1YADA

Structure of teni from bacillus subtilis
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
200
structure length
190
Chain Sequence
MELHAITDDSKPVEELARIIITIQNEVDFIHIRERSKSAADILKLLDLIFEGGIDKRKLVMNGRVDIALFSTIHRVQLPSGSFSPKQIRARFPHLHIGRSVHSLEEAVQAEKEDADYVLFGHVFRGVSLLSDIKQRISIPVIAIGGMTPDRLRDVKQAGADGIAVMSGIFSSAEPLEAARRYSRKLKEMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Regulatory protein tenI
publication title Structural characterization of the regulatory proteins TenA and TenI from Bacillus subtilis and identification of TenA as a thiaminase II.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 70
structure length 190
sequence length 200
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.99.10: Thiazole tautomerase.
pdb deposition date 2004-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1yadA00
3G1YA 3W2LA 4IPIA 3T44A 3WK3A 5D32A 1Q6RA 3BLIA 3EWBX 1EPXA 2JBMA 3I65A 3BG3A 4CNOA 2Y70A 1MEIA 3LCXA 4MVAA 1I2PA 3HPZA 3VKJA 4R34A 1ZHAA 3HB9A 1OK6A 2V2DA 4O0KA 2QCHA 1CI1A 1LOQA 3UWZA 4JNMA 4TR9A 4TIMA 3E9AA 3L5MA 3NL5A 2CU0A 1PHWA 5KITA 2ISWA 3LHVA 5CPLA 3CWOX 4UTUA 3PUDA 3LXBA 1XFBA 3TH6A 5F2IA 2RH9A 1JCYA 3MYOA 1G4EA 4MLRA 3MO7A 4RJEA 5HWJA 2QCGA 1EUNA 1F6KA 4JTGA 1JUKA 1GYNA 2C6QA 3QPZA 1Q6LA 3ABQA 2NXGA 3GIYA 3ABSA 4N9EA 1H63A 4DELA 4X22A 1HFBA 2ZRVA 1P1XA 1OFAA 2R8WA 4MYAA 3S1UA 1JCLA 4JY9A 3L5LA 5F2LA 1D9EA 3QMSA 2EGZA 3FYOA 1K02A 2J9ZA 2PRLA 1TQXA 1TIMA 4HSNA 4BF9A 4DBDA 3EWXA 2X2GA 5FEZA 2HTMA 3NXFA 2A6NA 4AF0A 4BWLC 1PCKA 2ZZ1A 3SECA 3SR7A 2YDAA 2QUTA 4WXYA 2GPTA 3LCLA 2J27A 4YWIA 1D3HA 3F03K 2V9DA 1XBYA 3IVTA 1KM2A 3F1QA 3PBUA 1MZHA 1SW0A 2DORA 3QZEA 2YYUA 3UD6A 3W73A 1XKYA 3UPBA 1TQJA 3WJYA 3U8GA 4UTWA 3DHFA 5I3FA 3JR2A 3W1MA 3FEMA 5AHEA 4JTIA 5FF4A 2NXHA 2Y63A 1RV8A 2A7PA 3EXTA 5FESA 5K9CA 1SQ7A 4RR4A 3KVJA 3R5EA 5GVJA 1VCFA 5U7SA 