1ZL1A

Crystal structure of the complex of signalling protein from sheep (sps-40) with a designed peptide trp-his-trp reveals significance of asn79 and trp191 in the complex formation
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPKLKTLLSVGGWNFGPERFSAIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFAGNEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGRSFTLASSKTDVGAPVSGPGVPGRFTKEKGILAYYEICDFLHGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLAEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Chitinase-3 like protein 1
publication title Crystal structure of the complex of signalling protein from sheep (SPS-40) with a designed peptide Trp-His-Trp reveals significance of Asn79 and Trp191 in the complex formation
rcsb
total genus 115
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1zl1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1zl1A01
3PHAA 4J3SA 4GO9A 4W86A 1ZBVA 2F61A 5D8ZA 3AIQA 1GHSA 5IFPA 1JF6A 5A3HA 1D2KA 4Z2LA 3ZQ9A 3OLDA 1JZ8A 2GSJA 4KMQA 3WQVA 4B3LA 3FXYA 2W4XA 2ZWZA 5A1AA 3VIHA 3W37A 4PMOA 3RO8A 5A8QA 3POHA 2XVLA 2G4FA 2Y8KA 2QLYA 4B15A 1YHTA 2Y2WA 4PTXA 2BXYA 3T2PA 1TA3B 3ZR6A 3ZSSA 1JAKA 1QNSA 1MVYA 5AYBA 3WDIA 2GK1A 3WH6A 1KBBA 4AZBA 5A6MA 3G6LA 3OG2A 4IUGA 1GOMA 4ACYA 1CLVA 4NSBA 4DWSC 2J8FA 1ZJAA 4H8HA 1UH3A 4Q22A 3N12A 1J0ZA 5CLWA 2G41A 1JNDA 1UKSA 3AFBA 3CTTA 2IUZA 7TAAA 3OA5A 4WKHA 3WNOA 1R7AA 1ZBCA 1E70M 2VRKA 3ZMRA 1E6QM 3SCTA 3GDBA 1JG9A 2PWGA 1UQZA 4CCCA 1HVXA 3IJ9A 1OB0A 1UR2A 1KQYA 2D24A 3TTOA 3AHYA 5C70A 1CGUA 2E9BA 5BROA 3UERA 1PPIA 1WE5A 2ZUVA 5A8MA 1BSIA 2J4GA 1UZ4A 3I3DA 3S2CA 2DT3A 1HP4A 4JHOA 2WHMA 1US3A 3SCOA 5D9MA 2FHFA 1WKYA 2PWHA 4P7NA 4NRSA 2YBTA 2J7FA 2WHJA 3ZT7A 2OLHA 3GBEA 4C7GA 4AYSA 1JF5A 3NSMA 2VZVA 2VMFA 1KFWA 3F5LA 4GZJA 1V0NA 