1Y0EA

Crystal structure of putative mannac-6-p epimerase from staphylococcus aureus (strain n315)
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
222
structure length
222
Chain Sequence
AMLPHGLIVSCQALPDEPLHSSFIMSKMALAAYEGGAVGIRANTKEDILAIKETVDLPVIGIVKRDYDHSDVFITATSKEVDELIESQCEVIALDATLQQRPKETLDELVSYIRTHAPNVEIMADIATVEEAKNAARLGFDYIGTTLHGYTSYTQGQLLYQNDFQFLKDVLQSVDAKVIAEGNVITPDMYKRVMDLGVHCSVVGGAITRPKEITKRFVQVME
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase
publication title Crystal structure of putative ManNAc-6-P epimerase from Staphylococcus aureus (strain N315)
rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
total genus 75
structure length 222
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date 2004-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04131 NanE Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1y0eA00
3CC1A 3IIZA 2C14A 5AOUA 3N9SA 3W2LA 4CCEA 1FWWA 3TX9A 3TW6A 1CX9A 3QRHA 3JS3A 2F84A 2H3DA 1P4CA 4MLRA 2CZDA 3L9CA 2NUXA 4KWVA 2Z0IA 1JUBA 2WJZA 3G1DA 3IIOA 2QAFA 1EIXA 2Y7FA 3QMRA 3U8GA 4ORMA 3KRZA 4DBEA 1K8YA 4AAJA 4O4VA 3TE9A 2VFDA 3UPWA 1SR9A 1OF8A 2ISWA 1FXQA 5FF4A 3QYQA 1QFEA 1W8SA 1YTDA 4MFEA 2O7SA 4OHQA 2VFFA 3PBUA 5DCDA 4QQ3A 3VKJA 4HNTA 1GYLA 2XN2A 3M5XA 3EX3A 3WJYA 3I65A 3O6DA 1WBHA 4OE7A 4UTTC 1KBJA 3EWXA 5TIMA 4AWUA 2OT0A 3TA6A 3VFLA 1W3TA 1TTQA 1GT8A 3M47A 3E96A 1L6WA 3EEGA 1SZNA 1YTKA 2QCCA 1LROA 1VHNA 1FY6A 3LHWA 4ZVJA 1LM1A 3DFPA 5I3HA 3TR2A 3QC3A 1VLIA 3S5ZA 3TK7A 1OG0A 1LZOA 3O63A 4N4PA 3GDRA 4EF8A 3BO9A 5D02A 1W5OA 3P81A 1K02A 1NVMA 5HQEA 4MJZA 3LRLA 4M19A 2HS6A 1B4EA 3MHUA 3G3MA 1L6SA 1JCMP 1F05A 3WK0A 3WJXA 2OZ0A 2R14A 2P10A 4WJEA 4ICNA 3BW4A 2FDSA 4JY9A 3GDMA 1K7XA 3QPYA 3B0VC 3W1NA 3M43A 2C15A 3CPRA 1T8XA 5E1QA 2GVJA 4O53A 3QH2A 4UFJA 4AWSA 3G24A 3W72A 3MI3A 3VNDA 1NAL1 3W2JA 4G1KA 2A4AA 4YL2A 2ZRVA 1OFBA 3DZ1A 4EF9A 2VEIA 5TBOA 3G22A 1G4SA 3MI6A 5LGXA 1SFJA 2A2IA 1TPEA 2WV8A 1OYCA 1XI3A 4XZ9A 3OBKA 3OVRA 5C54A 4GWEA 3MI2A 1SFLA 4X2RA 3ABSA 3S5NA 4BWLA 3O06A 2ZRWA 3CEUA 4S2CA 3W1UA 