1Z0HA

N-terminal helix reorients in recombinant c-fragment of clostridium botulinum type b
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
NKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
publication title N-terminal helix reorients in recombinant C-fragment of Clostridium botulinum type B.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 101
structure length 438
sequence length 438
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2005-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1z0hA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1z0hA02
1AVWB 3D5OA 3DGTA 1GICA 4WZFA 3CA6A 3C9ZA 1JLYA 3WO4A 3HN1A 4JCKA 3FUOA 1FMZA 5HCBA 4QKRA 2Z42A 3OBTA 2DVGA 4PBPA 4I4UA 5FRAA 3O5SA 3BAGA 4LBOA 1J0SA 1P63A 3WMVA 3WHTA 2Z48A 2P3KA 1ULGA 3AH2A 5DUVA 1IILA 1IT0A 1N3QA 1CJPA 4YZ5A 4YZ2A 1IOAA 2WSUA 1G9CA 3BA4A 4H55A 3MPPG 1SZ6B 3RTJB 3AYEA 1JLXA 3CA0A 4BLJA 1IJTA 4M3CF 1EV2A 2RG9B 1HKNA 4XFUA 2A70A 4Q9GA 4XKIA 1MS3A 1CESA 4LBQB 1BYHA 1GZWA 3AP6A 1II4A 4SLIA 2WRYA 2FO1A 5F90A 3LSEA 3LSDA 4JQ0A 3M3EA 3AZXA 4CTEA 1ULEA 3QR5A 3WMUA 4FPEA 4I4OA 4Q1PA 4HANA 2Y9XE 4BOWA 4EFQA 2VH9A 1YYNA 4OWKA 1TEIA 3NBEA 2ZGTA 3PVOA 3R4SA 4Z9WB 2YUGA 4ZFUB 4LBJA 3ZC8A 2GNTA 1W3AA 3A21A 1W6MA 1G86A 4NO4A 2ZHLA 4G6MA 2VW0A 4LO3A 1GLHA 3IM5A 2YMZA 3A23A 1WD4A 3AK0A 2NTDA 1UN1A 4YGEA 2D3PA 4XE9A 1K5UA 3NBCA 3WINA 2R1BA 3WO3A 5DZGA 5CB7A 2ZGLA 1JT4A 4FOWA 4J2KA 4AN7B 3A0NA 3POSA 4I7IA 1RZOB 1DQ2A 3CAHA 1PUUB 1ULDA 2BQPA 2NMOA 1MC9A 2E7QA 1HQWA 3MW3A 3H6QA 4DCKC 4XTPA 3OJ2A 2P39A 4QD2B 3MW2A 1JUIA 1GV9A 4DPNA 5IT6A 2BEAA 4LBKA 3HMYA 3Q9OA 4R9AA 4X39A 5H9SA 3B9UA 3HR9A 4BM8A 4HA2A 4FOVA 2KKIA 3RRDA 1AJOA 1MS9A 1Q8QA 3NV2A 2AUYA 2EXKA 1IS4A 3AJYA 3FLTA 1JXNA 1JW6A 1GZ9A 1R8OA 1HWOB 1LOAA 1QQKA 1FN0A 3UJ0A 3EF2A 3POYA 2K4AB 3O4CA 2OUJA 1SCSA 3VUOA 1CVSA 2P2KA 2PHTA 3U4XA 1AX0A 3WOGA 4J2SA 4QALA 2AQZA 4USPA 1ONKB 2E7TA 3B00A 4M3CB 3I8TA 2W68A 2A3WA 1W6MB 2PHWA 2ZABA 1UZYA 1M16A 5FREA 4DRVA 1SCRA 5GLVA 5D63A 3V0BB 