3CUFA 1PAMA 1MW1A 2FH6A 4AD4A 3WMCA 1BGAA 2BY0A 1VAHA 1OWQA 3B9DA 4GQQA 3FY1A 4WSJA 1WDSA 2W67A 1M04A 2XHYA 1OT2A 3ALFA 2XVPA 3JUGA 1QVBA 2D0FA 1CGYA 4MAVA 2VVNA 3AIWA 2BVTA 4RE4A 4U3AA 1MFUA 3SCUA 4D1JA 1IZJA 1QNQA 1CXIA 4AZ6A 4LPCA 1V03A 2DSUA 1UR4A 3SUUA 4KRTA 1J0YA 3NJ3A 3EMZA 4W7WA 3GYCA 1UWIA 4W84A 1H0GA 1I1XA 1UA3A 3WUFA 1JI1A 5A2BA 3ZJ8A 3RIKA 3VTRA 1W3LA 2W61A 2GJRA 3AMGA 1KXQA 4ACZB 4OJYA 2DH3A 4WKAA 4JKLA 1LL7A 2ZUWA 4UFKA 3WUBA 5D9OA 1VEPA 3AHXA 4B16A 1B31A 1EDQA 3CO4A 2FH8A 1VF8A 1GZJA 1AQHA 1MWOA 4DWSD 2O9PA 2WMJA 3I3BA 2CERA 3AS1A 3SCRA 2WVVA 1E56A 4J3UA 2CKSA 2VUYA 3NDZA 5DF0A 1RP8A 3BXWA 3W26A 1K9TA 3MSGA 2Y24A 4CCDA 3GNRA 2QV4A 2D2OA 4TX8A 3M07A 1JIBA 2OYLA 4M82A 3WEZA 2OYMA 3W0KA 9CGTA 3ZSTA 4AZCA 3BMWA 1E4NA 2QPUA 3CUIA 2J7EA 2WNWA 1A47A 2WSKA 4M56A 3DC0A 4FK9A 2WZEA 3W82A 2BHUA 1LWJA 1QI5A 2WWCA 5AY7A 4AZGA 4J3VA 2DSWA 3CPUA 5DT7A 3ZJ7A 4W7VA 1JXJA 1HNYA 2PBGA 3LMYA 4JFTA 2E0PA 1V6XA 1EDTA 2YLAA 2WC4A 3T0DA 4PBGA 1EA9C 3II1A 3VINA 4OOUA 2BHYA 2BXZA 2CEQA 1E6ZA 2XG9A 4JFWA 4ZE5A 2E40A 5A6BD 1V0KA 1UG6A 2WHLA 1VFMA 3GH7A 1DWHM 3A6OA 1UWUA 5BXRA 3WEMA 1FP8A 1JFXA 5A2CA 7A3HA 4CVUA 3SUVA 1BPLB 2DH2A 1JAEA 3UETA 1V3HA 3PZOA 4LYQA 1CNVA 3D3AA 4GXPA 1ISZA 3CZJA 4URIA 1TA3A 4BZYA 3VIJA 1H0IA 3EDKA 3APGA 1XV8A 4C7DA 2O9RA 1PIGA 2JEQA 1U2YA 2WC7A 2VR4A 4LGXA 4M8UA 5I2UA 1XRVA 3MSDA 3GH5A 2WVUA 5HDRA 2QPSA 1ISXA 4AD3A 4JZ5A 1H11A 2V3GA 2GVYA 5HNNA 3L4TA 3AS3A 5HOSA 2YIHA 2CCRA 2DT0A 1PX3A 2YA0A 3RMEA 3OB8A 4WF7A 1LL4A 2PWDA 4NF7A 5DMYA 5ABGA 1CTNA 4AZ7A 4W7UA 2CHOA 4U5KA 5D9NA 5E0CA 1B3ZA 5JIPA 1DP0A 1WP6A 1PZ3A 1Q6FA 1QI3A 4GINA 2YL6A 2ZXAA 4ZE4A 2VVSA 1VFFA 3W38A 2OWWA 1LLOA 1FH8A 1CGWA 1Q6CA 4PUEA 3L4ZA 1KR0A 1UR0A 1OINA 4UFJA 4CD5A 3W6MA 2PWEA 3AXIA 1CDGA 4OZOA 4LX4A 4P8UA 3PTKA 1ISVA 5JIWA 1E9LA 