The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKAAWSKVGGHAGEYGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSDLSNLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chains
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| publication title |
A new relaxed state in horse methemoglobin characterized by crystallographic studies.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WCU A; 1NQP A; 4XS0 B; 1C7B A; 1HBB A; 2DXM B; 3WCV A; 1UIW B; 2VEE A; 1JP8 A; 1NIH A; 2DN2 B; 1DWT A; 2SPM A; 3QJB A; 5CNF A; 3GQG B; 1EWA A; 1EMY A; 3FS4 B; 1V75 B; 1MTI A; 1HDS A; 1L2K A; 1CMY A; 1YE0 A; 3D7O B; 4N7N A; 1CO9 A; 1Y85 A; 1O1L B; 1TU9 A; 4UIQ A; 1ABY A; 1YGD A; 1JY7 A; 1YEV B; 1J3Y B; 1ASH A; 5KKK A; 1V07 A; 3GYS B; 3LR7 A; 1YMB A; 1BBB B; 1HGB B; 1RQA B; 1Y7D A; 1VXB A; 3V2Z A; 2D6C A; 4N7O A; 1Y0D B; 1MNI A; 2FRI X; 2DN3 A; 1HV4 A; 1XZ5 B; 2ZLT B; 1O1I A; 3IC2 B; 5CMV A; 3PI9 B; 1GCV B; 1YMA A; 2QRW A; 1CIO A; 1VWT B; 1YHU A; 4O2G A; 2ZLU B; 3AQ5 A; 1Y31 B; 3UHI A; 2W6V B; 1S5Y B; 1Y4P A; 2MGJ A; 1DKE B; 1GBV B; 1OUT B; 3PEL B; 1O1K A; 1Y4R A; 3S66 B; 1ECD A; 3E5O A; 3UHD A; 1CG8 B; 3S48 C; 5KER B; 4TWV A; 2ZLW B; 3SDN A; 3VRG A; 1HBH B; 1FDH A; 3WTG B; 1YEU B; 1DO3 A; 2LH7 A; 3ONZ A; 2MGD A; 3S1J A; 4VHB A; 1B86 B; 1MGN A; 4NZI A; 2D2M B; 2QSS B; 1MLF A; 3QQR A; 1Y2Z A; 2GKM A; 1U7R A; 1FCS A; 2D60 B; 2R80 B; 1JZK A; 2ZT4 A; 3OZW A; 4HHB B; 4DC8 A; 3VRE B; 2LH2 A; 3WFX A; 1G0B B; 1Y4B A; 1MLU A; 1A4F A; 2HBS A; 3EOK A; 1IWH B; 4N7P B; 1Y7Z B; 2HBC A; 2O5Q X; 1V9Q A; 3G4Y A; 4NK2 A; 1MWC A; 1DM1 A; 2QLS A; 3BOM A; 2ZT1 A; 2OLP A; 1Y0C B; 3MN0 A; 2R4X A; 2MHB A; 1GDI A; 1JEB A; 1V4X A; 2AUO A; 1LFL A; 3LB4 A; 1COH B; 2EVK A; 2BLI A; 3UI0 A; 1JF3 A; 2LH5 A; 1V5H A; 1LFQ A; 1HCO A; 1Y5K B; 106M A; 4TWU A; 1S0H B; 3ZOM A; 1YDZ A; 1YZI A; 1AJ9 A; 2BWH A; 2H35 B; 4MQH B; 1NZ5 A; 4TYX A; 2QSP A; 1LH5 A; 1J41 A; 1QSH A; 1MKO B; 1N9F A; 2VYZ A; 2HHB B; 1RVW A; 3EU1 B; 3BCQ A; 1O1M B; 2IN4 A; 3LB3 A; 4UUR A; 4O4T A; 1BZP A; 1Q1F A; 2LH3 A; 1CH3 A; 1CH4 A; 6HBW A; 1J3Z B; 3MKB B; 2ZLV A; 4F6B A; 1Y8K A; 1X9F C; 2HZ2 A; 1SDL B; 3WCT C; 1W92 A; 3GKT A; 3W4U A; 1T1N B; 1JWN A; 