1YOLA

Crystal structure of src kinase domain in complex with cgp77675
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
256
Chain Sequence
AKDAWEIPRESLRLEVKLGQGGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMNKGSLLDFLKGETGKYLRLPQLVDMSAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKEPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
publication title Crystal structures of active SRC kinase domain complexes
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 256
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2005-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1yolA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1yolA01
3A7HA 5DVRA 4WNOA 5GIOE 1FMKA 2XNBA 4RVKA 3PJ8A 4MWHA 4O0RA 3QGWA 4QNYA 3KU2A 4Y85A 4KUJA 2FSTX 3MS9A 3VBVA 4O7YA 2HIWA 2WTIA 5JN2A 2Z60A 3EQRA 4BGHA 4PDPA 4YPSA 3W2QA 4Y83A 4C4FA 4LOPA 3U4WA 3M2WA 4EYMA 1Y6AA 4R3RA 4QMPA 2F7ZE 3BHHA 4FSYA 4UY9A 4BIBA 4HVSA 2OLCA 3W2RA 4ZMFA 5AJQA 3AG9A 1H0VA 1Q8ZA 4D4VA 3M11A 3NRMA 5FQDC 3I0OA 5K9IA 3WI6A 4O7SA 1CKIA 5IQHA 3EYGA 2VTJA 3MFTA 2CNVA 1CMKE 5AUXA 4IZYA 4XRJA 5HBJA 4M14A 5K0KA 3P1AA 3RVGA 3PSCA 3U87A 4OBOA 2VUWA 2JKQA 4FK3A 5EM8A 4L8MA 2I40A 4U40A 3OFMA 4DCAA 3KY2A 2YFXA 3Q9YA 4IWOA 4WBOA 5I9UA 3UVRA 4AOTA 4DN5A 3I4BA 1H26A 4FTLA 4HNIA 2O2UA 3I0QA 3KA0A 3PIYA 3T3UA 4RC3A 5L3AA 2AUHA 3QZIA 3BRBA 4IX3A 3R7GA 4IWPA 3PLAE 1LEWA 4FTMA 3GEQA 4X2GA 2OJGA 4RC2A 5ANGA 3UG2A 4FGBA 2F7EE 3CPBA 2FUMA 3RNYA 3TKHA 3TKIA 3K2LA 5HTBA 1FOTA 1YDSE 4D28A 4G5JA 2OIQA 4M12A 2VU3A 3TNHA 3MVMA 4AU8A 2W9ZB 3GUBA 4QT1A 4TW9A 5FRIA 4NFNA 4O0WA 4CRLA 5BMMA 1YI3A 4F9CA 3QUEA 2WTDA 3FKLA 1JKKA 2W1CA 3R7IA 1OGUA 3I7BA 1UU7A 2R3NA 4CYJA 2ITVA 5B2MA 1PXKA 3ETAA 4N6ZA 4YJVA 4U79A 3HDMA 4N4SA 3HZTA 4BIEA 3FEGA 3GI3A 4BCQA 3N4UA 3C0IA 4F65A 3LXNA 4M8TA 3QLGA 5IMEA 4UMUA 5K4JA 1YI4A 3S3IA 3L9PA 5FP5A 4ASDA 3HMOA 3RINA 5HG7A 4HVGA 3OOGA 3KCKA 4O1OA 2SRCA 4RFMA 4BZNA 4M97A 5JFXA 3LCSA 4FX3A 3KK9A 2BKZA 3QD3A 5I4NA 1U5QA 1ZOHA 4FL3A 3UDBA 