1X1OA

Crystal structure of project id tt0268 from thermus thermophilus hb8
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
277
structure length
277
Chain Sequence
WQGGLEEALRAWLREDLGQGDLTSLLVVPEDLEGEAVILAKEGGVLAGLWVAERVFALADPRTAFTPLVAEGARVAEGTEVARVRGPLRGILAGERLALNLLQRLSGIATLTRAYVEALAGTKAQILDTRKTTPGLRALEKYAVRVGGGRNHRYGLFDGILLKENHVRAAGGVGEAVRRAKARAPHYLKVEVEVRSLEELEEALEAGADLILLDNFPLEALREAVRRVGGRVPLEASGNMTLERAKAAAEAGVDYVSVGALTHSAKALDLSLLVVRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of project ID TT0268 from Thermus thermophilus HB8
rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 98
structure length 277
sequence length 277
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1x1oA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 1x1oA01
2ISSA 5BMWA 1H51A 4Q32A 2W79A 3G3MA 3QC3A 4LVDA 3UD6A 4IWWA 1RQEA 3MI2A 3HG2A 1WXJA 1ZY9A 1WOAA 1QO2A 1VR6A 1LBFA 2V5LA 4QNWA 2C16A 2BXVA 3LXAA 1OX5A 2H8ZA 5LKYA 4HN4A 3QSRA 1IGSA 3EWZA 5DELA 3O6CA 1LLWA 2CU0A 2YXGA 4YWIA 3Q58A 1NAL1 2FPYA 4RKAA 3G0UA 1A5SA 1S5WA 4XBKA 5SWUA 2RHGA 2Z0IA 2JBMA 5CGQA 5DY2A 3EKZA 1OX4A 1YTKA 4LOCA 3E96A 4QJ1A 3MUXA 4OGZA 4LC8A 1PHQA 3EWXA 3GK0A 2YZRA 3FEMA 2Y70A 2HSAA 4O14A 3GLCA 1Q6RA 3KAOA 1LBMA 3AO0A 4BI6A 2YCEA 1QPQA 2RKXA 4M19A 3WJSA 4NXKA 3IRDA 3UWVA 3S5ZA 3TU9A 4MLJA 1JVNA 3FS2A 2ISWA 2Q3RA 1THFD 1PIIA 1KTNA 3CIXA 4O18A 1SU5A 1TJRA 3QPZA 4ZQMA 1QDSA 2RDUA 3HMJG 4I7WA 1OFOA 3TIMA 5HUOA 4RLIA 1YDOA 5CSSA 4CCCA 3W7PA 2QCEA 3TSBA 3FJ6A 4C1KA 4FNUA 5EBUA 2QDGA 3T55A 1H61A 3LHZA 3G0XA 3LLFA 3M5XA 3TJXA 1ME9A 2ZDRA 3NPWA 4A2RA 1KW1A 3UWWA 3TW6A 1C9DA 3RFAA 3UPWA 1U5JA 3W2UA 3NZRA 2FQIA 5U7SA 4JTUA 3W7DA 4CCDA 2O7SA 3DBPA 2YYTA 4AVFA 3LI1A 5E0KA 1KFJA 2Q8ZA 2VFDA 5L9FA 2Y7DA 4LW7A 3CEUA 3W1PA 3B04A 3T44A 3NL5A 1WA3A 3STFA 5DBTA 1LOQA 4WZHA 4DO6A 1LOLA 4Z08A 3DFOA 1K8ZA 