1BNWA

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 73
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bnwA00
2CABA 2ILIA 2WD2A 4MDLA 4QK1A 5EHWA 4KAPA 4PYXA 4BCWA 1TTMA 1CAZA 4G0CA 3MHOA 5EZTX 1ZGFA 3IBUA 4HBAA 4YGFA 4K0TA 4Q83A 1CVDA 3IAIA 4RUYA 1G52A 1LZVA 2NNVA 5FNLA 1CNIA 4K0ZA 5E2MA 4ZAOA 3SBHA 5A6HA 2AW1A 1HVAA 4Q87A 2WEHA 2GEHA 4Q9YA 1CZMA 3M5SA 4HT2A 5JDVB 1RAZA 2O4ZA 3S75B 3TVNX 1CNJA 3B4FA 2WEJA 3RZ0B 4Z1KA 5EIJA 1BNMA 1CVHA 4Q08A 1JV0A 1CANA 1H4NA 3M1WA 1I8ZA 3GZ0A 1YO1A 3DVBA 1ZSAA 4ZWYA 5FL5A 1RJ5A 1RZDA 4QJXA 4FPTA 4E5QA 2OSFA 3MZCA 3U3AX 1FR7A 1HUGA 2AX2A 3MHMA 4N16A 3MHLA 4Q7SA 3V7XA 4KNIA 4HEZA 4K0SA 5FNGA 3RZ1B 2POWA 4Q0LA 3M96A 3P44A 4Q6EA 1RZAA 3MWOA 5DVXA 1LG6A 4YGJA 1FLJA 2CBCA 1KOQA 3T5UA 3MHCA 3V3JA 2HFWA 1OKNA 1RZEA 2POVA 4JSZA 4Q99A 1G48A 4QIZA 4M2RA 4IWZA 4CQ0A 5BRWA 1JCZA 2NMXA 1XEVA 3HLJA 3K34A 4M2WA 2CBAA 2NXRA 5BNLA 3S9TA 4G7AA 1FQLA 4M2VA 4HEWA 3R17B 2FOUA 3PO6A 3K2FA 5FLQA 3MNAA 1BCDA 5EKJA 4L5VA 3D8WA 4R5BA 3S76A 5FNIA 5E28A 4UOVA 2NN7A 4C3TA 4L5UA 3CAJA 3M2ZA 2NWPA 3KLDB 3RJ7A 2VVAX 4YWPA 3RLDA 3S77B 5BYIA 5FNHA 1CCTA 2NN1A 4KNNA 1UGFA 3Q31A 4ETQC 1XQ0A 1I9OA 3D92A 1G45A 2FMGA 4PQ7A 1YO0A 3MNIA 1CIMA 3DD0A 5DSRA 3V3FA 2ZNCA 4QJWA 3L14A 1BNWA 3M2NA 4HU1A 1IF6A 4Z0QA 5EH7A 2GD8A 1BNQA 4MLXA 4YGKA 2HD6A 3NI5A 4KUWA 4ZX1A 4KNMA 4WL4A 2EZ7A 4WW6A 1G3ZA 4ILXA 1OQ5A 2FW4A 1Z9YA 5EH5A 5L6KA 1FR4A 5FL4A 3C7PA 4RUXA 1CA2A 2X7SA 4QSIA 5E2KA 3JXGA 4CA2A 4E3HA 1KWRA 1KOPA 1TEQX 4XFWA 5SZ1A 3KKXA 1FQMA 5FNJA 1FQRA 4TWLA 4WR7A 1IF7A 1CNBA 5EKHA 3BL0A 1HCBA 2NXTA 5C8IA 5E2SA 3RYXB 5DOHA 4QTLA 1CAHA 3DV7A 4PXXA 1HUHA 2W2JA 5SZ0A 3MNJA 1YDCA 3CA2A 3OYSA 6CA2A 1I91A 1BICA 1XEGA 1H9NA 1I9QA 1TG3A 2NWOA 4M2UA 3D0NA 3RG4A 2FNNA 5FLSA 5JEHB 5FDCA 4XIWA 3T5ZA 4ZWIA 1FQNA 1FSQA 1RZCA 1ZFQA 5SZ7A 4YXUA 4Q06A 3IGPA 2WD3A 1V9IC 5DSNA 3M1QA 2QOAA 5DRSA 4KP8A 2ABEA 5DSIA 5JQ0A 1HEBA 1CAJA 4RIVA 1CAIA 1HECA 4K1QA 1RZBA 4E3FA 3ZNCA 3M1KA 3MHIA 1XPZA 