3UIBA 4GRBA 4O91A 5E8TA 4DG3E 2W06A 3NVKI 5AADA 2X6EA 5CF8A 4MK0A 3SLSA 4E8AA 4BL1A 3PVUA 5FTGA 4EQMA 4TYHA 3FYJX 3NPCA 3ZU7A 2ITTA 5CT7A 4LG4A 5DLSA 4JI9A 3DZOA 3E8DA 5LQFA 4DFLA 3ZOSA 4TKSA 2PVMA 3ORNA 1TVOA 3R04A 3LE6A 3NNXA 3OT8A 5CSVA 5GHVA 2IPXA 2ACXA 2UZDA 2J0IA 3QL8A 4IANA 3TZ7A 4BGGA 4CKIA 3AOXA 4O0XA 1V0BA 5JK3A 5FEEA 5IF1A 5IU2A 2W7XA 4FZDB 4ARKA 2JKMA 3TTJA 2PYWA 5M4UA 2BFXA 2UZLA 4AGUA 3L8XA 5K5NA 2QI8A 5L6OA 3L8PA 5EOBA 3AT4A 5LVLA 4KSPA 4S33A 3PYYA 5FBNC 3D2KA 5BVWA 4EOMA 5IUGA 5J9YA 3UE4A 5BUEA 4N0SA 3NW6A 2C3KA 2RG6A 4HGTA 1PXOA 4XHKB 3PXZA 3FYKX 4IM0A 5DEWA 5EDRA 4YHTA 3UZPA 4JT3A 4DFZE 5CEKA 3WE4A 2ZM3A 3OC1A 2VWBA 4BKJA 3LPBA 4EONA 1H1SA 3C0GA 4BHNA 3QU0A 4EH7A 3BKBA 3EOCA 5C4KA 4GG5A 2XBAA 3V8SA 2EU9A 4V05A 3OWKA 4XG7A 1BX6A 1WMKA 4YJRA 2YZAA 1J91A 1NY3A 2XIKA 2GPHA 4BDFA 4OBPA 2CJMA 5ANKA 5E8XA 3TV6A 4DLIA 3FKOA 4DITA 2HK5A 2HW6A 4AF3A 5IA0A 3DDQA 2XK7A 2XKEA 4QQCA 5H2UA 3V01A 4EJNA 2GNIA 5A6NA 4CFMA 1FVVA 3I79A 2ERZE 4IH8A 2XCHA 3QKKA 4YJTA 5HU3A 5BMSA 4RJ7A 4YC3A 3TDVA 3KKVA 4BDDA 3E8EA 3ZCLA 5D11A 5E92A 3QQGA 1LEZA 4A9UA 4FKLA 1WVWA 3GGFA 3ULIA 4N57A 3OF0A 3KF4A 2ZM1A 3BELA 4GVJA 5HO8A 2OZOA 1ZRZA 3FQHA 4AGWA 4H39A 2CHLA 2G2FA 4I5PA 4LYNA 5CNOA 4CFNA 3KMWA 2Y9QA 3R71A 1QPCA 3NGAA 5HLNA 1FMOE 2UVYA 4R3CA 3VJOA 3MSSA 4J71A 3OOMA 3DA6A 4GUBA 4JQ8A 2NRUA 4RX9A 4PDYA 5JFWA 3SA0A 2WMQA 2O3PA 5CU2A 4LM5A 1NVQA 3P79A 4JIAA 1WBTA 5IEVA 1H1WA 2W1EA 3D5WA 3TG1A 3SW7A 1URCA 5E1SA 5EK7A 3CIKA 2PPQA 4JG8A 4FE2A 4FTIA 3PXFA 3DBQA 2QR7A 2BZHB 3CY3A 3QTSA 5FEQA 4BCNA 5BVOA 4A4XA 2HXLA 3WE8A 3L8VA 1L3RE 3R7VA 4AUAA 5AMNA 3EQDA 3JR1A 1ZYDA 5LVPA 2YLFA 3UOLA 3WIGA 1P4FA 2PUPA 4ZSJA 4TYJA 5CI6A 2YM7A 3LMGA 4OTWA 3FMDA 5AP2A 1H01A 4FVRA 2YEXA 2QOHA 4OLIA 5GJDA 3DBEA 4CT1A 4G6LA 4C36A 4D4SA 4L67A 1YKRA 3KRXA 3VWAA 4FEVA 5C03A 4M67A 4TYGA 3R1SA 3U51A 4E7WA 3TNWA 3KQ7A 2OZAB 5HBEA 5D10A 4YZCA 4C4EA 3IDPA 4DFXE 4O0YA 4MF1A 3ZYAA 3IW8A 5DR9A 3H3CA 2B9FA 4ID7A 4QPMA 3QRTA 3ZM9A 2UW4A 4KINA 4CLIA 1OVEA 3CD3A 