4Z2KA 3PTMA 2FGLA 2A3BA 1A3HA 2UY5A 4M1RA 2WB5A 2VX5A 1FH9A 2IXUA 1OGGA 2PF0A 5I23A 5EB8A 4YHEA 1VFOA 4F9JA 1ECEA 4CU8A 4CKQA 4N0RA 3CHDA 3AIRA 4XUYA 3WNPA 1UYQA 4DM1A 4AEFA 3W81A 1JZ7A 2YKKA 1UWTA 3VGGA 3ECQA 3EDFA 5BXPA 4UZSA 2VJXA 1K9EA 4DUWA 3TONA 4DUVA 3AHTA 2XIIA 3TTQA 1GOKA 3WF3A 2Y5EA 4EKJA 4D6DA 1W9VA 1JZ4A 3VO0A 4BQ3A 1R7OA 5D4YA 3F4VA 1C92A 4FF5A 1G01A 3AOFA 3OLGA 3O6AA 2E9LA 3T09A 2J62A 2VRJA 3ZIZA 2W92A 4WLCA 3VNZA 2DSZA 1WDQA 1XYZA 3TP4A 1HP5A 1J18A 5BXSA 2EO7A 4CN1A 4PMYA 2B31A 4GIAA 3U5UA 4Z2GA 2ZUNA 1FFQA 1VBRA 4MNLA 1QW8A 1WNOA 2VZUA 1HJQA 1JL8A 4YHGA 2J25A 5A6AA 4JCLA 2E4TA 3VU2A 1ODUA 1D3CA 4AMCA 5DO8A 5I79A 1W9UA 1MW2A 5LA0A 1CWYA 1NOFA 1NWSA 3FNDA 3CZGA 3GH4A 4NI3A 3AICA 5LA1A 5M3WA 1J9YA 4DUXA 4A3HA 4D6CA 1M03A 3K8MA 4NRRA 2DEPA 2ZE0A 1GVIA 1GOOA 2RGLA 1C3FA 4XV0A 1PX8A 5CLTA 5BCAA 3ARZA 3K8LA 5I78A 4U33A 1H1NA 1ITXA 2XPKA 3VDBA 4IPNB 1IV8A 5HBFA 1E1EA 1Q6EA 3MS8A 1RPKA 2NT1A 3W28A 5CSYA 3N9KA 4OKDA 2JF6A 3ARRA 3EYPA 1E0VA 3WL1A 1FA2A 3O2LA 3AZSA 4FLSA 2WMGA 3WQ5A 4UFIA 4CD4A 1NP0A 2VX6A 5E0FA 3EDEA 1CXKA 2WVVB 4AIUA 5EFDA 4AXNA 4D72A 3AXHA 3MUIA 4AZIA 3ZT6A 1XD1A 3NYDA 3WDQA 1V02E 4UNIA 4JFUA 2ZICA 1FH7A 1J01A 4QLKA 3AIEA 1V0LA 2XFYA 4TVUA 4QCFA 3AZRA 3NDYA 2J47A 1B1YA 3CUGA 4Z2HA 1HL8A 2VZSA 4UTFA 4YPJA 1JD9A 4AZCB 1LJYA 5BXTA 4MJ2A 3CHCA 1UWQA 4M80A 3QOMA 3VM5A 2F8QA 1VRXA 4D6EA 1MQQA 1MYRA 3MU7A 3AYRA 3WDPP 1QNPA 4QDMA 5DFAA 4V2XA 1JYXA 2QF8A 1UR9A 1C93A 1UKQA 4FLRA 5A94A 2EJ1A 1B3YA 3AYSA 3AMKA 1QHZA 3VDHA 3HU7A 1R86A 4H8VA 4D6GA 1JZ3A 1E71M 3WDJA 2J7BA 2V5CA 1KBKA 4AWEA 1BYBA 2AAAA 1W3HA 3VNYA 2J7DA 2W63A 4PMNA 3CUJA 1DWIM 3WNKA 4MB4A 3WQ6A 4W5ZA 4PMZA 1JYWA 1MXGA 4D1IA 3RPMA 4RE3A 3RM9A 4W85A 1UH2A 2EBNA 2VR5A 2J7HA 2QMKA 1H2JA 3TTYA 4PEEA 4R5EA 2BNJA 1OBAA 4MNJA 2UY2A 4RL3A 