The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
TFKSAVKALFDYKAQREDELTFTKSAIIQNVEKQDGGWWRGDYGGKKQLWFPSNYVEEMIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| molecule keywords |
1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate phosphodiesterase ga
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| publication title |
Crystal structure of of the SH3 domain of phospholipase C Gamma-1
rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
13
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| structure length |
61
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| sequence length |
61
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| ec nomenclature |
ec
3.1.4.11: Phosphoinositide phospholipase C. |
| pdb deposition date | 2004-11-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RTZ A; 2AK5 A; 2DL7 A; 1M27 C; 2DVJ A; 4DEX A; 5IH2 A; 2DBM A; 4Z8A A; 1ZUU A; 3PVQ A; 1H92 A; 2KRN A; 1MV3 A; 2CSI A; 2JM9 A; 2MOX A; 3VS1 A; 2ENM A; 2FG0 A; 1N5Z A; 1I0C A; 1AWW A; 2A08 A; 1NG2 A; 4KRT A; 4OMO A; 1NYF A; 4J9H A; 3RNJ A; 2EBP A; 1BB9 A; 2O9V A; 1OV3 A; 3EG1 A; 4RTW A; 2DL5 A; 4ZNX A; 4HCK A; 2GQI A; 1EFN A; 2SEM A; 4J9I A; 1QWE A; 1H3H A; 1I1J A; 2D1X A; 5FWC A; 2YSQ A; 1VYU A; 1YN8 A; 2O9S A; 4AG1 C; 2DIL A; 3NMZ C; 2KE9 A; 1JU5 C; 1WXT A; 2OI3 A; 3REA B; 1JQQ A; 2DRK A; 3QWY A; 3I5R A; 1Z9Q A; 2O88 A; 2RPN A; 2F2W A; 4JJC A; 2DX1 A; 1U06 A; 2D8H A; 1PWT A; 2HEQ A; 3SHW A; 1M3A A; 2EYY A; 2ROL A; 1ZUK A; 4J9E A; 4OML A; 4JZ3 A; 2G6F X; 2F2V A; 1CSK A; 1X43 A; 2CT4 A; 2EW3 A; 4CC3 A; 1MUZ A; 1V1C A; 2JXB A; 4LUE A; 1NLP C; 2EYX A; 4Y92 A; 3O5Z A; 4J9C A; 1BBZ A; 4EIK A; 1T0H A; 2M0Y A; 2LJ0 A; 4F14 A; 3VRZ A; 1HJD A; 1M3B A; 4CC7 A; 2D0N A; 2ABL A; 1AOJ A; 2YUO A; 2EQI A; 2CDT A; 1WXU A; 4Z88 A; 2A37 A; 4HVU A; 2LNH B; 2J6F A; 4RTU A; 1QWF A; 3VS4 A; 2K9G A; 1A0N B; 3PE0 A; 1UHF A; 2DL8 A; 3EGU A; 1Y57 A; 2EYZ A; 2NWM A; 1B07 A; 1UUE A; 4OMP A; 3EG0 A; 2KRO A; 1KFZ A; 2PTK A; 2RQW A; 5IHI A; 2KBT A; 