The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
DRMAAPRAEALFDFTGNSKLELNFKAGDVIFLLSRINKDWLEGTVRGATGIFPLSFVKILKDFPEE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase activator
|
| molecule keywords |
Neutrophil cytosol factor 4
|
| publication title |
Solution structure of SH3 domain of p40phox
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
|
| structure length |
66
|
| sequence length |
66
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2W0Z A; 1NYG A; 3VS5 A; 4JZ3 A; 1W1F A; 1H3H A; 2IIM A; 4DEX A; 3JV3 A; 4J9F A; 2KT1 A; 1UFF A; 2HDA A; 1UEC A; 5FWB A; 2LJ1 A; 4E6R A; 2JMC A; 2L3Q A; 2KRO A; 1I07 A; 1NM7 A; 2DF6 A; 4RUG A; 2KYM A; 2O9S A; 1AWW A; 2RPN A; 1S1N A; 2C0O A; 2NUZ A; 4OMM A; 2RQW A; 2PNI A; 1K0X A; 3UA7 A; 1JU5 C; 1K76 A; 1ZBJ A; 2LCS A; 2YUO A; 1PRM C; 1KIK A; 2HEQ A; 1EFN A; 1IO6 A; 1K1Z A; 2XMF A; 4OML A; 1AWJ A; 1ABO A; 1UUE A; 2AZV A; 1PNJ A; 3H41 A; 2E5K A; 1M3B A; 2DBK A; 1ZSG A; 1SHG A; 3O5Z A; 3VS3 A; 3M0S A; 2BZX A; 2GBQ A; 2B86 A; 1KFZ A; 3SEM A; 1SSH A; 2BZ8 A; 2OI3 A; 3GBQ A; 1I1J A; 1OEB A; 2I0N A; 2DMO A; 1BK2 A; 3THK A; 2CUD A; 1XOV A; 2OAW A; 4LUE A; 1AEY A; 4J9D A; 4IIO A; 2K3B A; 4HCK A; 2DLP A; 3M0T A; 1YCS B; 1GFD A; 2LJ0 A; 1WXU A; 1UJ0 A; 1UHC A; 2DX1 A; 1X27 A; 3REB B; 2C0T A; 1K0S A; 4X1V A; 2YUN A; 2EYZ A; 2D0N A; 1E7O A; 1K4U S; 3RBB B; 2LZ6 B; 2DVJ A; 1NEG A; 4RTU A; 2ECZ A; 4K11 A; 4RTY A; 2DRK A; 2FRY A; 5EC7 A; 2CSI A; 4CC2 A; 1OPL A; 2RQU A; 2D8J A; 2QDL A; 1Z9Z A; 2EYX A; 2DBM A; 2AZS A; 4F14 A; 3M0Q A; 2BZY A; 2RF0 A; 4Y92 A; 2RNA A; 2LQN A; 4J9C A; 2K6D A; 1GCQ C; 2GNC A; 4D8D A; 2HCK A; 5ECA A; 2K79 A; 1PKT A; 1VYV A; 4OMO A; 2D8H A; 2DL4 A; 2KT8 A; 1Z9Q A; 2DL5 A; 1X2Q A; 1UHF A; 2JM9 A; 3H0F A; 1V1C A; 2KBT A; 2FPF A; 4AFS C; 1AZE A; 2CT4 A; 1GBQ A; 1H8K A; 1E6G A; 2DRM A; 1MV3 A; 4HVW A; 3ZL7 C; 2C0I A; 5I11 A; 4RTT A; 2EVR A; 4F17 A; 2EW3 A; 2O9V A; 1M30 A; 2ABL A; 1M27 C; 2RMO A; 1YN8 A; 3M0R