1YQJA

Crystal structure of p38 alpha in complex with a selective pyridazine inhibitor
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
356
structure length
356
Chain Sequence
HMLEMSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
publication title Design and synthesis of potent pyridazine inhibitors of p38 MAP kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 356
sequence length 356
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2005-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1yqjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1yqjA01
3C5IA 4UN0C 4K1BA 2UW9A 3D7ZA 4FT9A 1JSVA 2PVYA 3RI1A 3EKKA 4EUTA 2G01A 2CKPA 5FEDA 4GFMA 2ZMCA 4P5QA 4NEUA 4BGGA 3JPVA 4DFUA 3P7AA 4FTKA 4FEWA 2W1FA 4OTGA 5EYDA 5FXQA 3LKMA 3QGYA 3E87A 5D7AA 3TNIA 3GI3A 5BMMA 3SQQA 2H96A 2E9NA 2W9FB 1Q5KA 4NW5A 5EQPA 2BAQA 4RWLA 4UALA 2QR7A 5CU4A 3PWYA 1IA8A 3V5JA 2W7XA 4XV9A 4DFZE 4B9DA 2CKEA 3QKLA 4FL3A 4U97A 2H34A 3G0EA 1PRYA 3B2TA 4PTEA 5IA0A 1EH4A 3S3IA 4J99A 5D9HA 5CZIA 1WVYA 5TOZA 4RX5A 3I1AA 4FL2A 3WIKA 3ZM9A 4C34A 3OT8A 2W1GA 2H8HA 4FV6A 3UOKA 3GC8A 4YUQA 4XRLA 5J8IA 4FKTA 2O0UA 5DHJA 4YURA 4QTBA 2CNUA 4JX3A 2WD1A 4JR7A 4NM7A 4BWXA 4TYJA 1PKDA 3BPRA 4J98A 4CCBA 5JQ5A 1G8SA 3GENA 5LARA 2F7EE 2PMOX 4QNAA 3NW6A 4YJOA 4DN5A 3PJCA 1Q8WA 4M67A 5JFSA 2XRWA 3OWJA 4DEDA 3HKOA 5TKDA 4D2TA 2EVAA 1P2AA 3MB6A 4JDHA 1GNGA 3U4WA 3W8QA 3RVGA 3Q3BA 2GS6A 3WILA 5CEPA 4I5CA 4XP2A 2HIWA 5L4QA 3KMWA 4EUUA 2QHNA 5LQFA 2ACXA 3ATSA 4LGGA 3OW4A 4GUBA 4BB4A 4ZOGA 4BZDA 3CD3A 4OR5A 1Q24A 3FHIA 3QTIA 3FY0A 4QMOA 3A7GA 3DT1A 5AAFA 4EL9A 4PMPA 3OOGA 2X1NA 4QYHA 2IWIA 3A61A 5GIPE 4IVCA 1R3CA 4I21A 3NGAA 5IQFA 3JXWA 1OZ1A 3I6UA 4F7NA 4IANA 5CWZA 2YIWA 5AP7A 5BMSA 4NCTC 2CGVA 5I9WA 2GHGA 3C50A 2UZBA 2CCIA 2VTLA 4FV9A 4AAAA 3AG9A 5GIOE 4KIPA 4QMQA 3GU4A 3VHKA 5AUXA 4E6CA 3O8PA 3N4VA 3KXXA 3CBLA 4DEAA 1VZOA 3C13A 4C4HA 1VR2A 4RBLA 2FSMX 4AZSA 3S00A 3ZXZA 3VW6A 5ANJA 2YERA 4K6ZA 4FT5A 2UZNA 3PXYA 1I09A 4PDYA 