1Z6RA

Crystal structure of mlc from escherichia coli
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
395
structure length
382
Chain Sequence
QIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVHEMLEAHLVQELGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDLPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMSSMLHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Mlc protein
publication title The crystal structure of Mlc, a global regulator of sugar metabolism in Escherichia coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 106
structure length 382
sequence length 395
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1z6rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA03
1YS7A 2GZWA 2DI3A 1YFHA 2A5YB 2OQGA 5AQMA 3KHYA 3G3ZA 2YX7A 1ZREA 4PGGA 5HVQC 2VYPA 2QENA 4A6DA 3DPTA 2RDPA 3GEZA 3B73A 3KZZA 5FLXK 2D1VA 4XEIA 2J5PA 5AQNA 2KJBA 1EV7A 2XKOA 1KXPA 1CF7B 2V1UA 2G7HA 1USTA 1BU6O 4MTEA 1AWCA 3O1BA 4TV7A 2P9KB 4EJOA 4KDPA 2QQAA 3HRSA 4FPAA 3M1FA 3ZEUB 1U6ZA 3F21A 3K0LA 1S7AA 1NGEA 1G3TA 1P4AA 2NRAC 3JSPA 2XUBA 5K5OA 4JD2B 4BVPA 3ZMVA 2D45A 1K7AA 1ON2A 2KJCA 2V9VA 3U2RA 1IF1A 4CXFA 4PL8A 1IW7F 3OHRA 2MC3A 5AQPA 4EV0A 3LDOA 1V4SA 1OYIA 4BRAA 2ISYA 4H0EA 2AXLA 1SD4A 3I59A 4M9ZA 2P6SA 3CUQA 3K2ZA 4G6DA 3FE1A 5LRRA 4GXOA 4BR5A 4CICA 4G94A 1QQMA 5JVTA 2JRTA 4HF2A 3SQNA 3WE2A 3VGMA 4BRMA 4KFCA 2E7WA 3WTUC 2ZGZA 3QP5A 1H1VA 1HKSA 1OPCA 4NHJA 2P9IA 2RVCA 3SK3A 4OIPF 3HHGA 4LB5A 2CH6A 1BN5A 5EOYA 5E8GA 2RN7A 2QUFA 3UKUB 1LEAA 4PKGA 3I4PA 3U4LA 4MNUA 3F3XA 3D2EA 4YIIA 2OAZA 1MWKA 1GLJO 3C3WA 1YW7A 4RAYA 3A5OC 3O80A 2HTJA 1J2XA 4BGBA 2YSRA 3WTYC 1T39A 3D5LA 2JPCA 5CVRA 3V7SA 4ZYHA 3KLNA 2V52B 2LDUA 1Z91A 3JTHA 4H5RA 1BOAA 1T38A 4F7ZA 2M8EA 4DHYA 5ED4A 4AIJA 3BEXA 4GNIA 1R1UA 4XBFA 1D3YA 5LHHA 2KIMA 5BPLA 1RDWX 5H20A 1YQAA 