1ZYDA

Crystal structure of eif2alpha protein kinase gcn2: wild-type complexed with atp.
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
302
structure length
270
Chain Sequence
SLRYASDFEEIAVLGQGAFGQVVKARNALDSRYYAIKKIRHTEEKLSTILSEVMLLASLNHQYVVRYYAAWLERRNFVKKKSTLFIQMEYCENRTLYDLIHSENLNQQRDEYWRLFRQILEALSYIHSQGIIHRDLKPMNIFIDESRNVKIGDFGLAKIGTAMYVATEVLDGTGHYNEKIDMYSLGIIFFEMIYPFSTGMERVNILKKLRSVSIEFPPDFDDNKMKVEKKIIRLLIDHDPNKRPGARTLLNSGWLPVKHQDEVIKEALKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase GCN2
publication title Structural Basis for Autoinhibition and Mutational Activation of Eukaryotic Initiation Factor 2{alpha} Protein Kinase GCN2
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 75
structure length 270
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-06-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1zydA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1zydA01
2YM3A 3E92A 5I9WA 1NVSA 2PSQA 3VIDA 2Z7RA 2PY3A 4HOKA 4JIAA 2YABA 3KRXA 3PYYA 2J9MA 3V01A 4BFMA 4ZJVA 2OIDA 1WAKA 4PDSA 4FNYA 4NM3A 4BDDA 2W4JA 3KRLA 3RZBA 4ACCA 3EFJA 5LQFA 4O0VA 1JSVA 2YFXA 2WMVA 3BLRA 3MB7A 3EKNA 1AGWA 3GT8A 4OW8A 2PUNA 4WRSA 3EQGA 3BE9A 4L53A 5J9LA 3AGMA 5IQIA 4AT4A 4F7JA 2CLQA 4IFGA 3T9IA 5L2QA 5GZ8A 4CQEA 4C3RA 3FAAA 3MVMA 2W9FB 5IDPA 3ELJA 2Z7QA 3ZO2A 2W5AA 2VWVA 1H25A 5FD2A 5ANGA 3TNWA 1JKKA 3SRVB 2J5EA 1ZYDA 4G3EA 3EQPA 2FO0A 4BZDA 2J0JA 2ESMA 4IVBA 1UKHA 2UVZA 3VS6A 2X7GA 4FKRA 4Y73A 3NUPA 3LCKA 3NW7A 4TNDA 2WMSA 3F69A 4FGRA 4ZXTA 3NR9A 3SXSA 3U55A 1FVRA 4WSYA 4APPA 5LWMA 4ZS4A 3UNZA 5IDNA 3OC1A 3CQUA 2R2PA 4OTIA 4DEGA 3RWPA 4E4XA 3DBEA 5AM6A 3VUMA 2X2LA 3LQ8A 1OPJA 2GS2A 2UW0A 3PE1A 4ZTHA 5HE2A 1O6KA 4MQ2A 2WOUA 1JVPP 1FINA 3Q6WA 5E1EA 3KA0A 4KSPA 3Q53A 3R9OA 5A6NA 4F0IA 3IW6A 4CLJA 2PMIA 3BYOA 3MDYA 3ZH8A 5BVKA 2IZUA 4Z16A 4FICA 5A4QA 4FIJA 3CTQA 3RCDA 4Y5HA 4A9RA 5CF8A 4XOZA 5KKRC 4ERWA 4ZTQA 3OROA 5GIPE 3IS5A 3WZEA 4BDCA 3AT4A 2QO9A 3CXWA 3K3JA 1OIUA 3PZEA 4G6LA 4ID7A 3CGFA 3HV3A 4DEIA 3AC4A 3ERKA 3LQ5A 5TT7A 4TL0A 3IKAA 5GJDA 4WNMA 5JT2A 