The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
GMERGIVQYDFMAESQDELTIKSGDKVYILDDKKSKDWWMCQLVDSGKSGLVPAQFIEPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
Cytoskeleton assembly control protein SLA1
|
| publication title |
Yeast SH3 domain three-dimensional proteome
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5GJV B; 2D8J A; 2MCN A; 4HVW A; 2RNA A; 1YN8 A; 2O9S A; 1MV3 A; 3M0U A; 3O5Z A; 4LN2 A; 1VA7 A; 2LJ3 A; 4QT7 A; 2EYW A; 2RQV A; 1HSQ A; 1UTI A; 1I07 A; 4RTT A; 1X43 A; 3U23 A; 2KT1 A; 2ESW A; 2JMC A; 2DYB A; 2W0Z A; 1SPK A; 1ZUK A; 1FYN A; 1WA7 A; 2PTK A; 4AFS C; 1KFZ A; 1GCQ C; 1MV0 B; 1XOV A; 2FRY A; 2FEI A; 4HXJ A; 4RTY A; 1K0X A; 1WLP B; 2M0Y A; 2KBT A; 1GBQ A; 2CH4 W; 2FPE A; 2O88 A; 1UFF A; 1UUE A; 1RI9 A; 1JXM A; 4AG2 C; 2RQW A; 1NLP C; 2RQU A; 2J6O A; 4ESR A; 3VS1 A; 1SHG A; 2EW3 A; 2KGT A; 2ECZ A; 1OOT A; 3VS5 A; 1BB9 A; 1EFN A; 4J9I A; 2EBP A; 2KRS A; 1M30 A; 1YP5 A; 5IXB A; 2DIL A; 2J7I A; 1X2Q A; 1CKB A; 4JJB A; 4LE9 A; 1K1Z A; 2EVR A; 2CRE A; 2KEA A; 3LH5 A; 1NYG A; 2D0N A; 3VRZ A; 2EGA A; 1M27 C; 2XMF A; 1GRI A; 1AWO A; 2YDL A; 4J9C A; 1JO8 A; 1ABO A; 3RBB B; 5IHN A; 3R6N A; 3EG1 A; 1GL5 A; 2YUQ A; 2ED0 A; 1J3T A; 2ENM A; 2PNI A; 2L0A A; 2DF6 A; 1MUZ A; 2H8H A; 2OJ2 A; 4CC7 A; 1T3L A; 1YWP A; 1K9A A; 2RQR A; 1WXT A; 4D8K A; 1K0S A; 1NYF A; 2V1R A; 2DMO A; 4KRT A; 3M0S A; 4AG1 C; 5IXF A; 2KRM A; 4GBQ A; 1WXB A; 2JM9 A; 2LJ0 A; 1T0J A; 2LJ1 A; 1X69 A; 3M0P A; 2ROL A; 3I5R A; 1CSK A; 2HDA A; 3VRY A; 1W70 A; 4JPB W; 1VYV A; 4X1V A; 1V1C A; 1GBR A; 1Y0M A; 3M0R A; 5EC7 A; 4AFQ C; 2GNC A; 2L3S A; 2K2M A; 1ZUU A; 2DE0 X; 2DL5 A; 2DVJ A; 3TSW A; 2CSQ A; 2CSI A; 1ABQ A; 1TUD A; 1YWO A; 2B86 A; 2F2V A; 2X3W D; 2EYX A; 3VS0 A; 2D1X A; 2KXC A; 2PZ1 A; 1ZBJ A; 1BU1 