2P4WA 4EGZA 2GUPA 5CVVA 1SD5A 1HKBA 3CQXA 3VODA 4I0BA 4GO1A 3RDIA 3RSEB 5D6FA 2IPQX 1QZYA 1ZG3A 1QBJA 1DKGD 4B1VA 3VOEA 4U7DA 5ERIA 4FWPA 1QHAA 1WKMA 2HTSA 4EGYA 4PDKA 1L0OC 5J6XA 2M5WA 3KFWX 1XCVA 4A5NA 3S41A 4H0XB 5D8LB 3FMRA 4BXUA 3GFIA 3MN6A 4BGAA 5F2RA 3HSCA 2BBYA 3QFPA 5D5WB 2O3FA 2DLLA 3VF2A 5EEGA 4QLCU 2D0PA 3DXKA 3AAPA 1WSUA 2QVOA 5AQFA 2QZ8A 5EY4A 3FFKB 5BMZA 5AZIA 1I1SA 2FXUA 3QU6A 3IWZA 1FT9A 2FF4A 1HW2A 1CZAN 4P9UA 2HEOA 1ONVA 1E4FT 4ZYEA 3OV8A 3UKRA 3M7GA 1QO0D 1LDJA 1ZARA 2Z9OA 2GWJA 1W4MA 2Y48A 1Q1HA 4RAZA 5CVJA 5JFRA 3ULQB 4CGZA 3IKVA 5ICGA 5LHIA 4HTLA 1Z6RA 3J80K 5L3FA 4L3QA 3QMLA 1W7PA 1E2XA 4IZ9A 2Q0RA 4BRFA 2Z99A 1SQKA 2P9SB 2H27A 3DXMA 3NEUA 4DB3A 3N4MA 3JXUA 1TTYA 3H92A 5LEKA 4FWLA 5ICFA 3HIFA 2NLXA 1WOQA 1GLEG 2G9WA 4Y15A 4CO8A 3ERED 1IXRC 2PBIA 4BR0A 2PEXA 3CIPA 5E8IA 2D1HA 3FMQA 4AIKA 1T6SA 1DUXC 2MLKA 1CF7A 4O5VA 5CVIA 4RTFD 5AQUA 2ASPA 2E2PA 4HX7A 2K27A 4U88A 2P9KA 2FU4A 4LMYA 3H6EA 4IRGA 3DXJF 4Q4ZF 4EM0B 3RKWA 2NNYA 4EVIA 1S22A 3ZEUA 1IN7A 4A2BA 3KEOA 1MWMA 2KIUA 4I7HA 3ZMDA 4A0YA 5KVRA 3LFKA 4JD2A 3MEXA 5K5QA 2PJPA 2RNJA 3VEOA 3O4WA 2FSWA 5L3BA 5B8HA 1REPC 5AQRA 3F8FA 5IT9K 2J5OA 2NNNA 3H1QA 1QQNA 2E1ZA 1ZG5A 1HUXA 4UXNA 3IFRA 3FXQA 4IHSA 3EKSA 2Q31A 1ZLKA 4HLXA 3H45C 3IMXA 3ATVA 2HF4A 4H5NA 2CW0F 2JPBA 4I6MB 1ZGAA 4BRPA 2PMUA 1YLFA 3U1DA 5FPMA 1KGSA 1ZHFA 4CYDA 1OKJA 2VBWA 4PGHA 3TDZC 5A2QK 2Q2EA 2V51B 3VF4A 1FYMA 5BRHA 3ID8A 2LF8A 3W3DA 4HOBA 3KE2A 3VENA 1STZA 1U3EM 4WXCA 1U5TA 3J7AO 3L4IA 2E20A 3IWFA 3IUCA 2VBXA 1ULYA 2IIRA 5AQTA 1GLLO 2OZUA 4MTDA 4H0PA 1NHAA 4BQAA 1NGHA 2ZCWA 2YJEA 4FOIA 2CH5A 3GW2A 4YIFA 1MJAA 3ML6A 1XB4A 1XSDA 3FLCO 4L0YB 1BUPA 1P8ZA 3VGLA 4HWIA 4BC5A 2UYTA 4LK0F 3WTSC 1NGAA 3IKTA 4IF4A 3E6DA 2OU2A 2QWNA 3O08A 3K69A 2O0YA 4GYIA 2Z5UA 1K8KA 2OA4A 5E1WA 3WG9A 1YS6A 1S29A 4GCVA 2VODA 1KU9A 