1ZBCA

Crystal structure of the porcine signalling protein liganded with the peptide trp-pro-trp (wpw) at 2.3 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGPQRFSKIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGQEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSKTDVGAPVSGPGIPGQFTKEKGILAYYEICDFLQGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords signal processing protein
publication title Crystal Structure of the porcine signalling protein liganded with the peptide Trp-Pro-Trp (WPW) at 2.3 A resolution
rcsb
total genus 120
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1zbcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1zbcA01
5AC4A 1V02E 3OB8A 5BRPA 4OOZA 1HJUA 4JFTA 2VUYA 3VX0A 4PMQA 3AMKA 1KXHA 3SUWA 3AZRA 5CXPA 4M1RA 1IZKA 4WKAA 3WMBA 1G01A 1CLXA 1GQLA 3VIKA 4TVCA 3AS1A 1V0LA 1AMYA 1QI5A 3GBDA 1H3GA 4CVWA 3AMLA 3N04A 4PSRA 1UD8A 4PCTA 1B3YA 4UQ9A 4D6DA 3N1AA 4UFIA 2DGAA 1XYZA 1E5NA 3VIJA 4FMVA 1E1EA 3CHCA 4JZ5A 1BFNA 6CGTA 3F4VA 2WLZA 1TUXA 1RP8A 1HIZA 3RILA 5E6YA 3MUIA 3KZSA 1CXIA 3W28A 1FP9A 1IT0A 1O7AA 4Z2HA 3WH8A 4B9YA 2WSKA 1OD0A 4QLKA 4GXPA 1C7SA 3N9KA 3L4ZA 2HISA 4JHZA 1EDGA 2ZX9A 3VD5A 2YDSA 4XB3A 2CHOA 3CGTA 4JIEA 1EO7A 1JG9A 1B0IA 1W2VA 1EHAA 4YHEA 2ZXBA 1NWTA 4EAMA 5M5DA 4GZEA 3WQVA 4PMOA 1ISXA 1JYXA 1UH4A 2GK1A 4AZGA 1H11A 4UOZA 1G5AA 5A2BA 1SR0A 3RPMA 3DHPA 4D1IA 2FGZA 2D23A 3PZ9A 5JBEA 1C7TA 1LJYA 1Q6DA 1V03A 4OIFA 2ZX5A 1KGWA 1LL7A 4MAZA 4Z2JA 1JI1A 2D24A 5AYIA 3MMWA 3FXYA 4WSJA 1X6NA 5E9AA 3VD9A 3OLIA 2VJXA 1WPCA 4HMCA 1CXEA 1W1YA 3WQWA 1OSEA 1UWQA 3VMOA 1V3HA 2HVMA 3I3EA 3RJXA 4FLQA 2XM2A 4H8HA 4AEEA 3TTQA 4NRRA 3VGGA 2PWHA 1W1PA 4H8VA 4AYSA 4KGLA 2VL4A 4BQ5A 3BAJA 2XG9A 3SUVA 1H0GA 4QCFA 1G1YA 5HPCA 3MU7A 2YKKA 3L4WA 3IJ8A 1ZU8A 2WSPA 1G9HA 3VM7A 2A3EA 2VZSA 5I24A 1E0XA 4UQDA 3RM9A 2PBGA 1E4LA 1DTUA 1E70M 1MW2A 3BAKA 1MQRA 4DM1A 4D6EA 5A69A 1WDQA 2JEQA 3FN9A 3VUPA 2BXZA 4L4OA 1WKYA 5JBDA 1FP8A 1EQPA 3MV11 1KGUA 3AMGA 2WMIB 1JL8A 4TTGA 2XFYA 6TAAA 