1XC3A

Structure of a putative fructokinase from bacillus subtilis
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
AMLGGIEAGGTKFVCAVGREDGTIIDRIEFPTKMPDETIEKVIQYFSQFSLQAIGIGSFGPVDNDKTSQTYGTITATPKAGWRHYPFLQTVKNEMKIPVGFSTDVNAAALGEFLFGEAKGLDSCLYITIGTGIGAGAIVEGRLLQGLSHPEMGHIYIRRHPDDVYQGKCPYHGDCFEGLASGPAIEARWGKKAADLSDIAQVWELEGYYIAQALAQYILILAPKKIILGGGVMQQKQVFSYIYQYVPKIMNSYLDFSELSDDISDYIVPPRLGSNAGIIGTLVLAHQALQAEAAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Putative fructokinase
publication title Structural studies of ROK fructokinase YdhR from Bacillus subtilis: insights into substrate binding and fructose specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 90
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.4: Fructokinase.
pdb deposition date 2004-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1xc3A01
5BPLA 1JCFA 1D4XA 4QS9A 2YHXA 4H5VA 3CJCA 2FSKA 3F9MA 1C0FA 4MLHA 3WXLA 3ENHA 3VGLA 4YDUA 4H5TA 3CJAA 3H45C 2IVPA 1HPMA 4BC3A 1NGFA 2ASPA 1Z6RA 3O5BA 3ZX2A 2W40A 3ZX0A 4Z94A 2W41A 3QDKA 2YHWA 4BRDA 1X3MA 3QFUA 4FPAA 4CZFA 4H5NA 1BG3A 5JLHA 2PAVA 1NGJA 5AQLA 4IJNA 3UB5A 5F0XA 5ELZA 4QS7A 4IWVA 2Q36A 4BGBA 4BRAA 4EHUA 3MMVA 4FWQA 2P9KA 2P9KB 2YHYA 4BVOA 3TPQA 3UE5A 1T6CA 4F9OA 4CZJA 3A5MC 1LOTB 5AQFA 2P9UA 2P9UB 5BN9A 4CD1A 3CHWA 3QFPA 4BR5A 5ADXH 1HLUA 3WQTA 2CGJA 3GOIA 4ISFA 3A5NC 5FPDA 5F2RA 4H03B 4CJ7A 1V4TA 4CZKA 1GLLO 4BRFA 1ATRA 3BF3A 4CI6A 3SK3A 1NGBA 5EX5A 4AM7A 1KAYA 1Q18A 1QQMA 1JCEA 1T44A 1SAZA 2CH6A 3CJBA 3MN7A 1J6ZA 1WUAA 3FZMA 3LL3A 4FWSA 1XC3A 3R8EA 2ZGYA 1SZ2A 3DAWA 4IO8A 4B9QA 2DPNA 5BREA 1DGKN 3I8BA 2A40A 3O6WA 4YDUC 1DKGD 3H1QA 3FZLA 5EOYA 4FWNA 1C0GA 1ESVA 5BN8A 5AQMA 4FO0A 3HI0A 3MCPA 3UKUA 3UKUB 1BA0A 4B1UB 4DB3A 5BPMA 4A62A 4K42A 4O5FA 3HZ6A 1P8ZA 5EY4A 4BRPA 2GELA 2P9NA 4M63C 2P9NB 5AQPA 5AQWA 4BRLA 3A0IX 2V7ZA 1HUXA 4CZEA 1R59O 2YI1A 2FXUA 5F1XA 3QICA 2BUPA 3MDQA 5AQYA 3ZEUB 3LDPA 3D7EO 3VGKA 1CZAN 4E1JA 5AFUA 3O8MA 4H0TB 5TKYA 4BR9A 5LY3A 1NLVA 3A5OC 1QHAA 5AZIA 3U4LA 1NGIA 1X3NA 4H5WA 4B1VA 4JAXA 1G99A 3IDHA 5E26A 2FSNA 1NGHA 3L6QA 