1XBAA

Crystal structure of apo syk tyrosine kinase domain
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
274
structure length
266
Chain Sequence
VYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMVVKTVAVKILPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVNE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
publication title A novel mode of Gleevec binding is revealed by the structure of spleen tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 266
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2004-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1xbaA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1xbaA01
4A4LA 3CBLA 1V1KA 4GJ2A 2QO9A 2X1NA 3GU5A 5AADA 4R3RA 1FBNA 1YI3A 2GFSA 2DQ7X 3QU0A 5BUJA 4UZHA 4YTIA 4Z55A 4QTCA 2Y4IC 1Y8YA 2C1AA 3DXNA 4HOKA 2WFYA 3EN6A 1FQ1B 4Q9SA 2WQNA 2JFMA 3CJFA 2VWZA 4EZ3A 3L8SA 4PTCA 4O0WA 2RFDA 4ZY4A 5BVWA 3AMAA 3GCPA 5DR6A 4HYHA 2X81A 3PG3A 4IXPA 4EQMA 3HUBA 4AQCA 3CQWA 4U6RA 3WOWA 4BICA 4GVJA 4CLJA 2VV9A 3H3CA 4CG8A 2O8YA 3EL8A 3TG1A 2PE2A 4LGDA 3KKVA 3RGFA 4R8QA 4AGDA 4I41A 4QMMA 1Q8YA 2UZLA 3NUYA 4HZRA 4RZWA 3QTUA 2YDKA 4JBPA 4N70A 3R01A 5K9IA 5E1SA 5TT7A 5FTGA 1FOTA 5HNBA 4H1MA 4I92A 3MB7A 4XG8A 4YGAA 5J9YA 2B9FA 3R00A 2WTCA 4EORA 4WG3A 3TNHA 4D2RA 3VS0A 4O82A 3VJOA 4J99A 3GQLA 4DFLA 4G9RA 4NL0A 4E4LA 3MY5A 4E5AX 3OXIA 4EH9A 3UNZA 4OW8A 4BBFA 4IM0A 3WF8A 4ACHA 3S00A 3ENHA 1ZYSA 3MPMA 1Q8ZA 4ASEA 3D5WA 4W4XA 2X6EA 2XCHA 4GKIA 3KVXA 1Y6BA 2QVSE 4X3FB 1RJBA 2HYYA 2PVLA 3FLWA 4G9CA 4W8EA 5A4TA 4E26A 3RK9A 1DM2A 2BTRA 4IJPA 2Y4PA 4FSYA 4JIKA 3E8EA 3CP9A 4FTMA 1ZOGA 2BR1A 4FUYA 2EXCX 1M2RA 3VUTA 4II5A 1Q41A 3RINA 2BAQA 4TWNA 4L46A 4S34A 2YDJA 5L2QA 2XCKA 3C4XA 3LXLA 3QZGA 1H1SA 4CFFA 4EK3A 4YJOA 3NVKI 3DV3A 1JPAA 3ORIA 3ORZA 4I5HA 3PXZA 2UW0A 4TW9A 5CSVA 5IQCA 4FNWA 4ZSEA 1GAGA 3FMHA 4X3FC 4LI5A 3HV6A 4ZTSA 3VBVA 4DFBA 3D5XA 4FGBA 3RVGA 4BHZA 2E9VA 1YDSE 5BUIA 4KIOA 3UZRA 3E8CA 2Z7QA 3D2IA 3WIKA 2R9SA 3LOKA 5CQUA 4D1ZA 4RQKA 4Z16A 