A; 1RUW A; 4K11 A; 1B3Q A; 3M0Q A; 1M8M A; 1T3S A; 5FWC A; 2FG0 A; 2KRO A; 2GGR A; 1NEG A; 2CT3 A; 2EPD A; 4RTW A; 4GLM A; 1AVZ C; 3NHN A; 1U5S A; 1QKW A; 1ZLM A; 1X2K A; 1GFC A; 2AZV A; 5FWB A; 3FJ5 A; 2KE9 A; 3VS2 A; 1KSW A; 4OMO A; 2LX7 A; 1IO6 A; 2O31 A; 4Y92 A; 2YUP A; 2BZ8 A; 2ABL A; 1KIK A; 1UDL A; 4JZ3 A; 3C0C A; 2EYZ A; 2DM1 A; 2E5K A; 4CC4 B; 2FPD A; 1T0H A; 2YT6 A; 4E6R A; 5HCK A; 1TUC A; 2RF0 A; 1AZE A; 1JXO A; 3UA6 A; 3UA7 A; 2A08 A; 1Z9Z A; 3PVL A; 3I5S A; 3I9Q A; 1WXU A; 2KYB A; 2JMA A; 3NGP A; 2DX1 A; 1K4U S; 4LUE A; 2LP5 A; 4J9H A; 2LQN A; 2RMO A; 3VS6 A; 3SHW A; 2A37 A; 4DEX A; 3TVT A; 1OPK A; 1RLP C; 2KXD A; 1BBZ A; 2A28 A; 1AZG B; 2ED1 A; 2BZY A; 3M0T A; 2AKK A; 1VYU A; 2VKN A; 4J9G A; 2ROT A; 2LNH B; 2NUZ A; 2OAW A; 1UEC A; 4OMP A; 1X6B A; 1AWJ A; 2JXB A; 2YUO A; 1NG2 A; 4M4Z A; 4OMN A; 1U3O A; 4F14 A; 1OPL A; 1UHF A; 4Z8A A; 1NLO C; 1E7O A; 4OMQ A; 1NEB A; 1M3A A; 2DL7 A; 4JZ4 A; 4HVV A; 1AOJ A; 2DJQ A; 1X27 A; 2CH4 A; 3H0H A; 1UJY A; 1WIE A; 1UG1 A; 1PKS A; 1K76 A; 2RQT A; 1ZUY A; 2JM8 A; 2I0N A; 1GCP A; 1M3B A; 2FO0 A; 2C0O A; 3IQL A; 1TG0 A; 1Z9Q A; 2EGE A; 4RTV A; 1GFD A; 1ZSG A; 2X3X D; 4DEY A; 2SEM A; 3KFV A; 2LCS A; 2K3B A; 2J06 A; 4OMM A; 1LCK A; 3VS4 A; 2YUN A; 1WFW A; 3REA B; 2FPF A; 1A0N B; 1WYX A; 2MOX A; 2J6K A; 1HJD A; 1UHC A; 1AWX A; 2KYM A; 2VWF A; 1GCQ A; 2BZX A; 1NM7 A; 1YNZ A; 2QDL A; 1M3C A; 3H0I A; 1YCS B; 4A63 B; 1H8K A; 4F16 A; 2LZ6 B; 2GTJ A; 2MIO A; 1SHF A; 1QLY A; 1X6G A; 1OEB A; 1SRL A; 3UF4 A; 1WI7 A; 5FW9 A; 1U06 A; 2DL3 A; 1ZX6 A; 2GQI A; 2EQI A; 2CUD A; 4AFU C; 2EKH A; 2V1Q A; 2C0I A; 2P4R A; 4HCK A; 2C0T A; 5IHK A; 2HEQ A; 2M51 A; 3EG3 A; 2BTT A; 4IIM A; 1G2B A; 2SRC A; 2F2X A; 2JW4 A; 2JT4 A; 2K9G A; 4FSS A; 1PRM C; 2G6F X; 3SEM A; 3PVQ A; 2K7A A; 1E6H A; 2DNU A; 2F2W A; 1PHT A; 1S1N A; 4R0K A; 2DBK A; 3EG2 A; 3I35 A; 1HD3 A; 1JU5 C; 2AK5 A; 2CT4 A; 1VYT A; 4LNP A; 4J9D A; 2DLP A; 4RTU A; 2AZS A; 4ZNX A; 1PNJ A; 1PKT A; 4OML A; 3PE0 A; 1FMK A; 1RLQ C; 1UE9 A; 3REB B; 4RUG A; 1QCF A; 1W6X A; 3H0F A; 1WDX A; 2J05 A; 5I11 A; 3EGU A; 2HSP A; 2O9V A; 2RPN A; 3EHQ A; 2DRK A; 1PRL C; 4CC2 A; 1SEM A; 3THK A; 1W1F A; 1H3H A; 2J6F A; 2LQW A; 5GJW B; 3EHR A; 2K79 A; 1ARK A; 1WX6 A; 4D8D A; 1I0C A; 3GBQ A; 5L23 A; 3QWX X; 2KNB B; 2DRM A; 1BK2 A; 2A36 A; 2D8H A; 4ORZ A; 2GBQ A; 3JV3 A; 4EIK A; 1UJ0 A; 2KR3 A; 1JQQ A; 2CDT A; 1QKX A; 2VVK A; 2OI3 A; 4AFZ C; 1G83 A; 1N5Z A; 1SSH A; 5I22 A; 2HCK A; 2L3Q A; 4J9E A; 2LMJ A; 1PWT A; 2W10 A; 3H41 A; 1AEY A; 2FRW A; 5IHI A; 3RNJ A; 3QWY A; 1H92 A; 2DA9 A; 1SRM A; 4J9B A; 1UGV A; 3A98 A; 1QWE A; 2DBM A; 5ECA A; 4J9F A; 3EG0 A; 2L3P A; 2YSQ A; 2HBW A; 3VS3 A; 2EYY A; 3UAT A; 4F17 A; 1E6G A; 1I1J A; 2DL4 A; 2L2P A; 1JEG A; 1KJW A; 4JJD A; 4LUD A; 4CC3 A; 3CQT A; 2AKL A; 4RTZ A; 3ZL7 C; 1AD5 A; 2O2O A; 3TSZ A; 1B07 A; 2GTO A; 2K6D A; 2JTE A; 2RN8 A; 4WCI A; 4HVU A; 2EGC A; 4JJC A; 2CUB A; 2JS2 A; 2JS0 A; 2KT8 A; 1Y57 A; 2DL8 A; 2NWM A; 3VS7 A; 1OV3 A; 3ULR B; 1CKA A; 1QWF A; 3NMZ C; 2KRN A; 4IIO A; 2IIM A; 4Z89 A; 1AWW A; 5IH2 A; 4Z88 A; 3NPF A; 4RTX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KQW A; 2MK5 A; 3CCS T; 5GJV B; 4WTO B; 3JB9 I; 1WHK A; 1YN8 A; 1MNE A; 1WJR A; 4LN2 A; 4QT7 A; 5A0G A; 2EYW A; 1SG5 A; 1M1F A; 3UDC A; 3CME T; 5GMK e; 4RTT A; 5DY9 A; 2CYZ B; 1W2B S; 2MF2 A; 3A8L B; 4EMK B; 3TCJ A; 2MMP A; 3D7S B; 2DEU A; 1NBE B; 1PG5 B; 3CMA T; 3OB9 A; 3CPW S; 2EAY A; 1ZUK A; 2I2L A; 4AFS C; 1GXI E; 5GAM f; 3HHT B; 4N0A C; 3RMS A; 2X51 A; 4PJO F; 1VQ9 Q; 2KI7 A; 4LDY A; 2KBT A; 2O88 A; 