A; 4OMN A; 1UGV A; 4HVU A; 3I9Q A; 4AG1 C; 3VS7 A; 2LNH B; 2DA9 A; 4GLM A; 1X2K A; 1G2B A; 4LNP A; 2JXB A; 1PHT A; 2DE0 X; 1A0N B; 4RTW A; 3UA6 A; 2J05 A; 1CSK A; 2F2X A; 2JM8 A; 2A28 A; 4D8K A; 1B07 A; 4J9G A; 1VYU A; 2RQR A; 2J06 A; 2JT4 A; 2G6F X; 3M0U A; 1UJY A; 2CDT A; 3R6N A; 3EG3 A; 4ZNX A; 1W6X A; 3EG0 A; 3VRZ A; 4Z89 A; 1LCK A; 1X6B A; 1YWP A; 4ESR A; 2K2M A; 1RLP C; 1SRL A; 2DM1 A; 4RTZ A; 2EKH A; 3LH5 A; 2H8H A; 1NEB A; 1U5S A; 2CRE A; 1T0J A; 2J6F A; 1BU1 A; 5IH2 A; 3EG1 A; 3EGU A; 1RI9 A; 5L23 A; 1ARK A; 2ED1 A; 3I5R A; 1WDX A; 4AFZ C; 1QWF A; 1OPK A; 4J9H A; 3SHW A; 3NPF A; 1GCP A; 4LE9 A; 2J7I A; 4J9I A; 2JTE A; 1ZLM A; 2KRM A; 2ROL A; 1U3O A; 2CH4 A; 4DEY A; 1PWT A; 3UAT A; 3QWY A; 1NG2 A; 2SRC A; 4IIM A; 4AG2 C; 2KEA A; 4J9B A; 2ESW A; 3VS2 A; 4CC7 A; 1RLQ C; 2SEM A; 1ZUU A; 1OV3 A; 1T3L A; 1KJW A; 4WCI A; 4JJB A; 2K7A A; 2RQT A; 3VRY A; 4JJD A; 1M3C A; 1AWO A; 1ABQ A; 2LQW A; 2DIL A; 5FWC A; 5IHK A; 1NLO C; 3M0P A; 2VVK A; 2LJ3 A; 3KFV A; 2OJ2 A; 1X43 A; 1HSQ A; 5IHI A; 2DL7 A; 2DL8 A; 3REA B; 4Z8A A; 1ZX6 A; 2AK5 A; 1QLY A; 2K9G A; 3UF4 A; 3QWX X; 2W10 A; 1VA7 A; 1SEM A; 1JXM A; 2F2V A; 3VS1 A; 3NGP A; 2EYW A; 2YDL A; 4AFU C; 5IXF A; 2J6K A; 2FRW A; 1CKA A; 1QCF A; 1M3A A; 2HSP A; 4CC3 A; 2M51 A; 2MOX A; 1QKW A; 3C0C A; 5I22 A; 4RTX A; 1BBZ A; 1JO8 A; 2EQI A; 2GQI A; 1WA7 A; 1M8M A; 2AKL A; 1AD5 A; 2A36 A; 1WI7 A; 2KNB B; 1W70 A; 2FO0 A; 3I5S A; 2KRN A; 4JPB W; 1UDL A; 2GTO A; 1AOJ A; 1AVZ C; 2NWM A; 2GGR A; 3TVT A; 1Y0M A; 2FG0 A; 2MCN A; 2A08 A; 4M4Z A; 3A98 A; 2EGC A; 2KE9 A; 2ENM A; 2EPD A; 4A63 B; 2X3X D; 1UTI A; 1WIE A; 2CT3 A; 4Z88 A; 1VYT A; 3FJ5 A; 2ED0 A; 4OMP A; 1FYN A; 1I0C A; 2DNU A; 2O31 A; 3IQL A; 3TSW A; 5HCK A; 4LN2 A; 2JMA A; 1KSW A; 1CKB A; 2L3P A; 4J9E A; 1GRI A; 3H0I A; 2KYB A; 1WYX A; 2YUQ A; 2M0Y A; 1TUC A; 2LMJ A; 4R0K A; 1T3S A; 1HJD A; 1B3Q A; 4HXJ A; 3NMZ C; 1FMK A; 2O2O A; 3EG2 A; 1WXB A; 2P4R A; 2L3S A; 3RNJ A; 2KGT A; 2RN8 