The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
PMFEAAYDFPGSGSPSELPLKKGDVIYITREEPSGWSLGKLLDGSKEGWVPTAYMKPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| molecule keywords |
Myosin-5 isoform
|
| publication title |
Yeast Myo5 SH3 domain, tetragonal crystal form
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
11
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RPN A; 2KT1 A; 2JM9 A; 2C0O A; 2JTE A; 2X3X D; 2RQT A; 2OI3 A; 3M0T A; 4RTX A; 4RUG A; 1JXM A; 1X2Q A; 2SRC A; 5IHK A; 5FWC A; 1BU1 A; 1PRL C; 1VA7 A; 1W1F A; 2ENM A; 2CUB A; 1KIK A; 1T0J A; 2GNC A; 2I0N A; 1Y57 A; 1WIE A; 3EG3 A; 1IO6 A; 1UHF A; 3NMZ C; 3SEM A; 1EFN A; 1OV3 A; 1WLP B; 2PZ1 A; 2E5K A; 2JW4 A; 3R6N A; 4JJC A; 2LCS A; 2KRO A; 2GQI A; 2YT6 A; 2A28 A; 4DEY A; 1PRM C; 2V1R A; 4RTV A; 2DRK A; 1K0X A; 4J9G A; 3JV3 A; 4LUD A; 1JU5 C; 3I5R A; 1K4U S; 1PWT A; 1GBR A; 1J3T A; 1UGV A; 1SRL A; 2DJQ A; 1X43 A; 1G83 A; 3U23 A; 1UUE A; 1OPL A; 1X6G A; 2DMO A; 1WA7 A; 1OEB A; 1WX6 A; 3THK A; 1CSK A; 2ED1 A; 2ECZ A; 4AG1 C; 1XOV A; 2JM8 A; 2KEA A; 2EVR A; 2KR3 A; 1BK2 A; 4OMP A; 1BBZ A; 2KRS A; 2DM1 A; 2FPF A; 2EGE A; 3EGU A; 4Z88 A; 3VS5 A; 4A63 B; 1K9A A; 4CC4 B; 2P4R A; 4JJB A; 2EYY A; 2KXD A; 2GTJ A; 4J9E A; 2MIO A; 1YCS B; 1PHT A; 2RF0 A; 2RQV A; 1ZUY A; 2J6F A; 2AK5 A; 1UTI A; 2IIM A; 1V1C A; 4FSS A; 1NYF A; 2FPD A; 1HSQ A; 2DIL A; 3TSZ A; 3VRZ A; 1WXB A; 1GRI A; 1RI9 A; 2ABL A; 1AZG B; 1M30 A; 1AZE A; 1NLP C; 2LJ3 A; 1GCQ A; 1JEG A; 3EG2 A; 3NHN A; 1WFW A; 4Z8A A; 1SPK A; 2PTK A; 1ZBJ A; 2J7I A; 2J6O A; 2BTT A; 3O5Z A; 5IXB A; 3TVT A; 2K2M A; 2FPE A; 1QKX A; 5IHN A; 1ZUU A; 4D8K A; 2EYZ A; 1MV3 A; 4KRT A; 3A98 A; 4J9F A; 1OPK A; 1H3H A; 3VS7 A; 2NUZ A; 2FEI A; 2KT8 A; 2YDL A; 1M27 C; 3FJ5 A; 1YWP A; 2D8H A; 4JPB W; 2DL8 A; 2RN8 A; 1UE9 A; 2D1X A; 2RQR A; 2VKN A; 5I11 A; 3UA7 A; 1NEB A; 4RTT A; 2EGA A; 2FG0 A; 3GBQ A; 2JT4 A; 2DL4 A; 3UA6 A; 2LZ6 B; 3NPF A; 3VS1 A; 5L23 A; 1W70 A; 1JXO A; 2DA9 A; 4HCK A; 3PE0 A; 1OOT A; 3H0I A; 2J05 A; 3CQT A; 2HCK A; 1AVZ C; 2EPD A; 1AEY A; 1W6X A; 2KRM A; 3QWX X; 1WXU A; 2G6F X; 2KNB B; 2BZ8 A; 4J9H A; 1JO8 A; 2C0I A; 4GBQ A; 4LUE A; 2F2V A; 2YUP A; 2ED0 A; 2AKK A; 1TUD A; 2CSI A; 1S1N A; 4JZ3 A; 4IIM A; 3H0F A; 1GFD A; 4IIO A; 4ESR A; 4OMO A; 1MUZ A; 2CSQ A; 1K0S A; 1N5Z A; 4OML A; 1E6H A; 2DF6 A; 1VYT A; 4F17 A; 2YSQ A; 2DE0 X; 1JQQ A; 4Y92 A; 3M0Q A; 4AFQ C; 1HD3 A; 1B3Q A; 1QWF A; 3PVQ A; 1WDX A; 2J06 A; 2DL3 A; 1CKA A; 2CT4 A; 3NGP A; 3EG0 A; 1UHC A; 1K1Z A; 1WXT A; 2KYB A; 2NWM A; 1HJD A; 1KSW A; 2EGC A; 1RLQ C; 3I9Q A; 2D0N A; 2RMO A; 1PNJ A; 4OMN A; 4D8D A; 2YUQ A; 1QLY A; 5FW9 A; 1E7O A; 1NM7 A; 2O31 A; 2DL5 A; 1YN8 A; 2LQN A; 2CH4 A; 2DL7 A; 2L3P A; 2ROT A; 3VS3 A; 2LJ0 A; 3M0U A; 4CC2 A; 3I35 A; 2BZY A; 1U06 A; 2V1Q A; 3UAT A; 1ABQ A; 3TSW A; 2QDL A; 2DVJ A; 4OMQ A; 2JXB A; 2HSP A; 4LNP A; 1FMK A; 2H8H A; 3M0P A; 1WI7 A; 2K9G A; 4JJD A; 2GBQ A; 2FRY A; 1X27 A; 4ORZ A; 2B86 A; 1ZSG A; 2KYM A; 3REA B; 2JS0 A; 4J9C A; 3EHQ A; 3KFV A; 2FO0 A; 3I5S A; 2BZX A; 2KBT A; 2EKH A; 4RTZ A; 1NG2 A; 1U3O A; 4AFS C; 1SRM A; 1YNZ A; 2LP5 A; 3RNJ A; 2CRE A; 5ECA A; 1I07 A; 4AFZ C; 1M3B A; 2A37 A; 3UF4 A; 2A08 A; 2F2X A; 2ROL A; 1RLP C; 2JMC A; 1GCQ C; 2JS2 A; 3EG1 A; 1U5S A; 2RNA A; 5GJV B; 4Z89 A; 1UDL A; 2VWF A; 3LH5 A; 1GL5 A; 1T0H A; 1X2K A; 3EHR A; 2L3S A; 1FYN A; 1SHG A; 1SHF A; 2KGT A; 2L0A A; 3M0S A; 2CH4 W; 1M8M A; 2M51 A; 4OMM A; 1AWW A; 2AZV A; 5IXF A; 1RUW A; 4J9B A; 2W0Z A; 2GTO A; 4JZ4 A; 2RQW A; 4DEX A; 2VVK A; 2K79 A; 3QWY A; 1ZUK A; 1X69 A; 3ULR B; 1KFZ A; 1QCF A; 3C0C A; 4RTY A; 1H92 A; 1M3A A; 4HVU A; 2YUO A; 2SEM A; 2XMF A; 1AD5 A; 1QWE A; 4AG2 C; 4R0K A; 3VS6 A; 2O88 A; 2FRW A; 1I1J A; 4GLM A; 1YP5 A; 2AKL A; 2O9S A; 3RBB B; 2OJ2 A; 1GBQ A; 4CC7 A; 4F16 A; 1GFC A; 1AWO A; 3M0R A; 4LN2 A; 1AOJ A; 5IH2 A; 4HXJ A; 1T3L A; 5FWB A; 2RQU A; 1UEC A; 2HEQ A; 2LQW A; 1GCP A; 4J9D A; 2MOX A; 2AZS A; 5EC7 A; 1SEM A; 1ZX6 A; 4J9I A; 5IHI A; 3VRY A; 3REB B; 2LNH B; 4RTU A; 1ZLM A; 2C0T A; 4E6R A; 1H8K A; 1PKS A; 2M0Y A; 2KE9 A; 1AWJ A; 4RTW A; 4HVV A; 1M3C A; 4K11 A; 1MV0 B; 1A0N B; 1YWO A; 1ABO A; 1NEG A; 2K7A A; 2DNU A; 4QT7 A; 3VS2 A; 3H41 A; 1LCK A; 1G2B A; 4X1V A; 1Y0M A; 4M4Z A; 4ZNX A; 4LE9 A; 2CT3 A; 2MCN A; 2DBM A; 4WCI A; 4AFU C; 3H0H A; 1UJY A; 