4N4QA 2B0MA 3HBLA 4O4VA 5FEXA 3L2IA 4FNSA 3I65A 3N73A 3TSDA 3VE7A 4FXRA 2DZUA 5F4WA 2C13A 3DENA 4Z1CA 4MLRA 3P7YA 4UTMA 1H63A 5H91A 4K8EA 1UASA 1G6CA 4N4PA 4IPJA 5A5WA 2Q8LA 4HNNA 2LLEA 4O4WA 4OBTA 4WJEA 4K36A 3W1NA 2V30A 1XBXA 3WK1A 1RVGA 3ZS4A 3R8RA 2F84A 1JQVA 1YYAA 2B4GA 3GZ3A 1QPNA 3TMQA 4WQ6A 1F74A 1FWRA 3N2MA 1QNVA 1T99A 4ORMA 4DO5A 1K8YA 2ZZ2A 2B7OA 4NNCA 4MYAA 4R7JA 2DZVA 1SO4A 3PB2A 4HNVA 4MPQA 3HPXA 3S5OA 1ICSA 1GOXA 4Z0JA 2J6XA 4N6FA 2TPSA 1R47A 3QW4B 4MIMA 1LBLA 1SO6A 3KRUA 4NXSA 4UTHA 2R94A 5KZDA 3M47A 3CB8A 4AHQA 3THAA 4W9TA 4ZQOA 3BO9A 4ADTA 3ABQA 2WNZA 3P81A 2Y85A 4JD4A 2ZRYA 3A23A 4O50A 2NWRA 3UWUA 3W7MA 4IXXA 3IVSA 4LY8A 3R13A 2QCDA 3N9SA 4MOZA 3PR2A 3HGOA 3O06A 2GQ9A 4QISA 4XWUA 3QQ1A 3B0UX 3P5ZA 3VI2A 3SGZA 2VEKA 5CKSA 4E2BA 1HO4A 3NPUA 1AW1A 4R53A 2WSRA 2ZTKA 4TR9A 4H4IA 5EMUA 4AWUA 4DBEA 1QR7A 3DFQA 3A24A 1XKYA 3M0ZA 1G4SA 1K7EA 2B7NA 3LERA 4A21A 2C6QA 2H6RA 5EPDA 5DN1A 5KSWA 1FXPA 1H7RA 3IEBA 2HS6A 1GYNA 1TV7A 1G4EA 1DV7A 5F2IA 3S1UA 4UFJA 5K7JA 3LHUA 5AN7A 3O1NA 4PEKA 1YLVA 4TMBA 1ZAJA 1O5KA 3W7NA 1DKWA 5K9DA 3DI0A 4K39A 4FXSA 4JTJA 4Y96A 4HIBA 1VHNA 4N9DA 4IXHA 5HUPA 4ZQRA 4IPIA 3M7WA 1L2UA 1GVSA 4AHPA 1ML1A 3KVKA 1TSIA 3W85A 4K8HA 4RX0A 2QCFA 2V82A 3GNNA 1FWNA 4Y6GA 4FB7A 1E51A 1HUVA 3SECA 1UB3A 3QH2A 5DCDA 3W7LA 1SZEA 4Q4KA 5D02A 4JTSA 1EP1A 3P62A 1RR2A 3PG8A 1N7KA 2ZRWA 2PRLA 3S1WA 2NUXA 4UTKA 1GVFA 1VCFA 3C3NA 1ZAIA 3CLMA 2GVJA 3MYOA 4Z1DA 4PL1A 1FDYA 4O19A 3ABOA 3CHVA 2EHHA 2ZRZA 1ALDA 3NL6A 5G2HA 4AWSA 1F6PA 3QF0A 1TPEA 1FCBA 1TIMA 1EUAA 3P61A 1RD5A 3HIJA 3W76A 2QAPA 2Q3OA 1OVDA 3S5YA 1H62A 4FO4A 4UNLA 1XXXA 1NF7A 5FF2A 5TQLA 1VQTA 4Q33A 2X1SA 3FA5A 3R89A 3W7IA 3W1XA 2DJXA 4UR7A 3SGUA 3W2JA 1JR1A 1JUEA 4OT7A 3I6RA 2IQTA 6ALDA 2CWNA 4PODA 2NXIA 1NFBA 1TB3A 1F76A 2J88A 4P2VA 3P74A 3PUDA 3MI3A 5D38A 4D2JA 4MZYA 3TXZA 