1YW1A

Structure of ytnj from bacillus subtilis in complex with fmn
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
429
structure length
393
Chain Sequence
RADFIQFGAMIHGVGGTTDGWRHPDVDPSASTNIEFYMKKAQTAEKGLFSFIFIADGLFISEKSIPHFLNRFEPITILSALASVTKNIGLVGTFSTSFTEPFTISRQLMSLDHISGGRAGWNLVTSPQEGAARNHSKSNLPEHTERYEIAQEHLDVVRGLWNSWEHDAFIHNKKTGQFFDQAKLHRLNHKGKYFQVEGPLNIGRSKQGEPVVFQAGSSETGRQFAAKNADAIFTHSNSLEETKAFYADVKSRAADEGRDPSSVRIFPGISPIVADTEEEAEKKYREFAELIPIENAVTYLAREAKARNLTLREVAQEMAFPRTLFIGTPERVASLIETWFNAEAADGFIVGSDIPGTLDAFVEKVIPILQERGLYRQDYRGGTLRENLGLGIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords PROTEIN YTNJ
publication title Structure Of Ytnj From Bacillus Subtilis in complex with FMN
rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 131
structure length 393
sequence length 429
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 1yw1A00
1BSLA 1Z69A 3B9NA 3FGCB 5LXEA 1EZWA 3FGCA 1M41A 1FVPA 1TVLA 1NFPA 3RAOA 3C8NA 4J2PA 5DQPA 2I7GA 4US5D 1NQKA 1F07A 1LUCB 1YW1A 1RHCA 5AECA 1XKJA 1LUCA 4US5A 2B81A 4UWMA 3B9OA 1BRLB 3B4YA 1BRLA 3SDOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JPMA 1B1YA 2A3BA 3CMGA 1MFUA 2ISWA 2WMHA 1ADDA 1NDYA 1ONWA 5KMYA 2YR1A 1HKVA 2OCZA 3E0IA 2ACQA 2BY2A 3URBA 1EJTC 3M0ZA 3V75A 3E5BA 3NM3A 2B81A 2WBGA 2BZNA 4FOUA 3OZPA 3RK8A 3U2CA 4URIA 3I6EA 4DJDD 1QI5A 4KMQA 2ZRYA 1LDCA 3BAWA 2BWGA 3RG6A 1E43A 1QPQA 3MPGA 3OGSA 4NRSA 5TNVA 1Y0EA 4MFDA 1M7OA 4DI8A 1XRSA 2AGKA 3W1LA 4GY1A 5K2ZA 2R14A 2YYTA 4QDMA 1RCXB 1EQPA 4KRZA 3LM7A 3F5JA 3USBA 1JUBA 3CT7A 5KITA 2E6YA 5A6BA 1PSCA 4XIAA 3L4YA 3IJ7A 1AMYA 4XD3A 2ACUA 2BVDA 4FLQA 2J47A 3BH4A 4WIWA 2WQPA 3NGFA 2EEXA 1UD4A 3QZ6A 2ZICA 2BMBA 3NIYA 3DC8A 3WK3A 4MUZA 1NVMA 1VLIA 4XWUA 2Z6JA 3DN5A 