1YI4A

Structure of pim-1 bound to adenosine
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
273
structure length
267
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGETRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Proto-oncogene serine/threonine-protein kinase Pim-1
publication title Pim-1 ligand-bound structures reveal the mechanism of serine/threonine kinase inhibition by LY294002.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 267
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-01-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1yi4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1yi4A01
3UOLA 4E6DA 4P7EA 3DKCA 5JFXA 3FLYA 1FGIA 2BAJA 4FTLA 4FT7A 3RCJA 3LJ0A 5JZJA 4TNBA 5M06A 4E7WA 4MCVA 3ZEPA 1S9JA 2UW9A 4QP2A 2C6IA 3DCVA 3P4KA 3JY9A 4BCIA 4E20A 4ALUA 2C0OA 3ALNA 3LXNA 4DFXE 1URWA 5KBQA 3OXIA 2AUHA 2QOKA 1XH9A 4F6UA 3NUAA 1TKIA 5IQHA 4KS7A 5IQBA 5GHVA 3PWYA 5JSMA 2OO8X 3CQUA 1ZWSA 3FMEA 4IWDA 3L8PA 4G3CA 2PY3A 4FNWA 4RJ5A 4TWNA 1O6YA 2QKRA 4YJPA 4EZ3A 4O0TA 3KRXA 4O6LA 3K2LA 4X3JA 3LFBA 4B9DA 5KKRB 3TV7A 4CNHA 5BYYA 4D0WA 4HGSA 3ULZA 3ZLWA 2QC6A 5JK3A 4I3ZA 4FEUA 5J5TA 3ANRA 4UX9A 4Q5EA 3TIZA 3VUTA 4GFGA 1IAJA 5DIAA 3NIZA 5IQEA 4UXQA 4KKEA 4OLIA 2GTNA 3DU8A 2X39A 4PPCA 5BNJA 4FODA 3UIXA 4CXAA 3A8XA 5IH6A 4BL1A 3F3ZA 3PYYA 1ZOEA 1XH8A 2NNWB 3MFTA 4DF3A 5A9UA 5L8KA 5AUXA 4MBLA 5LVLA 2ZAZA 5EHLA 3UYSA 4EBWA 5FLFA 5DA3A 4QYHA 2I6LA 4UZHA 4XBRA 3CSVA 5IUIA 4UY9A 4KBAA 1XH5A 2QU6A 3PXFA 1KV1A 2ZVAA 4MF0A 4GYIA 3UE4A 3ZRKA 3SXFA 3MY0A 4X2KA 4LGDA 3VUHA 3R6XA 3VBQA 3AC2A 4GRBA 5I9XA 3WF8A 4C61A 3DBFA 5CAUA 4A9YA 3DJ5A 2FSMX 3IK3A 1ZYCA 3VJOA 5M08A 2FVDA 3E7VA 3QQJA 5IZFA 3UMWA 1YI4A 5HBJA 4FYNA 3MS9A 4RQKA 3VF9A 3S95A 4F0GA 1ZZLA 1A48A 5EHYA 3TUBA 5LMKA 1XQZA 4FIEA 3HMOA 5JRSA 