1CAOA

Crystallographic studies of the binding of protonated and unprotonated inhibitors to carbonic anhydrase using hydrogen sulphide and nitrate anions
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Crystallographic studies of the binding of protonated and unprotonated inhibitors to carbonic anhydrase using hydrogen sulphide and nitrate anions.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase(oxo-acid)
total genus 81
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1caoA00
5AMDA 2FNMA 3RG3A 3K7KA 3P3JA 5BRWA 1CRMA 2HFWA 3M04A 3T5UA 4YXUA 1TE3X 4E3GA 1OKMA 3CZVA 3MHIA 1ZFQA 3GZ0A 4FIKA 1HECA 4HT0A 3K2FA 4Q49A 5A25A 1ZGEA 5EH8A 3LXEA 4XFWA 3S71B 5A6HA 4Q09A 4Q0LA 5FLRA 4GL1X 5JDVB 4WW8A 1FLJA 3CA2A 4L5UA 1Y7WA 1Z93A 3DVDA 4Q6EA 4CA2A 3V5GA 4YVYA 1ZSBA 4ETQC 3MZCA 2X7UA 3NB5A 4JSWA 4ZWYA 4UOVA 4Q8ZA 3MYQA 3RZ5A 2GD8A 4PYXA 3HLJA 3MNKA 4RN4A 1Z97A 3M3XA 1CCSA 3D0NA 5FNHA 5BRVA 3OKUA 3S78B 3T82A 1CILA 3L14A 4Z0QA 2WEOA 1CNHA 2FW4A 2NNVA 4YGLA 4C3TA 3JXHC 5CJFA 1OKNA 4RIUA 1RAZA 1CVBA 1HCBA 4G0CA 2CBBA 5CA2A 1CNKA 2O4ZA 1CAOA 3DV7A 3DC9A 1ZNCA 4YGKA 1AZMA 1H9QA 4KNJA 4MDMA 4FL7A 3DVBA 1IF6A 1BN3A 1BV3A 5G0BA 4YGFA 1CA2A 1G45A 4K1QA 4YGNA 5FNKA 3BL0A 3KKXA 5EH5A 3HS4A 1FQRA 3S75B 4KV0A 4Q9YA 3MNAA 5FLPA 1CVEA 3U47A 5FNJA 3M67A 3M2NA 4QIYA 3V2MA 4WR7A 5G01A 2POUA 1YO1A 3P5AA 1CAYA 1RZBA 1RZAA 1OKLA 1TH9A 4QSJA 3V3GB 4KNNA 2EU3A 4ZX0A 1UGGA 5EHVA 3OYSA 3P58A 4MDGA 3S97A 4QJ0A 4E3FA 3MHLA 3PJJA 5C8IA 4KUVA 4R5AA 2CBEA 3MNHA 4PZHA 4G7AA 4FVOA 2NNOA 2QP6A 3KOIA 3N3JA 3P3HA 3T84A 4Z1KA 4QTLA 1UGAA 3U45X 5SZ0A 3M1QA 1I91A 3FW3A 4XZ5A 1BNWA 5AMGA 1IF5A 1I9PA 4LHIA 2NXRA 4ITOA 3S72B 9CA2A 5DVXA 1JD0A 2AX2A 4N0XB 1MUAA 3DCWA 5E2NA 1FSRA 3S74B 5FLTA 4E49A 3P5LA 4Q78A 1I9QA 5L3OA 3EFIA 4Q7SA 2WD3A 4QSIA 3S77B 3M98A 2HNCA 4ZX1A 4FVNA 3S8XA 1I8ZA 4M2VA 5EZTX 3MNJA 3IAIA 4N16A 5E2MA 1G46A 3V3JA 1G4OA 4HBAA 4E5QA 5JQ0A 3M40A 3M2ZA 4CNWA 1RJ6A 4ZAOA 1BNUA 2HKKA 2FMZA 3SAPA 5E2RA 1FSQA 3D93A 5JEPB 3DD8A 4MDLA 5LMDA 2FOUA 3N2PA 1BNTA 1F2WA 4K0TA 5CACA 3KONA 4Q7VA 4QSBA 5FL5A 5SZ6A 2OSMA 1CAKA 3U7CA 3DC3A 3B4FA 