The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSNPGAVMGNPKVKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLARHFGKDFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chains
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| publication title |
A new relaxed state in horse methemoglobin characterized by crystallographic studies.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NS9 A; 1R1Y A; 1DXD A; 1VXA A; 1M9P A; 3WCW C; 3UHC A; 2LH5 A; 2GRH A; 5B85 A; 1DWR A; 5CNF A; 4WJG 1; 1Y0D B; 105M A; 4U8U C; 1IWH B; 3A5A A; 3G4U A; 3MKB A; 2W6V B; 3PI3 A; 4DC7 A; 1O1N A; 2D2N A; 1GCW A; 1HGB A; 1A0U A; 1OJ6 A; 4X0L A; 1NQP B; 2HBC B; 3OZU A; 1ABY B; 2MHB B; 2HHD A; 1FN3 B; 2RI4 A; 3NMM A; 4FH6 A; 4MBA A; 4FWX A; 1UVY A; 3U3E A; 3R0G A; 5JGG A; 3K3U A; 3OO5 A; 3G4Y A; 4F6D A; 4N7N A; 1V5H A; 2DHB B; 5JOM A; 1YHU A; 3HXN A; 2G10 A; 1K0Y A; 1N9X A; 1O1M B; 4SDH A; 1Y4B A; 1MOH A; 5EE4 C; 4PQC A; 3GYS A; 1OFJ A; 3E55 A; 1HGA B; 3QJC B; 3FH9 A; 2LH1 A; 2YRS A; 1YEN B; 1CG5 B; 1MBI A; 2QMB B; 1YZI A; 3QJB B; 4NXA A; 4H2L A; 2ZT1 A; 4M4A B; 5ILM A; 3GKV B; 1MTJ A; 1LHS A; 1FSX B; 3UHS A; 2HBF B; 1MOC A; 2D5X B; 1A9W A; 5F0B A; 1YIH A; 1V4U A; 2OHA A; 3OVU C; 2DN3 B; 1QXD A; 1EBT A; 3WCP B; 2PGH B; 1JEB A; 2GKM A; 5HBI A; 3D4X A; 4M4B B; 2D5Z B; 4NI1 B; 1G9V A; 4B3W A; 1QXE B; 3UHK A; 1MCY A; 2HZ2 A; 5CN7 A; 4JAC A; 2DXM A; 5CNC A; 1JZM A; 1GLI B; 1HHO B; 4N8T A; 1VXH A; 1YOG A; 3KMF C; 1YGD A; 2MGE A; 2GDM A; 3UHE A; 2ZLX B; 1A4F A; 3WCV B; 1YEQ A; 1HBR B; 1PBX A; 3DHT A; 4F6I A; 4MQI B; 1XZV A; 2HBE B; 1BZP A; 106M A; 4YU4 A; 2HHB A; 1GBV B; 2ZS0 B; 2ZLT B; 3PI4 A; 5B84 A; 3G4V A; 3HEP A; 4MXL A; 1YFF A; 3NG6 A; 1LFQ A; 4ROL B; 2GNV A; 1YDZ B; 1BZ1 A; 4WCH D; 2GTL B; 1N9F A; 1ECO A; 1SWM A; 4ROM B; 1VXD A; 2EKU A; 1UVX A; 112M A; 1AJ9 A; 3S65 A; 4O2G A; 1YEV A; 1MBO A; 2V1I A; 1NXF A; 3QJD B; 1Y83 B; 3UI0 A; 4PQ6 A; 1MLS A; 1THB B; 3M38 A; 1AJG A; 2HBG A; 1S5X B; 1Z8U B; 1D8U A; 4O35 A; 5CN4 A; 1Y0W A; 4YU3 B; 1DTM A; 1XXT A; 4MPM A; 1GCV A; 1C40 A; 1Y2Z A; 1YEO A; 1A00 A; 2MGD A; 1M6C A; 4L7Y B; 1OR6 A; 3WFW A; 2BKM A; 2EVK A; 1SHR B; 1NPG A; 2Z6S A; 1DO3 A; 1V75 