The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
GSSGSSGLNDLKESSNNRKARVLYDYDAANSTELSLLADEVITVFSVVGMDSDWLMGERGNQKGKVPITYLELLNSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
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| molecule keywords |
SH3 domain GRB2-like protein B1
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of Endophilin B1 (Sh3g1b1)
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
9
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature |
ec
2.3.1.-: |
| pdb deposition date | 2005-05-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EYY A; 3M0T A; 2BZY A; 5IHN A; 4WCI A; 4RTW A; 2MCN A; 3VRY A; 2KE9 A; 3NMZ C; 2QDL A; 1HSQ A; 2KRS A; 1X6G A; 3SHW A; 1X43 A; 2JMA A; 3EG2 A; 1ZUU A; 1NG2 A; 1PKS A; 1G83 A; 2DVJ A; 1WXU A; 2DBK A; 2CUB A; 2EPD A; 4J9C A; 5FWC A; 2YUQ A; 2FG0 A; 3VRZ A; 1HJD A; 2LQN A; 4IIO A; 2F2V A; 2YUO A; 4KRT A; 4HVU A; 1UUE A; 4AFU C; 2JM8 A; 1ARK A; 2W0Z A; 3C0C A; 2XMF A; 2FO0 A; 2K6D A; 2KEA A; 2CSI A; 4OML A; 3ULR B; 4J9E A; 5IXB A; 4HCK A; 1AZG B; 1H3H A; 2ROT A; 1QCF A; 4J9D A; 4AG1 C; 1RI9 A; 1UJ0 A; 1W1F A; 2LNH B; 4RTZ A; 1BU1 A; 1MV0 B; 2RQU A; 2DL8 A; 2EYX A; 1X2Q A; 2GNC A; 5EC7 A; 5FWB A; 2M0Y A; 2FRY A; 2CH4 W; 1SPK A; 1CSK A; 1BK2 A; 4JPB W; 2KBT A; 3KFV A; 1AWX A; 4LUE A; 1N5Z A; 4M4Z A; 2KT1 A; 1TG0 A; 4CC4 B; 1K0X A; 2JS0 A; 3VS2 A; 2GTJ A; 1TUD A; 2L2P A; 3REA B; 5IH2 A; 1QLY A; 1U3O A; 1JEG A; 3UA7 A; 2VWF A; 4J9B A; 2KRN A; 3NGP A; 4K11 A; 5ECA A; 3H0F A; 2D0N A; 2HCK A; 2RQV A; 1RUW A; 1ZUK A; 2JXB A; 4OMP A; 2D8J A; 1NEB A; 1ZLM A; 4ORZ A; 2K3B A; 1ZSG A; 2D1X A; 2CUD A; 2O88 A; 2EQI A; 3H41 A; 1W6X A; 2V1Q A; 1ABO A; 2K9G A; 2OJ2 A; 2PZ1 A; 2RQW A; 3FJ5 A; 1G2B A; 1NYF A; 1AWO A; 2YT6 A; 1M8M A; 2LJ0 A; 2RQR A; 1AZE A; 3QWY A; 4RUG A; 3REB B; 1TUC A; 2RMO A; 3EHR A; 3GBQ A; 2BZX A; 1Z9Z A; 1E6G A; 4LUD A; 2DA9 A; 2KGT A; 2C0O A; 3ZL7 C; 1PRL C; 1SHF A; 2DF6 A; 2LMJ A; 3UAT A; 1Z9Q A; 1OOT A; 