5KQDA 4CZIA 2QWNA 3M6GA 1U6ZA 4NB4A 4RCHA 1QZ6A 2ITMA 5KQ8A 2D0OA 5EXWA 2J4RA 3KVGA 2ZWHA 1ZC6A 1QQNA 3I33A 5LJVA 2D4WA 4MO5A 4WYBA 4BGAA 3C0BA 4IZ9A 4K25A 3MN6A 3RSEA 3RSEB 4IXCA 2CH5A 2Q0UA 4M7YA 1E4GT 1HX1A 4FOIA 4B1YB 3QBWA 3MN5A 2V52B 5AQIA 4JHDA 4JHDB 4DCHA 3WQUA 2KHOA 5AQOA 2A3ZA 3ATVA 3WXKA 2ASMA 4PL7A 4CZHA 5FPMA 2HF3A 3AAPA 4BR2A 2D0PA 2IIRA 4CZLA 4FOEA 2A41A 3H3NO 3SMPA 1GLEG 5ADXA 4FL9A 3FZHA 4XH1A 1YXQA 4BREA 3LM9A 4BG9A 3KZBA 1MA9B 5JLFA 1QQOA 3MN9A 3VGMA 1NGDA 3AARA 1GLFO 3TU5A 4I6MA 1RGIA 4I6MB 5B8HA 4HWIA 3H1VX 5JICA 3WXIA 4H0PA 1NGCA 2ASOA 4WQ4A 1ZBSA 2E2PA 3ULEB 3ULEA 2F9WA 3W3DA 4J8FA 1GLBG 1BU6O 4PKHA 4PKIA 1OKJA 2A5XA 2BTFA 3ZETA 3ZETB 4BR7A 1GLJO 2VYPA 4FWKA 3VF4A 1HJOA 3FZKA 3CQXA 4JN4A 3R6MA 2V51B 4CBXA 4FWPA 5EVZA 5BRHA 1NMDA 1GLAG 1E4FT 5AQKA 3UKRA 3UKRB 5KPZA 5CE3A 1BOTO 4EHTA 2GUPA 4BRGA 4CD3A 5BRDA 4FWMA 1NGGA 4AM6A 3GBTA 4H5RA 1NM1A 4PKGA 2QXLA 2E2NA 3SLCA 2Q97A 4CZGA 2CGKA 5AQJA 2H3GX 2EWSA 3AY9A 4CBWA 3ENOA 1HKCA 2V7YA 3DXMA 3DXMB 3ZX3A 2OANA 4ISGA 3EZWA 3A8YA 4DQ8A 4HTLA 4M7XA 4H0VB 1NGEA 4BC2A 2PBDA 4XH4A 2QWMA 3WUHA 3SJHA 2I7PA 3BP8A 1ZXOA 4CBUA 3R9PA 2QWPA 4DHYA 1BO5O 5AQZA 2A6AA 5AZIB 1YUWA 2E2QA 5FPNA 2CGLA 4CZMA 2P9IA 4WQ4C 2P9IB 3SMSA 2NZTA 1WOQA 5AQSA 2HF4A 3DXKA 1TUUA 1Y64A 3ATUA 3DXKB 3MK6A 4FSVA 3CERA 4XH5A 3U8XA 3VETA 2FF6A 3JXUA 4A2BA 4PL8A 5AQTA 2E8AA 3WXJA 4BQLA 2QWOA 2E20A 3VEXA 3M1FA 5AQUA 3IUCA 3VEYA 2ZGZA 1V4SA 1LCUA 3D2EA 3D2EB 3LDQA 4MLEA 2QWQA 5AQNA 5AQQA 1S22A 3CJ7A 5E84A 5AQRA 5AQVA 2QW9A 2HMPA 3AAQA 2P9LA 4LC9B 2P9LB 1XUPO 3VERA 3EN9A 2P9SA 2P9SB 1BWFO 3GL1A 2Q1NA 5I9EB 2E1ZA 1XQSC 1Z05A 1NBWA 4FWRA 2QWRA 2VCPA 2VWBA 2GWKA 2YJFA 3FR0A 1RFQA 4A2AA 3S41A 1RDWX 3J8AA 1ATNA 4JD2A 3VESA 4JD2B 3BUZB 4QS8A 3M3ZA 4BRIA 4A61A 4BC5A 1YVNA 3BEXA 4IJAA 3VEWA 2Q2RA 4NO7A 2IVNA 2E2OA 2FSJA 4BG8A 1X9JA 1MDUB 4B1ZA 3U9ZA 4BRHA 4RWTA 3EO3A 5BPNA 2QM1A 4BRKA 3A5LC 3LDNA 3O1BA 2GEMA 3FGUA 3JS6A 1NWKA 4Y0WA 1HKGA 1KXPA 1QZ5A 2FLOA 3WT0A 3H3OB 3D2FA 3D2FB 4BRMA 3VF6A 2WUSA 2HOEA 2Q0RA 2YCHA 1MWKA 2GWJA 3GG4A 4O8KA 2GTDA 4K43A 3GE1A 4MO4A 1BDGA 