A; 1CLS A; 5KER B; 1G08 B; 1X3K A; 2VLZ A; 3UBC A; 1ABS A; 2VYY A; 2V1F A; 4XDI A; 1MWB A; 3GQR B; 1SDL B; 2DN1 B; 1MLU A; 3PI8 A; 4N7P B; 3RJ6 A; 1BUW A; 1JP6 A; 1JY7 A; 1XZ2 B; 2MGL A; 1XZ5 B; 4G1B A; 1NEJ A; 3ONZ B; 1S5Y B; 2HBD A; 3WCW B; 2AA1 B; 2BNL A; 1Y8K B; 4MQK B; 5CN8 A; 2SPN A; 3CY5 B; 1HBH A; 102M A; 3VHB A; 1HLB A; 3WCT A; 3EDA A; 1EWA A; 1V4X B; 4U8U B; 1CMY B; 3QZX A; 2D2N C; 2ZLW B; 3QMA A; 1AJH A; 1QPW B; 3VRG A; 1HAC B; 4HRR A; 1OUU B; 3VRF B; 1LH7 A; 2QLS B; 3AQ5 A; 1LFL A; 2QU0 B; 3WCU D; 1DXT A; 4QAU A; 2ZS1 A; 1YHU C; 1LFY A; 1KD2 A; 3NFE A; 1Y5F A; 2ZST A; 4H0B A; 4MU5 A; 4HHB B; 5AB8 A; 2M6Z B; 2G3H A; 2BLI A; 1HV4 B; 1O1J B; 1O1I B; 1GJN A; 1A9W E; 1QI8 B; 1MYG A; 4FC3 A; 3ZJL A; 1B86 B; 4F69 A; 1A0Z B; 1F63 A; 3A0G A; 1LFZ A; 1YH9 B; 1BZ6 A; 1RQA A; 1RPS A; 2HBS B; 3AG0 A; 3O89 A; 1LH3 A; 1IRC A; 5EU2 A; 3GLN A; 1LFT A; 3MBA A; 1Y4G B; 2V1K A; 1MOD A; 1Y8H B; 3CIU A; 1Y7D B; 1EW6 A; 4FH7 A; 1HBB B; 3D7O A; 5EUI A; 3UBV A; 1G0A B; 2O5M X; 5D1V A; 4MQJ A; 2BWH A; 2D2M A; 4IRO B; 1R1X B; 1HBS B; 2FRK X; 2GKN A; 3UHX A; 2V1E A; 3AT5 A; 4MQH A; 1CIK A; 1QSH A; 2R4W A; 2D6C A; 2H8F A; 1MYM A; 1YGF A; 2JHO A; 5JDO C; 2R4X A; 4NS2 A; 3BCQ A; 3QQR A; 5MBN A; 5ILP A; 1HDB A; 4ILZ A; 2O5O X; 1DXU A; 2FRI X; 1YHR A; 1NGK A; 1CG8 B; 1XY0 A; 1YIE B; 1YG5 A; 6HBI A; 1JWN A; 3A5G A; 1Y22 A; 1C7B B; 2HHE A; 1NS6 A; 3SZK A; 3W4U B; 3IC2 B; 1MYJ A; 1F65 A; 5CHQ A; 5E29 A; 1UIW A; 1MLH A; 1MKO A; 1GBU A; 4C0N A; 3WHM A; 2R80 B; 1MLM A; 1G0B A; 3A59 B; 2R4Y A; 2ZFO C; 2DC3 A; 1XZ7 B; 2XKH A; 1X9F B; 1NZ5 A; 3PT8 A; 2DN2 B; 1FAW A; 1Y0T A; 4TYX A; 2MBW A; 1V9Q A; 3EDB A; 3ZJO A; 1Y4F A; 2W6W A; 1HDS B; 1Y5K B; 5CN5 A; 1MLO A; 3EOK B; 3UH3 A; 1BVC A; 1Y0C A; 3EU1 A; 1VXC A; 5E6E B; 1Y8W B; 1RQ4 A; 4MQC B; 3K8B A; 1FSL A; 4G51 A; 4HRT A; 4F4O A; 5HU6 A; 2EB9 A; 1COH A; 4L2M A; 2AUQ A; 2ZS1 D; 1IOP A; 2O58 X; 3ZJN A; 4N7O A; 1GVH A; 1NIH A; 1BBB A; 2XYK A; 3AT6 A; 5E83 A; 1J7S B; 1MLL A; 2MGI A; 1Y0A B; 2ZSQ A; 109M A; 1U7S A; 1S0H A; 3ZH0 A; 4UIQ A; 3MJP A; 1MLJ A; 2G12 A; 2ZLV A; 3BOM A; 1DKE A; 3GQG A; 1Y4R A; 1RQ3 A; 3WCT C; 2LHB A; 1J40 A; 4NI0 B; 1B0B A; 1CQ2 A; 2D2N B; 