1BN3A

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bn3A00
4WUQA 1DCBA 4QSBA 1HECA 3T5UA 2AW1A 3M1JA 3U7CA 5E2MA 2CBBA 2NWPA 3PJJA 3DVCA 5SZ5A 4Z1KA 4Q7SA 3M5SA 1CNHA 4Q8ZA 1A42A 4RIVA 3B4FA 4K0TA 3W6IA 2Q1BA 4C3TA 3DCSA 3MNUA 1CNKA 1G54A 1RZCA 2NNOA 3M3XA 4Y0JA 1BNVA 3IBNA 3HLJA 4CNVA 4X5SA 1ZH9A 5C8IA 5AMDA 3F4XA 4N16A 3OY0A 3M2ZA 2NXRA 3ML2A 4COQA 1URTA 1BNUA 1DCAA 3KONA 3IBLA 3SAPA 4E9OX 4MTYA 1G0EA 1BNNA 3JXGA 3P4VA 5JG5B 4IDRX 4Q06A 2AX2A 1FQRA 3ZNCA 3OYQA 4FRCA 5BRUA 1CCSA 4KV0A 3ZP9A 1IF4A 3HFPA 5DSKA 5FDIA 1CNGA 3HKNA 3KKXA 5FNIA 2Q38A 1FQNA 5JESB 4IWZA 1CVDA 1EOUA 4PQ7A 5HPJA 1KOPA 4K13A 1I9LA 5FLSA 4YYTA 4RN4A 1CILA 4YXIA 5DOHA 3EFIA 3DVDA 4R5BA 5A6HA 4MDGA 4CNXA 4YXUA 3M98A 4ZX1A 3R16A 3RG4A 1UGEA 3MHIA 1KOQA 1UGCA 2X7UA 3EFTA 2H15A 5DRSA 3DD0A 3U47A 5E5UA 3SBIA 1CNCA 1F2WA 1I90A 3M40A 5JG3B 1OKNA 4QJ0A 3SBHA 1CNXA 3MHOA 3N2PA 3V7XA 4CACA 1HCAA 3NJ9A 4L5UA 3BL0A 3M67A 3D0NA 1ZFKA 4Q83A 3HS4A 5E5RA 5JGSB 4QK2A 3M1QA 4HU1A 4KNJA 5SZ6A 5DSLA 5FLOA 1IF8A 5LMDA 1FR4A 1ZGFA 5FL6A 3MYQA 1HEDA 2EU2A 4WL4A 1FQLA 3IBIA 1IF5A 2W2JA 3FE4A 2FOUA 4YX4A 4M2UA 4YGKA 1YDBA 4YGJA 1BCDA 3JXHC 4MO8A 2OSFA 5JEPB 3FW3A 2FMZA 3S75B 4JSAA 3GZ0A 1CINA 3PYKA 4KAPA 5AMLA 3V3FA 4E3HA 4DZ7A 1FLJA 1ZFQA 1J9WA 3P3JA 2O4ZA 2EZ7A 5DSNA 4BCWA 1RJ5A 1CAYA 4QJOA 2QO8A 4ZWYA 4PXXA 5SZ2A 3T5ZA 4JS6A 5EH5A 1Z93A 1CAKA 3MNKA 1HCBA 3M04A 3IEOA 2CBEA 1OQ5A 2H4NA 3M2NA 1YDAA 4CNWA 4HEZA 4WUPA 1I9QA 4RFCA 1BNWA 5E2NA 5IPZA 3C7PA 1CAMA 3OIKA 4Q78A 1UGDA 3CAJA 2CBCA 4KNMA 5EKJA 1ZSBA 5EH8A 3TVOX 3DAZA 3BETA 3V3IB 3RZ5A 3KIGA 5EKMA 5E2KA 4TWMA 5FDCA 3M1WA 4Q08A 4QIYA 1UGGA 5EHVA 1CVFA 2NXTA 2NWOA 2WEJA 1FSQA 4XFWA 4G0CA 4ITPA 1FQMA 4YGNA 3RZ8A 1MUAA 3MZCA 3T84A 3T85A 4YGFA 5CACA 2ABEA 1ZGEA 5EZTX 4ZX0A 3DCCA 1DMXA 4UOVA 2QOAA 3V3JA 4HT0A 3RZ0B 1TB0X 3OIMA 3OKUA 1CNWA 4JSSA 5DOGA 5EKHA 1RZBA 3L14A 1THKA 2FNMA 2HD6A 1G0FA 1HEBA 5E2SA 1CRAA 1RAZA 4E3DA 3S8XA 5FNGA 3RYJB 4FPTA 2IT4A 2X7TA 3P5LA 