1XM3A

Crystal structure of northeast structural genomics target sr156
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
251
structure length
244
Chain Sequence
SMLTIGGKSFQSRLLLGTGKYPSFDIQKEAVAVSESDILTFAVRRMNIFLEQLDLSKYTLLPNTAGASTAEEAVRIARLAKASGLCDMIKVEVIGCSRSLLPDPVETLKASEQLLEEGFIVLPYTSDDVVLARKLEELGVHAIMPGASPIGSGQGILNPLNLSFIIEQAKVPVIVDAGIGSPKDAAYAMELGADGVLLNTAVSGADDPVKMARAMKLAVEAGRLSYEAGRIPLKQYGTASSPGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Biosynthetic protein
molecule keywords Thiazole biosynthesis protein thiG
publication title Crystal structure of Northeast Structural Genomics Target SR156
rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 67
structure length 244
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.8.1.10: Thiazole synthase.
pdb deposition date 2004-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1xm3A00
5BRBA 2CLIA 3PSVA 2CZFA 1JCJA 1S5TA 3KRZA 1RQBA 1SO6A 1TPWA 5LSMA 5CG7A 3IEBA 1SR9A 1F05A 1JRBA 3L0GA 1M7OA 4O0ZA 1GVRA 4U4MA 1NSJA 1OYBA 2ZRVA 2B0MA 3LRLA 3TQKA 2B7NA 2V81A 1LRQA 4WY0A 3SY5A 5LGXA 2YGYA 3GDTA 4GBUA 4OU1A 4Z0SA 5I3KA 1PCKA 1XI3A 3GZ3A 4X22A 3W2JA 4GWEA 5DXYA 4N02A 2QCGA 1VCFA 3VFLA 1H7XA 1KM6A 1LYXA 1IIGA 2I9EA 1ALDA 2DZVA 1QFEA 1O94A 1VRDA 3L66A 3B06A 2X30A 4A22A 1OFOA 4KFOA 2X16A 1ZY9A 2B7OA 1QOPA 3JR2A 1WQ5A 3EXTA 3KFTA 2J88A 3PUDA 1UB3A 3BW2A 1MO0A 2H8ZA 3HOJA 3QRHA 4IMDA 1U5JA 1KLZA 3GAKA 3W07A 2CLHA 2GOUA 1LBFA 3IVUA 4HIBA 1OFRA 4FX7A 4DF0A 2GQ8A 4K36A 4HNUA 3BVJA 1A5AA 4QAIA 1XBZA 1OFQA 3FKRA 4ADSA 5D2YA 2ATSA 1SFLA 3W7NA 2ZZ4A 1SPQA 1T99A 2G5WA 4LU0A 1OX5A 3DXIA 4M6PA 4UMBA 2GVGA 4IXXA 1P0NA 3G1DA 3KOFA 2JKPA 4TO8A 3GX9A 1DVJA 3B4UA 1K02A 3TK7A 2WNNA 1O95A 3IV3A 1KBJA 5K9DA 3I7RA 1L6YA 1YXYA 1XM3A 4EOUA 3W1XA 3RLVA 1TTJA 5C2XA 3HO8A 4HSOA 4UTMA 1FWTA 5CPMA 1RD5A 1Z48A 1WOAA 1W5OA 5HNRA 2ATMA 2EGZA 4GXMA 3LXBA 3LM7A 3BGGA 3P61A 4MFDA 1C8VA 1FCVA 3HGOA 4NJKA 2CLFA 2O7QA 2A2IA 1FWRA 1VHNA 4O8RA 3H55A 1HG3A 1TPH1 1M6JA 1OHLA 3PB2A 5T26A 2DZXA 3LHZA 4RX0A 3LHVA 4MLJA 3G0UA 3LX9A 1H7RA 