The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
The high salt (phosphate) crystal structure of CO Hemoglobin E (Glu26Lys) at physiological pH (pH 7.35)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
57
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YFF A; 4U8U B; 3NFE A; 3RJ6 A; 2GLN A; 2CMM A; 3FH9 B; 4DC7 A; 3W4U A; 2EB8 A; 1YMA A; 3AG0 A; 4ESA B; 3D17 A; 4HHB B; 1BZP A; 2BMM A; 1JL6 A; 4MQC A; 3B75 B; 1VRF A; 1UC3 A; 2HHE A; 3H58 A; 2H8F B; 3K3U A; 1LA6 A; 1VWT B; 2HHD B; 3WCP B; 3KUN A; 3OO5 A; 2MGM A; 2BWH A; 1JP9 A; 3VHB A; 1BVD A; 1MTI A; 2C0K A; 1XZ2 A; 1S5X A; 2HBG A; 4AVD A; 1Y4R A; 5M3S A; 1DUO A; 1GCW A; 4MQI A; 5E83 A; 1YGF B; 3UHW A; 1EWA A; 1FLP A; 3GOU A; 1VXC A; 1IRC A; 2DN3 A; 1MBO A; 1G08 B; 1G09 A; 5HU6 B; 1S0H B; 1SHR B; 2PGH A; 1HRM A; 1YG5 A; 1OJ6 A; 1YMB A; 1MLH A; 2DXM B; 3D1K B; 5HBI A; 2BKM A; 1A6M A; 2O5L X; 1XZU B; 3GQR B; 1N9H A; 2GNW A; 4MQG A; 5F2A A; 2ZLW A; 1BBB A; 1XZ4 B; 1HCO A; 1CP5 A; 1GBV B; 1K0Y B; 3ODQ B; 4MXK A; 1S5Y B; 3CY5 B; 1XZ7 A; 2BLJ M; 2YRS B; 3OO4 A; 1HBG A; 1RQA A; 1N9I A; 1S61 A; 1RTE A; 5CHQ A; 1DTM A; 3UHI A; 5CND A; 4NK2 A; 4SDH A; 3CIU A; 3M39 A; 1HGC B; 3OZV A; 1Y7Z B; 4O4T A; 1DO1 A; 1YZI A; 3ZJN A; 1MNO A; 3AQ9 A; 2QMB A; 1YH9 B; 3UGY A; 4F6B A; 1TU9 A; 5EYJ A; 2G0S A; 1LFY B; 2R4Z A; 3BOM B; 1Y2Z B; 2QFN A; 3WCU A; 3QJD A; 2ZLV A; 1COH B; 4YU3 B; 3MJU A; 3A5B A; 2HZ3 A; 4O2G A; 2EF2 A; 3QJB B; 3UHH A; 1J7W B; 1IT2 A; 2VM0 A; 1CLS B; 4MQH B; 1BUW A; 1QSH B; 2JHO A; 1Y4B A; 3S1I A; 1A6K A; 1HAC B; 1OUT B; 4H2L B; 2WTG A; 2SPL A; 4TWU A; 1J3Z B; 3PI4 A; 3BJ3 B; 1MBN A; 1MOD A; 1C7C B; 4G1B A; 1NAZ A; 2AUQ A; 1A6N A; 1HBH B; 5CNF A; 3QJC A; 3GYS A; 2D60 B; 4X0L B; 1Y4Q A; 3KMF A; 1HBS A; 1SPG A; 3PI8 B; 5CNE A; 1LH2 A; 2DN1 A; 1JWN A; 4C44 A; 1JL7 A; 1CMY A; 1J41 A; 3FS4 B; 1BZZ A; 1K1K B; 1L2K A; 3UI0 A; 1OUU A; 1GZX B; 3IA3 B; 3WFW A; 3R5I B; 3EU1 B; 2G0X A; 3E55 A; 1JY7 A; 2O5Q X; 1MZ0 A; 1U7S A; 1HBB B; 1MBS A; 2MGK A; 2ZFO D; 1CPW A; 1Y5F B; 1SDK B; 2HBS B; 1HAB B; 1WLA A; 1AZI A; 2ZST A; 3ONZ A; 1FDH A; 2R50 A; 2D2M B; 1Y5J B; 1GVH A; 1O1I B; 2SPN A; 3G4R A; 5E29 