1CA2A

Refined structure of human carbonic anhydrase ii at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Refined structure of human carbonic anhydrase II at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1989-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ca2A00
4K1QA 4PQ7A 4RUZA 4E4AA 1UGCA 3RYYA 1ZNCA 3BL0A 4WUQA 3MNAA 1IF7A 1UGFA 5AMLA 5DSOA 3RG4A 3M96A 1LG5A 4Q7PA 1LUGA 4YX4A 4MDLA 4QSAA 3V3GB 4HEWA 3FE4A 3MZCA 4HT0A 1CAHA 1KOQA 3HKTA 3HS4A 3B1BA 1G53A 1BN3A 4XZ5A 3RZ1B 3SAXA 1H9NA 3S77B 1CVBA 2NNGA 5FLOA 3DC9A 3D8WA 4IDRX 3KWAA 4RN4A 5SZ7A 5FLQA 3ZNCA 1UGBA 3DD0A 4FU5A 4YGNA 3L14A 3PYKA 5JGSB 5EIJA 1V9EA 4PXXA 1CNGA 1BNNA 3DCSA 5DSJA 3DCWA 1HUHA 1KEQA 1HCBA 3F7BA 3CZVA 1FQMA 3DBUA 1HECA 3HLJA 3P58A 3KOKA 5AMDA 1TG3A 5FL5A 1JD0A 3V3HB 1G46A 2FNNA 5A6HA 3IBLA 1CZMA 1CAJA 5EHWA 2HOCA 1OKMA 2H15A 2IT4A 3P5LA 4L5UA 4K0ZA 3M5SA 5CLUA 4ITPA 4QY3A 5DSRA 1JCZA 4RH2A 3PJJA 4YVYA 3U7CA 4ILXA 4PYYA 1G48A 3RG3A 1URTA 1BV3A 3HFPA 3M5EA 4FL7A 1I9OA 5HPJA 4Q8XA 3OILA 2O4ZA 5E28A 1I91A 1TTMA 2CA2A 4Q90A 1XQ0A 1LZVA 3D92A 1G45A 3GZ0A 1ZH9A 3MDZA 4M2VA 3ML5A 4KNNA 5BNLA 3D0NA 2EU3A 3NJ9A 4G7AA 3S8XA 1FSQA 1CNXA 1A42A 1EOUA 4RFCA 1CVHA 1CVDA 3RJ7A 2AW1A 3N0NA 5SZ3A 5G0BA 1CNIA 1RZCA 3B4FA 2POUA 3IBIA 5LMDA 2CABA 5A25A 1DCBA 1HEDA 3MNKA 5FLRA 4M2WA 3S71B 1BZMA 2CBEA 4QJXA 1I9PA 3RLDA 1IF8A 4QK1A 4YGLA 3KONA 1CNYA 4HEYA 5G03A 3RYXB 1DMYA 2FOSA 4DZ9A 5DSPA 1ZFQA 1CNBA 3M98A 3SBHA 1IF9A 3F7UA 1CVCA 3R16A 5DRSA 2EZ7A 4Q6DA 5JG5B 3BETA 1CCSA 3JXGA 1I9NA 1I9QA 4Q08A 2OSMA 5JGTB 1AM6A 1JV0A 3PO6A 1RZBA 2QO8A 1CAKA 5EH5A 1HEAA 1Y7WA 3CA2A 3M2NA 4Q83A 1BNUA 1CALA 4M2RA 2NWPA 1ZGEA 2NWZA 3MYQA 5FNKA 3F4XA 4E9OX 4HU1A 4C3TA 1FQLA 1J9WA 4PYXA 3F8EA 1G0EA 1UGAA 1CRAA 3OKUA 2CBDA 3R17B 4HF3A 4BF6A 3DVCA 3P3HA 4M2UA 4Q78A 4QSIA 4JSZA 4K0TA 1FQNA 1G54A 5FNIA 3P55A 4R59A 5DSIA 4JSSA 5BRVA 5EH8A 1CNHA 4E3DA 3OYSA 1CANA 1TB0X 5FLPA 4N0XB 5FLTA 2NNOA 1KWQA 5DSKA 2FMZA 2GEHA 2HD6A 3S78B 4KP8A 3JXHC 1HUGA 3M14A 5EHEA 2WD2A 3T84A 9CA2A 3N2PA 4WL4A 4E49A 