3OBGA 5L8JA 4LMUA 3PWYA 3OCTA 3FLZA 4EQMA 4U3ZA 5E8UA 3ZBXA 4Y85A 3R73A 3RTPA 2RFNA 4O6LA 4OTQA 3TZ7A 4MWHA 4YZMA 3HZTA 5IA5A 3UVPA 3HVCA 4O7YA 1MQ4A 3BZ3A 3PIXA 2ZB0A 4RVLA 2XK7A 3THBA 4J53A 4U79A 4N70A 3UVRA 3IG7A 4U7ZA 3ENHA 3BGPA 2I0EA 3D7TB 5AP6A 4TTHB 5M4CA 3JYAA 4KRCA 3AC5A 3KULB 5DMZA 3M2WA 4AU8A 4DN5A 4FSNA 4RLKA 2YCQA 4ZOGA 4AZVA 3Q4UA 3OHTA 4J99A 5L6OA 4F9CA 4ZAUA 4FEUA 1FGKA 4DINA 2YWVA 1KOAA 5AV3A 1AQ1A 5H8BA 2QONA 5KNJA 3L8XA 3P79A 3E64A 4EI4A 4AFEA 2YACA 3FUPA 1G8SA 4O86A 3PUPA 4X6RA 3G9LX 3MH2A 5CU4A 2XBAA 3UBDA 4AW2A 5CF4A 4RWKA 5DEYA 3ZCLA 5AR3A 4DA5A 2J0IA 2R3QA 4RC3A 5HX6A 2JKOA 2VTRA 2IVVA 4HGTA 3LLAA 3W8QA 4GFGA 4EOQA 3IDBA 3FI3A 4JAIA 3Q4CA 4LMNA 4TPTA 2HZ0A 4WIHA 5EI8A 5HGIA 2QO7A 3W2OA 2CKQA 3F82A 4XG2A 4I23A 2FH9A 1KE5A 2WELA 3E3PA 4MBJA 5JEBA 3VULA 5L4QA 3OW4A 1S9JA 2OZAB 5LWNA 4FSYA 1LPUA 3MSSA 4QMTA 3VS4A 4CFFA 3CIKA 4ZSAA 2W96B 3DDQA 3JY0A 4GRBA 3ZRKA 3G51A 2ONLC 4D5HA 2PVFA 4IC8A 4CTCA 1YHVA 1YXXA 1Q62A 1IA8A 3NGAA 4ZTRA 5IF1A 3JVRA 3VNTA 2YAAA 4FTQA 1CKPA 2R64A 4G3DA 1ZAOA 4CMTA 1W8CA 3Q4TA 1GZOA 1UNLA 3L9NA 4NM5A 4J97A 3ORKA 3PY1A 3DTCA 1VYWA 3EFKA 3PSBA 3QTXA 4WNPA 3LFDA 3O7LB 1XH9A 4KBCA 1M52A 2C6TA 1PF8A 3KFAA 3PA5A 1Q41A 4C02A 4EOJA 2O8YA 3W2SA 2J7TA 4FTRA 4XRJA 3FMKA 3BLHA 5CLPA 4FKJA 4IADA 4MKCA 3QRUA 4AW0A 1PYXA 1X8BA 5FXQA 4BDKA 3B8QA 3O8TA 3WF9A 5I9ZA 4KUJA 1GIHA 4FOBA 4AUAA 3F3WA 3P7BA 1LR4A 3IECA 4O0RA 5IQEA 4AA5A 3IOKA 5CTPA 1Q4LA 4G34A 4FSQA 5I4NA 2WTWA 1UWHA 3PVGA 5KZIA 4BZOA 2X6DA 3I0QA 4BBMA 3GU7A 5DI1A 3GB2A 3PG3A 4A4XA 1QMZA 2OICA 2X9FA 4RBLA 4C4IA 5M51A 1YRPA 4IDVA 3FI2A 4F9YA 2VTPA 4QMLA 4CKIA 1H8FA 4QP6A 4AE9A 3MPTA 4QMYA 5DN3A 4CKRA 5M08A 4RFZA 5AUUA 2OKRA 5JQ5A 2XZSA 1PHKA 3IDPA 3OWLA 4RJ8A 4RWIA 3I1AA 3PVWA 1LUFA 2XNBA 4FSUA 4OTPA 4IB5A 4X6QC 5CEQA 4D9TA 5IQHA 4CVAA 4WUAA 3VC4A 4BCJA 1NA7A 2UVYA 4QP8A 3RHKA 5AR7A 4AA0A 2C3JA 3EQHA 5DE2A 1ND4A 2JKMA 1SMHA 4BI0A 5AV4A 4EOIA 3QLFA 4O27B 4EHGA 3NS9A 3EYGA 2RG5A 4Q5EA 2QR8A 2WO6A 3LQ3A 4LRMA 4CRSA 2QKWB 4XP3A 3R1QA 1P2AA 1Q8WA 3HX4A 4DGGA 4XMOA 2BHHA 4JG7A 5CZHA 