 2DZ9 A; 4QQ6 A; 1GBR A; 4LDU A; 3I5R A; 3M56 A; 2OI3 A; 1VQ7 Q; 5GAN j; 2EWN A; 3KFV A; 3QII A; 3FEO A; 3P8B B; 3A98 A; 4Z88 A; 4M7A A; 3G71 A; 4HVU A; 2PUO B; 2CP6 A; 4MZM A; 1RL2 A; 2LNH B; 3M5A A; 3OB9 A; 3VS1 A; 4M4Z A; 1NLP C; 4CRI A; 1YJ9 Q; 2JZ2 A; 4RG2 A; 6AT1 B; 2D0N A; 1YHQ Q; 4FW1 A; 3OYY A; 2EW3 A; 4QW2 A; 5GAM e; 4N0A A; 2H3E B; 4RTU A; 2OX7 A; 2HQH A; 2QQA A; 3G6E A; 1QKW A; 4MMK A; 2LX9 A; 3SHW A; 5FWB A; 2YUP A; 5GAM d; 1SKU B; 3RDV A; 1K73 R; 4M78 F; 3C0C A; 4MDX A; 2DIG A; 4F14 A; 2DIL A; 2LCS A; 4RMO A; 2MK5 A; 4E7H A; 2CDT A; 3HSB A; 3OYD A; 4LDV A; 1S1N A; 1O9S A; 2DXC A; 3LGL A; 3G4S T; 2SEM A; 1M90 U; 1FXX A; 2RI5 A; 4M78 G; 3OYA A; 2XU8 A; 1KC8 C; 1VYV A; 3I55 T; 1PRL C; 3V7C A; 1JJ2 P; 4OMF B; 4CC7 A; 5KYY B; 3VS7 A; 5LJ3 h; 4FCY A; 4OF1 A; 2MAM A; 1VQ6 T; 2J05 A; 2Y90 A; 3OA6 A; 2P4R A; 1M8V A; 4EPC A; 3NHN A; 1YIJ A; 2VB6 A; 3EH2 A; 4JPB W; 1G2B A; 4BY6 C; 3FC3 A; 2QA4 A; 2C0I A; 1JBM A; 2MWP A; 2ROT A; 1A0N B; 4LD9 K; 1D3B B; 3CD6 A; 1MHN A; 1RAF B; 4P5N A; 1RI0 A; 4RTY A; 1VIF A; 3QWY A; 1AWO A; 2GFU A; 5L8R E; 2JJ9 A; 4J9D A; 5KCH A; 5FRN A; 5GAN 2; 2RO0 A; 2DJZ A; 1MMG A; 1D1B A; 3PE0 A; 4L59 A; 5FRO A; 5HK3 A; 3UA7 A; 1Q7Y U; 1OEB A; 3Q1J A; 1UGV A; 1VOM A; 2X4X A; 2MOX A; 4JS5 A; 3EFO B; 4J6W A; 4M7A E; 2QYZ A; 1M2O A; 3CCJ T; 5DLO A; 1M9S A; 1M5Q 1; 4XAX B; 1Y0M A; 1ARK A; 3M4G A; 4M75 A; 1X01 A; 3QG1 A; 4PJO D; 4RTT A; 3UT1 A; 1Y71 A; 4E2F B; 3C95 A; 2CH4 W; 4C0Z A; 2XD0 A; 1AD5 A; 4KBM B; 5D6W A; 4C8Q C; 3RKW A; 2VUB A; 5GAM j; 2QGF B; 4F7U F; 3C4S A; 2NUT B; 2V26 A; 3R6O A; 1ABO A; 2P0K A; 2L3R A; 4NOY A; 1ZSG A; 2GFA A; 2K57 A; 5C6S A; 2CZ0 B; 3RR6 A; 5HY6 A; 4ZTF A; 1Q7Y R; 2DLP A; 2QTX A; 3FJP A; 2E5Q A; 1YJW A; 2RN8 A; 3H9N A; 1SF9 A; 4F7U G; 2DTO A; 2KE9 A; 4NL2 A; 1BI3 A; 2V1Q A; 4XTY A; 1VA7 A; 1N8R C; 5GAN h; 1AOJ A; 2QAZ A; 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