4XILA 1MS4A 5SV8A 2LALA 3D4KA 2ZHMA 4FQZA 3AKHA 4IYBA 3ZXEA 4GAFA 4IONA 3T1MA 5BQUC 5FNXA 1IRPA 1SLBA 4XFSA 5GLZA 2WQZC 1HWNB 1SLLA 1HDKA 4GXLA 1KNMA 2GNBA 7I1BA 4YM1A 5E24E 2ZHNA 3N7JA 2NMNA 4KC3A 3QLQA 4Y1YA 3NWKA 1ZA4A 5T5PA 2ZGOA 3FJIA 3Q7YA 1TFMB 3S8JA 2A6VA 4Q9PA 3PVEA 3LTQA 2NZ9A 4I8MA 3UD8A 5EYYA 1GNHA 2PHUA 1KITA 1MZ5A 3FJDA 1RITA 3BX1C 4D0ZA 1FX5A 4EB2B 4YW2A 3ZXJA 4QO3A 3OJBA 3OPZA 3ZXDA 2NP0A 4FPCA 1PZ9A 1RIRA 1YI7A 1D2SA 5EHAA 1R8NA 4J2XA 3M2MA 1S0DA 5T5JA 1LGCA 5B2HA 2W52A 2ARBA 1WBAA 4IY9A 4Y24A 4FQ4A 3RQ0A 3HOMA 3BRDA 3O5WB 5JOZA 1TTUA 1V6VA 4XJ8A 3NBNA 3ILAA 5DUXA 1QOOA 2GN7A 4PCRA 4X37A 3CU1B 1S0JA 3V64A 5JDBA 1XHBA 4XJUA 2A6WA 2E53A 3NV1A 1APNA 3N36A 4ITCA 5EYXA 1UPSA 1LOCA 1G9DA 1FYUA 1WW7A 2A7AA 2GNMA 4P14A 1WCSA 4Y22A 4XIKA 2OVUA 1QXMA 1IKQA 1Q8VA 1N1TA 3WG4A 2XG3A 2ZZJA 2GMEA 2CWMA 4Y1ZA 4LO7C 2GO2A 5KXCA 1BFFA 3BADA 1SLTA 1DFQA 3AZVA 4TZDA 8I1BA 1QKQA 4ZFWB 1Z0HA 2R0HA 2P34A 3IPVA 2XOAA 4YOLA 3POKA 2A3XA 5FZZA 4GKYA 1BARA 1AXKA 1UMZA 4Y20A 1EVTA 3FJ9A 2FHRA 2PELA 1IHKA 4BQ1A 4OW4A 5AVAA 1N47A 2I1BA 2D3SA 1WW4A 1QGLA 3IAGC 4CJMA 2ZHKA 4I96A 2AENA 4J2YA 4LBMA 2Y9FA 2VU9A 1BFCA 2A6XA 4R6UB 1LHOA 3CRHA 1QF3A 2VXRA 1LOFC 1DQGA 2GMMA 4GOYA 3NV3A 4USOA 2FFUA 1MVEA 3IKWA 4YW4A 4JKXB 2DRZA 2UWBA 5HPZA 3I2AA 1WW5A 3WO2A 4I1BA 1JOJA 3OGFA 2IWTB 5EG6C 41BIA 1H9WA 1QDCA 2HZ9A 4YW3A 3BAOA 2D43A 2Q9XA 2GALA 1VLNA 4OWLA 3A4UA 1J1TA 3QCWA 4GAIA 1CPMA 1UKGA 4LO7B 4P9WA 1GBGA 4Y22B 4AGRA 3WCRA 1NXD1 3WLUA 1BLAA 4H04A 4AWDA 1HCEA 2GDFA 3AX4A 4L8QA 2Q5TA 4ZXKA 2RQ9A 3OY8A 1HLCA 5DZEA 3FLPA 3FJCA 4UW5A 1S0EA 1GSLA 3BRFA 3LCPA 5DZFA 2D44A 2CNAA 1YBIA 5E8AA 1SFYA 3IPVB 2ZGUA 5FNWA 1FV2A 2HW9A 2EALA 1WLWA 4X3AA 2M49A 4Y20B 4WV8A 2A6YA 3CQAA 2AYHA 1LESA 1FNYA 4EEEB 1AF9A 4LBNA 1RMLA 3AH4A 2YY1A 2ERFA 2FGFA 2ZA9A 3T2TA 1HCDA 4HJJA 1Q8SA 1V6WA 4JC1A 2EIGA 3BAHA 1XZZA 2WBCA 2YROA 1H9PA 4YGCA 1S0BA 3GALA 1LEMA 4GWNA 1AX2A 3O0VA 2HWAA 1SACA 1DYPA 1G8WA 1N1SA 2ERMA 5JOYA 1LHVA 1SLAA 3OBRA 4YG0A 1BFGA 1OFSA 4PBOA 2RHPA 1DIWA 2GZBA 4YGBA 2D3RA 1VAMA 5E89A 5CA6A 2W39A 4DFSA 1FGAA 2GN3A 4FGFA 1T4QA 2A3YA 5BXTA 3MEPA 1SR4A 4YM2A 5DSSB 3PHZA 4FPOB 4IQPA 3RMYA 1OQLB 1TWEA 1IS3A 1W6OA 4I37A 1B09A 3OY8B 4QD2C 4RL7A 3CRIA 1VAVA 4WVVA 1QMJA 1CN1A 4YLZA 1FNZA 2MIBA 3M1HA 2ZGQA 3WDWA 2D22A 1KJLA 4AVSA 5F5QA 4Y26A 4F83A 5DUYA 4GP0A 2NYYA 1AFCA 3W9TA 4LO8B 3BA7A 5L73A 5H9RA 1GKBA 3ZPYA 4D8HA 1LU2A 3AYDA 4GOVA 5IK7A 3RMXA 5LK5A 2D23A 1KDMA 4KEIA 1BXHA 4UW4A 3VT2A 4XJZA 1PZZA 4LO2A 1DHKB 4JRAA 4P9YA 5HCFA 1V6MA 1F31A 1FAYA 2ZGRA 4AGGA 3O3QA 1IS6A 2DS0A 3T1LA 2KI6B 4OEFA 2B7YA 4LO3C 1UZZA 3ZX7A 2VW2A 4YGDA 1GNZA 1F9KA 2TEPA 3WDYA 4XMAA 1WLCA 1S0FA 2JD4A 3CRGA 3ZXLA 2VUAA 1QQLA 5GLTA 3WINC 2R49A 1BASA 5GLUA 1V00A 3BA5A 4Y1UA 3N3HA 3ZSLA 2AH2A 3FJJA 5IK8A 2WT1A 4JAWA 5T55A 1JTCA 4L4HA 3INAA 2VSAA 1W0OA 1YRZA 4TLPA 3CA3A 4Q1RA 3VT0A 1W6OB 2UURA 3Q7XA 4QBCA 4JKQA 5I1BA 1JT5A 5DG2A 3ZYPA 2JDZA 4Q91A 2E51A 2PHFA 5F8WA 1GZWB 1FWUA 2DUQA 3N7LA 2RSTA 1MS8A 2D6MA 1N3PA 5EWSA 3AZWA 1SBEA 4IY8A 3QYDA 3O4DA 2QYIB 2F2FA 1W3GA 3BAUA 5F8YA 3ZC9A 2FDBM 1H30A 4AVVA 2WLQA 2DTYA 1IOBA 2X2SA 5DXDA 3V65A 3AH1A 2KH2A 2XB6C 5CBLA 3P53A 4I3NA 4YZ1A 1N3OA 5KXDA 3VKFC 3VEQA 3BIWE 1XYFA 5F8SA 1S0IA 1WUVA 5T50A 1KRIA 2ZKNA 1IS5A 3R05A 4U36A 2QN4A 3PUBA 2R0FA 3PVNA 1LEDA 3UD7A 5GZGA 3Q7WA 5D62A 3IIRA 2YV8A 1TOOA 4I1EA 1PZ7A 3F1RA 3WV6A 1ILR1 1XQNA 2JE9A 3WG3A 4DS0A 2ZMKA 3FJBA 1UL9A 2ZGSA 4OUJA 2YZ4A 1A78A 2DVFA 5JVVA 2PHRA 1N4KA 1OQ1A 3C2UA 1ULFA 3FUQA 1LULA 4FPFA 1QOSA 2AAIB 1A3KA 1Q04A 1ONAA 3WG2A 2ESUA 2KM2A 4XTMA 4I4VA 3CNAA 3ZYRA 3WNXA 1LOBA 2A75A 4XJ9A 1AZDA 5GLWA 2P37A 1DQ0A 3IN9A 1BZWA 4G9MA 2NN8A 3UJ4A 1W6QA 2D6NA 1Z2VA 3FJHA 4LBLA 1IKPA 4XHXA 1JHNA 4I4SA 2JKBA 1HKDA 3WVJA 3WZ1A 2ZMLA 2NVHA 4A7YA 1A8DA 31BIA 1N1VA 3M3CA 2ZACA 4XJWA 4LBQD 3AKGA 3OJMA 4OEGA 3UJOA 4FPHA 1LGNA 2DUPA 2LIQA 4QC4A 2D7RA 3FJAA 3UL2A 4XBNA 3BAVA 1S0CA 1C1FA 1LU1A 3A0KA 1O4ZA 3BB2A 3OJVA 3VSZA 1ISVA 3O12A 1AJKA 4BMEA 4WVWA 3JU9A 3RS6A 3ZXFA 4C1WA 5DUWA 2WSVA 