1BNNA 5E5RA 3RGEA 4Q78A 2NXSA 4JSWA 4TWMA 1DCBA 1LUGA 3W6HA 4XIXA 5E2NA 5BRUA 1G0EA 1TG9A 4QY3A 3DC9A 1BN1A 1UGAA 3PYKA 4ITOA 3M1JA 4QSBA 5JGSB 2CBEA 2CA2A 3IBIA 5FLTA 4Q8YA 3KONA 3K7KA 3QYKA 3MNUA 1J9WA 4QSAA 4MDGA 3S78B 1CVCA 1FSRA 3RYYA 5DSQA 1DMYA 4FU5A 3U7CA 3M40A 3F8EA 1CRAA 3DCSA 3OY0A 5EHEA 3DC3A 4Q8XA 3N0NA 2NWZA 4Y0JA 5AMDA 5EH8A 5FLRA 1G54A 3KWAA 3HFPA 1CNGA 4CNWA 3KNEA 1IF8A 1F2WA 5IPZA 1CNXA 4JS6A 2EU3A 4KNJA 5BRVA 4WUQA 2NNSA 3MDZA 4CNXA 5JEGB 1JD0A 4YHAA 2FOVA 3RYJB 4FIKA 1CNYA 5JQTA 3T82A 4KV0A 3FW3A 4Q6DA 1Y7WA 5FNKA 3S74B 2FMZA 2HL4A 3JXHC 1UGCA 4GL1X 3UYQA 8CA2A 3M2XA 5A25A 1ZH9A 3U47A 1I9MA 3KIGA 4JSSA 4R59A 2CBDA 1OKMA 1BNVA 4KP5A 1RAYA 1ZSCA 3OYQA 3DVCA 3V3HB 5FDIA 4YXIA 3P3HA 2IT4A 1CAOA 4ITPA 5SZ3A 3DCWA 3KOKA 1DMXA 1CVEA 4QIYA 3V3IB 4CNVA 1CNKA 4ZWXA 3MNHA 4E3DA 4K13A 2X7TA 5SZ2A 3RZ5A 5J8ZA 2NNGA 3ZP9A 2HOCA 3F4XA 4ZWZA 1TB0X 3M5TA 1YDAA 1ZNCA 4E3GA 1CRMA 1CNHA 3P55A 3D9ZA 3KOIA 2QP6A 4WUPA 4Q7WA 4QJOA 2Q38A 1H9QA 4YVYA 3RYVB 3FE4A 4Z1EA 3DD8A 3T85A 4Q8ZA 2NWYA 4N0XB 3SAPA 2FOQA 1G46A 5EKMA 1HCAA 3CZVA 5SZ5A 3U45X 1G0FA 3DCCA 4LHIA 5DSLA 3RZ7A 5CACA 5DSOA 4Q90A 1Z97A 3NB5A 5DOGA 5JEPB 4Z1NA 1KWQA 1URTA 2WEGA 5JGTB 3R16A 4L5WA 3RZ8A 3T83A 3MMFA 1MUAA 1TE3X 1MOOA 2FNMA 3P58A 7CA2A 3NJ9A 5SZ6A 4MLTA 4Q09A 1ZFKA 4Q81A 5DSPA 1CINA 1IF5A 2Q1QA 1YDDA 1LGDA 3SBIA 1CNCA 1EOUA 1BNUA 1THKA 4WW8A 1YO2A 1IF9A 3IBLA 5E5UA 5JG3B 2Q1BA 4KUVA 3ML2A 4FVOA 3VBDA 3OKVA 3DVDA 3DBUA 1G6VA 1A42A 4PZHA 1RJ6A 5G0BA 3DA2A 1CCSA 1ZE8A 3M3XA 5HPJA 3D93A 2OSMA 4QJPA 1UGBA 5DSJA 3T84A 3S71B 3S72B 1HEAA 3HS4A 5FLPA 5SZ4A 4FL7A 4QSJA 1ZSBA 3P5LA 4YYTA 1LG5A 3DAZA 3IBNA 5EHVA 1IF4A 1CA3A 1TH9A 3S73B 3N4BA 1CVFA 1CAYA 5G0CA 3P5AA 3OIKA 3P3JA 1BN4A 1UGDA 2FNKA 1UGGA 2FOYA 2H15A 4Q7VA 4YXOA 1AZMA 1OKLA 1CAMA 4Q49A 4RFCA 3JXFA 4QJMA 5FNMA 3M04A 3B1BA 4Z1JA 4BF6A 3V2JA 3S8XA 1CVBA 5FLOA 1BZMA 2HNCA 4RH2A 1ZGEA 5AMGA 3EFIA 3S97A 1I9NA 5G01A 4Q07A 3RG3A 5FL6A 4HEYA 1AM6A 4YGLA 