2Y75A 3P9CA 3MN9A 2BV6A 4B09A 3E5QA 3RJPA 4LLNA 2VN2A 3SJHA 4L9TA 4XSXF 5E26A 1ATSA 2UXXA 4BRDA 2Q2RA 1QPMA 2V7YA 2QYOA 5HOOA 2FA5A 1SFXA 3BF3A 3AAQA 4OMZA 1IN5A 5JHUA 2VONA 5F1XA 2MA3A 2F5CA 2X4HA 5BOXA 2YR2A 3SLCA 1BM9A 3LAJA 2EFPA 1HKCA 3RIRA 1TQIA 3GYHX 1TNTA 4UHTA 3AARA 3JSOA 4IXAA 3KP3A 2GTDA 5CLSA 2HZTA 4FPBA 2A07F 4P55A 3CJ1A 3L2CA 2CO5A 2A3SA 3VEXA 3KLOA 2QM1A 4ESBA 2GEMA 3E6BA 4YFXF 4BG9A 4Y13A 4ZZLA 5E84A 2XAGA 1BO5O 1HQCA 4A12A 4G6QA 1XC3A 3CLOA 4OIOF 3LAPA 2DU9A 4A6EA 4I02A 4DCHA 2GWKA 2VXZA 2H6CA 4EM2A 5AQZA 4EHUA 5ADXH 4CZGA 3Q9VA 3WGGA 3I58A 4JK1X 1ZC6A 1FNNA 5LGTA 3CJCA 5KPRA 2HGCA 3MFKA 2BUPA 3KZBA 4O6JA 5AQKA 5LHGA 5F1RA 3KVGA 4F9OA 1L3LA 5JMVA 1QQIA 3IRQA 4Y17A 3SFZA 2BGCA 1NGBA 2QWMA 2JT1A 1JXSA 3J80Z 5FFZA 4LC9B 2M1BA 5LBQA 5AQVA 1T6CA 1DDNA 5HDGA 2OD5A 3HI0A 1FYKA 1I1GA 5IT3A 3VESA 2ZO4A 3EL2A 2EV0A 4L0ZB 3REOA 4IJAA 1XDUA 4AD9A 1G4DA 4RS8A 3QFUA 4CZFA 4K25A 4H5WA 3QU3A 2NZTA 1K78B 5DD4A 2H09A 3C18A 1YXQA 3SMPA 2HQRA 3QICA 3F23A 1QZ6A 1HBXG 1NWKA 1ZRFA 1TW2A 4KIBA 3CI5A 4I6MA 4ISEA 1FP2A 4PKIA 3ZN0A 1JGSA 1YVNA 4FT8A 4HF0A 1B1BA 1XSXA 4FHTA 2V79A 2YI1A 4G7ZF 2CSOA 1FOKA 3R4KA 4LB6B 4BHPA 3FWEA 5EVZA 3KP7A 3RPQA 2W40A 4K2EA 4IO8A 4L9JA 2PAVA 3NRVA 3CETA 3ECOA 1OKRA 2VC0A 1FBUA 2O03A 3DF8A 2O6GE 1R5HA 1P2FA 4KMUX 2NRHA 3C7JA 3ZPLA 2PLYA 4BQLA 2Z33A 3HUGA 4FSVA 4BYYA 3QDKA 1R23A 1TLHB 3GF2A 3CO7C 3T0YA 1Y64A 4FL9A 1RNLA 2OQRA 3H46O 2KHOA 3TDUC 4BVOA 5DCFA 5AFUH 3QB0A 5TJJA 4BREA 4A0XA 5A2QZ 1Q18A 2V1XA 2D0OA 1T6DA 4U0YA 3WTZA 3BJAA 4BHBA 5J8CA 4KN7X 2FMYA 3HRMA 4RB3C 2D2WA 2E7XA 4G9YA 3LM2A 5FB2A 3BJOA 1GVJA 3IDHA 4KYWA 1HW1A 4EMSA 4O3MA 5D4SA 5AQIA 4YDUC 1SAXA 3MWMA 4JQFA 2CQKA 4IWVA 5FPEA 1MGTA 3A0IX 3L7WA 2ZJ2A 2QWOA 2MD5A 5BR9A 4IRIA 1C0GA 4LJZF 2JZYA 5LGNA 4JHDB 1NGFA 4WQ5C 2PG4A 2E1YA 2DAOA 2A68F 1YW8A 1OYYA 