1UJ0 A; 2DYB A; 2F2W A; 2X3W D; 2K6D A; 1NLO C; 5I22 A; 1UFF A; 4EIK A; 2ESW A; 2CDT A; 3VS0 A; 2CUD A; 1X6B A; 3PVL A; 2LMJ A; 1T3S A; 2K3B A; 2PNI A; 1VYU A; 2DBK A; 2YUN A; 1WYX A; 1I0C A; 5HCK A; 1BB9 A; 3ZL7 C; 2LJ1 A; 1K76 A; 2L2P A; 4HVW A; 2J6K A; 2HBW A; 2DX1 A; 1VYV A; 1AWX A; 2LX7 A; 1NYG A; 1B07 A; 5GJW B; 2D8J A; 1CKB A; 1Z9Z A; 2OAW A; 2DLP A; 2KRN A; 1SSH A; 2EQI A; 3SHW A; 2JMA A; 2DRM A; 1Z9Q A; 1TUC A; 1ARK A; 2O2O A; 2GGR A; 2O9V A; 3IQL A; 2EBP A; 2HDA A; 4F14 A; 2EW3 A; 1UG1 A; 2W10 A; 2A36 A; 2EYW A; 1QKW A; 2EYX A; 1E6G A; 1PKT A; 4CC3 A; 2KXC A; 3VS4 A; 1KJW A; 2L3Q A; 1TG0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RR6 A; 2RPN A; 1KC8 C; 1FXX A; 2V26 A; 3VJP A; 3I56 T; 4RUG A; 3M55 A; 1PSF A; 5FWC A; 4MZM A; 2XDP A; 1VA7 A; 4JDS A; 3CPW P; 3M9Q A; 2DXB A; 3OYJ A; 2HBP A; 1VQK T; 1T0J A; 3PTA A; 1QW1 A; 3JCM X; 1X75 C; 1Y57 A; 2HL3 A; 3NMZ C; 5I21 A; 1Q81 U; 4LDW A; 3L2U A; 2JOY A; 5IN1 A; 2KRO A; 2LCS A; 2A28 A; 3OW2 A; 1Y7X A; 4B9X A; 2QQS A; 3FRN A; 3JV3 A; 1PM3 A; 3MJX A; 1YJW T; 1UGQ B; 2P0K A; 1K4U S; 1GBR A; 2QQA A; 3TQ7 P; 4M7A C; 2JZ2 A; 2LCL A; 1KQ1 A; 3EFO A; 7AT1 B; 1X43 A; 5GAN j; 1G83 A; 5GAN 2; 1X6G A; 1OEB A; 1SSF A; 4OGC A; 3QG1 A; 4ZTF A; 1XOV A; 4C0D B; 4BI3 A; 2JM8 A; 3PGG A; 3OYB A; 4FM4 B; 2EVR A; 3SFM A; 1BBZ A; 2KRS A; 3VS5 A; 2EGE A; 3CCE A; 2HQX A; 4PJM A; 2OTL T; 2P4R A; 2PUK B; 2COW A; 2VXF A; 3JSC A; 4E2F B; 3DLL A; 2EYY A; 2CP2 A; 1VQN T; 3QYH B; 3EFS A; 2RQV A; 2DTH A; 1RAI B; 2HMA A; 2J6F A; 1N27 A; 1OU9 A; 5A2Q E; 4FSS A; 1YJN Q; 1VQ5 A; 2QEX Q; 1HSQ A; 3TSZ A; 4PL6 A; 4XTU A; 1I5L A; 1GCQ A; 4LDX A; 3M53 A; 4IUV A; 3OYK A; 1IB8 A; 3CCS A; 2QAZ A; 1M9S A; 4ME7 A; 4BE0 A; 4AT1 B; 2PQW A; 1KQS P; 2X4W A; 4L5G A; 3C4S A; 1YJ9 Q; 2BTT A; 4E7Z A; 3EGX B; 4L6V 5; 1N8R U; 2LNV A; 3TVT A; 5LJ5 g; 2FPE A; 3CME A; 3CXC S; 4DBH A; 3JB9 D; 4QVZ A; 5IHN A; 2EYZ A; 1VQL Q; 3TU4 K; 5A0D A; 3E1S A; 4X9C A; 3NTH A; 4E7K A; 4N0A C; 3BY7 A; 2QGF B; 2GF7 A; 2KT8 A; 2YDL A; 1Q86 C; 5GAN 5; 5IT9 E; 1YWP A; 2KY9 A; 4JPB W; 2RN8 A; 4OB1 B; 2VKN A; 4J6Y A; 3GLX A; 1JJ2 P; 3EGD A; 1QVF A; 2RJC A; 3GBQ A; 4A4E A; 2JT4 A; 2K3X A; 2DL4 A; 5CKD A; 3C12 A; 2LZ6 B; 1M1F A; 1UEB A; 1OOT A; 2J05 A; 2EPD A; 3CC4 A; 1AEY A; 4ZGE B; 2KNB B; 4MZT A; 4O6J A; 2BZ8 A; 4J9H A; 1JO8 A; 5LJ3 f; 4GBQ A; 2F2V A; 2QA4 A; 2XG8 D; 2KQW A; 2AKK A; 2CSI A; 3QHS A; 4JZ3 A; 5GMK l; 5DM7 R; 2A7Y A; 4IIM A; 4C8Q D; 4ESR A; 1TUG B; 5GMK h; 1TS9 A; 2EAY A; 1ZBX A; 1K0S A; 1QVF S; 1Q95 G; 2DF6 A; 3CCJ A; 4F17 A; 2DE0 X; 2HL5 C; 4Y92 A; 4N4H A; 2KDS A; 2J06 A; 3G71 A; 1B34 A; 4PFZ A; 2EJG A; 2MWO A; 4N4I A; 2QTV A; 2CT4 A; 4XU3 A; 3CCM Q; 4F7U B; 4C0G A; 4XU1 A; 1UHC A; 1K1Z A; 2EGC A; 1RLQ C; 4C8Q B; 3I9Q A; 2RMO A; 3UDC A; 1M90 R; 1KHC A; 1QLY A; 1NPR A; 2JJ9 A; 5HK0 A; 3HFN A; 2C06 A; 1KC8 U; 5KYU A; 1K9M C; 4L59 A; 2RJF A; 4EDU A; 2DL5 A; 2YLC A; 1TSF A; 2L3P A; 3NTK A; 3UT1 A; 3JCM c; 3X24 B; 4KBM B; 3M0U A; 2D6F A; 1IGU A; 5GAN g; 3GF5 A; 2V1Q A; 2DYI A; 3QDR B; 4Z02 A; 4II1 A; 2M9U A; 2NUT B; 1WZO A; 4OMQ A; 2RK1 A; 2PVO B; 2HSP A; 1VQ5 T; 4LNP A; 4M75 D; 1FMK A; 3CPW A; 1YI2 A; 4E7H A; 2VGN A; 2GBQ A; 4OVA A; 2CS7 A; 2KYM A; 3CCS T; 2YWW A; 5KYN A; 2FO0 A; 3I5S A; 2BZX A; 4M7D E; 3CCU Q; 2EKH A; 4RTZ A; 3M56 A; 3CC2 A; 1U3O A; 2JTM A; 3SD4 A; 3CME T; 4AFS C; 2VAS A; 1YNZ A; 3E9F A; 4E7J A; 2ZPG B; 4M75 B; 2D0Q B; 3H9N A; 2DEQ A; 1PD0 A; 4BY6 C; 3CPW S; 2JTF A; 1RLP C; 2JMC A; 1GCQ C; 1UGS B; 4M77 F; 1M8V A; 2K57 A; 2RNA A; 1GL5 A; 4XTW A; 2VWF A; 2MPX C; 1YHQ Q; 1SHG A; 2E6Z A; 4J7I A; 3MP1 A; 3M0S A; 2HKQ B; 4FYY B; 2XHC A; 3CC4 T; 4LDY A; 4M77 G; 2CZ6 B; 1W2B P; 3L2W A; 4DBF A; 3QYG B; 3CC7 Q; 5KH6 A; 2QA4 T; 2K79 A; 3KBG A; 3QWY A; 1M1K C; 1X01 A; 4PFP A; 1H92 A; 4M7D C; 2RA2 A; 4HVU A; 2YUO A; 2XMF A; 3JCM g; 3GP8 A; 3DLM A; 2WSF E; 3A8G B; 4PLI A; 3OYN A; 1OX9 A; 3CCJ T; 3I55 Q; 4OB3 B; 1YP5 A; 2O9S A; 2RHU A; 3RBB B; 1KQS A; 4F16 A; 2ZCF B; 3G71 T; 3M0R A; 1VQP Q; 5FU6 B; 5C0M A; 2RH2 A; 1T3L A; 5FWB A; 2XID A; 1UEC A; 1D0X A; 1TTH B; 1Q86 U; 1GCP A; 2WSE E; 2G3R A; 1VQO Q; 3RUX A; 1SEM A; 1Q86 R; 4J9I A; 3WXM B; 5CKE A; 3VRY A; 1JJ2 A; 3EAE A; 4M7A F; 3OBW A; 1ZLM A; 5A0G A; 2D9T A; 5FU7 B; 3OS5 A; 3QKJ A; 1KD1 R; 3NTI A; 4IUU A; 3PMI A; 4JLG A; 3A5Z B; 