The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
54
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structure length |
54
|
Chain Sequence |
SDAVQRAKEVLEEISCYPENNDAKELKRILTQPHFMALLQTHDVVAHEVYSDEA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
LIN-7
|
| publication title |
A General Model for Preferential Hetero-oligomerization of LIN-2/7 Domains: Mechanism Underlying Directed Assembly of Supramolecular Signaling Complexes
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Caenorhabditis elegans
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| total genus |
14
|
| structure length |
54
|
| sequence length |
54
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2005-05-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y76 B; 1Y74 B; 1Y74 A; 1Y76 A; 1ZL8 B; 3B40 A; 1VF6 A; 1RSO B; 1ZL8 A; 1VF6 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4GKJ B; 3ZMZ A; 5KAI Z; 3CX5 F; 4LP8 A; 4UVA A; 3ETG A; 3OEE G; 3WB0 A; 1OJH A; 2QR4 A; 2A06 H; 2QM8 A; 4CH6 A; 4CH3 A; 4RUF A; 2KQX A; 2V4D A; 5J2T B; 1SES A; 1E1R G; 1IBM B; 2ZQM A; 2ZD9 A; 3OE7 G; 3I56 V; 1DTO A; 2UXC B; 3RYF B; 2DQ3 A; 3ABT A; 2PI4 A; 5H9C A; 1Y67 A; 2X7R B; 5IY5 B; 2IH1 C; 4ZKI A; 2DMX A; 1NU1 H; 1GKF A; 4RAI A; 2DYS C; 1R1B A; 1XUQ A; 1OCC C; 3BRC A; 2D3O W; 3ZMV A; 4F6E A; 4WFF A; 1LR1 A; 1Y74 B; 4NVP A; 1V54 C; 3E86 A; 3ETE A; 1Q6U A; 2JGD B; 4H13 B; 5K1X A; 4LH7 A; 4DYL A; 4YJ2 B; 4JI2 B; 4J9Y B; 2YC0 A; 2ZE5 A; 1I5Y A; 5LMU O; 3QO5 A; 1R3K C; 3ZRV A; 1X4T A; 2XUM A; 3CS5 A; 4GX0 A; 4PA6 A; 3T4Z A; 1V55 C; 5DN6 G; 1IVS A; 2XND G; 1K92 A; 3HR0 A; 2Y69 B; 3ZMS A; 4GKJ O; 2LQT A; 4JI3 B; 1O9G A; 2ETN A; 4MVQ A; 3CP1 A; 2ILM A; 4O4I A; 1YJ9 V; 3BPZ A; 1VQP V; 3RGB A; 3FKS G; 5EC2 C; 5BY1 A; 3ZHQ A; 1M57 C; 3IJ4 A; 2QM7 A; 4JZ2 A; 4DV1 O; 3TJT A; 4PA4 A; 4G2K A; 1IBM O; 