3EKUA 1MWMA 4RTFD 5AQGA 5AZJA 5AZJB 3LDOA 4XEIA 4KBOA 3CETA 3ID8A 4GNIA 4WQ5A 2D1KA 3EKSA 3H46O 3L0QA 3HBTA 1BA1A 3B8AX 1BUPA 4H0YB 2Q31A 4FWLA 2AA4A 2E88A 3DJCA 3L4IA 4BROA 4EAHD 3W0LA 2QWLA 1T6DA 4EFHA 3U9DA 2NLXA 4K41A 4BC4A 1IJJA 3CJ9A 3GDQA 2ZF5O 3VF2A 4B1XB 4BR0A 1JCGA 1SQKA 3O80A 3FFKB 3FZFA 3IFRA 3VEOA 3OHRA 1NGAA 3VEZA 3H6EA 2AP1A 1H1VA 3HSCA 1GLCG 5KPTA 2YJEA 1DEJA 3O4WA 4EIAA 5BRFA 2F9TA 4H0OA 1K8KA 1K8KB 3KHYA 2FF3B 1ATSA 3FLCO 1YAGA 3QMLA 3CQYA 3CJ1A 5BR9A 1KAXA 4FPBA 1U2VA 1U2VB 3G25A 3VEVA 3HTVA 3CIPA 1S3XA 4FWOA 2A42A 5AR0A 4L3QA 4BRQA 3ZEUA 3HM8A 3BF1A 3FE1A 1IG8A 3DWLA 3VOVA 3CI5A 4BRCA 3QB0A 2E1YA 4B1WB 4BQZA 3IMXA 4JNEA 5AQHA 5KPRA 2I7NA 3LDLA 3C7NA 5FPEA 3C7NB 4ISEA 4C23A 5AQXA 1EQYA 4BRNA 2IVOA 3LM2A 4GY2B 4H0XB 3EL2A 2UYTA 1HKBA 5AFUH 3O08A 3VPZA 3QBXA 3O1WA 1TYQA 1TYQB 5JMVA 2P9PA 1TUYA 2P9PB 1GLDG 3VENA 4WQ5C 2NRHA 4BVPA 1KAZA 3P4IA 3WEEA 3WEEB 4BR4A 5LJWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GOAA 1JCFA 1IKWA 4H5VA 3OTOK 3CJCA 3WXLA 1TV6A 4YDUA 3CJAA 2IVPA 3T1HK 1NGFA 1IKYA 3E1YA 1ZBLA 3ZX0A 3TSPA 1RTHA 4CJ4A 2EX3A 3M5RA 3OVNA 2YHWA 1ZBUA 4KHQA 3HOTA 3TAEA 3QFUA 1VQPN 1BG3A 2PAVA 1NGJA 4EP5A 5AQLA 4DV2K 3UB5A 1NKBA 4ZHRA 4IWVA 2O8DB 4BRAA 5CY4A 1RILA 2P9KA 4HVJA 4N76A 5JS2A 3UE5A 4CZJA 4OPKA 1LW0A 4CFDA 5BN9A 5J1EA 3CHWA 4QOZB 3WQTA 3CG7A 3THWB 3GOIA 3A5NC 1RDUA 4CK3A 4KH6A 5FDLA 1C1BA 3LAKA 4CJ7A 2UXBK 1U4BA 1SKSA 3N4QA 3DOKA 4GV3A 4CZKA 2HHVA 4PA1A 4DSKA 3NCIA 2O4GA 2RPIA 1ATRA 3I0SA 4X62K 1OH8A 1EXQA 2IC3A 1T8EA 1KAYA 1JCEA 3MN7A 3OYJA 1DTQA 3BZKA 4QCLA 2ZGYA 4LF6K 4GMJB 4CECA 3FZLA 1HRHA 1ITGA 4FWNA 4A5BA 1ESVA 3VQ6A 4WCEL 3F9KA 4FLTA 4FO0A 3UKUA 1Y97A 4AH9A 4A62A 3HZ6A 1P8ZA 2Z1HA 4A57A 4K8XA 4CIEA 4F4KA 3SUNA 2V7ZA 2YNGA 4I2PA 4F3OA 4CZEA 4BDPA 3OS0A 3NVKA 4DV1K 4AHTA 5F1XA 1NJIO 2BUPA 3G6EN 1U49A 3CMEN 5TKYA 4CJKA 3RR8A 1K9MO 3P1GA 1SUQA 3IAYA 5LY3A 4RW7A 3U4LA 4BE1A 3DRPA 4H5WA 4B1VA 3HXMA 1BL3A 4JAXA 4RW4A 4O0IA 1GOBA 1LWCA 1S5JA 5E26A 2O8CA 1JLEA 4EZ6A 1NGHA 5KQDA 4LFCK 2XHBA 4CZIA 1WBBA 4M3UA 1BCMA 4RCHA 5SWMA 1WSJA 4YNQA 2ITMA 5KQ8A 