1CNGA

X-ray crystallographic studies of engineered hydrogen bond networks in a protein-zinc binding site
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAALHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title X-Ray Crystallographic Studies of Engineered Hydrogen Bond Networks in a Protein-Zinc Binding Site
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cngA00
3NB5A 1JV0A 3M98A 3T84A 5FNKA 4HEYA 3SBIA 5EHVA 3P3HA 1CAOA 2ABEA 4L5UA 2CABA 3KWAA 4G7AA 1BZMA 3RYJB 3N4BA 4Q87A 3S97A 3HKNA 4Q8XA 1CVCA 1G0FA 3RG4A 1G1DA 3JXFA 3V3JA 4QJOA 1XEGA 5SZ0A 2EU2A 3B1BA 4FRCA 1I9PA 3DC3A 1ZSBA 4N0XB 3OYQA 4JSWA 1HEDA 2NWYA 3RJ7A 4M2VA 4PQ7A 5BNLA 3ML5A 4KUVA 2FMZA 3NI5A 1DCAA 3P5LA 4YXOA 1TB0X 2NN1A 1G0EA 2WEJA 4QK3A 4ZX0A 4ILXA 5JDVB 4YGNA 3KOIA 3S77B 2NN7A 4E5QA 5DSKA 1CCTA 3S74B 5JESB 5EIJA 4QK2A 3RZ7A 2POUA 3DV7A 3RYVB 5DSNA 3RZ1B 4ITPA 1CAKA 2FW4A 3D9ZA 3M40A 4JSZA 5IPZA 4E3DA 2NMXA 5FNHA 4XIXA 4Y0JA 1UGFA 1CAJA 1ZNCA 3N2PA 4KP8A 4MDLA 1G45A 1ZH9A 5FNMA 2GD8A 3D92A 4MLXA 2OSFA 4MDGA 3U7CA 1I9QA 5G01A 1V9EA 4XFWA 3MHIA 1DCBA 4CNWA 5FLQA 4ZWIA 4Q9YA 5SZ5A 4K0SA 4QJMA 5E2NA 1BNTA 1BN4A 5FLOA 1CVFA 1BICA 4RFDA 4RN4A 5DSJA 2CBEA 3C7PA 2WEOA 3KIGA 3HKQA 1FLJA 3IBNA 3P4VA 5DSRA 4YX4A 3U45X 4Q8ZA 1TBTX 2OSMA 4YGJA 4R5AA 5EH8A 1BCDA 5G03A 3S76A 3SBHA 1JCZA 2NNSA 1DMYA 1G53A 4XZ5A 2NXRA 4HF3A 1I8ZA 3L14A 3ZNCA 1I9MA 5DSPA 4TWMA 5FLTA 4ITOA 1HEBA 1CNXA 1OKLA 4K0TA 4Q49A 2FOYA 5EZTX 4R5BA 3T85A 1H4NA 4YVYA 3M1JA 5G0BA 1UGEA 4QEFA 1H9QA 4HT0A 4CACA 1YO2A 1THKA 5JG5B 1FQMA 1BN1A 1BNQA 5L3OA 5BYIA 5C8IA 1AM6A 3BL1A 1TH9A 3DAZA 3BETA 1CINA 4KNMA 1LGDA 2FOSA 4DZ9A 3IEOA 3IBIA 4KNNA 1I9OA 1RZBA 4Q7PA 5FLPA 4ZWXA 4E3GA 2NNGA 1KWRA 1CIMA 3P58A 1CNYA 3DCSA 4FPTA 4PYYA 4XE1A 4X5SA 5JG3B 1CILA 4QIYA 3M1KA 1CVEA 3S8XA 4KV0A 2HL4A 3PO6A 1IF7A 2AX2A 1FQRA 1Z9YA 5FLRA 5DSMA 3CAJA 4FVOA 2CBDA 3DVBA 1KOQA 3QYKA 2FNNA 3V7XA 4HT2A 2ILIA 4L5WA 3K34A 2POVA 3MHMA 3V2JA 4Z1KA 2Q1BA 5A25A 3V5GA 4E3FA 5DVXA 4WW6A 3HKUA 3RZ5A 3OKVA 5EKJA 1CANA 3DC9A 1EOUA 1YDDA 1I90A 1CNWA 1XPZA 