A; 2GTJ A; 1PKS A; 2RQV A; 3NHN A; 1TG0 A; 2KXD A; 1WXT A; 4JZ4 A; 3CQT A; 2AKK A; 2J6O A; 1GL5 A; 1YWO A; 2KR3 A; 1WFW A; 2DYB A; 2CUB A; 2MIO A; 2F2W A; 1AWX A; 1E6H A; 3EHQ A; 1GBR A; 1GCQ A; 5GJW B; 1AZG B; 1RUW A; 3TSZ A; 4F16 A; 2L2P A; 4LUD A; 5IHN A; 1UG1 A; 1Y57 A; 2CSQ A; 3EHR A; 4ORZ A; 1JXO A; 3VS0 A; 3U23 A; 1NLP C; 2PTK A; 1JEG A; 2FPE A; 2JW4 A; 4EIK A; 4FSS A; 2HBW A; 1T0H A; 2JS0 A; 1QKX A; 3H0H A; 2L0A A; 2LX7 A; 1K9A A; 1ZUY A; 2V1Q A; 2VWF A; 2V1R A; 1YP5 A; 2YSQ A; 3PVQ A; 4HVV A; 2DJQ A; 1SRM A; 1PRL C; 1SHF A; 2YUP A; 4QT7 A; 2DL3 A; 1WLP B; 4JJC A; 1NYF A; 5GJV B; 1H92 A; 2YT6 A; 4KRT A; 1X6G A; 3PVL A; 1HD3 A; 4RTV A; 1MUZ A; 1YNZ A; 2EBP A; 2LP5 A; 2ROT A; 1SPK A; 1X69 A; 2FPD A; 1N5Z A; 2KXC A; 3VS6 A; 5FW9 A; 1QWE A; 2FEI A; 1G83 A; 1TUD A; 4OMQ A; 1WX6 A; 1JQQ A; 2EYY A; 1MV0 B; 2PZ1 A; 2BTT A; 2JS2 A; 3ULR B; 2EGE A; 1ZUK A; 1UE9 A; 1OOT A; 5IXB A; 3I35 A; 2A37 A; 3VS4 A; 1U06 A; 2X3W D; 4AFQ C; 3PE0 A; 4CC4 B; 1GFC A; 2CH4 W; 4GBQ A; 2KRS A; 2D1X A; 1J3T A; 2O88 A; 2VKN A; 1BB9 A; 2EGA A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DVE A; 1NYG A; 5GMK j; 1RAH B; 3CPW P; 3VS5 A; 4C5I A; 1VQK T; 1W1F A; 1H3H A; 2JZ2 A; 3ZEH A; 2KT1 A; 1UFF A; 4E6R A; 2JMC A; 2L3Q A; 2M16 A; 2KRO A; 1I07 A; 2DF6 A; 2KYM A; 5CO7 A; 4M7A D; 3CMA A; 4PFO A; 1ZSZ B; 5FU6 B; 2ZPI B; 4DBR A; 4F7U B; 3CPW A; 1X75 C; 3L2U A; 3TQ7 P; 1VQN Q; 1AT1 B; 1KIK A; 1Q7Y C; 1HXD A; 2HEQ A; 1IO6 A; 1ACM B; 1VQ5 A; 2XMF A; 3G1J A; 3EGD B; 1PNJ A; 4FU6 A; 1N9S A; 2JN0 A; 1ZSZ C; 3H41 A; 4R55 A; 3G6E Q; 2B8A A; 3JCM J; 5FU6 C; 1I4K 1; 3GP8 A; 3O5Z A; 4BD3 A; 3M0S A; 2P0Q A; 2AT1 B; 1N8R U; 2CP3 A; 2OI3 A; 2BZ8 A; 1YBY A; 2FL7 A; 5GAN 8; 1M2V B; 3J81 E; 2I0N A; 4N0A A; 2QGF B; 3EAE A; 1XOV A; 1Y96 B; 4J9D A; 4M77 F; 1V76 A; 4HCK A; 2O4X A; 3SB2 A; 2DPP B; 2DX1 A; 1WHJ A; 3S3M A; 1X27 A; 5GAN h; 1D1B A; 4X1V A; 4RG2 A; 3G6E T; 3TEE A; 5GAN e; 2D0N A; 1M4Z A; 1K4U S; 2LZ6 B; 