1Y7WA

Crystal structure of a halotolerant carbonic anhydrase from dunaliella salina
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
NPNDGYDYMQHGFDWPGLQEGGTTKYPACSGSNQSPIDINTNQLMEPSSRSGTSAVSLNGLNVDGAQADGITLTNAKVDLEQGMKVTFDQPAANLPTIEIGGTTKSFVPIQFHFHHFLSEHTINGIHYPLELHIVMQEQDPADVATAQLAVIGIMYKYSENGDAFLNSLQTQIEGKIGDGTASYGDTGVSIDNINVKTQLLPSSLKYAGYDGSLTTPGCDERVKWHVFTTPREVTREQMKLFVDVTMGAHAGADVVNNRMIQDLGDREVYKYNY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Halotolerant alpha-type carbonic anhydrase (dCA II)
publication title Three-dimensional structure of a halotolerant algal carbonic anhydrase predicts halotolerance of a mammalian homolog.
pubmed doi rcsb
source organism Dunaliella salina
total genus 78
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-12-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1y7wA01
1RZAA 3OYSA 2HKKA 2VVBX 3IGPA 1CVFA 3RYXB 2FOUA 2VVAX 4GL1X 2O4ZA 1H9QA 4E5QA 1Y7WA 3KNEA 3MNAA 4QK2A 3HKQA 3MHCA 3S71B 1CVHA 1FR4A 4KUVA 4RUYA 4KV0A 1F2WA 3K34A 3P5LA 3S76A 2HNCA 5EHEA 5SZ1A 1CVEA 4ILXA 4ITOA 3M04A 1KEQA 3MHOA 3U7CA 3D9ZA 3D0NA 3DD8A 4Q7VA 3KOKA 4QIYA 3RZ1B 1ZNCA 3BETA 4QJMA 5JGTB 1CNBA 4PYYA 5BRUA 8CA2A 1FLJA 1HCAA 1URTA 6CA2A 4ZX1A 4XIWA 1CVCA 2CA2A 4C3TA 4ITPA 4YGKA 4KUWA 4RN4A 5G0CA 4YGNA 1HUHA 4Q87A 2GD8A 2ZNCA 2QO8A 4M2RA 1HCBA 3KS3A 3MNKA 3V2MA 1I9QA 3FFPX 3M5EA 5JEGB 3RYYA 1CAHA 4HBAA 3M96A 1G52A 5DRSA 4RFDA 4QIZA 3M67A 5J8ZA 3M3XA 5FLPA 5SZ0A 1MUAA 5C8IA 3SBHA 3M5TA 1CNXA 1BNQA 3M2YA 3L14A 3N0NA 3P58A 1G4OA 1OQ5A 1I9PA 3MHIA 3M5SA 3NI5A 4YGJA 1CNCA 3RLDA 5SZ7A 3DVDA 1TG3A 4KNNA 1OKLA 5BRWA 4G7AA 4N0XB 1CANA 4L5UA 3SAXA 1ZFKA 4WUPA 3DV7A 3MNHA 3UYNA 4Y0JA 4MTYA 5JEHB 1RZBA 1YDAA 4PXXA 4JSWA 1BCDA 3U47A 1JV0A 3KONA 1H4NA 1RAZA 1BNTA 1G45A 1Z97A 2NNSA 3HKNA 4MLXA 3SAPA 4CNXA 1FQMA 3IBLA 1BN4A 3DC3A 4QSJA 4Q09A 5FLQA 3N4BA 3NJ9A 3HKTA 4KP8A 2CBAA 4Q9YA 1TEUX 1I9OA 1I8ZA 1I90A 