3ZLGA 4X3ZA 2IKJA 4BR1A 4XSMA 3EX4A 4Y6GA 4FX6M 4PMOA 4JBRA 3EMQA 5I78A 1RJRA 5IHSA 3Q67A 4NAEB 2J7HA 1O5RA 4C6BA 1RSCA 4DJFA 4YWSA 4UR9A 4L5ZA 1ITCA 6A3HA 5M17A 5CSUA 3RYSA 3QR3A 4WEVX 1H7PA 3FS2A 4QITA 1OK4A 4CQAA 4ZXOA 5F2LA 1B2YA 1GQJA 2G3MA 4EANA 4R9XA 3IJIA 3KL0A 5LNRA 1BYCA 1KLYA 3MUAA 3WN6A 3RMJA 3OJGA 2J79A 3R8RA 4AIBA 3F4CA 1XHGA 1EYEA 2Z1WA 3F7JA 3MB9A 4X9YA 1NQ6A 3AU6A 4MYXA 2YB1A 4LB3A 2VRJA 3A22A 2GVJA 3HG5A 2QF8A 1RXOB 4WY0F 3UG5A 2D2GA 4NUWA 5IHRA 1EJSC 4PA8A 2Q71A 2V2HA 3UA3A 4NQ1A 4DB7A 3CUGA 1F8MA 1HFBA 1F2JA 1S1PA 3E9AA 2VZUA 1NP0A 5XIAA 2ATMA 2QMJA 5DY2A 4HHPA 3T9PA 1Y5WA 1C9DA 3GM8A 3MDUA 3GG0A 5JIPA 4QQUA 4XZLX 2VX7A 4UMAA 1XYZA 2Y6ZA 3L5MA 3SAZA 3DKLA 2J7EA 5BRBA 3OHIA 5F7UA 3LRLA 1LL7A 3T78A 4MVAA 2G3IA 3H2MA 1EHNA 2FPTA 1GOMA 2V3DA 2ICSA 1OZMA 2BFGA 4IG2A 5AC6A 3CZEA 1UMLA 5JVLA 1O94A 3H55A 1O66A 2PTDA 2QIWA 2QPUA 3HPXA 2NLIA 3NCOA 4UIOA 3G1HA 2HK0A 5H8MA 1TCMA 3NQ6A 4H9MA 3H4XA 3OZYA 2QKFA 4N0RA 3S2NA 1H41A 1A5MC 2ZUNA 4GJIA 2GJPA 1BLIA 3D6NA 2Z4GA 3SUSA 3M6DA 3PPCA 4DXKA 2QZRA 1MNZA 4O1FA 3VYLA 1WUFA 1KM1A 2X1IA 4J4KA 2P76A 3ZWTA 5BW6A 1NOWA 3AIEA 2OZTA 2SFPA 1XH0A 1YYAA 2JK2A 3GVRA 5FF2A 2XWDA 3KCLA 2IMRA 2YSWA 1RHCA 3UGVA 5KZEA 5DMNA 1MZRA 3H53A 2P8CA 2Q02A 4Q4RA 4C6DA 1XC4A 2G3NA 5CG7A 3OGRA 5LGZA 3DYMA 2BOGX 1TPH1 5FF0A 3QRHA 2XFFA 4MY1A 3PPGA 3FK4A 1UW9A 3VX0A 3S5YA 5JUVA 1J6OA 3UWVA 3KE0A 1XH2A 3G1FA 5DXXA 3SCTA 4WRHA 1BKSA 1TTIA 1LWJA 1VD6A 3W1NA 4HA1A 4AX7A 3EOSA 3G1XA 1FWGC 4O1CA 3VOCA 1RK6A 2PZ0A 4GWEA 4KT2A 4C5YA 4LY4A 1G7UA 4OBTA 3E2VA 1EF3A 3WEMA 4C1NA 3PSVA 5HULA 2GPTA 1E6SM 3C2EA 2PI6A 4KFNA 5CAHA 3H2AA 1H09A 2PWFA 3WELA 2GDVA 3VNLA 3V5FA 3LXCA 4B16A 5A6MA 2D2JA 2PU0A 1TWIA 2WVVB 2FZBA 2Z7KA 1C7SA 4H19A 5B7ZA 2GVGA 3B03A 3AALA 