3FI4A 1XH8A 3IDCA 3ALOA 5BVNA 2CKQA 4DH7A 2WEIA 2OO8X 5BPYA 2R3RA 3HMMA 4IX6A 3TZ9A 4EH3A 3EQFA 3QZGA 4DEDA 2XNNA 1WBVA 3OW4A 3ZXTA 3R9OA 3DTWA 4FV2A 4ASEA 3PVBA 4XG9A 3L9LA 3S1HA 1PRYA 5EQEA 2HY0A 3VBQA 3H30A 5FEDA 4EH5A 2GSFA 3ACKA 3BPRA 3MY1A 2VX3A 3ERKA 4BDIA 4W8DA 3DAEA 2ZMDA 3VAPA 3F5PA 4K0YA 4YBKA 4PPCA 5AA8A 4AX8A 4AE9A 3QXPA 2HENA 2XVDA 3C4XA 4PTGA 3FKNA 1L8TA 3FMLA 4OTRA 1KE8A 4PRJA 4G3DA 4GU6A 4O22A 2OBJA 5DI1A 2PWLA 4ENYA 2Z2WA 1OBGA 4AT3A 4HZRA 4TTHB 2Y6OA 3EHAA 4NL0A 4M69A 3GFWA 4MTAA 2P0CA 1XH9A 4IC8A 2QURA 4TZRA 2BZKB 3D83A 4FSWA 4G9RA 3V6RA 4E20A 5HIEA 2JDVA 2RKUA 3OROA 3UOHA 4O96A 3UQFA 3QXOA 3WF6A 5LVNA 4GYIA 4L6QA 2IZRA 1BI8A 5A4TA 4DA5A 4RA4A 5AUYA 5HVJA 1RE8A 1E9HA 3NLBA 4WOVA 3IOPA 1PHKA 4BDEA 3CKXA 3DLSA 3OUNB 2WQBA 5EOLA 2QLQA 2ZAZA 5JSMA 3MV5A 5I9VA 3DB6A 4I93A 4D9TA 3BHYA 3PY0A 1R78A 1MP8A 3ANQA 3NEWA 4C57A 2Q0BA 5DPVA 3VS2A 3NCZA 1FVRA 2UW7A 1TQIA 2XNPA 3OCGA 4L43A 4PDSA 3REPA 1OKZA 4IFCA 3UO4A 2RFEA 1KE5A 2VO6A 3CJFA 2G1TA 1MQBA 3Q53A 5DOSA 4U3YA 4ZZNA 4DFYA 2OICA 4KWPA 2AC3A 4W9WA 5IQDA 2CGXA 1DS5A 4R3PA 5JRSA 4PMMA 4C4HA 5HHWA 4PTEA 3GCVA 3QCYA 2QOFA 5FTQA 3UVQA 1U4DA 3F7ZA 4F09A 3ORIA 3QBNA 4ZXTA 3WZDA 1H1RA 1JKTA 2IWIA 4RGJA 1BL6A 2OF4A 3PRIA 5GZ9A 3SC1A 2R7BA 3IGOA 4AT4A 5C26A 1UU8A 3O71A 1U54A 3UIMA 5DYJA 3LFQA 3FC2A 4XEYA 5HLWA 4RT7A 4BB4A 4KA3A 4AW2A 2VTSA 3KRLA 3NUXA 4V04A 2WQNA 4ZSGA 2C30A 3AD4A 4H3PA 3A7GA 5L2TA 4U41A 4AW1A 2WTKB 4QTCA 4QP7A 2DUVA 2YWPA 4FSRA 4UWBA 4W4YA 2O63A 4GFGA 4YTFA 1IAHA 1H8FA 3QRIA 4S30A 4IQ6A 1OL7A 4EZ7A 4ZZOA 4XG2A 4TT7A 4PTCA 3VHEA 4BYJA 3S00A 5CALA 1CSNA 2UW9A 2VTLA 3TNPC 3DKCA 5EQPA 2FB8A 4MNEA 4YLJA 1IASA 2IVUA 1OPJA 1OIYA 3GP0A 2QU5A 3A8XA 5T3QA 3ZFXA 1SVHA 3RJCA 3D94A 4EH4A 3EQIA 4FV4A 4RVLA 4TYHB 3E62A 1PY5A 2XS0A 3DPKA 3MH2A 4G3EA 2Y4IB 5AEPA 4K33A 4EHVA 3ORMA 4BDHA 3LVPA 1OZ1A 5GINE 4A9RA 4M3QA 5EG3A 1HCKA 1NXKA 4FR4A 4G2FA 1ZOGA 3DTCA 4I3ZA 1G5SA 3BI6A 2WTCA 4GEOA 4YU2A 3LFFA 2QG5A 3TN8A 4IVBA 2W5AA 1JOWB 4M68A 4W9XA 1H08A 5A14A 