5A6BD 2EXOA 2UY4A 4IISA 1E4NA 1CENA 3IJ7A 4PMUA 3WFZA 3DYPA 1W2PA 1ESWA 3EMCA 2D20A 3CZKA 2D0FA 4IPNB 5BXRA 2VZUA 5GQBA 3BAWA 3T08A 1TZ7A 3ZM8A 5I2UA 1J0IA 2BY2A 2QV4A 4CCCA 1HXJA 1QPKA 1UR2A 4PBGA 1XGZA 2W92A 3NDYA 1DEDA 2J62A 1E1FA 4J28A 5BYWA 3CZEA 2BFGA 4U5IA 3W4RA 1ITCA 2XGBA 4W5ZA 2VVNA 2JALA 3OLEA 4F8XA 1QBBA 3S2CA 1OGBA 1BSIA 1EO5A 4JL1A 3G6LA 4EE9A 1DWJM 4W85A 3N15A 1W3KA 3AMCA 1US2A 1J0KA 1HF6A 1KCKA 2NW0A 3PZTA 5CG0A 2J47A 4LYPA 7CGTA 2O9TA 2V3EA 4J27A 1BG4A 1SFSA 4DM2A 1DHKA 4MNMA 1JXJA 3ZQ9A 1EOMA 3SCQA 4HA4A 2CBVA 3ARSA 1V0NA 5I0DA 2E8YA 3BH4A 1UHVA 4MNKA 3EDKA 1ZB5A 4J3TA 2YJQA 3VIIA 1QW8A 5AY7A 3BCDA 3VOCA 4HU8A 3B9DA 4GI8A 2G41A 1B30A 5D9PA 5ABHA 5CPTA 4J3SA 1VEOA 4E2OA 2EPMX 3NYDA 3GH5A 3CBWA 4HMEA 2FHFA 4P7QA 2FH6A 2E9MA 2W66A 2OSXA 4TVUA 3T0DA 4ZXLA 2BY3A 3T0BA 4HA3A 3QR3A 2DEPA 3PTQA 3CUFA 3PTKA 3L2MA 1M01A 2CKSA 3AICA 3D3AA 1Q6EA 1VBUA 1E6RA 1QHPA 4Q22A 3L4VA 3CZGA 2WHMA 3AXXA 4YHGA 3OA5A 2GVYA 1JYWA 2BY1A 3CUIA 5CPSA 1ZJBA 2CERA 4AZBA 1MXGA 3GH4A 4XV0A 2VOTA 3WQ4A 4F9JA 2XWDA 3GXIA 2V5CA 5FL1A 1XV8A 3J7HA 1K9DA 3DC0A 1HKKA 3DHUA 3ECQA 1B3VA 4JKKA 1Q4NX 3W29A 1CXHA 1WZLA 1C90A 2BNJA 3MO4A 2OWCA 2C7FA 3WD2A 2J8GA 7A3HA 4U5KA 2WVTA 4MNJA 4XUYA 1BTCA 2YL8A 4AISA 3AHVA 3KWXA 5CLWA 4PN2A 4GKLA 4KGJA 3VIPA 4PMYA 2X1IA 3AXIA 3BXWA 3WUEA 1TA3B 1VEPA 5A6AA 3WNKA 3ARRA 3VMNA 3ARTA 4B3KA 2V3DA 2DT3A 3WBAA 1QI4A 1V02A 5C8BB 1C8QA 1BGAA 2WW5A 1H1NA 3PZOA 1UR1A 4YN5A 4ATWA 1BAGA 1DWIM 1NARA 2WZEA 2A3BA 4A4AA 5E6ZA 4DWSD 3ALGA 3L2LA 2WCAA 3RO8A 1E55A 4CU6A 4H7VA 1V6UA 4JFSA 3OZOA 4UFMA 2QHAA 2WMIA 1OGGA 2WVSA 2YA0A 2CPUA 3WQ6A 1C3FA 1J0JA 2CESA 4OKDA 1X1NA 3O6AA 1LLOA 1CDGA 2WMGA 4M80A 2YA2A 2XM1A 3ZR6A 3EBVA 1PIFA 2VZVA 3ZMRA 2ZUWA 3FNDA 1OINA 4KWUA 2WWCA 2JF7A 2GJXB 3CTTA 3EDJA 1W9VA 1I1XA 1UWTA 4M8UA 4AD0A 1QI0A 3RM4A 1UQZA 1CGUA 1EOKA 2GSJA 3CZ8A 2C8NA 4H8UA 5KEZA 1AQMA 1XYFA 4AD4A 5I6SA 4Z2KA 1JZ4A 2BVDA 3WN6A 4AC1X 1B2YA 3VU2A 4MADA 5D8WA 3MMDA 4FLRA 3NDZA 1JFHA 2XFFA 4JAWA 1VFOA 1UQYA 2G3JA 