2DLP A; 3I35 A; 2EGC A; 2ESW A; 4AFZ C; 5IHI A; 5IXF A; 4Z88 A; 1UFF A; 4Z89 A; 2LZ6 B; 2YUN A; 2EVR A; 1SRL A; 1XOV A; 3VS3 A; 2DJQ A; 1NM7 A; 1GL5 A; 2YSQ A; 1CKA A; 3UA6 A; 2D8H A; 1WXB A; 4AFS C; 2EKH A; 4JZ3 A; 3U23 A; 1QKX A; 1E7O A; 2RQT A; 2A08 A; 2LX7 A; 1WFW A; 2FPF A; 1UG1 A; 1RLP C; 4CC7 A; 1QWF A; 1M3C A; 4JJC A; 1K4U S; 2DL5 A; 3I5S A; 2NUZ A; 2J6O A; 3UF4 A; 2EYZ A; 4LE9 A; 4Z8A A; 3VS7 A; 1AVZ C; 1OPK A; 1H8K A; 3JV3 A; 1YNZ A; 1B3Q A; 2GTO A; 2EGE A; 4ZNX A; 5FW9 A; 2J6F A; 2DBM A; 1NEG A; 1GBQ A; 2HDA A; 1UHC A; 3M0P A; 2EBP A; 2YDL A; 1X2K A; 1K9A A; 2CRE A; 2LJ3 A; 2LCS A; 2CT4 A; 1GRI A; 2DL7 A; 2DIL A; 2ABL A; 2ED0 A; 3LH5 A; 3M0U A; 2CDT A; 2JM9 A; 4JJD A; 1AWW A; 1PKT A; 4RTV A; 1VA7 A; 1YP5 A; 1K0S A; 2C0T A; 2OAW A; 4J9I A; 3RNJ A; 2KXC A; 4OMQ A; 1YWP A; 2DL4 A; 2FPE A; 2RF0 A; 3PVL A; 2DRM A; 2SRC A; 4RTX A; 2E5K A; 3EG0 A; 2KR3 A; 1UJY A; 2CSQ A; 1FYN A; 1PWT A; 4LNP A; 3A98 A; 2L3S A; 1SHG A; 4AFQ C; 3QWX X; 4JZ4 A; 1MUZ A; 1ABQ A; 1NLO C; 3M0S A; 4HVW A; 1YWO A; 4FSS A; 5GJV B; 2YUP A; 2L0A A; 1WX6 A; 4HXJ A; 2LP5 A; 2KYM A; 4J9F A; 1X27 A; 2J05 A; 2X3X D; 1BB9 A; 3NPF A; 2EYW A; 4GLM A; 1V1C A; 1WXT A; 2L3Q A; 2L3P A; 2LQW A; 3TVT A; 4OMM A; 2KXD A; 2AKL A; 1JXO A; 1VYU A; 2FEI A; 2G6F X; 3TSW A; 3TSZ A; 2JS2 A; 2ENM A; 1M27 C; 2A36 A; 4RTY A; 2GQI A; 1GBR A; 1GCQ A; 1YN8 A; 2EW3 A; 1JU5 C; 1UGV A; 2MOX A; 5I11 A; 2BZ8 A; 1H92 A; 2J7I A; 2HBW A; 1HD3 A; 2J06 A; 3O5Z A; 1JQQ A; 3EG1 A; 1MV3 A; 1KJW A; 2O9V A; 4OMN A; 4LN2 A; 1IO6 A; 2VVK A; 4GBQ A; 2IIM A; 1KIK A; 5L23 A; 1T3L A; 2CT3 A; 2GBQ A; 2KYB A; 3VS0 A; 1I1J A; 2H8H A; 1GCQ C; 1T0J A; 3EGU A; 2K2M A; 2PTK A; 3VS5 A; 2KNB B; 1GFD A; 4IIM A; 2DNU A; 4ESR A; 4R0K A; 3R6N A; 2I0N A; 1AD5 A; 1M3A A; 2O9S A; 2AK5 A; 2P4R A; 4X1V A; 1VYT A; 2EGA A; 1X69 A; 4E6R A; 2GGR A; 3VS1 A; 1OV3 A; 1M3B A; 2DM1 A; 2LJ1 A; 1LCK A; 1VYV A; 2DX1 A; 2A37 A; 3RBB B; 3H0H A; 2B86 A; 4DEY A; 5I22 A; 1UTI A; 4HVV A; 3IQL