3FGMA 4P0KA 4F34A 3P6IA 1S0LA 3O0XA 4ZLBB 5GM0A 1DQ4A 1V6UA 1G9FA 3UK9A 4A7ZA 3IM0A 5DZUA 2W08A 1XG6A 2E4MA 3FFZA 1QDOA 1DQ1A 1SBDA 2DVBA 4U2AA 4Q26A 4ISRA 4YFWA 5BOWA 1M2TB 4LO1A 4AGVA 3SNMA 4YM3A 1C4RA 2L5XA 4AYUA 3PJQA 5T54A 1W6QB 4XJAA 4AVTA 2ZR1B 4ZA3B 2AR6A 1FV3A 4I4PA 4FVVA 3USUA 4GKXA 1CONA 3BOPA 3SH4A 1NLSA 5JLVA 5KXEA 4TYSA 1LTEA 5DG1A 1HQLA 2EF6A 1V6JA 4CRQA 5CNAA 1LOGA 4YM0A 1ENSA 2VW1A 2D6LX 3ZSKA 3H6RA 1ENQA 2D1ZA 2DVAA 4G6JA 1ULCA 2ZGNA 3APBA 4Z8BA 2AGSA 1WD3A 4G1RA 1JY0A 4M3CE 3AKIA 2FMDA 3N35A 3O49A 2WNEA 1WBFA 3E8LC 1UX6A 1CQ9A 3CA5A 3AJ5A 3FLRA 1WLDA 3HSMA 4WBCA 4XOGA 1E0OA 3I4IA 5IUQA 3AYAA 2V5YA 3KMVA 1C57A 4I6IA 1KQRA 5H9QA 1HWPB 2PHXA 1ITBA 1FWVA 3OGGA 3IMNA 1Q8OA 1BJQA 2AREA 2EAKA 5EC5A 4XBQA 2AXMA 4CZSA 2ZGMA 5KXBA 2G4IA 4LBQA 2HWMA 3FJEA 1DZQA 4FPGA 1DJSB 4K1YA 3JUTA 4J23B 3RSJA 1V6LA 2ZAAA 1C1LA 1S0GA 1PUMB 4ZGRB 2DUOA 4ATEA 3O4BA 1NUNA 1T9FA 4XZPA 5GZFA 5JMCA 2ARXA 3AP4A 4BLIA 3SH5A 1BFBA 5DUUA 1AVXB 3M3QA 3H0OA 2EXHA 4I2SA 4D69A 3ILNA 1FQ9A 1TIEA 1GYKA 1AVBA 4PC4A 2D7IA 4ZFYB 2LTNA 1SLIA 3WDTA 1JQZA 4UW3A 5GZDA 1NZKA 2CYFA 3H6RB 2GNDA 2SBAA 2CL2A 2V73A 3FBYA 3H6SE 2AFGA 4ISQA 1CE7B 1MR5A 2Z49A 3ZVXA 2P23A 4IZXA 3NBDA 3OYWA 3D7WB 1JYIA 2DURA 1DYKA 5EXOA 1ISWA 3O4AA 1BKZA 2UWAA 1Q56A 5FZUA 3AXEA 5JOXA 1DFCA 1KDKA 1SR4C 5FZYA 3AYCA 4XMIA 4AN6A 1GZCA 3N7KA 4Y1XA 2EXIA 2FFVA 1CR7A 2GMPA 3KQRA 1ABRB 1Y7BA 4M01A 3FJ8A 1TP0A 4Z8SB 1HWMB 4X38A 5T52A 3ILRA 2Q3NB 2DRYA 3O44A 4ATFA 5D61A 4YW5A 2KI4A 1AX1A 4IHZA 4R9BA 5GJ6A 1LJ7A 2ZBJA 1ISYA 2VXTI 3W59A 1PZ8A 1YIFA 2R9KB 1BQPA 3R4UA 1ISZA 1V6OA 2X2TA 3O0WA 1DQ6A 1YF8B 2H0BA 2D6PA 5GZCA 2MLLB 1W6NA 4LO2C 4XBLA 3I29B 4FPLA 3KM5A 4K1ZA 1LCLA 4ZOTA 1ENRA 1VIWB 4ENDA 4P0LA 5GALA 1WBLA 3RG0A 1K5VA 1DZDA 4BPZA 3WDUA 1MVQA 1DBNA 3IM7A 1VCLA 3RTIB 3DUIA 1CPNA 3OYWB 4L4IA 1L2HA 4M3CA 3AZZA 1AVAC 1DZCA 1W6PA 2I2SA 2MC2A 3B69A 4XHBA 3V0BA 1QOTA 4XXPA 2K43A 4FPJA 5T5LA 3WDXA 2LIEA 4XDQA 1V6KA 3SLIA 1Q03A 4I0YA 1LHWA 1F5FA 2WT2A 1I1EA 2JJ6A 2CY6A 1V6XA 3F62B 2BFHA 3S8KA 4KBBA 4KEKA 1I3HA 1AXZA 1GGPB 1Q1UA 3WUCA 4UW6A 5BXRA 4GP3A 1FATA 3B9CA 1PWAA 3HALA 1N1YA 1HIBA 3UJQA 4XFTA 4ZBVB 1TWMA 2EXJA 4YZ3A 1V6NA 1JT3A 3UD9A 3O4OA 3AXDA 1G9AA 2F2FC 1R1ZA 4I30A 3BRGC 2DTWA 2Y9WC 2ET2A 4OZXA 2HYKA 2OUHA 4EKXB 2DV9A 4MYEA 1U0AA 1W6NB 3VWCA 5F9TA 1AXYA 4YFZA 4JP0A 1G82A 3ZXKA 1JYCA 2IHOA 3M3OA 1G7YA 1QU0A 2ES3A 1DQOA 3D6EA 3AZYA 1DLLA 1LGBA 3WG1A 5G00A 1WBCA 1QNYA 1FMMS 1LENA 2ZQNA 4I4QA 4A7KA 3I2XA 3T8SA 4QBVA 1W6PB 3V0AA 2UUSA 4OWJA 5BQUA 2VLCA 1D0HA 3AFKA 3V79C 2ENRA 4XYXA 3HBWA 4H9WA 1LHNA 3WDVA 1BA7A 3B3QE 4GA9A 1Z78A 4FPKA 2JECA 4Q2FA 3A07A 1IRAX 1YO8A 3WCSA 2NM1A 1LOEA 2WJSA 1MS1A 3VSFA 4FOYA 2CWSA 1DGLA 2UWCA 2VY0A 2C9AA 4P6AA 5GAQA 1MS0A 3BODA 1JT7A 3AP5A 2R1DA 21BIA 4RA0A 3IM6A 3L2YA 3CA4A 1RINA 4BMBA 2D6KA 4K21A 4NOTA 2DYCA 3SITA 1W0PA 2D24A 3CA1A 4GALA 3N0KA 4II0A 5BXPA 3A22A 5BXSA 2A71A 2J3PA 1GANA 2CTVA 4OEEA 2SLIA 4Q8LA 4YW1A 4P9XA 2Y9GA 5BYNA 3W58A 1LHUA 3POWA 3ZSMA 4DEPA 3FJFA 2R16A 4W65A 3WUDA 9ILBA 2KLLA 1CVNA 3TB0A 5CAZA 4HR6C 3VKNA 3WHUA 4D0TA 5HCAA 1EPWA 1LODA 3AP9A 4EFRA 3AJZA 4EFPA 3V0AB 1KJRA 3NV4A 5IK5A 4I4RA 2WT0A 5BP5A 1URXA 3ZSJA 2ZQOA 5BP5C 4G9NA 1Z4SA 1YTOA 2DREA 2OW4A 3AP7A 2A6ZA 4YZ4A 4ASMB 1RY7A 2E4MC 1MZ6A 4P0JA 2YXSA 2JE7A 2UU8A 1LECA 1EYLA 4LO1C 1MACA 3VV1A 1O4YA 3JRRA 3BAQA 3ZXGA 4DRRA 2P3JA 2VSEA 2D6OX 5IK4A 5BVPI 1JN2P 1DQ5A 2BEBA 4R9CA 4YG3A 2WKKA 3MALA 3JUUA 3P6JA 1MS5A 2DVDA 3GNEA 4Q27A 3VKLA 1LOFA 5T5OA 5DVHA 1JBCA 3VKOA 4DQAA 4JPZA 3WA1A 2DU1A 2ZGKA 1PC8B 4FP2A 1W3FA 1I1BA 4XIOA 4PF5A 1ZM1A 1X50A 1CIWA 3B01A 4LO0A 2ZMNA 1RG8A 6I1BA 3N7MA 4XXAA 4LO0C 4FPYA 4ZKTB 5H9PA 3SISA 3TAYA 2D7FA 2C5DA 2ZGPA 4IZEA 3FJKA 3SH3A 3ENRA 3NJ5A 3PMEA 1ISXA 3AJ6A 1YXWA 4GWMA 4FOQA 2F8XC 5E88A 3VKMA 4C1XA 2P3IA 5JOWA 4PQ9A 3SNVA 4I4XA 4Y1VA 1Q8PA 1VALA 1BLDA 1OKQA 1QNWA 2D20A 3K1XA 4I4YA 4HL0A 1S1AA 4DENA 4K20A 4R9DA 4QKSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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