The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structures of CO Hemoglobin E (betaE26K) approaching physiological pH (pH 7.5)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BAB A; 1C7B B; 3LHB A; 1VXE A; 4ESA B; 1Y0C B; 3QM9 A; 1Y4B B; 1X9F D; 4M4A B; 5E29 B; 4H2L B; 4U8U C; 1HAC A; 2ZFB A; 2GRH A; 3WCT D; 2D60 A; 1MBO A; 1YCB A; 1R1X A; 2SPO A; 3ARJ A; 1Y7Z B; 3S48 C; 2HBE B; 1MOH A; 1UVY A; 1SHR B; 1OUU B; 1Y7D B; 5HBI A; 1OFK A; 1A6N A; 2MYE A; 2ZSN A; 2MGA A; 1UIW A; 5HY8 A; 5JOM A; 1UX9 A; 1MNH A; 1HAB A; 1V4U B; 2IN4 A; 2D2M D; 4LPI A; 1WMU B; 1MKO A; 2VLZ A; 2G14 A; 3HXN B; 1B0B A; 3UHD A; 3B75 B; 4G1B A; 4G1V A; 2SPN A; 2OH9 A; 1A9W A; 2GRF A; 2V1K A; 1CQX A; 4PQ6 A; 1A00 A; 2QRW A; 4NK1 A; 1QXD A; 1Y0D B; 4B4Y A; 1PBX B; 4KMW A; 1J7Y B; 1IBE A; 2G0X A; 1J7W B; 3R5I B; 5CNC A; 2DXM A; 3BCQ A; 1C40 A; 1V4W A; 3LQD B; 1VXH A; 2V1I A; 3GQP A; 5CND A; 1Y85 B; 1VWT B; 1GDJ A; 3G52 A; 1F5P A; 1A0Z B; 4PQC A; 3G4Q A; 1CBL A; 3G4V A; 1NGK A; 3LB1 A; 1YCA A; 2MGG A; 2AV3 A; 3D17 B; 1YGD B; 4MXL A; 4ESA A; 3OZW A; 1YH9 B; 2DN1 A; 1S56 A; 3G4Y A; 4M4A A; 1MDN A; 4U8U A; 2DC3 A; 5E29 A; 4SDH A; 1MYT A; 1NS9 B; 1FDH A; 4UIQ A; 1JZL A; 3OJ1 A; 1YEO A; 2HHB B; 1X9F C; 1YFF A; 1J7S A; 1S0H A; 1SDL A; 2ZT2 A; 5ILR A; 1K1K A; 3HEP A; 3AQ8 A; 1M9P A; 3MJP B; 3W4U A; 1Y7Z A; 2DN3 B; 3WCT C; 2GTL D; 2H35 A; 3QM7 A; 2ZST A; 1MNJ A; 1RQ4 B; 3ZOL A; 3KMF A; 109M A; 1Y4F A; 1V4X B; 2D2N C; 1CH7 A; 1GDL A; 1S69 A; 1COH B; 2EF2 A; 1V5H A; 1O1I A; 1Y7C B; 2M6Z B; 3SZK A; 107M A; 1Y4R A; 1FSX B; 1M6C A; 2CMM A; 2H8F A; 1XXT B; 4KJT A; 1ECD A; 1Y4Q A; 2JHO A; 2QSP B; 1Y0D A; 1MBI A; 1PBX A; 3QQQ A; 1Y8W A; 1LFQ B; 5E6E A; 3BA2 A; 3CY5 A; 2ZFO A; 1A6G A; 1Y85 A; 3O89 A; 1YMC A; 1VWT A; 2SPM A; 1Y2Z B; 1A0Z A; 1JF4 A; 1O1K B; 2NRL A; 3E5I A; 4PQB A; 2XKH A; 4C44 A; 2NRM A; 1XZV A; 3K8B B; 1NAZ A; 1YIE B; 1VXD A; 2HCO B; 3WCU B; 1IOP A; 3UHE A; 4N7N B; 3UHS A; 3CIU A; 4F6D A; 1F5O A; 3QJB B; 1GZX B; 4MBN A; 2VM0 A; 1Y8I B; 4MAX A; 5KER B; 3GK9 A; 1MLM A; 1Y7G A; 1HBI A; 1LH3 A; 3PEL B; 1TES A; 1VHB A; 1NZ4 A; 1LJW B; 3NG6 A; 1RQ4 A; 