4MQC A; 1CLS B; 1M9P A; 3ODQ B; 2ZSO A; 1AJH A; 5ILP A; 2W6W A; 3HXN B; 4FWY A; 3PI1 A; 1AZI A; 1MLL A; 1Y4G A; 1J7W A; 1O1O A; 5E29 B; 1G08 B; 1O16 A; 1A0U A; 1UVX A; 1Y0W B; 5EUI B; 4YU3 B; 1IDR A; 2ZSP A; 1H97 A; 2AV3 A; 4MQG A; 3TM3 A; 1MLM A; 2MBW A; 2SPN A; 1LFZ A; 1YEO A; 4B3W A; 1C7C A; 5CHQ A; 4F6D A; 2PEG A; 3WCW B; 1YVQ A; 1HAC A; 3G4R A; 4OOD A; 3S65 B; 1SHR B; 1R1X A; 2OIF A; 4HRR A; 1DUO A; 7HBI A; 3ZJM A; 2HHE A; 1LFT A; 2V1H A; 4ROL B; 1HGA B; 1KD2 B; 1A01 A; 1J7S A; 1N9X A; 1F5O A; 1A6N A; 3GQP B; 5EE4 D; 1YIH A; 3PIA B; 3WFU A; 2W31 A; 1XYE B; 1Z8U B; 2MGK A; 2FAL A; 3D17 B; 1A9W A; 1VRF A; 4HRT B; 2ZSN A; 1YOI A; 2R50 A; 3VRF B; 1H1X A; 3NL7 B; 3WHM B; 5AB8 A; 5HU6 A; 2MGG A; 2H8D A; 5SW7 B; 3NFE A; 1NZ3 A; 2HBG A; 1IRD B; 2AA1 A; 2B7H B; 1N9H A; 1Y5F A; 2R1H B; 3UH3 A; 3ZOL A; 1YIE B; 4M4A B; 4ODC A; 3NML A; 1GDJ A; 2HBF B; 3TM9 A; 5F0B A; 4DWU A; 3FH9 A; 3AT6 B; 2Z6N B; 3UHH A; 1XZ7 A; 3QJD A; 1Y0A A; 5EET A; 5HLX A; 3AG0 A; 3DR9 A; 1Y35 B; 1YGF A; 3WCU C; 3U3E A; 1C40 B; 1BVC A; 3QMA A; 3WCW D; 2QFK A; 4MU5 A; 5JDO E; 1J40 A; 3HRW B; 3DUT B; 1GLI A; 1XZ2 B; 3A59 B; 1DXT A; 4IRO B; 1X9F A; 1Y83 B; 1LTW A; 1NWN A; 1HBA B; 2Z8A A; 3WCT A; 5M3S A; 2QU0 A; 1HBI A; 4B4Y A; 4ESA B; 1MLJ A; 5HY8 B; 2H8F A; 3GQR B; 1CQ2 A; 1Y22 B; 2ZFB A; 4L7Y B; 3OO4 B; 1JL7 A; 1GBU A; 3QZX A; 1Y4F B; 1O1P B; 1R1Y B; 2GLN A; 1ABW A; 3PT7 B; 1K1K B; 4MQK B; 3WR1 B; 3CIU B; 1RQ4 B; 2VM0 A; 5E83 B; 1QSI A; 1A9W E; 4L2M A; 1OUU B; 1HLB A; 1YOG A; 1NZ2 A; 4QAU A; 3MJP B; 1GVH A; 2DC3 A; 1YHU C; 1YEQ A; 1BZ6 A; 1DLY A; 1S5X B; 1RPS A; 1Y09 B; 3K3U A; 3OVU C; 2RI4 A; 1HBR B; 1D8U A; 1MDN A; 3BJ3 A; 4NS2 A; 3A0G B; 1YEN B; 3UHK A; 1FHJ A; 2BLJ M; 1V4U B; 1Y7C A; 1CP5 A; 1JL6 A; 2VRY A; 4H07 A; 5EOH A; 1JZM A; 3HF4 B; 4YU4 B; 1Y45 A; 1Y7G B; 1UFJ A; 3ZJI A; 1QXD B; 2D5Z A; 2MGE A; 2ZS0 B; 1BZZ B; 1V4W B; 5CHR A; 1QXE B; 1XQ5 B; 1Y46 B; 4F6G A; 1HDB A; 3H58 A; 4NI1 B; 3ZHW A; 2FAM A; 4M4B B; 2G10 A; 3B75 B; 3UHZ A; 3UHR A; 3PT8 A; 3CY5 B; 2DN1 B; 1S56 A; 1Y8W A; 2VEB A; 1CPW A; 1LFY A; 1J7Y A; 1I3D A; 1YCB A; 1MBD A; 3QJC B; 2HBD A; 112M A; 1G0A B; 1A3N B; 2EKU A; 4AVD A; 4JAC A; 1GZX B; 