2C69A 5CI7A 4UMTA 3C13A 3D7TA 2VTIA 3GBZA 1YOJA 3TT0A 2C1AA 2E9VA 2A19B 5EDPA 3KXXA 3OF0A 4Z7HA 3DB8A 1PJKA 4YTCA 1OKYA 1OPKA 3FPMA 3FXXA 3IONA 4D4YA 5KMOA 4KINA 1OIRA 4PNIA 3LFSA 2IN6A 4O7ZA 4O7WA 4C4EA 2QR7A 2X4FA 4QTDA 3V6SA 3E87A 1ZOEA 4LGGA 2BILB 5CU6A 2X8DA 3R01A 3C7QA 1MP8A 3FQHA 4F0GA 2C47A 3LFNA 3RALA 4TYHB 4FKUA 5HBJA 2YDKA 3TIZA 2GNFA 3MN3A 1RW8A 5AUYA 1OKZA 1OVEA 4K8AA 3D5UA 3N51A 3VRZA 1OKWA 5BYYA 3N4UA 3QF9A 4KWPA 3LKMA 4F6WA 4BIBA 3MA6A 2IW9A 4ONAA 1Y57A 3KK9A 3ZSGA 3AOXA 5EYKA 2RSVA 4FZ6A 4L7FA 2HAKA 3TNPC 5LCKA 2OZAA 3D5VA 2PZRA 2CHLA 3OBJA 2WTKC 3MH3A 4YHFA 3BWFA 4DAWA 1H08A 2PVRA 2B54A 2ERKA 3H0YA 4AN3A 4ZTNA 3PIYA 5ACBC 2B9HA 2YLFA 1CKJA 5CANA 2W06A 4JI9A 3VBTA 2XYNA 4CQGA 3TXOA 4EC8A 2GHGA 3HA6A 3ZHPC 2C6EA 5D12A 4JJRA 1CSNA 1W98A 3QD2B 5IISA 2B9IA 3PRIA 1OECA 1SM2A 5AR2A 2GSFA 1ZRZA 3ZSIA 4GIHA 3MFUA 5CSHA 1WCCA 3PA3A 3BX5A 3CC6A 4NUSA 4LI5A 4E5AX 3UOHA 3BQCA 5A4EA 4F1TA 4I5PA 3BEAA 1KUTA 4I24A 5HIBA 3R1NA 5C03A 3BV2A 4FEQA 4GS6A 4KB8A 3NIZA 4XS2A 5E1SA 2CGWA 5HESA 1P4FA 3ZDIA 5EKNA 2R9SA 3Q5IA 3UYSA 1ERKA 4C38A 3DKCA 3KXGA 2VGPA 2WMUA 4IAYA 4R6VA 2YLEA 2BDWA 4S32A 4RVMA 4LRKA 4E4LA 1XQZA 2VTTA 3RNIA 3H9RA 3TZ8A 4QYYA 4FSRA 5FDXA 3QA8A 3NNWA 4I5CA 4CFUA 4NK9A 3TTJA 4CMUA 4F9BA 3LOKA 3NUUA 2BFYA 4NWMA 3FLWA 3LFFA 3VUGA 4IIRA 3ENMA 2PVYA 2YCFA 4U45A 3VS7A 2BAJA 1SYKA 2C5XA 4G5PA 4O0XA 2JDTA 1XKKA 5JGDA 3GQLA 4IAIA 1KE8A 2CKPA 2IG7A 3DXPA 3NVKI 3BIZA 4ASZA 4IZ5A 3KXMA 4RJ4A 5ANDA 3Q6UA 2F49A 2YAKA 3O51A 4QPMA 3W8LA 4EKLA 5HLPA 3QX4A 3CLYA 4JDHA 5HU3A 3V5TA 1URCA 3EB0A 4C33A 4B6LA 4EEVA 5AWMA 3QD3A 3GU6A 3QRKA 3ZRMA 2VWXA 3DFAA 4QPAA 4GW8A 5TO8A 3I81A 3NYOA 4I94A 1PXJA 4HW7A 4BTMA 2C6OA 1CTPE 4V0GB 3C51A 4O84A 1R3CA 2PWLA 3WIKA 4HCUA 5EOLA 3DV3A 4ZLYA 5M06A 3Q9ZA 2F7EE 2HYYA 3ZMMA 4YSMA 4NFMA 2BZHB 3DKOA 1Q8UA 2GU8A 3E7VA 2CSNA 5I9XA 1M14A 2OZOA 3P86A 3UO6A 2BIKB 2ERZE 3QKLA 3RJCA 4AN9A 4QP3A 1L3RE 3A8XA 4KIQA 4R7IA 3SHEA 4QMOA 3V5QA 5IQGA 1UU8A 5EW3A 2GPHA 2YHVA 4IAFA 3FL4A 3ZFYA 4ZY6A 2PPQA 4FEVA 4H05A 5EM5A 4LOPA 3I79A 2VU3A 4DBXA 1UNGA 4M69A 