4JX6A 5AYYA 1TV7A 5KITA 4LUIA 1O5XA 2VEPA 1IIHA 5F4WA 1WOBA 4O11A 1QDSA 2Y7FA 5DCDA 3EX6A 4NVTA 5CSRA 3O15A 3STFA 4IMFA 2VEMA 3ABQA 4FEZA 3W6YA 2E6YA 1OFDA 3NZRA 4MYXA 1L9WA 2A7PA 3DAQA 5G5IA 4RCXA 1XFBA 1YPIA 4GE8A 1EX5A 1G69A 3LGEA 4IPJA 3SW6A 3AO0A 4N6FA 4CCDA 4C1KA 4EF8A 3IGXA 2QCNA 3QZEA 3F1QA 1GEQA 5KINA 1SO3A 2HMCA 3W7GA 4BFAA 1JQVA 1SSDA 4CQAA 1EPXA 1G4EA 5AHMA 5CZ0A 2WJZA 5HR6A 1KFCA 5AYZA 2JKAA 3N73A 4K37A 3QQ0A 2D73A 3INPA 1GT8A 1OABA 2QDHA 1IXPA 1Q6RA 3TFCA 3NEVA 1VLIA 3HBLA 5F2GA 3MI3A 2P1FA 3W9ZA 3P80A 3G1SA 4Z0JA 1QPQA 2J9ZA 3G0XA 5EPDA 4YCOA 2C16A 1RR2A 1GPWA 5EKYA 3OA3A 2E09A 3C61A 4Y9AA 4R7JA 1VH7A 1DJNA 2YXGA 4QITA 2IQTA 4KFNA 1H50A 1JVNA 3I68A 2FPTA 3WK0A 1O4UA 4LV4A 1G6CA 3M9YA 5G1YA 1RQHA 3P60A 3T4CA 2Z6JA 4OV9A 4ZQCA 3W73A 3W1TA 4A29A 1FUYA 3NQCA 3GXPA 2EF9A 3G8RA 5HULA 3DFOA 1TJRA 3HPXA 3CEPA 1KM4A 1PIIA 3A23A 4XTIA 2RDTA 5CZJA 3JS3A 2FFCA 3EXSA 1GQNA 4BI6A 1X6UA 3E12A 1AL7A 3G24A 2NUWA 1TYGA 3L0NA 4FNQA 2VFGA 2ZDRA 2OZ0A 1UJPA 4LW7A 1TPFA 3GIYA 4TX9A 3T7VA 3YPIA 3WFAA 2ISWA 4FXRA 3W71A 5DXXA 4ZQPA 1BWKA 4K38A 1TPEA 5EBUA 4UIOA 2Q8ZA 3TW6A 3PBWA 1JJKA 4UTIA 1JULA 2FB2A 3P5YA 4ZMGA 1H63A 2EAWA 3IIZA 3IIXA 6TIMA 2PRLA 1ZENA 3QH2A 3RMJA 3TC7A 2CLMA 3W1AA 3MO7A 3NNTA 1OFPA 4AB4A 4AMAA 3PBYA 3DI0A 3QF0A 1Z42A 3FYPA 4Z08A 5FEWA 2A4AA 4Z1BA 3A21A 3P82A 3I7QA 1FCBA 4XUGA 3OG3A 3M16A 5D03A 4WZHA 3C8FA 4X9SA 1G67A 3M6YA 2NLIA 3HG3A 2VFFA 2VELA 2Z2UA 1ICPA 1SFJA 2H6RA 3R13A 4JX4A 3GLCA 2V82A 3FA5A 1SSGA 1WBHA 1R2SA 4IPIA 4WJEA 1MEWA 4M5PA 4ML9A 4PEKA 1VYRA 2WNQA 4EWND 3SGZA 3LTPA 3PWAA 3IIPA 1P0KA 1NVMA 2R94A 3W86A 2FJKA 1GYNA 2QAPA 3HB9A 3P62A 1I2PA 4UCGA 3Q94A 2Y62A 4JN6A 4UTTC 3F03K 5D30A 2C6QA 3UQNA 2ZRZA 2GQ9A 5LHEA 3NXFA 2X1RA 4UFLA 3TA6A 4ZQMA 3SGUA 4IQLA 6ALDA 1OX4A 3EWWA 2E1DA 3MP4A 4JTUA 3RK8A 1XXXA 3TMLA 1AL8A 2ZQ0A 4JTHA 3KRUA 2VKZG 4LWWA 2CLOA 4JYEA 1W3IA 2JGYA 3Q37A 4QQ3A 4UFMA 5HUPA 3UWYA 3G0SA 5D05A 4I7UA 3G1VA 1FWNA 2NX9A 3ABRA 3OVRA 1EP3A 1OVDA 1TPDA 2E6FA 3LXAA 1VCVA 2J27A 3A22A 2VENA 4JICA 3UNDA 3ABOA 3W83A 4UTHA 1MEIA 