3QYG B; 1UFF A; 5FU6 B; 4O5V A; 4AG2 C; 3CCR A; 2KAF A; 2WSF E; 5GAN 8; 1SHG A; 2L89 A; 4MZP A; 1YIJ T; 3FIF A; 1EFN A; 3FDR A; 4F7U E; 1JJ2 P; 3S3N A; 2J7I A; 1WZO A; 3E2U A; 3CCR Q; 1K1Z A; 1NPR A; 2VAS A; 1NYG A; 4EDU A; 3M55 A; 2NUT A; 1KQS P; 1GRI A; 1M90 R; 4MML A; 1I8F A; 1YJW A; 3JCM f; 1ABO A; 2DD4 A; 3LGF A; 2IPO B; 3R6N A; 4RG2 A; 1GL5 A; 2YUQ A; 2HQH A; 1H64 1; 2DO3 A; 1PCX A; 2PNI A; 1YJW Q; 4M7D E; 3BDL A; 5GAN 6; 1DJ7 B; 3GP8 A; 2OTL T; 3HSB A; 3CBM A; 5HK0 A; 1ZSZ B; 1NYF A; 4PJJ A; 3S3O A; 4XTX A; 1UB4 A; 1Q7Y U; 2CS7 A; 3S6W A; 2EJF A; 5D7U A; 2LJ0 A; 4XTZ A; 5LJ3 e; 5GAO p; 2AHJ B; 3NTI A; 2LJ1 A; 3G7Z A; 2P4T A; 3M0P A; 2ROL A; 4KGZ B; 1CSK A; 4JPB W; 4EMG A; 4A4E A; 4X1V A; 1Y0M A; 5KE2 A; 1WHG A; 3OMC A; 3QJ6 A; 1WJS A; 2K2M A; 4ZTJ A; 3V7R A; 1ZUU A; 3DB4 A; 2DVJ A; 1YFN A; 3QO3 A; 4PFP A; 2F2V A; 4X34 A; 3VV0 A; 2DTO A; 4A4H A; 1K8A U; 5CQX A; 2EYX A; 3VS0 A; 1R0B G; 4B6M A; 1BU1 A; 1B3Q A; 3M0Q A; 5KYY B; 3PIP A; 1YI2 A; 2HD0 A; 2LT4 A; 1JB0 E; 2EPD A; 3QDF A; 5GAN d; 4RTW A; 4LD9 K; 4O6J A; 2AZV A; 1PSE A; 3FJ5 A; 1KSW A; 5GAN g; 4OMO A; 2LX7 A; 1IO6 A; 5I21 A; 1VQO Q; 1NJI R; 1M2V B; 4Y92 A; 2YUP A; 2BZ8 A; 3F70 A; 1KIK A; 5GAO l; 2JUF A; 3C0C A; 4KUL A; 4LD6 A; 1OX8 A; 2E5K A; 4M75 E; 1V76 A; 2FPD A; 1T0H A; 2DD5 A; 4XAX B; 2ZPB B; 1VIF A; 5LJ5 e; 2ZCF B; 1JXO A; 3UA6 A; 5HKC A; 3UA7 A; 1Z9Z A; 2HL3 A; 4TVR A; 2YRV A; 3I9Q A; 3NGP A; 2M16 A; 2LQN A; 2X4W A; 3I56 A; 3QHS A; 2QEX T; 3CC2 A; 2A28 A; 3CBP A; 2ED1 A; 4C92 E; 2CZ6 B; 2WSC E; 2CP6 A; 2VKN A; 4CI0 C; 3I56 Q; 1AHJ B; 4E7J A; 2RI5 A; 2XHC A; 3OYY A; 2OAW A; 3CC2 Q; 2JXB A; 2ZZD A; 2ZPE B; 4EMH A; 4M77 E; 1U3O A; 3HP9 A; 4Z8A A; 1NLO C; 4Z02 A; 1BI0 A; 3M58 A; 4DBF A; 2DK3 A; 1NEB A; 2DJQ A; 1TSF A; 2RJE A; 