1CALA 5AMLA 3HKNA 4LU3A 3EFTA 4JSAA 3W6IA 5DSMA 1Z93A 3ML5A 4FVNA 2WEOA 3M67A 4RFDA 9CA2A 12CAA 4QJ0A 5DSKA 3TMJA 3IEOA 1AVNA 3OKUA 1CNWA 4XE1A 1TEUX 1TBTX 3BL1A 3HKTA 3P4VA 3F7UA 2POUA 4R5AA 1BN3A 3KS3A 3V5GA 3N2PA 3UYNA 5CJFA 4QK2A 4XZ5A 1KEQA 4RN4A 1UGEA 4BF1A 1CILA 3F7BA 3CYUA 1I9PA 3PJJA 1G1DA 4YGNA 1BV3A 4DZ9A 3HKQA 4LP6A 1CAKA 3RYZA 4E49A 3MNKA 3SAXA 3M5EA 1DCAA 4MDMA 5CA2A 1HEDA 3LXEA 3OILA 1V9EA 1G4JA 5G03A 4COQA 2X7UA 2H4NA 1BNTA 2VVBX 3MYQA 3N3JA 4MO8A 4YX4A 1I90A 1T9NA 4HF3A 4Q7PA 3TVOX 4E4AA 5L3OA 3FFPX 3M2YA 2F14A 4ZX0A 2NNOA 1G53A 1I9LA 1G4OA 1FSNA 5EOIA 1YDBA 4KUYA 4QEFA 5CLUA 2CBBA 4CACA 3BETA 4MTYA 3OIMA 4RIUA 1CVAA 2HKKA 2FOSA 5JG5B 1CCUA 4PYYA 4RUZA 3M14A 3HKUA 3V2MA 4HT0A 4IDRX 5LMDA 4CNRA 4DZ7A 4QK3A 3V3GB 3M98A 4X5SA 5E2RA 2QO8A 4FRCA 4E9OX 2EU2A 5JESB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CAB A;  2ILI A;  2WD2 A;  4MDL A;  4QK1 A;  5EHW A;  4KAP A;  4PYX A;  4BCW A;  1TTM A;  1CAZ A;  4G0C A;  3MHO A;  5EZT X;  1ZGF A;  3IBU A;  4HBA A;  4YGF A;  4K0T A;  4Q83 A;  1CVD A;  3IAI A;  4RUY A;  1G52 A;  1LZV A;  2NNV A;  5FNL A;  1CNI A;  4K0Z A;  5E2M A;  4ZAO A;  3SBH A;  5A6H A;  2AW1 A;  1HVA A;  4Q87 A;  2WEH A;  2GEH A;  4Q9Y A;  1CZM A;  3M5S A;  4HT2 A;  5JDV B;  1RAZ A;  2O4Z A;  3S75 B;  3TVN X;  1CNJ A;  3B4F A;  2WEJ A;  3RZ0 B;  4Z1K A;  5EIJ A;  1BNM A;  1CVH A;  4Q08 A;  1JV0 A;  1CAN A;  1H4N A;  3M1W A;  1I8Z A;  3GZ0 A;  1YO1 A;  3DVB A;  1ZSA A;  4ZWY A;  5FL5 A;  1RJ5 A;  1RZD A;  4QJX A;  4FPT A;  4E5Q A;  2OSF A;  3MZC A;  3U3A X;  1FR7 A;  1HUG A;  2AX2 A;  3MHM A;  4N16 A;  3MHL A;  4Q7S A;  3V7X A;  4KNI A;  4HEZ A;  4K0S A;  5FNG A;  3RZ1 B;  2POW A;  4Q0L A;  3M96 A;  3P44 A;  4Q6E A;  1RZA A;  3MWO A;  5DVX A;  1LG6 A;  4YGJ A;  1FLJ A;  2CBC A;  1KOQ A;  3T5U A;  3MHC A;  3V3J A;  2HFW A;  1OKN A;  1RZE A;  2POV A;  4JSZ A;  4Q99 A;  1G48 A;  4QIZ A; 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