1YYNA

A common binding site for disialyllactose and a tri-peptide in the c-fragment of tetanus neurotoxin
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Tetanus toxin
publication title Common binding site for disialyllactose and tri-peptide in C-fragment of tetanus neurotoxin
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 112
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2005-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1yynA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1yynA02
4ATFA 4I8MA 1S0FA 3RTIB 2P39A 2D6MA 4Y1VA 1UX6A 4YM1A 2WQZC 1Q8VA 1PUUB 2NTDA 2SBAA 3AZZA 2K43A 2AXMA 3K1XA 3ILAA 1V6OA 1URXA 4J23B 1MC9A 1H30A 1FN0A 1VLNA 2RSTA 5T5PA 5IK4A 2A3WA 3N7JA 2BFHA 4GA9A 1W6QA 4Y1UA 3FGMA 2EXHA 1LU2A 4JCKA 1Q04A 2AH2A 3OBRA 1DLLA 1EVTA 4FPYA 3BAOA 4LO2A 3F62B 1DQ5A 1LTEA 1Z4SA 3AKGA 4TLPA 1A78A 1TWEA 1NUNA 2A75A 2UWBA 1GBGA 1BLAA 1UKGA 1BFBA 4DENA 1WBCA 1LHOA 5DXDA 3PUBA 5FRAA 2A6WA 1RZOB 1FWVA 1DGLA 3IM6A 1P63A 2DV9A 2GNBA 3SH4A 2GNMA 4Z8BA 1BKZA 3ATGA 4M3CF 3UL2A 1Q8QA 3AYEA 4Q26A 3WMVA 1N1SA 4KEIA 1GSLA 1LHNA 3CU1B 3BODA 3T1MA 4KBBA 3U4XA 1LGCA 1ULFA 5GLTA 1Z0HA 3FUQA 3CRGA 3AP4A 3TAYA 3HBWA 2P34A 1GYKA 4LO3C 2NP0A 4WZFA 4J2YA 3OGGA 2NM1A 3ZXDA 3OY8A 2YROA 3ZX7A 1AZDA 4FPOB 3RMXA 5CA6A 1AVXB 3R4SA 1M16A 1VCLA 3O4DA 4TYSA 2W68A 3BRGC 1O4ZA 3PMEA 1AX1A 4ZFWB 3RMYA 3FJBA 2J3PA 2K4AB 4YGDA 3QLQA 3FJFA 3IPVA 4UW5A 2KKIA 5I1BA 1AVBA 5HCBA 4J2KA 1C1LA 3F1RA 1UZZA 2E7QA 4JPZA 3UDAA 3WDUA 3O49A 3UJQA 3AP5A 4FPCA 1N3QA 3I29B 3B3QE 5T5JA 3OJVA 3OJBA 1WLCA 1E0OA 1SLTA 3M3QA 4BMEA 1TIEA 1BA7A 4DQAA 2RG9B 4WBCA 1BYHA 1BASA 3IM0A 3CA5A 2IHOA 1WD3A 4K21A 2KH2A 4Q1PA 1IOAA 3ZSKA 3O4AA 2D3RA 4D0TA 4ZKTB 1MVQA 3POKA 2LIEA 1WW4A 4U36A 4XHBA 1LOEA 5DUWA 4QD2B 2DYCA 4CZSA 3OYWA 4LO0A 3V0AB 4I0YA 4XJWA 3LCPA 1FATA 2P3KA 3HMYA 3MPPG 1SZ6B 4X39A 4X3AA 1J0SA 1IS4A 2GN3A 3O4OA 2DVGA 2ENRA 3BAVA 4FP2A 1PWAA 2C5DA 4XMAA 3V0BB 1UAIA 3IAGC 4YZ1A 2ZGRA 5GZCA 3VT0A 1XHBA 2I2SA 