3D4X A; 3M38 A; 3SZK A; 5CN5 A; 2YRS A; 4NK1 A; 3WCV B; 1RQ3 A; 3WCP A; 4BJA A; 1NIH B; 1CH2 A; 1DXV B; 3R5I A; 3QM6 A; 1YG5 B; 1YFF B; 3WI8 A; 3QJB B; 1G9V A; 5IKS A; 1K0Y A; 2D2M C; 3GOU A; 1CMY B; 3DHR A; 1XZV B; 3WFT A; 4N7N B; 1LH7 A; 3QM7 A; 4PQ6 A; 2AV0 A; 5E6E B; 2O5S X; 108M A; 3ZJH A; 1MLR A; 1NXF A; 3TLD A; 3HHB B; 1IBE A; 3IC0 B; 1LFV A; 2W6X A; 1FN3 A; 2ZFO C; 1UX9 A; 1JY7 B; 1MBN A; 1Y0T B; 1UIW A; 2D2N C; 3VAU A; 3UBC A; 1NS9 B; 3WFW A; 1Y4Q A; 5CN4 A; 3GQG A; 1HRM A; 1Y7D B; 2ZSX A; 2ZS0 D; 3ECZ A; 3UGY A; 3FS4 A; 4N7O B; 1S69 A; 1THB A; 1O1I B; 1MYI A; 3O89 A; 1N9I A; 4WJG 1; 1I3E A; 1EBC A; 109M A; 2LH1 A; 3RJ6 A; 1O1L A; 3UH7 A; 1Y8H A; 3QJE A; 1MBI A; 1YH9 A; 1HBS A; 1J3Y A; 2VLX A; 3GYS A; 1VXA A; 3UH6 A; 2MGB A; 1O1K B; 1BBB A; 1BVD A; 1HGB A; 3P5Q B; 1Y4V B; 3NG6 B; 1Y0D A; 3WCV D; 1SDK B; 2ZLT A; 1MYT A; 1YHR B; 2O5M X; 3PI9 A; 1UC3 A; 3R0G A; 2JHO A; 3UGZ A; 1MYG A; 3ED9 A; 1UX8 A; 1OFJ A; 1X46 A; 3G52 A; 3BJ1 A; 4G51 A; 3UHC A; 1LH1 A; 5D5R A; 1A00 B; 1SI4 A; 1F63 A; 1Y31 A; 2W6V A; 3UHB A; 1MYZ A; 1GBV A; 1HHO A; 3PEL A; 1A6G A; 4HBI A; 1DO7 A; 5D1V A; 1MNJ A; 5JDO C; 1CG8 A; 5KER A; 5EYS A; 2R4Y A; 1FLP A; 2FRJ X; 2AUP A; 4MBN A; 1HBH A; 3AT5 B; 3GKV B; 3KUN A; 4F6J A; 5EYJ A; 2HHD B; 3UHN A; 4WCH D; 2HBC B; 2MGM A; 1QPW B; 1FSX A; 2G0Z A; 1VXD A; 2DHB B; 4N8T A; 2ZSS A; 2QLS B; 4PQC A; 5AZR A; 2XKH A; 2MGH A; 2MYA A; 2WY4 A; 1JPB A; 2D2M A; 5MBN A; 1S61 A; 1JEB B; 4U8U C; 1B0B A; 1MNH A; 1NS6 B; 1V4X B; 4PQB A; 1Y5J A; 4NI0 B; 3UHT A; 1PBX B; 3KMF C; 1LFQ B; 3UHY A; 3NMM A; 2R80 A; 1NEJ B; 4HHB A; 107M A; 2MYE A; 1LH3 A; 1C7D A; 4ROM B; 3VRE A; 1CG5 B; 2NSR A; 1YZI B; 1IWH A; 4IT8 A; 4N7P A; 1Y7Z A; 1AJ9 B; 2ZFO A; 2AUR A; 1IRC A; 104M A; 3G46 A; 2D2N A; 1KFR A; 2W72 C; 1DXU A; 4NXA A; 5C6E B; 1KR7 A; 3UHV A; 1HAB A; 1QSH B; 2HCO A; 2ZT2 A; 2QMB A; 3RJN B; 5B84 A; 1RVW B; 1UVY A; 1WMU B; 2Z6T A; 1VXG A; 3BCQ B; 3OO5 B; 1BUW B; 2G0R A; 2ZSZ A; 3BJ2 A; 1NAZ A; 4F69 A; 2GRH A; 3MJU A; 6HBW B; 2ZLV B; 1LHS A; 1CH7 A; 3ASE A; 4MQJ A; 2GKN A; 2VHB A; 1JDO A; 4MQC B; 3G4W A; 1NPG A; 3ZJO A; 1Y4G B; 2HHB A; 4ZVB A; 3EU1 A; 1OFK A; 1J7W B; 1O1M A; 1O1N B; 