1YVNA

The yeast actin val 159 asn mutant complex with human gelsolin segment 1.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGNTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords PROTEIN (ACTIN)
publication title Crystal structure of yeast actin V159N mutant
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1yvnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1yvnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1yvnA04
1NGCA 4H5NA 3RSEB 1ZXOA 3IMXA 1RGIA 3MN7A 2VYPA 3UKUA 2ASMA 2ZF5O 4XH5A 3QICA 2W41A 1XQSC 3H3OB 4H5TA 5AQHA 4FWNA 2GUPA 2GTDA 5AZIA 4B1ZA 5AQZA 1XUPO 2GELA 4EHUA 1NGFA 3H6EA 3QMLA 4CI6A 5ADXA 1HKBA 5AR0A 1HKGA 3VGLA 1BO5O 2FSKA 2P9UA 5AQLA 5AZJB 2A40A 2ZGZA 1NGAA 1X9JA 1QZ6A 2IVNA 1GLBG 4CD1A 4PL8A 2DPNA 3VPZA 2QWPA 4CBUA 5JLHA 4XH4A 3VF4A 5BPLA 3HZ6A 4BREA 2YCHA 3A5LC 2QWRA 4DB3A 3U4LA 1IG8A 5AQWA 3WQTA 3FZKA 3UB5A 2ZGYA 2V7YA 4NO7A 2CH6A 4BG8A 1BDGA 1QQOA 1GLJO 4FWOA 3D2EA 3JXUA 5AQSA 5KPZA 4H0PA 1KAZA 3MN5A 3DXMA 2P9SA 3H45C 3KZBA 3B8AX 2NRHA 5BRDA 1S22A 1BG3A 2NLXA 2P9UB 4B1WB 5LY3A 3GE1A 3ZX0A 4HWIA 2Q2RA 5B8HA 1DGKN 3VEWA 3D7EO 3W0LA 1EQYA 4FWLA 1DEJA 3A5NC 1ATRA 2I7NA 3A0IX 3CETA 3EZWA 3O1BA 4K42A 2BTFA 2YI1A 1GLEG 2KHOA 3CJBA 1U6ZA 1IJJA 2P9PA 1ESVA 4BC2A 3ATVA 2UYTA 3M6GA 3DJCA 3O4WA 1J6ZA 3O08A 4IZ9A 3WUHA 3OHRA 4BQZA 4A62A 2P9IA 2D0OA 3O5BA 3AAPA 4CZIA 4CZEA 1C0FA 5FPEA 1BOTO 1S3XA 4CZLA 4L3QA 4WQ5C 1BA0A 3TU5A 4BRHA 3VEVA 2E8AA 5AFUH 3EN9A 4H0TB 3C7NA 2F9WA 2Q31A 4CZMA 2F9TA 4B1YB 4DCHA 4H03B 1Z6RA 4WYBA 3H3NO 4ISFA 5FPNA 3SMSA 5JICA 4BRGA 4JD2B 3O1WA 1RDWX 1HPMA 3ENOA 1HLUA 3UKRB 1C0GA 3LDPA 1JCFA 3BEXA 1GLFO 3U8XA 2QWOA 1U2VB 4K25A 4EFHA 4BRDA 4IWVA 4YDUC 4CZFA 1X3NA 4IO8A 2E1ZA 3ZETB 5AQPA 3EO3A 4EHTA 1NWKA 4PL7A 4BC4A 3SK3A 2ITMA 3VEYA 5EX5A 4AM7A 1ZC6A 2A3ZA 4FWPA 3R6MA 1KAYA 1MA9B 3CERA 4BQLA 4AM6A 5TKYA 3GDQA 4XEIA 4CZJA 1GLAG 5AQOA 2YJEA 3BUZB 1DKGD 4HTLA 5AQYA 2GEMA 2GWKA 3CIPA 2AP1A 3ULEA 3TPQA 1QHAA 3J8AA 3MN6A 3WQUA 3CJCA 