B; 1OFK A; 1Y31 B; 1Q1F A; 1NS9 A; 3IC2 B; 1VXB A; 1XZ5 A; 4QAU A; 1J7Y A; 1Y0C A; 3HYU A; 2QLS A; 3PT7 B; 1IBE A; 1O1M B; 3S65 B; 108M A; 1YHR A; 4U8U C; 1MOH A; 1DO4 A; 2Z85 A; 3BJ1 B; 2ZT1 A; 1A01 A; 4GZG A; 2QSS B; 103M A; 1G9V A; 1ABY A; 2EKT A; 3UHB A; 4F6F A; 1A4F A; 4HSW A; 1MLK A; 5CN9 A; 1YCB A; 4HRR B; 1C40 A; 2DC3 A; 2MGI A; 5ILE A; 1YHU C; 2RI4 A; 3QJE A; 2R1H B; 2VLX A; 1O1L B; 3V2V A; 2AUR A; 3GKV B; 4PNJ A; 4MXL A; 1F5O A; 2M6Z A; 3WCV D; 3QM7 A; 4ODC B; 3G4U A; 1XYE A; 1NIH B; 1YEV B; 1NEJ A; 1MOB A; 1YOH A; 5KDQ A; 2G11 A; 1J3Y A; 2G0Z A; 1IOP A; 2O5O X; 2NSR A; 5C6E A; 4PQB A; 1JZL A; 2ZT0 A; 4MBA A; 1YFF B; 2ZLX A; 1S56 A; 1BIN A; 3W4U B; 1MDN A; 109M A; 1JZM A; 5SW7 A; 3D17 B; 4H0B A; 1GCV A; 4YU4 A; 4MQC B; 1DXD A; 1YEN A; 2HHE B; 2H8D A; 1LFQ A; 2AA1 A; 1LA6 B; 1XZV A; 1J40 A; 1MYI A; 1HLB A; 2MGG A; 5EV5 A; 2BLI A; 2G14 A; 2W72 C; 2V1E A; 3A5A A; 2WY4 A; 1YOI A; 1UFP A; 1XZ2 B; 1DXU A; 1S5X B; 1LHT A; 1HDA B; 1HHO A; 1Y4R B; 1M9P A; 1MLQ A; 3UBC A; 5D5R A; 1WMU A; 2GTL B; 3P5Q A; 4MQI B; 3QZZ A; 1Y45 A; 1JP6 A; 5E83 B; 3A9M A; 3GOU B; 3GKT A; 2DN3 B; 1MNI A; 1G09 B; 2ZFB A; 2VEE A; 1MBI A; 2PGH B; 1NPG A; 1MYM A; 1YG5 B; 1A3O A; 2HCO A; 4F69 A; 4PQ6 A; 5JDO E; 2ZFO A; 1HGA A; 1MBA A; 107M A; 2VHB A; 4MQG B; 2ZLW B; 2NSS A; 3HRW A; 1BBB B; 1HCO B; 1MCY A; 2EVK A; 1XZ7 B; 3OO4 B; 1RQA B; 3MBA A; 1BZ6 A; 1CG8 A; 4IRO A; 4MQJ A; 3BA2 A; 3CIU B; 4NK1 A; 2QFK A; 1C7D A; 1URY A; 2GL3 A; 3E5I A; 5KER A; 3SZK A; 1DTI A; 3A59 A; 1YZI B; 3NG6 A; 1BZ0 A; 1UT0 A; 2QMB B; 1RQ4 A; 1MLN A; 3ECX A; 3QM8 A; 4NS2 A; 1MNK A; 1UVY A; 1GJN A; 2GNV A; 1YE0 A; 3ZH0 A; 3TLD A; 3QMA A; 3QJD B; 3AT5 A; 1JZK A; 4F4O A; 1CO8 A; 1SDL A; 3UBV A; 2ZS0 C; 2ZLV B; 1J3F A; 1B86 A; 1G0A A; 1V75 B; 3OK5 A; 1A0Z A; 1MTK A; 2HBD A; 3MJU B; 4F68 A; 2B7H A; 1XCH A; 2W6V A; 1VXH A; 4L2M A; 106M A; 2H35 A; 3WCV A; 2W6W A; 3HXN A; 1EMY A; 1A0U A; 5EUI A; 1YDZ A; 1DM1 A; 1KD2 A; 3PI1 A; 3WCU D; 2VYW A; 1BUW B; 1O16 A; 2GKN A; 1KFR A; 1THB A; 4KMV A; 1Y7G A; 5HY8 A; 1QXD A; 4KMW A; 2ZWJ A; 2O5S X; 3LB1 A; 101M A; 1URV A; 3MYN A; 1LFZ A; 1XY0 A; 4FC3 A; 1R1Y A; 