2RQU A; 1X69 A; 4RUG A; 2LMJ A; 2FRW A; 4JJB A; 3VS3 A; 4LUD A; 2AZS A; 2GBQ A; 2V1R A; 2YUP A; 5IHK A; 4IIM A; 4R0K A; 2PZ1 A; 2CUB A; 2JMC A; 4J9G A; 2RN8 A; 2FPD A; 2AKK A; 1IO6 A; 1TUC A; 4J9D A; 2X3W D; 2GTJ A; 2LQW A; 2EVR A; 2PNI A; 3EG3 A; 4JJD A; 1RUW A; 1GBR A; 1NEB A; 5HCK A; 4D8K A; 2E5K A; 1WLP B; 1UHC A; 3M0R A; 3NGP A; 3KFV A; 2LP5 A; 1T3L A; 1HD3 A; 2FPE A; 1W6X A; 2DRM A; 3VS5 A; 1PKT A; 1ABQ A; 2DE0 X; 1M8M A; 3VRY A; 3C0C A; 2DNU A; 2DL4 A; 3CQT A; 4AFU C; 4Z89 A; 1AD5 A; 3EG2 A; 1G83 A; 2YUQ A; 1T0J A; 4K11 A; 1AZG B; 2DLP A; 4OMQ A; 2MIO A; 3M0S A; 1QKX A; 2K2M A; 2HCK A; 4HXJ A; 1U5S A; 2AKL A; 1AZE A; 1SHF A; 4RTT A; 4JPB W; 1M30 A; 1PRM C; 3H0I A; 3I9Q A; 2X3X D; 4FSS A; 4AFS C; 3TSZ A; 3EHQ A; 3R6N A; 1HSQ A; 2YUN A; 1GCQ C; 1GFC A; 2LJ1 A; 1ARK A; 2RMO A; 1RI9 A; 5IXB A; 3A98 A; 5IHN A; 2OJ2 A; 2B86 A; 4OMM A; 2LX7 A; 2CUD A; 4HVV A; 2W0Z A; 3SEM A; 1ZBJ A; 1KSW A; 2KGT A; 1UTI A; 3NPF A; 3H0H A; 1S1N A; 2EGC A; 1X27 A; 2HBW A; 2RQT A; 1VYT A; 1YWP A; 3RBB B; 4D8D A; 5GJW B; 2LCS A; 2V1Q A; 3IQL A; 1E6G A; 3VS0 A; 1M3C A; 2L2P A; 2LQN A; 1WX6 A; 1JXM A; 2JM8 A; 1WIE A; 4GLM A; 2DMO A; 2RQR A; 4F16 A; 4RTV A; 3I35 A; 1TG0 A; 5IXF A; 2DBK A; 1SRM A; 2JW4 A; 3M0U A; 1Y0M A; 2LJ3 A; 3EHR A; 1YNZ A; 1K0S A; 1E7O A; 2RNA A; 1J3T A; 1AWJ A; 2ED1 A; 4RTX A; 1JXO A; 2L3P A; 2VWF A; 5FWB A; 1GCQ A; 1UEC A; 2YT6 A; 1NLO C; 1YP5 A; 4X1V A; 2YDL A; 1OOT A; 4LE9 A; 1B3Q A; 1RLP C; 2HSP A; 1GCP A; 2ED0 A; 3M0P A; 1JEG A; 1JO8 A; 1AVZ C; 1OPL A; 1RLQ C; 1K1Z A; 1VA7 A; 3M0Q A; 2ESW A; 1K0X A; 1MV0 B; 2KT1 A; 2EGA A; 2XMF A; 4RTY A; 1QCF A; 2K6D A; 2HDA A; 1CKA A; 3H41 A; 3I5S A; 2LZ6 B; 1SPK A; 1W70 A; 1K76 A; 1QLY A; 2CH4 W; 3UAT A; 2O31 A; 2JMA A; 1T3S A; 2A28 A; 1ZLM A; 1OEB A; 1VYV A; 5ECA A; 2BZ8 A; 2JT4 A; 5I11 A; 1PNJ A; 1XOV A; 4WCI A; 1WXB A; 3ZL7 C; 1SHG A; 3TSW A; 1G2B A; 2KYM A; 1UJ0 A; 2K3B A; 3VS7 A; 1X2Q A; 1WFW A; 2EGE A; 5GJV B; 2DJQ A; 1U3O A; 2L0A A; 3VS6 A; 2O2O A; 2BZY A; 4M4Z A; 1AWX A; 3U23 A; 1AEY