4CQ0A 3R16A 3B1BA 1RJ5A 4ITPA 5FDIA 2WEHA 1FQMA 4KUWA 4QJOA 3V3FA 3D92A 3DCSA 4RH2A 4JS6A 5FDCA 1BN1A 3IBUA 1CAJA 3T5ZA 1DCBA 3OIMA 3N4BA 2X7TA 3KOKA 3KS3A 3BL1A 1TEUX 3CYUA 3ML2A 3MHMA 2ZNCA 4HEYA 1THKA 4K0ZA 1CNXA 4COQA 2NNSA 1HUGA 4K13A 3MNUA 4JSSA 3RJ7A 1BNQA 5SZ2A 5FNIA 1CA3A 2VVAX 4ZWXA 4Q81A 4KNIA 1IF7A 3P4VA 8CA2A 4XIWA 5JG5B 3FFPX 3IEOA 3IBLA 4LU3A 3M1WA 4HF3A 4ILXA 5DOGA 1HEDA 4DZ9A 1CNIA 5SZ1A 1I90A 3M1KA 3F4XA 1KEQA 1FSNA 4ZWZA 5BRUA 1UGEA 3KLDB 4QK2A 1YDBA 4TWLA 1T9NA 3M96A 4XIXA 4XE1A 4YYTA 4JSZA 4KUYA 1TEQX 1AVNA 1G53A 2Q38A 4HT2A 3T85A 3V3HB 1TG9A 3RZ7A 4L5VA 1ZH9A 4MO8A 4RUYA 5EKMA 1HCAA 1ZSCA 1EOUA 3BETA 1DCAA 1CCUA 5JGSB 1G4JA 1A42A 4WUQA 3OIKA 5SZ3A 1HEBA 3EFTA 3RGEA 3ZP9A 4DZ7A 5SZ4A 4Z1EA 3RZ1B 1G54A 4Q7WA 3M2YA 3V3IB 4WL4A 1CALA 3OILA 2NMXA 1CZMA 2QO8A 3P44A 1TBTX 4QEFA 3KNEA 5EH7A 3HFPA 4Q06A 3M14A 4Q83A 1FR4A 2FOSA 2NWZA 1TB0X 3M5SA 4PXXA 3VBDA 1G1DA 3F7BA 1CNJA 1YDCA 3HKNA 3V2JA 1URTA 2NNGA 3M5TA 4Q6DA 2HOCA 2WD2A 3F8EA 1YDAA 4QJMA 1XEVA 3OYQA 5DSMA 5E5UA 3M1JA 2VVBX 2F14A 1CNBA 1V9IC 3PYKA 1HVAA 4QSAA 2ILIA 4IDRX 3DD0A 3SBIA 4FPTA 4Y0JA 1IF4A 2FOQA 2POVA 2Q1QA 2AW1A 3RYYA 1CVDA 4RFCA 3MNIA 1I9MA 3PO6A 5DOHA 2FOYA 3HKUA 3QYKA 3RZ0B 2WEGA 3Q31A 12CAA 3DVCA 3RLDA 1RZCA 5HPJA 3DCCA 3TVNX 1Z9YA 1XQ0A 4KAPA 4R59A 1V9EA 2FMGA 3NJ9A 1J9WA 1ZE8A 2ABEA 2IT4A 4BCWA 2H4NA 1RZEA 3U3AX 1BNVA 1TTMA 3IBIA 4KP5A 4E3HA 5EHWA 3UYNA 3P55A 4MLXA 3RYVB 3SBHA 2CBCA 2FNNA 1IF8A 3JXGA 5DSLA 5FL6A 1FR7A 1UGFA 4ZWIA 4RUZA 3SAXA 1LG6A 5DSIA 2WEJA 4E4AA 3W6HA 1I9OA 2Q1BA 1XPZA 2CBDA 3D8WA 5FLOA 5G03A 3DBUA 5CLUA 3TVOX 3JXFA 2W2JA 5EIJA 1CRAA 5JESB 1IF9A 3R17B 1ZSAA 4Q08A 5AMLA 4E9OX 3KWAA 5DSOA 5DSJA 4Z1NA 1KWRA 4HEWA 1LUGA 5JEHB 3MHOA 4LP6A 1CAZA 3MHCA 5BNLA 3D9ZA 4BF1A 1CNCA 1AM6A 1CAMA 1YO2A 4WUPA 4YXOA 3KIGA 5FNMA 2FOVA 1G48A 4YXIA 4BF6A 7CA2A 5FLQA 1DMYA 1HUHA 4L5WA 3S76A 2NN7A 3F7UA 2NXTA 3DAZA 3W6IA 5E28A 4PQ7A 5DSNA 4RIVA 1CCTA 2EU2A 1CVHA 3HKQA 4KP8A 4PYYA 3IBNA 1H9NA 3M5EA 1CNGA 2QOAA 4R5BA 4X5SA 2HD6A 4RFDA 4Q87A 3OKVA 4FRCA 5DSKA 3RYZA 1G6VA 1FQLA 2NWYA 3ML5A 5JEGB 2FNKA 2H15A 2HL4A 1G0FA 