1BNMA

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 72
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bnmA00
2FNKA 3MNJA 1G46A 4ZAOA 3M67A 3CA2A 4PZHA 4RUXA 1YDBA 1ZSBA 3D9ZA 3C7PA 4BCWA 1UGCA 1G1DA 3M2ZA 4YXOA 4ZWXA 5FNHA 1ZNCA 5E2MA 1YO2A 3DCSA 1XEVA 5EZTX 3P5LA 4Q8YA 1UGDA 2GD8A 4QJWA 3IBUA 3B4FA 2X7TA 4R5AA 4FU5A 3OILA 5EOIA 5FNLA 2HKKA 2NMXA 4QK3A 4Z0QA 3IGPA 1G4OA 3DCCA 5E2KA 3OIMA 3MHOA 3V3FA 4YXUA 5EKJA 1BNMA 1F2WA 2HL4A 4MLTA 1BNWA 4QIZA 3VBDA 3F7BA 1CNYA 1KOPA 5FL6A 3HKUA 4E49A 1BNNA 3JXGA 3PYKA 3DCWA 1XEGA 4N0XB 5FDIA 2CBEA 5JG3B 4M2VA 3S74B 5FNMA 3DVBA 3OIKA 4Q6EA 5G0CA 4WR7A 5JQTA 4WUQA 3MMFA 4Z1JA 4ETQC 3S76A 1BCDA 4JSWA 3HS4A 1G53A 1CA2A 3NJ9A 4HU1A 3RYZA 1IF7A 1FR4A 5BRWA 3T5UA 1G0EA 5JESB 4QJPA 3HLJA 3S97A 4CA2A 4PQ7A 1KWRA 4YYTA 1H4NA 4XFWA 3P58A 5SZ2A 3S77B 3MNIA 2NN7A 4CNVA 1CAJA 1Y7WA 3ML2A 4HEYA 4Q99A 4RFCA 5EHVA 3QYKA 3S9TA 1CCSA 1HEDA 4M2UA 4XZ5A 1TEUX 4QSBA 3S75B 1HUGA 3D8WA 4CNRA 1RZCA 1G52A 2H15A 4MDGA 1V9EA 1CILA 4Q81A 4BF6A 5J8ZA 1JCZA 3M04A 2POWA 3MWOA 4MTYA 3T84A 5FDCA 1JV0A 2WD3A 3P4VA 4Z1EA 1CNCA 4ZX0A 3P3HA 4Q90A 2ABEA 3RJ7A 1BN1A 3K7KA 4UOVA 1I9OA 1I9QA 1CAYA 3MNHA 3KWAA 3KIGA 3OYQA 3FW3A 2IT4A 2NWYA 3NB5A 4G7AA 5AMLA 4CACA 1G6VA 3TVOX 3D0NA 3DVCA 1YO1A 3U3AX 1CRMA 3S8XA 1ZFKA 4QSIA 4YWPA 4RFDA 5SZ4A 1ZH9A 4Z1KA 3SBIA 1IF6A 4HF3A 1CVDA 3KONA 1RZDA 3N2PA 5DSMA 2POUA 3MHIA 3RG4A 5DVXA 3DAZA 2CABA 4YGNA 4JS6A 1CA3A 1UGFA 5C8IA 2W2JA 5DRSA 1RJ5A 5JGTB 4FRCA 2NNOA 4HT2A 1AVNA 3MNUA 3RYXB 2HD6A 5AMDA 3MNAA 4QSAA 1G0FA 1ZE8A 1BZMA 3BL0A 4TWMA 5CA2A 2NN1A 1HECA 4Q49A 3DVDA 4ITOA 3OY0A 4LP6A 4DZ9A 3RZ8A 4L5VA 1XPZA 4YHAA 3EFIA 3FE4A 5DSRA 1CIMA 4YGFA 1G54A 3HKNA 3IBIA 5SZ0A 2CBBA 1KOQA 4Q78A 4YVYA 1CAOA 2FOYA 4YGKA 3F4XA 4M2WA 1FQLA 1AZMA 1CVAA 4RH2A 4R5BA 4Y0JA 1RZBA 1HEAA 4RUYA 5FNIA 3V2MA 3KOKA 4LU3A 4Q7SA 3KNEA 1G3ZA 1CAHA 3HFPA 5BRUA 4QSJA 1OKNA 3V3IB 1DCAA 5SZ5A 3N4BA 3W6HA 4KP8A 4PYXA 4QK2A 4Q8ZA 3RYJB 2X7SA 5DSPA 3GZ0A 