3QJC B; 2E2Y A; 3GYS B; 1Y4Q B; 1HBS B; 2XKG A; 3UHR A; 1BJE A; 1F5P A; 1NS6 B; 3G46 A; 1CMY B; 2ZSO A; 1Y7C A; 1YVQ A; 1J41 B; 1Y46 A; 2ZSP A; 3WHM A; 1O1J A; 1BZZ B; 1Y22 A; 3DHT B; 2R80 A; 1OUU B; 3QQQ A; 3BJ2 A; 1HDS A; 3AQ6 A; 1UVX A; 1JY7 B; 1V07 A; 3AQ7 A; 3VRE A; 104M A; 2MGC A; 4G1V A; 3MKB A; 1N9X A; 1RQ3 A; 2OH9 A; 5CNG A; 3S1J A; 5B84 A; 1YEQ A; 1J52 A; 3ONZ B; 1MYH A; 2Z8A A; 3WCW C; 4KJT A; 3ARK A; 1V9Q A; 3EOK A; 1BZR A; 1HV4 A; 1UX9 A; 1NS9 B; 1YGD B; 1FSX A; 1XZ5 B; 1J7Y B; 1Y0C B; 1Y8H A; 2D5Z A; 3QQR A; 1GDJ A; 3EDB A; 2LH3 A; 5CN8 A; 5JGG A; 2QLS B; 1EBT A; 1YHR B; 4N8T A; 1BIJ A; 1HSY A; 1PBX A; 1A01 B; 3LQD A; 1G9V B; 1ABY B; 1Y8K A; 3G4Q A; 2ZLT A; 1ECN A; 1A4F B; 3GQG B; 1RVW A; 5EE4 C; 3TM9 A; 3ZJI A; 1Y4G A; 1YHU D; 2GKM A; 1Y4V A; 1DXC A; 1CH3 A; 5EYS A; 1A3N A; 1UFJ A; 3PEL A; 1CH2 A; 2VEB A; 1U7R A; 2M6Z B; 1V4X B; 3S48 C; 5IKS A; 4B4Y A; 3QM6 A; 1XYE B; 2GRF A; 1ECD A; 1NEJ B; 5KDQ B; 2GTL C; 1J3Y B; 2OH8 A; 1B0B A; 2Z6N A; 1MNJ A; 1OR4 A; 5C6E B; 1O1K A; 2O5T X; 2VLZ A; 1V5H A; 5CNC A; 4UIQ A; 5SW7 B; 4JYQ A; 1VXG A; 1A00 A; 2SPM A; 3OJ1 A; 4KN3 A; 1GCV B; 4YU4 B; 4MBN A; 5ILP A; 1RPS A; 1LH7 A; 1YEN B; 2H8D B; 4MAX A; 1LFQ B; 1JF3 A; 2D2N C; 4WJG A; 4N7P B; 3K9Z A; 2AA1 B; 5HLQ A; 1O1N A; 1J40 B; 1XZV B; 3BCQ B; 3MYM A; 1HDB A; 3PT8 A; 5JOM A; 1HHO B; 1V4W B; 3LB3 A; 3K8B B; 1DLW A; 4NI0 A; 4JAC A; 1R1X A; 2NRL A; 1NQP A; 2G0R A; 4M4A A; 5F0B A; 2OHB A; 2HBC A; 2ZS1 C; 3P5Q B; 1Y45 B; 1FAW A; 1YHE B; 3OVU C; 3LB4 A; 3GDJ A; 3PI2 A; 1VRE A; 2ZFB B; 2GRZ A; 1A3O B; 1DXV A; 2ZFO B; 1JP8 A; 1HGA B; 3S66 A; 1AJG A; 2V1G A; 3WI8 A; 1VXF A; 3HRW B; 1Y0A A; 2MGJ A; 3UHQ A; 5AB8 A; 1JEB A; 3WCT C; 3TM3 A; 4NI1 B; 4C0N A; 3ZJM A; 1CG8 B; 1VXA A; 1YIE A; 4MQJ B; 2O58 X; 3GK9 A; 4U8U A; 1C7D B; 5KER B; 3SZK B; 5E6E B; 3A59 B; 1F65 A; 1GBU B; 3NG6 B; 1CIK A; 1BZ0 B; 2V1I A; 1AJ9 A; 2MHB A; 2D5X A; 4N7O A; 1LH6 A; 5EQM A; 1ITH A; 1YHU A; 2HBF A; 1Y7D B; 2XYK A; 2ZS0 D; 3UH7 A; 1CH9 A; 1X9F C; 3AT5 B; 3NML A; 1VXE A; 4F4O B; 5HLX A; 1SDL B; 1B86 B; 1G0A B; 1Y35 B; 3PI9 A; 1A0Z B; 3AQ8 A; 2HBD B; 2AV0 A; 4HRT A; 2B7H B; 3LR7 A; 