4YHAA 2NWPA 1G3ZA 5JG3B 3TMJA 1LG5A 5DSRA 1BN4A 1XEGA 5G0CA 4M2UA 4Q7PA 4YX4A 1BNMA 2CA2A 3M2XA 4KNMA 4CACA 3S73B 3K34A 3HKTA 1OQ5A 5IPZA 1KWQA 5SZ7A 3CAJA 1G52A 3T83A 2GEHA 4FU5A 3MWOA 4M2RA 1CNYA 1CNWA 5SZ5A 1CAIA 4QY3A 4QJPA 4HU1A 1ZGFA 4TWMA 4CNRA 2CABA 1CINA 4Z1JA 1I9LA 4Q99A 5EHEA 1CIMA 5EKJA 4QJWA 5FLSA 1HEAA 1BZMA 4YGJA 4JSAA 3V7XA 4M2WA 2X7SA 1YDDA 3N0NA 4QK3A 2EZ7A 3RZ8A 4IWZA 1YO0A 4YWPA 3DA2A 3ZNCA 3RYXB 5EOIA 1BCDA 5BYIA 1I9NA 2CBAA 1ZFKA 4QIZA 5JQTA 4E3DA 1UGCA 3RYJB 5E2KA 4MLTA 5FNGA 4MTYA 5FL4A 4Q8YA 1CAHA 3C7PA 1CVCA 1DMXA 4CNVA 5E2SA 1BNNA 1KOPA 1TG3A 2NXSA 2OSFA 1BICA 4RUXA 5JGTB 3NI5A 1CVFA 3UYQA 1G0EA 3RG4A 4Q90A 1JCZA 1CANA 5DSPA 1LZVA 3IGPA 3OY0A 4QJXA 2POWA 2NN1A 4WW6A 5EKHA 4QK1A 1RZDA 1MOOA 2NWOA 5J8ZA 3FE4A 1CVAA 4Q8XA 5FNLA 1UGDA 4HEZA 5DRSA 1UGBA 1KOQA 5DSQA 1FQNA 1JV0A 3MMFA 1RAYA 5E5RA 4CNXA 1H4NA 3S9TA 5L6KA 6CA2A 3MDZA 4Q07A 1LGDA 4K0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5AMD A;  2FNM A;  3RG3 A;  3K7K A;  3P3J A;  5BRW A;  1CRM A;  2HFW A;  3M04 A;  3T5U A;  4YXU A;  1TE3 X;  4E3G A;  1OKM A;  3CZV A;  3MHI A;  1ZFQ A;  3GZ0 A;  4FIK A;  1HEC A;  4HT0 A;  3K2F A;  4Q49 A;  5A25 A;  1ZGE A;  5EH8 A;  3LXE A;  4XFW A;  3S71 B;  5A6H A;  4Q09 A;  4Q0L A;  5FLR A;  4GL1 X;  5JDV B;  4WW8 A;  1FLJ A;  3CA2 A;  4L5U A;  1Y7W A;  1Z93 A;  3DVD A;  4Q6E A;  4CA2 A;  3V5G A;  4YVY A;  1ZSB A;  4ETQ C;  3MZC A;  2X7U A;  3NB5 A;  4JSW A;  4ZWY A;  4UOV A;  4Q8Z A;  3MYQ A;  3RZ5 A;  2GD8 A;  4PYX A;  3HLJ A;  3MNK A;  4RN4 A;  1Z97 A;  3M3X A;  1CCS A;  3D0N A;  5FNH A;  5BRV A;  3OKU A;  3S78 B;  3T82 A;  1CIL A;  3L14 A;  4Z0Q A;  2WEO A;  1CNH A;  2FW4 A;  2NNV A;  4YGL A;  4C3T A;  3JXH C;  5CJF A;  1OKN A;  4RIU A;  1RAZ A;  1CVB A;  1HCB A;  4G0C A;  2CBB A;  5CA2 A;  1CNK A;  2O4Z A;  1CAO A;  3DV7 A;  3DC9 A;  1ZNC A;  4YGK A;  1AZM A;  1H9Q A;  4KNJ A;  4MDM A;  4FL7 A;  3DVB A;  1IF6 A;  1BN3 A;  1BV3 A;  5G0B A;  4YGF A;  1CA2 A;  1G45 A;  4K1Q A;  4YGN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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