A; 1W70 A; 1OEB A; 1T3S A; 1PHT A; 2M51 A; 1RLQ C; 3EHQ A; 2AZV A; 2SEM A; 1E6H A; 1K76 A; 1EFN A; 4J9G A; 1S1N A; 4JJB A; 2DE0 X; 1NLP C; 2RNA A; 1QWE A; 2F2W A; 4AG2 C; 1ZUY A; 3VS4 A; 2RPN A; 1QKW A; 5IHK A; 4F14 A; 1UHF A; 3EG3 A; 1WI7 A; 4A63 B; 1UE9 A; 1AEY A; 4OMO A; 4EIK A; 2JTE A; 4F16 A; 2MIO A; 4D8K A; 1SSH A; 3SEM A; 3H0I A; 2HEQ A; 1J3T A; 1OPL A; 1YCS B; 2FRW A; 2DYB A; 2HSP A; 1WDX A; 1X6B A; 1PNJ A; 3PVQ A; 2F2X A; 4F17 A; 2ED1 A; 1WA7 A; 1U06 A; 2JW4 A; 1U5S A; 2J6K A; 4DEX A; 2DL3 A; 2FPD A; 2KRM A; 2AZS A; 1B07 A; 2W10 A; 1I0C A; 1BBZ A; 3NHN A; 1K1Z A; 2DRK A; 1UDL A; 2X3W D; 1GFC A; 2BTT A; 2RN8 A; 2AKK A; 1ZX6 A; 3I5R A; 4Y92 A; 2PNI A; 2K7A A; 3M0R A; 1M30 A; 2NWM A; 2ROL A; 4RTU A; 1PRM C; 4QT7 A; 2KT8 A; 3M0Q A; 1CKB A; 1SEM A; 3THK A; 1WLP B; 2DMO A; 2C0I A; 2VKN A; 2JT4 A; 1A0N B; 4J9H A; 1UEC A; 2ECZ A; 3VS6 A; 1AOJ A; 4RTT A; 2V1R A; 5GJW B; 2O2O A; 3PE0 A; 1NYG A; 1WYX A; 1JXM A; 2CH4 A; 5HCK A; 4CC2 A; 1GCP A; 4CC3 A; 1KFZ A; 1JO8 A; 4D8D A; 1AWJ A; 1T0H A; 2OI3 A; 1Y0M A; 2O31 A; 1I07 A; 1Y57 A; 1KSW A; 1FMK A; 2K79 A; 3I9Q A; 2A28 A; 2KRO A; 1WIE A; 1ZBJ A; 2JMC A; 1SRM A; 3CQT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1D3B A; 1ZQ1 A; 5IHN A; 3OYC A; 4RTW A; 4PJO A; 3MPU B; 1NE8 A; 4PK4 A; 2QDL A; 4IUQ A; 2P0Q A; 1VQ5 T; 1OU8 A; 2KRS A; 2JMA A; 2WSC E; 3CC4 T; 3M9Q A; 1PM3 A; 3GIB A; 1H64 1; 1YHQ A; 4J9C A; 3I56 T; 2DVE A; 2QQB A; 2ZAE A; 3LH0 A; 1HJD A; 1G3S A; 2F2V A; 2E64 A; 3G6E A; 2YUO A; 1OU9 A; 1KG1 A; 1N9S A; 3OYF A; 1FXX A; 3C94 A; 4BI4 A; 4XU1 A; 5LJ3 f; 4OML A; 3CMA A; 2LVM A; 3SWN C; 5IXB A; 4AMC A; 1AZG B; 1ZSZ A; 1IZ6 A; 1RI9 A; 1UJ0 A; 3CME Q; 3V8J A; 1TXQ A; 2DL8 A; 2EYX A; 2GNC A; 2R57 A; 1YIJ A; 3G4S Q; 2LNV A; 1TUG B; 3EG9 A; 5IN1 A; 1KD1 C; 2K4Y A; 3KFV A; 1N5Z A; 2JS0 A; 2KDS A; 3VS2 A; 1YJ9 A; 1HXD A; 1TUD A; 3UPU A; 2OTJ T; 1KC8 R; 2B8A A; 2KRN A; 4C92 C; 4DBF A; 2QAZ A; 3HHT B; 3HSB A; 5C6S A; 2JXB A; 4OMP A; 1B34 B; 