1CIMA 3P5AA 5FLPA 4QSJA 3DD8A 3HKQA 1AVNA 3DVBA 4KUVA 4Q0LA 3T82A 2WEGA 3SAXA 3N3JA 5BRVA 5SZ7A 3CA2A 1CNJA 4BF1A 2QP6A 3DC9A 1XQ0A 4ETQC 4DZ9A 5EH7A 4MDMA 4KP5A 4RFDA 3DC3A 3MWOA 4Q49A 3UYQA 2FNNA 3HKTA 3RZ7A 4ZAOA 4Q8YA 3RYYA 1XEVA 3M2XA 4MDLA 1I8ZA 3D9ZA 2FOYA 4Q09A 1LG6A 3KOIA 3MNAA 1CNBA 2GD8A 5BNLA 5EIJA 5CLUA 4QTLA 4LP6A 4CA2A 3OKVA 1CNYA 1OKMA 3M2YA 4FIKA 4FU5A 1FR7A 4WR7A 5G03A 2POVA 3MMFA 1I9MA 1TE3X 4FVNA 4FL7A 3NI5A 1TTMA 2FW4A 3M1KA 3IGPA 1BICA 2WEHA 3W6HA 1G3ZA 5DSIA 1G6VA 1CCTA 2EU3A 2X7SA 4KUWA 5DSMA 4RUYA 3V2MA 4Q6EA 4Z1JA 5L3OA 5JDVB 1BN1A 1I9NA 1CAZA 4Q6DA 1JD0A 3P44A 3S73B 1BNMA 1TG9A 4YWPA 4ITOA 4JSWA 5BYIA 5CA2A 1BZMA 4R59A 1G53A 1UGFA 1H9QA 4KUYA 1CCUA 2Q1QA 1G45A 1RZDA 3RGEA 2HL4A 1CAOA 3RZ1B 4XE1A 4QJMA 3K7KA 5JQTA 3S78B 3BL1A 3MHLA 3CZVA 4Z1NA 1HEAA 1BN4A 1AZMA 1G4OA 3KOKA 2WD2A 3S77B 5FLQA 2NNGA 5JEGB 1ZSCA 3HKUA 3V3GB 3RLDA 4XIXA 3S9TA 1LGDA 5DSQA 1TEQX 1YO2A 1LG5A 2OSMA 4HEWA 5JEHB 2FMGA 4QY3A 5JQ0A 3T83A 1YO1A 2NN1A 5G0CA 3JXFA 1TEUX 1G52A 3Q31A 5FL5A 3V2JA 5A25A 1KWQA 2GEHA 3MDZA 3D93A 4Q81A 4CNRA 3S97A 1HUGA 8CA2A 12CAA 4QJWA 2CBDA 4ZWIA 2CABA 4QJXA 3MNHA 4QIZA 5FNLA 4YVYA 1Z9YA 2NN7A 3IBUA 4YXOA 4E4AA 5DVXA 2VVAX 3QYKA 4Q87A 5SZ3A 1OKLA 1V9EA 4RIUA 4HEYA 4PYYA 4K0SA 1G48A 2FOSA 4KNNA 1CVCA 5L6KA 3P3HA 3IAIA 2ILIA 1CA2A 3F8EA 3MNJA 4HT2A 9CA2A 3V3HB 3RG3A 4YHAA 1YDDA 3N4BA 3RYVB 4QJPA 4Z1EA 1H4NA 5E2RA 4RUXA 3F7BA 1RAYA 3RJ7A 1T9NA 5EOIA 1CVEA 4RH2A 3DA2A 4QSAA 1I9PA 1TH9A 5DSRA 3V5GA 4ZWZA 5DSOA 4Q7PA 3DCWA 2WD3A 2FOQA 2HNCA 3TMJA 4HF3A 3OYSA 4Q7VA 6CA2A 1AM6A 4L5WA 5BRWA 1CRMA 4HBAA 1KEQA 1TG3A 3MHMA 3DV7A 1CAHA 5SZ0A 4R5AA 1UGAA 2CBAA 3P55A 2NNSA 4M2WA 5FNMA 4E5QA 1Y7WA 5SZ1A 1CA3A 1G1DA 4QSIA 2CA2A 4M2VA 3OILA 2HFWA 4GL1X 1CANA 3RYXB 3VBDA 1JV0A 5E28A 2FOVA 2NWYA 1CAIA 1FSRA 4E49A 1IF6A 3KNEA 1BNQA 1LZVA 4K0ZA 3KLDB 4PYXA 4QK1A 5EHWA 3K2FA 1CNIA 4E3FA 4Q07A 4K1QA 3RYZA 4TWLA 3PO6A 5CJFA 3FFPX 2ZNCA 1G4JA 1XEGA 4LHIA 5DSPA 