1O1P A; 3PI8 B; 3WTG B; 3OK5 A; 1GDK A; 1KD2 B; 2BLI A; 4B3W A; 4QAU A; 1S61 A; 4MXK A; 2G10 A; 3NL7 A; 2IG3 A; 1NZ3 A; 1COH A; 2O5Q X; 1LFL A; 1Y7C A; 3UHX A; 1A9W E; 4YU3 A; 2D2M A; 1SDK B; 1FSX A; 3H57 A; 3ZJL A; 4M4B A; 3LB3 A; 1F65 A; 3GDJ B; 2OHA A; 6HBW A; 1XXT A; 4NI1 B; 4F68 A; 2MGC A; 5B85 A; 1I3E A; 1HBB A; 2C0K A; 3DHT B; 1YIH B; 1A01 B; 2ZLT B; 1YMA A; 4NI0 A; 1C7D A; 1G08 A; 3D1K B; 1Y31 B; 1J41 A; 4XS0 B; 1Y46 A; 2AA1 A; 3OZU A; 1GBV A; 3V2Z A; 2VLX A; 4MQK A; 5ILE A; 4MBA A; 1LFZ B; 3AT6 A; 1HRM A; 2Z8A A; 3G46 A; 4WCH D; 2ZS0 D; 3MN0 A; 3QJD B; 2QLS A; 2Z6S A; 4HHB A; 5HU6 B; 3EOK A; 3ARL A; 3A5B A; 3LB2 A; 1HBH B; 3IA3 B; 4OF9 A; 2VEE A; 3QJB A; 1HGC A; 1GZX A; 3NML A; 3E5O A; 5IKS A; 1J40 A; 2GNW A; 5KER A; 2MGL A; 2AUO A; 3QM6 A; 3P5Q B; 3UH5 A; 1RPS A; 2ZSX A; 1HDB B; 1S5X A; 2VEB A; 1HDS A; 3RJ6 A; 1Y35 B; 3FH9 B; 3EU1 B; 1Y0W A; 4MQJ B; 1DKE A; 3PI8 A; 1LFT B; 2GKN A; 2HHD B; 4O2G A; 3IXF A; 3ZJM A; 1Y8H B; 2GTL A; 1KD2 A; 2W72 A; 2VYY A; 3E4N A; 3G4W A; 1EW6 A; 1FAW B; 1G0A A; 3OZV A; 1N9X A; 5D5R A; 3AQ9 A; 1VXF A; 1O1O A; 5EYJ A; 1MBN A; 1AJ9 B; 1SDK A; 3UHC A; 1Y83 A; 1ABW A; 3QM5 A; 3VRF A; 3GDJ A; 1YE2 B; 4FWY A; 3ARK A; 2O5M X; 1BVC A; 3UH7 A; 103M A; 1T1N B; 3OGB A; 1YVT A; 5ILM A; 3DHT A; 4MU5 A; 2ZLT A; 3M38 A; 1MYH A; 2BWH A; 1O1L A; 2D5X A; 3GYS A; 3D1K A; 101M A; 1J3Z B; 3ONZ B; 1RSE A; 4L7Y B; 1BAB B; 5HLQ A; 2LH6 A; 1MOB A; 3QJD A; 1MYG A; 3QZZ A; 3K9Z A; 5HU6 A; 5ILP A; 3V2V A; 3QZX A; 1MOC A; 4F6G A; 1C7C A; 1CIO A; 2ZLX B; 1A3N B; 2ZS0 C; 3WCP A; 1A0U B; 2NSR A; 1G09 B; 1J52 A; 1YG5 B; 2W6V A; 1R1X B; 1H1X A; 2W6W A; 5JDO C; 1DLY A; 1MWB A; 3QJC A; 2WTH A; 4HRR A; 2HZ2 A; 4MQJ A; 1UIW B; 1MNI A; 3BOM A; 5HY8 B; 3BJ1 A; 3ZJI A; 1GDI A; 3AQ6 A; 5SW7 A; 1FAW A; 2ZSS A; 1OFJ A; 1MKO B; 1QI8 A; 1JZM A; 1XZ2 A; 1MOA A; 1AJH A; 2R50 A; 1NZ5 A; 1V75 B; 3E55 A; 2RI4 B; 1NEJ A; 1AJ9 A; 1YHU A; 1A00 B; 2ZT0 A; 4GZG A; 1LHT A; 2E2Y A; 1YE2 A; 2QSS A; 2W6Y A; 2ZLU A; 1QXD B; 2BNL A; 1XY0 A; 1VRF A; 2FRI X; 2DXM B; 1BUW A; 1JW8 A; 1EBT A; 2ZLV B; 3GOU A; 2G0V A; 3ZJP A; 3PT8 A; 2VRY A; 3ZOM A; 2DN1 