1KQS S; 1M2V B; 1YWO A; 8ATC B; 2QAS A; 4N4G A; 4A4H A; 1LOJ A; 2K7A A; 1YI2 T; 1IHW A; 5I2S A; 4XTX A; 3JCM e; 2CP5 A; 3QPH A; 1LCK A; 1Y0M A; 1K73 C; 3OBY A; 4ZNX A; 2MCN A; 4M77 A; 2F2W A; 3CC2 T; 2X3W D; 1NLO C; 1WHL A; 3E2U A; 3JB9 I; 2L8D A; 3M57 A; 4EIK A; 3CCL A; 2ESW A; 1YIT Q; 3LX7 A; 1D1A A; 2CUD A; 4C0D C; 4KH0 B; 3PVL A; 2NYS A; 2K3B A; 4KUD K; 2F1L A; 3CCM A; 1K76 A; 3L2R A; 1K9M U; 2J6K A; 2HBW A; 3MO8 A; 3RDV A; 2LT4 A; 2DX1 A; 1AWX A; 2BKD N; 3S3M A; 5GAN 4; 1K9M R; 2D8J A; 2HNI A; 2QK0 A; 2DLP A; 2JMA A; 4NOY A; 3G6E A; 2DRM A; 1G3S A; 2ZPB B; 1ARK A; 2DEU A; 1LJO A; 2GGR A; 2O9V A; 2EBP A; 2KI7 A; 4F14 A; 2EQJ A; 2A36 A; 2CP0 A; 3V7R A; 4JUV A; 2R5M A; 1C6V X; 3LW5 E; 4RTX A; 4OB2 B; 2XU8 A; 2KT1 A; 2C0O A; 3M0T A; 1PD1 A; 3CXC P; 1JXM A; 1QQJ A; 3BDL A; 4HCC A; 3LWI A; 5AYF A; 4CRI A; 2V8K A; 4A54 A; 3OA6 A; 2LDM A; 2FL7 A; 3L2Z A; 1XNI A; 1W1F A; 2K4Y A; 2CUB A; 2GNC A; 5L8R E; 1WIE A; 1DJ7 B; 4F7U E; 1VQL T; 3JCM Q; 2E3I A; 2EYQ A; 1NPP A; 3VV0 A; 3JCM P; 1EFN A; 1WGS A; 2O01 E; 4J83 A; 1YIJ Q; 4C8Q E; 2YT6 A; 2V1R A; 3OB9 A; 4C0Z A; 1S72 Q; 3ZBD A; 4LD9 K; 2DTO A; 5GAO r; 2XDD A; 3RER A; 1J3T A; 1UGV A; 3MEU A; 2GCX A; 3OY9 A; 4B9W A; 5D6Y A; 2X51 A; 1UUE A; 1RL2 A; 1WX6 A; 1W2B A; 1CSK A; 1M1K U; 2DAQ A; 3QO3 A; 1VQ8 Q; 3V8L A; 2CGH A; 2KEA A; 4QQ6 A; 1K8A C; 1BK2 A; 4OMP A; 2DM1 A; 2FPF A; 5DLO A; 4Z88 A; 2E4H A; 1YFN A; 2O4X A; 1M2V A; 2BE9 B; 2MIO A; 2YRV A; 4EMH A; 2HKN A; 2IPO B; 2DTI A; 3OYH A; 2AK5 A; 2ZPF B; 1UTI A; 4M75 E; 2IIM A; 4MZP A; 4C8Q C; 3V7C A; 2FPD A; 5LJ3 h; 4OP0 A; 4RCC A; 1WXB A; 1GRI A; 2ABL A; 1M30 A; 3CCM T; 3QSU A; 1NLP C; 2V8I A; 4QKU A; 4YTL A; 4ZGD B; 1JEG A; 1BIB A; 1RAG B; 3EG2 A; 3EFR A; 1WFW A; 2E5Q A; 1SPK A; 2PTK A; 3CPF A; 4UC4 A; 1TOV A; 5J26 A; 1ZUU A; 1MV3 A; 4KRT A; 4J9F A; 2DER A; 3OS0 A; 4KH1 B; 1MHN A; 1RAB B; 2D8H A; 2D1X A; 1QVG S; 3HKS A; 1K73 U; 2VB6 A; 2XD0 A; 3H8Z A; 3G1J A; 2FG0 A; 3V7S A; 3NPF A; 3VS1 A; 5KYW B; 2QTX A; 4JRP A; 2Z0W A; 4HCK A; 1VQ9 Q; 3PIP A; 3OYY A; 2HCK A; 5GAN 7; 3L2V A; 3CCU T; 5GAM g; 2KRM A; 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