3BJ6A 2WC2A 3RYPA 3D2FB 5TRDA 1HKGA 2VCPA 4G7OF 2YX4A 3T5XA 3WXKA 2AS5F 2P5VA 4HZFA 4MEYF 1NGGA 4IXCA 2Q0OA 2STWA 4I0AA 2X0LA 4GGGA 5DUKA 1TQPA 2A3ZA 2E88A 4IPAA 2C6YA 1U6GA 5DCMB 3W6KB 3VETA 5BS6A 1TUUA 3O3KA 4EIAA 2ZGYA 3ABUA 3M9AA 2YHYA 4M7XA 3L00A 2IT0A 2XGXA 2QQBA 2XASA 2P5KA 2STTA 5ICEA 5KPZA 4EHTA 3LWFA 1SFUA 2DT5A 1CGPA 3QBXA 3BY6A 2NYXA 3HM8A 4K42A 5FFXA 3SHFA 2UXNA 4AVPA 2GAUA 1R59O 5AQWA 5LEJA 1F9NA 2PBDA 3O2PE 3IRRA 3GFLA 5K5RA 3FMSA 1SD6A 2P8TA 1D8JA 1MD0A 2XV4S 3I5UA 4HX4A 4M73A 3ZQ7A 4B1ZA 1FPQA 1SD7A 1IXSB 5D6EA 2E2OA 4CZJA 4OOIA 1O3RA 1QQOA 2KIFA 1QGPA 3H3ZA 4FX0A 3BPXA 3KETA 2V7ZA 1S3JA 2MBFA 2QWWA 5BQTA 1QZZA 4B1XB 4Z94A 3CO6C 2M87A 5FO5A 1KU2A 4ENKA 1FX7A 3R60A 4C23A 1XCBA 3E3VA 1PUEE 2FXAA 3HRTA 3RI4A 1O57A 4E1JA 2AP1A 3T8RA 5JICA 1EH6A 3FXUA 3WODF 2CWEA 4FWSA 3WEEB 2OBPA 2HKOA 1HLUA 2ITMA 3H3UA 4RB0A 2A6EF 1RUNA 1BC8C 1UCRA 3MZYA 1ZH5A 2ZF5O 3ZX0A 4OIQF 3U9ZA 1VTNC 4N9IA 4OIRF 3V8LA 4M6YA 1FSEA 2P9NA 3MQ0A 3M1EA 4B1YB 2V1DA 1R36A 3HRUA 2DFIA 3MZHA 1KU3A 3QBWA 2XHKA 1O7LA 4N0BA 4Z2YA 1KAXA 1KQ0A 4MQVA 2W41A 3N97A 3V7CA 4ENMA 3I8BA 4BC3A 1KU7A 1IN6A 5E1ZB 1RFQA 1U2VA 2ACJA 1P92A 3QAHA 4UVAA 3HTSB 1ATNA 3FZFA 4XLPF 4UUVA 2Q36A 1H0MA 3CJAA 2IP2A 3P9KA 1WRJA 1ZRCA 4KUMA 4A5MA 5AR0A 1T0FA 6PAXA 2K7LA 1DPRA 2HOEA 4ISGA 4NB5A 3L09A 3V8JA 1TBXA 4ESJA 2QXLA 3VPZA 1RI7A 3E5UA 5K1YA 4D0PA 2FBHA 1BA1A 1XMAA 1A04A 1FP1D 3VEPA 2WTEA 3MN5A 3CUQC 3SZTA 2FNAA 1HSTA 3FM3A 4XH5A 4BR2A 1C0WA 1XGNA 4Q47A 4BRGA 3GVAA 4MO5A 4KICA 2XAQA 1XUPO 4JHDA 1V3FA 2EWSA 4LG0B 3LDLA 2CG4A 2H3GX 5DD8A 1E17A 3MN7A 1ZN2A 4UNOA 2IVPA 4CZKA 4LK1F 1R1TA 2FLOA 2GA1A 1TQMA 2FBKA 1EQYA 2DQLA 3GO5A 1BWFO 3BUZB 5BPNA 4BR9A 1V4RA 5BREA 3IC7A 2J4RA 3WQUA 4CZHA 2HYFA 1AOYA 5FLXZ 3CDHA 3LSTA 2EA2A 2CGLA 1HSJA 3H1VX 2D4WA 4E70A 1U8RA 1I27A 2ZMEB 4IHTA 5FGMA 4LD5A 3FZLA 