4K77A 3TN8A 4D4SA 5CASA 4D2SA 5AR2A 4OBOA 4DCAA 1OUYA 5EW9A 3SDJA 3RMFA 4GSBA 3ZC6A 2ONLC 4HVDA 3PSBA 5IUHA 3BZ3A 3HNGA 3SA0A 1SMHA 2OF4A 4OTPA 4PTEA 4QQCA 1JVPP 1TQIA 3S4QA 5C8KA 4MBJA 3PXRA 1YQJA 1U5QA 2XRUA 3BHVA 3F3UA 1FPUA 3CCNA 2Z7RA 2A19B 3NDMA 2VO3A 5AR3A 4CFXA 3ZM9A 5DLSA 4RIYA 3Q5ZA 2RF9A 1Z57A 3KXHA 3NW6A 4BDJA 1OKVA 2RFEA 2WTVA 1H0VA 5K0XA 5AWMA 3FPQA 4DA5A 3ZO4A 2YM3A 2Y0AA 2DWBA 4DHFA 3H4JA 4PWNA 4ERKA 4NUSA 3TIYA 4MD7E 2W1EA 3PXFA 3FJQE 4J52A 5HU9A 2YCSA 5J95A 3ZDIA 2XBJA 3F3VA 4ZY6A 2B1PA 3T9IA 2WTIA 4ZK5A 3VN9A 4BCFA 4DFXE 3HX4A 5HO6A 4FKQA 1Y91A 3O51A 3FZPA 3DZQA 4AP7A 3C1XA 4OTFA 4YLLA 4CFMA 5KKRC 4QP1A 5LCJA 1WBOA 4XG7A 5KMOA 3QYZA 4FIJA 5LMKC 2YACA 3PTGA 2HWPA 4L68A 1K3AA 5HHWA 4CFVA 4R7BA 4MTAA 3PYYA 4MBLA 2ERZE 4BCNA 4GFGA 2C1BA 5JGAA 1MQ4A 4HVGA 2J90A 3NWWA 4PRJA 3IOKA 1P2AA 1MUOA 4QMLA 4FTUA 5IEXA 3FMLA 4QQ5A 4X7QA 2W1FA 4JQEA 3GOKA 5HE1A 3U9CA 4GVAA 2BZIB 2J9MA 1WVYA 3CC6A 5ETFA 3VUMA 3NYVA 4DINA 4N0SA 3PJCA 4GW8A 4XJ0A 3C0IA 1L3RE 4NWMA 4TWOA 3ZFMA 3NLBA 5J5SA 4H36A 4BTFA 4D1SA 1OIQA 3UMXA 3ORTA 2IW9A 3MFSA 3QTQA 4IZ7A 3VBTA 2GNJA 1JKSA 2QHNA 3LFSA 3KMWA 5FBNC 3NCZA 1OBGA 1JKLA 3C50A 3OY3A 2VTNA 3NCGA 4ITIA 2WAJA 4QPMA 4YJUA 1T46A 2B55A 2C4GA 2BDJA 3KXZA 2BKZA 4RFZA 5FRIA 1GZNA 3LE6A 4FTTA 3EFJA 3ORNA 5HG8A 4CTCA 3ORMA 4BZNA 3DKFA 2X8DA 4KBKA 2XKEA 2GS2A 2W5BA 2WMBA 2ZDUA 5LCKA 2JDVA 3P7BA 2B53A 2EU9A 4J71A 3WI6A 2ITQA 4D2VA 1DS5A 2LGCA 4RFYA 3UG1A 3LCDA 3R7IA 3QGWA 5HVKA 3LHJA 5KHXA 4ZSLA 4AW1A 4ACDA 4AA4A 3FMDA 3RWQA 2ZVAA 4IX5A 1GJOA 3RCJA 2PTKA 5CSPA 4W4WA 1W83A 3SVVA 3PIYA 3PE2A 3KCFA 5AR5A 5M09A 1IAJA 4J95A 4C4EA 2WIHA 2X39A 4U8ZA 4AZFA 4YHFA 4DLJA 4RIOA 5K0KA 4ASXA 2C68A 4FL1A 4F9YA 3DTWA 3KL8A 3EMGA 3QZHA 3OC1A 5K4JA 2X8IA 4U79A 2GS7A 2FO0A 2PVNA 3PZHA 4DGMA 1PF8A 2HENA 3EQHA 5BUEA 5T68A 3AD4A 3LM5A 4CXAA 1QPCA 4J8MA 2R7BA 1RW8A 2C47A 4DH3A 4CMUA 1FMKA 2OJJA 2WQMA 2VWVA 5DVRA 4FKWA 4GYIA 4BDGA 4EC8A 3ZDUA 3QWKA 4BCHA 3GFWA 4DEIA 5C26A 4C37A 4AACA 3TKUA 3GC0A 4WKQA 