5BVDA 5BUIA 2VTIA 1UNGA 4FTMA 2JC6A 4FT0A 3U9NA 4WNKA 3O71A 1U5RA 3GQLA 4I92A 4KSQA 1R78A 3F88A 4HGTA 4RIXA 2HYYA 4IDTA 4TN6A 1IAHA 1BYGA 3MB6A 5HGIA 4JVGA 3LIJA 4ALWA 3VW6A 3VRZA 4ZZNA 5CNOA 2XS0A 3QHRA 2YLEA 3RPYA 2EVAA 5BVFA 3QZGA 2PL0A 3UVPA 4GUEA 4FKQA 1ZMUA 4BICA 3DLZA 1OI9A 2ESMA 2BKZA 2IZUA 4U40A 4RWIA 5CSWA 2XK7A 2WZJA 4X21A 3RWPA 4NZWB 3EFKA 1F5QA 3DNDA 5IA1A 2GQGA 3BYVA 2GMXA 2Z8CA 4FV6A 1H1WA 4C0TA 3BE2A 2GNLA 2X2MA 5KX8A 3LLAA 3W2CA 4EZ5A 5HESA 3NUNA 4V0GB 1NVQA 3ZXTA 4HVHA 5M51A 2Q83A 4AQCA 3EYGA 5CALA 3PA4A 3H30A 1MRUA 3CY3A 4NKAA 1LPUA 2IW9A 3FMJA 4Z7GA 4WBBB 3E7OA 5IQFA 4YPDA 4QRCA 1NVRA 2IW8A 4FIGA 4EWQA 2YFXA 5K5XA 2BALA 5EDQA 4MXYA 5JZNA 2YIWA 1V0BA 4WSQA 4XG6A 3VIDA 3ZONA 4O22A 4R5YA 3HMPA 4B0GA 3ACKA 3KREA 2YCQA 2XCHA 2H6DA 4NYEA 3Q3BA 3IDPA 4TWCA 2J0LA 4XRLA 3TZ8A 3Q04A 2V5QA 4C3RA 3P78A 5ETCA 4BDAA 1WVXA 1XH4A 5DEWA 4DEDA 5LWMA 2A2AA 5ANJA 4J99A 5KBRA 1LEZA 4FEXA 3I0OA 4XLIA 5FXQA 3QXPA 3UQFA 4OTWA 3C13A 3OTVA 4Y5HA 4I94A 4YTIA 2PVJA 4CKIA 4EHZA 4ITHA 1IA9A 2WMAA 1YHSA 3TNPC 4F63A 2GNJA 3UYTA 4QP9A 3KEXA 4AFJA 4BCQA 3R8PA 4MEDA 4D4RA 3NIEA 3TKUA 4GYGA 4FTNA 4ZXTA 2WMTA 1IEPA 4S34A 3PJ8A 2BIKB 3G90X 4XP3A 2HAKA 3HZTA 5H9BA 5AX3A 5B2KA 5F4NA 4LI5A 4FVPA 3EFJA 4D1XA 2UV2A 2BHHA 4M13A 2VTLA 4KNBA 3R04A 4WT6A 3LQ3A 2QODA 1WBTA 4XP0A 2OW3A 4IMYA 2B1PA 3NEWA 5M56A 3WE4A 1KUTA 3NUUA 5DN3A 3R7EA 2BRHA 3F5XA 5F1ZA 3R7YA 1PKDA 3OS3A 3LFCA 2WKMA 3TTJA 3NVKI 5DRDA 2XKEA 4AGCA 4D4VA 3VBYA 1PXNA 3LFNA 4J97A 4RT7A 4QMLA 4IVAA 5G6VA 2WFYA 3NAYA 4A4XA 1UNHA 1IA8A 1U46A 1YXTA 2C1AA 4QT1A 5CYIA 2WTIA 4IXPA 1OIRA 4FYOA 5FEQA 4NW5A 3BYUA 2OZOA 4ZSGA 3COIA 4C36A 3ZLXA 1F3MC 1KWPA 3F7ZA 2BVAA 4W8DA 1YOLA 2V7OA 2GS6A 4D2TA 1CKPA 2W5AA 5I3RA 2QOOA 3DFCB 3DKGA 4JT3A 1F0QA 5AM7A 2OXDA 5DT4A 2F2UA 3PWDA 1WBOA 4MAOA 4D55A 