1WIE A; 3PFS A; 2KMT A; 4OB3 B; 1WHM A; 1TG0 A; 4FYV B; 2E3H A; 2EGE A; 3C94 A; 4J6W A; 3VYG A; 2LNV A; 1S72 Q; 4OMM A; 4AT1 B; 1IGU A; 4A53 A; 3LWI A; 2OTJ Q; 2KSS A; 3QZ9 B; 1WYX A; 2MOX A; 1C6V X; 1UHC A; 4C8Q E; 2CZ1 B; 1GCQ A; 2QDL A; 3H0I A; 2JVV A; 4XQ3 A; 3PIO A; 3JB9 F; 4BE0 A; 1QCN A; 1X6G A; 5IN1 A; 3QG1 A; 2D0Q B; 3JCM J; 1WI7 A; 5FW9 A; 1JRI A; 1U06 A; 2DL3 A; 3X26 B; 3CXC P; 3MET A; 1VQP T; 2C0I A; 4R56 A; 2P4R A; 4QQG A; 3V8L A; 5IAY A; 1VQM Q; 5GAM g; 3JCM V; 2M51 A; 3EG3 A; 1OI1 A; 2BTT A; 4IIM A; 2SRC A; 2F2X A; 2NYS A; 4JRQ A; 4M7D D; 5KYY A; 4FSS A; 1PRM C; 2QI2 A; 1P92 A; 1PHT A; 2HL5 C; 2EQK A; 5KYW A; 3CCV A; 2PUO B; 3L2V A; 2VXE A; 2CT4 A; 1JBM A; 1VQK T; 1V29 B; 4OML A; 3CCV Q; 1VQ5 A; 3PE0 A; 4FU6 A; 1KC8 C; 1FMK A; 3OBY A; 2DYI A; 3REB B; 4RUG A; 1QCF A; 4A4F A; 1XJW B; 1M2O A; 4B9W A; 1K73 C; 3EGU A; 4KBM B; 1PSF A; 2HSP A; 2ZGW A; 4KH0 B; 3M4G A; 3CCU A; 4M78 D; 2DRK A; 3JCM g; 3EAE A; 1SEM A; 3X25 B; 3EHR A; 1K9M C; 3Q1J A; 1VQN A; 1ARK A; 1X75 C; 4RCC A; 1Y07 A; 4PJM A; 2DZ9 A; 5L8R E; 4ORZ A; 3V7C A; 1HYO A; 4HKE A; 4J83 A; 1UJ0 A; 1YJ9 T; 2KR3 A; 1JQQ A; 2DER A; 4AFZ C; 5FRN A; 2RHU A; 2BE7 D; 1WQ7 A; 2LQ8 A; 1Q7Y R; 4PLL A; 3KXT A; 2DIQ A; 1VQ7 A; 1AEY A; 3QWY A; 4JS5 A; 4J9B A; 2B8A A; 4FT4 A; 4M75 B; 3G71 A; 3EG0 A; 2DEQ A; 2YSQ A; 2YRD A; 2COW A; 4F17 A; 1VQ7 Q; 2CP0 A; 2EKO A; 1N8R U; 1BKB A; 2RJF A; 4HT9 A; 4LUD A; 4RTZ A; 4HT8 A; 1K8A R; 3TSZ A; 5GMK j; 2GTO A; 4FYW B; 2K6D A; 2VC8 A; 2IG0 A; 3FJP A; 3CCJ A; 1YHQ A; 4PFZ A; 4JRP A; 4FW1 A; 4C92 B; 2CUB A; 3SB2 A; 1RAD B; 2JS0 A; 3CCQ A; 5D6W A; 3OYK A; 2RK2 A; 4XTY A; 5A0L A; 4F7U A; 1QP3 A; 4DOW A; 2X4Y A; 1QVF S; 2HSE B; 2GQV A; 5GAN h; 3DLL A; 3I55 A; 1I5O B; 1QWF A; 4M77 B; 3CCQ Q; 1AWW A; 5IH2 A; 4DA4 