4E3HA 3M96A 1HUHA 1FQNA 1OKLA 1LZVA 3M1KA 4K0ZA 4Q87A 1I90A 3BL1A 5G03A 4E4AA 4Q08A 5CLUA 4QJXA 2FMGA 4ILXA 3V5GA 3V7XA 1CVEA 4HEZA 1I9LA 3T83A 1EOUA 3UYQA 3N3JA 4E3GA 3RG3A 3BETA 4FVNA 5G01A 2HFWA 3L14A 4KUYA 2WD2A 2FNNA 3M5TA 5E5UA 2VVAX 3CZVA 5EIJA 1ZGFA 1UGAA 1TH9A 2Q38A 3MHCA 5E2RA 1UGGA 5DSKA 4Z1NA 3K2FA 5DSJA 1I8ZA 1BNVA 4QEFA 5FLTA 1FQRA 1DCBA 2NXSA 2VVBX 1TG3A 3DA2A 1CVBA 2F14A 4QJ0A 4JSSA 3IBLA 5SZ6A 4QTLA 5CJFA 4QY3A 3IAIA 1IF9A 4L5UA 2FOUA 2EU2A 6CA2A 1XQ0A 4ZWIA 1CALA 8CA2A 3RGEA 4R59A 3B1BA 1I9NA 1G48A 1RAZA 1HCBA 3D93A 4Q9YA 3P5AA 5DSNA 3MHMA 1CNHA 1CAIA 4WL4A 3Q31A 5A25A 3M1WA 1YO0A 1UGEA 3DV7A 4CNXA 5FLQA 4MO8A 5E2NA 3NI5A 1YDAA 1Z9YA 2NNSA 4KV0A 2Q1BA 4DZ7A 3T5ZA 3M2NA 3RZ5A 5JDVB 4HBAA 3M1JA 3U7CA 3V2JA 5JGSB 4KAPA 1CVCA 3U47A 5E28A 4K0SA 4K0TA 4JSZA 4KNMA 12CAA 5L3OA 1KWQA 2NXRA 4RIUA 3DC3A 3MNKA 1I91A 3M14A 1FR7A 3P44A 3KKXA 1BV3A 5DOHA 1LGDA 2NWZA 4IDRX 1HVAA 1FSRA 2NWOA 2POVA 4TWLA 5EH7A 1CVHA 4Q83A 3MHLA 2AX2A 1IF8A 3IEOA 4COQA 4BF1A 5LMDA 4Q07A 3MDZA 4ITPA 4CNWA 4XIXA 4CQ0A 3UYNA 4E3FA 3DD8A 1A42A 4GL1X 3CAJA 1TBTX 4FIKA 3PJJA 4HT0A 1YDCA 3R17B 4ZX1A 3MZCA 3M1QA 3KS3A 4KNJA 5JQ0A 2HOCA 2O4ZA 4QK1A 2WEOA 1CAKA 5DSQA 1JD0A 1FLJA 3HKTA 3M3XA 3M40A 3RZ1B 5FL5A 2CBCA 3DBUA 2CA2A 1CNGA 3V3JA 1RAYA 4E3DA 4M2RA 4Q7PA 3TMJA 2X7UA 4LHIA 4KUWA 4K1QA 2QOAA 2NXTA 1CRAA 2OSFA 1G4JA 3PO6A 4YXIA 2WEJA 2FNMA 1RZAA 3EFTA 4KP5A 5CACA 3RLDA 1CNXA 1MUAA 4G0CA 4X5SA 2EU3A 1FSNA 1Z93A 4E5QA 1OQ5A 2OSMA 1ZSCA 3OKUA 1Z97A 5EKMA 1CNWA 3M5SA 1THKA 4KNIA 4XIWA 5FNGA 3S78B 3SBHA 1DMXA 4PYYA 2NNGA 5FNKA 2WEHA 5EHEA 5AMGA 5SZ3A 1CZMA 4FL7A 1CANA 3F7UA 3F8EA 5JG5B 3M5EA 3K34A 2FW4A 5DSOA 2NNVA 3N0NA 5DSIA 2ZNCA 5FLRA 4Q6DA 3FFPX 4RIVA 4Q7VA 1IF5A 1URTA 4JSAA 1TB0X 1V9IC 5A6HA 5EKHA 5JEHB 1BICA 1OKMA 1CNIA 4ZWZA 4YX4A 2GEHA 1ZGEA 3T85A 3RYVB 3ZP9A 2FOQA 3P55A 3CYUA 4Q0LA 1BNTA 3R16A 3JXFA 3LXEA 5FLSA 1RJ6A 2WEGA 4N16A 3V3HB 1J9WA 5FNJA 3S73B 3KLDB 3TVNX 3MYQA 4K13A 3KOIA 