The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
GSSGSSGSEIQLNNKVARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFPSNFVTTNLNIETEAAAVSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Signal transducing adapter molecule 2
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the Signal transducing adaptor molecule 2
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
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| structure length |
88
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| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GL5 A; 2MOX A; 4GBQ A; 2JXB A; 4RTZ A; 1GFC A; 2CDT A; 1X27 A; 4JJD A; 2KRM A; 3M0Q A; 1YCS B; 1S1N A; 1YWO A; 2YUO A; 2NWM A; 2KYM A; 2KE9 A; 4QT7 A; 2X3X D; 1T3L A; 2LQN A; 2KYB A; 2KXD A; 2P4R A; 2DMO A; 2CH4 W; 1QWE A; 1M3A A; 2YT6 A; 4JJB A; 3EG2 A; 1SHF A; 1RLQ C; 2CUD A; 3VS0 A; 4RTX A; 3R6N A; 1UJY A; 1T3S A; 1GBQ A; 2C0O A; 3JV3 A; 3A98 A; 2JMC A; 1JXO A; 1N5Z A; 1PWT A; 3QWX X; 3I9Q A; 1ZLM A; 2HCK A; 2DL8 A; 2EGC A; 4RTV A; 3PE0 A; 2I0N A; 4GLM A; 1GFD A; 4IIM A; 1XOV A; 2CT4 A; 2EGA A; 3VRY A; 1X6G A; 4FSS A; 1RLP C; 1NEG A; 1Y0M A; 1E6H A; 1ZUU A; 1NLO C; 3M0S A; 1SSH A; 4D8K A; 3RBB B; 2LJ1 A; 4X1V A; 1YNZ A; 2OAW A; 1UE9 A; 3IQL A; 1B3Q A; 2JM8 A; 1AWO A; 2X3W D; 4D8D A; 1TUC A; 1OEB A; 2FO0 A; 1X43 A; 4F17 A; 1Y57 A; 2YUP A; 1H92 A; 1GRI A; 2W0Z A; 1GCQ A; 2BZY A; 2J7I A; 1TUD A; 1PHT A; 1Z9Q A; 2HBW A; 3THK A; 1SRL A; 2OJ2 A; 2RQU A; 4ORZ A; 2MCN A; 1PRM C; 2E5K A; 2L3S A; 1X6B A; 2EYW A; 2JTE A; 2ED1 A; 3REB B; 4OMP A; 1UHC A; 1K0X A; 2FRW A; 1RI9 A; 1MV3 A; 2LCS A; 1BBZ A; 2A08 A; 5EC7 A; 2PZ1 A; 2OI3 A; 4RTY A; 3TVT A; 4ZNX A; 1NYG A; 1H3H A; 2PNI A; 2J05 A; 2GGR A; 3VS4 A; 4Z89 A; 2SRC A; 1UFF A; 1OPL A; 1EFN A; 2EW3 A; 1PKT A; 1WXU A; 2DIL A; 4Z8A A; 1W1F A; 4Z88 A; 2BTT A; 2KR3 A; 2L0A A; 2DX1 A; 4LNP A; 3VS3 A; 3GBQ A; 1QCF A; 4AFZ C; 2DA9 A; 1ZX6 A; 2FPF A; 4OMO A; 2K6D A; 2ABL A; 4CC3 A; 2FPD A; 4E6R A; 4RUG A; 3ULR B; 2LMJ A; 3ZL7 C; 1AVZ C; 1KSW A; 1CSK A; 2JT4 A; 4JZ3 A; 1UUE A; 4F16 A; 2FG0 A; 1AZG B; 1CKA A; 2YDL A; 2RQR A; 2DL3 A; 3O5Z A; 2J6K A; 1AOJ A; 1TG0 A; 1UTI A; 2KT8 A; 2B86 A; 1WA7 A; 2EGE A; 1K9A A; 2DL4 A; 4OMN A; 5IH2 A; 1SHG A; 1V1C A; 2RN8 A; 2G6F X; 2DRK A; 2DVJ A; 1WI7 A; 3UA6 A; 1M27 C; 1M3C A; 2DYB A; 1X2K A; 4J9F A; 1QKX A; 5IHI A; 1I07 A; 2ROT A; 1NEB A; 2ESW A; 2F2W A; 2DRM A; 1RUW A; 2K2M A; 1FMK A; 1WDX A; 2LNH B; 3VS7 A; 1BB9 A; 4R0K A; 1A0N B; 5I11 A; 3KFV A; 4LN2 A; 1UG1 A; 1HD3 A; 2GTJ A; 2DBK A; 5FW9 A; 1PRL C; 1UHF A; 1AZE A; 2BZ8 A; 4J9H A; 2F2V A; 2A28 A; 2GTO A; 2D8H A; 4OMQ A; 4RTW A; 2K9G A; 2KRO A; 2EYY A; 1LCK A; 2JS0 A; 3H41 A; 2O88 A; 4AG1 C; 4JZ4 A; 1W70 A; 1ZSG A; 4AG2 C; 1W6X A; 2V1Q A; 2DE0 X; 1U3O A; 1E7O A; 2ECZ A; 2LX7 A; 1GCQ C; 2HEQ A; 3I35 A; 2O31 A; 2RF0 A; 3C0C A; 4J9G A; 2KNB B; 2PTK A; 1T0H A; 1Z9Z A; 2ED0 A; 4AFQ C; 5IHN A; 2RQW A; 4ESR A; 2DJQ A; 3FJ5 A; 2J6O A; 2H8H A; 3EGU A; 1AEY A; 3RNJ A; 3VRZ A; 1JQQ A; 1WXB A; 2BZX A; 3H0I A; 1GBR A; 1CKB A; 2FRY A; 4HVU A; 1SEM A; 1K1Z A; 3VS6 A; 2D0N A; 1ZUY A; 1MV0 B; 2JW4 A; 1QKW A; 1KFZ A; 1SRM A; 1YN8 A; 1VYV A; 1HSQ A; 5FWC A; 2CRE A; 2RQV A; 3M0P A; 1ABQ A; 4HVW A; 4HXJ A; 2EYX A; 2LZ6 B; 3M0R A; 3I5S A; 1OOT A; 3VS5 A; 1VA7 A; 1AWX A; 2DLP A; 2L2P A; 1WFW A; 3EG0 A; 1ARK A; 2ROL A; 3SEM A; 4K11 A; 4CC2 A; 2JM9 A; 4OMM A; 1X69 A; 2FPE A; 1NYF A; 1UDL A; 2CT3 A; 1SPK A; 1K0S A; 3I5R A; 5GJV B; 4OML A; 1IO6 A; 2MIO A; 3CQT A; 1GCP A; 4IIO A; 2EVR A; 1J3T A; 3UF4 A; 2HSP A; 1I0C A; 4AFU C; 1M30 A; 1K4U S; 5ECA A; 2VVK A; 4J9E A; 2SEM A; 1MUZ A; 5IXB A; 1JU5 C; 2DM1 A; 4A63 B; 3H0F A; 4CC4 B; 5L23 A; 2D1X A; 3TSW A; 1PNJ A; 5HCK A; 2VKN A; 2DL7 A; 2FEI A; 2KGT A; 2O9V A; 1WX6 A; 1WXT A; 2KBT A; 2QDL A; 1HJD A; 1NG2 A; 2AKK A; 4EIK A; 3PVQ A; 3U23 A; 3M0U A; 1T0J A; 1YWP A; 2RPN A; 2KXC A; 2DBM A; 3NPF A; 4RTT A; 3NGP A; 1H8K A; 3SHW A; 3REA B; 4LUE A; 2YUQ A; 4DEX A; 