4RLLA 3CKWA 3UTOA 3VIDA 2OFVA 1YRPA 5AR5A 3ZLWA 3EQRA 1RDQE 4D9UA 1DAWA 4IB1A 4YO4A 3PY0A 5E90A 3TZ8A 3VS5A 4ZLYA 4USEA 2PWLA 3S4QA 3MESA 3E8NA 3SXFA 3EFLA 4EOIA 2IW8A 2WTWA 3I81A 2XNGA 4V05A 3VUKA 4CFMA 4UX9A 2JDTA 3O7LD 4LRMA 3KRLA 2BIKB 5IEXA 3NSZA 5EW8A 3LE6A 5JFVA 4BN1A 5K4IA 4C37A 2B1PA 3CKXA 4CFWA 5EM8A 4FTCA 4D2VA 4C57A 3V04A 4X2NA 5ANOA 4D5KA 3PY3A 3GFEA 4MHAA 5C8MA 3KFAA 3P1AA 4CFNA 4UY9A 3UP7A 3AQVA 5HG7A 4FTUA 2BRNA 4CT2A 2HW6A 3KXNA 5HOAA 3DBCA 3UBDA 1MQ4A 3QRIA 4EH3A 4EJ7A 1AGWA 5IQAA 1GZOA 4W8DA 2CGWA 2XB7A 2PVLA 4V04A 4CT1A 4K0YA 3FLWA 4A4LA 3F66A 1H1SA 5IH6A 2B9IA 2VTSA 3ANRA 3G6HA 3M11A 5K4JA 1ZZ2A 3H10A 3TTJA 3ZYAA 3C4EA 4DEHA 1Q8TA 2X8IA 4FIEA 3DK6A 4WRGA 2OGVA 3NIZA 2R3FA 5TE0A 3RNIA 5EW3A 4DH1A 1OBGA 3CTJA 4IIRA 3AD5A 3BWJA 4U42A 3MY5A 1KUTA 3HDMA 4F7JA 3PA4A 1H1WA 5LOHA 4E4LA 5EK7A 3VS1A 4RG0A 5BVFA 1JQHA 2BCJA 3FKNA 3KC3A 1BL7A 4IX6A 4RPVA 3EQCA 3FZRA 3HA6A 4DEBA 4G5JA 3RNYA 5M57A 4NWMA 3LCTA 3BHTA 3ORTA 4F1OA 2NRUA 3I5NA 2GTNA 4DT8A 3E63A 3CTHA 2B4SB 3KL8A 4QP3A 3GFWA 3IK3A 3VBQA 3CPBA 3R8MA 3DBFA 3POZA 3VUTA 3DCVA 1PKGA 3IW7A 4A7CA 2ZM1A 3DV3A 1PY5A 3VBWA 4TTHB 1YOLA 4FGBA 4YTFA 2VWIA 2B52A 2C1BA 1BI8A 5EQYA 4WHZA 4ACMA 3K3IA 2VWVA 1K3AA 3DXNA 2JFMA 5J9ZA 2R2PA 2C3KA 4LUEA 3EL8A 4KBAA 4AN2A 3G15A 5AFVA 4JT3A 5DEYA 3F3UA 2QG7A 2WTIA 3PPJA 4NKSA 3QZIA 4QQJA 4G6LA 3CS9A 3GCVA 3POOA 4XBRA 4YGAA 3ZUVA 4Y46A 4AUAA 5DRBA 2QI8A 2CNQA 2AC5A 1PXKA 5LVPA 1J1CA 2X2KA 4B4LA 1TQPA 5AM7A 4RJ7A 4C4EA 3IW5A 3IGOA 4O0YA 1YDRE 3QQKA 4FSZA 1WBVA 4LL5A 2XJ1A 3GBZA 4IZYA 2WTKC 4ONAA 5AADA 3SLSA 5I3RA 4EZ3A 4EK6A 5H8BA 2PHKA 3HRFA 4IZAA 5AP4A 5B0XA 3R7IA 4GT3A 1G5SA 3VF9A 3QQGA 4EKLA 4BBEA 3WZJA 3HMOA 2C1AA 4TZRA 5BVEA 3NYOA 4HNFA 4UXQA 5KMKA 4MNEB 5E9EA 3K2LA 3G9NA 3F2RA 1JSTA 3OFMA 4ENXA 3TJDA 2BRBA 5KUPA 1SMHA 4O1PA 4F4PA 5A4EA 2OXDA 4GG7A 4FEUA 4GFGA 3UOLA 1YW2A 4AOJA 5HTCA 3NUNA 2XK8A 3MA6A 5AV0A 3FMMA 4KRDA 5IUGA 4FV4A 4UMTA 3TWJA 3P9JA 1OKWA 3ZRKA 2X9FA 4V0GB 1YI4A 