1GCW B; 1K1K B; 1A0U B; 1O1P A; 1Y4Q B; 1QSI B; 2QSP B; 1XQ5 A; 3OO4 B; 3VRE B; 4UZV A; 1CPW A; 1YCB A; 4MBN A; 1FLP A; 1XZU A; 1Y4V A; 3BJ2 B; 1J7W B; 1MLQ A; 2RI4 B; 1NPF A; 1C7C B; 4O4Z A; 3ZHW A; 1Y35 B; 1IBE B; 3DHR A; 1NZ3 A; 2OH8 A; 1NZ2 A; 3ZJP A; 2ZSS A; 4DC8 A; 1JP8 A; 3OO5 B; 1CO8 A; 2EB8 A; 2MGK A; 4DWU A; 4KMV A; 1Y09 A; 1Y7Z A; 2BMM A; 3G4W A; 3WR1 B; 1YVT B; 110M A; 1Y4B B; 2D60 A; 1BZZ A; 3HHB A; 1A3N B; 3D17 B; 2ZSN A; 3WFU A; 3GDJ A; 5CNG A; 1SDK A; 1MLG A; 5SW7 B; 1ITH A; 3PT7 A; 5C6E B; 1MLR A; 1SPG A; 3R5I A; 1Y45 B; 3P5Q A; 5F2A A; 1HDA A; 3LQD A; 3PIA A; 3GOU B; 1UMO A; 2QFN A; 1U7R A; 4AVE A; 2D2M C; 1YE0 B; 2WTG A; 1F5P A; 1Y0D A; 4F6J A; 5EET A; 1IWH A; 2AV3 A; 1O1K B; 2GLN A; 2W6V A; 2Z6N B; 7HBI A; 3GQP B; 3G46 A; 1NQP A; 2HBC A; 1N9I A; 1ABY A; 2MHB A; 1FN3 A; 1LFV B; 3WFT A; 3A5B A; 1VWT B; 3D1A B; 1O1L B; 3UHG A; 1FHJ B; 5CNE A; 4NXC A; 2HHB B; 2W72 C; 2DHB A; 1DWS A; 1HJT A; 1VXE A; 1YE2 B; 4BJA A; 3LR9 A; 1C7D B; 1O1M A; 2O5Q X; 3HRW B; 1X9F D; 2VYZ A; 1CP0 A; 3PEL B; 1MYI A; 1M6M A; 3WCU A; 1HGA A; 3QJC A; 103M A; 1YEN A; 3QJE B; 1CG5 A; 2QMB A; 3QJB A; 2ZFO B; 1BVD A; 1EMY A; 1WMU B; 4M4A A; 107M A; 2BLH A; 5CNB A; 3GKV A; 1FSX A; 2MYB A; 1BZ0 B; 4MAX A; 1BIN A; 2D5X A; 1Y7G B; 1XXT B; 2DN3 A; 4UUR A; 1YOI A; 3WCP A; 2PGH A; 1Y46 B; 4H07 A; 5EYS A; 4B4Y A; 2SPO A; 4M4B A; 2D5Z A; 4NI1 A; 3UHQ A; 1QXE A; 1Y31 A; 1AZI A; 108M A; 1VXF A; 2ZLU B; 1GLI A; 3D1K B; 3SDH A; 1HHO A; 3UGY A; 1NAZ A; 3UHW A; 2NRL A; 2ZLX A; 5HAV A; 5CMV A; 1HBR A; 2H35 B; 1MOB A; 2PEG B; 4MQI A; 2HBE A; 3UHN A; 1Y5J B; 3LB3 A; 1Y4P B; 1JL6 A; 3G53 A; 1DXV B; 2MGF A; 1GBV A; 2ZS0 A; 2ZLT A; 3G4R A; 5HY8 B; 4ROL A; 1YDZ A; 2OH9 A; 2O5S X; 3FS4 B; 3BJ3 A; 1DXC A; 5CN9 A; 2B7H B; 4ROM A; 3DUT A; 1CIO A; 2MYD A; 4FWY A; 3UHT A; 3TLD A; 3QJD A; 1NWN A; 1GZX B; 5AZR A; 1Y83 A; 3TM9 A; 1ECD A; 1CH1 A; 2EF2 A; 1THB A; 1XZ4 B; 4MQG B; 2V1H A; 4HSW A; 1OBM A; 3AQ7 A; 1S5X A; 3BJ1 B; 2AUO A; 3UHH A; 4YU3 A; 2FAM A; 1YCA A; 1J41 B; 1W92 A; 3E4N A; 4L7Y A; 1SHR A; 3HYU B; 1Y5F B; 3S1I A; 1BIJ B; 5HLX A; 3HC9 A; 4F68 A; 3S66 B; 1XYE B; 4XS0 B; 1V4W B; 1RTE A; 5KER A; 1G08 A; 1ABW B; 