5EI6A 3FYJX 5L8LA 3HDNA 3BLQA 3KRRA 3QD3A 5DPVA 4G5JA 4YJVA 3MFSA 4GCJA 3ROCA 3JPVA 2VWUA 3HLLA 3V3VA 4ZLYA 4JDIA 5LMAA 4PDSA 2PE2A 4MNEB 4P5ZA 4IM2A 5AV0A 4QOXA 5ETIA 4AZVA 3PVUA 3EFWA 4GT5A 3GU7A 5ANKA 4KIKB 3UJGA 3AC1A 2X7FA 4BZOA 2XIRA 4BGGA 4LM5A 1QMZA 2H8HA 4TXCA 3SRVA 3ZS5A 3C4XA 2E9OA 5M4UA 4BF2A 2VV9A 3FKLA 4O1OA 5L2SA 3D5UA 4I6HA 3MA6A 4GK2A 4OAUC 5CEOA 4E6CA 1Y8GA 2V55A 1FINA 3AGLA 1GJOA 5AR7A 3WF6A 4O7WA 4ZJJA 4NU1A 5AUZA 4NTSA 5D12A 5HO7A 3SW4A 2V7AA 1JKKA 4FTCA 5AWMA 3ULIA 4F0IA 5EKNA 2RKUA 4CQEA 3SA0A 4WRGA 3LLTA 3WIGA 3F2AA 2RG6A 4RA5A 4YPSA 3W2QA 4YZBA 5AA9A 3N4TA 1YXUA 3KXNA 3ZDUA 3D7ZA 5TT7A 3EHAA 1MQ4A 3MH0A 4APCA 4IJPA 3S3IA 3TN8A 3Q4UA 2UW6A 4FC0A 2JLDA 2DWBA 2G2HA 3TT0A 3L9MA 3EWHA 3UPXA 5KMLA 4GH2A 4DN5A 3WI6A 2YABA 1QCFA 4XHKB 4G5PA 4YLLA 5CQUA 4MKCA 3BE9A 4I22A 4RX8A 4FUXA 1FPUA 5I4NA 4RZWA 1AGWA 4EZ7A 4FTKA 4GK3A 2VAGA 3EL7A 3MH1A 4FL2A 4QYYA 3V8SA 1PXJA 4I21A 4Y5QA 3VBXA 1PMUA 2XNNA 3PSBA 4LQMA 4NIFB 4TWOA 5IA2A 1FVRA 4NJ3A 1FGKA 4RFYA 4HZSA 4R1YA 5HQ0A 2F9GA 4F09A 3BHTA 4PPAA 4DG3E 2X9FA 3F5UA 4WKQA 2VTNA 3TKIA 2VN9A 3IOKA 4RWLA 3AC4A 3PIZA 5H3QA 3PA5A 4D2PA 4DH3A 4EK6A 2CGVA 3TTIA 4QP4A 3BBWA 4Q9ZA 4E1ZA 5CEKA 4D4YA 2G01A 3OXZA 3PP0A 3QU0A 3HUCA 2LGCA 2ITQA 2I0VA 1H1SA 2NPQA 2XNOA 3D15A 4K8AA 4LL5A 4O27B 2J2IB 4QQCA 3OTUA 3CY2A 3OWJA 4EH7A 4K9YA 5CNNA 3COKA 5HBEA 4L53A 3P5KA 3WF7A 4UMQA 5DMZA 3RAIA 3RMFA 1TQPA 1R39A 2B9IA 2ITUA 2Z7RA 4LFIA 2P4IA 3VNTA 3TM0A 1J7UA 2OJIA 1OKWA 2FO0A 1E9HA 3ZO1A 3TNWA 2WAJA 2ZM1A 3TACA 3FL5A 4UN0C 3D5XA 1WVWA 3KC3A 4USFA 4FR4A 4EEVA 4BI1A 3H10A 4EUTA 3SVVA 5DYJA 5L2QA 2C30A 4J96A 3DJ6A 4PX6A 5CSVA 2YHVA 4DH1A 3AD4A 4RLLA 3DJ7A 4Q2AA 3K3JA 4JAIA 4AAAA 3ORTA 4E4MA 1OIQA 5AX9A 5KMKA 5LOHA 5EDPA 4EQCA 2XEZA 3OXTA 5DI1A 3FJQE 4M0ZA 4EONA 1L8TA 1OL2A 3MDYA 3QAME 