1UKPA 3UR7A 3VUPA 1N82A 1MQRA 4B9YA 3N13A 1HJSA 2WMKA 2E3ZA 1DWGM 4WK9A 1LQ0A 1L8NA 1OSEA 5FIPA 5ABFA 3BAIA 3D5HA 4BQ2A 1B3VA 1FHDA 4XZWA 2BY2A 1HVQA 1CECA 1JXKA 3GXDA 2D3LA 1W32A 3SCWA 2F2HA 4TXEA 4KGJA 1LG2A 2XUCA 3TA9A 3T2OA 1JZ6A 4AISA 1W9XA 4PMUA 1QPKA 1EQCA 1EGZA 1MXDA 2W62A 1B3XA 2CIPA 4FLOA 2W66A 5TD4A 4PCTA 1J0KA 4GPNA 3WF1A 3CZLA 2NSXA 2ZWYA 1CBGA 1EDGA 1Z32X 3F5JA 3POCA 4U2YA 4RE2A 4CU6A 4AD2A 1XSKA 2WLYA 1ZS2A 3CZKA 3FN9A 8A3HA 2Q8XA 1S46A 1BHGA 1B2YA 2J78A 1I75A 2OYKA 3L4YA 3BMVA 5I24A 4HU0A 4J27A 1SYTA 2G3NA 3EBVA 5I77A 3MV11 2D20A 3PZNA 1UA7A 1BG9A 3DYMA 3WUEA 2DSKA 3M7SA 1V3MA 4GKLA 1E5NA 4AEEA 5KEZA 3L2LA 3UG3A 5GPRA 4HMEA 1AMYA 2HISA 2CBVA 5ABEA 2FGZA 3FW6A 3IAQA 1SMDA 3A4XA 1Q4NX 1W2VA 2VO5A 5M5DA 1ZB5A 5A2AA 1CEOA 1V02A 1V3IA 1H41A 3AMLA 4EK7A 2UWFA 5CQ1A 1ZL1A 2YL9A 1GORA 2FDMA 2VURA 4GI6A 1NOUA 1V6WA 3K1DA 4PRWA 3VMNA 6A3HA 1HF6A 1H49A 3KEHA 1V3KA 4A4AA 1BG4A 1E6RA 2J74A 1VB9A 2A3HA 4MDPA 4X0NA 3VIMA 5AYIA 1CGTA 1NARA 1TVNA 2A3EA 2ZXBA 1PZ2A 4Y7EA 3ZOAA 3L4VA 2X09A 2WVSA 3QHNA 3PZTA 1W9DM 1KB3A 1HN1A 3VDAA 1J10A 1CGXA 4J3WA 1GW1A 1JI2A 4HZ8A 1C91A 2AOSA 1DWAM 1BAGA 1B90A 4K68A 1C8QA 3N17A 3CLWA 2BVYA 2J7CA 3O9NA 1HJWA 4KGLA 3MUAA 5IFTA 5HXMA 3ARPA 3WDHA 3AXXA 3AMDA 1EXPA 3U7BA 1BYCA 1CIUA 3ZM8A 5C8BB 5FL0A 1VJSA 3SCSA 2OWXA 2DQXA 3AHZA 2A3CA 1B3WA 3WH5A 4MPKA 3PZVA 1U33A 1M53A 3RM4A 1E43A 5C71A 4CUCA 2WSPA 5BRPA 1HKMA 2EPKX 4CU7A 2DDXA 3UCQA 1BGGA 1EIBA 3W6LA 3KL0A 4CN4A 1HKKA 3TTSA 2CBJA 3NSXA 2E9MA 1CENA 1EO7A 1UKTA 1XC6A 4F66A 2EPLX 1GVYA 4BQ4A 3RJXA 1G0CA 1XYFA 3KL5A 2DT1A 2D3NA 2ZUSA 4H2CA 4ZFMA 1XSJA 2A3AA 2D23A 3SUTA 2E8YA 4AD0A 3G6MA 1FOBA 1UOKA 3WQ4A 3SCQA 3RILA 2GUYA 3RCNA 2WXDM 4TTUA 3VGDA 2PI6A 3A4WA 2G3MA 3VIIA 3VPLA 3CZEA 1GOIA 4M81A 1J12A 1GJUA 2WKGA 3WNMA 1HX0A 1XGZA 1WO2A 