5CAOA 2EB2A 5K4IA 4PMTA 3CXWA 5F20A 4FTJA 2XK4A 3R8PA 1ZZLA 2PVNA 3ID6C 1CKJA 4HYUA 2C1AA 4BYIA 4TWOA 4DBXA 1JSUA 4Y73A 4CKJA 5GJFA 2ZB1A 3SD0A 4QPSA 3C4FA 4RBLA 3QALE 3UP2A 3C51A 3FHIA 5M44A 3OHTA 2YDIA 3R28A 3O8TA 3LXPA 4QMWA 1PYXA 2C4GA 3BIZA 3T3VA 3V8TA 5LCJA 3ITZA 3MIAA 3LQ3A 5JGDA 5ANIA 1UKIA 5C8KA 2ZM4A 4BDBA 4KIQA 4JJRA 4YO6A 4HCTA 3A8WA 3JUHA 4H1MA 4YHJA 3WYYA 3EQCA 2XF0A 5LMKA 3WARA 4Y5QA 3TL8A 4ZZMA 2PTKA 4JDIA 3MA6A 5AWMA 3ORZA 4AN3A 4AP7A 5L8LA 4HGSA 4RWLA 3G90X 2WPAA 2EXEA 4G1WA 4ZTHA 3WYXA 2XK8A 4EWQA 3QCQA 5J7HA 4RIXA 4O7ZA 4I20A 1M2RA 3SQQA 4ZEGA 5C27A 4JAIA 4APCA 2VWWA 2C0TA 3PFQA 5HICA 4JLCA 4FSUA 3EB0A 4XV3A 4FKWA 3F5UA 3OEZA 2YISA 4EK6A 4DT9A 2J0LA 5T68A 1MRVA 2YM6A 4QTEA 3MESA 2FA2A 4DEGA 3KL8A 2QOIA 3AC1A 2A2AA 2CNUA 2OJIA 3Q2JA 3O96A 3F3TA 4Q5HA 2ZOQA 2XIXA 4B4LA 4BTMA 3PVWA 5BQ0A 2GS6A 2FO0A 2XJ1A 1GOLA 2WQMA 4C61A 3IPHA 1BYGA 2BAQA 2BCJA 2J51A 4OTPA 4C37A 1M2PA 1VEBA 3M1SA 3FMEA 3FLYA 4TWPA 3BYMA 2UVZA 5ETFA 5KMLA 4B9DA 3HNGA 3F5XA 4O0UA 3R1YA 3JVRA 3PSBA 4KRDA 4DGLC 2X7FA 1KOAA 4FKVA 3EL8A 4PL3A 4MD8E 1W98A 3EJ1A 2PVHA 4OTDA 4YC6A 5C01A 5CANA 1JAMA 2P33A 1Y8YA 3PJ3A 4GCJA 1WBNA 2HELA 3FSFA 3ZM4A 3D0EA 4FSNA 3FLWA 2G9XA 4DHFA 4FKGA 5L4QA 3F88A 2RIOA 2VTOA 3FLSA 1WBWA 3NDMA 3C9WA 4R7HA 4CZTA 4FTCA 3ZEPA 5EKNA 3A4PA 1UKHA 4MVFA 2YM8A 3QYWA 4YBJA 4IMYA 4A7CA 5CQWA 3BU6A 2ITQA 3KMMA 2B9IA 4FSZA 4R5YA 4C38A 3ZO1A 4DYMA 4OTFA 3ZUVA 3MDYA 3II5A 5FD2A 5HGIA 3UMXA 2RFDA 3BEAA 1WFCA 4YZDA 1BUHA 4DC2A 3LMHA 4IB0A 1SVGA 5EW3A 3NUUA 2UZOA 3HAVA 1HCLA 4I4EA 3LMIA 3P86A 4RMZA 4HW7A 4FUXA 4O7LA 2FSLX 1ZYCA 5FXSA 2WFYA 2QR8A 4U81A 3GVUA 4W8EA 3RKBA 2CNQA 3FPQA 5AM7A 1VYWA 3IGGA 2FH9A 3LFBA 3NNWA 4QQ5A 4ANSA 5HO7A 3NWWA 5IH6A 5M56A 4IZAA 3BWJA 4IADA 3LJ1A 4IJ9A 4BBEA 3RCJA 3PE1A 3PIXA 4RWKA 3E64A 2OGVA 3MIYA 3E8NA 4CVAA 1YQJA 3MB7A 4WNPA 3N4VA 3MPAA 4BTKA 4LMUA 3W2CA 5CZIA 3NYVA 3VQHA 2ZV9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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