4QSJA 2FOUA 5BRWA 4Q8YA 2X7UA 1BNTA 3EFTA 4KAPA 2FOQA 4E3GA 1ZFKA 5SZ2A 3M1JA 4L5VA 3U3AX 3K2FA 5EKJA 3DV7A 1CA3A 2VVBX 4TWMA 1YDAA 4FIKA 5SZ6A 5DOGA 4KNIA 2ILIA 3OYQA 4N16A 1KOPA 3C7PA 4WW6A 2VVAX 5EOIA 3NI5A 3P44A 4WR7A 3MHIA 4QJ0A 1BICA 3MNHA 2WEJA 2NXTA 4LP6A 2HNCA 5JDVB 1FLJA 1UGGA 3D93A 4Q9YA 2NN1A 3HKQA 3M2YA 1T9NA 4WUPA 4QJMA 2GD8A 1G4JA 1G3ZA 3P4VA 3V3FA 4FVOA 4MDMA 4JS6A 4R5AA 1YO0A 3RYVB 3M2ZA 1Z93A 1CAZA 8CA2A 4ZWZA 2X7TA 2Q1BA 3RZ0B 4YGJA 3D9ZA 3MHOA 4KP5A 5FNJA 3UYNA 4QJWA 5E2SA 3IBUA 4QIZA 4RUYA 1I9LA 3HKNA 1TEUX 4CNRA 1BN1A 1ZSCA 3S9TA 3S76A 4XIXA 4QJOA 4ZWIA 7CA2A 2NN7A 3K7KA 1CILA 2CBCA 1OKNA 5FL4A 1IF6A 3KLDB 4QTLA 3M3XA 3JXFA 4PZHA 4KUYA 1FSNA 3OY0A 1XEVA 4ZWXA 1CAYA 1HEBA 1KWRA 3MNIA 4QSBA 4KUVA 5FNGA 4E3HA 3OKVA 1LGDA 2NXRA 3V2JA 4Z0QA 5EHVA 3IBNA 4KV0A 4UOVA 4DZ7A 1CCUA 3OIMA 2NWOA 3DAZA 4CA2A 5SZ5A 1IF5A 1CA2A 4ZWYA 2NNVA 1MOOA 1CCTA 3W6IA 1I8ZA 5E2MA 5FNLA 5L6KA 2QP6A 4QIYA 3Q31A 4LU3A 3M1KA 4K13A 5E5RA 1TH9A 5EH7A 1AZMA 4Q7WA 2Q38A 2FW4A 4XE1A 4KNMA 3P5AA 4FPTA 1HVAA 1CAOA 2H4NA 5EKHA 1CAMA 1DCAA 2NWYA 3T5UA 1BCDA 4KNJA 3M5TA 5E2RA 5JEPB 5BYIA 1ZGFA 5DSMA 3S75B 2OSFA 4Q49A 5FLSA 4XIWA 3V5GA 3M1WA 4HT2A 4BF1A 4LHIA 3M2XA 1CNCA 3V2MA 4FVNA 1CIMA 5FNMA 2HFWA 1YO1A 1BNWA 5DSQA 3M04A 4Q0LA 3M1QA 4ITOA 5JQTA 1BNMA 4CNXA 5FNHA 3DC3A 1G6VA 4MDGA 3N4BA 4JSAA 4FRCA 5E2NA 3DD8A 1CVFA 1XEGA 5G01A 5JQ0A 1YO2A 1OQ5A 4L5WA 4Q8ZA 3W6HA 2WEHA 5L3OA 3KNEA 4YGKA 3VBDA 5DSNA 2WD3A 5BRUA 1RJ6A 1BNQA 1TE3X 2HL4A 4QK3A 4Q6EA 1G4OA 1CRMA 4COQA 5SZ1A 1FSRA 3K34A 2NMXA 1I9MA 1FQRA 3S72B 3KKXA 5JESB 4CNVA 4CQ0A 1CNWA 5IPZA 1HCAA 4Q06A 3EFIA 3ZP9A 4E3FA 4BCWA 4Z1KA 4RUXA 2POVA 4WW8A 2W2JA 1Z97A 4ZX0A 4ETQC 1XPZA 1ZSBA 4TWLA 3P3JA 3OIKA 4MLTA 6CA2A 4KUWA 3SAPA 5E2KA 2FNMA 3RGEA 4ZAOA 3V3IB 2FNKA 2X7SA 1BN4A 4GL1X 4Q09A 3CAJA 1UGDA 4QJPA 3U47A 5SZ0A 4RFDA 3FFPX 5DSLA 3MNJA 3FW3A 3S73B 3U45X 3LXEA 5E5UA 1H9QA 4RIUA 3KIGA 4YWPA 5JEHB 5SZ4A 1BNVA 1RJ5A 4XFWA 1TG9A 4K0SA 4Q7VA 1G1DA 4IWZA 1LG6A 5FDIA 4QEFA 1ZE8A 3KS3A 1CVEA 1RZAA 4Q07A 3HKUA 