2ADP A; 1BS3 A; 4DUY B; 4PDV A; 2UXC O; 3Q4H A; 2XT9 A; 4DR2 B; 4FM1 A; 1NT2 B; 5FNV B; 4QPJ A; 1GN3 A; 4TV9 B; 1YSC A; 2XHB A; 2RJZ A; 1N36 O; 1URF A; 3KG2 A; 3TGU H; 1J5E B; 5LXT B; 2X0L A; 1KP2 A; 1KU9 A; 3JCZ A; 3ZRW B; 2WLL A; 4X1Y A; 3L70 H; 3RVZ A; 3STZ C; 2F1M A; 1MOF A; 2WLH A; 1FXK C; 5LGU A; 3SJC C; 3SPH A; 4FK5 C; 1BHB A; 5IE9 A; 2PF4 E; 1S3J A; 2EIM C; 4ZBM A; 5GTH Z; 3JSN A; 2OTJ V; 3WG7 B; 4JI2 O; 3X2Q C; 1SQB H; 2UU9 B; 3T4D A; 4QNH B; 2FL4 A; 1I0H A; 1VF6 A; 1KYO F; 2QTS A; 1SQG A; 4O2B B; 1JJO A; 3CJH A; 5LYJ B; 4I9Q A; 4JI3 O; 2KSD A; 2OYQ A; 4CS2 A; 3R65 A; 2LGW A; 4O4J B; 1SA0 B; 2QKC A; 2X6B A; 2GSM B; 3K9S A; 1IDS A; 1DF4 A; 1QVG U; 1SZX A; 4DR7 B; 1FS0 G; 4DR2 O; 4DV2 O; 2JGU A; 4H33 A; 4Q20 A; 3TK1 A; 3A8T A; 2WA3 A; 3ETD A; 3T1H B; 2XAF A; 1FFX B; 5L3F A; 2IJH A; 2JJ1 G; 3NXS A; 3RVY A; 1TA8 A; 3IGA C; 4I50 B; 3B09 A; 3ABL B; 1QCE A; 2C2A A; 4JAV A; 2QA4 V; 4TV9 A; 1YXB A; 3CB2 A; 4FM2 A; 3OTF A; 5ITZ B; 2IH3 C; 2Z0A A; 2NNU A; 1VIB A; 5EIB C; 1AR1 B; 4I55 B; 1JCH A; 3BAA A; 3CYO A; 1SET A; 3O9O A; 2UU9 O; 3AG2 C; 4RUE A; 2CGN A; 4FMT A; 3JD1 A; 4UCO A; 5EBL C; 5LMN B; 1PL4 A; 2PZS A; 2W0X A; 4LNU B; 4RO2 A; 1TUB B; 2BTQ A; 4MTF A; 1KD1 W; 5CMU A; 4BR6 A; 1G8M A; 2P22 C; 1N32 B; 1YIT V; 2LW7 A; 3H1I H; 2K9P A; 4DR4 B; 2PY5 A; 1Q82 W; 1NS1 A; 4P9P A; 2FML A; 5LBQ A; 4WBN A; 3K04 A; 1RM1 B; 4NXM B; 4DR7 O; 1GM8 A; 1R6T A; 2D2C B; 4B3R B; 3QTC A; 4CH5 A; 1BMF G; 5CA1 B; 1I5X A; 4X89 A; 1QBZ A; 3PJS K; 2R70 A; 5EZY A; 4PDL A; 3T1H O; 1PKX A; 2HVK C; 5CBH A; 4GYC B; 2OTL V; 5IWA O; 1OCO B; 1VQ7 V; 4J10 A; 1JVM A; 1WAZ A; 4TUY B; 3CSX A; 2NN4 A; 3CCL V; 4DR6 O; 5JJN B; 2F93 B; 4ABM A; 1K33 A; 4WFB V; 4WFA V; 5A2Q N; 1FFT B; 1GO3 F; 2P90 A; 5LP6 C; 1ROP A; 4I50 A; 1QLN A; 3DC6 A; 3BEH A; 1TGO A; 1BE3 H; 2JS5 A; 1RSO B; 4MVR A; 1FKA O; 3ZMT A; 