A; 1PRL C; 3JV3 A; 3QWX X; 4HVW A; 1W1F A; 1CKB A; 1I07 A; 2JTE A; 3TVT A; 4CC2 A; 1GL5 A; 2F2X A; 1X6B A; 2KNB B; 4DEY A; 2CT3 A; 1WDX A; 2FEI A; 5FW9 A; 1WYX A; 2W10 A; 1BK2 A; 4OMN A; 1KIK A; 2L3S A; 2FPF A; 2KYB A; 2MCN A; 1FMK A; 3PVL A; 2FRY A; 4J9B A; 4J9F A; 5I22 A; 1SEM A; 2ECZ A; 2JS0 A; 3VS2 A; 4E6R A; 3H0F A; 1ZUY A; 2J6K A; 2DL3 A; 2DM1 A; 2K7A A; 2CH4 A; 2J7I A; 1UGV A; 2GTO A; 2EYW A; 1E6H A; 4F17 A; 2C0T A; 1WA7 A; 1UFF A; 5EC7 A; 1K9A A; 1KJW A; 4LN2 A; 1K4U S; 2ROT A; 2QDL A; 1LCK A; 2DYB A; 4GBQ A; 4IIO A; 3LH5 A; 1X6G A; 4LNP A; 2RQV A; 1OPK A; 4AFZ C; 1ZSG A; 2VVK A; 2CSQ A; 2NUZ A; 1NEG A; 2BZX A; 1UDL A; 2J6O A; 1UJY A; 2K79 A; 2OAW A; 1GBQ A; 1NM7 A; 1ZX6 A; 2DA9 A; 3REB B; 2C0O A; 2J06 A; 4QT7 A; 2P4R A; 4ORZ A; 3THK A; 4CC4 B; 2L3Q A; 2KR3 A; 1GFD A; 2EKH A; 5L23 A; 2A36 A; 1PKS A; 2KXD A; 2I0N A; 2AZV A; 4A63 B; 1YWO A; 1Z9Z A; 2SRC A; 4ESR A; 3FJ5 A; 1GRI A; 3NHN A; 2FO0 A; 3ULR B; 2IIM A; 2GGR A; 4AG2 C; 2KT8 A; 4JZ4 A; 2C0I A; 3M0T A; 1X2K A; 1SRL A; 2EPD A; 2KEA A; 1QKW A; 1PHT A; 1AWO A; 1SSH A; 1UG1 A; 2M51 A; 1FYN A; 3UF4 A; 1ABO A; 3GBQ A; 1YCS B; 1H8K A; 2J05 A; 2KXC A; 2KRM A; 3UA6 A; 2KRS A; 1WI7 A; 1BU1 A; 2DF6 A; 2GNC A; 2JS2 A; 2RF0 A; 3UA7 A; 4AFQ C; 2D8J A; 1UE9 A; 1NYG A; 2H8H A; 2CRE A; 2VKN A; 2BTT A; 1TUD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4C8Q E; 4L5G A; 2DVJ A; 2X4Y A; 3QO3 A; 1OU8 A; 1MV3 A; 4Z02 A; 3VS1 A; 2DXT A; 2FG0 A; 4M78 A; 2MYS A; 2QA4 A; 2A08 A; 1VQ9 A; 4ZTF A; 4OMO A; 5CR2 A; 3MET A; 5KCH A; 2O9V A; 1VQP T; 3A8O B; 1JB0 E; 1PC0 A; 2X4W A; 4M75 B; 1YI2 A; 3QDR B; 2XDP A; 2SEM A; 2RM4 A; 4J9I A; 4RCC A; 2AT1 B; 3FC3 A; 1VQL Q; 1YN8 A; 1D1A A; 4HA8 A; 2KE9 A; 4L6V 5; 1JU5 C; 1IGQ A; 2QQA A; 2KMT A; 4FSX A; 2DRK A; 3QWY A; 2ATC B; 3TU4 K; 1OZ3 A; 2F2W A; 2D8H A; 4FYY B; 4C0F A; 3OQ5 A; 1RAA B; 3CC4 Q; 3RER A; 4J7I A; 4A4F A; 2EYY A; 3LYI A; 1ZQ1 A; 2ROL A; 3N5B B; 4J9E A; 3OYF A; 1C6V X; 1YJW Q; 3M5A A; 2DYI A; 4M77 F; 3CXC A; 3CCM T; 1VQL A; 2CT4 A; 3JB9 D; 