B; 1YOI A; 5CN6 A; 2MGJ A; 4X0L A; 4U8U B; 2MGM A; 3AQ5 A; 1JEB A; 2ZLX A; 1A3N A; 5EET A; 1A0U A; 1KR7 A; 1YEO B; 3UGY A; 1YFF B; 1J7S B; 1S0H B; 1SDL B; 1K1K B; 1G09 A; 2MYD A; 1GCW B; 1M9P B; 3H58 A; 2DN2 A; 3W4U B; 1YG5 A; 5AB8 A; 3GQG A; 1XZ7 A; 2Z85 A; 2D2N D; 2H35 B; 5HLU A; 1LFV A; 2OIF A; 1HSY A; 1SPE A; 2RAO B; 1CG5 B; 1Y4F B; 1J3F A; 1NPG A; 4FH7 A; 1NS6 A; 1YOG A; 3D1A A; 5CN4 A; 110M A; 2W31 A; 1O1I B; 1O1M A; 3SZK B; 1Y4R B; 1V75 A; 3QM8 A; 2RI4 A; 1JP8 A; 2H8F B; 1Y4Q B; 1A6M A; 1JDO A; 2BLH A; 5CNF A; 1Y8W B; 1XZ5 B; 1MTI A; 5E6E B; 4NZI A; 3CY5 B; 3VRG B; 1MZ0 A; 3AG0 A; 3UHU A; 3KUN A; 3HYU B; 2ZFO B; 1SI4 A; 1HV4 A; 2G0Z A; 3ECX A; 1GCV B; 3RGK A; 2ZLV A; 3WCW D; 1JL7 A; 3MKB A; 1XZV B; 4DWU A; 1CG8 A; 4UZV A; 1G0B A; 5F0B A; 3UHY A; 1AZI A; 3AQ7 A; 5HAV A; 2QFK A; 1JPB A; 2MHB B; 3CIU B; 1I3D A; 4NK2 A; 1NXF A; 1GVH A; 1X9F B; 1MLK A; 2LH7 A; 2Z6T A; 1K0Y A; 1GCW A; 4IRO A; 1HLB A; 5CN7 A; 1LUE A; 1Y7G B; 3G4R A; 2V1J A; 3OVU C; 3NG6 B; 1OJ6 A; 1RTE A; 1O1P B; 4XDI A; 3UBC A; 2RAO A; 1CG5 A; 1DWR A; 2ZS1 D; 1Y0A B; 5AZQ A; 3MYN A; 1A4F A; 3NL7 B; 4VHB A; 2PGH A; 3OO5 A; 1LFL B; 1MLJ A; 2OH8 A; 1QPW A; 2D2M B; 3HHB A; 4YU3 B; 2WTG A; 1QSH B; 4IT8 A; 4M4B B; 2G0S A; 6HBW B; 5KDQ B; 2ZT3 A; 2HZ1 A; 4G51 A; 1HBB B; 5C6E B; 1CBM A; 2R1H B; 1XZ5 A; 4F6J A; 4NI0 B; 2ZLW A; 1HHO A; 3D7O B; 3PI3 A; 1RQ3 A; 1MYI A; 3VRG A; 1C7D B; 1G08 B; 5EUI B; 1J41 B; 1Y46 B; 2AA1 B; 3DHR A; 3HYU A; 1GBV B; 1NZ2 A; 2HHE A; 1GCV A; 3A59 A; 4MQK B; 2O5L X; 3AT6 B; 1MLF A; 2NX0 A; 3TM9 A; 3VAU A; 2QLS B; 4HHB B; 1CH5 A; 2MGB A; 3O7N A; 3EOK B; 4L2M A; 3UBV A; 2ZSZ A; 3WCW C; 1MLS A; 3FS4 A; 1VXA A; 2D5Z A; 2MHB A; 2W6X A; 2MGD A; 1CH3 A; 1HGC B; 6HBI A; 1CIK A; 1X9F A; 108M A; 1J40 B; 1EWA A; 1RPS B; 1S5X B; 1HDS B; 4HBI A; 1DO3 A; 1CO9 A; 3WCT A; 1HJT A; 2ZT4 A; 105M A; 3UHK A; 1Y0W B; 1DKE B; 1BZ0 B; 2VHB A; 1Y5F B; 2GTL B; 3WFT A; 2D2N A; 3S1J A; 3ZJN A; 2AV0 A; 2W72 B; 5EV5 A; 1Y4G B; 2WY4 A; 1Y0A A; 1G0A B; 1MLL A; 2DHB B; 1MLH A; 4NS2 A; 3UHW A; 1NQP B; 1O1O B; 3ODQ B; 3G4U A; 7HBI A; 2ZS1 C; 1QSH A; 4WJG A; 1Y83 B; 2MGE A; 