3EQCA 4GU9A 2PVJA 1E1VA 4K77A 4EK5A 2JLDA 4YJVA 5CAPA 2IWIA 3SW4A 5BVOA 2VUWA 2ITZA 2W1DA 2AUHA 3F7ZA 3TJCA 5HO6A 1QPDA 2P0CA 2Z60A 4N6ZA 1PXPA 4DGLC 1OB3A 2HCKA 3LZBA 3POZA 4UWCA 5FEDA 3RK9A 5K5XA 1VJYA 3MESA 4JLCA 1IG1A 1PYEA 2W17A 4IJPA 2QOQA 3KVWA 4OTDA 4L01A 4EOSA 2XNOA 2BRHA 4B8LA 2Y4IC 1VZOA 4KSQA 4L67A 4K9YA 4RIWB 4QYEA 3OCSA 5IA0A 4Q9SA 1NVRA 1B38A 2IZRA 2X7FA 2CPKE 4ZIMA 3F9NA 5HCZA 5HE0A 4EH8A 2BR1A 3CQEA 4EHZA 3MPMA 4HYUA 3JY9A 1YWNA 4I0RA 4IM0A 4NT4A 2GNGA 3TEIA 3SW7A 5CU2A 3AC2A 1YI4A 1ZOGA 3VS2A 4IHPA 5DYJA 5D11A 2JD5A 2WHBA 2UV2A 2AYPA 3FKLA 3M11A 3W2PA 2BPMA 3P7AA 2QO2A 4GK2A 2GMXA 4U80A 4EK8A 2BDFA 1PKDA 3UMWA 3WYYA 4Y83A 5TE0A 1Q5KA 2HENA 2X8EA 5HVJA 3DDPA 4ZS0A 2Q0BA 4RX5A 2UZUE 3M42A 3UQFA 2VO6A 2J5FA 3COMA 3RK7A 3FI8A 5AUWA 5IA3A 5JRSA 1F0QA 4FF8A 4L8MA 5IEVA 3EH9A 4O7TA 4EBWA 3DBDA 2YCRA 4U8ZA 3Q4ZA 4CTBA 3KEXA 3CBLA 3Q60A 2B1PA 4YO6A 4F7SA 2RF9A 2XEZA 3BPRA 3I5NA 1MUOA 4FI1A 4YGAA 5FEEA 4AGDA 4E7WA 4BF2A 5HE3A 3RAWA 3O7LD 3W55A 4EH5A 4DG2E 5LMBA 4TWNA 5CEMA 5E91A 3NUSA 3SA0A 2WEVA 5CI6A 5LXMA 3MJ1A 3QTZA 4O0UA 3CP9A 3SAYA 3P1AA 5DG5A 4RIXB 5IQDA 4FKVA 3A7FA 3DLZA 4HGSA 4B7TA 4I0SA 2ONLA 3F3UA 4EH6A 1Q61A 3A61A 2ITWA 3QTRA 2WD1A 3K54A 4FV2A 4JBOA 3NRMA 4JX7A 3WE4A 3O2MA 5EOBA 4AW1A 3VBYA 3BELA 5CXZA 3QQJA 4GK3A 4DTAA 3EL7A 5CAOA 3WIGA 4EL9A 4IM3A 3UZRA 3PJ3A 1E9HA 1PMVA 4FL2A 3W16A 2OI4X 2OJFE 4J95A 2WMBA 3QWJA 3HAVA 5M53A 4N57A 3FLYA 4ANLA 1K9AA 5CSWA 1P5EA 3NZ0A 4NKAA 2BFXA 4RX7A 3AG9A 4FIHA 4F1OA 2V22A 4IH8A 3C0GA 2R0IA 4LYNA 3C4EA 5AUZA 3TNIA 5C1QB 3EN9A 4XHKB 2GFSA 5H8EA 3UIUA 4OTRA 3V5WA 4ASEA 4XYFA 4FVRA 4CFWA 2PHKA 3NMUF 4HZRA 1OM1A 2HOGA 2CGXA 2WTDA 3QQHA 5KMJA 4OGRA 4QP4A 4LRJA 4OTWA 4XLVA 2RFSA 5ETAA 4YJPA 5HVKA 3MH1A 4NCTA 1UV5A 3A62A 3IQ7A 2CGUA 3GC9A 2VRXA 4FIEA 2R3JA 5AP7A 5EM8A 3R9DA 4ANQA 4EH7A 2C5YA 2H8HA 4FKSA 2SRCA 3U4UA 3ZLXA 4BWXA 4YJQA 4G5JA 3TKHA 3TUBA 3RAHA 3NSZA 2P2IA 1FPUA 5BUJA 4EOKA 2JKKA 2JAMA 2QOCA 3HRBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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