3S74B 1CNYA 4XIXA 5DSIA 3M2XA 1DMYA 1YDDA 2EZ7A 3S75B 4IDRX 1BICA 1CA3A 3HLJA 5JG5B 4ZAOA 2NNOA 3C7PA 3ML2A 1ZSAA 4RIVA 3S9TA 1CVAA 1CAMA 1CRAA 3CAJA 3ML5A 2FMGA 3M40A 4YX4A 1MOOA 3RYVB 3IBIA 1ZE8A 3M1QA 5EH7A 3RZ8A 3V3FA 4E4AA 1CAKA 3T5ZA 2WEOA 4Q7WA 4RUZA 3DCWA 2CBEA 5DSQA 3Q31A 5EH8A 2FOSA 5DSJA 1TBTX 1CNJA 2FOVA 4Q06A 1TH9A 5JDVB 5FDIA 4E49A 2IT4A 2WD2A 2AX2A 1RZCA 5FL6A 4QSAA 4M2UA 4KNMA 1ZFQA 1LZVA 1ZGEA 4K0SA 1UGDA 4Z1JA 3LXEA 3W6HA 4K1QA 3MHLA 4RH2A 5E5RA 5EKJA 3P4VA 4Q8XA 1TTMA 2CBDA 5A6HA 5FNKA 12CAA 3M2NA 4QJPA 1XQ0A 3IEOA 4E9OX 1H9NA 1UGCA 4WW8A 1CAOA 5BRVA 3UYQA 3NB5A 4WL4A 2QOAA 3D8WA 4YGFA 4QK3A 1HEDA 4ZWIA 2WEGA 4R5AA 1CALA 5AMGA 5G0BA 2FOYA 1LG6A 3HKUA 4N16A 4YHAA 4JSZA 4LU3A 1FQLA 4WUQA 1G3ZA 5JQTA 5FLOA 1DCBA 2NMXA 2NNGA 5JEPB 4Q90A 4LHIA 3T82A 2X7UA 2HOCA 5EH5A 4BF1A 5EHWA 3U45X 4FL7A 3OKVA 3RG3A 1CNGA 4UOVA 4ETQC 4RFCA 1TG9A 4FIKA 1IF7A 1RJ6A 3OYQA 4TWMA 4Z1NA 1G4JA 5E5UA 4QTLA 3OKUA 1BZMA 4XE1A 1JD0A 3B1BA 3RGEA 3CA2A 5SZ4A 1UGAA 1CZMA 5DSRA 4BCWA 4PYXA 3DD0A 1BNNA 9CA2A 1A42A 4MLTA 4CNVA 4CNWA 2Q1QA 3T83A 3P55A 3HFPA 4Q7PA 2EU2A 3BL1A 4Q6EA 3CZVA 4RUXA 1CA2A 1TB0X 3CYUA 3B4FA 5E2KA 3KOIA 5L3OA 5AMDA 1DCAA 1CILA 4Z0QA 1G0EA 4QSBA 5IPZA 2ABEA 1KOPA 5E28A 3S97A 5LMDA 3MWOA 3P3JA 1I9NA 5DOHA 3GZ0A 4QJXA 1TEQX 3BL0A 3N3JA 2EU3A 5JG3B 1RJ5A 1G53A 1I9MA 1CNWA 3PJJA 1UGBA 3OIKA 4BF6A 2NWZA 1V9IC 5BNLA 5CACA 5DSLA 3V5GA 2NN1A 1CNKA 5DOGA 3M2ZA 1XEVA 2HL4A 4M2VA 1T9NA 1TE3X 5HPJA 1ZSCA 1FR7A 1UGFA 4G0CA 2Q1BA 4HEYA 4FVNA 5CJFA 4TWLA 1CAIA 1BNVA 1KOQA 1HUGA 1I91A 2X7SA 3MNUA 4DZ9A 4QY3A 3ZNCA 1RAYA 1IF4A 2OSFA 3KLDB 5DSPA 3DBUA 4HU1A 5G01A 2WEJA 3RYJB 1RZEA 3KKXA 4YXOA 4YXIA 4Q6DA 1CCTA 1BNUA 1HEAA 3OILA 3P44A 4L5WA 4CNRA 2FW4A 4X5SA 1CCSA 2NN7A 3S78B 4Q49A 2X7TA 5E2MA 4QK1A 4JSAA 2NWYA 3DVCA 5G03A 3M1KA 5L6KA 1CIMA 1CRMA 5E2SA 3IBUA 3RZ0B 5FNJA 3P5AA 1G48A 5FLSA 1BNMA 1HECA 5FDCA 3R17B 4MDGA 1XPZA 5DVXA 3MZCA 