A; 3GNF B; 3RKW A; 3G6E A; 5DLQ E; 4DBR A; 1M90 C; 3RMQ A; 5GAO r; 2D8J A; 2MCN A; 3I55 Q; 2IVW A; 4HVW A; 3L42 A; 2O9S A; 2HZY A; 2RI2 A; 2R5M A; 1D09 B; 2EJG A; 3PGG A; 2QYZ A; 3G6E Q; 1Q86 C; 2L8D A; 4X9C A; 3CCR T; 2E64 A; 2EQM A; 3H9N A; 3MP6 A; 1UTI A; 1X43 A; 4M7D A; 1LOJ A; 4E7L A; 4BB7 A; 2X35 A; 2QA4 Q; 2R5A A; 2KT1 A; 3OW2 A; 2JMC A; 3QJY A; 4QQ6 A; 2DYB A; 4C5G A; 4C8Q B; 1QVG A; 5GAN 4; 3L2Q A; 2PTK A; 4N4H A; 1GCQ C; 1XOV A; 2JZ2 A; 1WLP B; 1N27 A; 2EYQ A; 2M0Y A; 3EGX B; 1MND A; 8AT1 B; 1GBQ A; 3WVD B; 1RI9 A; 1YJW T; 2RQW A; 1FMV A; 1BIA A; 2PVD B; 3HKS A; 3T9N A; 4ESR A; 3VS1 A; 2RJC A; 2O4X A; 3HFN A; 1VQ4 A; 4HCB A; 2ECZ A; 1D1C A; 3VS5 A; 3MP8 A; 4J9I A; 3M53 A; 2QGF B; 4M78 A; 1YP5 A; 1MMA A; 2DXU A; 2Y4Y A; 1CKB A; 1D1B A; 2EVR A; 1N9R A; 1WNL A; 2KEA A; 4PJO E; 4ATO A; 2LQK A; 3PT9 A; 4JDS A; 3VRZ A; 3E19 A; 1AT1 B; 2YDL A; 1W4S A; 2JJ9 A; 2RHX A; 1NJI C; 1VOM A; 3RBB B; 5FRM A; 3EG1 A; 4QKU A; 8ATC B; 2ENM A; 3UWN A; 3CC7 A; 2L0A A; 3TU4 K; 2DF6 A; 1MUZ A; 2OJ2 A; 5GAO m; 2L5Q A; 1T3L A; 1YWP A; 1K9A A; 1RAE B; 2RQR A; 1WXT A; 2O01 E; 3TEE A; 4M75 G; 3CC7 Q; 3INZ A; 1BI1 A; 4GBQ A; 1YI2 T; 2R58 A; 5GAM h; 1T0J A; 2DXB A; 1X69 A; 5J39 A; 4IUP A; 4UC4 A; 5LJ5 j; 1VYV A; 4RKU E; 3HL8 A; 1GBR A; 2BUD A; 4AFQ C; 2L3S A; 4FCY A; 4QVC A; 1LPL A; 3TSW A; 2CSQ A; 3A8M B; 1TUD A; 1YWO A; 2NUP B; 4C92 G; 5IT9 E; 4A4K A; 4MZT A; 4M77 A; 2KXC A; 4C0D C; 1RAH B; 1ZBJ A; 4KT0 E; 4K11 A; 4OF1 A; 5FWC A; 4IKF A; 2KRO A; 1NEG A; 3A8O B; 4M7A F; 3EG9 A; 2CT3 A; 3NHN A; 5CVI A; 4M77 G; 1X2K A; 2QQB A; 3VS2 A; 2QQ9 A; 2RM4 A; 3PTA A; 3S3M A; 1VQ9 A; 3I56 T; 2O31 A; 1B7T A; 2PU9 B; 3JCM h; 3CC2 T; 1WHL A; 3OYE A; 3SWN A; 3RR6 A; 1QP2 A; 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