3ABRA 2V2CA 2WO5A 3HOJA 1WDWA 4O1DA 1LBFA 1AK5A 3QYQA 4PA8A 4HPXA 5HUOA 2VFFA 5E0KA 3LOTA 4UR7A 3GAKA 3HBLA 4HT3A 4O8RA 5F4XA 3EX1A 3IIXA 4O1AA 4NX5A 5FF3A 3B05A 4ZQNA 1OFDA 2FFCA 1NF0A 5FF7A 2V2HA 3TUUA 2A1YA 2QJIA 4M6VA 3W7NA 1QPRA 3P84A 2BXVA 4BI7A 3PS7A 5G1TA 1ICPA 1DQWA 3G1VA 1W0MA 3HG4A 5DELA 3GDLA 1GT8A 4UC5A 5LNUA 3G3MA 2DZUA 5HMSA 3UNDA 2GQAA 3TNOA 1DKWA 2ZA3A 3NQFA 3C2FA 4OHQA 4UMCA 3LHWA 1TV8A 3NPUA 1TCDA 5AHLA 4A2SA 2WSRA 4UMAA 1ZFJA 4ORIA 4PC8A 5TIMA 1XUUA 3JRKA 2X1RA 1QOQA 2XN0A 3LCHA 2BX7A 4LUIA 1B4EA 2VFEA 3OIXA 3KRUA 1H62A 2A2IA 4WZHA 1VHCA 5DXYA 1L6WA 4Y9AA 1PHQA 4IXXA 4O17A 3TAKA 3S5ZA 3TE9A 4DEFA 2HSAA 1OYAA 1R46A 3BG5A 1EB3A 2ZZ5A 4LUJA 1TSIA 2QCCA 3EX6A 1K3UA 4XKYB 1OX4B 3DKJA 3O6DA 1QPOA 3TK7A 3W76A 1K8ZA 1XI3A 4PODA 3NEVA 3W1TA 3CT7A 3T40A 3PVFA 4UTHA 5LNVA 1LRTA 1LROA 4JR5A 2CZFA 5CPNA 3NQ2A 1ICQA 2ZA2A 1S3HA 3THQA 1MEWA 1TPC1 3OVQA 3CEUA 1KW1A 2A7NA 3N2MA 3TXZA 2B7NA 4GBUA 4PH6A 5I3KA 1J5TA 1KTCA 1PV8A 4K39A 3JS3A 4PL1A 2BZNA 3QF0A 4H6KA 3R2GA 1Q45A 2QDHA 2QCLA 3M5ZA 3GNNA 4LV9A 4MFDA 5K4XA 3L9CA 3P81A 5CSSA 2R94A 4Z1AA 4M6QA 1FQ0A 4JEQA 2DZVA 1U5JA 1LBLA 4DF1A 2WNNA 1M6JA 3UWYA 3R8RA 4N9BA 5DBUA 2Z2UA 3DKLA 3W9ZA 1XBXA 1JCMP 3W7LA 3EEGA 4BWLA 4AVFA 1ME7A 3SGZA 2EHHA 2VFIA 3VFLA 1TRDA 3W83A 1XL9A 4NNCA 5K2ZA 1KFCA 3Q94A 2NWRA 4AEOA 3CIWA 3WJXA 1FCQA 2QDGA 3L5AA 2KZHA 3D0CA 3USBA 1W5PA 4O1CA 2NLIA 2RFGA 3QC3A 7TIMA 5IBXC 5HWMA 4JY8A 5D37A 1SPQA 1IGSA 2H6RA 4LS0A 1AW1A 1DL3A 3EXRA 4IMDA 4XZ9A 3QH2A 3L0NA 1N55A 4NNAA 1QPNA 5D03A 4XQ6A 1IIGA 2PC4A 2NUWA 3C61A 4HNTA 1OJXA 4N02A 1W5MA 2PRMA 3NYZA 3FJLA 3TMQA 1G4TA 2YX0A 3TV8A 4HNNA 2J88A 4RLIA 5G4WA 5C55A 4RK8A 2YR1A 1W31A 2DP3A 1GJPA 4O19A 1P4CA 3STGA 3HGRA 1SFJA 4DQWA 2B4GA 4NQ1A 1RQBA 1FUYA 3LB0A 4JTLA 5CPOA 4PCFA 2A7RA 3G1FA 5HUPA 4ZVJA 4ONVA 2FPTA 4RZ5A 3TCEA 3M5VA 4JTJA 5K9DA 2CLKA 1SZNA 