2HWMA 3ZXFA 4Y22B 3CA4A 4BMBA 1FGAA 1SBDA 5IK7A 1HWMB 4YZ5A 4YGCA 2VSEA 1V6KA 3E8LC 1IT0A 2XB6C 4GWNA 2DVAA 3C2UA 3BA7A 1K5VA 3RQ0A 5GZFA 3LSEA 1ILR1 2E7TA 4JC1A 1Q1UA 2Y9WC 2D23A 4K1YA 4QBVA 3BRFA 4I4SA 2XG3A 3A4UA 5L73A 1S0IA 5BP5C 2NVHA 2VXTI 1B09A 2ZHNA 3VUOA 4XJUA 4Q9GA 2UUSA 4LBKA 1FQ9A 4I4VA 1EPWA 1LJ7A 3ASIA 1W3AA 1V6IA 1LESA 2I1BA 4XFTA 1GZ9A 4GP3A 2ZGPA 4AVTA 1QOOA 1AJOA 2YV8A 2BEBA 4I4OA 4JKXB 2JE9A 1HKDA 3NV1A 3CNAA 3P6JA 4IONA 3UD8A 1AFCA 4XMIA 1GICA 2VW1A 2CYFA 3ILRA 1QGLA 3IKWA 5FZZA 4D0ZA 1GV9A 2QYIB 1TWMA 3WO4A 1V00A 1IS5A 4Y1YA 1RITA 4YW2A 3INAA 1SR4C 5F8SA 1JW6A 4YG6A 1AXYA 3BB2A 1MS4A 2WNEA 5T5OA 3AJZA 2GZBA 1G9FA 1MZ6A 3POSA 3AX4A 4FOYA 4YM0A 1IKQA 2D1ZA 3VT1A 3WG2A 4PC4A 3VWCA 5DUYA 4YG3A 3VEQA 2Y9FA 2RQ9A 3NV3A 4P0LA 5BQUC 2ZABA 3UJ4A 4I96A 1IJTA 1LOAA 3N3HA 3UJOA 4YW1A 1KDKA 4UW3A 3APBA 2YXSA 2FFVA 5JMCA 1AX0A 3BA5A 2GO2A 1DYKA 3FBYA 2R1BA 4QALA 1DJSB 3HN1A 1HKNA 2DUPA 5BXRA 1R1ZA 1W6NB 1OQ1A 2Q3NB 2ZGQA 4R9AA 2ESUA 3SH5A 5GZGA 4YZ2A 4XFUA 2YMZA 3AP6A 4AYUA 1V6UA 4ZGRB 2WSVA 4FPKA 3N7MA 1HWOB 5GLVA 2C9AA 3O5WB 2GMEA 1AXKA 1ISVA 1C57A 2YUGA 4ZFUB 4R9DA 2Z42A 2DS0A 3AJ5A 3ZC8A 2JECA 1IILA 3WLUA 3ZXJA 1PC8B 3AK0A 4XJ9A 3NV2A 3V0AA 2GMPA 4M3CE 1ISXA 1KRIA 3V79C 1NZKA 3A21A 4AGVA 4DPNA 1WLDA 3I2AA 4IHZA 2E6VA 1ONKB 4OWKA 2ZBJA 2F2FC 1WBFA 3AJ6A 2ZKNA 3I4IA 3V0BA 2E4MA 1NXD1 3MW3A 1QF3A 9ILBA 1H9WA 4G6MA 1TP0A 1YF8B 1WD4A 3AP9A 1ZA4A 4AN6A 4EEEB 5CBLA 5HCFA 4I4UA 1SR4A 2ZQNA 1IKPA 1SACA 4Y22A 1HQLA 4HJJA 4X38A 4LO7C 1APNA 1GLHA 4GKXA 4WVVA 1ISZA 2A71A 3WCRA 3O4CA 1QDOA 1FX5A 3S8JA 2D6PA 4ZXKA 2D6KA 4XILA 3WO2A 4II0A 5EYYA 2VW0A 2W39A 1Q03A 1I3HA 1F31A 3AKFA 3PG0A 3OYWB 4PBPA 2ZGUA 4OWJA 4F34A 1JQZA 1FNZA 2OUHA 2AREA 2NZ9A 4BM8A 1IRAX 3BAUA 3JU9A 3T1LA 1JT4A 1ENSA 3UK9A 3FFZA 3DGTA 3FJ9A 2D6LX 4YFZA 1UL9A 1H9PA 1LCLA 4IZXA 1CJPA 2PHFA 2CL2A 5SV8A 1DQ0A 3WDYA 1LOGA 2VSAA 3AZVA 2ZGLA 1LOFC 3W58A 3AZWA 1QKQA 4HA2A 4YZ3A 2FFUA 4KC3A 1CESA 1YI7A 4HL0A 4SLIA 1V6WA 2A5ZA 4Y1XA 