1YJN A; 1IB8 A; 3PNW C; 1QVG S; 2K5L A; 3E2U A; 4JUV A; 4XU3 A; 4M75 E; 4J9C A; 1TWB A; 3TCJ A; 1M2V B; 1T0H A; 2LJ0 A; 2RH2 A; 2DXC A; 3CC4 A; 1M5Q 1; 3CPW S; 2CP6 A; 3L2Q A; 4KGV B; 2E3H A; 4QQG A; 2F5T X; 3C94 A; 2J6F A; 2K9G A; 4XTV A; 1WJS A; 1WNL A; 1YJW A; 2DL8 A; 2D6F A; 1PD1 A; 4OMP A; 1LNX A; 3WVD B; 4BB7 A; 2FZG B; 2DTI A; 2EKO A; 5IHI A; 4C8Q F; 3GP8 A; 1VQ4 Q; 1UB4 A; 3LGL A; 1K9M U; 1VQK A; 2FRW A; 5J39 A; 3BDU A; 2LCC A; 2AZS A; 3CD6 T; 3EG9 A; 4KGX B; 2HZY A; 5IHK A; 2CS7 A; 1RAB B; 4QVD A; 5AT1 B; 1X6O A; 2JMC A; 1QW1 A; 2RN8 A; 2YWW A; 1TUC A; 4J9D A; 2LQW A; 2EVR A; 3SFM A; 2GFU A; 3HRS A; 4E7S A; 3MP1 A; 4WF2 A; 1YIJ A; 1K73 R; 2E5K A; 1VQ4 A; 3NGP A; 3KFV A; 4PJL A; 3FJP A; 2KAF A; 4M7D A; 1JJ2 A; 3VS5 A; 2MF2 A; 2ZGW A; 1M8M A; 4M78 B; 3VRY A; 1K9M R; 4Z89 A; 1AD5 A; 2LRQ A; 3EG2 A; 2BKD N; 1AZG B; 3MPU B; 1VIF A; 2LVM A; 8AT1 B; 4BDZ A; 4R55 A; 1MGQ A; 3JCM c; 4FYX B; 3ASK A; 2HCK A; 3INZ A; 1VQ5 T; 4FYW B; 3QHS A; 4HXJ A; 3EGD A; 4JRQ A; 2VB6 A; 4JPB W; 1PRM C; 1G3W A; 3I9Q A; 2P0K A; 1HSQ A; 2BIV A; 1ARK A; 3LX7 A; 3VUZ A; 2E3I A; 3A98 A; 4M75 F; 3MEV A; 2B86 A; 1LPL A; 4OMM A; 4HVV A; 5DLO A; 2AIR B; 3SEM A; 3L2W A; 3MHX A; 2M1H A; 2BE7 D; 1G3Y A; 1S1N A; 3EFS A; 2R5M A; 3J7A F; 2ZPE B; 2XHC A; 1VYT A; 1G3S A; 4M78 E; 2RI3 A; 3QJY A; 3OYD A; 1K8A C; 4RMO A; 2DXU A; 1HK9 A; 3G71 A; 3D7S B; 1JXM A; 2DMO A; 4NOY A; 3R6O A; 1TG0 A; 4PJO F; 3DLM A; 4MZM A; 3G1J A; 2AHJ B; 2DBK A; 1ZA2 B; 3LGF A; 3MJX A; 1FMV A; 2FZC B; 1K0S A; 4C92 G; 1E7O A; 3QPH A; 3M55 A; 2ED1 A; 4MML A; 2RI5 A; 4N4H A; 4KT0 E; 2VC8 A; 2VWF A; 4MDX A; 2OTJ T; 1GCQ A; 1UEC A; 2YRV A; 1Y96 A; 5LJ3 f; 2QEX Q; 2HSP A; 4DOV A; 5GAM d; 2ESW A; 2LT4 A; 1YHQ Q; 4A54 A; 3CCQ Q; 4YTL A; 2DFU A; 1MV0 B; 3CME Q; 2HNI A; 5GAM h; 2HD0 A; 4BE2 A; 1QCF A; 1KQS S; 5GAM j; 3CBO A; 1NJI U; 5CK9 A; 2RJD A; 4JRI A; 5GMK m; 4J6W A; 5CIU A; 2R58 A; 3CCV A; 4F7U G; 2NUP B; 2A28 A; 1TU0 B; 3VKI A; 1OEB A; 3ER0 A; 3V8L A; 1M8V A; 2EWN A; 3JB9 H; 3S6W A; 4C92 C; 2HKN A; 