1K73 U; 3S3M A; 2K3B A; 5LJ5 g; 1VQ4 A; 1XQH A; 2CUD A; 3QG1 A; 3S6W A; 2V1Q A; 2PZ1 A; 2RQW A; 4XAX B; 1PSE A; 5GAN 6; 1SG5 A; 3EFO A; 3J81 E; 3CC2 A; 1AWO A; 2YT6 A; 2WAC A; 3CCS A; 2YWW A; 5GMK i; 3MEU A; 1Z9Z A; 4LUD A; 3MCA B; 2C0O A; 3V7C A; 3LYI A; 2LMJ A; 5CAI A; 1Z9Q A; 3DLL A; 2A3L A; 1OOT A; 3I35 A; 5IHI A; 2K5L A; 4Z89 A; 3EGD A; 1XTD A; 4WF2 A; 2LZ6 B; 1WPY A; 2RI3 A; 1FWZ A; 2EAY A; 1GL5 A; 5GMK h; 1WHJ A; 1TU0 B; 3OMG A; 3OW2 S; 4JZ3 A; 3BE3 A; 1E7O A; 2EQK A; 1UG1 A; 2F5T X; 1YHQ T; 1MND A; 1X75 C; 2NUZ A; 4J8O A; 2JTF A; 4M75 A; 3UF4 A; 5LJ5 f; 4DOW A; 2NUP B; 2YLC A; 3LWH A; 3P8B B; 4Z8A A; 1PD0 A; 4DOV A; 1OPK A; 1R0B G; 4E2F B; 1NBE B; 2MWO A; 1R8O B; 4EMK B; 1M4Z A; 1NEG A; 2L3R A; 3QJ6 A; 3M0P A; 2EJF A; 4B6M A; 1X2K A; 2CRE A; 2LJ3 A; 5HK0 A; 3C12 A; 3SD4 A; 2ZPB B; 1TWB A; 1I5O B; 1QMC A; 1AWW A; 4DBH A; 4P5N A; 1YP5 A; 2C0T A; 4BDY A; 1D0X A; 4OMQ A; 1YWP A; 2KY9 A; 4PJL A; 1KQ2 A; 4M7D E; 3EG0 A; 4F7U F; 2FZG B; 2KR3 A; 3JCM e; 4DBQ A; 3OW2 P; 3CBP A; 5KYW B; 1SHG A; 5LJ3 h; 4AFQ C; 3OYJ A; 2DJZ A; 4JZ4 A; 1Y96 A; 1MUZ A; 5GAM g; 1M1K U; 2K3Y A; 3CCE T; 3CCL Q; 5GJV B; 4OGC A; 2YLB A; 3KXT A; 1YBY A; 4HXJ A; 1D0Z A; 2V8K A; 2LP5 A; 3RES A; 2J05 A; 2X3X D; 1VQP Q; 2L3P A; 1M90 U; 1QW1 A; 3CC4 Q; 3QII A; 3CEY A; 3M4Y A; 4OB3 B; 1YJW A; 3RIR A; 1FMV A; 5LL6 S; 2FEI A; 2LQK A; 3MO8 A; 2XG8 D; 2MMP A; 3V8K A; 4Y28 E; 3X24 B; 2EW3 A; 4HKE A; 2BZ8 A; 2DXT A; 2EWN A; 3OMC A; 1Q7Y U; 2HBW A; 2ZPI B; 2DXC A; 1N8R U; 1IHW A; 5HY6 A; 3CC7 T; 4XU2 A; 1ACM B; 2MWP A; 3GNF B; 3CCR Q; 2VVK A; 2LX9 A; 4RCC A; 2O4X B; 1QVG S; 2F1L A; 2CT3 A; 2AT1 B; 2GBQ A; 1KC8 C; 1K9M U; 3BDL A; 4FYX B; 1I1J A; 5GAO m; 3VS5 A; 5DLQ E; 4IIM A; 3CBO A; 3EFR A; 4PJN A; 1OUL A; 4IKF A; 1C6V X; 2YRC A; 2I0N A; 2O9S A; 1M3A A; 1VYT A; 2A7Y A; 2CZ0 B; 4C8Q F; 2GGR A; 4XTW A; 2DTH A; 1UGP B; 2DM1 A; 2K5F A; 3ZEH A; 4A4F A; 1U1T A; 3PNW C; 1MNE A; 2DK3 A; 3JAM E; 1T3S A; 3X28 B; 1PHT A; 1YIT Q; 4M78 E; 