1T05A 2B5JA 2J4RA 1L3VA 5J2PA 3I33A 2OPQA 4MO5A 3SAHA 4KKOA 4DTMA 3C0BA 4DG1A 3K9KA 3EE9A 4M7YA 1IBLK 1HX1A 4FOIA 1C0MA 3VQBA 4JKCA 2V52B 4JHDA 3OYBA 4DCHA 3H08A 4DR5K 5AQOA 4CEZA 2D0AA 3ULDA 3ATVA 4PQUA 4PL7A 5FPMA 3KD5E 2HF3A 3AAPA 4CEAA 1IH7A 2P5OA 4K8ZA 1HQUA 3OYCA 3IG1A 3MAQA 3VN5A 4W5NA 1GLEG 4FL9A 3FZHA 3V9ZA 1YXQA 1XI1A 4K0KK 3LM9A 4JKGA 2OA8A 3PO4A 1MA9B 2YNHA 3MN9A 1A5XA 3VGMA 2HSTA 3RR7A 4DTPA 4JK8A 3LAMA 4YOWA 1RGIA 1N5YA 4HWIA 4DV3K 3WXIA 4KHWA 2ASOA 5GAHP 3ULEB 4AHVA 4CEQA 1GLBG 4PKHA 1OKJA 3C95A 5CR4A 4WFAL 4CCHA 4FWKA 4FXDA 3U6FA 4PY5A 3VF4A 2ZQBA 3HVRA 3TSQA 4GKJK 1VQ6N 3HL8A 3P83D 1XHZA 1XNRK 1XHXA 3DYAA 3R6MA 4Y1CA 4CBXA 1RT5A 1NMDA 1HNIA 3SJJA 5AQKA 4IFEA 3UKRB 1LWEA 1SS6A 3O3HA 1J5OA 5KPZA 1BOTO 4CD3A 5BRDA 4C8OA 4JI1K 2BANA 5GAGP 4AM6A 4H5RA 4HUEA 2QEXN 3CFOA 2E5LK 1QSLA 4CZGA 2CGKA 3P39A 2H3GX 2BGGA 4Z4EA 3BGRA 3ENOA 3L2VA 3CM6A 4KFBA 1WSEA 3TAMA 4IO9L 2QKBA 4M7XA 1T3VA 4H0VB 4X64K 1L3TA 4IOAL 4KHPK 2PBDA 4XH4A 4FK4A 1YJ9N 4C8NA 2I7PA 3SJHA 2WFBA 1ZBFA 1NK5A 4YOXA 1TKDA 1B92A 5FPNA 2HNZA 2NRRA 4CZMA 2P9IA 4DFKA 1WOQA 3K5LA 4CJEA 2HF4A 1VQMN 1Y64A 3MK6A 3CERA 2VQEK 4B9MA 2DTUA 4CFBA 5J2MA 2FF6A 3J7AP 1W97L 3EY1A 4DR1K 5AQTA 3AA5X 1OH5A 3M1FA 3V1QA 2ZGZA 3TTDA 1V4SA 3D2EB 3T1YK 3CM5A 4M3YA 5AQQA 1S22A 5E84A 2HBMA 2HMPA 1KLMA 3V9WA 4CESA 2P9LB 1HYSA 1XUPO 1S1VA 3GL1A 5I9EB 2E1ZA 1VQNN 3KTQA 3EE8A 4JK9A 1Z05A 2VWBA 5CYQA 2GWKA 4YORA 4LSNA 4DTJA 1RFQA 3S41A 1VQ7N 1RDWX 3RRHA 3OBWA 4IG3A 3PO5A 5M1PA 3VQQA 4BRIA 4M3WA 1RT2A 3PUFA 1Q81O 3PX6A 2Z1GA 2E2OA 2FBVA 5CZ1A 2VGNA 4B1ZA 3L2QA 3U9ZA 1IG9A 4RWTA 1HR0K 1JXEA 5KRTA 4DTRA 3LDNA 3QNNA 3JS6A 1VSEA 1D9DA 1GOCA 4Y0WA 1QZ5A 2FLOA 3AVFA 3H3OB 4KH5A 3QEVA 2HOEA 3P38A 3THWA 1MWKA 4CIFA 4O8KA 2GTDA 4OPJA 4K43A 4MO4A 1BDGA 1X1PA 2RKIA 2OPRA 4UQGA 5AQGA 5AZJB 4FJIA 2KLAA 4C8KA 2ETJA 3QERA 3CETA 4GNIA 1YTAA 5GADP 3H46O 1BA1A 1Q9YA 3B8AX 4FJLA 3LP3A 3L4IA 1NMNA 2QWLA 1T6DA 2HW3A 4JI4K 1B9FA 2ATQA 3U9DA 1F21A 3VQCA 1TK8A 4BC4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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