3S72B 4C3TA 1BN4A 7CA2A 1CVFA 4WW8A 1LG5A 4MLXA 5EH5A 5EH8A 2EZ7A 4Q06A 1LG6A 3ML5A 3RZ0B 3JXHC 5BNLA 2NWPA 4Q8XA 2CBDA 3OYSA 4HEWA 1CNKA 2HNCA 2Q1QA 2CBAA 1AM6A 1CAMA 3DD0A 5BYIA 3RYYA 1FQMA 3D92A 1TEQX 2QP6A 4PXXA 1ZFQA 5HPJA 4KNNA 4RUZA 1I9MA 3M2YA 4XE1A 1CNBA 4MDMA 5FLOA 1BNUA 1HCAA 4IWZA 1H9NA 9CA2A 1G45A 1H9QA 3P3JA 3SAXA 2ILIA 1CAZA 1BNQA 1MOOA 3W6IA 5DOGA 4KUVA 1YDDA 1KEQA 3HKQA 4QJMA 4FPTA 5E2SA 2FOSA 1FSQA 5L6KA 1CCUA 2FMZA 1ZSAA 4QJOA 5FL4A 3U45X 3ZNCA 1LUGA 2H4NA 3V3GB 5JEGB 4RN4A 5SZ1A 1UGBA 3M2XA 1T9NA 4L5WA 3OKVA 4ZWYA 5DSLA 4YGLA 1TG9A 3DC9A 1TTMA 5FLPA 5G0BA 2FOVA 4QIYA 1RZEA 2QO8A 3IBNA 4Q09A 1TE3X 1CCTA 1IF4A 5E5RA 4MDLA 4E9OX 1CNJA 4FVOA 5JEPB 4YGJA 3M98A 4WW6A 5IPZA 1DMYA 1HEBA 3S71B 5BRVA 3RZ7A 1I9PA 4WUPA 3SAPA 1CINA 1BN3A 5EHWA 5SZ7A 4Q7WA 2AW1A 3T82A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FNK A;  3MNJ A;  1G46 A;  4ZAO A;  3M67 A;  3CA2 A;  4PZH A;  4RUX A;  1YDB A;  1ZSB A;  3D9Z A;  3C7P A;  4BCW A;  1UGC A;  1G1D A;  3M2Z A;  4YXO A;  4ZWX A;  5FNH A;  1ZNC A;  5E2M A;  1YO2 A;  3DCS A;  1XEV A;  5EZT X;  3P5L A;  4Q8Y A;  1UGD A;  2GD8 A;  4QJW A;  3IBU A;  3B4F A;  2X7T A;  4R5A A;  4FU5 A;  3OIL A;  5EOI A;  5FNL A;  2HKK A;  2NMX A;  4QK3 A;  4Z0Q A;  3IGP A;  1G4O A;  3DCC A;  5E2K A;  3OIM A;  3MHO A;  3V3F A;  4YXU A;  5EKJ A;  1BNM A;  1F2W A;  2HL4 A;  4MLT A;  1BNW A;  4QIZ A;  3VBD A;  3F7B A;  1CNY A;  1KOP A;  5FL6 A;  3HKU A;  4E49 A;  1BNN A;  3JXG A;  3PYK A;  3DCW A;  1XEG A;  4N0X B;  5FDI A;  2CBE A;  5JG3 B;  4M2V A;  3S74 B;  5FNM A;  3DVB A;  3OIK A;  4Q6E A;  5G0C A;  4WR7 A;  5JQT A;  4WUQ A;  3MMF A;  4Z1J A;  4ETQ C;  3S76 A;  1BCD A;  4JSW A;  3HS4 A;  1G53 A;  1CA2 A;  3NJ9 A;  4HU1 A;  3RYZ A;  1IF7 A;  1FR4 A;  5BRW A;  3T5U A;  1G0E A;  5JES B;  4QJP A;  3HLJ A;  3S97 A;  4CA2 A;  4PQ7 A;  1KWR A;  4YYT A;  1H4N A;  4XFW A;  3P58 A;  5SZ2 A; 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