1V6VA 3NBCA 1KNMA 2AYHA 31BIA 1BQPA 3ZC9A 1W3FA 2R0FA 1LHUA 5JLVA 1DZCA 4Q1RA 2PHXA 3AYCA 1S1AA 3PVNA 5FNWA 1CPMA 3M1HA 4QKRA 2P3IA 1BARA 4HANA 4G6JA 4FP3A 1AVAC 4FPGA 4Y20A 2R49A 3WDTA 4BLJA 5JDBA 1W6PB 2UURA 5E24E 2OUJA 1JT3A 1FWUA 4FQZA 1N3OA 4LBQB 4ATEA 1ENRA 2F2FA 1MS8A 4PBOA 4JAWA 3FJJA 1DQ1A 3CA3A 5DZEA 1M2TB 2V73A 3ZVXA 4IY8A 2A70A 3USUA 1W6NA 4AVVA 2M49A 2PHRA 2DVDA 5F9TA 1CE7B 1DFCA 1T4QA 2A3XA 4YW3A 5E8AA 3AZXA 2D3PA 2W08A 1G7YA 5EYXA 4H9WA 2ZGKA 1QQLA 2VU9A 4GAFA 4A7ZA 3FLPA 1Q56A 3PJQA 2K8RA 2BEAA 5F8WA 1DFQA 3M3CA 3M3EA 2HZ9A 4LO1C 3FJIA 2ZGOA 1N3PA 2D43A 2Y9XE 1CR7A 3WMUA 1JXNA 1ONAA 2ARXA 3RSJA 3SNMA 2JJ6A 1AJKA 1LOCA 1ENQA 2EXIA 3A23A 1QU0A 4AVSA 5FNXA 4GOYA 5E88A 1LOBA 2HW9A 1SCRA 1S0DA 2X2SA 4I3NA 1XYFA 5DUVA 4R9CA 3ZYPA 3A22A 2ZACA 2P2KA 2ZHLA 2P37A 3D4KA 4Q2FA 3BA4A 1JTCA 2GNDA 1DBNA 1O4YA 2D24A 2R0HA 5JOWA 1HLCA 1SBFA 1Q8OA 3B9UA 3ILNA 4YGBA 4W65A 2PELA 2ZA9A 3SH3A 4C1XA 1AVUA 1QDCA 1MVEA 3OPZA 1QQKA 1BFFA 1ISYA 3H6RB 2ZHKA 3BTAA 1JLYA 4BPZA 3VT2A 3AH4A 4I30A 5BXPA 5JVVA 2ERFA 3AYDA 3WDWA 1K5UA 4IZEA 4YLZA 4TZDA 2R16A 3A07A 1VALA 1WW5A 3B01A 3OBTA 1YYNA 2GN7A 1HWNB 3WO3A 1CPNA 2HYKA 4XXPA 1HQWA 2AQZA 4FQ4A 4OWLA 3FJKA 4XXAA 4L8QA 1JHNA 1W6OB 4K1ZA 3BX1C 1W0OA 2X2TA 3BAQA 3FJHA 2NMNA 5T50A 5G00A 3WUCA 5H9PA 4Z9WB 1UN1A 4M3CB 2FO1A 2KLLA 5DSSB 2VLCA 5D61A 4LO3A 3WINC 5T52A 4FOQA 3SITA 4LBMA 3C9ZA 3WHUA 1SCSA 3V64A 1EV2A 1DQOA 7I1BA 4XFSA 4LO1A 5H9RA 1R8OA 3H6SE 4I2SA 3LTQA 4LBQD 2W52A 1FV3A 3JRRA 5FZUA 2WLQA 4PCRA 2D7RA 4Q27A 3POWA 1W6PA 4EFPA 1II4A 1SFYA 5GAQA 2AGSA 4WVWA 4LBQA 2OVUA 1BFCA 3HSMA 3Q9OA 3VKFC 4FPHA 4C1WA 5LK5A 3RG0A 2A6VA 2DTWA 2KI6B 5F90A 1LEDA 1ABRB 3WG1A 2D7IA 1GNZA 1NLSA 1A3KA 1KJLA 3CAHA 3ZYRA 1WW7A 21BIA 3FUOA 3LSDA 1XG6A 4Q9PA 1JYCA 4LO8B 1FV2A 2DTYA 5CNAA 1JYIA 1G9CA 4XDQA 3AXEA 3CA1A 2D7FA 4I1EA 3CQAA 3ZXEA 1WUVA 2D6OX 1CN1A 2DVFA 1G9BA 1IS6A 5BXSA 4X37A 1TTUA 2VW2A 1UZYA 1DZDA 5IK8A 4YM3A 1MS9A 1F9KA 4Y20B 3NWKA 1U0AA 2JE7A 3WZ1A 2E53A 