4G28 B; 3ASN C; 3JCU Z; 5LMN O; 3DSQ A; 2FYU H; 2HG5 C; 4J80 A; 4ZOL B; 1HR0 O; 1QHT A; 4XDJ A; 1Y4M A; 1N32 O; 4DR4 O; 3E35 A; 3K59 A; 2P67 A; 3H9V A; 1GAX A; 4NXM O; 1ENV A; 3JAW B; 2DWE C; 2JK5 C; 2H94 A; 4X20 B; 3AG3 B; 1XMQ B; 3DXR B; 3AG4 C; 4B3R O; 4GCZ A; 1NKD A; 2QWN B; 1TUB A; 3ABK B; 4ICG A; 2A3Q A; 4B3M B; 1FXV A; 1JA8 A; 4LF4 B; 3BFR A; 2QWO B; 3NR7 A; 1MZF A; 5IYB O; 1V9P A; 1NTK H; 3G6E V; 4JI7 B; 4UCV A; 1KEC A; 3HKE B; 5FPO A; 2XAS A; 1BHA A; 3GWO A; 3ABU A; 4DK1 A; 1PNL A; 3CCS V; 5CN0 A; 4OGQ B; 5LOV B; 4QE9 A; 3RYI B; 2X6C A; 4AHC A; 1ZL8 B; 3CCE V; 2EIL B; 5EK0 A; 1WN7 A; 1W2B U; 4PV1 B; 1YI2 V; 1SF9 A; 3W7S A; 1AI6 A; 3ZCC A; 4X1I B; 1L0L H; 1MMM A; 1D5A A; 2K1E A; 1G6U A; 1G4Y B; 2ZXW B; 3DGE A; 2BCC H; 3ZIA G; 4LF9 B; 4JI6 B; 3SR2 C; 2UUC B; 2ZE6 A; 5BR8 B; 4R50 A; 5C8Y B; 2HLD G; 1KMI Z; 1J95 A; 1VEW A; 4LFB B; 1GK9 A; 3BA9 A; 1MAB G; 4X88 A; 2F23 A; 5EC1 C; 1XMQ O; 3VQV A; 4DRX B; 4KUM A; 5LA6 B; 4ZOL A; 3ZHR A; 3N27 A; 1FYJ A; 4TWK A; 1S5J A; 3FB6 C; 2IW5 A; 4ASU G; 2GV9 A; 4U7O A; 4LF4 O; 1EN5 A; 1M93 A; 1P7B A; 3E8B A; 4GUN A; 4IHJ B; 4FM0 A; 2E75 B; 3VOU A; 4DV4 O; 1JOY A; 1S76 D; 1YDX A; 3VQW A; 4JI7 O; 3LDD A; 4X20 A; 3RFR A; 2QWQ B; 2GDS A; 4B7K A; 3OUS A; 1VAR A; 3F7Y C; 2AHZ A; 1XNQ B; 4MTX A; 3WB1 A; 4PJ0 Z; 3JAK A; 2F4V B; 1N8R W; 1CPY A; 1KBH A; 3UO2 A; 4U7N A; 3SGI A; 3JD0 A; 4FIP C; 1VF6 C; 4PA3 A; 1H38 A; 2CH7 B; 2KB1 A; 5FPR A; 3RYH A; 4L87 A; 1HP8 A; 1JR9 A; 5EBW C; 3D36 A; 3VBB A; 3E89 A; 3QVN A; 1YJN V; 3KCX A; 3P3P A; 2PGG A; 4UCT A; 4MVZ A; 3ZHU A; 1F4N A; 4FLX A; 1XMO B; 2EZO A; 2P5O A; 4DV6 B; 1VQL V; 1YVW A; 3M7M X; 1ZLZ A; 5LOV A; 3CCM V; 3N2G A; 2R9R B; 3BA8 A; 1IXM A; 2DJV A; 2WLN A; 3JAL B; 2FB5 A; 3D3I A; 4JI6 O; 2UUC O; 5BR8 O; 4LF8 B; 2YIB A; 3CCJ V; 1JFF A; 1VQM V; 2UXB B; 2IBZ H; 1P4R A; 1W0K G; 4HZ3 A; 2WLJ A; 4X1I A; 3JAR A; 4P2Z A; 2JJ2 G; 4EFB A; 1R6K A; 2P7T C; 2GTA A; 4EEQ A; 4EB6 A; 3ICX A; 1K4D C; 1DGS A; 5J2U B; 1H8E G; 4RQF A; 3CCR V; 2QWP B; 3OMA B; 2CTQ A; 2RNB A; 5GON B; 5KAF Z; 2ZKO A; 5B3S C; 2WA4 A; 1AJQ A; 4JI5 B; 5JJE B; 2QGN A; 4H0L B; 2YEV A; 4GKK B; 4X1K B; 3AG1 B; 3JD3 A; 3B8N A; 2F4V O; 4JYC A; 1AVM A; 1VP7 A; 2EIN C; 4UUJ C; 5CBG A; 3E8H A; 4UVB A; 1SQX H; 2JDI G; 4D6T H; 4DV3 B; 4FLY A; 4PI0 A; 4O4H A; 5KLV H; 1XMO O; 1KQS U; 4DV6 O; 2HP8 A; 1OHH G; 3RWR D; 3OM3 B; 3JAT A; 5J9P C; 1PP9 H; 3H01 A; 2BOB C; 4GX5 A; 4IIJ A; 5IJ9 B; 4FFB A; 3STL C; 4TV8 B; 4UCR A; 4I4T B; 1NH2 D; 3IC9 A; 1Z5W A; 4ZI7 A; 2UXB O; 2Y4T A; 1RPR A; 1KKD A; 1DLB A; 1ZWI C; 3ABM B; 3D3Q A; 4LR3 A; 2OIE A; 4ZHQ A; 1SKV A; 2B1G A; 5IYZ A; 5KA5 A; 5IYC O; 3K5L A; 1SQV H; 2ARH A; 1R3J C; 3AEI A; 1GN4 A; 2NR5 A; 1ORQ C; 1Y76 B; 1YIJ V; 4R7C A; 5TIS Z; 2RCV A; 5IJ0 A; 3T1C A; 4JI5 O; 2BE3 A; 4I0X B; 1Q43 A; 5EBM C; 3MHH C; 5L3G A; 1R6N A; 4JTC B; 1Q81 W; 4GKK O; 1FD9 A; 2V1D A; 3B77 A; 3N2K B; 1Q6I A; 2AZ2 A; 5E1A C; 5FL7 G; 4B3S B; 3AK2 A; 2DYR C; 3EHB B; 2Z3Y A; 5J2T A; 1GTO A; 4DV3 O; 4JYB A; 3SPJ A; 1IXB A; 3J81 N; 5JVD B; 2OCH A; 4K0K B; 3RYF A; 4LFA B; 1EN6 A; 1GM9 A; 4J9Z B; 5K1P A; 3UT5 B; 2W6J G; 4JTD B; 3OW2 U; 4H44 B; 2E5L B; 1OCZ B; 1QLE C; 1Q8I A; 1WNS A; 4IT5 A; 3H1L H; 1AJN A; 1MSD A; 3B40 A; 3F7V C; 1AJP A; 5CA0 B; 2Q9L A; 1NVP B; 2BOC C; 4DV7 B; 3CC7 V; 4BIO A; 3ZMU A; 2CTW A; 3U11 A; 1M90 W; 2XAH A; 2DYS B; 2ZT9 B; 1YF2 A; 1Y74 A; 2L35 A; 1IZ3 A; 1OCC B; 4CS4 A; 2FKX A; 2Q4P A; 1WPB A; 1MA1 A; 5LHI A; 4LFC B; 5IJ9 A; 4PDR A; 2JGD A; 1W59 A; 4GZR B; 2ZE8 A; 2N05 A; 1FAF A; 2EX3 A; 1V54 B; 1NVP D; 4I4T A; 4YJ2 A; 2ZDI A; 3S3X A; 3CCU V; 5KMG B; 2NLJ C; 3D8C A; 3JD4 A; 1GN6 A; 3BCC H; 1Y66 A; 3CRA A; 3P30 A; 5B1B B; 3T2M A; 4K3A A; 2QM4 A; 2QSA A; 3SYQ A; 4DUY