4NJIA 1FX6A 1C8VA 1FCVA 1KLYA 3G0XA 3W84A 1ZJIA 3PM6A 1W5OA 3GX9A 4A29A 4Y96A 2B7PA 4D2JA 4LNYA 4P2VA 4XKYA 1OX4A 1F76A 1X6UA 4K7YA 4LY8A 4X3ZA 3W7CA 4IUOA 1R2SA 4NXSA 1GWJA 3U2OA 2Q3RA 3QMRA 3P80A 6ALDA 1FWRA 5HNRA 4LRSA 5AB3A 3LBCA 3LDVA 1LOLA 5BNKA 1LM1A 2HS8A 4NVTA 1KM6A 2G96A 5CSRA 3CTLA 5D2YA 1DQXA 4IGHA 3S1XA 2FPYA 4Q32A 2ABAA 4FIQA 3C52A 1QO2A 3PB2A 3S5NA 3C2OA 3N34A 3GAYA 1JULA 4X9SA 4LT9A 5I3IA 1ZAHA 1B3OA 4LVDA 4EIVA 4AAJA 4R33A 3TIMA 1WXJA 3DBPA 3M6YA 4EOUA 1HG3A 5H91A 1YXYA 3P8IA 2RDTA 2A5HA 2CLFA 3W72A 2Z6IA 2YXGA 3W2KA 3PSWA 1GTEA 1JCXA 2TSYA 1Z48A 5HJLA 1KLZA 1FWSA 5LNWA 2H8XA 1TV5A 1AW2A 1K7FA 2X1SA 3AO0A 4GJ1A 5KZDA 4XWUA 4AWUA 3KRSA 4JYFA 1OVDA 2E6FA 1WYIA 5AHIA 1A5CA 2P1FA 3O8AA 1H1ZA 4TMBA 1RVGA 1EIXA 2I9EA 5DCBA 4MZYA 3LI0A 1PVNA 4OV4A 4UCGA 2ZZ4A 4AF0B 4UFHA 3RFAA 2HS6A 4JTTA 1YPIA 2NWSA 1QWGA 1LBMA 1GYLA 4JD4A 1FDJA 4WOZA 5DBTA 1VLIA 4Q33A 1ME9A 1W8SA 3LTSA 1YXDA 4IMEA 1BKSA 3RMJA 4YXGA 1QOPA 4HNUA 2ZYFA 2QCDB 4A3UA 1WOAA 2ATSA 4HSOA 1I8JA 2WNZA 3TMLA 1DJQA 3LTPA 4JXCA 2ZDRA 2DZPA 3MP4A 3TSBA 2P0OA 3TC6A 1Y0EA 4O57A 5EL1A 1JRCA 2ISSA 3KVKA 1W5NA 4YCOA 4Z0JA 2J6XA 2WJZA 3TQVA 3MI2A 2Y89A 4DPPA 3VCRA 3QQ1A 1ADOA 2I14A 2Q8ZA 3FJ6A 5LGZA 3BG9A 5IBXA 2EKCA 4AHQA 3MYPA 4DF2A 2F7FA 1FWWA 3UWUA 5F4WA 2RHGA 2YFNA 2W6RA 2ZTJA 2CLIA 1H5YA 3FIGA 4M19A 5LNSA 3BARA 3W7QA 2OJPA 2YCEA 1EWDA 4UTTC 1VHNA 3TX9A 1FCUA 3W88A 2XN2A 3MJYA 5G2IA 4DPQA 4LVFA 2YW3A 3TKFA 3IGSA 4CCCA 1H50A 2G5WA 3MP5A 3OBKA 2GOUA 2C19A 4AMAA 5C54A 2FJKA 4IMGA 1F5ZA 1W56A 3MW7A 5AOUA 1XC4A 2E09A 1LRNA 3VE9A 1KFJA 5AC7A 3K30A 3QSTA 4LS1A 5E93A 1GPWA 5F2MA 2NV1A 4RX0A 3G0UA 2Y88A 2JKAA 3HGOA 4J9JA 2ZRXA 4P61A 3W86A 4LVGA 1ALDA 1LORA 2C16A 3F4NA 3GDRA 1L6YA 1MSSA 3TFCA 1WAUA 3PBWA 3W7PA 3O16A 2YW4A 4UTIA 3QJAA 1LZOA 1BWLA 1Z42A 1MXSA 3PG9A 4QQ3A 4AWSA 1H7RA 3W7JA 1J2WA 5BMXA 1RD5A 1TTJA 