1HXDA 5DCMA 1GLAG 1GXQA 2A6HF 2ZXJA 3G25A 2IA2A 2YCHA 3LL3A 3F8BA 3NQOA 3GBTA 4P9FA 3BZ6A 3WGHA 3ZX3A 4B8XA 3C0BA 4PL7A 4M6XA 5KQ8A 1XGSA 1BI3A 1P4XA 4WQ4A 5BPMA 2GXBA 2E8AA 2F9TA 4BRCA 3VGKA 1JHFA 5HDNA 2V6CA 2Y0MA 4CI6A 5ADXA 3UKUA 1S6LA 2XAHA 2YPRA 3EDPA 4EJUA 1JHHA 3E97A 1LOTB 2GXGA 1NBWA 5ILUA 1T44A 3FXRA 5LJVA 1XD7A 3EYYA 3GOIA 2DBBA 1IG8A 5EX5A 4B1WB 2A42A 4CBWA 3LA7A 3FZMA 3ZN1A 3FZKA 1K79A 3LA2A 3Q5FA 2UZKA 4QS9A 3OOPA 1R5GA 2FF6A 1Z1DA 1WI9A 5L3DA 2L3DA 2CGPA 1S8NA 1T98A 2F5FA 1ZBSA 5HS7A 3RSEA 4B1UB 2VT2A 1PDNC 2EFQA 3LQQA 2GIVA 3WEEA 3HTVA 3PQKA 4H5TA 3D0SA 3O6WA 1J7KA 4BRKA 3UE5A 3E5XA 1ON1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YS7 A;  2GZW A;  2DI3 A;  1YFH A;  2A5Y B;  2OQG A;  5AQM A;  3KHY A;  3G3Z A;  2YX7 A;  1ZRE A;  4PGG A;  5HVQ C;  2VYP A;  2QEN A;  4A6D A;  3DPT A;  2RDP A;  3GEZ A;  3B73 A;  3KZZ A;  5FLX K;  2D1V A;  4XEI A;  2J5P A;  5AQN A;  2KJB A;  1EV7 A;  2XKO A;  1KXP A;  1CF7 B;  2V1U A;  2G7H A;  1UST A;  1BU6 O;  4MTE A;  1AWC A;  3O1B A;  4TV7 A;  2P9K B;  4EJO A;  4KDP A;  2QQA A;  3HRS A;  4FPA A;  3M1F A;  3ZEU B;  1U6Z A;  3F21 A;  3K0L A;  1S7A A;  1NGE A;  1G3T A;  1P4A A;  2NRA C;  3JSP A;  2XUB A;  5K5O A;  4JD2 B;  4BVP A;  3ZMV A;  2D45 A;  1K7A A;  1ON2 A;  2KJC A;  2V9V A;  3U2R A;  1IF1 A;  4CXF A;  4PL8 A;  1IW7 F;  3OHR A;  2MC3 A;  5AQP A;  4EV0 A;  3LDO A;  1V4S A;  1OYI A;  4BRA A;  2ISY A;  4H0E A;  2AXL A;  1SD4 A;  3I59 A;  4M9Z A;  2P6S A;  3CUQ A;  3K2Z A;  4G6D A;  3FE1 A;  5LRR A;  4GXO A;  4BR5 A;  4CIC A;  4G94 A;  1QQM A;  5JVT A;  2JRT A;  4HF2 A;  3SQN A;  3WE2 A;  3VGM A;  4BRM A;  4KFC A;  2E7W A;  3WTU C;  2ZGZ A;  3QP5 A;  1H1V A;  1HKS A;  1OPC A;  4NHJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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