4K0TA 4Q81A 3DCCA 4R5BA 4COQA 3QYKA 2F14A 2CBBA 4K13A 2POWA 3VBDA 4MO8A 3F7BA 1CCUA 4M2WA 4QJWA 4YVYA 4QEFA 1UGGA 3RZ5A 2NXSA 5E2NA 3W6IA 1Z93A 3MMFA 4Q8ZA 1CNIA 1G46A 3F7UA 7CA2A 4FPTA 1YDBA 4Q0LA 3K7KA 1HVAA 5EZTX 4YXUA 4XZ5A 3U3AX 5EHVA 3KIGA 1BNWA 1J9WA 1IF6A 4WW6A 1LGDA 4HT0A 3R16A 4JS6A 5EKHA 1UGEA 1CNHA 2NNVA 5SZ6A 5FNLA 4HT2A 3S72B 4CACA 1BN3A 2GEHA 3PYKA 4Z1EA 4L5VA 1CAZA 1XEGA 3MYQA 5FL5A 4Q78A 1CVDA 1FSQA 1Z9YA 1FSNA 3PO6A 3RJ7A 3F8EA 5SZ3A 4ZWZA 3MDZA 4R59A 2HD6A 4ZWYA 2AW1A 1ZGFA 5JGSB 1BN1A 3K2FA 1FSRA 1AVNA 1YO2A 3S73B 4JSSA 5FLRA 1CAJA 4Z1KA 2POUA 4QJ0A 3RG4A 4Q83A 3IAIA 4YGLA 5CLUA 3V3JA 5A25A 4MDLA 1IF8A 4MDMA 5CA2A 3MHMA 3DC9A 5EOIA 4FVOA 3V7XA 1FQRA 4CA2A 3V2JA 4E3DA 1KWRA 4KP5A 5FNHA 3FW3A 1YDCA 1CINA 2OSMA 4QJOA 4Q8YA 4KUYA 3D92A 4ZX0A 4Q08A 4ZWXA 1YO1A 5JQ0A 1G6VA 3RYZA 4KNIA 3DVBA 2QP6A 4KNJA 4CQ0A 2NWPA 1YO0A 2POVA 3IBNA 4Q99A 3P3HA 3V3GB 2FNMA 4YYTA 3HS4A 1LUGA 3S77B 3D93A 3M1WA 3F4XA 5SZ5A 1LG5A 5DSKA 3TMJA 3EFIA 5DSMA 5DSOA 3S8XA 1DMXA 3JXHC 3JXGA 4PZHA 5DSNA 2H15A 3TVOX 1V9EA 3RZ7A 4LP6A 1G54A 5FLTA 3SBIA 2W2JA 5JESB 1IF5A 1IF9A 3KWAA 4WR7A 3JXFA 3V3IB 4QSIA 3M1JA 5FL4A 1JCZA 4KAPA 1CVBA 1ZH9A 3ZP9A 2FMZA 3EFTA 1BV3A 2WD3A 1I9LA 5E2RA 2FNKA 4PQ7A 1RZDA 4E3GA 2HFWA 2H4NA 3M98A 5AMLA 4Q7SA 1FQNA 5FNIA 3DA2A 4IWZA 1EOUA 2ILIA 4HF3A 1KWQA 4RIUA 4YWPA 1AM6A 5FNGA 3MNIA 1G1DA 2WEHA 1OKMA 3MNJA 3OY0A 3N2PA 3T85A 5BYIA 1HEBA 4HEWA 3V3HB 1ZSBA 2CBCA 3DAZA 1CAYA 3M14A 1G0FA 3T5UA 1THKA 5FNMA 3T84A 4K0ZA 4FU5A 2NXTA 2FOQA 1AZMA 3OIMA 5SZ2A 4XFWA 4FRCA 4DZ7A 5EKMA 2NXRA 3DCSA 4HEZA 3TVNX 1OKNA 2Q38A 2FNNA 4Q07A 4E3HA 2NWOA 3FE4A 4E3FA 2CABA 5EIJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1RZA A;  3OYS A;  2HKK A;  2VVB X;  3IGP A;  1CVF A;  3RYX B;  2FOU A;  2VVA X;  4GL1 X;  2O4Z A;  1H9Q A;  4E5Q A;  1Y7W A;  3KNE A;  3MNA A;  4QK2 A;  3HKQ A;  3MHC A;  3S71 B;  1CVH A;  1FR4 A;  4KUV A;  4RUY