3LBMA 5EMUA 3NPWA 2ZRYA 1KM4A 5LZLA 2H3BA 1GVSA 3NQCA 1KM5A 5DCDA 4Z0SA 4NJKA 1JR1A 1SZEA 3HG3A 1O60A 5D02A 2CW6A 2DZXA 3MI3A 2J9XA 1GG0A 4LWWA 1L9WA 1DORA 1KA9F 3GDTA 1DVJA 1GOXA 1OFOA 1LYXA 4S1FA 3BW4A 3LTYA 4ZQRA 1OK4A 2XFWA 1WX0A 4FNRA 3NGJA 4O53A 4UTJA 4IMFA 2C18A 1VYSX 4L4MA 3B4UA 3E0IA 1V5XA 3ZFHA 3W1QA 2CZEA 2Y7DA 3HGSA 5BRBA 1AG1O 1OG0A 1UCWA 4C1KA 3L0GA 5D2XA 3M0ZA 3W1AA 2QCDA 3G24A 5BW6A 3AJXA 4QITA 4S2CA 3DI0A 4O52A 2H3DA 3LV6A 3MHUA 3WK0A 4UMBA 4FF7A 1IXOA 1QAPA 1QDSA 2FB2A 3H53A 3FS2A 1H7WA 3MI6A 2FB3A 3G1HA 3IGXA 4IPJA 4TO8A 4LC6A 1F73A 4HIBA 3VE7A 2J24A 5CZJA 3SI9A 1AL8A 4EWND 4H4IA 3UZ5A 1NFBA 5DY2A 3HF3A 3I68A 2W79A 2ZQ0A 1B4KA 1TJRA 3NVTA 2NUXA 4CCDA 1B9BA 3N2XA 4NJGA 3EWZA 5C2XA 3WK1A 3OG3A 1WQ5A 3NQEA 1A50A 4A2RA 3UY8A 3LHTA 2DU2A 4LRTA 3TROA 2C14A 5LHFA 2OCZA 2G95A 4Y8FA 4GUHA 1TPEA 2CLMA 3GDKA 2EF9A 2V81A 1G69A 4YMZA 3ELFA 1UUOA 3NQGA 1EA0A 2CLHA 3L67A 3CWNA 3M44A 1H51A 3NAVA 1Z41A 1R30A 4HNVA 4WY0B 3GKAA 4JS3A 1EX5A 2YGYA 4ICNA 3UY7A 3W75A 4UTTA 3I7SA 1H7XA 4OQVA 5HR7A 4RXFA 3H54A 2OZ0A 5LNRA 2NZLA 1NAL1 2V5BA 4LW7A 5EY5A 5FEPA 3G1XA 1VZWA 1YADA 2JKPA 2FIQA 1YTKA 1R2TA 4MUZA 3WJSA 3GVGA 5CZSA 4AH7A 3BO9A 4IQLA 3KAOA 3TW7A 4IOTA 1TTQA 2CFFA 1FDYA 3OA3A 2A4AA 1X8FA 3O06A 1ZNNA 3W7OA 5J5DA 3NQDA 2R91A 4O4VA 3BLFA 5IM51 2RKXA 2VFHA 1WOBA 2ZBTA 2FPVA 2QCEA 4AWTA 1CW2A 1Z44A 1VS1A 3LCIA 1DBTA 1PCWA 5J5RA 3B8DA 3NZRA 5K7JA 1UJPA 2OT0A 3QPYA 1O5KA 3PG8A 2GQ9A 3O05A 4PTNA 3HGJA 3PBVA 2DZTA 3GYEA 3LI1A 5FF2A 2YZRA 3MBDA 1RZMA 3Q2DA 1OX5A 4GWEA 4ORMA 1K7XA 3PWAA 4QAIA 3NQMA 5FF0A 3CLMA 3OVPA 4QIUA 5HULA 3S42A 3W7IA 1W3IA 3C2RA 2DJLA 1QO5A 1S5TA 1XXXA 4FNUA 4JIQA 3SZ8A 4NNBA 4UTKA 3HO8A 3P5YA 4BI5A 5D38A 1SW7A 4XUGA 3QMTA 5AHMA 2ATMA 2DZWA 1Q6QA 2GQ8A 3FKKA 2VENA 3G8RA 4O50A 3WFAA 1GEQA 3I7QA 5I3HA 3NA8A 3W7RA 2Z1BA 2Z0IA 1I2QA 3S1VA 1THFD 1TV7A 4Q4KA 