1Q18A 3O6WA 3P4IA 3ZX2A 4FPAA 4F9OA 1X3MA 4KBOA 4M7YA 4BR0A 5EY4A 2Q0RA 3WEEA 2HMPA 1QQMA 3HI0A 4JHDA 2A41A 1GLLO 4PKIA 4BR4A 1NMDA 4IXCA 4A2BA 1NBWA 3HBTA 4EIAA 4BGAA 3FR0A 3FZHA 2V52B 2P9LA 2YHXA 4H0XB 1T44A 3DXKA 4JAXA 4BRLA 3UKUB 4BR2A 5AQJA 5AQXA 5EOYA 4K43A 2PAVA 2IVOA 4BC3A 2YHYA 5AZIB 1MWKA 2Q97A 4A61A 4H5RA 4MLHA 3DWLA 3CJ9A 2P9NA 1K8KA 1SQKA 1HKCA 3U9ZA 3WXKA 4BRKA 5BPNA 1LCUA 3ZX3A 3SJHA 4Z94A 1WUAA 2CGJA 1MWMA 4IJNA 4H5WA 4MLEA 1NGJA 5BRFA 2FF6A 1E4FT 1E4GT 3WEEB 1TYQA 3LM9A 2V51B 4FWQA 2E2QA 3QBXA 4JNEA 5AQMA 4I6MA 3ENHA 4FWSA 2H3GX 4CZHA 4C23A 3VEXA 3LDLA 4RTFD 1G99A 3SLCA 1TUYA 2QWMA 5JMVA 2D1KA 3R9PA 3ZEUA 3CQYA 4BRAA 1R59O 4CJ7A 3EKSA 5F0XA 1P8ZA 3LDOA 3R8EA 5KPRA 1NGGA 4WQ4A 3UE5A 1GLDG 1V4TA 5E84A 3D2EB 3VGMA 3C0BA 3WXLA 1GLCG 3WXIA 1HX1A 3D2FA 3FFKB 1YVNA 2P9SB 1MDUB 3DXMB 3M1FA 5KQDA 3CJ7A 2A5XA 2QXLA 1KAXA 1V4SA 3QB0A 4A2AA 4FWRA 4EAHD 4CZKA 4LC9B 4BRFA 5ADXH 4DQ8A 3MMVA 2A42A 4H5VA 1CZAN 2OANA 5BPMA 2P9KA 3G25A 3VENA 3MN9A 4FWMA 1H1VA 3LM2A 1T6CA 2P9PB 1Y64A 2CH5A 2GWJA 4J8FA 4FO0A 3RSEA 1JCEA 1NGBA 2E1YA 5BREA 4WQ5A 3VEZA 2E2PA 4H0VB 3CJ1A 1BA1A 2P9IB 2QW9A 3VERA 4BVPA 1QQNA 2Q36A 3BP8A 3CJAA 4K41A 5BRHA 4Y0WA 2FLOA 4M7XA 4CD3A 3ID8A 1BUPA 5AZJA 5LJWA 3C7NB 3SMPA 3GBTA 3MK6A 3ATUA 5AQNA 2ZWHA 5CE3A 5LJVA 1OKJA 3F9MA 2EWSA 1JCGA 2Q1NA 4PKGA 4ISGA 4PKHA 3WXJA 2D0PA 1XC3A 3BF3A 3VF2A 2VWBA 4FL9A 2WUSA 5AQQA 2QWLA 1HJOA 3KVGA 5AQTA 2W40A 3U9DA 4O5FA 3AAQA 4B1UB 3HSCA 4BRNA 5AQRA 5AQKA 4RCHA 4QS8A 3MDQA 2HOEA 2QWNA 3VESA 3VEOA 3A5OC 2E2OA 1NM1A 5EVZA 2D4WA 3FZMA 4BGBA 1NGEA 2E88A 3VETA 5AFUA 1WOQA 2IVPA 1D4XA 3FZLA 4BR5A 2Q0UA 3JS6A 3DAWA 2YHWA 2E2NA 4FOEA 3M3ZA 1NGDA 4CZGA 3IDHA 5BN9A 2CGKA 2IIRA 2ASOA 4QS7A 3ULEB 4E1JA 2I7PA 1NLVA 3QFPA 4JN4A 4BR7A 3GL1A 2QM1A 1KXPA 4BRPA 2E20A 3VOVA 5I9EB 3LDQA 5KPTA 3CHWA 1SZ2A 3WT0A 4BRCA 1YXQA 3FE1A 2BUPA 4GNIA 4JHDB 1RFQA 2VCPA 5FPMA 4B9QA 2PBDA 3VGKA 4BRQA 1HUXA 1ATSA 3QFUA 4BROA 3O8MA 3MCPA 3FGUA 2ASPA 4QS9A 5KQ8A 2P9LB 3GOIA 