1T1N A; 3AQ8 A; 3GQR A; 3OZV A; 1GDI A; 1SDL A; 1O1O B; 2DN1 A; 1BAB B; 4N7P A; 3UHV A; 1UC3 A; 1XZ2 A; 1HRM A; 1S6A A; 3IA3 B; 1XZ5 A; 1HAB B; 3ONZ A; 1CH5 A; 1UX8 A; 1JZK A; 1HBA B; 1MNJ A; 1S5Y A; 5EUI B; 3WCW A; 2AA1 A; 1Y8K A; 1MOA A; 4MQK A; 2AUR A; 3MJU B; 2D2M B; 3ZOL A; 3VAU A; 3CY5 A; 1HCO B; 3IXF A; 3BA2 A; 4ZVA A; 1J3Z B; 1L2K A; 2Z6T A; 1V4X A; 4U8U A; 1CMY A; 1DO1 A; 3ODQ B; 2ZLW A; 1QPW A; 1NWI A; 3B75 B; 1OUU A; 1IRD B; 1G09 B; 4NK1 A; 2GL3 A; 5MBA A; 4ODC B; 5KDQ B; 2QLS A; 3WCV D; 2QU0 A; 2VLX A; 2H8D B; 1MWD A; 1MYZ A; 3UHD A; 3RJN B; 2SPL A; 2QSS B; 1NS6 B; 3SZK B; 1ASH A; 2W72 B; 2RAO B; 2MGM A; 2W6X A; 2WY4 A; 3WTG B; 4HHB A; 2M6Z A; 1YVQ B; 1UIW B; 1A01 B; 1HV4 A; 2BW9 M; 2WTH A; 6HBW B; 1O1J A; 1MNK A; 2ZS0 D; 3SDN A; 1MBD A; 3WCU C; 3WHM B; 1QI8 A; 1ECN A; 4OF9 A; 1DO4 A; 1HGC B; 1J3Y B; 2V1G A; 1B86 A; 1A0Z A; 2GTL D; 3WFX A; 4IT8 A; 3PI9 B; 2HBS A; 3ZJI A; 1OUT B; 1UFJ A; 2GRF A; 1Y4G A; 2R1H B; 1Y8H A; 1HBB A; 1YHE B; 3NL7 B; 2O5T X; 1G0A A; 1HBI A; 1WVP A; 3LB1 A; 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1JZL A; 2MGJ A; 5JGG B; 3P5Q B; 1RVW A; 1DUO A; 1Y0A A; 4N7N B; 1NZ4 A; 2ZS1 C; 1KFR A; 1YHU B; 3HXN B; 1K0Y B; 5M3S A; 3GYS B; 4NI0 A; 3FH9 B; 2EVP A; 5C6Y A; 2YRS B; 1KR7 A; 2LH7 A; 1YZI B; 1DTI A; 1K1K A; 1JL7 A; 4H2L B; 1Y4Q A; 1QSI A; 2QSP A; 2V1J A; 4LPI A; 3OO4 A; 3OK5 A; 3VRE A; 1VXB A; 4VHB A; 1GDL A; 1J7W A; 3BJ2 A; 3QM8 A; 3QM7 A; 1C7C A; 4KMW A; 1YIH B; 1V4U B; 1JP9 A; 1Y35 A; 1IBE A; 1QXD B; 2ZT0 A; 2VLY A; 1JEB B; 2MGH A; 3D4X B; 3KUN A; 1MLK A; 1MLF A; 1MBN A; 1G9V B; 4KN3 A; 2ZT3 A; 3E5O A; 1HLM A; 1CH3 A; 2Z85 A; 2XKG A; 2E2Y A; 2DXM B; 3WR1 A; 1YVT A; 1A3N A; 4N8T B; 4MXK A; 1YGD B; 2ZSX A; 3D17 A; 1A4F B; 3MYN A; 3WCU B; 1DLW A; 1YEQ B; 1PBX B; 2NSR A; 3ORD A; 3DHT B; 4C44 A; 5SW7 A; 1XZV B; 5C6E A; 3HEN A; 3UH6 A; 2C0K A; 3ED9 A; 1Y45 A; 4YU4 B; 1CP5 A; 5IKS A; 2MYE A; 1YFF B; 3MYM A; 3NG6 B; 1LFQ B; 3E5I A; 1MTK A; 3GOU A; 2R50 A; 4DWT A; 1BZ1 B; 2ZSO A; 3UH5 A; 3M39 A; 4F6G A; 1YE0 A; 1MYH A; 1AJ9 B; 5EYJ A; 2MYC A; 3S65 B; 1YEV B; 1Y31 B; 1TES A; 2MGC A; 1O1K A; 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