3AC2A 1PXPA 4OUCA 3SOAA 2H9VA 3BGQA 5DR2A 4PDPA 1M7QA 1KE9A 2DUVA 3HP2A 3OTVA 4IM3A 4ZLZA 5CF6A 5D12A 4J1RA 4YJSA 3ZFXA 4EC9A 3A7FA 4O83A 3MVHA 4D0XA 2DS1A 3TNWA 4JRNA 1YXUA 2IJMA 3ENMA 4IBMA 4O6LA 2R3LA 4J53A 1W0XC 2EUFB 4R7BA 2R3RA 3R1QA 2VTOA 4BDHA 4FL1A 5I9XA 3EN6A 3QXPA 3EN4A 4ANOA 2IPXA 4X21A 3Q4ZA 5A4CA 4ZSLA 3QLFA 4H1JA 4MKCA 2W1DA 4XBUA 5AMNA 5AV3A 4YMJA 2NPQA 5AR2A 3SW7A 1U54B 3NIEA 2XKFA 5CI6A 4LQMA 1YWRA 3R7GA 5CI7A 4KSPA 5L8JA 3UPXA 1OVEA 3HZTA 2O8YA 1LEWA 4KKGA 3BU3A 4BTMA 2R3OA 2YLEA 5AWMA 1Z5MA 3N51A 1W98A 4OBQA 3RK9A 4X2JA 3LQ3A 1ZWSA 2R3NA 3BEGA 4G16A 4GEOA 4QD6A 5CSXA 4AW2A 5CNNA 3U6HA 5CF4A 1R39A 4JDIA 4EQUA 2O2UA 3H9RA 2VTRA 4O7LA 3BRBA 4P90A 2EU9A 2QLQA 4IFCA 5IQHA 3SHEA 3TG1A 3ZLXA 3H3CA 5CEQA 4FV7A 3T9IA 3Q96A 4EOKA 5E8TA 2YIQA 2ZDTA 4ZZNA 3Q9ZA 3D7TA 3IOKA 3L8XA 3OUKA 3TACA 3QTXA 2VD5A 3OBGA 4L44A 5HU9A 5DT3A 4FIJA 2XF0A 4TYGA 2BTSA 3SRVB 4QP9A 3LMHA 2OZAA 1KWPA 4FVRA 3ZSHA 4BDCA 4DH7A 3VUHA 1H24A 1MRYA 3A62A 3HECA 3LXNA 4CFXA 3I60A 4BGHA 2XIRA 4Z16A 5CZHA 3E8DA 4EORA 2PVJA 4I5MA 1HOWA 4K2RA 5EH0A 5GZ9A 4XNEA 2PMLX 3ZRLA 3G90X 3FSKA 3LFQA 1B38A 5D41A 3UO5A 3UOHA 1YDSE 1HCLA 2IZRA 3ZTXA 4U5JA 2GNIA 2C30A 3D5VA 3LJ2A 2GNHA 1DAYA 3DZQA 3HVCA 2A1AB 1UNGA 1M2RA 4FSWA 4IC7A 4ANQA 4CFFA 1TKIA 4CRSA 2X8DA 3KCFA 3KY2A 1NT2A 4JR3A 2OH0E 3EN7A 4LI5A 3MBLA 4MEDA 5A6OA 1CTPE 4NJDA 3HMIA 2VNYA 5AUWA 3W33A 4ASZA 3FC1X 3G2FA 4ITHA 5M51A 2VV9A 3VS6A 3UQGA 3ZLSA 4U80A 4HVHA 4A9RA 3FI8A 5ETAA 4CSVA 1P4FA 4DG2E 4GYIA 3FYKX 2UW5A 4JBVA 5T68A 3HYHA 2PK9A 3RPSA 5CEKA 4CQEA 4CLJA 3SA0A 4RFMA 1H00A 3LQ8A 4R5SA 4O0SA 4ALWA 4MD8E 4LV5A 5CSVA 4AG8A 2OFUA 4EOQA 2NP8A 3EZRA 5IQIA 2JIUA 4DFYA 1Q61A 2R3MA 3TNHA 2WMQA 3VHEA 1ND4A 4Y95A 2XS0A 2C0TA 1SVEA 3FMKA 2PVNA 4GS6A 5HKMA 3UGCA 1ZMWA 2PMNX 3U9CA 5IF1A 3ANQA 3PLSA 1CSNA 4KKHA 5ACBC 3Q9WA 3LIJA 3LPBA 3C4FA 3TZMA 3WF7A 4D2RA 3F82A 4IH8A 4FOCA 4M14A 4ALVA 3DK7A 5M4CA 5FUTA 1JKSA 4MK0A 4DEIA 3F5XA 4PX6A 2W5HA 2RL5A 4M12A 5CAVA 1ERKA 2YJSA 