O; 1MNG A; 1WPX A; 3QO8 A; 4RQE A; 5GW7 A; 4FLW A; 1E1Q G; 1L1F A; 2Q7G A; 2IU3 A; 1LNQ A; 4X9Q A; 5KX5 B; 1V55 B; 4MW3 A; 2FTK A; 1J5E O; 1KKC A; 4OPH A; 3ASO C; 4UV9 A; 3E22 B; 4ZIB A; 1F7Y A; 1IBL B; 1Y76 A; 4PDM A; 5IDJ A; 1XL4 A; 5EYP B; 2Q7E A; 2RN9 A; 4YY3 B; 3WFV A; 3A0R A; 2LP7 A; 4K0K O; 4LFA O; 1D2D A; 1OCR C; 5FNV A; 1QU7 A; 3FYE B; 4NTW A; 1M57 B; 3CD6 V; 3RN4 A; 1BQZ A; 1SQP H; 4GX1 A; 4NB5 A; 3LSU A; 4RWU A; 1S0V A; 3N2K A; 2QKA A; 2A7W A; 2E5L O; 2OIG A; 1U97 A; 5LXT A; 3JSL A; 3EFF K; 5JH7 B; 1Z2G A; 2P6J A; 3CPW U; 3ZRW A; 2QEX V; 2GBO A; 4DV7 O; 1EZV H; 4DXW A; 2UUB B; 1H2S B; 2M7W A; 1GN2 A; 5LGT A; 2ZM6 B; 3FAV B; 2QKS A; 4QGP A; 4LFC O; 3K3W A; 2OCC C; 1O9H A; 4UCS A; 5CA0 A; 1FXK B; 4MW8 A; 3FFQ A; 3AG3 C; 4UCU A; 3RT3 C; 5B5E Z; 1K7D A; 4X66 B; 1NBM G; 2KG7 B; 3IC7 A; 2HVJ C; 5KUM A; 2EIM B; 2CAZ C; 2EIK C; 5BZB A; 3ZJZ A; 3X2Q B; 4X65 B; 1UJW B; 4O2B A; 5BMV B; 5LYJ A; 3AG7 A; 1H2G A; 3ZHV A; 2LW1 A; 3L74 H; 4O4J A; 5BXZ A; 3TXQ A; 3HKD B; 3D36 C; 4FPP A; 1SA0 A; 5LL6 Y; 4O2A B; 2ATK C; 3R66 A; 4B7E A; 3B8M A; 3HKC B; 4EKW A; 3CCV V; 1IBL O; 1H2N A; 2GHY A; 3K57 A; 3B4S A; 4J42 A; 4YY3 O; 2YI8 A; 5E79 Z; 1MSW D; 1VMG A; 1NTZ H; 2OWO A; 2VQF B; 3K06 A; 2XAG A; 5KX5 A; 3LSS A; 4AQY B; 2WAM A; 3CRM A; 4FLU A; 4U3F H; 5B1O A; 1FFX A; 3GB7 C; 3O65 A; 2XTA A; 4LF5 B; 5EYP A; 3APO A; 5FLX N; 4OPA A; 1WB7 A; 2B9Z A; 3L75 H; 1XQ8 A; 1LUW A; 1VQ5 V; 2UUB O; 4DV5 B; 4UFZ A; 2JVD A; 1RP3 B; 1Q6H A; 1T5E A; 1S5L Z; 2ZM6 O; 1VQ6 V; 1OZ0 A; 4QPK A; 1A32 A; 5ITZ A; 4W4L A; 1F4M A; 5B1N A; 1YCI A; 3C3T A; 4X64 B; 1H8H G; 5KHH A; 4I55 A; 3WU2 Z; 2UUA B; 4UV8 A; 3LNM B; 4Z2W A; 4X66 O; 1PNK A; 4WCE V; 1EBO A; 3ZHT A; 2EIJ C; 2Y48 A; 4CS3 A; 1S77 D; 3RW0 A; 1QR9 A; 2YXH A; 1ZAU A; 4X65 O; 1QR8 A; 2JEX A; 4NR1 A; 2CE4 A; 3AG2 B; 3K79 A; 1NJI W; 4LNU A; 1EZJ A; 1CEZ A; 1K34 A; 4LF6 B; 4G27 B; 1PL0 A; 4XDK A; 1D5N A; 2HJD A; 2EZP A; 4WFE A; 1R3I C; 1NR7 A; 1WA8 B; 3QO7 A; 4BIZ A; 1AI4 A; 4MVU A; 2HFE C; 2DE0 X; 1I08 A; 4U3J B; 1PM9 A; 5EIB D; 3ZN0 A; 3W7X A; 1K5S A; 1JPX A; 1X59 A; 5KHK A; 2P4K A; 2ZCE A; 5CA1 A; 4D7T A; 2VQF O; 5JWP A; 1VQO V; 2CUG A; 4AQY O; 4R6Z A; 4JTA B; 4E2L A; 3AK1 A; 5LHH A; 2HEP A; 4JYY A; 4LF5 O; 4JYA B; 1PD3 A; 4R8C A; 3UKM A; 1BSM A; 2F43 G; 4TUY A; 1N4C A; 2AXT Z; 5DED A; 1H2M A; 3DTU B; 1THZ A; 4YHH B; 4BWA A; 1M4U A; 1XDC A; 3CMA V; 3ZED A; 4NTX A; 4X64 O; 3SYC A; 1UFI A; 2UUA O; 3RYC B; 3SJQ C; 4IGG A; 3LDE A; 2AGA A; 1H2K A; 3JAS B; 4AI8 A; 1RSO A; 1B06 A; 3FB7 C; 2CGO A; 1SRY A; 2DW4 A; 3QG5 A; 5LP6 B; 1UPG A; 3OAA G; 1B04 A; 1FJG B; 4WF9 V; 2VWJ A; 4JAA A; 4DR5 B; 4QIW F; 2L6L A; 1US6 A; 5B1A B; 1N34 B; 5CA3 A; 2YIB D; 3ASN B; 2ZIM A; 4B3M O; 3APQ A; 3ML0 A; 1XHX A; 4MVS A; 3SPI A; 1BCC H; 4J11 A; 3JAW A; 5JQG B; 5IY5 C; 1VQ4 V; 3DXR A; 4I7Z B; 1FXH A; 4KL1 A; 1KB9 F; 3E8F A; 4J7Z A; 4C7U A; 5F2V O; 4DUZ B; 3OFN G; 3UQ8 A; 4PD4 F; 4HNA B; 2HKO A; 3AG4 B; 2BSK B; 2UXN A; 4JAU A; 2AZ0 A; 5HFM A; 1JJ2 U; 4JYA O; 3W7T A; 4IYH A; 3SYA A; 3HKE A; 1SC5 B; 2MK3 A; 2H8P C; 1M9N A; 1M56 B; 4FLT A; 2ZDI C; 4JF3 A; 1BZK A; 1AB3 A; 1TAE A; 3G4S V; 4YHH O; 4OX9 B; 3LDC A; 3RYI A; 4DK0 A; 3CRQ A; 2B5U A; 1ZL8 A; 1YTF D; 3FYI B; 1NTM H; 4L8J A; 4LF9 O; 3L71 H; 1VQN V; 2JIZ G; 2Q0O C; 2Y69 C; 1BGY H; 3M99 B; 4Z1M G; 4LFB O; 1W0J G; 3AK3 A; 3OD4 A; 1FJG O; 4E4E A; 1HNZ B; 4DR5 O; 2EJ7 A; 4HBN A; 1N34 O; 1BT8 A; 1AI5 A; 4FFK A; 1S5H C; 4O4I B; 3TXS A; 1F23 A; 3I5D A; 1P49 A; 3EVK A; 3ZHS A; 1BL8 A; 5KA6 A; 5C8Y A; 3JAS A; 1YJW V; 2YIC A; 3OT7 A; 5C93 A; 2ZNI A; 1GM7 A; 2YIA A; 4NXN B; 3M8A A; 1AP6 A; 5H6Q A; 2IJJ A; 2HJF C; 4DRX A; 5LA6 A; 1NZ6 A; 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