2NXIA 3MW7A 1U5JA 1IXNA 1P0NA 3BGJA 2J6XA 4OT7A 4GXMA 5K7JA 4C1KA 3NEVA 3KRUA 3NQMA 7TIMA 4JN6A 3INPA 1EPXA 1XXXA 4I9AA 2QF7A 3DI0A 2XFWA 1ME9A 2G95A 3DU0A 4A29A 3W9ZA 4O1BA 3W7IA 4BK9A 1HFBA 3RF9A 2ZCGA 3BLFA 3LXBA 1R2SA 1YXYA 3A5FA 1YDVA 4JGDA 5C6MA 4Z1DA 1TV7A 2NWSA 5BOOA 3HPSA 1Z44A 2DJXA 4GC4A 5BMXA 1XFBA 2TRSA 2CFFA 4FNPA 1LLZA 5HULA 3PBWA 1OJXA 5HWNA 3IGUA 4W9TA 3QSRA 1SQ7A 1O5KA 1H61A 2NX3A 3DFNA 1OFDA 1ZAIA 3HOJA 4Q33A 1FWSA 5FEPA 1FCVA 3C52A 4IXXA 3SECA 1OYBA 4AXKA 2J9ZA 1LP6A 4DF2A 2V5BA 4E2BA 4A22A 3NPXA 4K8HA 1LCOA 3S8HA 4NJJA 4MLJA 2Y61A 2QR6A 3P82A 3N2XA 1AW2A 1VZWA 3ABQA 1TQXA 5G4WA 2PRMA 4FXSA 1IXPA 2F7FA 4KFNA 4MKNA 1R30A 1HUVA 4N2YA 4BWLC 5EL1A 4Z1BA 1YDNA 3NQ8A 2B7QA 1TMHA 5MHBA 2VFHA 4POCA 2FTPA 1VH7A 3G1YA 3NZRA 1ZHAA 3UWWA 5FEXA 3EWYA 3W2KA 1RR2A 1VYSX 5GVJA 3GKFA 3TKFA 3TJXA 3CHVA 4JTUA 1NF7A 4PL1A 2BXVA 2P1FA 5K9DA 3E9AA 2B7OA 5D2YA 4RZ4A 3L65A 3YPIA 3LI0A 1I8JA 1JUEA 4ORIA 3TFCA 4GRSA 3SI9A 4LC8A 4UR8A 3EXRA 4KFOA 4EOUA 1K03A 4RKAA 3NG3A 5TQLA 3PULA 1LRNA 3FS2A 1KM0A 4WXYA 2ZA1A 3TU9A 3O6CA 4JTSA 3R5EA 4O1AA 1XL9A 2QCNA 4ZMGA 3DFSA 3W86A 4WY0B 2C6QA 4LS1A 3GDKA 3NM3A 3NXFA 1F5ZA 4JIQA 3GKAA 3UNDA 5KSWA 2TMDA 3R2GA 4OGZA 1IF2A 4S2BA 4IX2A 3LCHA 3L67A 3CB8A 4MY9A 3NGJA 2KZHA 4LW7A 3W6YA 5FF3A 4M7SA 4AHOA 1PE1A 3C2OA 3FOKA 2ZZ3A 5E93A 3ZFHA 4CLMA 1VCGA 3CU2A 4WOQA 5D32A 1L9WA 4FX7A 2G97A 5KINA 5C2XA 1GVQA 1OX5A 3MBFA 1QDSA 1KM4A 1KLYA 1VYPX 1OFAA 3ATYA 4UTHA 3W83A 2X1TA 3BW2A 1UBSA 5LNSA 4FX6M 1EP1A 3WFAA 3W07A 3DH7A 1F7BA 2AAMA 3W7DA 1GVRA 2YW3A 3SIZA 5HUOA 3P62A 3NA8A 1K3UA 1VGAA 3W1AA 4DEFA 1TPDA 4E38A 1ZJIA 5ABTA 2YZRA 3TC6A 2VFGA 3GB6A 1KFLA 1QPNA 4O28A 3BLEA 4JS3A 2ABBA 4DBDA 4WD0A 4LC6A 3JR2A 3NZ1A 3T7VA 1ME8A 3SR7A 1K8XA 2X16A 5C5YA 4U28A 1ZALA 2V2CA 1MXSA 1X8FA 1XKYA 2ZZ1A 5AHIA 1T99A 1GJPA 3C3NA 4RXFA 5D33A 4WX2A 4O0ZA 3HMJG 1MZHA 3DGRA 3W1RA 2GQAA 2A21A 4ADUA 1OYAA 3TV8A 2I9EA 5G5IA 2B4GA 2IQTA 1DKWA 3TDFA 1PV8A 4HHPA 4H6KA 5IM51 1NFBA 1Q6RA 2VENA 3GR7A 2BX7A 1F73A 5J5DA 5BMWA 2E6DA 3LX9A 4GFSA 2CLEA 4IUOA 1QMLA 4IPIA 