4CVWA 2V3FA 2DIJA 3MV01 1F4AA 2PWFA 2TAAA 3WUGA 4H7VA 3L4UA 5JBDA 3VIGA 5KZ6A 4PMVA 1XD0A 3BAXA 4W87A 5DT5A 2J75A 1I1WA 1EOKA 5I5RA 3PZIA 3AIBA 1W3JA 4A3YA 1LL6A 1R85A 2RGMA 1CXLA 5D8WA 1KGUA 2VI0A 1VBUA 5BRQA 4BQ5A 3CH9A 3PZQA 1CXFA 2ZX6A 1DTUA 1IT0A 3WL0A 1H4PA 2PBOA 3N1AA 4HA1A 4P8VA 1X6NA 4PMQA 1V0MA 3ARXA 3L4XA 5AC4A 1R87A 4UOJA 1EHNA 4GI9A 4J3XA 1E55A 5FL1A 1TR1A 3AISA 2D0GA 3ZJ6A 1B9ZA 1JDDA 3GNOA 1KGWA 3AI0A 3VD4A 1HJVA 3W25A 4CD6A 5ABFB 1JGIA 1ISWA 3E1F1 4EE9A 3VIPA 1KXVA 1GUVA 2GJXA 4BA0A 1GQJA 1ODZA 2V3EA 1TZ7A 3QR3A 4UQEA 2ZX5A 2W91A 5JUVA 3WNNA 1HKJA 3VMPA 1NQ6A 3ARSA 1E1FA 3QOKA 4OOZA 1W2PA 2JALA 1QHPA 4MB1A 3VX0A 3A4AA 1O7AA 4S3KA 3N15A 5A69A 4R27A 1E3XA 4C7FA 3WH8A 1TUXA 4OIFA 4HOWA 4M29A 4F9DA 1SMAA 5A8PA 1C8XA 5CPTA 2WAGA 2O92A 1G5AA 4MAZA 2J77A 2VQUA 3KE0A 1ZU8A 3VX1A 1OGBA 3WFZA 1QBAA 1KXTA 1ISYA 2ZUTA 2ZX8A 4AY1A 3IK2A 4AC1X 2J7GA 5M17A 2X2YA 3W4RA 3U57A 3BH4A 4Z2JA 4S3JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3BAK A;  2WYS A;  1KR1 A;  3WY1 A;  4BS0 A;  3UR8 A;  1E6P A;  1WAW A;  2YJQ A;  4ATL A;  2E8Z A;  1FP9 A;  3VIF A;  1UUQ A;  2BY1 A;  4UOQ A;  1VEO A;  1E3Z A;  2XGI A;  5E9A A;  1KQZ A;  3THC A;  1FHL A;  1LF1 A;  4UFM A;  1E72 M;  3DHU A;  1MW0 A;  1GNX A;  1W91 A;  4QAW A;  1ITC A;  1CGV A;  4UR9 A;  4XX6 A;  4HU8 A;  4PUD A;  1M01 A;  3HJE A;  1JDA A;  3AS2 A;  1NOW A;  4U5I A;  3W24 A;  6TAA A;  4QLJ A;  3SUS A;  4W8B A;  4WSK A;  2CKR A;  1FFR A;  4WIW A;  3WD2 A;  2NW0 A;  4X9Y A;  4UQB A;  1VEN A;  3N11 A;  2DPE A;  5CSU A;  3T2Q A;  1VJZ A;  2V3D A;  3AQU A;  2EPM X;  4JIE A;  4WKF A;  2X0Y A;  1XSI A;  4AIO A;  3ZJK A;  5A6J A;  3L4W A;  1HJU A;  1O6I A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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