4FSWA 5K0XA 3Q9YA 3FI8A 2I0HA 3RK9A 5IQAA 4C33A 2CGXA 3ZSGA 1YKRA 2VTQA 4F70A 3C4ZA 3EN6A 4Q9SA 5GZ9A 3OHTA 3R7IA 3K5VA 4H3QA 4OBQA 3VW8A 5FTGA 3HDMA 1OBDA 4E8AA 2NRYA 4Z3VA 2RFEA 1O6LA 4IFGA 4EQUA 3IW8A 4EH4A 3O0GA 4KBKA 3G2FA 4YHTA 4HVSA 3IW6A 1R1WA 4GG5A 4BCMA 1Q97A 4CYIA 1Q62A 3OOMA 4W4XA 5IG1A 5GZ8A 3U54A 4ID7A 3E8DA 2CN8A 3DXPA 2CMWA 4C02A 4FE2A 2RSVA 4PPBA 4PDYA 5DR6A 3FKNA 3ZM4A 5E8WA 1L3RE 2EXMA 2PUNA 5IA5A 5CVGA 3OW3A 1MRYA 3ALOA 4Y46A 5K5NA 1Z5MA 4O2PA 3KK9A 4G31A 4FT9A 5M4IA 5HCYA 4ZEGA 1URCA 5J5SA 1Q4LA 3C5UA 2R3OA 4PV0A 3C0HA 5E8SA 3NMUF 4FV2A 4GU6A 3PG1A 4IC7A 2EWAA 3ZBFA 4GJ3A 2PPQA 2WTCA 3E93A 4GW8A 2GHLA 3CPCA 4M3QA 4M15A 5EK7A 3S2PA 5HIDA 3MPMA 4BKYA 1YQJA 2XIZA 4DA5A 2GHMA 3TNIA 5LVMA 3NCZA 5AR3A 4PMPA 2HXLA 4F6WA 3PXZA 3U4UA 4ENXA 2PYWA 2ETKA 1GAGA 3PY3A 4XOYA 5AP2A 3WZDA 2YWPA 2DQ7X 2OFVA 5CX9A 5CU0A 3QF9A 4W4VA 2WOTA 4FSRA 3FC1X 3Q9XA 4ZSEA 3R2BA 5L6OA 3ZH8A 2R0IA 4UBAA 4IW0A 3W1FA 3LE6A 2C6TA 3CBLA 3DTWA 1NA7A 2W1ZA 1IRKA 1UKIA 2I7QA 4EHVA 3KCKA 4ANBA 4FIIA 2B9FA 4E4NA 2B53A 1H08A 1PMEA 3A4PA 3ZZEA 1P14A 3QHWA 5BVEA 4G3DA 5AUWA 2XIYA 3UZTA 3R7GA 5FWKK 3W2PA 5J7HA 3EQGA 2BZKB 4P4CA 4TYGA 1OL1A 3CTJA 1A9UA 2OBJA 3LMGA 3PG3A 3SKCA 5A4LA 1SM2A 4NFMA 4HGEA 3GCVA 5BVNA 3ZFXA 3F6XA 3LCDA 2WO6A 4HCVA 4PQNA 3WZKA 5CF6A 2OKRA 4KBCA 4G16A 3DBQA 4E73A 3DPKA 2RFNA 2PVHA 2ZDTA 3C4EA 5K3YA 1ZAOA 2FGIA 4JQEA 3P7BA 5D1JA 3PY1A 3S4QA 1KE7A 2CLXA 3QWKA 5E91A 4APPA 4BKZA 5M55A 4LRMA 2GFSA 1YOMA 2VO0A 1BX6A 3U4WA 5M4CA 4D28A 5IU2A 2EB3A 3IG7A 3P7AA 2PWLA 4XG9A 4FZ6A 2JGZA 2R3GA 4FZ7A 3DK6A 3O51A 3FLNC 4O0UA 1YI6A 3ETAA 4U6RA 5E92A 5FP5A 3CCNA 5CQWA 4AT3A 4ANNA 4CTCA 5M44A 4XV3A 4I0RA 4JRNA 2WQMA 4IBMA 4M12A 1WCCA 4QP3A 3AMAA 2XNBA 3QX2A 4RFZA 5CT7A 4YUQA 3UQCA 4MD8E 2A27A 5D10A 2C0IA 2ERKA 3A61A 5AAFA 2GCDA 