1NEG A; 3EFO A; 1K8A R; 4RTY A; 4BUG A; 3OYD A; 1M90 U; 4P5N A; 1VQM A; 4C92 F; 2V8K A; 4F14 A; 5LJ5 j; 2BZY A; 4Y92 A; 3S3O A; 2RNA A; 2CYZ B; 3EGX A; 4J9C A; 2ZAE A; 3FDR A; 4OMO A; 1K73 R; 3FJP A; 3DLM A; 3VUB A; 2A3L A; 1IZ6 A; 1Z9Q A; 2DL5 A; 1X2Q A; 4UC4 A; 1UHF A; 3V7R A; 4BY6 B; 2GCX A; 3HRU A; 2FPF A; 3MEU A; 1BI2 A; 2M1H A; 3ZL7 C; 4LD9 K; 2EVR A; 1OZ3 A; 4PNO A; 2MK5 A; 2RJE A; 4HVU A; 3I9Q A; 1WGS A; 4NOY A; 4M7D E; 4BY6 C; 3ASK A; 1OU9 A; 3OBY A; 4OB3 B; 2J05 A; 2HL3 A; 4Y28 E; 3CCE A; 2F2X A; 1B07 A; 4J9G A; 4MZP A; 3SDZ A; 1VQO A; 4HA8 A; 1Y7X A; 2G6F X; 3M0U A; 3CCV Q; 1EX4 A; 1X6B A; 4ESR A; 2E6Z A; 1SRL A; 3M4G A; 3JCM Q; 2K5L A; 5IAY A; 1RAF B; 1T0J A; 2DK3 A; 2J6F A; 2YRC A; 4M75 G; 5LJ3 f; 3V8K A; 5C0M A; 1ARK A; 3CCQ Q; 4C92 E; 4DBH A; 2HD0 A; 5GMK i; 3JCM e; 4FYV B; 2DJZ A; 2WSF E; 2L5Q A; 3RES A; 5GAO p; 3I55 A; 5DLO A; 1ZLM A; 4XTU A; 4OB0 B; 1U3O A; 3EFR A; 2RB6 A; 1EZZ B; 4DEY A; 1PWT A; 3WXM B; 3QWY A; 4J9B A; 2ESW A; 3CCV T; 1MNE A; 2K3Y A; 4ZTF A; 2G3R A; 4A4H A; 2F5T X; 1ZUU A; 5GAM h; 3OYN A; 5KYW A; 2MPX C; 2K3X A; 1KD1 C; 4NL3 A; 5CQY A; 3KBG A; 3OYI A; 1WZO A; 3CCQ T; 4ANJ A; 1W2B P; 4M7D B; 1JJ2 P; 4BE1 A; 2E3I A; 2DL7 A; 3C95 A; 4Z8A A; 1KC8 U; 2AK5 A; 3OS1 A; 2K9G A; 3AHU A; 3JSC A; 1WQW A; 3QWX X; 1VA7 A; 4M7D C; 2QTX A; 5FU7 B; 4M77 C; 3TCJ A; 3L2W A; 3H8Z A; 3NGP A; 4M78 E; 2YDL A; 1W2B A; 4ELY C; 2AIR B; 3CD6 T; 1M1K U; 1CKA A; 3PNW C; 1QCF A; 4HCC A; 1JJ2 A; 2HSP A; 3MP8 A; 4PLL A; 1VQ4 A; 1YJN Q; 5FRN A; 5I22 A; 1C6V X; 4C92 B; 3GLX A; 1U1S A; 4C8Q F; 2DEQ A; 4EPC A; 1WA7 A; 1ZSZ A; 1M8M A; 4JRK A; 1D1A A; 1AD5 A; 5FU7 C; 3V8J A; 4QVC A; 2RHZ A; 3WVE B; 1QP3 A; 2R58 A; 1BIA A; 1AVZ C; 3DKM A; 1QVP A; 3V7C A; 4IUV A; 2JOY A; 2VXE A; 5KYU B; 4C92 C; 3EGD A; 2A08 A; 4OVA A; 2RK2 A; 5D6W A; 4JJN K; 2ENM A; 3JRZ A; 1WNL A; 5GAO m; 2FZG B; 2X3X D; 1IXD A; 5IT9 E; 2ED0 A; 3SWN B; 2DNU A; 3PIO A; 4OMF B; 3CCJ Q; 2MWP A; 3HKS A; 2KYB A; 