3MHLA 4E3HA 2CBBA 5L6KA 3P5AA 3MNJA 2FNMA 4K0ZA 1OKNA 2GEHA 2X7SA 1A42A 4KP5A 1IF6A 4KAPA 4RUXA 2NXTA 1CNJA 5CA2A 1HUHA 3T5UA 4M2UA 1FR4A 4ZAOA 5SZ1A 3KNEA 3FE4A 3OIKA 3RZ0B 1I9LA 3P44A 4RUZA 5AMDA 1CAIA 4Q0LA 1RZDA 3M5TA 3P55A 5FL4A 3CYUA 4PZHA 4QJWA 4E49A 3OYSA 1BN3A 2WEGA 1ZFQA 3UYQA 1HCAA 3OY0A 4WUPA 1BNVA 3F7UA 2Q1QA 1HECA 3DD8A 1CVBA 3RYYA 3S75B 3F4XA 1HCBA 3DCWA 5SZ4A 2F14A 4FIKA 2X7UA 2WD3A 1CAHA 1J9WA 1RAZA 2O4ZA 1CNKA 5SZ3A 3RGEA 1UGGA 3EFTA 1TE3X 1Z97A 3B4FA 3DBUA 1OQ5A 1V9IC 3RZ8A 4ZX1A 6CA2A 3HS4A 1UGDA 1CCSA 3K2FA 1AVNA 5BRWA 4N16A 5DOHA 1MUAA 5E2MA 4E4AA 1CNIA 4QIZA 4Z1JA 3MNIA 3N0NA 2NWZA 5EHEA 3M67A 3ZP9A 3DD0A 3IGPA 4YWPA 1CAMA 4QSJA 1F2WA 1UGCA 1FSRA 1G3ZA 1UGAA 3F8EA 3S73B 3MZCA 5FDCA 2Q38A 2CBCA 5JEPB 3IBUA 4Q08A 3M96A 3EFIA 4MO8A 3D0NA 3OIMA 3CZVA 4HBAA 4Q06A 4RH2A 4Q99A 4CNXA 5FNLA 3CA2A 4Q81A 1LUGA 5J8ZA 2FMGA 3HKTA 5E28A 1Y7WA 3S9TA 3M5SA 1FQNA 4GL1X 3M5EA 1RZCA 1LG6A 5BRVA 4KNIA 1CVDA 4HEZA 4QJXA 1OKMA 1ZFKA 3TVNX 3FFPX 5FL6A 4YXIA 1KWQA 1YDBA 2CA2A 3V3IB 1CNGA 4RFCA 2VVBX 4ZWYA 2FOVA 3M04A 4KUYA 3U3AX 3RLDA 3D93A 3IBLA 4BF6A 2QP6A 2QOAA 1CRMA 3F7BA 3OILA 3KOKA 3U47A 1IF8A 3M2XA 4YGLA 5FNJA 4YYTA 3Q31A 4KNJA 4FVNA 4Q83A 3M1WA 1KOPA 4LP6A 4QY3A 2H4NA 1LZVA 4Z0QA 1HEAA 2FNKA 1LG5A 2FOQA 3TVOX 5SZ7A 5FL5A 3DCCA 5E2SA 1CCUA 1ZE8A 5EKHA 3V3FA 5JGSB 1YO1A 2HFWA 1YDAA 5SZ6A 1ZSCA 1FSNA 3S72B 3V2MA 3M1QA 4MTYA 5AMLA 1CVAA 3OKUA 3PJJA 3MMFA 5DSOA 3TMJA 5EKMA 5FNIA 4BCWA 4XIWA 3LXEA 2QO8A 3MNUA 4ZWZA 4QJPA 1G6VA 1XEVA 3W6HA 2HOCA 4WW8A 3KS3A 4HU1A 1CZMA 1UGBA 5BRUA 1CAZA 2ZNCA 4Z1EA 3MNKA 2H15A 4M2RA 4WR7A 3V3HB 3PYKA 4QSAA 4YHAA 1G46A 5LMDA 1HVAA 3MNAA 4PYXA 4FL7A 3RYZA 1FR7A 12CAA 5EH5A 5G0CA 1YO0A 3IAIA 3MWOA 1CNHA 2NNOA 4CQ0A 5E5UA 3T83A 1URTA 3NJ9A 3M3XA 5FNGA 5JQ0A 1TTMA 4Q09A 2NWPA 3HLJA 3KLDB 3R17B 4Z1NA 4ETQC 1BV3A 4K1QA 1CNBA 4G0CA 1CAYA 4HEWA 4R59A 1CRAA 2EZ7A 3SAXA 4KUWA 4Q7WA 1CA3A 5CACA 2POWA 3S78B 5JGTB 1BNNA 3DVCA 1BNWA 3K7KA 1RAYA 5DOGA 4YXUA 3T82A 3S71B 5DSQA 1CA2A 4WL4A 3GZ0A 3M2ZA 3MHOA 1TG3A 4RUYA 3R16A 4BF1A 