1OFRA 4JTFA 1F5ZA 1GTEA 3RMJA 5BRBA 5F2LA 4NVTA 5CPOA 2OCZA 4ADSA 2ZA3A 4H6KA 1ZHAA 3I7QA 3MP3A 2NX3A 2VOMA 2CLKA 4H3DA 4UMBA 4DF1A 2CW6A 4UNKA 4TMCA 4BR1A 2QCNA 4IGHA 4O17A 3PUEA 4NQ1A 3N9RA 1LLZA 1H1ZA 2GJNA 1X1OA 3F4WA 1M6JA 3W1RA 3BG5A 3EXSA 5BW6A 2QF7A 1S3HA 1H50A 3NQEA 1LORA 5D2YA 4JR5A 1GG1A 4WOQA 2C18A 4CNOA 1W0MA 4JS3A 3EWWA 2J24A 4M6QA 3W73A 4WOZA 2W6RA 3FOKA 4N9CA 4EOUA 2A7PA 1TV5A 2GJLA 4X3ZA 1KFKA 5K2ZA 3QRHA 1VH7A 3TC6A 1QPOA 1XM3A 3M5ZA 3PULA 1P1XA 4DQWA 3C52A 1AW2A 4IQLA 3M6YA 3W7JA 3AJXA 3LRKA 1VYRA 3LTSA 2B7PA 2YFNA 3LX9A 2XN0A 4AF0A 2P10A 3N19B 4NU7A 5E93A 1FBAA 2NX1A 5G4EA 5FEZA 1WQ5A 1O4UA 1I2PA 3I7SA 3B8DA 4XZ9A 4UFLA 1SZGA 1VRDA 4HNUA 2OT0A 4LT9A 2R8WA 2VEIA 3C6CA 1FCUA 3W3OA 1GG0A 5AOUA 5G2WA 1H60A 2E09A 3C4UA 1OFPA 3L68A 2ALDA 3GYEA 4N6EA 1K7XA 3A5VA 3O05A 1J5TA 2ZZ5A 3PBYA 4QSHA 1KM5A 5BNKA 2CZDA 1OK4A 1M7OA 3SR7A 1GQNA 5D05A 3M16A 3N14A 1GJPA 3TMLA 1H7WA 1WAUA 3B03A 4PH6A 4IMCA 2ATSA 1NVMA 3S6DA 3CM4A 2Z6JA 2QUVA 3G0SA 4DBDA 1JRBA 1W3TA 3NYZA 1TTJA 3IVTA 4O1CA 1MZHA 2VEMA 4X22A 4PL2A 4A22A 3W87A 3UWQA 3DAQA 3EX6A 3FFSA 3LM7A 4EF8A 3C2VA 4K7YA 4O12A 1EWEA 5DY3A 3O6DA 4DO4A 1PL9A 3M1ZA 2E6YA 3THQA 5HWJA 4IX2A 5C54A 2VENA 2NX9A 4XBSA 4ICNA 3VE9A 1VJIA 2NLIA 3DU0A 5K4ZA 3S8HA 2QCMA 1I45A 5I3JA 3R12A 4HT3A 3M9YA 3L5AA 1W5NA 1B9BA 4KWWA 1DVJA 4YCPA 3B05A 1Z48A 3CTLA 4QITA 3A5FA 5AHIA 1SUXA 1MXSA 2NWSA 3W72A 1TTQA 1BTMA 4FEZA 4M5PA 5FI8A 3W71A 2B7QA 1EUNA 2YX0A 3KVLA 3P8JA 3WJZA 2VFGA 3NQ6A 2WKJA 3O63A 5I3HA 1OFAA 4JTHA 1OFQA 1HTIA 5E1QA 2CLMA 4JX6A 4OV9A 2ISVA 4HSOA 5LNRA 1HO1A 1OYBA 3TROA 1RQHA 1I2OA 4DF2A 3DFPA 1SSGA 1SO5A 5D2TA 4DXVA 3U2OA 1F73A 3G1DA 4LV4A 3UZJA 2QEZA 1VGAA 3BG9A 3PSVA 1ZFJA 3NQGA 1KA9F 3KFTA 4UTIA 3W74A 3L66A 4NNAA 2ZBTA 3W6YA 5HR6A 4O28A 1WYIA 5HWNA 3KX6A 3DFTA 4HKPA 1EWDA 1AK5A 1FX6A 1YXDA 4YLWA 3LXCA 4I7VA 