1JXKA 1TCMA 1EGZA 1VJZA 4P7LA 2DSUA 1UKSA 2XVGA 4UFLA 4M82A 4PYSA 1WDPA 1J18A 4TTUA 1JFXA 5DF0A 3OBAA 1E5JA 1WDRA 3VO0A 1VRXA 3PZIA 1HJXA 2G4FA 4HOZA 3ZSTA 3AJ7A 3RJYA 2V5DA 3TTSA 4UQBA 2JFEX 3WSUA 4URIA 5HBFA 1LG2A 3L4XA 1XRVA 1UG6A 4QLJA 1VF8A 3MKKA 3ZJKA 1ODUA 3RM8A 2Q8XA 2WPGA 2J78A 3EDEA 4KRTA 3WUBA 3MUY1 3IANA 3L4YA 1WDSA 4CD5A 3WF4A 3WEMA 4DUXA 4QDMA 1QNSA 3VGBA 1HVQA 4EKJA 1B3ZA 1PX4A 2VQUA 2VZTA 4J3XA 8CGTA 1K6AA 2QF8A 2DH3A 1RH9A 4UCFA 4D6JA 3TA9A 2FDMA 4BS0A 2JIWA 1J0ZA 1GORA 2DQXA 4UQEA 1BGGA 4DUWA 3BAIA 1ISZA 1D7FA 1GUVA 3WH5A 5M3WA 3O2LA 3VMPA 4CU7A 2OWWA 1A3HA 3ALFA 5CLTA 2G3MA 3PZQA 3SCRA 3RDKA 3AS2A 3EMZA 2XTKA 4NSBA 5LA0A 3ARPA 5M03A 1GOWA 4ZXOA 2Y5EA 1QNQA 4UQAA 1W9PA 2E9BA 1HN1A 1E71M 2W5FA 1QW9A 2CCRA 1H2JA 4W8LA 2CXGA 1XSIA 1UKTA 1XD0A 1JNDA 3AIQA 4TVDA 3WF3A 5A6LA 3WBEA 2E40A 1LWJA 3PHAA 4MB3A 1XSJA 3EMQA 4LPCA 1E73M 4FK9A 2VO5A 4HA1A 2EBNA 3VNYA 3WDRA 3MANA 1JIBA 3PZMA 4W87A 3OLDA 1TA3A 1JAKA 1VB9A 2Z1KA 4GPNA 3AHTA 2ZUSA 3CUHA 2G8ZA 3W6MA 1I75A 1QNOA 1WZKA 1TMQA 2OLHA 1XD1A 4PMZA 3VM5A 5DFAA 1FHDA 3OG2A 4MDPA 4OBSA 1GZJA 1V3LA 1B90A 2PBOA 2J7FA 2VX7A 2A3CA 1UZ4A 4PUEA 2ZUUA 1D2KA 5JH8A 5FD0A 3IK2A 2D22A 4HPHA 4GZIA 3MS8A 4KRUA 1HKJA 1B3XA 2J75A 1MW1A 4GINA 1HVXA 5EFDA 1GHRA 1VFMA 1JZ2A 2DSWA 1NOWA 2GJXA 2JEPA 3FHAA 1EDQA 5M17A 5HXMA 3RIKA 2OYMA 4QLLA 3IJ9A 1VAHA 2VX4A 4HPGA 1YHTA 4H41A 2F2HA 1TVNA 2UY3A 3PZNA 1FOBA 1ZBVA 5DT7A 3SUTA 2E8ZA 1MQPA 4JKMA 4OBRA 5I23A 1H0IA 1RD6A 1V3IA 3UERA 5HOSA 1JZ8A 4J7RA 1KBKA 1V0MA 1HJQA 4F66A 1CXKA 4M56A 3ZT6A 2O92A 1US3A 2PF0A 2YDQA 1XCXA 3O9NA 1C93A 1W3JA 1OGSA 1J12A 4D6GA 3WIJA 1XH0A 4W8AA 3W53A 1MXDA 1DWGM 5TD4A 3W38A 3WH9A 1PPIA 2CIPA 3PBGA 1CEOA 2EPLX 4U2ZA 5A6SA 5A2AA 1PZ2A 1CPUA 1G94A 4B16A 4ZENA 2EPOA 2DH2A 3B9EA 1GOOA 4RE4A 2UY2A 3AMDA 2WNWA 1V3JA 2CNCA 1V6WA 1HX0A 3BGAA 5E0FA 2DSVA 4CD7A 4W93A 1QI2A 4LXFA 3BC9A 1ECEA 4EANA 1HKMA 2PC8A 3WENA 3WD1A 1FH8A 3WL1A 3THCA 1ZJAA 4LYQA 2ZUNA 2X05A 4AZ5A 2WMHA 4BF7A 5ABFB 4DWSC 1JYNA 2IUZA 