2NZTA 4H0OA 3I8BA 1TUUA 3I33A 3DXKB 4WQ4C 4BC5A 4CBWA 3H1QA 3H46O 3QBWA 3EKUA 3L4IA 3QDKA 3S41A 1LOTB 1NGHA 4BVOA 5AQIA 1ZBSA 5AQGA 4O8KA 3CQXA 2P9NB 1K8KB 3AARA 3VF6A 2V7ZA 4JD2A 3CI5A 4GY2B 4M63C 3GG4A 3UKRA 5AQFA 4BRIA 5FPDA 3FLCO 3HM8A 1BU6O 1U2VA 1TYQB 3BF1A 3W3DA 1YAGA 1YUWA 5BR9A 4NB4A 4MO4A 3L6QA 4FSVA 5E26A 3ZETA 4I6MB 4FOIA 3EL2A 1T6DA 2FSNA 3FZFA 4B1VA 4FPBA 3ZEUB 3HTVA 3AY9A 4BG9A 2FSJA 1SAZA 3LDNA 4BR9A 3A5MC 4MO5A 4DHYA 5BN8A 2QWQA 1Z05A 1ATNA 5EXWA 2AA4A 4CBXA 2HF3A 2J4RA 4FWKA 5AQUA 3D2FB 2CGLA 3O80A 2HF4A 3KHYA 4BRMA 3A8YA 5F1XA 3IUCA 2YJFA 5AQVA 3L0QA 3LL3A 3IFRA 5F2RA 3H1VX 1QZ5A 5ELZA 2P9KB 4YDUA 5JLFA 4ISEA 1BWFO 4IJAA 4B1XB 2FXUA 4XH1A 2A6AA 4RWTA 1NGIA 2FF3B 4H0YB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RSEB 1BQNA 3MN7A 1N34K 4KB1A 2NRWA 4CJFA 3NGZA 3QICA 4B8AB 4DTOA 3CCEN 1LAVA 4CF9A 3THWB 5AQHA 3TAMA 2GTDA 2FBXA 3TAPA 5AZIA 5FLXO 2G8FA 2VGNA 4MFBA 1NK8A 2GELA 1NGFA 3DRSA 4KI4A 3VQQA 3VGLA 1YIJN 1VSLA 4C1NI 5AZJB 2A40A 4FJLA 1S6QA 4JK7A 4CD1A 2IS3A 2OYQA 3QINA 1SV5A 4DQSA 4XH4A 4DR2K 4B3TK 4JKGB 4DTXA 1C1BA 1N6QA 3VA3A 2QWRA 3ZCMA 4IG0A 4CEZA 4W5OA 4FW1A 4NO7A 4BG8A 4DG1A 2F7TA 1M90O 5CZ1A 3HRGA 4FWOA 5AQSA 3OBYA 4WF9L 4H0PA 1VRUA 3V1RA 1NK6A 1HQEA 3L8BA 5LY3A 4CK3A 1D8YA 3OA9A 1N32K 2A1SA 1IBLK 3VEWA 4DV6K 3D7EO 3W0LA 1EQYA 4FWLA 5LL6Z 3QETA 3I8DA 4QCLA 3A0IX 3CETA 3EZWA 3O1BA 4O55A 2BTFA 3K9JA 3CJBA 1XWLA 4E89A 3DJCA 2UXDK 3THVA 1TV6A 3CCMN 1A5WA 1F21A 4CJLA 3CC7N 3B6OA 3P1GA 1CXQA 4FJNA 3WUHA 4BQZA 3OBWA 4RW6A 4W5QA 4FJ5A 1RBRA 2P9IA 4CZIA 3NHGA 4B9TA 1BOTO 3HP9A 1D9FA 3E9PA 2O8FB 3N4QA 3K5OA 3MCAB 3NF7A 1XNRK 3V1QA 2XY7A 4XJXA 2UXCK 2F9WA 4CZMA 4B1YB 1VQNN 3KLFA 4ISFA 3H3NO 1X9MA 3AVBA 3O1WA 1HLUA 1GLFO 4K25A 4EFHA 4BRDA 1WSJA 4JRQA 1S1UA 4PL7A 1M1KO 4IBNA 4LD0A 3LPUA 4JI0K 3KTQA 1CLQA 5C2DA 4FLXA 2A3ZA 1KLMA 1KAYA 4WCEL 3ID6A 4O5BA 4XEIA 5AQOA 1QSLA 1YTUA 4JK9A 2GEMA 2GWKA 4EP4A 3NE6A 3J8AA 1JL2A 3VTHA 3MN6A 3CFPA 4CGDA 1SUQA 3CJCA 1Q18A 4DFPA 5T7BA 