3O1NA 2BVYA 2A3CA 4O52A 3OIHA 1F76A 1Q7QA 2JQXA 4I8YA 2QDDA 4Z2KA 1KWKA 1VLWA 3LHWA 1PWLA 4O11A 2P5NA 2DJXA 2WYSA 2A7PA 1EF2A 3DHPA 1SO5A 1XG3A 3KLKA 2OFJA 1JCMP 5BOEA 1CLXA 3ID7A 3SW6A 3MHGA 4N4PA 4XBSA 4O1BA 1G7VA 3MP5A 1TIMA 3ARXA 4A2RA 3I3EA 5AHNA 2VR4A 4GIYA 1E4IA 4RDZA 4HN8A 3MCMA 1BVWA 2FH8A 4CNPA 1HXJA 3HGSA 3SIMA 1ISYA 3UGRA 1R2SA 2RGMA 2D73A 1JZ4A 3VX1A 4AZ5A 1OG6A 1KFEA 2O55A 3IWPA 3L5AA 1ZRQA 3FW6A 3M5VA 2DDXA 3DESA 4YWIA 3O63A 3S3GA 1A80A 5I6SA 3KRZA 4B2DA 4JIQA 2UWFA 2NQ5A 3Q94A 1O5QA 2HNEA 2HPIA 3BOLA 4HK7A 2NVAA 2XH4A 1VJSA 3GHRA 3VNMA 3VGEA 5BWFA 4LAMA 3MSGA 1JYWA 4P2VA 5CQ1A 3EPMA 1CNVA 1W9XA 4HNVA 1RD6A 2J4GA 3FX4A 5LIKX 1UR2A 4JICA 1PIFA 3BSMA 3MA8A 5CPLA 3W82A 1D8WA 1YDVA 1G5AA 1UR1A 4NAEA 4IXHA 2WMJA 2Y1HA 3VMOA 1XYMA 2VCAA 4UOJA 5LNVA 3W3OA 2X16A 3FY1A 1GVOA 1UIPA 1OWQA 4JTLA 3FIGA 3KRUA 2Z1VA 3B0PA 1B5TA 5HUOA 3WLKX 1G0CA 2QQ6A 3LHZA 2OT1A 1I2PA 3W72A 3KLLA 3IANA 1M53A 1QO5A 4QAIA 4AWTA 4C6IA 1LTDA 4IQEA 3M0JA 3N19B 3QW3A 1WNOA 2I16A 4KH2A 3BAJA 3WK1A 2BBFA 3MI2A 1VIWA 3WMLA 3R79A 3WBAA 1R3WA 2HSAA 1TPVA 2QF7A 1XFBA 3TR9A 2DP3A 1OJXA 2PAJA 3A12A 3D3AA 3H2EA 3K13A 3SSZA 2GSHA 1E0TA 2ZZ4A 4R85A 2VCBA 2X1SA 2FGLA 3KCOA 2HTMA 3CQIA 3HQPA 3N9RA 5H6HA 3KCJA 5CBBA 2HCVA 4O1AA 1MUWA 2PZNA 1FWHC 4Q4OA 4S3BA 4PUUA 2FHCA 1F05A 5HANA 4ADUA 3QEZA 2EPMX 3BURA 3B04A 3BZJA 2P8BA 3C4UA 1THFD 1G9HA 5G2IA 5T8GA 3NSMA 1GK8A 4HU4A 2P53A 1XDJA 5H91A 4G5DA 1LORA 2ZZ7A 1R8LA 1I2QA 4XO7A 4GFIA 3AQUA 3MSDA 3P3BA 1XIEA 2WAGA 3AHXA 3TN3A 1I2OA 3WH8A 2OJPA 1EWEA 4AHQA 1E56A 3R2GA 1F6YA 3TW6A 3SCRA 1CGUA 1UOKA 3FA4A 5F4WA 1UKPA 4H41A 4XUGA 3RITA 2PWEA 1MFVA 3VIJA 1EGVA 1FY6A 1NFBA 2GJLA 1IWBA 3ZJ6A 3LMYA 1W3TA 3VVGA 2VFGA 3XISA 3BVJA 2WC7A 1US3A 3II1A 5JBDA 3WLMA 2NLYA 1DVJA 