4YCPA 3BG9A 3C3NA 1DQXA 1DJQA 2PRHA 1A5SA 3O16A 3I7SA 4NJGA 1GOXA 1HL2A 4UTWC 4WY0B 3W7RA 3S9YA 5HUOA 2YFNA 3Q2DA 3S6DA 2V5BA 5D38A 1PVNA 3WJXA 2GQAA 4CQ8A 2PE4A 3O06A 3LTYA 3DBPA 4O50A 5AFDA 4MY1A 4HT3A 3CWNA 3DFTA 4UTUA 1AMKA 4E0CA 4PC8A 1XUZA 2NWRA 1ZHAA 5D2VA 2QDGA 1LOSA 3UXDA 3EWUA 4MVAA 3FS2A 2H3DA 4GFSA 1EB3A 4RLIA 3VKJA 3LCXA 1KM5A 1KA9F 1T96A 1S3HA 4WOZA 1G4SA 4MLRA 5AOUA 2AAMA 1ZAJA 5AHIA 3GKAA 4AWUA 1IXQA 1GJPA 4XBKA 3O05A 4DBDA 4O1BA 4IJBA 3GVGA 1ME9A 3PM6A 2ZCGA 3M5VA 4NX5A 1CI1A 1TREA 1EP2A 2A6LA 1NAL1 2YR1A 3LRMA 1X7FA 4AXKA 1E51A 4S2CA 1FCQA 3CTLA 1NFBA 3CC1A 3LBMA 3TCEA 3R8RA 4LY8A 1GYLA 1K8ZA 4CQ9A 1NF0A 4ZQNA 1X8FA 2Y61A 1SUXA 2DJLA 3HGJA 4LRTA 3W7CA 1FX6A 4IMGA 4P61A 1BKSA 4QISA 3UZJA 1FXPA 1KM0A 1W5MA 2YYTA 3P74A 3W2UA 1OYAA 1FDZA 2YX0A 4XBSA 3EWZA 2O7SA 3LCGA 1M5WA 1S5WA 2OJPA 4UNKA 5G4WA 3NVTA 3M0ZA 4NZJA 1TPVA 3DHFA 3T40A 1AG1O 4XWUA 4JTJA 1LP6A 3FEMA 5K7JA 5HQEA 4ICNA 4LTSA 3C4UA 1OYCA 4PCFA 1FCUA 1H51A 1YXCA 3WK1A 2WOQA 3RNDA 4TMCA 4GUIA 2FPVA 3LHWA 4MY8A 1KW1A 3NM1A 2C19A 5BMWA 3LBCA 3M47A 3HIJA 3W7PA 1JQXA 3T55A 4PL2A 2P10A 2VXNA 3C0JA 5K9CA 4UXDA 3QMRA 4ORMA 4E2BA 4D2JA 5F2MA 1GTEA 1THFD 2DJXA 2VEIA 4K7VA 4JXCA 3W74A 1AK5A 1BTMA 1YDVA 3DU0A 4DF1A 3C2FA 5BMXA 4PH6A 2ISVA 1L6WA 4JDBA 1F2JA 4QNEA 5TBOA 4XKYA 5I3GA 4RK8A 2G95A 4BI7A 4M19A 5K2ZA 3GAYA 2ZZ1A 4UFJA 4DO5A 5LNRA 2FLIA 5D33A 1K03A 2BWGA 1QO2A 3NR0A 3CM4A 1PS9A 3ZWTA 1J5TA 4GUJA 1GWJA 3E9AA 4N9CA 5FEXA 2PCQA 3HMJG 4TU1A 4O12A 2ZZ6A 3QSRA 1KFKA 1UUMA 2G97A 5J5RA 2RDWA 2EKCA 3TJXA 4O4VA 1RZMA 5C55A 2C14A 3TR2A 3KRSA 4CNPA 1CX9A 3OEXA 3TKFA 3L9CA 1ADOA 4AAJA 3KVJA 3HF3A 3NOEA 4NJIA 1SO5A 4E38A 5FEPA 4LS2A 3PF3A 4PA8A 5CZSA 1JCMP 1LRNA 4R34A 3STGA 4HN4A 2Y7GA 1QR7A 4KKXA 3IRDA 1W0MA 3S5NA 4QM1A 1DHPA 3OHIA 1DBTA 1TPB1 2E6DA 1ICQA 3S8HA 1RQEA 1OX6A 3S5OA 2WSRA 4UR8A 1XDLA 3FOKA 3W2LA 5EL1A 2YW3A 4M6VA 1MSSA 1T0OA 4UUIA 4QIUA 2YW4A 3M41A 5D2TA 3M43A 3TC6A 4JX5A 4O4WA 2PRMA 5DELA 3KVLA 4BI5A 3LRKA 4ZQOA 3W84A 5EMUA 1LTDA 4UMAA 5AYXA 3W2MA 4OBTA 2Y63A 3O6CA 3PULA 5AC8A 3OIXA 