2P0OA 1XBZA 4K37A 1IXQA 1D3GA 2YYUA 1OYAA 1TREA 2QDHA 4NX0A 1X8FA 4XKYB 3NDOA 3W2LA 1WBHA 2YW3A 3MO7A 1OHLA 3LRMA 4AMAA 3L5LA 4PFMA 5AFDA 2FTPA 3N2XA 5C6MA 2AQWA 3LHWA 4WY0F 1K8XA 1V7YA 2WSQA 3LHYA 3NQCA 1Q6OA 2C14A 3W2NA 3NQ2A 2G96A 1A53A 1BKSA 1W3IA 4L4MA 3QZEA 2NUWA 3TUUA 5C2XA 3C2OA 4B5NA 1TPVA 4FNRA 1K03A 3G22A 4ZL1A 3LCGA 1TJPA 3W9ZA 5DCBA 3ANYA 4JN6A 4PC8A 1JCXA 1OFEA 4ZVJA 1FWWA 4AHOA 2ZRXA 3PS7A 2OT1A 4GUGA 1SW0A 5FF7A 5FF0A 1FQ0A 4O1DA 5EYWA 1LP6A 4NJIA 3BVJA 3RU6A 3ABRA 4XQ6A 4CCEA 3GAKA 3BV4A 1MEWA 3OBKA 1SW3A 1B57A 2QCHA 5TIMA 5T26A 4GWEA 4UFHA 3M44A 3NNTA 1EA0A 2JKEA 1G7VA 5L6UA 4ADUA 1QPRA 2E5CA 3QPYA 2X1RA 4LVBA 3NAVA 4MVAA 1WDWA 2V0TA 2A21A 1TO3A 3W1TA 1EX5A 4MZ1A 3NXFA 3IIZA 5LHFA 4LVAA 4O52A 3WK3A 1U83A 4OQVA 4LU0A 5LSMA 2TMDA 5AHMA 1K3UA 3G1YA 3A9IA 3MBFA 3TC7A 5G2IA 1ZJIA 1LZOA 3FLUA 5DXYA 1LOSA 2UV8G 2YDAA 1X1ZA 3G1SA 3PBUA 6TIMA 3HG5A 5EA9A 1MSSA 4OV4A 5FEWA 2CLLA 3IIOA 4N9BA 4N02A 2DZWA 1T8XA 2E77A 2GVGA 4I7UA 3H54A 2ZRUA 1O60A 1R2SA 2FPVA 5CZSA 4IJBA 2GPTA 3STGA 1K02A 3W88A 3W2MA 5FF3A 4FX7A 1LRNA 3R5EA 5GVJA 3HG4A 3W7CA 2R91A 2E1DA 4JTLA 4AWTA 1A5CA 1ZALA 2E68A 2NV1A 2QJHA 2C1HA 2F7FA 1XBYA 4WXYA 3G1FA 4JXCA 1JQXA 3ZFHA 1Q45A 3C56A 4HHPA 3M5VA 3LI0A 3FYPA 2A7NA 3IV3A 1XUZA 1W8SA 2I14A 3BW3A 1JCLA 4RR4A 3IIVA 5K3VA 4UC5A 3CQ0A 1DQWA 2BTMA 3C2RA 1FDJA 5LNVA 2QAFA 2GOUA 1TQXA 1JCNA 4RV8A 3P84A 4NZJA 4Y8FA 3WFAA 1P0KA 3KRSA 1OJXA 3T7VA 3WK0A 2JKAA 1UBSA 2EKCA 3TW7A 1TV8A 3IGUA 1QWGA 3W1UA 2FB2A 3W2KA 2G5WA 1SO3A 3B06A 3W7RA 1H7OA 4YL2A 3HO8A 1UJPA 2YPIA 3L67A 4AB4A 2ABBA 1XL9A 2O7QA 4EVZA 1B4KA 2Y61A 3UYCA 2G95A 1TRIA 1G67A 4WUIA 4RJEA 5F1VA 3FJLA 5AYXA 1KLYA 5HNRA 5U4NA 5HMSA 1X7FA 4CQAA 4FNTA 3BLEA 3ELFA 1GEQA 5J5DA 1EEPA 3F4NA 3GDKA 2C15A 1UCWA 1TPC1 5HINA 3W1MA 1UUMA 1CW2A 2OJPA 1YPIA 2ZRVA 1MEIA 2QKFA 2PE4A 4NJGA 3KXQA 4GUJA 