1E4MM 5C5YA 2Q09A 2PGFA 2ZRZA 4DNHA 3AIWA 2Q8XA 3W2UA 3DHFA 3WG6A 1UWIA 4W4QA 2VEFA 3LERA 3T8QA 5AVHA 2WNZA 1LL6A 4GYKA 3UXAA 3MP4A 4UFIA 2GK1B 2ZZ3A 4GY0A 2BGSA 4ICNA 4GZIA 4M7SA 2YIHA 4LUSB 3ZLFA 4OV9A 1UKTA 4FB7A 4ICMA 2ZFAA 5A8OA 4DRSA 1HL2A 3F5LA 3GE7A 4F3HA 1DQWA 2R1PA 1YADA 2QCLA 3SGUA 3GYEA 4MJ4A 4AYSA 2TPSA 3W4RA 1N55A 3GWQA 1UD3A 1GEQA 3VMPA 3LPGA 1RJPA 5HWMA 1XIGA 4G8TA 3A47A 1Q66A 3APTA 1OX4B 4E38A 1GW9A 5DCEA 5E5CA 1F61A 1OBAA 4S3DA 1VEOA 1UA7A 1X98A 1ONEA 1YNQA 2QULA 1TV8A 2V63A 3H12A 3NFUA 3WK0A 2WVVA 1SYTA 2CPUA 2EO7A 4MPQA 3AOFA 4J3SA 3FHQA 3KOZA 3W1UA 3P7YA 5HA7A 1JQXA 5E09A 3RLUA 3MHFA 2X0HA 1XP3A 3ANUA 4NAFA 4KF1A 5BXSA 3STEA 2CW6A 2IXVA 1VKFA 1H1ZA 3EWDA 1KM4A 3BMXA 1IXQA 5G1YA 5BZAA 4NILA 3UQNA 3IGXA 1GPWA 2PWHA 4DQWA 3Q37A 1LWIA 1OFRA 4WY0B 2XIMA 1QJWA 4IP7A 3SRKA 3P8IA 2PD5A 1UZDA 4D6HA 1C92A 4NG3A 2ZADA 2E6AA 1B57A 1V79A 4C6MA 1P6WA 3BDKA 1ZHAA 4WXZA 3ZJKA 3QHMA 5A1AA 2Y4SA 1GTEA 3AYTA 3FA3A 1GGOA 4FSAA 4YVVA 4XD5A 4FOJA 4GCXA 3BICA 1W91A 1UC4A 5G5IA 1US2A 1TZ9A 4HU0A 5AZ1A 1ZP3A 3BLPX 4O18A 5IM51 2OOGA 2WZMA 1DTNA 1SFLA 5DX7A 4HZ8A 3AXIA 4Z2IA 3IJ6A 4LAKA 3M16A 2BB0A 1F3WA 4S3CA 4BI6A 2QGYA 1YBQB 5LSMA 2DEPA 1E3XA 2QCGA 1YE6A 4IFKB 2NV1A 1TVLA 2PDMA 4MG4A 1TJ2A 4HYVA 3OQ8A 4WLCA 1QW8A 3ANYA 3ATZA 5XIMA 1W9BM 4M51A 3UXDA 4AD4A 3IUDA 3L4VA 3TOYA 1NFGA 4M8UA 4GI6A 2Y88A 3TV8A 4PB5A 4J40A 2PD9A 3CPRA 1M68A 1T40A 2JBMA 3WD4A 4MJZA 3TYEA 1S2UA 3RHGA 4PB4A 4E6MA 3HPFA 4IJRA 3E74A 1NF0A 2GUUA 1CB2A 3BQ6A 3B9AA 3E02A 4U3AA 3AS1A 4Q8NA 1KCKA 1CXLA 1A5LC 4TTGA 1EL3A 1EP3A 2I5QA 4C65A 3F03K 3ALGA 2A1YA 1UA3A 1UP2A 1X7IA 5F2MA 4MYAA 1LT7A 4C1LA 2J24A 1FQ0A 2RH9A 1XIFA 3LTPA 3UJ2A 1KQYA 1NWUA 4XIMA 4S3FA 2V69A 3SCOA 3TE9A 1QU4A 4PBFA 3EB2A 4EPDC 4JL2A 1GYMA 