4C2VA 1WVWA 5HE3A 5EOLA 2WMSA 3DAKA 3LFFA 1TQMA 4QYGA 3ZH8A 4L3LA 3A99A 3NNVA 3UP2A 2BHHA 3R04A 5HTBA 2GMXA 4N0SA 4QP2A 3QCSA 3HAMA 4NKAA 2J0IA 2QVSE 4IM0A 4UYAA 5KZ0A 2J0KA 3IQ7A 1ZYLA 4IDTA 4ZIMA 1WMKA 5DWRA 5BUIA 2CLQA 1OIRA 5BVKA 3PWDA 3WZKA 3ZO3A 4FSYA 2J4ZA 4RVKA 3QHWA 3VC4A 4RA5A 2JBPA 4IZ5A 1BLXA 4DLIA 4QP4A 3P79A 3UDBA 2EWAA 5CSPA 4E5AX 4P5ZA 4E93A 4Z3VA 1REJA 3R7VA 4OGRA 2VX3A 5BUJA 4XG9A 3GC0A 5AJQA 3UNZA 4BR3A 2HZIA 4I4EA 4KABA 4ASDA 4EOSA 4YC8A 2JKMA 4KRCA 3RKBA 3CJFA 1H25A 4APCA 4WNKA 5IH5A 2CPKE 4U43A 3UE4A 3F3WA 4PRJA 3LLTA 4IWPA 4FEXA 3MPAA 2BRGA 1SNUA 2CDZA 2O65A 2BZIB 3P4KA 4C3PA 5J1VA 4I0RA 2YLFA 4I3ZA 3R7OA 4AN9A 4EH6A 4F6UA 5KNJA 2ETMA 3LXKA 3TJCA 1MQBA 2BALA 3FZSA 3PPZA 3KGAA 4M0YA 5H8EA 3UODA 4PMSA 1H8FA 4QMTA 4WBBB 5K0KA 2J7TA 2JAMA 1WBNA 4FNYA 1APME 2WQOA 3KRXA 4NJ3A 4DGOA 2KTYA 4GYGA 5K9IA 3TN8A 4YSMA 4BCJA 3QQLA 4J7BA 4GU9A 3O8TA 4OTWA 4QOXA 4GG5A 2UZOA 4XOYA 5FD2A 5HLPA 3UO4A 4D4VA 4DE4A 4RJ4A 4QQTA 1BUHA 2YM6A 4F6WA 2VWXA 3A7HA 3HNGA 3KK8A 3OCGA 2WMBA 3R30A 2WTKB 4ANLA 3NS9A 4F9BA 3D83A 3I0QA 4XG7A 1WBPA 4FK3A 3KN6A 4RJ8A 3Q9XA 2PUUA 3CE3A 4DFNA 5BYZA 2E2BA 4EC8A 4P2KA 1H07A 1ZYDA 2HCKA 2W1EA 3NYXA 4XYFA 4EQCA 3UQCA 1ZOEA 4JQ8A 4R3RA 3PXFA 2XCHA 3V5PA 1LR4A 3ZBFA 3ZZWA 3ERKA 3LFCA 4GCJA 4JDKA 3LFAA 2PSQA 2WELA 3UG2A 3TL8A 5KMLA 2UW4A 4LOPA 3BCEA 4KINA 2XIXA 1UU3A 3NR9A 2IVUA 4FSUA 3L8PA 3F9NA 3QTZA 4ORKA 2ITWA 5EG3A 4ANNA 2OSCA 4AT5A 4FKOA 3RINA 4DG3E 4O81A 3FMDA 4JAJA 2QODA 2PULA 4HPUE 4CYIA 3EL7A 3RAKA 2HAKA 3O96A 3BIZA 3D9VA 3QUDA 2QQ7A 1SM2A 4DCEA 3LCSA 3R21A 5CQWA 3D0EA 3GCSA 3BX5A 1S9JA 5L2QA 3HRBA 5AP3A 4FODA 3WF9A 2R4BA 3QRJA 3TUDA 2C5VA 2BUJA 2HZNA 5ANDA 4CTBA 4FTLA 1KE6A 4IE9A 4AA0A 3AC1A 3KB7A 3F69A 3QYZA 4I1ZA 4R7HA 4KBKA 4DGGA 5IISA 4MNFA 4XG3A 3P23A 4I94A 4DLJA 4EBWA 2PUPA 5DOSA 3ACJA 4HYHA 4X2KA 5FM3A 4FTMA 5AM6A 3ZO4A 3ZZEA 4BWPA 4ZTMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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