A;  4KV0 A;  1F2W A;  3K34 A;  3P5L A;  3S76 A;  2HNC A;  5EHE A;  5SZ1 A;  1CVE A;  4ILX A;  4ITO A;  3M04 A;  1KEQ A;  3MHO A;  3U7C A;  3D9Z A;  3D0N A;  3DD8 A;  4Q7V A;  3KOK A;  4QIY A;  3RZ1 B;  1ZNC A;  3BET A;  4QJM A;  5JGT B;  1CNB A;  4PYY A;  5BRU A;  8CA2 A;  1FLJ A;  1HCA A;  1URT A;  6CA2 A;  4ZX1 A;  4XIW A;  1CVC A;  2CA2 A;  4C3T A;  4ITP A;  4YGK A;  4KUW A;  4RN4 A;  5G0C A;  4YGN A;  1HUH A;  4Q87 A;  2GD8 A;  2ZNC A;  2QO8 A;  4M2R A;  1HCB A;  3KS3 A;  3MNK A;  3V2M A;  1I9Q A;  3FFP X;  3M5E A;  5JEG B;  3RYY A;  1CAH A;  4HBA A;  3M96 A;  1G52 A;  5DRS A;  4RFD A;  4QIZ A;  3M67 A;  5J8Z A;  3M3X A;  5FLP A;  5SZ0 A;  1MUA A;  5C8I A;  3SBH A;  3M5T A;  1CNX A;  1BNQ A;  3M2Y A;  3L14 A;  3N0N A;  3P58 A;  1G4O A;  1OQ5 A;  1I9P A;  3MHI A;  3M5S A;  3NI5 A; 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 1CCS A;  2NN7 A;  3S78 B;  4Q49 A;  2X7T A;  5E2M A;  4QK1 A;  4JSA A;  2NWY A;  3DVC A;  5G03 A;  3M1K A;  5L6K A;  1CIM A;  1CRM A;  5E2S A;  3IBU A;  3RZ0 B;  5FNJ A;  3P5A A;  1G48 A;  5FLS A;  1BNM A;  1HEC A;  5FDC A;  3R17 B;  4MDG A;  1XPZ A;  5DVX A;  3MZC A;  4K0T A;  4Q81 A;  3DCC A;  4R5B A;  4COQ A;  3QYK A;  2F14 A;  2CBB A;  4K13 A;  2POW A;  3VBD A;  4MO8 A;  3F7B A;  1CCU A;  4M2W A;  4QJW A;  4YVY A;  4QEF A;  1UGG A;  3RZ5 A;  2NXS A;  5E2N A;  3W6I A;  1Z93 A;  3MMF A;  4Q8Z A;  1CNI A;  1G46 A;  3F7U A;  7CA2 A;  4FPT A;  1YDB A;  4Q0L A;  3K7K A;  1HVA A;  5EZT X;  4YXU A;  4XZ5 A;  3U3A X;  5EHV A;  3KIG A;  1BNW A;  1J9W A;  1IF6 A;  4WW6 A;  1LGD A;  4HT0 A;  3R16 A;  4JS6 A;  5EKH A;  1UGE A;  1CNH A;  2NNV A;  5SZ6 A;  5FNL A;  4HT2 A;  3S72 B;  4CAC A;  1BN3 A;  2GEH A;  3PYK A;  4Z1E A;  4L5V A;  1CAZ A;  1XEG A;  3MYQ A;  5FL5 A;  4Q78 A;  1CVD A;  1FSQ A;  1Z9Y A;  1FSN A;  3PO6 A;  3RJ7 A;  3F8E A;  5SZ3 A;  4ZWZ A;  3MDZ A;  4R59 A;  2HD6 A;  4ZWY A;  2AW1 