3RLVA 2B7QA 4TX9A 2QAFA 1F05A 5G2WA 3B04A 2FLIA 1KM1A 4K7VA 4FNTA 4N4QA 1X7FA 1YPFA 3CM4A 4MY1A 3FLUA 1SZGA 1XBVA 4GC4A 3TSMA 5F1UA 4K38A 5HWNA 5AYZA 3M7WA 2JK2A 3QW4B 3W85A 4L4LA 4WQ6A 2BLEA 3NPXA 2NX1A 3E96A 2X30A 4N6EA 1FBAA 1K7EA 2NXIA 1G7VA 4LVAA 1K8XA 4RZ6A 5AHFA 3T78A 1JUBA 1LTDA 1TJPA 3DFQA 3NNTA 3NDOA 3SFKA 3MHFA 4DF0A 3B0UX 2P10A 3MWAA 3DENA 3QSRA 2E6DA 2YPIA 3NO5A 3PR2A 3S8HA 1L2UA 2BSLA 1AL7A 5CKSA 4JX4A 4FHAA 4FNSA 5ABTA 2HMCA 3TR2A 4WY0A 1ZY9A 4GUGA 3HG5A 1LOSA 3I7RA 2VXNA 2XN1A 3OHIA 1LLWA 4FXSA 4CCEA 2VKZG 5BOOA 3TQ0A 4GE8A 4M7TA 3P82A 5HINA 4CNNA 4WJEA 3RU6A 3TU9A 2VOMA 5LHEA 1UBSA 3DGRA 3W71A 4WD0A 2ZRUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BKH A;  3G1Y A;  3W2L A;  3T44 A;  2E3Z A;  5D32 A;  4Q4Q A;  3EWB X;  4P8V A;  2QVN A;  4PB3 A;  2J7C A;  3OVG A;  2JBM A;  4QXI A;  3CHD A;  3LCX A;  4MVA A;  3HPZ A;  3VKJ A;  3HB9 A;  3FVM A;  4G7F A;  2ZDS A;  1CI1 A;  2IQD A;  4OIF A;  4TIM A;  3E9A A;  3NL5 A;  1UWI A;  3PN8 A;  4W93 A;  5LA1 A;  3PUD A;  1XFB A;  4M6U A;  5F2I A;  3PBG A;  1JCY A;  1G4E A;  5H8M A;  1AVA A;  3MO7 A;  1EUN A;  1MMF A;  3ALG A;  4ZFM A;  1H41 A;  3TZN A;  4JTG A;  1PAM A;  1Q6L A;  3STP A;  1FH9 A;  7XIM A;  3O9N A;  1RP9 A;  1H63 A;  1P1X A;  4ATW A;  4MWA B;  2HK0 A;  4JY9 A;  3IJD A;  3BXW A;  3RG6 A;  1GNX A;  1D9E A;  4J7R A;  1K02 A;  4BY3 A;  2PRL A;  3FK4 A;  4B2D D;  3F4C A;  1KGX A;  1TIM A;  2X7V A;  4HSN A;  4ERG A;  2PA6 A;  4P8U A;  2HTM A;  3DFY A;  2A6N A;  2V3E A;  4FPS A;  1P7T B;  2YDA A;  2J27 A;  1B90 A;  1L8P A;  1A0D A;  4CGT A;  1VIZ A;  4H83 A;  3REQ A;  2REQ B;  1KM2 A;  1MZH A;  1SW0 A;  3MKV A;  2DOR A;  3FST A;  3KRB A;  2VUR A;  4LNC A;  3FV9 A;  2EPM X;  4L4P A;  2J74 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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