1K76 A; 2A36 A; 2HDA A; 1AD5 A; 2RMO A; 2AZS A; 1NLP C; 2JMA A; 3NMZ C; 1UEC A; 2L3Q A; 2KEA A; 3M0T A; 1ZBJ A; 4CC7 A; 1X2Q A; 1UJ0 A; 1FYN A; 1KJW A; 3EHQ A; 2XMF A; 4JJC A; 2V1R A; 3EG1 A; 1WLP B; 1QLY A; 5GJW B; 3UA7 A; 3EG3 A; 1I1J A; 1JEG A; 2M0Y A; 1NM7 A; 2LP5 A; 1BK2 A; 1OV3 A; 2VWF A; 3PVL A; 2GBQ A; 3VS2 A; 1U06 A; 2RNA A; 2EPD A; 1B07 A; 1UGV A; 1VYU A; 2KRS A; 3VS1 A; 2F2X A; 2D8J A; 1WYX A; 2DL5 A; 3EHR A; 3NHN A; 1ZUK A; 2YSQ A; 1E6G A; 2L3P A; 2CH4 A; 2ENM A; 1G83 A; 2AZV A; 4AFS C; 3QWY A; 2J6F A; 2DNU A; 2LJ0 A; 5I22 A; 1KIK A; 2CUB A; 3TSZ A; 2EYZ A; 4J9B A; 1AWW A; 4DEY A; 2J06 A; 4JPB W; 5IHK A; 1JXM A; 2GNC A; 2K79 A; 2K7A A; 3LH5 A; 1JO8 A; 4KRT A; 3UAT A; 2KT1 A; 1PKS A; 2KRN A; 2DF6 A; 1ABO A; 1G2B A; 1QWF A; 2AKL A; 1YP5 A; 4J9C A; 2YUN A; 5FWB A; 1WIE A; 1U5S A; 5IXF A; 4HVV A; 1OPK A; 2EKH A; 3H0H A; 2AK5 A; 2W10 A; 1VYT A; 2M51 A; 4HCK A; 2K3B A; 4WCI A; 2A37 A; 4J9I A; 2EQI A; 4RTU A; 1M3B A; 2O2O A; 2JS2 A; 2CSI A; 2CSQ A; 2IIM A; 4LE9 A; 2EBP A; 2RQT A; 1AWJ A; 2GQI A; 2NUZ A; 2C0T A; 4LUD A; 2C0I A; 4M4Z A; 4F14 A; 2LQW A; 1BU1 A; 1M8M A; 2O9S A; 4Y92 A; 4J9D A; 2LJ3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2P0Q A; 3V7C A; 1GL5 A; 2YLC A; 4O6J A; 3S3M A; 4FU6 A; 2CZ6 B; 1YI2 A; 1YFN A; 3UDC A; 3QKJ A; 2CDT A; 1MGQ A; 3I55 Q; 2KRM A; 4PLI A; 2DTI A; 2LC4 A; 4C92 B; 1S1N A; 2YUO A; 4M75 C; 2LT4 A; 1RAA B; 1VQ7 T; 4L6V 5; 2X3X D; 2E6Z A; 2KXD A; 5FU6 C; 1Y07 A; 2ZGW A; 4M75 A; 2YT6 A; 5GAM h; 3EG2 A; 1Q86 R; 3T9N A; 3VS0 A; 1R0B G; 1ZBX A; 2KSS A; 4M78 C; 1WGS A; 3I56 T; 2M1H A; 3JB9 H; 1I81 A; 4V2S A; 1VQ5 T; 3FLG A; 1FWZ A; 3JV3 A; 1JXO A; 3G6E Q; 1YIT A; 3M9Q A; 3CCV A; 2L89 A; 3G1J A; 3I9Q A; 2DYI A; 2ATC B; 2RHX A; 4M78 A; 1N27 A; 2I0N A; 1GFD A; 1M2V B; 4IIM A; 1BKB A; 4PJO A; 4FSS A; 1RAC B; 2JVV A; 1C1A A; 3CD6 Q; 1E6H A; 1ZUU A; 2KI7 A; 3R6O A; 4A4G A; 4N4I A; 4IUQ A; 3N5B B; 3P8D A; 1UGQ B; 3CCR Q; 4M75 G; 1MMA A; 4HCB A; 2L5Q A; 