3R02A 4ASDA 1GIHA 3RZBA 3LCKA 2ITVA 1XJDA 5JEBA 3G6HA 4FKGA 3DOGA 2YCRA 1JLUE 2ZB1A 5FGKA 1Y6BA 2P33A 3UBDA 3NS9A 4ZP5A 4USDA 3UNZA 5HE0A 3BV3A 4O0VA 2OJGA 3OUKA 4TRLA 4XUFA 3UMXA 3VHKA 3QQUA 4CLJA 3GU8A 1Q8TA 3H3CA 4K1BA 3RM7A 3TV4A 3V51A 2VTJA 3WF9A 4IVCA 4OTFA 3PXYA 4DTKA 2G1TA 2WU6A 4FG8A 4GS6A 3NR9A 4E4LA 1H1QA 4ERKA 3E64A 2R3KA 4TYHA 5LJJA 4IIRA 5IH5A 3SC1A 3FHIA 3NNWA 4Y72A 4S30A 4BDJA 5KMNA 2B55A 3O8PA 4IWPA 3RBWA 2VTSA 3KU2A 1UVRA 4CCBA 2BKKA 5KHXA 2XNPA 4DH7A 1P5EA 4R78A 2BRGA 2WMUA 4BDBA 3AXWA 3Q2JA 1KOAA 4B7TA 3MV5A 3PLSA 4IX5A 4KUJA 4IAIA 2HZ4A 4CFVA 4QPAA 4EOSA 3QBNA 1R3CA 3CS9A 3OEFX 4PNKA 5IEVA 4II5A 1WBWA 5HCZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3UOL A;  4E6D A;  4P7E A;  3DKC A;  5JFX A;  3FLY A;  1FGI A;  2BAJ A;  4FTL A;  4FT7 A;  3RCJ A;  3LJ0 A;  5JZJ A;  4TNB A;  5M06 A;  4E7W A;  4MCV A;  3ZEP A;  1S9J A;  2UW9 A;  4QP2 A;  2C6I A;  3DCV A;  3P4K A;  3JY9 A;  4BCI A;  4E20 A;  4ALU A;  2C0O A;  3ALN A;  3LXN A;  4DFX E;  1URW A;  5KBQ A;  3OXI A;  2AUH A;  2QOK A;  1XH9 A;  4F6U A;  3NUA A;  1TKI A;  5IQH A;  4KS7 A;  5IQB A;  5GHV A;  3PWY A;  5JSM A;  2OO8 X;  3CQU A;  1ZWS A;  3FME A;  4IWD A;  3L8P A;  4G3C A;  2PY3 A;  4FNW A;  4RJ5 A;  4TWN A;  1O6Y A;  2QKR A;  4YJP A;  4EZ3 A;  1TFF A;  4O0T A;  3KRX A;  4O6L A;  3K2L A;  4X3J A;  4AQK A;  3LFB A;  4B9D A;  5KKR B;  3TV7 A;  4CNH A;  5BYY A;  4D0W A;  4HGS A;  3ULZ A;  3ZLW A;  2QC6 A;  5JK3 A;  4I3Z A;  4FEU A;  5J5T A;  3ANR A;  4UX9 A;  4Q5E A;  3VON A;  3TIZ A;  3VUT A;  4GFG A;  1IAJ A;  5DIA A;  3NIZ A;  5IQE A;  4UXQ A;  4KKE A;  4OLI A;  2GTN A;  3DU8 A;  2X39 A;  4PPC A;  5BNJ A;  4FOD A;  3UIX A;  4CXA A;  4AXC A;  3A8X A;  5IH6 A;  4BL1 A;  3F3Z A;  3PYY A; 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