4Q81A 3S74B 1THKA 3M67A 5CACA 2HKKA 4ZX1A 4QK2A 3T83A 3DCCA 3T85A 4X5SA 1RZDA 1CNKA 3RZ5A 3V3JA 4R5BA 2POWA 4Q99A 4Z1EA 1OKLA 4YXIA 4HEZA 3T5ZA 5EZTX 1TEQX 3KOIA 1CNJA 4Y0JA 3MHLA 3CYUA 2F14A 3IAIA 1AVNA 4Z1NA 4Q87A 1CVAA 5DVXA 1ZSAA 4YHAA 4MO8A 3RZ7A 3SBIA 2QOAA 1I90A 3DVBA 4RIVA 3MNUA 5CJFA 3UYQA 3ML2A 2CBAA 3N3JA 4YXUA 1FR7A 4YGFA 3T82A 3TMJA 4CACA 1YDBA 3MWOA 1CAIA 4MTYA 3S97A 5G0CA 3MHMA 5CA2A 1V9IC 5C8IA 3TVNX 4HBAA 1CINA 5JG3B 5AMGA 2FOVA 2AX2A 2EU2A 4CNWA 5FDCA 1DMXA 1YDDA 2FOYA 1G0FA 4MLXA 1RAZA 3MHCA 3MMFA 5FL6A 3IEOA 5J8ZA 2FMGA 4Q7SA 1IF4A 2WEOA 12CAA 4JSWA 1F2WA 1RZEA 3IGPA 2ZNCA 2Q1QA 1UGEA 3DVDA 3BL1A 1G52A 4Z1JA 3V7XA 1Z9YA 1MUAA 1TBTX 4G0CA 3RYJB 2NXSA 3M40A 4YXOA 3RZ8A 3DA2A 1H4NA 1YDCA 2CBBA 5JEGB 1RAYA 3QYKA 5EKMA 3NB5A 2NNSA 3RYZA 3TVOX 1FR4A 4YYTA 2WEGA 4E5QA 2ABEA 5DOHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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 4K1Q A;  4PQ7 A;  4RUZ A;  4E4A A;  1UGC A;  3RYY A;  1ZNC A;  3BL0 A;  4WUQ A;  3MNA A;  1IF7 A;  1UGF A;  5AML A;  5DSO A;  3RG4 A;  3M96 A;  1LG5 A;  4Q7P A;  1LUG A;  4YX4 A;  4MDL A;  4QSA A;  3V3G B;  4HEW A;  3FE4 A;  3MZC A;  4HT0 A;  1CAH A;  1KOQ A;  3HKT A;  3HS4 A;  3B1B A;  1G53 A;  1BN3 A;  4XZ5 A;  3RZ1 B;  3SAX A;  1H9N A;  3S77 B;  1CVB A;  2NNG A;  5FLO A;  3DC9 A;  3D8W A;  4IDR X;  3KWA A;  4RN4 A;  5SZ7 A;  5FLQ A;  3ZNC A;  1UGB A;  3DD0 A;  4FU5 A;  4YGN A;  3L14 A;  3PYK A;  5JGS B;  5EIJ A;  1V9E A;  4PXX A;  1CNG A;  1BNN A;  3DCS A;  5DSJ A;  3DCW A;  1HUH A;  1KEQ A;  1HCB A;  3F7B A;  3CZV A;  1FQM A;  3DBU A;  1HEC A;  3HLJ A;  3P58 A;  3KOK A;  5AMD A;  1TG3 A;  5FL5 A;  1JD0 A;  3V3H B;  1G46 A;  2FNN A;  5A6H A;  3IBL A;  1CZM A;  1CAJ A;  5EHW A;  2HOC A;  1OKM A;  2H15 A;  2IT4 A;  3P5L A;  4L5U A;  4K0Z A;  3M5S A;  5CLU A;  4ITP A;  4QY3 A;  5DSR A;  1JCZ A;  4RH2 A;  3PJJ A;  4YVY A;  3U7C A;  4ILX A;  4PYY A;  1G48 A;  3RG3 A;  1URT A;  1BV3 A;  3HFP A; 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