2VUB A; 1VQ9 T; 1WHH A; 3EHQ A; 2ZCF B; 1UGQ B; 4XK8 E; 5GAO l; 3L2V A; 3V8L A; 1NLP C; 3L2W A; 2ZPE B; 4EMK C; 4AG2 C; 2XDP A; 3A8H B; 1UHF A; 3JCM V; 4A63 B; 1QVG P; 3QJY A; 1JBM A; 4LDW A; 4OMO A; 4M7A G; 1BI3 A; 1EX4 A; 2P0P A; 3CCJ Q; 2QQ9 A; 4F16 A; 4E47 A; 1JB0 E; 4D8K A; 1OI1 A; 4PJO G; 4IUR A; 3SEM A; 4N4I A; 1VQK Q; 2HEQ A; 4A4G A; 1ZSZ B; 5IAY A; 3CCQ T; 5LJ3 e; 3PVQ A; 2FB7 A; 2DXB A; 2RA2 A; 3EG9 B; 2FHD A; 2DL3 A; 2KRM A; 1B07 A; 3A8O B; 1BBZ A; 4M7D B; 4QVZ A; 2RN8 A; 4J6W A; 2AKK A; 3ASK A; 3HFN A; 2K7A A; 1ZBX A; 4M7D D; 2E41 A; 4N4H A; 2VGM A; 4QT7 A; 2KT8 A; 2LTO A; 2CP5 A; 2E6Z A; 4BB7 A; 2RI2 A; 3CPW S; 4E7H A; 1SEM A; 4LDV A; 4QQD A; 4PFP A; 4PKC C; 3CXC A; 5I2M A; 2DMO A; 4R56 A; 3EH2 A; 2VKN A; 1F1B B; 1X01 A; 3HL8 A; 3OBW A; 3CME T; 3M57 A; 4QQG A; 4QKU A; 4RTT A; 2V1R A; 3G4S T; 2O2O A; 1YJN Q; 4L59 A; 3EFO B; 1JXM A; 1UEB A; 2IPO B; 3CBM A; 2FL7 A; 4CC2 A; 2RK1 A; 1ZHI A; 1KFZ A; 1JO8 A; 4J7I A; 1M8V A; 4ZGE B; 1X6O A; 3NTK A; 5GAN d; 2QA4 T; 1JJ2 A; 1ZBJ A; 3MEA A; 2YHT A; 1UGR B; 5CCA A; 3EGD B; 4WCI A; 3CCL A; 3VRY A; 2KE9 A; 4M7A F; 4MDX A; 3E9G A; 2ZZD A; 3CCE Q; 2LCC A; 4PJO F; 1HSQ A; 1X6G A; 3SHW A; 1WJS A; 1NG2 A; 3J80 E; 1VQ5 A; 2DVJ A; 1WXU A; 3I55 Q; 2EPD A; 1K73 R; 2BE7 D; 3CC4 A; 3OYM A; 3MEW A; 3TCJ A; 4FW1 A; 5GAM h; 4M75 B; 4F04 B; 1Q81 R; 2LQN A; 3I56 A; 4IIO A; 2MK5 A; 4E7I A; 3OYK A; 3OS0 A; 2COW A; 4M7A C; 1UUE A; 3RKW A; 2V8J A; 4TVR A; 4PJO C; 2JZ2 A; 4LD6 A; 4M75 D; 1ARK A; 2W0Z A; 3RKX A; 4FT2 A; 5LJ5 e; 4BDZ A; 5IT9 E; 4LD9 K; 3H9N A; 1QCF A; 4J9D A; 1W1F A; 2LNH B; 5HKC A; 5A0L A; 3QHS A; 4X9D A; 1MV0 B; 5KYY B; 1VQ8 Q; 1N6A A; 2DKG A; 1BCM A; 3CC7 Q; 2FRY A; 1SPK A; 3UT1 A; 2VGN A; 3LLR A; 4F7U E; 3CCU Q; 4M78 D; 3H6Z A; 4M75 G; 3L2U A; 3WXM B; 1EZZ B; 1TG0 A; 2E70 A; 2HD0 A; 4CC4 B; 3F70 A; 3OYG A; 2L2P A; 2A0F B; 1O75 A; 3JB9 F; 3UA7 A; 5KE2 A; 2OTJ A; 4E7L A; 2PVG B; 1NEB A; 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