4M77 F; 3IQL A; 3CCM A; 1AWO A; 3H8Z A; 3V8J A; 3SB2 A; 3OYE A; 3HPW A; 2OTL Q; 2FO0 A; 1G3Y A; 2M16 A; 1Y57 A; 4M78 G; 3CBM A; 2W0Z A; 3FDR A; 4BD3 A; 3LGF A; 2AIR B; 1PHT A; 1Z9Q A; 3TQ7 P; 3CC4 Q; 4JRP A; 1SRL A; 1VOM A; 1W4S A; 2RQU A; 1PRM C; 4BDZ A; 4OMF B; 3LW5 E; 2YRV A; 1QVF S; 4J6Y A; 1OU8 A; 4NL2 A; 1JRI A; 5LJ5 g; 1G3T A; 2NUP B; 4PJL A; 3MEA A; 3CBO A; 1UHC A; 3A8H B; 1D1A A; 2A08 A; 2OI3 A; 3QYG B; 4RTY A; 2DPP B; 4MZT A; 4FL6 A; 4PNO A; 2HMA A; 3MKD A; 2J05 A; 2GGR A; 5CIU A; 3OYA A; 1OX8 A; 2C06 A; 1Q81 U; 3MPU B; 3FJP A; 5C0M A; 4E7L A; 2JNG A; 5GAO m; 4Z88 A; 5GAN 3; 4C92 A; 4LNP A; 3GBQ A; 1QVG S; 1QCF A; 5LJ5 d; 1D09 B; 5GAM f; 1D3B A; 2ABL A; 1N6A A; 1PM3 A; 4RUG A; 2CP2 A; 4OB2 B; 3G71 Q; 3JB9 J; 4C5I A; 3PGG A; 3GF5 A; 1KSW A; 3TEE A; 1CSK A; 2CZ0 B; 2MF2 A; 4KGV B; 1VQO T; 2MAM A; 1IZ6 A; 2X51 A; 1K73 U; 2QA4 A; 2RHY A; 1FX7 A; 4PFP A; 4Y91 A; 5KYX A; 1VQK A; 4E7Z A; 3V8K A; 3CCU A; 5KYU B; 3GIB A; 4OMN A; 1JJ2 S; 2VV5 A; 3S6W A; 3SWN C; 1SHG A; 1M2V A; 1V1C A; 2RN8 A; 4M77 D; 1K73 C; 2K5F A; 4IUR A; 1YHQ A; 4C92 G; 1LVK A; 1K9M C; 1X2K A; 1I8F A; 3PIP A; 1QKX A; 2ROT A; 3SWN A; 1Q82 C; 3RKY A; 2K2M A; 3GPL A; 4HCZ A; 3PFS A; 2DER A; 3X28 B; 5GAN h; 4X34 A; 1BB9 A; 4HKE A; 5I11 A; 3KFV A; 2NUT A; 4LN2 A; 2WAC A; 1HD3 A; 2DXC A; 3I56 Q; 3JCM g; 4M7D F; 3RMS A; 1VQ4 A; 1QMC A; 4RTW A; 3L2W A; 2JS0 A; 3H41 A; 2O88 A; 2E1H A; 4OB3 B; 3L2V A; 1W70 A; 3DLM A; 1M90 C; 1WHL A; 3FIF A; 1U3O A; 5GAN 7; 2G3R A; 2Z0W A; 4FW1 A; 4DOW A; 1I4K 1; 2ECZ A; 4HA8 A; 3CD6 A; 2VGN A; 2K5I A; 1OQK A; 3I35 A; 2RF0 A; 3MHX A; 3JAM E; 3JCM d; 1T0H A; 4C0D C; 1NJI C; 1VQ9 T; 4E47 A; 5IHN A; 3NTK A; 3D7S B; 4KH1 B; 2HZY A; 4J7F A; 1AEY A; 2WSC E; 1WXB A; 1UGP B; 1QVG A; 3HRU A; 3EFS A; 4QQ6 A; 2BZX A; 3H0I A; 1GBR A; 2GCX A; 2QTX A; 3VJP A; 1K1Z A; 2E6N A; 3VS6 A; 5GAO r; 1QKW A; 1KFZ A; 2F5T X; 3VU3 C; 5FWC A; 3M0P A; 3CXC S; 1YJN A; 4HT8 A; 1OOT A; 3VS5 A; 2LVM A; 1AWX A; 1S72 T; 2ROL