4BF6A 4CQ0A 5G0BA 5DSJA 1BNTA 3ML5A 4WW6A 1FSNA 1I9OA 5G01A 1LUGA 3S72B 2FNKA 3MNIA 2NMXA 4ZWXA 3LXEA 5EHEA 3D8WA 4Q9YA 5J8ZA 1RZEA 5FLRA 1ZNCA 2HKKA 3U3AX 1G46A 4G7AA 3M96A 3M5TA 4WW8A 2POWA 3UYNA 1H9NA 1Z97A 3NB5A 4YGLA 1RZAA 1DMYA 3D92A 4L5VA 3N0NA 3MHCA 1BV3A 1XPZA 1IF7A 3M5EA 3B1BA 3F7UA 2WEOA 4Q8XA 2VVBX 1ZSAA 1CAJA 1UGBA 1CZMA 3KWAA 4ILXA 1HVAA 4Q7WA 1MOOA 3S76A 1TBTX 4LU3A 5FL4A 3K34A 1HUHA 1BN3A 1IF9A 3S74B 5FNJA 2HOCA 4FVOA 4RUZA 4KNIA 4PZHA 1KWRA 3CYUA 1JCZA 2NNVA 2POUA 2NWZA 4Q99A 4Q90A 4QEFA 4M2RA 1RJ6A 5FLTA 3P58A 4E3GA 1YO0A 5AMGA 3R17B 4QK3A 2NXSA 1V9IC 4MLXA 3TVNX 3KS3A 1CVAA 2F14A 5FNHA 4N0XB 4JSZA 5JGTB 1I91A 3U45X 3M14A 1ZE8A 4Z0QA 1CVBA 7CA2A 1CALA 5SZ4A 3DBUA 3S71B 4XZ5A 1YDCA 4MLTA 4XIWA 1CVHA 4KP8A 5FNKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WUQ A;  1DCB A;  4QSB A;  1HEC A;  3T5U A;  2AW1 A;  3M1J A;  3U7C A;  5E2M A;  2CBB A;  2NWP A;  3PJJ A;  3DVC A;  5SZ5 A;  4Z1K A;  4Q7S A;  3M5S A;  1CNH A;  4Q8Z A;  1A42 A;  4RIV A;  3B4F A;  4K0T A;  3W6I A;  2Q1B A;  4C3T A;  3DCS A;  3MNU A;  1CNK A;  1G54 A;  1RZC A;  2NNO A;  3M3X A;  4Y0J A;  1BNV A;  3IBN A;  3HLJ A;  4CNV A;  4X5S A;  1ZH9 A;  5C8I A;  5AMD A;  3F4X A;  4N16 A;  3OY0 A;  3M2Z A;  2NXR A;  3ML2 A;  4COQ A;  1URT A;  1BNU A;  1DCA A;  3KON A;  3IBL A;  3SAP A;  4E9O X;  4MTY A;  1G0E A;  1BNN A;  3JXG A;  3P4V A;  5JG5 B;  4IDR X;  4Q06 A;  2AX2 A;  1FQR A;  3ZNC A;  3OYQ A;  4FRC A;  5BRU A;  1CCS A;  4KV0 A;  3ZP9 A;  1IF4 A;  3HFP A;  5DSK A;  5FDI A;  1CNG A;  3HKN A;  3KKX A;  5FNI A;  2Q38 A;  1FQN A;  5JES B;  4IWZ A;  1CVD A;  1EOU A;  4PQ7 A;  5HPJ A;  1KOP A;  4K13 A;  1I9L A;  5FLS A;  4YYT A;  4RN4 A;  1CIL A;  4YXI A;  5DOH A;  3EFI A;  3DVD A;  4R5B A;  5A6H A;  4MDG A;  4CNX A;  4YXU A;  3M98 A;  4ZX1 A;  3R16 A;  3RG4 A;  1UGE A;  3MHI A;  1KOQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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