3WJWA 3PB2A 4O8RA 1FDYA 2OCZA 1Z48A 5K4ZA 5DXYA 8TIMA 1Q45A 3PB0A 4JNMA 2LLEA 5CPOA 4E2DA 3C61A 3KOFA 2E6YA 1TV8A 4MYAA 3NQEA 3W23A 3IVSA 1TJRA 2CLKA 1LYXA 1LBMA 2ZFAA 1OK4A 2GOUA 2V0TA 4IGHA 4JTKA 3PVFA 1JQXA 3W1PA 5DY3A 3W7HA 2NX1A 3O07A 5BRBA 1EB3A 2YDAA 5LZLA 3I7SA 1JCNA 2PRLA 2C1HA 4CCCA 5DN1A 4S1FA 4HSNA 2RDTA 4JTIA 3ABOA 3DHFA 3OVQA 4OV9A 4LUJA 4PC8A 4MPQA 3S6DA 4N9CA 3U6WA 1SU5A 3N73A 2V30A 3DFOA 3HJZA 2VFIA 4XTIA 4ADSA 4AF0B 3MHFA 1ALDA 3O16A 3PG8A 3QFEA 4LWWA 5AHFA 2ZYFA 2CU0A 2Y7GA 4JTGA 4JXCA 1PHWA 2EKCA 3N3MA 3DKLA 1AW5A 3W87A 3S1UA 3E12A 3PWAA 2QCDB 4MZ1A 1XBXA 1N7KA 1OK6A 1HO1A 3FKRA 1U83A 3AO0A 2VOMA 5CZ0A 2DU2A 2VFEA 1P0KA 4XQ6A 1S5TA 1DQWA 5FESA 3PUEA 4FB7A 3P8JA 2CZEA 1GOXA 3EWBX 2E5CA 4K7VA 3EX6A 3UQNA 5HNRA 5CSSA 1SW0A 4NUWA 2TSYA 4NU7A 4O17A 5HMSA 2FB2A 4GUJA 3I6RA 1G4TA 4ZQOA 3LHYA 4JX5A 4O18A 1FUYA 3P7YA 3BG9A 5LHFA 1KM5A 3LV6A 5CPLA 2E77A 2FFCA 2QJIA 4QJ1A 3KVMA 5D38A 4WXZA 3L68A 5AHEA 3BG3A 1TPC1 2B7NA 4O12A 2A7PA 1H7PA 4DPQA 3LHTA 2ALDA 1TTPA 4UTKA 4IOTA 3G18A 1YDOA 1OX4B 3TSBA 1SZGA 3G1VA 4CQAA 1D3GA 1M7PA 5HR7A 4JY8A 3IIVA 3G1AA 3KVKA 4O16A 2ISSA 4P2VA 2GQ8A 1A5BA 1LRQA 1W0MA 2JKAA 3N2MA 1FDJA 2Q8LA 3NAVA 4GE8A 5CZJA 1K7EA 1Y0EA 4O4WA 1RQBA 1XCFA 2E68A 3P61A 1G7VA 5BNKA 2GPTA 5AYYA 2JBMA 3GDTA 3KX6A 1C8VA 3LCXA 1XBYA 2ZZ7A 4QSHA 2RFGA 1LLWA 4N9DA 5G2WA 3S42A 1J4EA 4MVAA 3LGEA 1KFCA 1WAUA 1VYRA 4CNOA 1DBTA 4UMCA 2XN1A 4MFDA 2VEMA 2QCMA 4WOZA 3W3OA 1IIGA 4FO4A 1PCKA 2J9YA 4LUIA 5U7SA 2ZQ0A 1FBAA 5H91A 3THQA 3HGRA 4ZL1A 1W5NA 2Z6JA 3LI1A 2Z6IA 3BPWA 1I2NA 2PRHA 3W70A 2WPBA 4J9JA 2QDHA 1I2PA 2QCFA 3NNTA 3C2RA 4N6EA 3LTYA 4NZJA 1FQ0A 1Q6QA 4NT0A 3P60A 1VPXA 3LHVA 3M5VA 1GTHA 3CLMA 4MOZA 3SW6A 3DFTA 3TAOA 3TC7A 3VE7A 1OF6A 4JEQA 3A5VA 3TQKA 4O52A 2WNNA 4HSOA 4FIQA 1XBZA 1Z42A 1RVGA 1R2RA 4Z1AA 3TQ0A 1BWLA 1A5CA 1MEIA 1JCXA 1UJPA 1DVJA 3PSVA 1QPOA 4M5PA 3C8FA 4PA8A 5KTLA 1V5XA 5HWJA 3GX9A 3SZ8A 5I3IA 1EUAA 1SSDA 1W56A 3C0JA 1KV8A 4ZQPA 4RR4A 4IMCA 4ZZ9A 1LOLA 1FWTA 2WNQA 3GLCA 5D04C 4LY8A 2R91A 3M5YA 1FX6A 2PCQA 2WSRA 2VC6A 4O13A 