A; 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 2WD3 A;  1I9L A;  5E2R A;  2FNK A;  4PQ7 A;  1RZD A;  4E3G A;  2HFW A;  2H4N A;  3M98 A;  5AML A;  4Q7S A;  1FQN A;  5FNI A;  3DA2 A;  4IWZ A;  1EOU A;  2ILI A;  4HF3 A;  1KWQ A;  4RIU A;  4YWP A;  1AM6 A;  5FNG A;  3MNI A;  1G1D A;  2WEH A;  1OKM A;  3MNJ A;  3OY0 A;  3N2P A;  3T85 A;  5BYI A;  1HEB A;  4HEW A;  3V3H B;  1ZSB A;  2CBC A;  3DAZ A;  1CAY A;  3M14 A;  1G0F A;  3T5U A;  1THK A;  5FNM A;  3T84 A;  4K0Z A;  4FU5 A;  2NXT A;  2FOQ A;  1AZM A;  3OIM A;  5SZ2 A;  4XFW A;  4FRC A;  4DZ7 A;  5EKM A;  2NXR A;  3DCS A;  4HEZ A;  3TVN X;  1OKN A;  2Q38 A;  2FNN A;  4Q07 A;  4E3H A;  2NWO A;  3FE4 A;  4E3F A;  2CAB A;  5EIJ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RZA A;  3OYS A;  2HKK A;  2VVB X;  3IGP A;  1CVF A;  3RYX B;  2FOU A;  2VVA X;  4GL1 X;  2O4Z A;  1H9Q A;  4E5Q A;  1Y7W A;  3KNE A;  3MNA A;  4QK2 A;  3HKQ A;  3MHC A;  3S71 B;  1CVH A;  1FR4 A;  4KUV A;  4RUY A;  4KV0 A;  1F2W A;  3K34 A;  3P5L A;  3S76 A;  2HNC A;  5EHE A;  5SZ1 A;  1CVE A;  4ILX A;  4ITO A;  3M04 A;  1KEQ A;  3MHO A;  3U7C A;  3D9Z A;  3D0N A;  3DD8 A;  4Q7V A;  3KOK A;  4QIY A;  3RZ1 B;  1ZNC A;  3BET A;  4QJM A;  5JGT B;  1CNB A;  4PYY A;  5BRU A;  8CA2 A;  1FLJ A;  1HCA A;  1URT A;  6CA2 A;  4ZX1 A;  4XIW A;  1CVC A;  2CA2 A;  4C3T A;  4ITP A;  4YGK A;  4KUW A;  4RN4 A;  5G0C A;  4YGN A;  1HUH A;  4Q87 A;  2GD8 A;  2ZNC A;  2QO8 A;  4M2R A;  1HCB A;  3KS3 A;  3MNK A;  3V2M A;  1I9Q A;  3FFP X;  3M5E A;  5JEG B;  3RYY A;  1CAH A;  4HBA A;  3M96 A;  1G52 A;  5DRS A;  4RFD A;  4QIZ A;  3M67 A;  5J8Z A;  3M3X A;  5FLP A;  5SZ0 A;  1MUA A;  5C8I A;  3SBH A;  3M5T A;  1CNX A;  1BNQ A;  3M2Y A;  3L14 A;  3N0N A;  3P58 A;  1G4O A;  1OQ5 A;  1I9P A;  3MHI A;  3M5S A;  3NI5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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