1Q7YO 3KKSA 1WLJA 4M3RA 4Q5VA 5I3UA 1KRPA 4B9NA 5J2QA 3MAQA 1VSJA 4IDKA 3QEVA 3JAMO 1NBWA 1KD1O 4DQQA 3OYEA 2Z1JA 4CGIA 3CQ8A 3G0ZA 1HYVA 1FK9A 1RTJA 4CEDA 4GW6A 2YHXA 4JAXA 3NVKA 5HL7L 3ZSWA 4B9LA 5AQJA 1TKDA 5E41A 2PAVA 2IVOA 4NXNK 5AZIB 4I9LA 2QKBA 4FVUA 4CJ5A 5HBMA 4NLCA 3DWLA 3PX4A 2P9NA 1K8KA 4DQIA 1LCUA 4H5WA 2FF6A 1E4FT 2QKKA 2V51B 1K6YA 4JNEA 1ASVA 3VQ9A 4DUZK 4CZHA 4C23A 3LDLA 4IFYA 4M45A 1G99A 5JMVA 2QWMA 3T19A 1B92A 3NAEA 5F0XA 4BACA 4EP5A 3QEIA 5C24A 4FLTA 2A1RA 3UE5A 4AF1A 3CCQN 1VSFA 3ISNC 4I7FA 1IH7A 3VGMA 3WXLA 3WXIA 1HX1A 2WTUA 3M1FA 2F96A 3RMDA 1T05A 3ZYYX 4OLAA 3OS0A 3WNGA 4CZKA 4BRFA 4KI6A 2YX6A 1CZAN 2OANA 4AH9A 5CYMA 4X62K 4M3UA 1RILA 4FCYA 1S1TA 3R1XA 1HYSA 1H1VA 2OPQA 4O44A 2IC3A 1Y64A 2OPSA 4E7KA 2RPIA 3CMAN 1TKTA 2E1YA 4JI5K 4WQ5A 1BI4B 3SAFA 3AVIA 3TAFA 2HHTA 1YVUA 3OYHA 1N33K 1BA1A 2P9IB 2QW9A 4E19A 4IFEA 3EZ5A 4DV2K 3ZLJA 1EWQA 3THYA 1W7AA 2HHSA 2HNZA 4Z4IA 3OYIA 3P39A 2FLOA 4M7XA 4CD3A 3PV8A 5LJWA 2IDOA 1NK5A 2ZWHA 5C2FA 5CE3A 5BR8K 4FLZA 3LANA 1TGOA 2EWSA 3CPEA 1QSYA 1L3VA 2Q1NA 5M1NA 1KFSA 3AVAA 3VF2A 1IBKK 5CYQA 2QWLA 3WNHA 1HJOA 3KVGA 4B9VA 3OY9A 1ZBIA 4I2PA 5AQKA 3MEDA 4Z0UA 1ZBHA 1VHXA 3VESA 2E2OA 1NM1A 4QAGA 2D4WA 2P51A 2UUBK 3DLBA 1NJXA 3LAMA 4KRFA 4BR5A 4MDBA 1ZBFA 3KKRA 3NBPA 2IAJA 3DAWA 4FOEA 1IKXA 5BN9A 2CGKA 1JLAA 2IIRA 3CC2N 4KHNA 2BDPA 4JI7K 2WONA 1QVGM 3QFPA 4JYAK 2QM1A 4FYDA 3LDQA 2UUAK 3SPZA 3I55N 4CVNE 4B9QA 2B5JA 4HHTA 1BGXT 3SBTA 1HUXA 4OVLA 3S3NA 1TL1A 2E6LA 3QFUA 4BROA 3FGUA 5GAEP 4JI6K 4CJ3A 3HSTB 4OKEA 1LWCA 1HR0K 2NZTA 3I8BA 1TUUA 4ILJA 4BC5A 3QBWA 3SV4A 3BDPA 1EKEA 3S41A 4FJKA 4DTNA 1YHQN 3RR8A 2VWJA 3V9SA 5AQIA 3AVCA 4X64K 2Z1GA 4O0IA 3QEPA 2KTQA 3CQXA 4PWDA 2P9NB 1W0HA 1K8KB 4LY7A 3CCSN 2RF2A 3AARA 4JD2A 3MXJA 4KFBA 1BQMA 3LZIA 3NCIA 3UKRA 2YNGA 1O13A 3H08A 1NKCA 3L6QA 1FKPA 3LDSA 4FSVA 3ZETA 4F3TA 3L2QA 4FOIA 4I2QA 1RT4A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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