4HNVA 2A7NA 1C9DA 2RH9A 5K2ZA 3TXVA 3Q37A 2CLIA 3P84A 4K37A 2XN0A 4WQ6A 4XBKA 2DZWA 2C13A 2ZTKA 2Q3OA 4M6PA 2Y7DA 5AFDA 4RLIA 1XDMA 3T40A 4UC5A 1TB3A 5AHNA 1OX6A 1GTEA 2Y70A 1W1ZA 3W2MA 1GG1A 4UTLA 1ICSA 2ZZ6A 5EBUA 3S5YA 3THAA 1UB3A 4H4IA 2I14A 4YXGA 5D37A 4JR5A 1ZCOA 5K4XA 2YGYA 4UIOA 4TMCA 4PTNA 4JYEA 4I7UA 1GVFA 3ELFA 5EYWA 2HSAA 1EEPA 3NL2A 4UMBA 2QJHA 3A24A 4DO5A 1TPVA 4XKYB 1LDCA 3B8DA 3OIXA 2CLOA 3G3DA 4CNNA 1A5SA 3T78A 1VCFA 4AHQA 4UFLA 3NQCA 3SFKA 3GR8A 4TIMA 1UUOA 3TROA 1VC4A 3C2FA 1WBJA 3IIXA 2J9XA 4OWGA 3LXAA 2YPIA 4DPPA 3NR0A 3I7RA 3LCIA 1RD5A 4A3UA 3M7WA 2WSQA 3UXAA 1NSJA 2TPSA 2ZRUA 2GJNA 1OFEA 3UY8A 5G4EA 3LTPA 3L0KA 2VEKA 1WA3A 2Z2UA 3H55A 1QAPA 3SGZA 2W0UA 4Q4KA 1G4PA 5HWMA 3S9YA 3N19B 1Q3NA 1QOQA 3OVPA 4HT3A 3G0SA 4IWWA 4MY1A 5CG7A 3M16A 1FCUA 3C2EA 1YXDA 1LBFA 1RQHA 3GXPA 2NV1A 2QCDA 3TSMA 1X6UA 4Y96A 5F2LA 2QAPA 1QPRA 3L2IA 3HO8A 1V7YA 5U4NA 2C0AA 2UV8G 4IX0A 5IBXC 3MO7A 3TMLA 3DBPA 3LLDA 3UY7A 3W7OA 1RZMA 2OX1A 3NL6A 4OU1A 1WXJA 1H7NA 1JRCA 4LU0A 1DOSA 4H3DA 2FIQA 1WYIA 4O11A 1KFKA 3TUUA 1YADA 3EB2A 5D05A 3RMJA 4O14A 4UR7A 3TQVA 4NVTA 1JJKA 3S0CA 4IMGA 1CW2A 3D0CA 3NQVA 1KM6A 1WV2A 3W7JA 1L6YA 3UD6A 1VHCA 1MO0A 2A7RA 4UTMA 4HNUA 3MWAA 3LERA 2QCLA 3NO5A 2QUVA 3FYOA 3W7PA 1M5WA 1G69A 5KMYA 1MEHA 1HO4A 2Y6ZA 2Y62A 4LOCA 4NX0A 3T4CA 1TTJA 2X2GA 2ZZ5A 2B0MA 3NM1A 4IQLA 1W5MA 3LXCA 3CWOX 5E0KA 3HPZA 3SSJA 3B4UA 3GZ3A 3CIWA 3WJSA 2ATSA 3NQDA 1AL8A 3HG4A 1SO5A 4MUZA 1OVDA 4Y8FA 1VQTA 2W79A 3CTLA 4A2SA 1OFRA 4PL2A 4LNYA 3FIGA 4GUIA 3FFSA 1AMKA 1TSIA 2V82A 2E5BA 3A22A 2Q3RA 2ZZ4A 2DP3A 1KTNA 1KA9F 4UTWC 2A1YA 5I3JA 5LHEA 2H6RA 4RV8A 3EX2A 1SW3A 3HGOA 3PBYA 4FF7A 3N14A 4PH6A 4FEZA 4IMFA 1L2UA 3KAOA 4JD4A 1EX5A 1O60A 3B05A 1PCWA 2ZRYA 2J24A 4O0KA 3KRSA 2EF9A 4LVAA 2DZPA 4K39A 2BZNA 4LVBA 1R46A 3KXQA 1SUXA 3UZJA 4BI5A 4RCXA 1F2JA 3M9YA 3T55A 5D09A 1VRDA 2GVLA 3QMTA 1SO4A 4UNKA 4X3ZA 3UWQA 2V2DA 3GAYA 3FEMA 1B57A 3F03K 1W54A 3DHDA 1R47A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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