2CTVA 3O4BA 5DVHA 3IN9A 1GGPB 4XJZA 3NBEA 2GDFA 4KEKA 2ZMNA 3USUB 3ZXKA 3WA1A 4Q91A 3AFKA 5DZUA 1D2SA 5H9QA 3BAGA 4A7KA 4LO7B 2EAKA 3WVJA 1V6XA 1MS1A 3IM5A 3AJYA 2PHTA 1WCSA 1N1VA 1BFGA 2ERMA 3CRHA 2B7YA 3O3QA 4LBOA 4FOWA 5BP5A 1PUMB 1LGNA 2DVBA 2NYYA 3H6RA 4OZXA 4I6IA 4LO2C 3T8SA 4AN7B 1AVWB 2CWMA 5GM0A 4IYBA 1RMLA 3A0NA 2ZGSA 2IWTB 3B9CA 4P0JA 5FZYA 1RY7A 1V6NA 2PHWA 3BADA 4R9BA 5F8YA 4MYEA 3W9TA 2DUQA 2DRZA 2OW4A 4XYXA 3N0KA 1W0PA 2VY0A 4XIOA 3FJCA 2Q5TA 5EC5A 1W6OA 4FGFA 1EYLA 3KM5A 4D69A 3VKMA 3ILFA 4OUJA 1FYUA 4OEFA 1RIRA 2ZGNA 4Z8SB 1G82A 2LALA 4YFWA 4M3CA 5D63A 3H0OA 4XOGA 6I1BA 2UWAA 2KI4A 2ZR1B 2GALA 2WKKA 3Q7WA 1S0CA 1G86A 2D44A 1JUIA 1IOBA 5JOZA 4YGEA 1ULEA 3ZSLA 1IHKA 2CWSA 4ZOTA 1BJQA 4BLIA 4UW4A 3NBNA 4J2XA 4Q8LA 4EKXB 3WG3A 3DUIA 5D62A 4P9WA 3MEPA 4XZPA 1QXMA 5KXCA 4P14A 3ZSJA 1JLXA 1QNYA 1CVSA 5CAZA 5BQUA 1MR5A 2DURA 4XIKA 3UD7A 2LTNA 5GLWA 1TOOA 4RA0A 2ZMLA 4GXLA 1S0GA 1GANA 3PVOA 4FOVA 3D6EA 4H04A 4YG0A 2WT2A 2XOAA 1PZZA 1YO8A 1PZ7A 1N4KA 5DZGA 1LENA 2NN8A 4JRAA 2VXRA 1OQLB 1SLCA 3UJ0A 1XQNA 1MS0A 3RS6A 4F83A 4G9NA 3FJDA 1TEIA 1CONA 4WV8A 2ET2A 3KMVA 4P6AA 1RG8A 4U2AA 4AWDA 2MLLB 3AZYA 1ZM1A 1PZ8A 3AP7A 2CNAA 4OEGA 2A3YA 3WUDA 5GZDA 5DZFA 1WBAA 1JT5A 3ZPYA 5BYNA 5B2HA 1BZWA 4XHXA 2QN4A 2ZZJA 3BAHA 1KJRA 2AAIB 3AH2A 4USPA 4GKYA 4GALA 1D0HA 3FJEA 3WCSA 4I37A 3AXDA 1AX2A 4ITCA 2DREA 1V6JA 4YOLA 2EALA 5GLUA 4YZ4A 1G9AA 3O44A 4EFRA 1RINA 1C4RA 1DYPA 4UW6A 4DRVA 4OW4A 4XBNA 1MZ5A 3OJ2A 2WSUA 2P3JA 3M3OA 2P23A 4D8HA 3SNVA 4CRQA 4LO0C 2RHPA 3WNXA 1WBLA 2WRYA 3SISA 5GALA 2L5XA 1LHVA 1T9FA 4ZBVB 1PZ9A 1FAYA 1OFSA 3MW2A 5EG6C 1DQ6A 4Y26A 1F5FA 3NBDA 2YY1A 3WDXA 4CJMA 2F8XC 2EXJA 3GALA 1BLDA 1S0BA 3IMNA 2Z48A 3D7WB 1LODA 3NV4A 5BVPI 1VAMA 2AUYA 4XBQA 4FPEA 1C1FA 1GNHA 1CVNA 3VSFA 2MIBA 3VKLA 3AKIA 4GWMA 2A6XA 1G9DA 1JY0A 1DIWA 5H9SA 4XBLA 5KXDA 2DWRA 4L4IA 4JKQA 1IS3A 5T54A 4XTMA 3Q7YA 1HWPB 5HPZA 4Q8KA 1R8NA 3BRDA 5DG1A 2LIQA 2YZ4A 5IT6A 1UPSA 4DRRA 2GMMA 3CA0A 1MACA 3VV1A 1YRZA 