2W6V B; 1NZ2 A; 2MGB A; 1Y83 A; 2LH1 A; 1UIW B; 1CH4 A; 1Y4P A; 3WCV B; 3G4V A; 3HXN B; 1A0U B; 1AJH A; 5CN5 A; 4F6I A; 1YDZ B; 2AUO A; 1KD2 B; 3QM5 A; 1Y09 A; 3WFT A; 4ROL A; 4MQK A; 3UHT A; 2QSP A; 2MYB A; 4NZI A; 1THB B; 1FHJ A; 1Y7G B; 1QXD B; 3G4Y A; 1MOC A; 1LFZ B; 2ZT4 A; 1Y4F B; 1SI4 A; 6HBI A; 4FC3 B; 1R1Y B; 1YE2 A; 4NXC A; 3D1A A; 2WTH A; 2MGE A; 1H1X A; 4WCH D; 3WR1 A; 1HLM A; 1RSE A; 1T1N A; 2V1K A; 1Y7C B; 1MLG A; 1YVQ B; 2W72 A; 2Z6S A; 3NFE B; 3WHM B; 1Y46 B; 1O1J B; 1Y22 B; 2R80 B; 1CQ2 A; 3ZJQ A; 3BJ2 B; 4PQC A; 3UH3 A; 4N7N A; 1HDS B; 2MGF A; 3VRE B; 4TWV A; 1RTX A; 3MKB B; 2ZT3 A; 1RQ3 B; 1FN3 A; 3DHR A; 3WCW D; 1QI8 A; 3OO5 B; 1GDL A; 2HZ1 A; 1YEQ B; 3V2Z A; 3EOK B; 1HV4 B; 2IG3 A; 1FSX B; 3QJB A; 2D5Z B; 1Y8H B; 2ZSZ A; 3LB2 A; 3NMM A; 1J7W A; 5CN4 A; 2V1F A; 3MN0 A; 2O5M X; 4VHB A; 3IXF A; 1GCW B; 1MWD A; 1ECO A; 4N8T B; 1BIJ B; 1PBX B; 1Y0D A; 4MQH A; 1IWH A; 3LQD B; 3AT6 A; 2ZT2 A; 1Y8K B; 2MYA A; 3NL7 A; 5EE4 D; 2ZLT B; 3HEO A; 1RVW B; 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2MYE A; 1PMB A; 2OIF A; 1YIH A; 1G0B A; 1A9W A; 1QXE A; 1CG5 A; 4O4Z A; 3ZJL A; 1AJ9 B; 2MHB B; 2D5X B; 4N7O B; 1Y0W A; 1GDK A; 2R4Y A; 2KSC A; 3ZJO A; 4DWT A; 3WFX A; 1X9F D; 1CH5 A; 1YHU B; 2HBF B; 3M3A A; 4G51 A; 5CNB A; 3HYU B; 4U8U D; 1IBE B; 3ZJJ A; 1ABS A; 1M6C A; 3PI9 B; 1DO3 A; 1Y0T A; 1DXT A; 4HRT B; 5AZR A; 2RAO A; 5CMV A; 2QRW A; 1C7B A; 2MGL A; 1Y83 B; 1HDA A; 2FAL A; 1LFT A; 110M A; 1Y4P B; 1MLM A; 2ZSS A; 2GTL A; 1C40 B; 1BVC A; 1Y09 B; 3VRG A; 4OOD A; 4ROL B; 4MQK B; 2GRH A; 3WTG A; 2RI4 B; 3IC0 A; 3QJE B; 2Z6T A; 1GLI A; 2QSP B; 1FHJ B; 3HEP A; 2LHB A; 3ZJH A; 2FRF A; 4FWX A; 3AQ5 A; 4ZVB A; 1SI4 B; 2HBE A; 1O1P A; 2QU0 A; 1YE2 B; 5ILM A; 3D1A B; 1MYJ A; 1YEO A; 2D2N A; 3WR1 B; 2OHA A; 1T1N B; 2MGA A; 2IN4 A; 3PI3 A; 1CP0 A; 2W72 B; 2ZLX B; 3VRF A; 2DN2 A; 2OLP A; 1LFV A; 1N9F A; 2G0V A; 3A2G A; 2G3H A; 1MKO A; 1MLU A; 1ECA A; 3ECZ A; 4N7N B; 3RGK A; 2D6C A; 1A6G A; 2DHB A; 2ZS1 A; 2MBW A; 3UHZ A; 3DR9 A; 1Y8W A; 1CIO A; 1FN3 B; 3DHR B; 1QI8 B; 2NRM A; 1QSI A; 3DUT A; 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