A; 1UGS B; 3OW2 A; 3EG9 B; 3JCM X; 2MMP A; 3KUF A; 2ZPG B; 2CT3 A; 1PD1 A; 3RKW A; 4EMG A; 2LT1 A; 1QVP A; 3CME T; 2MIO A; 4Z02 A; 3CQT A; 4IIO A; 1J3T A; 4AFU C; 1M30 A; 1UEB A; 2K2V A; 2VVK A; 3L2Z A; 1I5O B; 5KYU A; 4J9E A; 5HK3 A; 3L1A A; 1LPL A; 4CC4 B; 2D1X A; 1MMN A; 1RAE B; 3CCE T; 4XTW A; 3TSW A; 4C5G A; 2K3Y A; 5GAN f; 3CCS A; 4M7D D; 3FRN A; 2PUO B; 2H3E B; 2MPX C; 2YWW A; 1EZZ B; 2D0Q B; 1NG2 A; 4EIK A; 3JB9 G; 1D0Z A; 2RI3 A; 4E2F B; 1VQO Q; 4Q5W A; 4EDU A; 1YWP A; 5EG2 A; 1AHJ B; 3E19 A; 5I21 A; 2HQH A; 2HDA A; 2OTJ T; 2RMO A; 1ZSZ B; 1NLP C; 3PMT A; 3M0T A; 2RHU A; 4N0A A; 3OYF A; 3RIR A; 1KJW A; 4B9X A; 1VQ7 A; 1D1B A; 2V1R A; 1NE8 A; 1QLY A; 5M9O A; 4JS4 A; 3UA7 A; 1VQP A; 1I1J A; 4FYV B; 1JEG A; 5GAN 2; 5KYY B; 3PVL A; 2GBQ A; 3VS2 A; 3LWI A; 1VQ5 A; 1U06 A; 2RNA A; 1UGR B; 2EPD A; 1ZA1 B; 1G5V A; 2D8J A; 1WHM A; 4AT1 B; 7AT1 B; 4C8Q B; 4BDY A; 5A2Q E; 2YXY A; 4BAC A; 4D6W A; 2AZV A; 3HTR A; 4A4E A; 1HYO A; 1U1T A; 2F5K A; 2FHD A; 3JCM Q; 2R5M A; 3P8B B; 5CQX A; 4HCC A; 5I22 A; 1W2B A; 4A4K A; 3V7S A; 1KQS S; 1AWW A; 2GNC A; 3LH5 A; 3HFN A; 4OF1 A; 2RD1 A; 2KT1 A; 2RHZ A; 1ABO A; 3MEU A; 1ZA2 B; 2AKL A; 2VYT A; 5FWB A; 3OYY A; 1HK9 A; 4NOY A; 1F1B B; 5IXF A; 5FU7 B; 4HVV A; 5GAO l; 2CZ1 B; 4PL6 A; 3QJY A; 2QQS A; 4CRI A; 1VYT A; 2X9H A; 2PVG B; 4IUP A; 4RTU A; 1M3B A; 1K73 R; 2CP5 A; 2EBP A; 2XKO C; 4JLI A; 1PSE A; 2NYS A; 3CMA A; 3I55 T; 4LUD A; 2C0I A; 4RCB A; 1VQM T; 1MMG A; 4B6M A; 1PD0 A; 2Y4X A; 3M57 A; 2MOX A; 4RCC A; 2EQJ A; 3TRE A; 2JXB A; 1ZSZ A; 1GFC A; 3OYC A; 1IHV A; 4XAX B; 2L3R A; 3CCE Q; 1YWO A; 1M90 R; 3QBY A; 2KYM A; 4QT7 A; 2LQN A; 2DMO A; 3G4S A; 4FM4 B; 1BIB A; 2VAS A; 2QQ9 A; 5KYY A; 4KBM B; 1KC8 C; 3J80 E; 1UJY A; 3L2R A; 1GBQ A; 4RMO A; 2JMC A; 1N5Z A; 3QWX X; 2JJ9 A; 1X75 C; 2OTJ Q; 1SSF A; 2HCK A; 2DL8 A; 4A53 A; 1P92 A; 2AT1 B; 4J7I A; 2IVW A; 2E41 A; 4GLM A; 2XIC A; 1XOV A; 2CT4 A; 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