3W7CA 2R91A 3B9EA 1C8XA 5K4ZA 2EXOA 1WKDA 3USZA 3MUXA 2VEPA 5CLTA 1OY0A 2EF9A 3TTYA 2ADAA 2BP1A 2V5DA 1PZ3A 2QJIA 4UZUA 1KXHA 4GQQA 1YNYA 3DCPA 1YXCA 1D2KA 3N73A 1I0BA 3WNNA 1VH7A 1E5NA 1V0LA 2ZXQA 3M6YA 4IF2A 4PMYA 3GKFA 2VRKA 1V6TA 2H8XA 3B0VC 4X0NA 3DX5A 1MXGA 1BVNP 1Z3NA 3LPPA 4XSLA 2WKLA 1JEZA 2R1NA 4QE4A 1VBRA 4BQ3A 3P60A 4GLEA 3LUTA 2W6RA 4POCA 2PDCA 4GNKB 1O5XA 3BCJA 3OU8A 4QP0A 3O2LA 2W0UA 4C90A 2R6OA 4BI5A 2O9TA 1B3OA 3UJFA 1TFVA 1ELSA 2DSUA 1XLHA 4F2UA 5FA5A 1LG1A 3TCEA 3CK5A 1O5KA 1MXSA 3R0DA 4BF5A 4MJMA 2E5BA 4JEJA 4Q4MA 1JULA 1MWOA 2ZXAA 5B7YA 3VOJA 4AIOA 1VAHA 4DJDA 5I06A 1JDFA 3QVQA 5LA0A 1MXDA 1QRQA 2ZUSA 4K7YA 3A6OA 1DEDA 3UA4A 3ONCA 4JNYA 2Y5JA 4RKAA 4FALA 3DYPA 1S5TA 4QR6A 2A21A 5GNXA 4O13A 1R3TA 1MI3A 2J62A 5AVNA 1EJWC 4BKNA 3SQSA 3UWYA 1OX6A 4MMWA 3LS9A 2WANA 5FJRA 1GVYA 1ZNNA 3RN6A 2Y8KA 1JPKA 1WDQA 3ZO9A 1Q6LA 3FNDA 3VUSA 4ZSUA 1SVDA 1FVPA 4A05A 3Q65A 4GJJA 4M6PA 2G3FA 1NP2A 3QM3A 2OMAA 3K46A 2ZDSA 1H7RA 3EXSA 1PL9A 1Z89A 5HUPA 1E71M 1P5BA 2ODOA 3VGHA 4O53A 4AEFA 4GZJA 3R1ZA 3BSHA 3GR8A 2GK1A 1BXBA 4Q4QA 5SWUA 5G2WA 1SPQA 3KHJA 1GOOA 3LGGA 4WQ6A 4ONVA 2NXHA 3GVVA 3TLQA 2XIQA 4B5SA 5T26A 2Q3OA 1FH8A 1CZ1A 3NQFA 4Y9NA 3M43A 4HPGA 1P0KA 1E6ZA 4DWSB 3BO9A 1H61A 3MP3A 1OX4A 1OYAA 3NL2A 3CV2A 4LCSA 3GO2A 2WK2A 3EWUA 3VKAA 5BROA 3QSRA 4PCPA 1P0DA 1HKMA 2JALA 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 1BSL A;  1Z69 A;  3B9N A;  3FGC B;  5LXE A;  1EZW A;  3FGC A;  1M41 A;  1FVP A;  1TVL A;  1NFP A;  3RAO A;  3C8N A;  4J2P A;  5DQP A;  2I7G A;  4US5 D;  1NQK A;  1F07 A;  1LUC B;  1YW1 A;  1RHC A;  5AEC A;  1XKJ A;  1LUC A;  4US5 A;  2B81 A;  4UWM A;  3B9O A;  1BRL B;  3B4Y A;  1BRL A;  3SDO A; 
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