5ECA A; 3L2V A; 4X9D A; 1PNJ A; 4FT2 A; 5KH6 A; 1IXD A; 3M56 A; 1BIA A; 3OYM A; 2HMA A; 1YHQ A; 1Q82 R; 1SHG A; 3CME A; 2KYM A; 4M7D B; 4HCC A; 2RJF A; 1VQ7 A; 2K3B A; 2E12 A; 2ZPG B; 4OGE A; 2DJQ A; 2BZY A; 1QVP A; 3U23 A; 1PRL C; 3VJP A; 4KUD K; 3EGX A; 4HVW A; 5LJ3 e; 1W1F A; 1CKB A; 3A8H B; 4WTO B; 1R0C B; 2F2X A; 1X6B A; 3JB9 F; 3QG1 A; 3CCS Q; 2FEI A; 4M78 F; 2DZ9 A; 3BE3 A; 5FW9 A; 2QDY B; 2FPF A; 1FMK A; 3PVL A; 2R57 A; 5J3B A; 1Q7Y U; 2D0Q B; 2ZAE A; 2HQX A; 1VQN Q; 1R77 A; 1KK7 A; 1ZUY A; 3RKW A; 4JS4 A; 2J6K A; 3Q1J A; 2DL3 A; 1WHJ A; 1ZA1 B; 1QVF A; 2DM1 A; 2K7A A; 4XU2 A; 2J7I A; 4M7D E; 2EYW A; 2EAY A; 1K4U S; 1OI1 A; 2DYB A; 4IIO A; 2JN0 A; 3CCS A; 3PFS A; 4M7A A; 1D0Z A; 2E70 A; 2VVK A; 2CSQ A; 2KDS A; 1KG1 A; 4C0D C; 1C1A A; 1NM7 A; 1ZX6 A; 2DA9 A; 2WAC A; 3REB B; 3OS2 A; 1VQN A; 1BCO A; 3OYC A; 1Q7Y R; 4C5E A; 2L3Q A; 2CP3 A; 4EMH A; 2DD5 A; 3CBM A; 3H9N A; 3M4Y A; 1GFD A; 2EKH A; 1WGS A; 1Q86 R; 2MWP A; 2XID A; 2E41 A; 1PKS A; 2I0N A; 3M4G A; 2AZV A; 3MEW A; 4BE1 A; 3NHN A; 3ULR B; 1S72 A; 1Y96 B; 3G6E Q; 3LH0 A; 1VQP Q; 3SWN A; 2KT8 A; 1G3T A; 1SRL A; 2EPD A; 3QZ9 B; 1QKW A; 2RD1 A; 1KD1 C; 3FEO A; 4C5I A; 3E9G A; 2YLB A; 4FW2 A; 1FYN A; 3CCR T; 4M7A D; 1ABO A; 2KXC A; 2KRM A; 2A0F B; 2EQU A; 2RO0 A; 1X75 C; 3HKS A; 2JS2 A; 2RF0 A; 3CC2 Q; 1YIT A; 2H8H A; 4DBQ A; 2CRE A; 1VQP A; 2M02 A; 5J26 A; 4C8Q G; 2KQW A; 3G7Z A; 9ATC B; 1W4S A; 2CP5 A; 1KC8 C; 3CCM Q; 4C5G A; 3UPU A; 3BFM A; 2KRN A; 2CSI A; 4V2S A; 1N5Z A; 1NG2 A; 3EGX B; 5CO7 A; 2CGH A; 4E7K A; 1NYF A; 4J9H A; 7AT1 B; 2EBP A; 1IRE B; 3JCM J; 3CCQ T; 4M7D F; 1OV3 A; 2DL5 A; 4ZNX A; 4XQ3 A; 1I1J A; 2RJE A; 1VYU A; 4AG1 C; 3OYB A; 3OSV A; 2DIL A; 3OYY A; 3QYH B; 4E2F B; 2QQ9 A; 3CCM A; 1WXT A; 2OI3 A; 4C8Q C; 1JQQ A; 3JB9 I; 4BY6 C; 2O88 A; 2DX1 A; 1U06 A; 2RHX A; 3OYG A; 1QCN A; 5DLQ E; 4E47 A; 3SHW A; 3QZ5 B; 1KQ1 A; 4C0Z A; 1U1T A; 1I5O B; 2V8K A; 5A0G A; 4M7A B; 4OMF B; 1QVG P; 2H3E B; 3GF5 A; 4JZ3 A; 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