8TIMA 4KFPA 3RF9A 4GRSA 1N7KA 3PBVA 2Q8LA 3W72A 5E1QA 1VQTA 3DFPA 3NAVA 4A21A 4U28A 2WV8A 4GUFA 4IGHA 3UWWA 1R47A 3FYOA 5HJLA 5K3VA 2V2CA 5E93A 1VCGA 5EY5A 1LZOA 1SZFA 3HPZA 1Q6OA 2QKFA 1PHWA 3LHTA 1H7WA 5ABTA 4YMZA 1LBMA 2RDUA 2X2GA 1TV8A 1K3UA 2CZ5A 1IXNA 4N6EA 5FEZA 2OX1A 2G96A 3NPUA 3NQMA 3TUUA 1HUVA 5AC6A 2WSQA 3W7KA 1GVFA 2QJHA 3MBDA 1B3OA 4RZ5A 1H7NA 3PC0A 1QMLA 3W85A 2V2DA 3NO5A 4JTTA 2V9DA 2GVJA 5DY3A 4LS0A 3O63A 3BARA 1B4KA 4X2RA 3VE7A 3UYCA 3NPXA 3NL6A 3EWYA 4IUOA 1HFBA 2KZHA 1LLZA 3MBFA 4K6AA 1UASA 1W3TA 2W0UA 2EHHA 1VYPX 4Z1DA 4DF2A 1MEHA 2DZPA 3W88A 3GDKA 4N9BA 4POCA 2C13A 4FXSA 1KFJA 5DY2A 1LCOA 2E5BA 1OX4B 3FFSA 3NZ1A 2ZTKA 1VGAA 3G1FA 4O17A 4A3UA 4FX8A 4MZ1A 3S5YA 2E5CA 3MMTA 3CQ0A 4N4PA 4O15A 3W75A 5HR7A 1XCFA 1TTPA 3W1UA 5BW6A 3C2OA 3PSWA 2NV1A 4UR7A 3LCLA 3NQFA 4S1FA 4ZVJA 4HNNA 3IVSA 4IMEA 5D32A 2TPSA 1TIMA 1KM3A 3BK0A 4N2YA 4MYAA 2ZA2A 4A2RA 4Y8FA 5A5WA 4JTSA 3W1MA 1PCWA 4UFHA 5DBTA 4LVGA 4H6KA 1PL9A 3THQA 2J6XA 4RV8A 3M7WA 1VR6A 5D2XA 2DORA 2HS6A 3O6YX 2JK2A 3GKFA 1W37A 1HTIA 1G4TA 1HO4A 3KVKA 1SQ7A 3C56A 4UMCA 4IX0A 3ATYA 1GVQA 1WDWA 3ELFA 2QCLA 3TV8A 2ZZ7A 2I14A 5AB3A 5G1TA 3M44A 5C54A 4UTTA 1FWWA 3TE9A 2A0NA 1EIXA 3CHVA 4FB7A 3UPWA 5D2WA 1W54A 3B03A 1P1XA 4PL1A 2QAFA 3M5YA 3PAJA 1JRCA 4LT9A 2NUYA 4KWWA 2Y6ZA 4WX2A 3S1VA 4WY0F 3SJ3A 3K30A 5FF0A 3KHJA 2DZUA 5C5YA 3KAOA 4K7YA 3PB0A 3NGJA 3THAA 3RLUA 3G1YA 3CT7A 3W7QA 4J9JA 1ZAHA 5DCBA 3CIWA 1F73A 3R2GA 4WUIA 4FHAA 1XBVA 4BWLC 5LNSA 4Z1CA 4RZ6A 5F2LA 1EUNA 1QAPA 1KBIA 4JGDA 2QJGA 4K39A 1Q3NA 3UZ5A 5I3HA 3SIZA 4YWIA 4LC6A 1EA0A 3RFAA 5LHFA 3W1PA 4KWVA 4Q33A 2H3BA 4UTWA 3KVMA 1Y0EA 1DKWA 4TIMA 1U83A 4DO4A 2DU2A 3DENA 4HSNA 4DPPA 2X1UA 4NZFA 4MIMA 4UFKA 3U2OA 3NQAA 3PUEA 2X1TA 3MYPA 4GUGA 4JYFA 1JUKA 4CLMA 4QJ1A 2ZYFA 5IBXA 3TNOA 3MYOA 3WJYA 1L6SA 2XN1A 4LVAA 3C6CA 2W79A 3O1NA 3N2XA 1OJXA 3P8JA 1BWLA 3SR7A 4LVBA 3UWZA 1G7VA 1H1YA 2NV2A 3CEUA 1ZNNA 2CFFA 4OE7A 1I2NA 3G1XA 4JD4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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