1A0U B; 2GTL C; 3OJ1 A; 1U7S A; 2OH8 A; 2VYW A; 4F4O A; 102M A; 4MQG B; 1YVT B; 1YEO B; 3MKB A; 1MLQ A; 1MLO A; 1MNK A; 1NZ4 A; 2BK9 A; 5EQM A; 2PEG B; 1SDL A; 1YVQ B; 1T1N A; 5ILE A; 2RAO B; 1HAC B; 5HBI A; 1A3O A; 1MNO A; 1CLS A; 1VXH A; 105M A; 4AVE A; 1R1X B; 3HXN A; 2O5L X; 2V1J A; 5EV5 A; 1LFT B; 5HLQ A; 5E29 A; 1LJW A; 1J7S B; 103M A; 1MOA A; 1Y0W A; 3UHG A; 1A0Z B; 4FC3 A; 1YIH B; 3E55 A; 4OF9 A; 1MLN A; 1G09 B; 4U8U A; 2D5X A; 3GK9 A; 1ITH A; 1TES A; 4ILZ A; 1SHR A; 1XXT B; 4X0L A; 5HU6 B; 3KMF A; 1ECN A; 1MLK A; 1FAW B; 2EKT A; 1MBA A; 5CND A; 4MPM A; 1LH2 A; 2AUQ A; 4ROL A; 3NFE B; 1KD2 A; 4KN3 A; 4FWZ A; 1YHE A; 1XY0 A; 2MYB A; 5AZQ A; 2PGH A; 2QFN A; 1XZ4 B; 2ZSY A; 4ODC B; 2W72 A; 3PIA A; 3FH9 B; 3DHT A; 1HGC B; 1XYE A; 3M3B A; 3QJD B; 3D17 A; 4LPI A; 4MXL A; 5HAV A; 5CNB A; 4H0B A; 1YGF B; 3A5G A; 1M6M A; 3NL7 A; 3A2G A; 4UZV A; 2R4Z A; 2MGL A; 1MLS A; 1MLG A; 2ZS1 B; 4PNJ A; 3M39 A; 1YIE A; 2NX0 A; 1J40 B; 2Z6S A; 2MGI A; 2V1I A; 2GNV A; 1BZ1 B; 2HBF A; 1UFP A; 2SPL A; 1X9F B; 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3D4X B; 1MBC A; 2ZS0 A; 2ZLX A; 1BZZ A; 1V4W A; 1XQ5 A; 2YRS B; 1RQ3 B; 1ABS A; 3WCP B; 1HLM A; 3WCU B; 3R5I B; 2EVP A; 4M4B A; 1NQP B; 1C7B B; 1HBB B; 3A5A A; 2DN1 A; 4MQI A; 1MYM A; 1K0Y B; 2NRM A; 3GOU B; 2ZT0 A; 1SPG A; 3DHR B; 2BLH A; 3QJC A; 1HDS B; 5CN8 A; 3UHX A; 1DXD A; 1G0A A; 1YE0 B; 1GZX A; 1Y85 B; 1IBE B; 1LFV B; 1FN3 B; 4O35 A; 1ABY B; 1DXV A; 2GRZ A; 1YG5 A; 2EB8 A; 1YFF A; 4XS0 A; 1YGD B; 3MBA A; 2DXM A; 3UHW A; 4GZG A; 1Y4Q B; 2DN2 A; 1F5P A; 4DC7 A; 2MB5 A; 1THB B; 2V1K A; 2WTG A; 3HC9 A; 1XZV A; 3MYN A; 1V75 A; 1OR4 A; 2DN3 B; 1HV4 B; 1IT2 A; 3MOU A; 5E6E A; 1CIK A; 1Y8H B; 3QJE B; 1DXC A; 3D7O A; 1YH9 B; 3HHB A; 3K9Z A; 5CN6 A; 1YHU B; 1Y01 B; 3IC0 A; 2HZ3 A; 2CMM A; 1HBS B; 1Y0T A; 2HZ1 A; 4MXK A; 1NS9 A; 1Y4P B; 1MTK A; 1YEV A; 2MGC A; 2VYY A; 2OHB A; 2MYD A; 1OJ6 A; 3G53 A; 1MYF A; 1Y4R B; 3WCU D; 4NXC A; 1RQA A; 2SPO A; 4HSW A; 1XZ5 A; 3IC2 A; 3VRG B; 1GCV A; 4MAX A; 5EE4 C; 3BJ1 B; 4G51 B; 1URY A; 2BKM A; 4FH6 A; 1VWT A; 1SI4 B; 3HEN A; 4F6I A; 2G0V A; 3PI2 A; 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