5GAO l; 2LMJ A; 1YIT Q; 1Y96 A; 4A4G A; 3EG2 A; 1LPL A; 5HY6 A; 2L3S A; 3SWN C; 2GTJ A; 2RQV A; 3OS0 A; 4XTZ A; 2COW A; 2KXD A; 1WXT A; 2A0F B; 3CQT A; 4JZ4 A; 2EQU A; 3EG9 B; 2R57 A; 3RR6 A; 3LH0 A; 1YI2 A; 1VQ8 Q; 3OQ5 A; 4M78 B; 1IRE B; 1HYO A; 3EFS A; 1AZG B; 2YHT A; 3CCS A; 1NBE B; 2OAU A; 3TSZ A; 2FZC B; 1UGQ B; 1QVG S; 5IHN A; 5KE3 A; 5IN1 A; 1UG1 A; 2CSQ A; 2PU9 B; 1K9M U; 3CCJ T; 4L6V 5; 1YIT T; 3FEO A; 3Q1J A; 4FSS A; 1WPY A; 2HBW A; 4M78 C; 3OYF A; 2JS0 A; 1TSF A; 2WSE E; 3JB9 I; 4BI8 B; 2LX7 A; 1PD0 A; 2KY9 A; 3M58 A; 1K9A A; 2QEX Q; 3CD6 A; 3FB9 A; 4X9D A; 2YSQ A; 3TU4 K; 2YRD A; 4E7J A; 3PVQ A; 2K57 A; 3RIR A; 1PRL C; 1B7T A; 4BI4 A; 2O4X B; 4KUL A; 4M7D D; 1WLP B; 3NTH A; 4JJC A; 5GJV B; 3JCM f; 1H92 A; 4VUB A; 1MUZ A; 3ZFJ A; 2LP5 A; 1I81 A; 1XNI A; 2EQK A; 2FPD A; 3KUF A; 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3PIP A; 3L2Z A; 1M9S A; 2VC8 A; 1K0S A; 2E10 A; 2DD4 A; 1YJ9 T; 3OB9 A; 2D6F A; 3L1A A; 5CKE A; 3VYG A; 2RHY A; 1X6O A; 3E19 A; 4C92 A; 2FRY A; 5EC7 A; 2A7Y A; 4JRQ A; 4EMK B; 4CC2 A; 3PMI A; 1Q86 C; 2EYX A; 2DBM A; 9ATC B; 2K6D A; 1GCQ C; 2GNC A; 4MML A; 3QJ6 A; 4D8D A; 2HCK A; 1PKT A; 4ZN3 A; 2YRV A; 5KYU A; 1VQP T; 2KT8 A; 4NS5 A; 4EMK C; 2JM9 A; 1TH7 A; 1I5O B; 2PUO B; 3QHS A; 5CKD A; 7AT1 B; 2KBT A; 3MEV A; 2KI7 A; 5CK9 A; 4AFS C; 2BIV A; 2QK0 A; 1AZE A; 1M90 R; 3VU3 C; 1M5Q 1; 1RAC B; 2CT4 A; 2DRM A; 3A8G B; 1IB8 A; 2C0I A; 5I11 A; 5KCH A; 4RTT A; 3RKW A; 2C06 A; 1M30 A; 1M27 C; 1PC0 A; 5LJ5 d; 1YN8 A; 3M0R A; 3QJY A; 1UGV A; 4AG1 C; 2HQX A; 1X2K A; 3N5B B; 2X4W A; 4LNP A; 4M75 F; 5LJ3 g; 4OGE A; 4RTW A; 5GAN 6; 4PJO E; 1CSK A; 1A0N B; 4J7F A; 1BI0 A; 2XG8 D; 1WHK A; 2A28 A; 4D8K A; 4FYY B; 3EG9 A; 2JT4 A; 1VOM A; 3RMQ A; 5KCO A; 5J3B A; 4MZM A; 1W6X A; 1LCK A; 1JRI A; 2KAF A; 2K2M A; 2BKD N; 1RLP C; 1LJO A; 2DM1 A; 4M78 A; 4RTZ A; 2CP2 A; 2XKO C; 2GQV A; 3OY9 A; 2DTI A; 5A0L A; 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