1MP8A 3PSDA 4ANOA 4EHEA 1CDKA 4OTRA 1E9HA 2HELA 2XBAA 4RRVA 3COMA 3IQ7A 3NNVA 3PRIA 3QUEA 5KE0A 2NP8A 4W9WA 3TNWA 3CLYA 3QUDA 3ZONA 2CKPA 1H24A 3QCYA 2OO8X 3E3BX 4UXLA 4V05A 4EH7A 5GJFA 2G01A 4F6SA 3GU8A 4DG2E 2G1TA 2AYPA 2C5VA 4QP7A 1PXLA 5AX9A 4L8MA 2JIUA 5CAOA 3ODZX 2ITZA 4IB5A 3HRFA 1PXPA 3G6GA 4G5JA 3C7QA 3A7FA 1Q4LA 2J0MB 3ORXA 4TNBA 3SOAA 1GIHA 4RGJA 3R8UA 2JBPA 4HW7A 5H8BA 4IDVA 3S0OA 3R9OA 5KUPA 1IA9A 4QP9A 4QMQA 3IW8A 3AMYA 5GZ9A 1NVQA 4ACCA 3QQLA 4BIEA 4O7ZA 3EQGA 4FV2A 4ALUA 4L3LA 3FL5A 4FSUA 1OPLA 4U41A 3FV8A 2XNGA 3KRXA 3BE9A 3MH2A 4WOVA 5CAUA 3P78A 3LMHA 2YIQA 3O17A 5I9VA 3GOPA 2XM9A 2BZKB 1U54B 4RX9A 5AM7A 3QBNA 4BYJA 4NK9A 1BUHA 4RWLA 4BIBA 4O7WA 3FQEA 5E9EA 3R8LA 1OMWA 3ZEWA 3NW5A 2C0IA 5IUIA 5KCVA 4M8TA 5HX8A 1ZRZA 2BDFA 3LIJA 5HBEA 3V5TA 3ZTXA 3I7BA 3SAYA 1V0OA 2HW7A 2V7OA 3BE2A 4RVKA 5IH5A 2C3LA 5CY3A 5GZAA 1RDQE 1U4DA 4PL3A 2C69A 2HZIA 3DBEA 2PULA 4MWHA 4LL5A 4OTQA 4YZMA 3A7IA 2WU7A 4ZTRA 1ZZ2A 2F7XE 3E87A 5AP4A 4O7LA 3ZFYA 3ZO3A 5DRDA 4KUJA 5CEMA 4J98A 1H1QA 4J53A 4A9RA 3EZRA 3R7GA 4HVSA 3O8UA 1PKDA 4WSQA 1M7QA 3DPKA 4FKUA 3R1NA 3W1FA 4L00A 4O0SA 4KIKB 1UV5A 3OOGA 5DIAA 4WRSA 2JIVA 4CFNA 3UP7A 4Y85A 2GDOA 3HKOA 2QONA 4IACA 2V7AA 3RKBA 4O7RA 3I5ZA 4TY1A 4K9YA 3MV5A 4YJTA 4N6ZA 4EOMA 4PF4A 4EHGA 3BIZA 4K8AA 3NGAA 4FSRA 2YJRA 2ZV8A 4GIHA 3V3VA 4JDKA 1PYXA 3C4WA 5HE0A 5AV4A 2Y6MA 4RG0A 4FX3A 3P4KA 3L9NA 2HIWA 3PA5A 1MRYA 4RJ4A 3TTIA 2W9ZB 3D94A 2OI4X 4RFMA 4XRLA 5IZFA 4GJ3A 5AUWA 2FSLX 1XHAA 3F82A 2ZAZA 4DT9A 2QNJA 4FG8A 3VW8A 4XG3A 1Q3DA 1KSWA 3R7EA 5LXMA 2WIPA 1G3NA 3FWQA 3IS5A 3PP1A 4DAWA 2CCIA 4FVRA 2PL0A 1YXXA 3BELA 2X8EA 4FF8A 4J1RA 2WMWA 3IKAA 1LPUA 1R78A 4IAYA 4AA0A 5IMXA 3CS9A 3IDBA 4WA9A 2PVRA 2YITA 4IB0A 1IG1A 2UW6A 2P2HA 4QTBA 5EI6A 4FC0A 4GV1A 4O0YA 2OH4A 4HPTE 2F49A 3O7LD 4TNDA 4L43A 4D2WA 3CY3A 2F7ZE 2XNPA 3S1HA 3UOJA 5AV3A 1LEZA 2CHLA 3OW3A 4IWQA 1M52A 2XK8A 3RPRA 1XBAA 2YWPA 5AA9A 5E8SA 4CD0A 4UALA 4UYAA 2FSTX 2QO7A 4XV9A 3F2AA 5DN3A 3FXWA 4XUFA 4L67A 4I0TA 3TNIA 