3A2G A; 1ABW B; 3VRF B; 5E83 A; 2HBD A; 5KDQ A; 3UHR A; 1FSL A; 2XKG A; 1YVT B; 5C6E A; 3UHH A; 1HGB A; 2R1H A; 1N9I A; 1HBA B; 1O1L B; 1Y5J A; 2D5X B; 3D7O A; 3GYS B; 3IC0 A; 5EUI A; 3HC9 A; 1BIJ B; 3GKT A; 1MBC A; 3WCV D; 1BZP A; 1FHJ A; 1Y8K A; 1DWS A; 1Q1F A; 2LH1 A; 1C7C B; 2BKM A; 5JGG B; 3WCP B; 1DO4 A; 2H8D A; 5JDO D; 4DC8 A; 2HBC A; 2G3H A; 5CN9 A; 1DXU A; 1NIH A; 1DXD A; 2W6V B; 1SPG A; 1BZZ A; 1CMY A; 1VRE A; 111M A; 5CHR A; 3K3U A; 3QJC B; 1LH5 A; 1MLR A; 4HRR B; 1UT0 A; 1F63 A; 4N7O A; 3BOM B; 4FC3 A; 1BZ0 A; 1KFR A; 1DXC A; 3BJ1 B; 2MBW A; 3WHM A; 1Y5F A; 1IDR A; 5SW7 B; 3R0G A; 1UC3 A; 1Y4G A; 2DHB A; 1QI8 B; 1IT3 A; 1XZ2 B; 5CNE A; 1NQP A; 1MWD A; 3ODQ A; 1NEJ B; 1YHU B; 3ZHW A; 1LHS A; 2VLY A; 3LB4 A; 3ZJQ A; 2QSS B; 2ZLU B; 1Y45 B; 2AUR A; 2GL3 A; 1XY0 B; 1EMY A; 1QSI B; 1CLS A; 1YZI B; 1HBA A; 5AZR A; 3UHG A; 1CH4 A; 1MYZ A; 2R4X A; 1FN3 B; 1BUW B; 1BIJ A; 2GDM A; 1THB A; 3UHI A; 3ORD A; 3GOU B; 1MBS A; 1YDZ A; 3A0G B; 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2MGH A; 4N8T A; 2O5T X; 1DO1 A; 1WVP A; 4F69 A; 3PT7 B; 4MQG A; 1DWT A; 4HRT A; 3NMM B; 1CH1 A; 112M A; 4ROM B; 1OR4 A; 4H07 A; 2R80 A; 2EKT A; 3G53 A; 1O1N A; 1VXC A; 2YRS A; 1A4F B; 1DXT A; 5CNG A; 3ED9 A; 2PGH B; 3UGZ A; 1B86 A; 3OO5 B; 1YHE A; 2LH5 A; 1HBR A; 1RVW A; 1QPW B; 3HHB B; 3KMF C; 1YOH A; 2G0R A; 4MQC B; 1MYM A; 1XQ5 A; 1YVQ A; 1Y0T A; 1QXE A; 4G51 B; 5CNB A; 4YU4 A; 1HGA A; 1O1J A; 1YEV A; 2ZLW B; 2EVP A; 1VXB A; 1HHO B; 1LTW A; 3WI8 A; 1RQ3 B; 3QMA A; 1DTI A; 2EKU A; 3DHR B; 3S65 B; 2HHE B; 2B7H A; 1BJE A; 3BJ2 A; 3SDN A; 3A59 B; 3VRE A; 3IC2 A; 1MTJ A; 1BVD A; 2AUP A; 1U7S A; 3GQR A; 3NFE B; 3LR7 A; 3LR9 A; 1HCO A; 2PEG A; 5EE4 D; 2V1G A; 5EU2 A; 1DXV A; 3FS4 B; 2ZFO C; 4FWX A; 2D5Z B; 1RQA A; 1J3Y A; 3WCU D; 1LFY A; 1C7B A; 1MBD A; 1Y0C A; 3VHB A; 1YEN A; 1JF3 A; 1Y4B A; 1DO7 A; 2O5B X; 3WCT B; 3WR1 B; 1MTK A; 4H2L A; 1CPW A; 1IWH B; 3PT7 A; 4O35 A; 3BJ3 B; 1XYE B; 1X46 A; 1IT2 A; 3NMM A; 5EQM A; 5CHQ A; 4ROM A; 3GLN A; 2D2N B; 3A5A A; 1S6A A; 3OO4 B; 1GLI B; 3UHQ A; 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