4WUQA 5DRSA 4QSIA 2WEHA 3HFPA 4TWLA 4DZ7A 5DSLA 4JS6A 1FQLA 2X7TA 2HNCA 2WD2A 1TEUX 3DVDA 5FDIA 3DA2A 3JXGA 3MHCA 2EU3A 1G52A 4K13A 5E5RA 2CBAA 1XQ0A 4QSBA 1RZAA 7CA2A 1RJ6A 1ZGEA 3KONA 1TEQX 5SZ2A 1RJ5A 1IF9A 1MOOA 2VVAX 3MNHA 3JXHC 3UYNA 4Q07A 2W2JA 1G48A 5HPJA 4QTLA 3M2YA 3FW3A 4FU5A 4L5VA 4CNVA 8CA2A 1YDCA 4MDMA 4Q90A 5EH7A 1I9NA 2FOUA 4Q7VA 2HD6A 1CVHA 4RIUA 5EHWA 1CNCA 1Z93A 3T5ZA 3M14A 3KKXA 4Q6EA 5DSIA 1DMXA 3RG3A 5E2KA 4E9OX 3N3JA 5JQTA 3BL0A 4QJ0A 4IDRX 3SAPA 4C3TA 4CNRA 1AZMA 1ZSAA 1G54A 1RZEA 1T9NA 3P3JA 5FLSA 2NWOA 1KEQA 2NNVA 2NXSA 4UOVA 5E2RA 4COQA 1G4OA 1FSQA 1JD0A 1G4JA 4Q6DA 1ZGFA 4Q8YA 3W6IA 5A6HA 4MLTA 4Q78A 3MYQA 4QK1A 5AMGA 4YGKA 1IF5A 3D8WA 4RIVA 4LU3A 5JEHB 2AW1A 2HKKA 1BNMA 4IWZA 1I91A 4JSAA 5CLUA 4JSSA 4CA2A 1CALA 2IT4A 3MDZA 4M2WA 3VBDA 1H9NA 1IF4A 1HUGA 5EOIA 3ML2A 4YGFA 4LHIA 5CJFA 5JEGB 3V3GB 9CA2A 3RYXB 4PXXA 1TG9A 3M2NA 1BNUA 4Q7SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NB5 A;  1JV0 A;  3M98 A;  3T84 A;  5FNK A;  4HEY A;  3SBI A;  5EHV A;  3P3H A;  1CAO A;  2ABE A;  4L5U A;  2CAB A;  3KWA A;  4G7A A;  1BZM A;  3RYJ B;  3N4B A;  4Q87 A;  3S97 A;  3HKN A;  4Q8X A;  1CVC A;  1G0F A;  3RG4 A;  1G1D A;  3JXF A;  3V3J A;  4QJO A;  1XEG A;  5SZ0 A;  2EU2 A;  3B1B A;  4FRC A;  1I9P A;  3DC3 A;  1ZSB A;  4N0X B;  3OYQ A;  4JSW A;  1HED A;  2NWY A;  3RJ7 A;  4M2V A;  4PQ7 A;  5BNL A;  3ML5 A;  4KUV A;  2FMZ A;  3NI5 A;  1DCA A;  3P5L A;  4YXO A;  1TB0 X;  2NN1 A;  1G0E A;  2WEJ A;  4QK3 A;  4ZX0 A;  4ILX A;  5JDV B;  4YGN A;  3KOI A;  3S77 B;  2NN7 A;  4E5Q A;  5DSK A;  1CCT A;  3S74 B;  5JES B;  5EIJ A;  4QK2 A;  3RZ7 A;  2POU A;  3DV7 A;  3RYV B;  5DSN A;  3RZ1 B;  4ITP A;  1CAK A;  2FW4 A;  3D9Z A;  3M40 A;  4JSZ A;  5IPZ A;  4E3D A;  2NMX A;  5FNH A;  4XIX A;  4Y0J A;  1UGF A;  1CAJ A;  1ZNC A;  3N2P A;  4KP8 A;  4MDL A;  1G45 A;  1ZH9 A;  5FNM A;  2GD8 A;  3D92 A;  4MLX A;  2OSF A;  4MDG A;  3U7C A;  1I9Q A;  5G01 A;  1V9E A;  4XFW A;  3MHI A;  1DCB A;  4CNW A; 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