4F6WA 3HP5A 5KMJA 5LJJA 1H26A 3MVMA 4K2RA 2PUNA 3AD5A 3C4FA 4UYNA 4ANMA 5CEIA 4C4JA 5LWNA 5TE0A 4F1TA 4X2NA 4I21A 5J87A 3EYGA 4BR3A 3LCKA 4GFMA 4ZXTA 2CGXA 2UZWE 4FTLA 4IVDA 2YZLA 2C3KA 4I24A 4RWKA 5E91A 3R8VA 3VUIA 3ZCLA 3MIYA 4I6FA 1H00A 3RAHA 3HV7A 4O81A 1URWA 3POOA 5ANOA 2I0EA 4UB7A 2XKDA 1WBTA 1WVXA 3CTJA 3G6HA 3KC3A 3FC2A 3FQSA 2QOOA 5HCXA 3UG2A 4FV3A 3MGYA 4FODA 4AW5A 4F4PA 1R1WA 3AC1A 3L9MA 3IDPA 2W1DA 2ZYBA 4CTBA 5J1VA 4X3JA 5HIEA 4TN6A 2YLFA 3TV4A 2OBJA 4E73A 5CSHA 3U4WA 5EYMA 3G5DA 4RA4A 2R3KA 5JFWA 4F7NA 1J1CA 3GNIB 3C4CA 4X6RA 4O7YA 4PPAA 4LMNA 5D41A 4BTMA 3EH9A 2R0UA 2UZNA 3N4VA 4WNPA 1U46A 3FLNC 3HDNA 3TNQB 4I5MA 4C3FA 3KVWA 3CEKA 3PJ8A 3QC4A 1YOLA 2W1IA 5EYKA 1MQBA 1SVGA 2VRXA 3BQCA 5CQWA 3ROCA 3FUPA 1H08A 4EK5A 3G15A 2BAJA 1PMEA 4PY1A 5E90A 2PU8A 3H9RA 3OBGA 1LP4A 5IG1A 5LVOA 1Q99A 2W7XA 3V8WA 2X0GA 2P0CA 4EH3A 2FA2A 4JBOA 3V8TA 4FTIA 5M51A 3QHWA 3L8VA 2WQBA 4AXAA 1QPDA 4KNBA 2V62A 4E7WA 5K5XA 3QTIA 4JLCA 4USDA 3ZXZA 5CAVA 5M44A 1J7IA 3RZBA 4Y83A 3RCDA 3H30A 5I9WA 4WUAA 3O2MA 5L2WA 4E4XA 2XA4A 1OL5A 4RWJA 3Q04A 3KGAA 2HZ4A 4B4LA 2B52A 3KRRA 3CY2A 2ZB1A 4ZMFA 3TI1A 4YTFA 3AC5A 2WELA 5EM8A 4JXFA 3HGKA 4DEDA 3VVHA 5G6VA 2OZAB 3DQWA 3LFFA 5BNJA 5CU6A 4DH7A 3K2LA 3RBWA 4AWIA 3AC4A 1YDRE 1PHKA 3QALE 2RG6A 5E8XA 5KO1A 3TIZA 4WIHA 3RK5A 5M53A 2VTSA 4QD6A 1KE9A 4MXCA 3P23A 2X7GA 4ACGA 4ORKA 4NM5A 3P7CA 4W8DA 2BRHA 3IW6A 5CVGA 5HVYA 5IPJA 4A7CA 2WMTA 3MH1A 3V5WA 5CNOA 3QUPA 3VS5A 4I4EA 4C02A 3FC1X 2VWWA 5AV2A 4EOLA 1AD5A 1ZWSA 3QZIA 4F08A 3LMGA 4FL3A 5AUYA 1BL6A 2XMYA 5CEQA 2UUEA 3CPCA 3O8PA 2PMOX 4PMSA 4EYMA 4NJDA 3UPZA 4GU6A 1P4OA 1OBDA 2WGJA 3UQGA 4A07A 4EUUA 3I6WA 1SYKA 3BWJA 3T9TA 4XS2A 3VS7A 2QU6A 1WFCA 2C6TA 5HO7A 4MD8E 2XIXA 4NYEA 4YJRA 3RPVA 1PRYA 2IJMA 4GYGA 4YTHA 3QD3A 1VEBA 4FV1A 3R8ZA 5IQBA 3PPKA 4RWIA 1CKIA 4R1YA 3TL8A 4TPTA 4R3CA 1P5EA 3EIDA 3RPYA 2VZ6A 4Y46A 2B9IA 5DHJA 3QHRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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