3N7KA 2VUAA 4PF5A 3JUUA 3T2TA 3A0KA 3R4UA 4KEJA 2PHUA 4GP0A 3V65A 1S0EA 1ULDA 2BQPA 2ZMKA 1AXZA 1LOFA 3WG4A 5DUUA 1J1TA 1CQ9A 2ZQOA 4J2SA 2R9KB 2WT0A 5IUQA 3BOPA 3AKHA 2EXKA 3JUTA 3N35A 3QCWA 5DG2A 1OKQA 1XZZA 2UU8A 1WW6A 1W6MB 2V5YA 1SLIA 1YIFA 2KM2A 1BXHA 2A6ZA 3O5SA 1KITA 3CRIA 4G9MA 4IQPA 1L2HA 2DU1A 2R1DA 2A6YA 4GOVA 1GZWB 5GLZA 2ZGTA 4H55A 4Y1ZA 3FJ8A 3PVEA 1YBIA 3IM7A 1JBCA 2WBCA 2Y9GA 3HOMA 2ZAAA 4YW5A 2ARBA 3FJAA 3N36A 3FLRA 4P9XA 5E89A 1UMZA 1QMJA 4I4YA 4M00A 1FMMS 1Y7BA 4IY9A 4FPFA 4FPLA 4XE9A 1FMZA 1S0JA 1I1EA 4OEEA 1JOJA 3HALA 2EIGA 5KXBA 3QYDA 1V6LA 1A8DA 4ZLBB 5T5LA 3N7LA 3GNEA 1HCDA 4L4HA 4QBCA 3RRDA 1Q8PA 2ZHMA 4DFSA 1SBEA 5JOYA 1HCEA 1MS5A 3POYA 2Z49A 4I4RA 2D3SA 1LHWA 2TEPA 4JP0A 1AF9A 1ULGA 3ENRA 3QR5A 4FPJA 41BIA 4FVVA 1FNYA 1V6MA 4QD2C 3WV6A 3CA6A 2FMDA 1JN2P 4I4QA 2WJSA 5HCAA 1CIWA 1IRPA 1GKBA 1DQGA 3WDVA 4RL7A 3VKOA 2JDZA 1DHKB 1DQ4A 3W59A 2HWAA 3MALA 3O0VA 1KDMA 1ISWA 2H0BA 1VIWB 4NO4A 4YM2A 5KXEA 2SLIA 5EHAA 4YW4A 2EF6A 1LU1A 4DCKC 3KQRA 1DQ2A 4ISQA 2E4MC 4USOA 2UWCA 1W6QB 3AH1A 3I8TA 4LBJA 1QOTA 3R05A 4XJAA 4BQ1A 4I1BA 4R6UB 4QKSA 2ZGMA 3O12A 4XTPA 2AFGA 4I4PA 3FLTA 3TC2A 5GZEA 4ASMB 3HR9A 5FREA 4G1RA 2A7AA 3ZSMA 3MW4A 5BOWA 3IIRA 1S0LA 4K20A 3PHZA 1GZCA 2Q9XA 2GNTA 2CY6A 4ZA3B 5EWSA 3D5OA 3NJ5A 2NMOA 1AXMA 3OJMA 3O0XA 2DUOA 3ZXGA 3B00A 3TB0A 2AENA 1LGBA 4AGGA 3P6IA 4Y24A 1JT7A 4LBLA 2E51A 1SLLA 1Q8SA 4CTEA 3RTJB 1HIBA 3VSZA 1DZQA 4XKIA 3WINA 2FHRA 1VAVA 2D6NA 2WT1A 2JD4A 4QC4A 3S8KA 4DS0A 4BOWA 4ZFYB 1W6MA 1SLAA 1LULA 5AVAA 4EB2B 3UD9A 1ULCA 1HDKA 4I4XA 4QO3A 1G8WA 1X50A 5IK5A 2MC2A 3O0WA 4DEPA 4XJ8A 2FDBM 1MD6A 1GZWA 4ENDA 3VKNA 1I1BA 3OY8B 3OGFA 1WLWA 5DUXA 3L2YA 4M01A 2ES3A 4HR6C 2D22A 5F5QA 3AYAA 1N47A 1QNWA 2FGFA 1LECA 1QOSA 3P53A 1TFMB 3WHTA 1SLBA 3M2MA 3IPVB 4LBNA 3B69A 2AR6A 3BIWE 4I7IA 4EFQA 2VH9A 4PQ9A 4NOTA 3ZXLA 1Z78A 2D20A 4AGRA 3I2XA 5JOXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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