5FCZA 2W4XA 1BVNP 2NSXA 1KWGA 5HNNA 1VFFA 4HP5A 1FA2A 1E6SM 4UR9A 2XSAA 1K9FA 3THDA 2W63A 2CETA 1ZL1A 1GJWA 3E1F1 3FHQA 4JFUA 3WEOA 4CD6A 1JI2A 4WKFA 1TR1A 3AFBA 3BLPX 1CGVA 2WC7A 3PZUA 2OWXA 2D3NA 1UZ1A 2YIHA 5CGMA 1E3XA 2DT0A 2DDXA 3VDCA 2O9RA 4TOQA 4D72A 1ZBWA 3N11A 1R7AA 3RCNA 3QGVA 1Y7VA 2B31A 4Y7EA 1HJWA 2J4GA 1XH2A 1D3CA 1MFVA 3ZJ8A 4AIEA 4AXNA 1B1YA 3IAPA 4CU8A 2EO7A 2ZUTA 5DEZA 3T0AA 5JIPA 3T09A 2EPKX 2YA1A 1KGXA 3KE0A 3QOKA 2OSWA 2MANA 2O9OA 3WNNA 1GVYA 1N82A 3K4AA 3W26A 4IPLA 5D8ZA 2ZXDA 2FHCA 1UWSA 1VIWA 3AIRA 4BA0A 3VTRA 3GYCA 1UA7A 2FGLA 3TTYA 4CVUA 1V3KA 5A8NA 1S46A 4B9ZA 3WUFA 3ARZA 4Z2LA 2YL6A 4W7VA 4ZEPA 2WHJA 4AZHA 1GQJA 3WDJA 4U3AA 4UFJA 3VGDA 2YBTA 5JUVA 3MMUA 1W9DM 2WLYA 1WO2A 5GNZA 1UD5A 3GNPA 3ARVA 1NM9A 1JAEA 4ZFMA 3KL5A 1OBAA 3QHMA 5ABEA 4ZE5A 1BYDA 5A6KA 4ML4A 2WWDA 3VGHA 4JFVA 1JZ5A 1V6VA 2GDVA 1E56A 1C91A 2QMJA 3AYRA 1GNXA 1UUQA 1GOMA 3ZO9A 4MTVA 1JZ7A 3WF0A 1HKIA 1IV8A 5A95A 1DWHM 4PSPA 4B15A 4MAVA 3GBEA 1UKPA 3ARWA 4NF7A 5GNXA 3NSMA 3ZR5A 2DSZA 3AS3A 1UWUA 2ZUVA 2AOSA 1EDTA 2WB5A 4S3JA 4J3VA 4AEFA 3AZSA 4HTYA 3SCPA 3U5UA 1KR0A 4V2XA 1EXPA 2X2YA 2WK2A 1LF1A 3MUZ1 4RL3A 2YDRA 4WK9A 2YLLA 2CEQA 1H5VA 5GNYA 4YPJA 1QVBA 1HP4A 2WMJA 1CXFA 3LPPA 2X09A 2WCSA 2Y24A 2XJ7A 4UZUA 2DPEA 1NP2A 1Z32X 4UNIA 5A94A 4PTMA 1F4AA 4EK7A 3WY1A 4TXEA 1W9XA 4GI6A 1TE1A 5I79A 3SCWA 3N13A 2BVTA 3LPFA 3L4UA 4V27A 5LA1A 3DYOA 1K9TA 1UYQA 4RE2A 1JYVA 1W3LA 2WANA 3VGEA 1FFRA 3VD7A 1ISWA 2VCAA 3K4DA 1U30A 3W25A 4M29A 2J7CA 4JCLA 4KMQA 2W62A 2CYGA 4AD3A 5FKYA 5ABFA 1M04A 4WSKA 1J0YA 3CH9A 3A4AA 5LYRA 4E4PA 5BCAA 2X0HA 1DWFM 3AYSA 1BF2A 2ZOXA 2VRKA 3A47A 2X0YA 3QHOA 1L0PA 4M81A 4H04A 1KXVA 1OT1A 2YL5A 4AIOA 3PZGA 3GZAA 1NH6A 2XFRA 2PWFA 2ZUMA 4UQCA 4P7NA 2VZOA 3QOMA 4E8DA 1UR9A 3BAXA 4UFKA 5ECUA 2J7BA 3WH7A 5I5RA 3ARQA 4NI3A 1GJUA 4W86A 1XHGA 5EB8A 2XIIA 2DIEA 5BRQA 4MNLA 1E0WA 4CN6A 1WAWA 2CBIA 4JCMA 3GXMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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