4GNJA 2GQ8A 4GUFA 3MW7A 4LUJA 1MO0A 3EWBX 4S1FA 2TSYA 2WOQA 2ABAA 3UZ5A 4O13A 2DU2A 1KFEA 3S42A 5ABTA 3W1AA 3CU2A 4MFEA 3DFNA 1KM0A 1W54A 5CZTA 3B0VC 3U8GA 5D33A 3BK0A 3HB9A 3PG9A 2ZZ6A 2Y89A 3Q2DA 1OX4B 4ZMGA 3CIWA 3NQVA 3W7QA 3TAKA 1JUBA 3JR2A 3VNDA 4UTLA 4MFDA 3PAJA 4FF7A 1G4TA 1ADOA 3NM3A 4Y9AA 4RK8A 3TCEA 3TQVA 4ZQNA 3STEA 1VCGA 3C2FA 1TPFA 4AAJA 1W5MA 2RH9A 2V9DA 3K30A 1K7FA 1PVNA 1BWLA 1DJQA 1DJNA 3KVJA 2A5HA 4JTEA 2GVLA 3NZ1A 3W07A 3G1VA 4LNYA 4JNMA 3LCXA 1YTEA 3G8EA 1OG0A 3IIXA 4LWWA 5KINA 3NQAA 3TK7A 1W5PA 1JRCA 1M7PA 1XBVA 3HGRA 3HPSA 4GUHA 4DEFA 3F1QA 2X1TA 1I4NA 5CG7A 1TYGA 3FIGA 1QAPA 3EXTA 3W23A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5ENL A;  5CJ5 A;  2YCK X;  4DZI A;  3WLQ A;  3GW0 A;  2O7S A;  2NVA A;  2YYT A;  3DBP A;  3ZST A;  2Q8Z A;  1GNX A;  5L9F A;  1KCX A;  2GVY A;  6XIM A;  3CEU A;  1QJW A;  3T44 A;  3NL5 A;  1WA3 A;  2FGL A;  4WZH A;  4H9X A;  3DFO A;  5JVH J;  4Z2J A;  4N4Q A;  3HBL A;  4L1G A;  1OIM A;  4GGH A;  3I65 A;  3WLT A;  2DZU A;  5F4W A;  3P7Y A;  4IH3 A;  2VR5 A;  2Y8K A;  1A3H A;  4AVO A;  5A6T C;  1UAS A;  4J2M A;  5HPC A;  2VP8 A;  3W6M A;  3BUR A;  3KCJ A;  1KB3 A;  6ENL A;  2DUX A;  4D6H A;  2BVD A;  2G3N A;  2IUZ A;  4OBT A;  4WJE A;  2V30 A;  1XBX A;  4MNJ A;  1YYA A;  3KL5 A;  5B80 A;  5H8P A;  3PIP J;  3N2M A;  1K8Y A;  1C91 A;  1EXB A;  3T8Q A;  4QTG A;  1SVD A;  1FWI C;  1PKY A;  1SO4 A;  5C71 A;  4MB3 A;  4N6F A;  2QVN A;  1ZCC A;  1MW2 A;  1SO6 A;  1Y5W A;  4I9J A;  4FLO A;  3W29 A;  4L9Y A;  3THA A;  4CVW A;  4ZQO A;  4ADT A;  3VIN A;  2Y85 A;  3H8A A;  4GZE A;  4O50 A;  3UWU A;  3GHT A;  1XIN A;  3SUU A;  4PUL A;  2GZX A;  3IVS A;  3WQ5 A;  2GK1 B;  4KH2 A;  2GQ9 A;  4QIS A;  3SN0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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